The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNIKTAWEKIGSHGGEYGAEAVERMFLGFPTTKTYFPHFDFTHGSEQIKAHGKKVSEALTKAVGHLDDLPGALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLANHHPSEFTPAVHASLDKFLANVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Crystal structure determination of Lepus europaeus 2.8 A resolution
rcsb |
| total genus |
54
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-02-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2VRY A; 1J7Y A; 1YEN B; 1V5H A; 1BUW B; 1CH4 A; 2DN3 B; 1F5P A; 1LFQ B; 1BZ0 A; 3QZX A; 3G4R A; 3BA2 A; 3A2G A; 1MLM A; 1V4U A; 3OGB A; 1YEU A; 5ILR A; 1MOB A; 4MQG A; 1O1P B; 1HGC A; 2D2M A; 1Z8U B; 5CND A; 5HLQ A; 2W72 B; 3HHB B; 4MQH B; 1GCW B; 1NIH A; 2PGH B; 3UHC A; 1XZU A; 1HAC B; 1Y5K B; 4M4A A; 2G0Z A; 4H2L A; 2YRS A; 3OVU C; 4H07 A; 1Y8H A; 1PBX A; 1FN3 A; 3IXF A; 1QI8 A; 1QPW A; 4DWU A; 2ZLV A; 2ZFO C; 2EKT A; 4XS0 B; 3VRF A; 1VWT A; 4TYX A; 3UBV A; 1Y4F A; 3BOM A; 5EQM A; 1HDA B; 1UX8 A; 1YG5 B; 1O1K B; 4AVD A; 3K3U A; 3GLN A; 3LB2 A; 4IRO A; 3GKT A; 1NGK A; 1Y0A B; 3NL7 B; 2VYW A; 1MLG A; 5ILP A; 4HRT A; 3QM5 A; 2XYK A; 1CPW A; 3ZJH A; 3GKV A; 2V1K A; 1GBU A; 1GVH A; 101M A; 1JWN A; 3UHK A; 1VXH A; 1G08 A; 1X9F A; 5KKK A; 1URY A; 1MKO A; 5HU6 B; 1YCA A; 5E83 A; 2R4Z A; 4HHB A; 2D5Z A; 4UZV A; 1J7Y B; 1DWT A; 3NFE A; 1G09 A; 1RTE A; 1GZX A; 3MOU A; 1BZ0 B; 4G51 A; 1V4U B; 5M3S A; 1YEU B; 3WR1 A; 4MQG B; 107M A; 1Y4Q A; 1HGC B; 4NXA A; 2KSC A; 2D2M B; 3UHQ A; 1MTK A; 1FSX A; 1VXG A; 3U3E A; 5CHR A; 2ZT1 A; 1K0Y A; 1NIH B; 4WJG 1; 1Y09 A; 1Y8K A; 1XZU B; 1YHR A; 4M4A B; 1LH5 A; 1B0B A; 1XZV B; 4H2L B; 2YRS B; 5ILM A; 3MYN A; 1PBX B; 1FN3 B; 3EOK A; 1QI8 B; 3UHR A; 1Y45 A; 1QPW B; 4DC7 A; 4H0B A; 3MJU A; 2W31 A; 2ZLV B; 3VRF B; 2D5X A; 1VWT B; 2SPL A; 2LH3 A; 1Y4F B; 1J3Y A; 3BOM B; 6HBW A; 2V1F A; 2V1H A; 1RQA A; 1G9V A; 1CIK A; 3WCW C; 3V2V A; 3ONZ B; 1N9H A; 4G1B A; 4IRO B; 3GQP B; 2QFN A; 2FAL A; 4HRT B; 2EKU A; 1LH3 A; 2MGG A; 5D5R A; 1MWC A; 2FRJ X; 4PNJ A; 1HBG A; 1Y0C A; 5MBA A; 3UHN A; 3ZOL A; 4ESA A; 1YOH A; 1DUK A; 3UH6 A; 1Y2Z A; 1JP6 A; 3UGZ A; 1CMY A; 1AZI A; 1JDO A; 3ZJJ A; 5CHQ A; 1X9F B; 1MKO B; 1I3E A; 1HBA A; 