3LOTA

Crystal structure of protein of unknown function (np_070038.1) from archaeoglobus fulgidus at 1.89 a resolution
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
DDVVIVTCAITGAIHTPSMSPYLPVTPDQIVEEAVKAAEAGAGMVHIHARDPKDGRPTTDVEVFRYICREIKKQSDVVINVTTGGGGTLGIPVEERAKVVPALKPEIATFNMGSMNFAIHPLLKKYKEFKYDWEPEYLEMTRDIVFRNTFKDLEALSRIFKENDTKPELECYDIGQIYNTAFMFHEGYLEPPLRLQFIHGILGGIGTAVEDVLFMKQTADRLIGRENYTWSLVGAGRFQMPLGTLAVIMGGDVRVGLEDSLYIERGKLAKSNAEQVEKMVRIVKELGKRPATPDEVREILGLKGKERVNF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structure genomics, unknown function
molecule keywords uncharacterized protein
publication title Crystal structure of PROTEIN OF UNKNOWN FUNCTION (NP_070038.1) from ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS at 1.89 A resolution
rcsb
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 107
structure length 310
sequence length 310
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05853 BKACE beta-keto acid cleavage enzyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3lotA00
2QJIA 5HULA 1D3HA 1LDCA 5HR7A 2A4AA 1TTIA 4W9TA 1Q6LA 3W7MA 3WK1A 4NXSA 4XBSA 3C2VA 3PULA 2GJLA 4I7WA 3IVTA 4Z1AA 5HQEA 3UY7A 2BWGA 3UWQA 3KVMA 1FQ0A 4MFEA 3K30A 4JX5A 5AC8A 1XBXA 1YLVA 5E93A 3CEPA 3A24A 3E0IA 1CW2A 4YCPA 1XC4A 3NL2A 1G6CA 1SR9A 3NA8A 3TSMA 3TJLA 3LHZA 3GX9A 2BLEA 1ICQA 1LTDA 3NQDA 3OEXA 1VR6A 5DBTA 4DELA 4WJEA 5KSWA 1QOQA 3G0XA 4AB4A 1TPVA 4S1FA 4JTIA 2ZRVA 3CT7A 3O63A 3DXIA 2DJLA 1LROA 1FCVA 1GEQA 3NAVA 4O4VA 1T99A 4GUHA 3O06A 2E5DA 1XM3A 3MP3A 3M47A 3CTLA 1NF7A 4LWWA 2V2DA 3EXRA 3WK2A 3HG3A 1JUEA 3C4UA 3MI6A 2OX1A 3SR7A 5LHEA 2CZFA 2Q8LA 4K8EA 4O16A 4E2BA 4GBUA 3LTSA 3T7VA 2OT1A 4HSNA 2BTMA 3EEGA 3CB8A 2C13A 1EEPA 4LRSA 4NNAA 4MZ1A 4NQ1A 1BWLA 2NV1A 3LDVA 1M6JA 5D2XA 5DCEA 2E5BA 2V81A 1H7OA 2NX3A 4MY1A 3R12A 3DI1A 2QCHA 2RKXA 5G4WA 2WKJA 3RF9A 4Z1CA 3W7IA 1I2QA 3EWBX 2B7OA 1LRQA 4O0ZA 1SPQA 1DBTA 1IXPA 1EP2A 3C3NA 4LV4A 5D30A 1DQWA 4PC8A 3IIZA 3BG9A 3UWVA 3NEVA 1VQTA 4FXSA 1LBFA 4JGDA 4MY9A 4FB7A 4HN4A 5HR6A 3LERA 4XKYA 3I7RA 3C2FA 4XZ9A 4JTHA 2VENA 4K37A 