3LDQA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldqA04
3DXKA 4K42A 3O08A 3C7NA 4BRPA 1YUWA 4BQLA 4BC4A 2VYPA 1NGDA 4BREA 4FOEA 3MDQA 2NLXA 3L0QA 1J6ZA 2P9PA 3A5LC 3O6WA 4A2BA 1YAGA 2E2NA 3O5BA 3GG4A 1NMDA 1YVNA 2Q31A 3HSCA 5JLFA 2GEMA 3ZEUB 3U4LA 3WQTA 3EZWA 3MN7A 3H3NO 4K25A 3P4IA 3KVGA 3L4IA 1EQYA 3WQUA 2D0PA 4CJ7A 2QWMA 1ZC6A 3LL3A 4BR5A 3CQYA 2V7YA 1GLLO 2ASMA 5I9EB 3I8BA 3U8XA 3WXKA 2CH6A 4DQ8A 4PL8A 4A61A 3CERA 4PKHA 2H3GX 3LDQA 2A41A 1GLCG 4BR9A 1XUPO 4XH5A 2QWOA 2W40A 5AQOA 5BRFA 3CI5A 4EHTA 1RDWX 1SZ2A 3CJAA 4H0XB 3FLCO 3KZBA 2IIRA 2W41A 4ISEA 5KPRA 3AARA 3FZKA 3QICA 3A8YA 1JCGA 5LJWA 2FF3B 4A62A 2YJFA 1JCFA 3SLCA 1ZBSA 1R59O 3MN5A 3RSEB 2VWBA 1HKCA 2WUSA 2Q1NA 1NGEA 4BRCA 3TU5A 3D2EB 3VEWA 3A5MC 3ZEUA 5AZJA 5BR9A 3EL2A 1QQMA 5BPLA 4CZFA 1ESVA 3GBTA 5AQFA 4BGAA 4H0TB 4H03B 3R9PA 3CIPA 3S41A 2J4RA 5ADXH 4RWTA 1QZ5A 4BROA 2NZTA 2QWNA 4K41A 4CZJA 3KHYA 3VPZA 3LDNA 3JXUA 3WEEA 3I33A 1BA1A 3WXLA 4DHYA 3BEXA 2UYTA 3H46O 3M1FA 4HTLA 4BQZA 4YDUC 5JICA 4H5TA 4FWMA 2E2QA 4QS7A 3OHRA 4PKGA 2P9NB 3ZETA 3A5NC 2CGJA 1RFQA 3AAQA 2GTDA 4GY2B 5AQTA 1ATSA 1C0GA 3M3ZA 4MO4A 4O8KA 4CZEA 3A5OC 2PAVA 2V52B 2YJEA 2QWLA 3BUZB 3M6GA 3WXIA 3ZX2A 2P9UB 3MMVA 3QBWA 4JNEA 4H0VB 4ISFA 4K43A 3SK3A 5AFUA 1BWFO 3EKSA 2FSKA 5AQJA 5AR0A 1KXPA 3ATVA 4BG8A 4BGBA 5AQKA 1HJOA 3G25A 4BR4A 3AAPA 3RSEA 4CBXA 3EN9A 5AQQA 1BG3A 4BRQA 4H5NA 2E2OA 1S22A 3ATUA 4FWLA 3D2EA 1D4XA 4JHDB 5AQZA 5AQHA 1NGAA 2HMPA 1HKGA 3VETA 4E1JA 1BOTO 4FOIA 3R8EA 1MWMA 2CGLA 5EXWA 2GELA 1KAZA 5EX5A 2A42A 3VEOA 3LM2A 2ZGYA 4BR0A 5KPTA 3IMXA 4IXCA 4MO5A 2YCHA 4WQ5A 3UKUA 3FFKB 3VGLA 4JD2B 3ULEB 4IJAA 1MWKA 3MN9A 4NO7A 1YXQA 5AQVA 4BRMA 4H5WA 2P9NA 4MLEA 3FGUA 1T6DA 4BC3A 2Q36A 4AM7A 