3LHB A; 4HHB B; 3NFE B; 1G09 B; 2ZLT A; 3OK5 A; 3A5B A; 1GZX B; 1GJN A; 2GTL C; 3UI0 A; 1Y4Q B; 1DXU A; 3ZH0 A; 1FSX B; 1K0Y B; 2VM0 A; 2DHB A; 1NEJ A; 1Y09 B; 2MGH A; 2CMM A; 1Y8K B; 1KR7 A; 1YHR B; 1F5O A; 1MOA A; 1H97 A; 1EWA A; 1MYJ A; 2ZT2 A; 3NG6 A; 2NRM A; 1Y7C A; 2MBW A; 4ZVA A; 2ZSP A; 3ZJL A; 3O7N A; 1MWD A; 3EOK B; 1Y45 B; 4C0N A; 3MJU B; 1NXF A; 5CN7 A; 2HHD A; 103M A; 1J3Y B; 1Y4P A; 5HAV A; 4G1V A; 3A0G A; 1A9W A; 6HBW B; 1HAB A; 1XZ2 A; 2ZLW A; 1A9W E; 1RQA B; 1LFZ A; 1G9V B; 4FH7 A; 2AUR A; 1HV4 B; 2AUQ A; 1Y4R A; 3HF4 B; 2G12 A; 1DO4 A; 1D8U A; 3QJD A; 1YHU C; 3G53 A; 5D1V A; 3PIA A; 1O1M A; 1BZR A; 3R5I A; 1SHR A; 1NQP B; 1Y0C B; 4ESA B; 2VYZ A; 1HDS A; 2QSP A; 1CMY B; 2VEB A; 2W6W A; 4KJT A; 2M6Z A; 3LQD A; 1HBA B; 5JDO E; 3OO5 A; 1Y22 A; 5SW7 B; 1DXD A; 1DTI A; 5HLX A; 2ZLT B; 2HBE A; 3RGK A; 3UHT A; 2O5B X; 1XXT A; 1DLY A; 2ZSS A; 4ZVB A; 4NK2 A; 1XYE B; 5EUI A; 3ZJI A; 3PI3 A; 3AQ6 A; 5EV5 A; 2DHB B; 3AQ8 A; 1NEJ B; 2G0V A; 2ZLX A; 1A3N A; 3NG6 B; 1N9F A; 3HC9 A; 1DUO A; 1Y7C B; 3AT5 A; 1JL6 A; 2ZSO A; 2DN2 A; 3VRE A; 4O4T A; 5HBI A; 2OHA A; 3UHB A; 3ZJR A; 2HHD B; 2H8D A; 2MGA A; 3GYS A; 3ED9 A; 4ILZ A; 1Y4P B; 1KFR A; 3A0G B; 1Y4V A; 3WFX A; 1HAB B; 1XZ2 B; 2ZLW B; 1MLL A; 4HRR A; 3MBA A; 2MGJ A; 2AV0 A; 1LFZ B; 111M A; 3ORD A; 3PT8 A; 1Y4R B; 1VRF A; 3WCU D; 3QJD B; 1O1L A; 1M6M A; 2XKI A; 2ZS0 B; 1YIE A; 1YHU A; 5CN5 A; 3PIA B; 1O1M B; 2RI4 B; 5C6E A; 1SI4 A; 3R5I B; 1SHR B; 1J41 B; 3CIU A; 1CBL A; 4MQC B; 1HDS B; 2ZST A; 2LH7 A; 2Z8A A; 1MBS A; 2QSP B; 4DC8 A; 5F2A A; 3LQD B; 1YFF A; 2MYB A; 3S1J A; 1YMA A; 3OO5 B; 1Y22 B; 3M3B A; 1XZ7 B; 1CBM A; 1A4F A; 4MXL A; 1YZI B; 2ZWJ A; 3WCV B; 1NZ3 A; 2HBE B; 3S65 A; 2G14 A; 1N9X A; 1XXT B; 3UHV A; 1JF4 A; 1A0U A; 3HEP A; 2WY4 A; 5EUI B; 1JF3 A; 3G4W A; 1RPS A; 2HHE A; 1MYG A; 3ARK A; 5CNB A; 1HGB A; 3UH7 A; 1JZM A; 2ZLX B; 1A3N B; 4YU4 A; 3OJ1 A; 3AT5 B; 3PI2 A; 1A6M A; 2DN2 B; 3VRE B; 1SDK A; 2ZS1 B; 4N7P A; 1BZZ A; 1YCB A; 4XDI A; 3GYS B; 2H8D B; 4U8U D; 4BJA A; 1Q1F A; 3MKB A; 5JGG A; 1Y4V B; 1VRE A; 2FRI X; 1Y85 A; 1J3Z A; 2Z6S A; 3PT8 B; 2V1E A; 1UMO A; 1O1L B; 2OIF A; 1YIE B; 1YHU B; 2HZ1 A; 5C6E B; 1SI4 B; 4FH6 A; 