3LHWA

Crystal structure of the mutant v182a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGAGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: "remote" residues that stabilize the active conformation.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 83
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3lhwA00
3W88A 4JTEA 1FCUA 3TR2A 3C2RA 4E2DA 3L68A 2QEZA 2Y70A 1G4PA 1K7EA 4HPXA 4JDYA 3DENA 3KFTA 2A5HA 4ZVJA 4ADSA 3PG9A 3WK0A 3G18A 3QPYA 1KLZA 2WSYA 3DFOA 4DF1A 2PE4A 1QMLA 4GNJA 4JTIA 2E6DA 2YYTA 4LUJA 4ALDA 4NJJA 1OK6A 2A7RA 1X1ZA 4W9TA 3O1NA 3PS7A 3W74A 3GZ3A 3CTLA 3KX6A 3W7CA 5KTLA 4FNUA 4QAIA 2F84A 3WK1A 4QQ3A 3W6YA 2E09A 3SW6A 1LYXA 2V0TA 1L2UA 1ZFJA 4UFIA 5H2ZA 2CZDA 1LLWA 2E6FA 5D2XA 2W79A 3LI1A 5AN7A 3G0SA 1VYSX 2ZZ1A 1DORA 4WUIA 5EPDA 3V75A 2E6YA 3VNDA 4Z1DA 5LGXA 1YDOA 1F6KA 2TYSA 3EX2A 5AHEA 2DJLA 5DCDA 1M5WA 4H6KA 3W1MA 5K2ZA 3NGJA 1Z41A 4LVDA 2BX7A 4NNCA 2A21A 2I9EA 4A2SA 3HJZA 1PV8A 2E1DA 5BRBA 4IMFA 3EKZA 3LXBA 1QOPA 1V5XA 4UTWA 4O4VA 3W2KA 4AHPA 1VRDA 1W5OA 4JX6A 4O14A 5DXXA 5FEZA 4GUGA 2ZRWA 3RU6A 1ZAJA 2HS6A 3LCWA 3NQ8A 4N9DA 4LOCA 3TH6A 4RK8A 4IOTA 2TSYA 3WK3A 4UR7A 2FQIA 3FA5A 1THFD 1TV8A 5BMWA 1B4KA 2WSQA 4XWUA 3W2UA 1GTHA 3G24A 4AAJA 3LHUA 2QCHA 3DFQA 3P60A 1R47A 4Y8FA 4K6AA 1L6YA 2EHHA 1L6SA 3VFLA 1JCJA 2ZRUA 3IV3A 3NL5A 3TMLA 3LXAA 3DFSA 4LVGA 4I7WA 3TX9A 2Y7EA 1B4EA 3Q94A 3WJWA 3NQMA 4S2CA 4EF8A 3W7NA 1G7UA 3TA6A 3W07A 1OJXA 1LORA 1OF6A 1GEQA 2ZYFA 1QPNA 5D2TA 3CLMA 3N2MA 5FF4A 2FTPA 5KITA 3W1RA 4NUWA 2EKCA 4UTJA 3RNDA 3UWUA 4DEFA 4JTJA 3S8HA 1RQEA 3BGGA 3BLEA 1BKSA 2NX1A 3Q2DA 5I3JA 3OG3A 3QYQA 3VI2A 1F6PA 1TV7A 4Q4KA 4X2RA 2D73A 3USBA 4JTKA 2V2DA 2PURA 5G4WA 4JYDA 3H54A 3LBCA 1F73A 3ABSA 3W84A 3NQEA 2HSAA 1S5WA 2VFGA 2V30A 3D0CA 1OFRA 3S1XA 5CPMA 5EBUA 5U7SA 1H7PA 4D2JA 3HBLA 2Y89A 1JJKA 4DF0A 1T96A 5K9XA 3W7DA 3TROA 3A9IA 4DQWA 4UTWC 4MOZA 3WJSA 3C61A 2O7QA 1XDMA 3NNTA 4MLRA 