1JCEA 2YHXA 4RTFD 4Z94A 4XH4A 3W3DA 1RGIA 4FL9A 4M63C 3VEZA 4B1VA 1OKJA 5EY4A 1Z05A 5FPNA 4FWPA 3QFPA 3FZLA 1QHAA 4GNIA 1SQKA 3BP8A 2QM1A 4A2AA 5AQIA 4WQ4C 1LOTB 2GWKA 5BN9A 4B1XB 1DGKN 5JMVA 3CETA 1ATRA 4FSVA 1C0FA 2CH5A 3L6QA 2GUPA 4BRNA 4FWOA 2PBDA 2P9KB 2P9IB 2IVPA 2VCPA 1BUPA 3UKRB 1ATNA 4PKIA 3CJ1A 3HZ6A 3SMPA 4I6MB 2D4WA 4JD2A 4IO8A 3DXMB 1NGFA 2A5XA 3VEYA 3MCPA 3DAWA 4FWQA 3ZX3A 5BRDA 3QFUA 1GLBG 1DEJA 5AQYA 1TUYA 4H5VA 3VF6A 2AA4A 4CBUA 3FZFA 1GLFO 5AZIB 1HX1A 1ZXOA 5ADXA 4DB3A 4CD1A 5BPNA 2BTFA 2P9LB 3EKUA 2QWPA 2Q0UA 4QS9A 2V7ZA 4XEIA 1KAYA 4L3QA 1MDUB 5AQUA 4AM6A 1SAZA 3FE1A 1P8ZA 2YI1A 3C0BA 3H45C 3HBTA 4BRFA 1MA9B 3IUCA 1Z6RA 2GWJA 1NGBA 1WOQA 4BR2A 4BRAA 2CGKA 3D7EO 2QW9A 2P9IA 2FLOA 4BRLA 2QWQA 2ASOA 2I7NA 3UKRA 1NBWA 3C7NB 5AQWA 1NGIA 1HKBA 3QMLA 2D1KA 3LDPA 1T44A 1K8KB 3LDOA 1TYQB 3AY9A 2ZGZA 3FZHA 3A0IX 3O1BA 4B9QA 5BPMA 4WQ5C 4EHUA 5FPMA 3GE1A 3GDQA 5AQGA 1X3MA 3H1QA 4YDUA 1IJJA 1BO5O 3VESA 4BR7A 1NWKA 4B1UB 3CJ9A 2E1ZA 3MK6A 4BG9A 1BA0A 4FPAA 2QWRA 3BF1A 2FSNA 5AFUH 3O80A 1NGHA 1BDGA 1V4TA 5AQXA 4FWSA 2ASPA 4CZIA 4CZLA 4BVOA 2AP1A 1HUXA 4FPBA 2F9WA 4BRGA 5JLHA 3HTVA 2FSJA 4M7YA 3ID8A 4XH1A 2E8AA 1E4GT 4F9OA 5CE3A 3TPQA 4FWRA 3QBXA 5BRHA 3U9DA 1S3XA 2P9UA 4FWKA 1K8KA 4KBOA 1TYQA 2F9TA 4O5FA 1T6CA 2EWSA 2DPNA 1WUAA 2NRHA 3LM9A 2ZF5O 1NGJA 1NGCA 1QQOA 2V51B 4IWVA 1U2VB 1GLEG 3UB5A 4CD3A 3UE5A 2Q97A 1GLJO 3ENOA 5AZJB 3BF3A 4JHDA 5B8HA 3D2FB 3IFRA 1X3NA 2A3ZA 2Q0RA 1U6ZA 3DWLA 5AQRA 3O4WA 3VGKA 4H5RA 4FO0A 1TUUA 4M7XA 3MN6A 2IVNA 5EOYA 3VF4A 3WEEB 4IZ9A 3CJ7A 3LDLA 3ULEA 2ZWHA 3IDHA 3QDKA 4LC9B 2E88A 2I7PA 4CZMA 5F0XA 3SJHA 3ZETB 4B1WB 1NGGA 1E4FT 4B1ZA 4BRIA 1NLVA 4WQ4A 3R6MA 3ZX0A 2OANA 4HWIA 5ELZA 2YHYA 2D0OA 