3LE6A

The structure of cyclin dependent kinase 2 (ckd2) with a pyrazolobenzodiazepine inhibitor
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
294
structure length
283
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cell division protein kinase 2
publication title Pyrazolobenzodiazepines: part I. Synthesis and SAR of a potent class of kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 283
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2010-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3le6A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3le6A01
3QQFA 1FBNA 3HV4A 3OEZA 5EI2A 3E3PA 3IPHA 1SZMA 4QO9A 2J4ZA 3V51A 1LEZA 2A4LA 1YXTA 3A61A 3MBLA 4QPMA 5C03A 2UZBA 3ZLWA 4IX6A 5IA2A 4EOOA 1JSVA 2PZRA 3A4PA 4FZDB 2ITVA 1KOBA 3EL8A 4MF1A 3R7EA 3VS7A 2PL0A 4JS8A 4JRNA 3S95A 3A7JA 2UVZA 3POZA 4N0SA 4M67A 4R8QA 3UZPA 2GS6A 1FVTA 2GHGA 1IG1A 1OKZA 3ALOA 4LYNA 5AV4A 1ATPE 3V5LA 3HLLA 4I94A 1WBTA 2VNYA 4RQKA 4C57A 3Q3BA 5L6OA 4KABA 4AF3A 5ETFA 3UOHA 2F7XE 3UIBA 2YCFA 4RT7A 4IXPA 4CQEA 3QTWA 1CDKA 3F5GA 2GQGA 4AXAA 3H4JA 3MV5A 4E7WA 3UQFA 4IHPA 3D4QA 5FTOA 3OW4A 2CNUA 3OXTA 4HW7A 4C36A 4QMLA 5LVMA 4DTKA 4EEVA 2BAJA 3IGGA 5JSMA 5KUPA 2BZJA 4ZSEA 4O2ZA 1ZARA 4L7SA 1PMNA 5H8EA 4P90A 3FC1X 4F1TA 4FSUA 4XMOA 4E1ZA 2CKOA 1WBPA 1Q3WA 2PVNA 3QX2A 4EH7A 4FEUA 2EXCX 5HX8A 2WTWA 2QLUA 3BELA 2XH5A 2QO9A 1DI9A 3IW4A 5CLPA 5CAQA 4JR3A 3EQBA 2IVUA 4UWBA 3UNJA 4CG8A 1PF8A 5K4IA 3ZXTA 4RJ3A 2IW6A 2YITA 4NZWB 5KMMA 1PXJA 4YZ9A 5KMLA 4FNYA 3VBQA 3R2YA 3QUEA 3V8SA 4FTMA 3U55A 1RE8A 2YHVA 1FGIA 3EFKA 3BYVA 4YHTA 2RG5A 3DAEA 4QTDA 4U97A 4DCAA 4EOMA 3CE3A 5CF8A 5M06A 3HGKA 4IVAA 3EZVA 4EOQA 2E9UA 3RAIA 5HBJA 5JQ8A 3FMJA 4ZTMA 5DE2A 2WMAA 4JQ7A 2J90A 3FAAA 4BDJA 1B38A 3QXOA 3TKUA 4K1BA 4BCFA 2OXXA 5DRDA 2BDWA 2XP2A 3REPA 3LFBA 5EYKA 2R3PA 2Z7LA 2QHMA 3EN9A 5DLSA 3F2NA 4YZBA 1KE6A 4DBXA 3PJ2A 2JC6A 4RLLA 4XG2A 3TZ9A 3VUKA 1REKA 3DBQA 3W55A 4W8DA 3VWAA 5DMZA 2WMVA 1XH9A 3QCXA 5IEVA 4O84A 5D41A 