3TSMA 3ABRA 3ZR4A 2F7FA 3GVGA 1ALDA 3W7PA 2CLFA 4UTIA 4JN6A 2H90A 5KZDA 3LCIA 3TSBA 3S1UA 4YCPA 4A22A 3N73A 3P81A 1M7OA 2H3BA 4Y6GA 5FEPA 3PULA 1A50A 4O16A 1G4TA 1HTIA 3BLIA 5IM51 1TPDA 4RCXA 4LY8A 1RD5A 3PF3A 2WNQA 4JICA 1K3UA 2WOQA 4UMAA 4WD0A 5KINA 1TYGA 2JK2A 4MJZA 3NQ6A 2QAPA 2R91A 3SGZA 4LV4A 3TW6A 4HNVA 5C2XA 3W7OA 4O4WA 4BF9A 1Z42A 4N4QA 1W5NA 5AHFA 2Q8ZA 1IF2A 2GQ8A 1YTEA 3TFCA 4LS1A 4AXKA 2ZZ7A 4OBTA 1FCVA 1FX6A 4BWLA 3P74A 5CPLA 3GXPA 4OQVA 1ICQA 3CM4A 3I68A 4NNAA 5KSWA 4MUZA 3O6CA 3NQ7A 4EOUA 3HGJA 1IIHA 1KM2A 2DZTA 3N9SA 2ATSA 4FX7A 5F1VA 5DCBA 1HL2A 3QEZA 1LZOA 3C4UA 1TO3A 1GZGA 1BEUA 1RR2A 3PWAA 4MYAA 1EP1A 2NXHA 3E02A 4JDBA 5D38A 3TMQA 1YPFA 3PB0A 4NU7A 3DZ1A 1WV2A 2E68A 4O18A 2J24A 3GX9A 2CLOA 1GVOA 4LC6A 4FHAA 3W7HA 1ZENA 4TU1A 4OGZA 1DOSA 3W1TA 1QOQA 1I2RA 1KTCA 4RJEA 2CZFA 3P5YA 3SY5A 1SUXA 1I2QA 2E77A 5A5WA 4PH6A 3SSJA 3V1PA 2QUTA 1T99A 2DZVA 3ATZA 4JR5A 3LHYA 2QCDB 3NPXA 3BW4A 1Q6RA 4MZ8A 4MKNA 2QCDA 3THQA 2AAMA 1AW1A 3W22A 3ANYA 3LHVA 2FLIA 2QR6A 1JULA 1ADOA 2DZWA 4AMAA 4K7YA 3I7SA 4LT9A 1LBFA 3WFAA 3GDKA 4ZQMA 5C54A 1B57A 4AWSA 1G67A 1LTDA 2QUVA 3SGUA 1UUMA 4O1CA 4PFMA 4U4MA 3PBUA 2ZZ6A 4N9BA 3HB9A 3W76A 3IRDA 4WY0F 1O60A 1VPXA 2H6RA 1GWJA 3AJXA 3CHVA 1TPH1 4BI6A 3UZ5A 2QJGA 3MW7A 3I65A 4BWLC 5FEXA 1FDZA 4CCEA 2ZTJA 5G2IA 3N9RA 1KFBA 2C16A 3BV4A 3F03K 2I14A 5U4NA 2NV1A 2QCFA 4OV9A 4AEOA 5EY5A 2H3DA 3R5EA 1XBZA 3W7GA 3MBFA 3WJYA 4AB4A 1KTBA 4AF0B 3L0NA 2B4GA 5MHBA 4AF0A 5LHFA 3CEUA 4UFLA 1LDCA 2E5DA 3PUOA 2OX1A 3LTYA 4RZ6A 1HG3A 5FF0A 2KZHA 1FDJA 3MP5A 3M5VA 4JS3A 3L66A 2FFCA 1VCFA 4MJMA 4QITA 3AO0A 3P62A 1W5QA 1TRIA 2QCNA 3TW7A 3TU9A 1ICPA 2VEMA 4MYXA 4AHQA 4ADUA 4KFNA 1SZEA 3MHGA 5CZTA 2A1YA 3Q58A 1EB3A 3M9YA 2JGYA 4N9CA 1F74A 2GQAA 4NX5A 4HKPA 2YW3A 5LNUA 4A3UA 4C1KA 4DBEA 5HUOA 1JCNA 1PS9A 3E96A 3BLFA 1FWTA 5AB3A 1BTMA 3MJYA 2ISSA 4IUOA 1I2PA 2VKZG 5BOOA 3FJLA 3LOTA 1SFJA 3H55A 1B3OA 3N19B 