3LFQA

Crystal structure of cdk2 with sar60, an aminoindazole type inhibitor
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
298
structure length
289
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Cell division protein kinase 2
publication title Rational design of potent GSK3beta inhibitors with selectivity for Cdk1 and Cdk2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 289
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2010-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3lfqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3lfqA01
4TNDA 4I41A 4KRDA 3MFTA 3R21A 4FIEA 2C6IA 4ZIMA 3VAPA 4EHGA 4L52A 5IKWA 2C5VA 3NIZA 5CU3A 4YLLA 5JQ8A 2B55A 3MBLA 4R1VA 5GIOE 4DFNA 2XBAA 4KIKB 4LGGA 3AC5A 3RP9A 5AR4A 2FSLX 4C37A 5CEMA 1RE8A 4WOVA 3MTLA 3VBXA 2W5BA 2ITOA 4ZJVA 3KREA 2QONA 4C3FA 4QNYA 3DS6A 4YZDA 3TKHA 3OP5A 3C4EA 4ZJIA 4D4SA 2NNWB 3R9OA 2YIYA 4FZ7A 3KVXA 4AGWA 4UWCA 5AV1A 4MBJA 4R7IA 2NRYA 2UZEA 4YPDA 3QQUA 3W33A 4FNYA 4AS0A 3FZOA 3C4CA 4YTHA 3QD3A 4UMQA 2OF2A 5EM5A 2RFEA 4B6LA 3QFVA 3FE3A 2WIPA 1ZOGA 2RIOA 3NVKI 3LXPA 4KS7A 3Q60A 2HENA 2F7ZE 3G9LX 3QXOA 4PPCA 4RWIA 4GFMA 3PE1A 2VGPA 3FYJX 3FKNA 3DK3A 3P7CA 4LGHA 2V55A 4W8EA 5DMZA 1ERKA 3DPKA 2XF0A 2YCSA 3KRWA 3MY0A 2C3JA 2PVFA 3W2SA 4EOQA 1IA9A 4MH7A 2J7TA 2XJ0A 4FKPA 5EM7A 4Y95A 5LVPA 2EB3A 2C6MA 2FA2A 4RZVA 3RAKA 2XNBA 4FZAB 4RX7A 4RWLA 4IWDA 4FTNA 4G9RA 3D4QA 4UYNA 5F95A 4ACHA 2XKCA 4HVIA 5IA3A 1UU3A 3P78A 4TN6A 4UYAA 4FV0A 3QL8A 3NWWA 5IPJA 1GNGA 3ZLWA 2YWVA 3MY5A 4YZBA 5CS6A 5DR2A 1HCLA 2YN8A 3KY2A 4GMYA 3NSZA 4CD0A 3P9JA 1XH6A 4XRJA 4DFXE 4GH2A 3BGPA 3H30A 3UYTA 4DEEA 2WMSA 3ZSIA 4LOOA 2X6DA 4KBKA 1LR4A 4ZSAA 3QC9A 4LRJA 4MF1A 5GJFA 4HJOA 4I0SA 3TKUA 4ZTQA 3Q4ZA 1CKJA 3RVGA 4CSVA 4YO6A 5M4IA 3MESA 3O8PA 4UB7A 4TWOA 5DYJA 1ATPE 2OJFE 4II5A 4I4EA 2P2IA 3BQRA 3MJ2A 3Q9ZA 4JT3A 5TOZA 4AE6A 4JR7A 4OAVB 2VO7A 1QL6A 5AV0A 3Q4UA 4EOMA 4A9SA 4KABA 3H0ZA 3MFSA 3BU6A 4YJQA 5CEIA 4GKIA 5DG5A 3PXFA 3IDPA 