4GYGA 5K0KA 3R9NA 5HE0A 5HNIX 5LJJA 2I0HA 4BI1A 5JGBA 3LQ5A 3NUYA 4RIYA 1OGUA 5B2MA 1LUFA 1G3NA 3TV7A 4AG8A 3QD2B 3K54A 4RIYB 2XEZA 5LMKA 4IM0A 4F9WA 2X1NA 3DJ7A 1STCE 5E8YA 2WPAA 3U6JA 5M09A 2XEYA 3FZTA 3Q4TA 3CGFA 4EZ7A 3ORXA 3ZO4A 1SVEA 2Z7QA 4ZSJA 5CEIA 4L68A 3VW8A 3ZHPC 2OZOA 2X7FA 4IEBA 4BYJA 3VRYA 4KD1A 4NUSA 2JKKA 4NKAA 4GL9A 3TM0A 3QTSA 3VO3A 5BUEA 3NUPA 3ORKA 2C47A 2WMXA 3II5A 4AP7A 4LI5A 3EFJA 3D0EA 2WTVA 5K3YA 3QUDA 4FT5A 5EDPA 4C4JA 2GCDA 4CFNA 4YBJA 3CXWA 4H39A 4EHEA 5LVNA 3IDPA 3U4UA 5JN2A 5A4LA 5DT0A 4YU2A 3H30A 3F66A 4PY1A 2BTRA 2JIVA 4NKSA 2HY0A 3BIZA 4GIHA 3W2SA 4IW0A 4BKZA 4C4HA 4EJ7A 5M07A 4EC8A 4Q9ZA 2QODA 4IAAA 1UVRA 5AIRA 3B2WA 5EK7A 3ROCA 5ITAA 3QD3A 4MXAA 4MXOA 4ZS4A 3IS5A 4BDIA 4GS6A 5KHWA 1WZYA 2V5QA 3OCSA 4BGGA 1CMKE 3W2PA 2GNGA 2W96B 4OTIA 5D12A 4QMPA 4O0XA 3C9WA 1GJOA 3PXFA 4NTSA 3ACJA 5AP1A 4IBMA 3TV6A 5BQ0A 2RGPA 4IC7A 3TDWA 3OS3A 3HA6A 4TYIA 4LV8A 3H9RA 2PULA 1VYWA 2JAMA 3MPTA 4HGLA 5EM7A 5HIEA 1LR4A 3F82A 4CZYB 2VO7A 4U44A 4D2TA 1Q8ZA 3MY1A 5HTIA 4FVRA 4AE6A 1OKWA 4DFXE 3R01A 5CT0A 4EHZA 4O27B 3NS9A 4TTHB 3C4FA 4QTAA 1K2PA 3P5KA 4IX5A 1B39A 5TR6A 4ZEGA 2OICA 4M0YA 4C8BA 3B8RA 1Q97A 1GZ8A 4WSYA 4XV9A 4G17A 3SKCA 5L2IA 2VX1A 4C7TA 4ZY6A 3MH0A 3PIZA 4FUYA 3DBCA 5IEYA 4PNKA 3UVRA 3ODZX 5L4QA 4MTAA 1JAMA 1PYXA 5IQDA 3E62A 2GS7A 4G3GA 4X2JA 5GZ9A 5HO6A 1P5EA 3NCGA 3MWUA 3EFLA 3MVJA 3OUKA 3PVGA 4FKJA 5IA5A 4W9XA 3LJ1A 3DZQA 4RVMA 4DEGA 3QTRA 3SRVA 4ARKA 4C33A 3GU7A 3UMXA 4FICA 2W05A 3EQHA 4BTMA 4D4RA 3MN3A 3AXWA 5TT7A 5LVOA 4I0RA 1QCFA 5EG3A 2GMXA 3AQVA 1O6KA 4U7ZA 3SOCA 3BBTB 5HX6A 2W5AA 3KMWA 4FL1A 4FTOA 4PTCA 5DFPA 3QZGA 3ID6C 1IASA 2G15A 3FL4A 5HOAA 2J0JA 3Q9WA 3R28A 4X2NA 4YZMA 5CY3A 4IVBA 5AP5A 2C6TA 2ITWA 4RA4A 1XH8A 3QX4A 3ANQA 2V7AA 3Q2MA 4XG9A 2NPQA 3DCVA 3W18A 1Q61A 3E8DA 5K4JA 2WTKB 3QTUA 3R7UA 5HZNA 2YIYA 2Q83A 2OWBA 4IJ9A 2GNIA 4LUEA 4V04A 4HOKA 3RAKA 4YO6A 3DV3A 2YISA 2A19B 5AR3A 4DGGA 3ZTXA 3HAMA 2RFEA 3R1SA 4C62A 5HIBA 5J1WA 2GTMA 4FTUA 