3LM2A

Crystal structure of putative kinase. (17743352) from agrobacterium tumefaciens str. c58 (dupont) at 1.70 a resolution
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
225
structure length
225
Chain Sequence
MAEDQTVLAIDIGGSHVKIGLSTDGEERKVESGKTMTGPEMVAAVTAMAKDMTYDVIAMGYPGPVVHNKPLREPVNLGEGWVGYDYEGAFGRPVRIVNDALMQAIGSYNGGRMLFLGLGTGLGAAMIVENVAQPMEIAHLPYRKGKTYEHYVSEAYREKKGNAKWQKRVQDVVERLSAALEPDEVVIGGGNVERLENLPPKCRRGDNAMAFEGGFRLWKNADLIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Putative kinase
publication title Crystal structure of Putative kinase. (17743352) from AGROBACTERIUM TUMEFACIENS str. C58 (Dupont) at 1.70 A resolution
rcsb
source organism Agrobacterium tumefaciens
total genus 58
structure length 225
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3lm2A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3lm2A01
1NMDA 1DEJA 1NLVA 5BRFA 4IXCA 2WUSA 4IWVA 1X9JA 3LDNA 3A0IX 2FSNA 1KAXA 1JCFA 3MMVA 3U9DA 4H0VB 3MN7A 5AQNA 5KPTA 2I7NA 4BR7A 4BRPA 3CQXA 2HF3A 5AR0A 4BC3A 4B1VA 2QWLA 4O8KA 3VENA 1BA0A 4BRIA 1ZC6A 3WUHA 2GUPA 3CHWA 4K41A 2HF4A 3A5MC 3LDLA 4L3QA 2Q2RA 2FSKA 4BR2A 4K42A 4CBWA 3DAWA 3CI5A 1LCUA 4FSVA 2ZF5O 2V51B 4WQ4C 3GL1A 3ZX2A 1HLUA 4H03B 1ATSA 5AZJB 4FWOA 3WQUA 2ZGZA 5AZIB 1NWKA 4FWRA 3L4IA 1SQKA 1QQNA 2QXLA 3GBTA 4B1YB 3GDQA 4DB3A 3ZX3A 4I6MB 3A5LC 3VEWA 4IZ9A 1EQYA 3FFKB 3MCPA 5FPEA 1NGDA 2P9PB 5ADXH 5E84A 3C7NB 3I33A 5JMVA 2D0PA 1T6DA 4B1WB 3QICA 3ZX0A 3AAQA 3AY9A 4CBXA 5BPMA 3QFPA 1T44A 1NGBA 4A2AA 4BR9A 1K8KB 3O80A 4BRFA 3EKSA 5FPNA 1QHAA 4MLEA 4BROA 3QDKA 4IJAA 4EIAA 3ZEUB 2IVOA 4H0YB 4B1UB 3ENHA 3O8MA 4H5NA 4XH1A 4JNEA 1GLJO 5AQLA 3H46O 4BQZA 3O5BA 1D4XA 4QS9A 1GLAG 4JD2B 3FR0A 3JS6A 2YCHA 3GE1A 1TUUA 5EX5A 1YVNA 3FZMA 2Q1NA 1RGIA 2YHYA 4M7XA 4XEIA 1ZBSA 1BG3A 4FWKA 3BUZB 3I8BA 2P9IA 4PKGA 4BRAA 3CETA 5AQOA 3O6WA 5AQXA 3DWLA 4H0PA 4O5FA 3CIPA 3BP8A 3SK3A 2HOEA 3WEEB 2Q0RA 1IG8A 2FSJA 1X3NA 3FLCO 2GEMA 4NO7A 4FWLA 5AQVA 3ULEB 1CZAN 4BVPA 3U4LA 1MWMA 4GNIA 5AQYA 1TUYA 5AQWA 4CZGA 1GLEG 4EAHD 1MDUB 3KZBA 4RTFD 3L0QA 1KAYA 1YAGA 4BGAA 1NBWA 1S22A 