2DQ7X 3A8WA 4C34A 5JSMA 2Z02A 4I21A 4RIOA 3IOPA 2G15A 5FM3A 5AV3A 5IDPA 3HV7A 1UVRA 5CSVA 4AN2A 3S0OA 4S33A 2FVDA 4RQKA 5I9YA 2PMIA 1H1WA 2QNJA 3FY0A 3PPZA 5IZFA 4YP8A 4C61A 3LOKA 4TNBA 3OW3A 3OTUA 4F0FA 5CYIA 5DT3A 3R1YA 3E8EA 4RA4A 3BU3A 4EOIA 3CQUA 5IQCA 4IE9A 4D28A 3UNKA 4HNIA 3UVPA 3D5XA 1YXVA 4GCJA 3AD5A 4F0IA 5CU0A 5AAEA 3GBZA 3CSVA 4RZWA 4FSRA 1GIJA 1QMZA 4LUEA 4D4RA 5AUZA 3ROCA 1OUKA 4FYOA 2XEZA 1GAGA 3AMYA 3T8OA 4QPAA 4F7SA 2Z7RA 2W99B 4O2ZA 2PE0A 4TY1A 4BB4A 5JMSA 2QD9A 1BI7A 4KKEA 4USFA 1UWHA 5HHWA 3TXOA 2WU7A 5AR7A 1ND4A 3PZEA 4EH4A 4YC3A 4EK6A 4RRVA 1WVXA 3V5WA 4AA5A 2QKWB 4GIIA 2ITWA 5K9IA 4RX8A 5AP3A 5HNGA 4N4SA 1Q8TA 5BYYA 5HZNA 3ZYAA 4F65A 2YAAA 3SGCA 5BMSA 2IW6A 2IWIA 1UV5A 2E9OA 2RKUA 4MKCA 4DHFA 4JNWA 4FKLA 4EH3A 5IQHA 5IQIA 4UMUA 5BVFA 4W9WA 4XG6A 3T9IA 3U4UA 4GG7A 3Q2MA 2YDIA 2ZDTA 3TDVA 4DG0E 3O7LD 4TPTA 3QLFA 1BX6A 2PMLX 4JDKA 2NP8A 3V3VA 3MH2A 4IADA 4DF3A 3H9RA 4E6CA 5AR2A 5K4IA 2UZTA 1M2QA 4O27B 4EZ3A 2C5XA 2PWLA 3DXPA 4H3PA 5K5XA 3KMUA 1KV2A 4PMPA 2C6OA 4KAOA 5CVFA 4E73A 4ANLA 4Z3VA 4BWKA 1OKWA 5A9UA 1W8CA 4JIAA 5C8KA 2R7BA 1REJA 3E3PA 1UKHA 3PLAE 1XJDA 4UV0A 3DDPA 2QOIA 4DTKA 2PVKA 4KA3A 3UIMA 2WZJA 2BALA 4Q5EA 3E92A 5IQFA 1FMOE 3MSSA 1JSUA 3OCGA 3OCSA 4E5BA 3P7AA 4BTFA 3V8WA 3A2CA 1OBDA 4PY1A 3WF5A 3MIYA 4HVDA 4EOLA 4E1ZA 5HO6A 3N4TA 5M08A 1IA8A 4NUSA 4DINA 2C69A 5CAVA 3HMIA 3K3IA 1H27A 2RG5A 2XYNA 4JOAA 4YZMA 4CRLA 3VJOA 1B6CB 4JG6A 2C4GA 4IVBA 3F3WA 4FUYA 3B2TA 3GU8A 5CVGA 2OGVA 1OITA 4DYMA 2BIKB 1MRVA 2KTYA 4A4OA 5HG7A 1XR1A 2WOUA 5HO8A 3LXKA 4OBPA 5D1JA 3D5VA 2OF4A 3TIYA 3ZUTA 3O71A 4J52A 4ZLZA 4ID7A 2C6EA 3I4BA 4FV4A 4Y73A 4DITA 1NW1A 3BBTB 3QX2A 4QP1A 4XV3A 4IW0A 4P90A 3QTUA 2R9SA 3F3UA 2C0IA 3FQHA 3DQXA 2XKEA 3RINA 3E7VA 5BQ0A 3L8SA 2HXLA 4ACGA 4AU8A 4CV9A 4RX5A 4HVGA 5IUHA 2EXCX 4PNKA 2PYWA 5I4NA 4MXZA 3C4XA 1JKTA 2AYPA 4L67A 5AV2A 4ARKA 3MJ1A 4QMLA 3F3TA 5M57A 4EJ7A 4BCNA 4DGGA 4FSNA 4USEA 3FC2A 5JT2A 3ORKA 4WBBB 4CT2A 4MWIA 4AAAA 4IWQA 4FZ6A 