2ZDUA 2JFMA 5CI6A 3SDJA 4EI4A 4F1MA 3N9XA 4FT3A 1W0XC 3TNHA 3OBJA 3TIYA 4CFFA 2ZYBA 3EN5A 3LFSA 4CT1A 4O7SA 5DBXA 4FV4A 1OL2A 2C3IB 1H1PA 3QGYA 5M51A 1ZRZA 4OBPA 4O2PA 2C30A 3OVVA 4FSRA 3RK7A 4ZMEA 3MS9A 4I1ZA 3UOLA 5CF4A 1XH4A 3A7FA 4FTKA 3LQ3A 1K9AA 4U43A 3LMHA 3R9RA 3R7OA 4GYIA 1KWPA 4P7EA 3RM7A 4D1XA 3EN4A 3AG9A 3MB7A 4FV2A 4LRKA 4QTCA 3LFFA 4BVUA 5LXMA 3ORZA 2R3IA 4JOAA 1JQHA 2W1GA 5HCZA 2VWIA 2W1IA 4FV7A 3COIA 1URWA 3HDMA 1AD5A 3A62A 3NYOA 4EZ3A 4G6LA 3I5ZA 4AX8A 3U9CA 5J7HA 4DEDA 2E9OA 5D11A 4CD0A 2PHKA 2OKRA 3OWKA 4E73A 2UW3A 3L9MA 2G9XA 4MWHA 4CRSA 4DGMA 3LLAA 1R39A 3BRBA 1PXPA 4Y8DA 3NVKI 3UIUA 4IACA 3DNEA 1JBPE 4ZSAA 4J53A 1OPJA 1ZMVA 2EXEA 1RW8A 2V22A 3NR9A 4H05A 4D55A 4EOJA 5AAEA 4YC8A 3CPBA 5HLWA 2NRYA 3CY3A 3KEXA 5AP4A 3OXIA 4NWMA 1KV1A 3JVRA 3CIKA 3R7IA 5EI6A 2OJFE 4BKJA 3I0QA 2WHBA 4L6QA 5M4UA 1OM1A 4FSNA 1XJDA 2RL5A 3GCUA 2Y8OA 2P2IA 2B4SB 4F6WA 1OL5A 1PKGA 3KXXA 3HL7A 2RFNA 3WF7A 3KMUA 3L8PA 3VBYA 5CX9A 5GJDA 1JVPP 3TTIA 4U5JA 4KIOA 3FZ1A 3OWJA 4ANBA 4G2FA 3U9NA 3WZJA 2JDOA 2HWOA 2ZV9A 3G9NA 4G5PA 4FTNA 2ZB0A 1MQ4A 3VVHA 4FK6A 5M53A 3V3VA 1PXIA 3KFAA 5FM2A 2BRNA 5CNNA 3K5VA 3LM5A 4YTIA 2PPQA 5HEZA 5CF6A 4YJPA 3ATSA 3DNDA 3DTCA 3GEQA 4TYEA 2IZTA 4MD8E 2NO3A 3GT8A 3NNVA 5DI1A 4O0VA 3MH2A 2QI8A 5AUVA 3TCPA 5JGDA 2R9SA 4U80A 4XYFA 3TIZA 5ANEA 3KXHA 5G6VA 4DLIA 3CLYA 3DBFA 3FC2A 4DH1A 2ZV7A 2PK9A 3NCZA 3F69A 4KS7A 1U54A 5HG5A 4H58A 1H1WA 4JVGA 4FKWA 2GS2A 5BNJA 5JFVA 2CHLA 2LGCA 4TYJA 1U54B 1W84A 4FYOA 2F49A 2OH0E 4L45A 4TYGA 2LAVA 2PY3A 1BYGA 4BDBA 2HAKA 5C01A 5BVKA 3RKBA 5ETCA 1W98A 3UG1A 1PXOA 3T9TA 4ANLA 5LCJA 4XV3A 4G9RA 3V5WA 4FSTA 4BI0A 1FMKA 2CSNA 2OLCA 2WTKC 3PJ3A 3I0OA 1MRUA 4XRJA 5FRIA 3FL5A 5KZ0A 4AWIA 3ATTA 2BKKA 2GHMA 3B8QA 3CC6A 3DLSA 3U4WA 4CFUA 3PXZA 5C9CA 4LOQA 4RX9A 4G3DA 5CNOA 2PMNX 4ZS0A 3GNIB 3ODYX 4GUEA 4QMMA 4I23A 3RZBA 3P79A 2WELA 4AZFA 4E6QA 4ORKA 3EJ1A 3PLAE 3UODA 3RNYA 4J52A 3LXKA 4FTIA 4HVSA 5CAPA 1Q3DA 3G90X 4K77A 3KA0A 2OJ9A 3N51A 5E92A 