2XFWA 2VC6A 3S0CA 1VS1A 1J2WA 3W85A 1FDYA 1TIMA 4UTWC 3TXVA 2OJPA 3L21A 1LLWA 3M5ZA 4OGZA 1EUAA 3TU9A 3AJXA 5G5IA 3UD6A 5CZSA 2A5HA 3G24A 1OFBA 3QPYA 1H63A 3UQNA 3CLMA 2PURA 1VZWA 1SU5A 1I2OA 4A3UA 3P8IA 3GLCA 1XDMA 2QJGA 3W7LA 3NQ8A 3SZ8A 4I7UA 4OV9A 2QCDA 5AHNA 1AMKA 3O6CA 4CQAA 3GNDA 1L6YA 3W7JA 1MEWA 2B7PA 4K8HA 4M7TA 5CPLA 2WSRA 3G1HA 3W87A 5LNSA 2RDTA 2DZVA 4RXFA 3BLIA 4IUOA 2V5BA 3CWNA 2EHHA 4Y8FA 4XKYB 1A5AA 2FQIA 2DP3A 4O10A 3OVRA 1FWSA 5DN1A 2QCMA 1WV2A 4QSHA 1A5CA 1UB3A 4FEZA 1A50A 4UFHA 4CNOA 3V1PA 3PC0A 5AYYA 3B05A 1K8XA 3GAKA 2HSAA 1KM3A 1TV8A 4R7JA 1FCQA 3A5VA 3M5VA 1PE1A 1XUZA 1IXQA 1TPC1 1Z41A 4O1CA 4FF7A 5TBOA 1XI3A 3LHTA 4KFNA 3HQ1A 2A21A 3FA5A 3NVTA 3PVFA 1GVOA 5IBXA 2QCDB 3E12A 1D9EA 4GXMA 2DORA 3W2UA 1O4UA 5U4NA 4AF0A 1GQNA 5EA9A 4LVFA 2CLLA 1OABA 2BXVA 4QJ1A 4BWLC 4PA8A 2ATMA 1I45A 4AHPA 3USBA 3T55A 2GQ8A 5LZLA 3TCEA 3NR0A 4QAIA 3MJYA 2RDWA 2D73A 5AHLA 3QC3A 3DI0A 2H90A 4RJEA 2VELA 1JRBA 3MI3A 3TJXA 3TSBA 5E0KA 3NO5A 4FHAA 1FXQA 5LNRA 2VEKA 3W07A 1LRNA 4JDYA 5DXYA 3O8AA 5D32A 2YCEA 5KZEA 5HINA 3RNDA 5K4XA 3S1VA 4X3ZA 1OX5A 3HF3A 3DKJA 4PTNA 4N9CA 3TDFA 3W7NA 3NPVA 1KV8A 1KTBA 1K7EA 5DY3A 1OFAA 4XWUA 2Y7DA 2WJZA 4BI5A 1NAL1 1KFLA 4AF0B 2ZZ2A 3PB2A 4JEQA 1PV8A 5G1TA 1WYIA 4ADUA 4O52A 3LXBA 1R30A 4LTSA 3PG9A 1KFCA 1LM1A 4XTDA 3QMTA 4WY0A 3I65A 1W5QA 3CPRA 4G1KA 3QZEA 2ZA2A 3L5LA 4GUJA 3W7QA 4RZ4A 5DY2A 3W75A 2A7RA 1WOAA 3STCA 1LBLA 3B4UA 1PVNA 2GJNA 3S5NA 1W5NA 4Y6GA 3W1MA 2FIQA 3PY2A 2X1TA 2QCCA 3FJLA 3P7YA 1MZHA 4J9JA 1HO1A 2R8WA 1P0KA 4FO4A 5TQLA 5GVJA 3W22A 4TMCA 2YX0A 2ZA1A 4UMAA 3UPBA 4ZQPA 2ZYFA 1GTHA 1TPWA 3S5YA 4AWSA 4UFMA 5I3HA 2NXIA 3LI0A 3N3MA 2WNZA 2BX7A 5HJLA 1FUYA 4K6AA 4LVGA 1FDZA 2NWSA 3A5FA 3P62A 4N4QA 4JDBA 1MEHA 3DGRA 4CQ8A 3GDTA 1J5TA 2C6QA 5BRBA 3NQCA 3W74A 3G1FA 3FJ6A 3NQVA 2VEIA 4O53A 1SZGA 4DQWA 1TCDA 4WY0B 1ML1A 3PS7A 3KOFA 1TJPA 1ZJIA 2VOMA 2VFDA 1W5MA 2FPVA 3IGSA 3LV6A 2EAWA 4MYAA 3QFEA 1H7RA 3NM1A 1DV7A 1EWDA 1LRTA 5K9XA 1WQ5A 2DJXA 1X1ZA 2ZTJA 3IEBA 2GUUA 4HT3A 3T78A 3RLUA 2CZEA 4DF0A 1CI1A 1EWEA 1F6PA 4H6KA 4Q32A 2FLIA 5AHMA 3SGUA 3ZR4A 5HNRA 