3TV8A 2OT0A 3HGRA 4UIOA 3B04A 4IGHA 4MFEA 2OZ0A 4FNSA 2E5BA 2P1FA 3JRKA 4JTHA 1S5TA 4GUHA 3HPZA 3TNOA 5AHMA 1H62A 4ONVA 4LW7A 1PCKA 3HQ1A 2YCEA 1LOQA 5I3IA 2CZ5A 2NZLA 4MPQA 2VELA 3W73A 3TJXA 5DBTA 4O50A 3THAA 4UTKA 3L0KA 3QFEA 1NSJA 1G7VA 4NJGA 2YDAA 4B5NA 3HO8A 3BO9A 3WJZA 4OWGA 3QM3A 3FKRA 4OHQA 3O6YX 2GJLA 1VJIA 3HGSA 4IMGA 1OFPA 4BR1A 4HPJA 3UPWA 3QSTA 1H61A 2WNNA 4LC8A 5CZSA 2QJIA 4E38A 3GKFA 5GVJA 1XCFA 4S1FA 4LNYA 5AFDA 1JQXA 4UC5A 1M7PA 2G96A 3NQCA 1FCBA 1GYNA 2X2GA 2Z6JA 2NUYA 1QDSA 3P7YA 5AHNA 4UTMA 2C0AA 2GVLA 1JR1A 5D05A 5LSMA 2J6XA 2Y61A 2QJHA 1LM1A 4O1BA 4WY0B 4WQ6A 4WY0A 2G97A 3M7WA 1K7FA 3W83A 1K8YA 4NX0A 3QMRA 1KM4A 2JKAA 3N34A 2P10A 3QH2A 1KFJA 3W71A 3A5VA 1C29A 1UBSA 1P0NA 2GPTA 4XKYB 4YLWA 3RFAA 4XKYA 2AQWA 2GQ9A 5SWUA 3B0UX 3A23A 2C3ZA 2O7SA 3P67A 2JKEA 1TV5A 3RLVA 3F1QA 4HT3A 4H4IA 1H1ZA 4CQ9A 3PM6A 5DLCA 5AHIA 4ADTA 1TB3A 2Y7DA 1NEYA 5F4WA 2I1OA 5E93A 1W31A 2Z1BA 1SQ7A 4MVAA 4HHPA 2ABAA 1H7OA 2WPBA 1T8XA 1W56A 4NJKA 5AHLA 1Q3NA 5I3KA 5HINA 3LLFA 3ABOA 3C2EA 3G3MA 2A7PA 1KM0A 4N2YA 3BVJA 4FEZA 2ISWA 4UUIA 3GXNA 5AC6A 5F2LA 1SO3A 2R14A 2NWRA 4O13A 3CB8A 2VFIA 1FXQA 3HG3A 3EWBX 3MHUA 5LGZA 3B0VC 4DXVA 1OX5A 4M5PA 3LRKA 3L65A 3DHDA 1NAL1 4LTSA 4N6EA 3NG3A 3G1SA 3MI2A 1QWGA 1LBMA 5F2GA 2H8XA 4RR4A 2A85A 1PHWA 1W37A 3TC6A 5FF3A 1GG1A 3M16A 3CIWA 1R46A 3PSVA 3HG5A 3LI0A 3W7QA 1EP3A 3T78A 3S9YA 1ZCOA 2ZA1A 1GOXA 1H51A 1SW0A 3G0XA 4KWWA 3C6CA 4UNKA 4QISA 3C8FA 1SZGA 1SFLA 4ZL1A 4Z08A 3R2GA 1QNVA 4LU0A 1SW3A 3PUDA 4GXMA 1KM1A 1FDYA 1UUOA 3W86A 4KKXA 4IMCA 4PA8A 3MYPA 4TR9A 2HTMA 1ONRA 1DJQA 2B7NA 3QJAA 2EPHA 4FIQA 1W8SA 5DXYA 4POCA 3LB0A 1R2TA 3HMJG 3NQAA 3M44A 1YXCA 1P1XA 5L6UA 3RLUA 3OVPA 1NVMA 2YPIA 3E9AA 1O5XA 2J88A 1NF0A 3GB6A 5CZ0A 3T40A 4BI7A 3VKJA 1ZY9A 3W7LA 5J5DA 1ME9A 4RXFA 3FS2A 4XTIA 3BG9A 4X3ZA 2RKXA 2JBMA 3DKJA 3VE7A 5G5IA 1TIMA 3NEVA 1TPC1 4JNMA 3O06A 3M6YA 5LNRA 3NM1A 2BXVA 1K7XA 3LCLA 5LZLA 