4MCVA 4XHKB 1P14A 1PHKA 1JBPE 4GT3A 4RT7A 2JGZA 2QQ7A 4TTHB 2IW9A 2NPQA 1YI4A 4ZTLA 3IOKA 1YRPA 2PUUA 1PMNA 2YDKA 3UOKA 4O7NA 3KRLA 4XG2A 4YC8A 2R3IA 4FG9A 5AAFA 4YTFA 3LKMA 4RVTA 3LQ3A 4BR3A 3CKWA 3DAKA 2V5QA 4QYFA 2I0EA 3QLGA 4OAUC 3KVWA 3C1XA 4BI0A 4EUTA 5DFPA 2XNGA 5BPYA 4O82A 2Q0BA 3MWUA 3CKXA 3UQGA 2RL5A 3GFWA 4BIBA 3NYNA 2XIKA 4NL0A 3FJQE 2JITA 4JRVA 5KCVA 3E3BX 1O6YA 4AW2A 4ZMFA 4LM5A 3BYOA 5CF6A 4IAAA 4BIDA 5F4NA 5AUVA 2OFUA 4GK3A 4UXQA 5CAOA 1ZMWA 3ZXTA 1U54A 5M4FA 4FV1A 5E4HA 3HP5A 4MAOA 1WBSA 5ANDA 3UG2A 5GZ8A 2ZV2A 1SYKA 3TNWA 2HOGA 4OW8A 4RPVA 3RM6A 5H8EA 4U43A 2PMOX 2XB7A 3PWYA 3ZUUA 4FA2A 2W5HA 1WAKA 4F09A 4E8AA 4MQ1A 4USDA 5AA8A 4PTCA 2JDSA 5EW8A 3F69A 3LMGA 5C26A 4M69A 5ANJA 3DBDA 1SVEA 4GEOA 4TWNA 2I0YA 2F4JA 3EZRA 5FLFA 2PU8A 4D4VA 1REKA 4U45A 3QZFA 3V8SA 1OGUA 2UW6A 1OKVA 4FKOA 4KNBA 3RHKA 3ZEWA 4EWQA 2YJRA 1FMKA 4ERKA 3PXZA 3CIKA 4QMOA 1W83A 3QKLA 4WRGA 3PUPA 4BDEA 3BX5A 3DDQA 2CNVA 2XIYA 3PJ8A 3JR1A 2BR1A 1NY3A 4FYNA 4DFLA 5FEDA 3BV2A 4NWMA 4M8TA 5IQBA 1OL1A 1Q62A 2I1MA 3ZFXA 5C4LA 3PFQA 4A06A 3V5PA 1TQIA 3MW1A 4XBUA 3ALNA 1BMKA 2GNIA 4HYIA 4A9YA 1FVVA 5GNKA 2H8HA 2W17A 2PPQA 4G6OA 3FI3A 2PSQA 3O51A 4YJOA 3R7EA 2V22A 3QYWA 1FOTA 2WPAA 3UOJA 3QYZA 2QR8A 3P7BA 2BZHB 3R6XA 5FXQA 4AGUA 4C4HA 3W55A 3ALOA 3RMFA 4DFZE 1XH8A 3LFAA 2QODA 5IA0A 2GHLA 3F7ZA 4ACMA 4HPUE 3I60A 3F88A 2Y7JA 5I9XA 2CN5A 3S1HA 4C7TA 5C03A 3VW6A 2ZB1A 5LCJA 4UZDA 5M07A 1UWJA 1UNGA 4NM0A 5LVMA 4HYHA 2W0JA 3KRJA 2I0VA 2WMQA 4FTCA 4Y46A 5AM7A 3Q96A 4CV8A 1OUYA 4O83A 4EOJA 4IZ7A 4DE4A 3EQRA 4ALUA 4X3JA 3Q5ZA 4D1SA 3THBA 2GNHA 2A4LA 4HW7A 4NTSA 4QT1A 4U41A 3IW8A 3ORXA 2UW3A 4IB1A 5J79A 4IAFA 3WZEA 1WBVA 1H0WA 3GVUA 5EW3A 4PPAA 5EK7A 4FEUA 4BCHA 1PXKA 5TF9A 3V5QA 5IA1A 4YZNA 3FLQA 3PPKA 4ERWA 5AJQA 3NUUA 5LVNA 3KMWA 3KXZA 5CQUA 3C7QA 3UNJA 5HD4A 2IVUA 4FV9A 4PTEA 5EH0A 1E1XA 3NPCA 2OIQA 2ITQA 2GTNA 3IECA 4UMPA 2YCRA 3OF0A 3PXQA 3UO6A 4FTMA 3WF6A 3D2KA 3ZRMA 4X2FA 3ELJA 4QO9A 4YUQA 2YCFA 4RJ3A 5HLNA 