4EIAA 5F1XA 5KQ8A 3VF2A 4B1YB 2P9SB 5KPZA 3DJCA 4CI6A 3WXJA 4NB4A 2BUPA 3GOIA 5E26A 4BRDA 1GLAG 4QS8A 3B8AX 4JN4A 2ITMA 3W0LA 1BU6O 5AQNA 4IJNA 1U2VA 2FF6A 3WT0A 2A6AA 1GLDG 5TKYA 3VEXA 5AQSA 3HI0A 2QXLA 4PL7A 3JS6A 4J8FA 3H1VX 2E20A 3CJCA 1XQSC 3D2FA 3VERA 4FWNA 4MLHA 5LJVA 3VOVA 2P9KA 2A40A 3J8AA 3O8MA 3U9ZA 4DCHA 3CQXA 4CZHA 5LY3A 3DXKB 4CZKA 3FR0A 3H3OB 3FZMA 4H0OA 1DKGD 3UKUB 3F9MA 3WUHA 1Q18A 4I6MA 3DXMA 4BRKA 4CZGA 5EVZA 1H1VA 2P9PB 5AQMA 2FXUA 5E84A 5F2RA 2IVOA 1KAXA 4RCHA 4H0PA 5FPDA 3O1WA 2HOEA 1LCUA 1NM1A 3EO3A 1XC3A 5AZIA 2YHWA 4BC5A 5BREA 3H6EA 1CZAN 1QQNA 3ENHA 4CBWA 5KQDA 3CHWA 1X9JA 4BC2A 2P9LA 2P9SA 5AQPA 3QB0A 3SMSA 5BN8A 4H0YB 3VGMA 4Y0WA 1Y64A 3VEVA 4EAHD 1HPMA 3GL1A 2HF3A 4JAXA 4ISGA 4BVPA 3CJBA 1IG8A 2E2PA 3VENA 2Q2RA 2HF4A 1G99A 1V4SA 5FPEA 4C23A 2KHOA 4EFHA 1QZ6A 2E1YA 4WYBA 1HLUA 3HM8A 4BRHA 5AQLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NF6A 1KVCA 3DRPA 2JGUA 3O08A 2JDQD 2P1JA 4BQLA 3PV8A 2VYPA 5BR8K 4IG3A 3VQ6A 3MWPA 4IEIA 2P9PA 3LP3A 4OGCA 4A2BA 1VQPN 1YF5L 4CK3A 2Q31A 3HSCA 4RW9A 2HBJA 1KV0A 3H3NO 3MN7A 4K25A 5C42A 3HVRA 4WFBL 4JRPA 3KVGA 2VG6A 4CJRA 3C65A 4PWDA 3L4IA 4GKKK 3LZIA 2D0PA 1BIZA 3ID6A 3A2FA 2ATBA 1QVGM 1YIJN 4I9LA 5KK4A 4CFAA 1NJXA 4LFBK 1RT3A 2JLEA 3AVAA 1KQSM 2ASMA 3ZT3A 1RTHA 5SZTA 3OY9A 2X6NA 3O4NA 4CJTA 3CERA 3ZSWA 1ASVA 1XUPO 2VWJA 5AQOA 5BRFA 1RDWX 1SZ2A 3CJAA 4H0XB 3KZBA 1RT1A 2W41A 5KPRA 3CC2N 2HHXA 1NJIO 3CCMN 3K5LA 2YJFA 1JCFA 4CGJA 1ZBSA 2O8CB 3K5NA 1R59O 4ID1A 3ZCMA 4M45A 4JKAA 3M8QA 4JEPA 4FW2A 2Q1NA 4W5QA 3J80O 3D2EB 3VEWA 4FM1A 5BPLA 4CZFA 3GBTA 3NF9A 2GL1A 4BGAA 3QEPA 4B9LA 1N34K 5ADXH 1MU2A 1QZ5A 4K41A 4DR2K 1HNVA 3KHYA 3WEEA 4CJLA 3I33A 3QI7A 3AVMA 4KPYA 4I2PA 4HTLA 