The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
ELVLALYDYQEKSPDEVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
|
| publication title |
Understanding the polymorphic behaviour of a mutant of the alpha-spectrin SH3 domain by means of two 1.1 A structures
rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
10
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2C0T A; 2CH4 W; 2EKH A; 2RF0 A; 3ZL7 C; 4CC2 A; 2M0Y A; 2AKL A; 1T3L A; 3ULR B; 2KYM A; 4J9E A; 1I07 A; 2O2O A; 1YCS B; 1ZX6 A; 1KIK A; 2BZ8 A; 2NWM A; 1AVZ C; 1PRM C; 1AEY A; 2K6D A; 1PNJ A; 4Z89 A; 1AWX A; 3QWX X; 4DEY A; 1OOT A; 2DX1 A; 2A28 A; 1AZG B; 1G2B A; 4ORZ A; 2EYW A; 1FMK A; 2A37 A; 1LCK A; 1WXT A; 4RTY A; 4D8D A; 1JU5 C; 4AFS C; 1QKW A; 5IXB A; 1CKA A; 3VS7 A; 3VS2 A; 5IXF A; 2DRM A; 1N5Z A; 1GFD A; 2DF6 A; 3VS3 A; 2LMJ A; 1JQQ A; 1JXO A; 4KRT A; 3QWY A; 4CC3 A; 4Z8A A; 2KBT A; 2AKK A; 2H8H A; 3UA6 A; 1YP5 A; 2HEQ A; 3A98 A; 1FYN A; 1GCQ A; 2LX7 A; 3H0I A; 2DL8 A; 4Z88 A; 1X69 A; 1X6B A; 2ESW A; 2FG0 A; 1KSW A; 1NLO C; 2DMO A; 2EGE A; 2EBP A; 2MIO A; 2DE0 X; 1W70 A; 3M0U A; 1W6X A; 2KR3 A; 2O9V A; 3M0T A; 2EW3 A; 4RTT A; 1K0X A; 3SHW A; 1S1N A; 1U06 A; 1ZUK A; 2ED1 A; 2F2V A; 1M8M A; 2KNB B; 2RQW A; 1RUW A; 2F2W A; 2GTO A; 5GJW B; 2SEM A; 1E6H A; 1SHG A; 2A08 A; 1PRL C; 2D0N A; 1VA7 A; 1GL5 A; 2CSQ A; 1H3H A; 1HJD A; 2KXC A; 3TSW A; 1TUC A; 1KFZ A; 1HD3 A; 1K1Z A; 1K76 A; 1SRM A; 2K9G A; 3VS4 A; 2IIM A; 2O88 A; 1TG0 A; 1VYU A; 2GQI A; 4RTZ A; 4ESR A; 3JV3 A; 1QCF A; 1YWO A; 2DM1 A; 4CC7 A; 3VRZ A; 1GBQ A; 2L3Q A; 1ABO A; 4RTW A; 2JW4 A; 1PKT A; 2CDT A; 2JTE A; 1GBR A; 2K2M A; 2YUO A; 2JS2 A; 1T0J A; 4JZ3 A; 1BBZ A; 1MUZ A; 1QWF A; 3LH5 A; 2V1R A; 2JM9 A; 2PTK A; 1TUD A; 1H92 A; 1EFN A; 2QDL A; 1ZLM A; 2M51 A; 1M3C A; 2EPD A; 1UG1 A; 1ZBJ A; 1Z9Q A; 1UJY A; 2JS0 A; 1T3S A; 5FWC A; 2J05 A; 2YUQ A; 1AWO A; 2J7I A; 2J6O A; 3SEM A; 2D8H A; 2P4R A; 4JJC A; 1SSH A; 1VYT A; 3O5Z A; 3KFV A; 4E6R A; 1BB9 A; 3TSZ A; 2BZX A; 1WA7 A; 2ROT A; 2NUZ A; 2DLP A; 2CSI A; 1X2Q A; 2RN8 A; 2K3B A; 3RBB B; 2EGA A; 5FWB A; 3REA B; 1AD5 A; 4CC4 B; 3VS6 A; 4OMQ A; 3H0H A; 2B86 A; 1I1J A; 1WLP B; 4J9G A; 3UAT A; 1K9A A; 1WX6 A; 1NLP C; 1HSQ A; 1SEM A; 5IH2 A; 2KGT A; 2DL5 A; 2LP5 A; 1PHT A; 2GGR A; 3I5S A; 3NMZ C; 1NEB A; 1U3O A; 4JJB A; 3UF4 A; 3TVT A; 2DL4 A; 