1GLLO 4XH4A 3S41A 3FZFA 2P9KB 5F0XA 5EOYA 4BG9A 3W0LA 5FPDA 1E4GT 1QQOA 4F9OA 3LDPA 3M1FA 4BG8A 5CE3A 5F1XA 1C0GA 4FWQA 3FZKA 3MN5A 2E2QA 4EHUA 2W40A 4WQ5C 4DQ8A 4BC2A 4ISEA 1TYQB 1WOQA 2A42A 3LDOA 3FGUA 5AZJA 3R8EA 4HTLA 4BR5A 4FWSA 5AZIA 4Y0WA 1GLBG 4A62A 4M63C 4BR0A 2OANA 4I6MA 1P8ZA 1JCGA 4IO8A 3H3OB 4FOIA 3KHYA 2P9PA 5JICA 1GLFO 1X3MA 3C7NA 2J4RA 1ATNA 3WXIA 2BTFA 1LOTB 2E2OA 2GELA 3VF4A 3ID8A 3O1WA 4MO5A 1E4FT 1K8KA 2Q0UA 2V52B 3BF3A 4EHTA 3FZLA 3A8YA 2GWJA 3WXKA 2D0OA 4YDUC 1C0FA 1V4SA 3SMPA 1BU6O 1RFQA 2H3GX 3ZEUA 3LM9A 1JCEA 5AFUH 5LJVA 2GTDA 3QB0A 4AM6A 1MA9B 5KPRA 2IVPA 3U9ZA 4LC9B 2AP1A 3WQTA 4JD2A 1S3XA 2QWQA 1GLDG 4BC4A 3CQYA 2A5XA 2P9NB 1DGKN 2D4WA 3UKUB 1BWFO 1HKBA 4BRNA 3EKUA 3M6GA 2EWSA 2BUPA 3ENOA 4CZMA 4ISGA 3A5NC 1HKGA 3VEZA 4BRKA 3W3DA 1SAZA 2NRHA 3SJHA 3RSEB 4QS8A 4H5VA 2E1ZA 3IMXA 3M3ZA 4WQ5A 2E2NA 3WEEA 4FWNA 3L6QA 2D1KA 1BUPA 3ULEA 5AQHA 4CI6A 3H1VX 1J6ZA 4E1JA 2A40A 4B1ZA 3VOVA 1ESVA 5AQKA 4FPAA 2A41A 5AQUA 5KPZA 5AQJA 4CBUA 3A5OC 3O1BA 2E2PA 3G25A 3D2FB 3ZETB 4CD3A 2ASPA 2ZWHA 3QFUA 1XUPO 1RDWX 3GG4A 2E8AA 2YHXA 4WYBA 4PL8A 1QZ6A 3O4WA 2P9KA 5KQ8A 4WQ4A 3H1QA 4BRGA 1QQMA 3BEXA 1BDGA 3DXKB 4DHYA 2NZTA 2F9WA 5AQMA 4BRMA 2QWOA 3D7EO 4H5WA 4YDUA 3HM8A 3MN6A 1U6ZA 3IFRA 3VEYA 1TYQA 2V7ZA 5LJWA 2P9LB 2ASMA 5BREA 2E88A 4EFHA 3VEXA 3WXLA 4BRDA 4H0XB 2QM1A 2P9SB 5EVZA 2QWPA 4A61A 4BQLA 4FOEA 3CJBA 1XQSC 3H6EA 3P4IA 3D2EB 4H5TA 4BREA 5EXWA 4FWPA 5FPMA 2QW9A 3C0BA 3TU5A 4B1XB 4CZFA 4FL9A 3HZ6A 2IIRA 4BGBA 5BPLA 2CH5A 3VF2A 1NM1A 1Z6RA 3CJ7A 1NGAA 1IJJA 3VF6A 1H1VA 3UKRB 3VETA 1V4TA 1BOTO 4XH5A 3HTVA 1XC3A 2NLXA 1U2VB 3CJCA 4C23A 4MLHA 2Q97A 3EN9A 4RCHA 3TPQA 3OHRA 2E1YA 4BVOA 1HJOA 4BR4A 1KXPA 3MN9A 3VPZA 4CJ7A 5BR9A 2QWNA 5TKYA 4H5RA 3CJ9A 2VCPA 1HX1A 1KAZA 3VEVA 4AM7A 2P9NA 3B8AX 1NGCA 3UKUA 5JLFA 1HUXA 5AQGA 5ELZA 1YUWA 4CZLA 5B8HA 1T6CA 5I9EB 4GY2B 4H0OA 4K25A 4JHDB 2CGLA 3H45C 4NB4A 5AQIA 2IVNA 2A6AA 2YI1A 2ZGYA 3WXJA 3IDHA 5LY3A 4BRQA 2W41A 3DJCA 3RSEA 1YXQA 2FF3B 2PBDA 3VGMA 2FXUA 5AQQA 1ATRA 3F9MA 1MWKA 1QZ5A 2YHWA 4BC5A 3BF1A 4FWMA 1NGIA 1WUAA 3EZWA 2VWBA 