2UYTA 4BQZA 4IDHA 5JICA 3L2RA 4YDUC 2PFUA 3J81O 4FZYA 4FWMA 4QS7A 4CEOA 3K9KA 5KGXA 3TAFA 4GY2B 2GTDA 1Q81O 5AQTA 4CZEA 3ZLJA 1HYSA 4QCLA 2QWLA 3MMVA 3QBWA 2G8HA 4N5SA 3D0PA 4ISFA 1J53A 4K43A 1DJTA 1JLAA 1NKBA 2OPSA 1OZZA 1CN2A 4CGDA 2O8CA 1KXPA 3CCSN 3CM6A 3AA2A 1T0ZA 3HJFA 1HMVA 4BRQA 1VSDA 1RDCA 2W00A 4F4KA 3D2EA 2WTUA 2HHWA 4FJMA 1DLOA 5AQZA 2HMPA 1Q9XA 5I3UA 1NK9A 1CLQA 1BOTO 1MWMA 4Q0BA 2GELA 3BZCA 1KAZA 3TSUA 3VEOA 3EZ5A 3LM2A 2ZGYA 4BDZA 2YKMA 3O9SA 4NLCA 5KPTA 4IXCA 1QVFM 1TAQA 4MO5A 2YCHA 4K8ZA 3VGLA 4M41A 3MN9A 3S5TA 5AQVA 1O13A 4H5WA 4MFBA 1RILA 2YHAA 3FGUA 1T6DA 3OS2A 1JCEA 4DSFA 1NRAA 4Z94A 4XH4A 1RBVA 3K0SA 4FL9A 5SWMA 2KBKA 2HB5A 1OKJA 4HVJA 3FZLA 1SQKA 1TKXA 5M1PA 1LWFA 4M3YA 3HXMA 1KLNA 4Y1CA 1J5EK 3BDPA 4M3TA 4FXDA 3ZSYA 3LPTA 2G8IA 3K2PA 2Z1GA 3CETA 1T1TA 1N6QA 1C0FA 4BRNA 3RR7A 2IVPA 4R79A 4DR7K 3SUOA 1P00A 1NK5A 1D9FA 4PY5A 5CZ1A 2DFEA 4X64K 4JKCA 3DI6A 2O8DB 3MCPA 4FLTA 3DAWA 5BRDA 1DEJA 1C0TA 4MQ3A 1RT5A 1PTXA 4CBUA 5AZIB 1HX1A 3DYAA 1F21A 4DB3A 4DF8A 4FLVA 1JKHA 4LF5K 2BTFA 3E7RL 5CYQA 1OMYA 3HL8A 4DQQA 1NE5A 3KP1A 1EX4A 2Q0UA 4QS9A 2ETJA 4DLGA 2F8SA 5KRTA 4EZ6A 5AQUA 1OVYA 4AM6A 4CHZA 4CHOA 3Q7BA 3H45C 3KP0A 1MA9B 3IUCA 1Z6RA 1T03A 4NXMK 1SUQA 4FJLA 1FK9A 4W5NA 1VQON 4F2RA 1YI2N 1JLQA 2CGKA 1RT4A 5GIPA 1SNBA 1ASWA 2ASOA 4NYFA 3SPZA 3RR8A 1NBWA 5AQWA 2D1KA 1T44A 1X9MA 1TAUA 3AY9A 2N2QA 1BCGA 2O8DA 4KH6A 2W6LA 1VQLN 3NH0A 2ZJQL 3IAYA 3EYZA 3LALA 4JS5A 3PIOL 3AVIA 4RW6A 4DV3K 4DUZK 4QOZB 1S9EA 1IKYA 1TK0A 3QIOA 1ZBIA 3OYAA 1MYNA 2YILA 4Z4IA 1BO5O 3NVMA 3SAFA 1NK6A 1TL3A 4CJPA 3PUFA 4EP5A 1TL1A 4BG9A 1M90O 3CCEN 4KB1A 2C1IA 3PX6A 3HM9A 4ILGB 1LAVA 3O80A 1BDGA 3EEQA 3L3UA 1S6PA 4CZIA 4CGHA 3G10A 4FPBA 4BRGA 