4AAJA 3EX1A 4LVDA 4IMGA 4MPQA 1KA9F 2NX9A 2PRMA 3STEA 1H7PA 1SSGA 4CNNA 4HNTA 5LSMA 2OCZA 1QPQA 2FB2A 4GUFA 1AL8A 3GB6A 3MW7A 1I2NA 5AYXA 3RLVA 1OYCA 5LGXA 3B04A 1UJPA 3DHFA 3TROA 3ABSA 3WK3A 2X2GA 4UIOA 3DFTA 4A2SA 1TMHA 1SO6A 4LNYA 3TC7A 3HGSA 1OX6A 3TV8A 5HWJA 2ZZ5A 2PCQA 1QMLA 2VXNA 4NNCA 4Q4KA 3W1QA 5C5YA 2G96A 3CIXA 4A2RA 3BLEA 1OFEA 3ATYA 1M7PA 2Y63A 4LVBA 1XUUA 3R8RA 1N8FA 3N19B 3W2NA 4JY8A 2WSQA 3QYQA 1JCYA 2Y62A 3L5AA 4QNWA 3UPWA 5C6MA 3W1AA 2NUWA 2EGZA 4O1BA 3QMSA 3ZWSA 3EX4A 1P1XA 3KAOA 1YDOA 4IJBA 1VCVA 5TIMA 4FNQA 1SO3A 3B0PA 4UTJA 3P67A 3NZ1A 4P2VA 1QOPA 1ME9A 1VPXA 3CEUA 4UNLA 3WJXA 2JGYA 4O50A 3G8RA 1OYBA 1H60A 1QAPA 3TSDA 5K2ZA 3QSTA 3EWYA 3IV3A 1JQVA 3MO7A 4IX0A 3W2MA 1BTMA 1JRCA 2YR1A 1B3OA 5D33A 3VI2A 1W31A 3A9IA 1H5YA 3STGA 4S2CA 1WA3A 1IIGA 4GFSA 3OVPA 4ML9A 3OBKA 3GYEA 5IM51 1K3UA 3WJZA 3GIYA 1TPB1 1NSJA 4JNMA 1XXXA 2GVLA 3L0GA 1DVJA 1N7KA 2Z0IA 3HO8A 4L4MA 4OU1A 4ZZ9A 2KZHA 3LCFA 4RZ6A 2CZ5A 3LCLA 2XN2A 4C1KA 4CCDA 1OK4A 4XBKA 2XN1A 3QW4B 4ICNA 1ALDA 4AHOA 5AC7A 3S8HA 2P10A 4LC6A 3QQ1A 3W7OA 2QR6A 1P4CA 5D38A 3IIXA 3TX9A 1Q6RA 1TSIA 1S5VA 4JTTA 3BK0A 3IVSA 4UTIA 2H3BA 4EF9A 4JTJA 2B7QA 3PUOA 4LT9A 2WSYA 3UYCA 3W84A 3H54A 5FEWA 1OVDA 1HUVA 5F2MA 1G4SA 2HTMA 3KX6A 4PH6A 2I14A 4AH7A 3DFSA 3TQKA 1O5XA 5I3FA 3C0JA 3KRUA 3UZ5A 2A6NA 1OHLA 4B5NA 2QEZA 3KXQA 4UUIA 1NFBA 3HB9A 2E6YA 1PHQA 4XTIA 1ZY9A 4OBTA 4NT0A 3NQGA 5D2WA 4A29A 4E2DA 2E6DA 3I6RA 3BO9A 2ISWA 4E0CA 5BW6A 2TPSA 1GZGA 2ZRYA 3INPA 1FCBA 4RR4A 1B9BA 1RQEA 4JY9A 1JCLA 3UXAA 3F4WA 4RLIA 1HG3A 4UTKA 1XFBA 2VKZG 3OIXA 1PHWA 4PL2A 2QCGA 1Q6OA 1B57A 1HL2A 3ABRA 2JBMA 1TQXA 3M41A 3IIOA 3W23A 2WO5A 1KM4A 1Y0EA 1F6KA 2J9YA 3W7HA 2CZDA 2GVGA 5K4ZA 3L67A 5FF0A 3FLUA 1PCKA 2OMAA 4NZFA 1Z48A 4DO4A 5F4SA 5EL1A 1LCOA 3E02A 1KFBA 2A6LA 2A7NA 5FF4A 3G22A 2E5CA 1N55A 4TO8A 2W79A 4LS1A 1W54A 3BW2A 3TFCA 2Y6ZA 4JYEA 3L68A 5I3KA 2Y88A 1G4EA 4ORIA 2B7NA 3NGJA 4MUZA 3TMQA 2V82A 4ALDA 1OF8A 3EKLA 4FNSA 1LBMA 5CG7A 1F7BA 4UTHA 3CU2A 3TMLA 3VE9A 3E96A 3O05A 3M6YA 1DQXA 2WNNA 4Z1DA 1TV7A 3QSRA 4ZQCA 5KMYA 4DPQA 5K3VA 1G67A 4Z0JA 5KZDA 3G1SA 