1NF7A 1W3IA 2OJPA 4L4LA 3C3NA 3O6DA 3UWYA 2BLEA 3GDMA 3VCRA 3P5ZA 1VH7A 5AOUA 5BW6A 2X1TA 4RKAA 5K9CA 5F2IA 3S6DA 3UWWA 1EWDA 4O8RA 4GBUA 2V8ZA 4UNLA 4EWND 4K8HA 4XBKA 1EIXA 1VR6A 3C2FA 3L2IA 1MO0A 3PR2A 3BG3A 3TFXA 2X1SA 3N2XA 4DO5A 1DL3A 3TC7A 3TKFA 2CU0A 4LUIA 1DV7A 2BTMA 2ZZ2A 5HWNA 1XM3A 2YW4A 4QNEA 2YR1A 3NPVA 4ZQNA 4LVBA 2OT1A 1P5BA 5LNWA 4FNQA 5DN1A 5HQEA 5G2HA 3IGUA 2G95A 1EWEA 4JTUA 4CNOA 3M5XA 1LRNA 3KAOA 4JTSA 4N4PA 3DH7A 3WJXA 1JCYA 3MI6A 1XBXA 2DU2A 5D04C 3LCXA 4WOZA 5HNRA 1VHNA 3R12A 4CQAA 3DFPA 2FPVA 1PVNA 3B05A 3EX3A 1W5MA 3TJLA 2QKFA 1YTDA 3UNDA 2FPYA 2GVJA 3N3MA 4OE7A 3WK2A 1PHQA 4EF9A 2X16A 4MY8A 1SO4A 1FY6A 1OX6A 3GLCA 4NT0A 1HUVA 2EGZA 3T4CA 1VS1A 4R53A 2LLEA 2V5LA 4O0KA 1FBAA 4CCCA 5F4SA 3EWYA 1XBVA 5H91A 1XXXA 4IMEA 5FF7A 4WOQA 1UB3A 3B06A 5HULA 4ICNA 2E6AA 5BMXA 1DQWA 3C52A 3I7QA 1KW1A 3QPZA 4UXDA 3CC1A 1YPIA 1QPOA 3LTPA 1WOBA 5C5YA 1TPVA 4N02A 3SFKA 5G1YA 2XN0A 4Y9AA 4CCDA 1TPUA 1G6CA 3VE9A 1UASA 3QW3A 4TIMA 5KZEA 1OABA 4U28A 4AVFA 1ZAIA 2HMCA 4JY8A 5D37A 1KLYA 3LDVA 4AHOA 3H53A 4GUJA 3G0UA 4X22A 1A5CA 4ZQOA 1A5SA 1ICSA 2V82A 4FB7A 4O0ZA 3CPRA 3NPUA 1PCWA 3ATYA 1VYRA 1KFLA 4R7JA 3OIXA 4O10A 1VGAA 1HFBA 4GRSA 3CQ0A 3DI0A 3DHFA 1FWSA 4HSNA 1F2JA 1K8ZA 3P84A 2Z2UA 2ISVA 1H1YA 3GR7A 1DBTA 4UTUA 4QJ1A 2VEIA 3LHTA 5K3VA 4EVZA 2Y88A 3MHFA 3A5FA 4NXSA 1MSSA 1H7RA 4S2BA 1AMKA 3UYCA 1C9DA 4K38A 4UR8A 1U83A 2A0NA 4QSHA 2J27A 4YWIA 1KFCA 4LVFA 4N6FA 2PCQA 2WNZA 4KWVA 4HIBA 1F76A 6ALDA 2PRLA 1R2SA 4PL1A 2VFHA 1AW2A 1M6JA 4FX6M 5G1TA 1JCLA 1MEHA 2UV8G 3K30A 4GUIA 4GWEA 3IEBA 2VEKA 3W75A 5FF2A 2NWSA 1G4EA 2ZZ5A 5ABTA 1MEIA 3HIJA 5FESA 1DJNA 4ML9A 4JYEA 5DELA 3M43A 1KM5A 3T55A 3EXTA 3E0IA 2ZRXA 3FYOA 3W87A 2RDUA 1KFEA 3LX9A 2DORA 1H7NA 2Y7GA 3EXSA 3OVRA 1X8FA 2CW6A 2VFEA 3NOEA 3KRZA 3NL2A 5HR6A 1IXOA 2YFNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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