2YFXA 4Y73A 1GZOA 2OFUA 4OT6A 2W9FB 4GT3A 4LUDA 3TV4A 3CEKA 4DHFA 1IAJA 1YDSE 1QPJA 5EW9A 3W2OA 5B2LA 3FZSA 3O7LB 2B53A 4DFLA 3RK9A 5DG5A 4BCIA 2A2AA 3H9OA 4FZ7A 2UW5A 4DG2E 4CQGA 4U6RA 3VS5A 1ZY5A 5AA9A 3IG7A 3AC4A 5LCKA 2X81A 2QD9A 5JK3A 3ZUTA 4DH7A 1OB3A 1OIQA 5HBHA 2IW9A 4FE2A 3QFVA 3RALA 4F7LA 4JDIA 1REJA 3BYSA 3Q52A 3EOCA 3EQIA 2G2FA 3QC9A 2XK8A 2CN8A 5M4IA 4C3RA 3TEIA 1UV5A 2VTPA 4GFMA 2A27A 2GDOA 1KE7A 4QP9A 2B7AA 3LE6A 3NWWA 5KX8A 5CEMA 4JXFA 2ZM1A 4U8ZA 2I1MA 3OXZA 5F1ZA 2X6DA 3LCKA 3AD4A 3KK8A 3GI3A 3JPVA 4XCUA 4C0TA 3NUNA 3G6HA 3QC4A 4FNWA 2B9IA 3O7LD 3ZRMA 5FD2A 5J95A 3Q04A 4NU1A 3FLWA 5FGKA 3EN6A 4TWOA 3L1SA 4FKQA 3QTIA 4BDFA 3Q4UA 2XM8A 4M66A 3OY3A 3MIAA 2HELA 4FIJA 4K33A 3WIKA 1JNKA 5BVFA 4G3FA 3NX8A 3MSSA 2GQSA 2QOFA 3QYWA 3UBDA 4YP8A 3MDYA 1G5SA 5FEDA 3CBLA 3RTPA 4IX3A 5M4CA 1R1WA 4G3EA 4WA9A 4FA2A 1V0PA 4E4MA 2IJMA 2CGXA 3FHRA 5I9YA 3MGYA 2EXMA 2BRBA 3ORPA 1H4LA 3QXPA 4XOZA 3BYMA 1BUHA 2QU5A 4I4FA 2QO2A 5A4QA 4YR8A 3TUCA 4ZTRA 2Z8CA 3ENMA 3MY0A 4KKEA 5EM6A 5AUUA 2V0DA 5L2SA 2ZM3A 2YCRA 3VJOA 3UQCA 4XP3A 3RCJA 3QHWA 4RWIA 4AACA 3A8WA 4C38A 2FVDA 2P33A 3BV3A 4CT2A 2C5VA 4UWYA 3UP7A 2R3MA 2OIQA 2IN6A 2JEDA 5CEQA 1PXLA 3FY2A 4G1WA 4GH2A 1YHSA 4M8TA 2BZHB 4QNAA 4APCA 3IW7A 4EWHA 2Y7JA 5AAGA 4UB7A 3RINA 4FNXA 3HV6A 4ZY5A 2YEXA 1KE5A 4J99A 3G2FA 1XH6A 2X7GA 3SG8A 3IKAA 4FX3A 2XA4A 5CEPA 1ZY4A 2OI4X 4FTQA 5IZFA 4XG8A 3W8QA 4DE4A 1DAWA 3E87A 3DTWA 4PL4A 3R2BA 2VTSA 5CU2A 5AMNA 4F09A 2BKZA 1J91A 2ETRA 2QC6A 2XJ0A 3BYOA 3A7IA 3KN6A 2X9FA 2F7ZE 4M13A 4UALA 3RZFA 3W2QA 1Y91A 4DH8A 1ZYCA 3BV2A 4GVJA 5IQAA 3VBTA 3QQHA 4WG5A 4D2WA 4D9TA 2B0QA 2ITOA 3PPJA 2OG8A 1Q4LA 1KE9A 4YLLA 5B0XA 2QU6A 2C6EA 3ZSHA 3UZTA 4GU6A 5LVLA 4DGOA 4GEOA 3WYXA 2FYSA 5AUXA 3WZEA 4F7NA 2WKMA 2YM4A 1NVSA 2QQ7A 4CYIA 2ITNA 3DAKA 5DNRA 5IKWA 5AR5A 4UXQA 3CPCA 4ONAA 4BTKA 1UNGA 2GPHA 4BWKA 3P86A 2X6EA 2UVXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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