5CN8 A; 2BLJ M; 1Y4B A; 2LH1 A; 1ECA A; 3V2Z A; 2XKG A; 1R1X A; 3BCQ A; 3WCT D; 2D2N D; 2VHB A; 1JW8 A; 1YE0 A; 2VLX A; 1CG5 A; 2B7H A; 2GRZ A; 1F65 A; 2O5O X; 1YFF B; 3S48 C; 1JPB A; 4L2M A; 1WLA A; 3EDB A; 4GZG A; 1YOI A; 1VXB A; 5MBN A; 3PI8 A; 1A4F B; 3SDN A; 1J3F A; 3S65 B; 3D1A B; 1NWI A; 3KMF C; 1C7C A; 1BJE A; 4DWT A; 1A0U B; 3HEO A; 4NS2 A; 1MBI A; 1RQ4 A; 1MLF A; 4F68 A; 1RPS B; 1BAB A; 2HHE B; 3ZHW A; 1HGB B; 4YU4 B; 1KD2 A; 1JEB A; 1SDK B; 2DC3 A; 1MBC A; 2QSS A; 1Y7G B; 3A9M A; 4N7P B; 5JGG B; 2HZ2 A; 3D4X A; 4ROM B; 1J3Z B; 1C7D B; 1MCY A; 1MLN A; 1IWH A; 1O1O A; 1C40 B; 2MYA A; 3B75 A; 3GQR A; 3P5Q B; 4MQI B; 1HBS A; 3DUT A; 1VXE A; 4LPI A; 1Y46 A; 4B3W A; 1Y4B B; 2D6C A; 1R1X B; 1B86 A; 1HGA A; 3QM7 A; 1ABW B; 1YE0 B; 2VYY A; 2QU0 A; 4TWU A; 2HCO B; 2R1H A; 1CG5 B; 1Y0W A; 1LH2 A; 1ECN A; 108M A; 1GBV A; 1BZP A; 3W4U A; 1DTM A; 3PI8 B; 2ZSR A; 1RQ3 A; 2EB8 A; 3GOU A; 3UHD A; 2BNL A; 3ZJQ A; 4JYQ A; 1R1Y A; 3OZV A; 1RQ4 B; 1YGD A; 1U7R A; 3OO4 A; 1BAB B; 2G0X A; 3S1I A; 5AZR A; 1UC3 A; 3QJC A; 3DHT A; 1HSY A; 2AA1 A; 2ZT4 A; 2FRK X; 1Y8H B; 2GRH A; 4NXC A; 1DLW A; 1XCH A; 1JEB B; 1YOG A; 5KDQ A; 1CH9 A; 1MLQ A; 1YE2 A; 1W92 A; 2QSS B; 2D2M D; 2GL3 A; 1HJT A; 2ZFO A; 4O35 A; 3PT7 A; 4F6I A; 1NZ2 A; 1WVP A; 4X0L A; 2Z85 A; 1O16 A; 1QSH A; 5B84 A; 1Y7D A; 1JP8 A; 1MLK A; 3D4X B; 1GDJ A; 1IRC A; 1RSE A; 2HBG A; 1U7S A; 3UHZ A; 1VXC A; 1IWH B; 4NZI A; 1MYH A; 4NI0 A; 1O1O B; 3GK9 A; 4M4B A; 2MGC A; 3B75 B; 3GQR B; 4WCH D; 3WHM A; 2BW9 M; 3DUT B; 2V1G A; 1FDH G; 3LB4 A; 1Y46 B; 2C0K A; 2HHB A; 3GKV B; 1GCV A; 2R80 A; 1B86 B; 2ZLU A; 1GBU B; 4WJG A; 1HGA B; 1BIN A; 3E5I A; 2QU0 B; 1SDL A; 2R1H B; 3VRG A; 1RVW A; 1Y0W B; 1UVX A; 1F63 A; 5CN4 A; 1G08 B; 4OOD A; 1QXE A; 2MHB A; 2EVP A; 5EE4 D; 3A59 A; 1GBV B; 5E83 B; 3W4U B; 1NS9 A; 3IC2 A; 2D5Z B; 2E2Y A; 3UHS A; 3UHU A; 1NAZ A; 1RQ3 B; 1A00 A; 4G51 B; 3GOU B; 5KER A; 3WR1 B; 2R4X A; 1XZ5 A; 2O5Q X; 3ECX A; 1BZ1 A; 1Y35 A; 1X9F D; 3D17 A; 4FWX A; 5JOM A; 1R1Y B; 1PMB A; 1YGD B; 4MU5 A; 3OO4 B; 2LH5 A; 3QJC B; 3DHT B; 1S56 A; 1MZ0 A; 3AG0 A; 7HBI A; 3MN0 A; 1HLB A; 4U8U C; 1GDK A; 3GQG A; 1MBA A; 2AUO A; 3A5A A; 4NK1 A; 2Z6T A; 1YE2 B; 