3MK6A 4QS7A 4IJNA 1HKCA 3O08A 4ISFA 2Q31A 3D2FA 3KVGA 3SLCA 2F9TA 2KHOA 3LDQA 3ZETA 5BRHA 4PKHA 4CZHA 4H0TB 5BN8A 3QBXA 3HSCA 1NGHA 3H3NO 5JLHA 3ATVA 3CJ1A 5BPNA 1GLCG 3QMLA 3DXMA 4A2BA 2A3ZA 3DXKA 3J8AA 5BRDA 3CJAA 4BRLA 3HBTA 4CZJA 3VERA 4CD1A 4RWTA 5AQFA 2YJEA 2PAVA 2CH6A 3MDQA 3UE5A 3R9PA 3VESA 2FF6A 4KBOA 4BRHA 5AQRA 1NGJA 3GOIA 2P9UA 2P9LA 2E20A 1HPMA 4PL7A 5BN9A 2HMPA 4BRCA 2P9SA 3VGLA 3QBWA 2ITMA 3AAPA 4FPBA 3FE1A 5AFUA 2UYTA 1BO5O 3DXMB 5EY4A 3ATUA 3CERA 3AARA 3D2EA 5AQZA 3U8XA 3HI0A 5ADXA 4CZEA 4DCHA 3LM2A 5AQPA 3SMSA 1ZXOA 1R59O 4MO4A 1NGGA 3UB5A 4CZKA 1Q18A 2FLOA 1NGFA 1BA1A 4JN4A 1DKGD 2P9UB 4B9QA 3UKRA 2CGKA 5F2RA 3VGKA 2V7YA 2ASOA 4CZIA 4FO0A 1U2VA 4PKIA 3IUCA 5AQSA 4Z94A 1G99A 2CGJA 2Q36A 4JAXA 2QWMA 1Z05A 4M7YA 2AA4A 2P9IB 3VEOA 1SZ2A 2VYPA 1NGEA 1Y64A 1OKJA 3WT0A 5AQTA 2I7PA 4J8FA 5E26A 4K43A 3FZHA 2QWRA 3EO3A 3JXUA 3R6MA 3LL3A 2YJFA 4HWIA 4JHDA 5KQDA 3EL2A 2DPNA 2GWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FYDA 1NMDA 4KPYA 4PHTX 4KV8A 2VWJA 1JJ2M 2WUSA 4IWVA 4Y1CA 2FSNA 4KHNA 3AV9A 4FK2A 3LANA 3CXCM 3J81O 5CHIA 1U48A 1MU2A 2HBLA 4M3WA 3CFOA 3MN7A 2I7NA 4A5AA 4BC3A 2QWLA 3AVAA 5LL6Z 4JKAA 4E89A 3VQ5A 1HQEA 2GUPA 3A5MC 4JV5K 4BR2A 4CGJA 2LSNA 3L3VA 4KH5A 1DLOA 2ZF5O 2V51B 5JS2A 1RT6A 2VWKA 3ZX2A 4BWJA 3KD1E 1ATSA 4FWOA 1Q8IA 1Q82O 4FWRA 4CECA 1QQNA 2QXLA 5KRSA 1W7AA 4B1YB 4JRQA 3AO4A 3OBYA 3A5LC 3K9KA 3EY1A 3D6RA 5FPEA 5ADXH 1IKXA 4BE2A 2D0PA 4I9LA 3ZX0A 3NAEA 3AAQA 4MDBA 1P90A 3F73A 2KFNA 1ASWA 4CHPA 4BR9A 1K8KB 3O80A 4YOWA 1UWBA 4IOCL 2NRTA 4AF1A 4B1UB 1XWLA 5AQLA 3H46O 1SKRA 4WE1A 4QS9A 1SL0A 4JD2B 1REVA 3VQ9A 1ASVA 4RW9A 2YCHA 4DKWA 1IKYA 2ZJRL 1RGIA 1Q9XA 4JRPA 2BGGA 1BG3A 1U49A 3BUZB 4B9UA 3T1YK 3KKSA 3CETA 2NUBA 5AQXA 4H0PA 4DTOA 5KI6A 3C6UA 2O8FA 4BDYA 3VQDA 3WEEB 1JLBA 2Q0RA 3ULEB 4FWLA 4W5TA 4BVPA 3L2WA 3PLAA 3NGZA 1TV6A 5AQWA 1KFSA 4KI4A 3B6OA 4EAHD 1MDUB 1K6YA 1ZBIA 4CJLA 3NCIA 4RTFD 4M45A 4BGAA 3ZLJA 4DS4A 1GLLO 4XH4A 1RDAA 2YHAA 5F0XA 2P9KB 4FJMA 1C0MA 3VQ8A 4FLWA 1U45A 5FPDA 3V4IA 5GIPA 1QQOA 3A2FA 3BDPA 4BG8A 3SQ2A 1C0GA 1HNVA 1TVRA 3FZKA 5JS1A 