3F6XA 3QZIA 1JQHA 4S34A 1JWHA 3ZO1A 3G33A 4GFGA 4AX8A 2WGJA 2GFSA 4MD8E 5LMAA 3ANRA 3W2CA 3V8TA 4AN3A 4FTOA 3RI1A 2NO3A 5JEBA 1XKKA 3KFAA 1Q3DA 4EONA 1SVGA 3BGZA 4HNFA 2XZSA 4R7HA 3GU4A 2OKRA 4FNZA 5LOHA 2CNUA 3HKOA 4FV7A 1BL6A 4O0YA 3WYYA 5ACKA 2JBPA 5DNRA 3LIJA 4Y85A 3O96A 3C4ZA 3GC7A 2PVNA 4RFMA 2WO6A 3IDCA 2BZJA 2WQNA 2WMTA 2X7FA 4FMQA 2XVDA 3DTWA 4FKTA 3FKOA 4K9YA 5AADA 3UPZA 5EDPA 3QCXA 4KB8A 3CY3A 4I22A 4MXOA 3ZTXA 5M44A 1PRYA 3GGFA 4GG5A 2IG7A 2REIA 3AC2A 4ZTMA 2JAVA 3FMKA 5HLWA 3CJFA 4FX3A 1LEZA 4BF2A 2R3JA 3L9PA 1KSWA 5IUIA 2ZV7A 3P0MA 2BKKA 3OT8A 3CJGA 3SD0A 4R3CA 5AX3A 2WTKC 4MHAA 4TL0A 3TZ8A 3RGFA 2VTTA 2B9IA 1H24A 2V7OA 3N4VA 3KN5A 3UC3A 5IU2A 3G6HA 4I5CA 4U42A 2JKKA 1SNXA 3VS1A 2YHVA 2V0DA 2V7AA 5BMMA 3CBLA 2IN6A 2X2MA 3UQCA 3DBCA 3KCFA 2PZRA 3F2NA 5E1EA 3NNVA 2XNEA 4IANA 4AZVA 3UIBA 2JIVA 3SW7A 4O7TA 4BDHA 3G6GA 4HGTA 4P7EA 1Q97A 4JVGA 3AMAA 2CCIA 1Q5KA 4LL0A 5FBNC 4GIHA 3S95A 1ZOHA 2R4BA 4G5PA 4FF8A 2ZVAA 2XIZA 4ANOA 2YDJA 3FSFA 2CKEA 4DBXA 2ZM3A 2XK9A 3C51A 3BHHA 4L9IA 5A54A 2W7XA 4NIFA 4YO4A 3W16A 3JPVA 2P55A 3EYGA 3KF4A 4DH8A 1IG1A 3GNIB 3EQDA 5CAQA 4AFEA 3TJCA 4R7BA 4J7BA 5CANA 4EYJA 4ZTRA 4C4IA 4QMZA 3EFLA 1R39A 5HG5A 4FV2A 2W5AA 3DTCA 2YZAA 2GNFA 3HV6A 4QP6A 3LFNA 1U59A 1JNKA 3LE6A 3LFDA 4ALVA 2ZM1A 2HZIA 4DFBA 5L2IA 1TKIA 2BIYA 4BYIA 5E8VA 4F9AA 2IZUA 3NW5A 3BWFA 2OH4A 3A61A 4FV5A 4EL9A 5IA4A 3MB6A 3V51A 5FXRA 3D9VA 3QD0A 3QGWA 4XG9A 4Y83A 4BKJA 4HCVA 5HOAA 3UP7A 1XH4A 2CDZA 2F2CB 3MPMA 3COMA 1LP4A 4QMQA 5B2LA 3IK3A 4FGRA 2ACXA 2ZV8A 3FZ1A 3LJ1A 4FKGA 4NIFB 4V05A 3AD4A 3QA8A 3TWJA 4OUCA 4QP2A 2IZRA 3WF8A 5KO1A 3L8PA 2PUNA 3FZTA 1PXMA 2WMAA 4MBLA 2X9EA 5DVRA 5ETIA 4BCQA 5C8NA 5EKOA 3CY2A 3BHYA 4I6QA 3QRKA 4ZSLA 3RAIA 1LPUA 3QKMA 4C62A 3MPAA 2H9VA 3LFCA 4P5QA 3OHTA 3DKGA 3ORTA 2OICA 5AR3A 5KE0A 3MH0A 4FT9A 2WELA 4AACA 3ZEPA 4FT0A 3TTJA 4QMYA 3BLHA 4PMTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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