1QXD A; 2GLN A; 2D5X B; 2ZFO B; 1GDI A; 4X0L B; 1S0H A; 3AQ5 A; 5EYJ A; 1QSH B; 1Y7D B; 4O2G A; 1YIH A; 2QFK A; 1BBB A; 1J52 A; 1LFT A; 3WCW A; 3BJ3 A; 2NX0 A; 4B4Y A; 3H58 A; 1NZ4 A; 3K9Z A; 2MGD A; 3WCP A; 4NI0 B; 1HBR A; 4FC3 A; 4M4B B; 1LHT A; 1O1J A; 3WHM B; 1IBE A; 1IRD A; 2MYC A; 3WCT C; 2LHB A; 2D2N C; 2GKN A; 1RTX A; 2HHB B; 1GCV B; 2R80 B; 1QSI A; 1EMY A; 2IG3 A; 4KMV A; 1Y2Z B; 1SDL B; 3VRG B; 1RVW B; 5HLU A; 4VHB A; 1MDN A; 1QXE B; 2MHB B; 4HSX A; 2BKM A; 1MOH A; 3A59 B; 4F69 A; 3IC2 B; 4O1T A; 5HY8 A; 1C7B A; 3G46 A; 1MYZ A; 4MQJ A; 4MPM A; 1A00 B; 3GDJ A; 5KER B; 2GKM A; 2GTL A; 1XZ5 B; 1EBT A; 4PQ6 A; 1DXU B; 1BZ1 B; 2HBF A; 1Y35 B; 3D17 B; 3AQ7 A; 3LR7 A; 3G4V A; 1MWB A; 2NSR A; 4C44 A; 1CP0 A; 2QLS A; 104M A; 1HDB A; 1HBB A; 3VAU A; 1ECO A; 1K1K A; 3GQG B; 2W72 C; 1MYI A; 1M6C A; 3HRW A; 4MQK A; 2MB5 A; 1ASH A; 1A6K A; 1QXD B; 1LH7 A; 3ZJS A; 1A6N A; 1MNJ A; 1FCS A; 1S0H B; 2O5T X; 5B85 A; 1YIH B; 1YVT A; 1BBB B; 2MGM A; 1Y31 A; 1LFT B; 3WCW B; 4F6B A; 3BJ3 B; 4ODC A; 1HBR B; 4FC3 B; 3UHI A; 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1V4X B; 1YEV B; 1LFV A; 1O1N A; 3LR9 A; 4MBA A; 1BVC A; 1FAW A; 3IC0 B; 1YEQ B; 4F6D A; 1JY7 B; 1Y8W A; 5EOH A; 2HZ3 A; 2R50 A; 3WFW A; 3S66 A; 3ARL A; 1CG8 A; 4N7N A; 3M39 A; 2H35 B; 1M9P A; 1MBN A; 3ARJ A; 1O1I B; 1LA6 B; 1Y4G B; 3E55 A; 1BIJ A; 3IA3 B; 1BZZ B; 4ROL A; 3MKB B; 2W6X A; 1XZV A; 1Y85 B; 1V9Q A; 2RAO A; 3WTG A; 1S5Y A; 1HCO B; 3HYU B; 3QZZ A; 3QJB B; 3QQQ A; 5CNC A; 5E29 B; 4KN3 A; 1G0A A; 5F0B A; 1CO9 A; 3AT6 A; 1LFL B; 2AUP A; 1Y0T A; 4F4O A; 2BLH A; 1Y5F B; 3ONZ A; 1MLH A; 2MGB A; 2DXM B; 4TWV A; 3BCQ B; 1A01 B; 1JL7 A; 3GQP A; 4YU3 B; 1MNI A; 2B7H B; 1AJH A; 3UHW A; 4OF9 A; 1XZ4 A; 1MNO A; 4QAU A; 2OLP A; 1MBO A; 1DO1 A; 2SPN A; 1NPF A; 4F6F A; 2QMB B; 1CH1 A; 4N7O B; 2ZSZ A; 1GLI B; 3ODQ A; 1AJ9 A; 3EU1 B; 2O5L X; 1YHE B; 1LFV B; 2GDM A; 1O1N B; 1C7C B; 3KMF A; 2VLY A; 4NI1 A; 1CIO A; 4AVE A; 1FAW B; 2HBS A; 2G10 A; 1ABY A; 1Y8W B; 3CY5 A; 2VLZ A; 3S66 B; 1CLS A; 3HXN A; 1CG8 B; 1H1X A; 1Y5J A; 2OHB A; 1CQX A; 4N7N B; 2O5S X; 1M9P B; 3R0G A; 1HHO A; 1Y01 B; 2PEG A; 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