1YN8 A; 2GBQ A; 2MOX A; 2FPE A; 4HVV A; 1M30 A; 4OMO A; 2LJ3 A; 2OI3 A; 2F2X A; 2D1X A; 2FRW A; 4D8K A; 2FPF A; 2JMA A; 2DL7 A; 2FO0 A; 3REB B; 1WYX A; 1M3B A; 4FSS A; 1NEG A; 4HXJ A; 2RMO A; 2HDA A; 1UHF A; 2DYB A; 2LZ6 B; 2LQN A; 4RTU A; 1G83 A; 1AWW A; 3EG1 A; 1JXM A; 2K79 A; 2EVR A; 4AFQ C; 1M27 C; 2VKN A; 4LN2 A; 3EG3 A; 1A0N B; 2AZS A; 2HBW A; 2E5K A; 1QKX A; 1H8K A; 2JT4 A; 3CQT A; 3I5R A; 2DRK A; 1UEC A; 1E7O A; 4OMM A; 2KT8 A; 5IHK A; 1GCP A; 2PZ1 A; 2DIL A; 1CKB A; 1K4U S; 1J3T A; 1BK2 A; 2CRE A; 1K0S A; 1QLY A; 2J6K A; 4JPB W; 2YUP A; 3VS0 A; 2BZY A; 2LJ1 A; 1X43 A; 1ZSG A; 4AG2 C; 2HCK A; 1OPK A; 1GRI A; 1UDL A; 1KJW A; 4R0K A; 4J9C A; 2MCN A; 2YSQ A; 2OAW A; 1SPK A; 2I0N A; 1CSK A; 5I22 A; 1UE9 A; 1NYG A; 2DVJ A; 2JXB A; 3PE0 A; 3GBQ A; 2ECZ A; 4GBQ A; 3EG2 A; 1ZUU A; 1X6G A; 2OJ2 A; 4J9I A; 2YDL A; 2L3P A; 3NGP A; 4J9F A; 4F17 A; 3H41 A; 4J9D A; 4GLM A; 2DL3 A; 2KRM A; 2O9S A; 3H0F A; 4RTV A; 5ECA A; 1W1F A; 5EC7 A; 1Y0M A; 4AFZ C; 1WIE A; 2KE9 A; 4IIO A; 1UFF A; 2KRN A; 2EGC A; 5I11 A; 3EGU A; 2KT1 A; 1YNZ A; 2FEI A; 2SRC A; 4AFU C; 1NG2 A; 1I0C A; 2EYY A; 4EIK A; 5L23 A; 2C0I A; 3THK A; 4M4Z A; 4AG1 C; 1IO6 A; 4IIM A; 2A36 A; 2DJQ A; 1OEB A; 2K7A A; 1OV3 A; 2V1Q A; 1UJ0 A; 4A63 B; 1YWP A; 1NM7 A; 2C0O A; 2KXD A; 1ZUY A; 2YUN A; 2D8J A; 1B07 A; 2RPN A; 1X2K A; 4OMP A; 2EQI A; 2RQV A; 2ENM A; 2RNA A; 1XOV A; 2RQR A; 1U5S A; 2W10 A; 2ED0 A; 2JMC A; 3IQL A; 3M0Q A; 2FRY A; 2EYX A; 3NPF A; 4Y92 A; 2AK5 A; 1PWT A; 4JJD A; 1WI7 A; 2JM8 A; 4HVW A; 3RNJ A; 1WFW A; 4LE9 A; 4DEX A; 2EYZ A; 2RQT A; 5IHI A; 4OML A; 4QT7 A; 1AWJ A; 1BU1 A; 4JZ4 A; 1WXB A; 2CUD A; 1UTI A; 1AZE A; 2W0Z A; 5HCK A; 1JEG A; 2XMF A; 1MV0 B; 3VRY A; 5IHN A; 2ROL A; 1MV3 A; 2CT4 A; 1QWE A; 1M3A A; 2CUB A; 3EHQ A; 3C0C A; 2G6F X; 1E6G A; 2X3W D; 2FPD A; 4F16 A; 2KYB A; 4F14 A; 1JO8 A; 2L0A A; 1UHC A; 5FW9 A; 1UGV A; 2YT6 A; 3M0S A; 1RLP C; 4HVU A; 3U23 A; 4K11 A; 3NHN A; 5GJV B; 1V1C A; 4HCK A; 1VYV A; 1Y57 A; 2L2P A; 2LNH B; 1WXU A; 2CT3 A; 4LUD A; 3UA7 A; 1UUE A; 1ABQ A; 2DNU A; 2ABL A; 2O31 A; 2KEA A; 4X1V A; 2L3S A; 2LQW A; 3EHR A; 2J6F A; 1ARK A; 2KRO A; 2BTT A; 4LUE A; 1B3Q A; 2CH4 A; 3M0R A; 2J06 A; 3I9Q A; 3VS5 A; 4RUG A; 1Z9Z A; 2X3X D; 2LCS A; 2AZV A; 2PNI A; 1AOJ A; 4J9H A; 1GFC A; 4OMN A; 4J9B A; 4ZNX A; 2KRS A; 1SHF A; 1OPL A; 2HSP A; 