1KFEA 4JR5A 2BSLA 1F5ZA 1RD5A 2V2CA 2A2IA 3NNTA 3PBYA 2OZ0A 1FWTA 3ZS4A 1FDJA 3FFSA 4N2YA 4O1AA 1K02A 4MFDA 4ZMGA 6TIMA 1G7UA 2QUUA 2HMCA 2YFOA 5AN7A 5D09A 3UY8A 2CU0A 4RZ5A 1OG0A 1TRIA 4RCXA 3P60A 3MBDA 4JTUA 3D0CA 1GVQA 5DELA 1YYAA 3DBPA 4AWUA 5FESA 4HKPA 1W0MA 5AC6A 3TIMA 1ZAIA 4IMEA 2R14A 1PCWA 2C1HA 1SFLA 4WY0F 1UCWA 3NPUA 4L4LA 2DZWA 3PBWA 1OYAA 4HNVA 2EF9A 3SGZA 3W76A 1THFD 2B0MA 1XBVA 1P5BA 2NUYA 4K38A 3EWUA 2NV2A 3W7DA 4HPJA 2X16A 1GVFA 2RDUA 4WD0A 4RKAA 4UTLA 4A22A 1FWWA 4HHPA 2V5LA 1AW2A 5FF2A 5ABTA 3SW6A 2FFCA 1NF0A 1XBYA 3L0NA 2NLIA 1L2UA 3N9RA 1AK5A 1BKSA 2VEMA 1QR7A 1SSDA 5FEXA 4NNBA 4ZL1A 5BMWA 2I9EA 4DO5A 2ZCGA 5F2LA 1ICPA 5D37A 3B0VC 3NM3A 1NEYA 3MBFA 3VCRA 2A7PA 1L6SA 1GG0A 3QH2A 3M0ZA 3G0SA 3P5ZA 4LW7A 1W3IA 3W7RA 3GXTA 3S1WA 3MHUA 1W3NA 3DZ1A 2Y7GA 4DF2A 4FNTA 3PWAA 1XDLA 5DCBA 3S1UA 3GDMA 2EKCA 3O6DA 4D2JA 2CW6A 1M7OA 1TPUA 2FPTA 1GYNA 4O1DA 1KTNA 4IOTA 1WAUA 1OX4A 1GJPA 2JK2A 1XCFA 2W0UA 2H8ZA 4IX2A 2HS8A 5D05A 5F4XA 3T4CA 5C55A 3SFKA 3BGJA 2YYUA 2GOUA 4Z0SA 1IIHA 4PODA 2Y89A 2DZSA 1LLZA 2I1OA 2FDSA 5C54A 2FTPA 4POCA 3W1XA 2RH9A 3KRSA 1KW1A 4UFLA 1TTJA 5G2HA 3UWZA 4BI6A 3W73A 2ISSA 3FKRA 4JIPA 5EPDA 1JCJA 3LHVA 5EY5A 4PCFA 3WK0A 1W5OA 4RXGA 2O7QA 2QAFA 2CLIA 3M16A 4JTLA 4YXGA 2A1YA 3TQ0A 4U28A 3TE9A 5AHFA 3PR2A 4HNNA 1JJKA 4GUIA 5CSSA 1K7XA 4IPIA 1RV8A 2AAMA 1B4EA 4YMZA 3GZ3A 4UNKA 5KTLA 3NZRA 1EPXA 1ME7A 4MJMA 4X9SA 4AWTA 1T96A 2E09A 2E6FA 1FY6A 1OX4B 3M43A 2NZLA 1WXJA 2NXGA 4P61A 2VEPA 4XUGA 4ZQOA 5IBXC 2G95A 5CPMA 3CC1A 5K9CA 3TAKA 4EF8A 3NL6A 2ZFAA 5J5DA 4ZQNA 3NDOA 3U6WA 4FX6M 4KFPA 4MZYA 2GQAA 4UFIA 5KITA 3KVKA 4IPJA 3NL3A 3QPZA 1VYRA 1VGAA 1JULA 1TYGA 1SO4A 2YZRA 1KM0A 2Y70A 3PM6A 5LHFA 3L0KA 4DF1A 1TPH1 4MZ8A 1YPFA 1R2RA 1RVGA 1SQ7A 3MYOA 2ZZ3A 2VFHA 3UWUA 3KVJA 4IMDA 4QITA 2X30A 1GT8A 4M6VA 2DZPA 1GWJA 3BVJA 3LHUA 2J9ZA 2Q3OA 2CLMA 1LZOA 4JTSA 4Y96A 1X1OA 8TIMA 3LM7A 4M19A 3MYPA 4O19A 2NX1A 4UTTA 4IXXA 2PRLA 4JYFA 1PS9A 1RR2A 4AEOA 4UTUA 3FIGA 1OFOA 3UZJA 1S3HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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