5JLHA 4A5BA 3HTVA 4YOUA 4M7YA 3VQEA 1K8AO 2G8VA 2OPRA 2YKNA 2P9UA 3LP0A 3E9PA 2UUCK 1OH5A 1UGLA 2NRWA 2IDOA 1E3MA 4ILHA 4O5FA 4E72A 3LM9A 2ZF5O 1NGCA 1RBSA 1X1PA 1U2VB 1UWBA 3AO4A 3VQBA 3AVCA 3NF8A 3TI0A 4KHUA 4JHDA 5B8HA 1ZYWA 4CJKA 2VQFK 3KLFA 2Y1JA 4JI7K 2B6AA 3E66A 4FO0A 1BCOA 1XHXA 3L3VA 3MN6A 2IVNA 3NF7A 5EOYA 3I0SA 3SV3A 4KYPA 3LDLA 3VN5A 4Z4HA 3ULEA 2ZWHA 2HHHK 3C6UA 2ZJPL 2E88A 5F0XA 3HPHA 3SJHA 1S1WA 1T3VA 4BRIA 1K8BA 3M8RA 2G8WA 4WQ4A 3ZX0A 1IH7A 3L2UA 5JS1A 5F1XA 3KWGA 3VF2A 2P9SB 4LH4A 4O55A 4K0KK 3OJSA 1X9WA 4CEZA 3L56A 2UU9K 3MECA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NF6 A;  1KVC A;  3DRP A;  2JGU A;  3O08 A;  2JDQ D;  2P1J A;  4BQL A;  3PV8 A;  2VYP A;  5BR8 K;  4IG3 A;  3VQ6 A;  3MWP A;  4IEI A;  2P9P A;  3LP3 A;  4OGC A;  4A2B A;  1VQP N;  1YF5 L;  4CK3 A;  2Q31 A;  3HSC A;  4RW9 A;  2HBJ A;  1KV0 A;  3H3N O;  3MN7 A;  4K25 A;  5C42 A;  3HVR A;  4WFB L;  4JRP A;  3KVG A;  2VG6 A;  4CJR A;  3C65 A;  4PWD A;  3L4I A;  4GKK K;  3LZI A;  2D0P A;  1BIZ A;  3ID6 A;  3A2F A;  2ATB A;  1QVG M;  1YIJ N;  4I9L A;  5KK4 A;  4CFA A;  1NJX A;  4LFB K;  1RT3 A;  2JLE A;  3AVA A;  1KQS M;  2ASM A;  3ZT3 A;  1RTH A;  5SZT A;  3OY9 A;  2X6N A;  3O4N A;  4CJT A;  3CER A;  3ZSW A;  1ASV A;  1XUP O;  2VWJ A;  5AQO A;  5BRF A;  1RDW X;  1SZ2 A;  3CJA A;  4H0X B;  3KZB A;  1RT1 A;  2W41 A;  5KPR A;  3CC2 N;  2HHX A;  1NJI O;  3CCM N;  3K5L A;  2YJF A;  1JCF A;  4CGJ A;  1ZBS A;  2O8C B;  3K5N A;  1R59 O;  4ID1 A;  3ZCM A;  4M45 A;  4JKA A;  3M8Q A;  4JEP A;  4FW2 A;  2Q1N A;  4W5Q A;  3J80 O;  3D2E B;  3VEW A;  4FM1 A;  5BPL A;  4CZF A;  3GBT A;  3NF9 A;  2GL1 A;  4BGA A; 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