1CLQA 3MEDA 1IBMK 2W40A 4BC2A 4ISEA 1LAVA 1RTDA 2KQ2A 3QEVA 4FWSA 4DTSA 1GLBG 1XHXA 3AVLA 1ZYQA 3HK2A 3VTIA 4J2EA 1C1CA 2OANA 4I6MA 3L2UA 1JCGA 4IO8A 3PX0A 3C7NA 2J4RA 3DOKA 4C8MA 4CGGA 5HRPA 4E1MA 4C8NA 5CYQA 1JL2A 1HNWK 4PUOA 3ID8A 2KZZA 4FM2A 4O0JA 2HHQA 1VSHA 3DRSA 1RDUA 3KLEA 4AH9A 4KHPK 4LH5A 1YJNN 2KTQA 2V52B 3BF3A 4EHTA 2D0OA 4DV2K 4CGDA 4DSKA 3ZEUA 4B8AB 4FVMA 4AM6A 4QCLA 2IVPA 1BQMA 3U9ZA 3SAHA 2AP1A 3WQTA 4ICLA 3H08A 2QWQA 2E6LA 5AJ3K 4DQQA 3D0PA 3V9XA 2O8DA 4JEPA 4FJGA 1HKGA 3VEZA 2X6SA 4KI6A 4CJFA 1HMVA 3RR8A 3SNNA 3BY5A 1U47A 2VQFK 4FWNA 4CGIA 3CCUN 1BCMA 3ASMA 4WFNL 4Z4EA 4A5BA 4OKJA 3PO4A 1C1BA 4OLBA 2WONA 1HNIA 5KPZA 3MWPA 5J2MA 4L8RB 1FK9A 1IBKK 2HBMA 3SQ0A 3KLFA 1QSYA 1RDWX 2OCEA 3DMJA 5KQ8A 3O4WA 3SAFA 2HHTA 4BWMA 4BRGA 1GOAA 1QQMA 2NRZA 1BDGA 3F2KA 4DHYA 4HVJA 1XNRK 1VQ5N 4WF9L 2YNHA 2QWOA 3KLHA 3AVCA 1WSHA 3C6TA 3D7EO 4H5WA 2G8IA 3DRPA 4CIGA 2O8BB 1TYQA 2YHBA 2V7ZA 1VRUA 2P9LB 3VQ6A 3SQ4A 3ITHA 4H0XB 4DTNA 2P9SB 1J5EK 4A61A 2KZMA 4KH4A 1FXXA 1IV0A 5JVGL 1E3MA 2G8FA 1Q81O 4JKHA 4FLYA 5EXWA 1YIJN 1A5VA 2Y1IA 1RDCA 3AVBA 3VQ7A 4A59A 3HZ6A 2UUCK 2IIRA 5M1QA 2RHKA 2CH5A 1BIZA 4FLTA 3VF6A 4W5NA 1O13A 4M41A 3VETA 4XH5A 3HTVA 3M5RA 1U2VB 5HRRA 1NJWA 3T19A 2WTUA 1I94K 1EWRA 5DM7L 2Q97A 3KK2A 3EN9A 4RCHA 4PQUA 4NCGA 2E1YA 5KGXA 1HJOA 4BR4A 1EO1A 1KXPA 3VPZA 5TKYA 3CCSN 4OPAA 2ETJA 3C65A 1KAZA 3QNNA 2E6MA 3M8PA 3U3GA 3TI0A 4KTZA 1WLJA 3MXIA 4DR4K 4OVLA 4GY2B 1CZ9A 1YT3A 3IAYA 2OPQA 5AQIA 3MWTA 2ZGYA 3WXJA 4J2DA 3IDHA 4BRQA 4CEOA 3NH0A 3NDKA 2OZSA 4FXDA 2WFBA 3C95A 3G10A 3RSEA 1YXQA 1VSLA 1S72N 3TTFA 2VG5A 3VGMA 2FXUA 5AQQA 3VQQA 3ULDA 1ATRA 4W5RA 4KB1A 1VQ6N 5C24A 1RBUA 4DSIA 3CMAN 2O8CB 3BF1A 4FWMA 3OYAA 1EETA 1OH6A 1RT2A 1WN7A 2HBJA 3G71N 4IJNA 1UA1A 4WCEL 5IT9O 1ASUA 1HKCA 3O08A 2Q31A 4N47A 3LDQA 4CF0A 4H0TB 3LAKA 3HSCA 4LF5K 4FK4A 3ATVA 5I42A 4JKDA 5CYMA 4PY5A 1SKWA 4BRLA 4B3MK 4CD1A 3CC2N 2G8KA 4DR1K 1RBTA 2BANA 1HJRA 2PAVA 3VESA 3L2RA 1CXUA 2HMPA 1QVFM 1WSGA 4JK8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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