3R6N A; 1RI9 A; 3VS1 A; 4WCI A; 1PKS A; 2VVK A; 2RQU A; 3FJ5 A; 1WDX A; 3PVQ A; 4LNP A; 2DBK A; 3I35 A; 4RTX A; 2GTJ A; 3M0P A; 1RLQ C; 2GNC A; 1NYF A; 2DA9 A; 2LJ0 A; 3PVL A; 1SRL A; 1T0H A; 3EG0 A; 1GCQ C; 2DBM A; 1X27 A; 2VWF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CCQ T; 4KUD K; 2E1H A; 4HCB A; 2HQH A; 4Y28 E; 2DTO A; 2AKL A; 1T3L A; 5D7U A; 3ER0 A; 3QDR B; 2HQE A; 3EH1 A; 4M77 G; 1AVZ C; 4XTW A; 4M78 D; 3JB9 I; 1MND A; 4Z89 A; 1AWX A; 5LJ3 h; 1AT1 B; 3OYM A; 2DX1 A; 4OF1 A; 5I21 A; 1AZG B; 3X25 B; 1G2B A; 4J6W A; 5KE3 A; 1ZSZ A; 5AT1 B; 1TH7 A; 5KYX A; 3L42 A; 3BDU A; 3BDL A; 2K5I A; 3VS7 A; 3VS2 A; 3GOX A; 5FU6 C; 2KY9 A; 1JBM A; 1FMW A; 4C5I A; 1HYO A; 1N5Z A; 4M75 C; 2DTH A; 1JQQ A; 5GAO l; 4KRT A; 5DM7 R; 4M7D B; 5LJ5 h; 5FU7 B; 2AKK A; 3M58 A; 4CI0 C; 1LVK A; 3UDC A; 3EAE A; 4QQG A; 4PJO A; 2M02 A; 1R8O B; 1VQ8 A; 1X69 A; 1X6B A; 4LDW A; 2FG0 A; 1KSW A; 2DMO A; 1B34 A; 2EBP A; 3NFC A; 3DLM A; 3LYI A; 1KQS A; 4C8Q D; 2OTJ T; 3RKY A; 2P0K A; 1VQN A; 1S1N A; 2HMA A; 2K3X A; 1M8M A; 2VYT A; 4JLG A; 5CO7 A; 2GFA A; 1IHW A; 1SHG A; 1RAH B; 4C8Q E; 3G6E A; 1VA7 A; 3PTA A; 1N6A A; 1GL5 A; 2CSQ A; 5FU6 B; 3TSW A; 1TUC A; 3QXE B; 2K3Y A; 4M75 B; 1N8R U; 4HT9 A; 1IB8 A; 2RHI A; 4LDY A; 1M1G A; 3JV3 A; 1GBQ A; 2EFI A; 1X01 A; 1VQM T; 2HNI A; 4II1 A; 3WVE B; 1T0J A; 1MUZ A; 1Q86 C; 5HK0 A; 1EFN A; 1OU8 A; 3CCV T; 2EPD A; 1UG1 A; 4C5G A; 5GAN e; 5KH6 A; 1BCO A; 1Z9Q A; 2QK0 A; 5KYU B; 4MDW A; 3QJY A; 1AWO A; 3SEM A; 2D8H A; 2C06 A; 1VQ6 T; 4IUR A; 3CME A; 1VYT A; 2BZX A; 1VUB A; 2ROT A; 2NUZ A; 3OYB A; 4J5Y A; 1WHM A; 2K3B A; 5GAN 7; 2LC4 A; 3RBB B; 3C12 A; 5FWB A; 4Z02 A; 5FLX E; 5IN1 A; 2AIR B; 2CP2 A; 2E64 A; 4CC4 B; 2RM4 A; 3EG9 A; 1YHQ T; 4J9G A; 3UAT A; 4KT0 E; 2LP5 A; 2GQV A; 3I5S A; 1NEB A; 4JJB A; 4MZP A; 2FPE A; 3M57 A; 3CMA A; 1D1C A; 4PJO E; 2LJ3 A; 3GNG A; 2OI3 A; 2F2X A; 4HA8 A; 2FPF A; 2M16 A; 4XU0 A; 2FO0 A; 3REB B; 5LJ3 j; 1IRX A; 1F1B B; 1WGS A; 2QTX A; 2RJD A; 1WQ7 A; 3CXC S; 4L6V 5; 1RI0 A; 2CP0 A; 4C92 F; 3OS1 A; 2RMO A; 2HD0 A; 2LTO A; 1YI2 A; 2HDA A; 3OA6 A; 4A54 A; 1VQ8 Q; 1UHF A; 2RI5 A; 2MPX C; 4RTU A; 2LT4 A; 1D0X A; 4LN2 A; 4DOV A; 4C0D C; 4E7J A; 1H8K A; 2DFU A; 3CQT A; 1VQN Q; 1E7O A; 3DLL A; 5LJ5 j; 3JRZ A; 2KT8 A; 2NUP A; 2K5F A; 1M1K C; 5IAY A; 3L2Q A; 4M7A G; 4R55 A; 4FT2 A; 1K4U S; 5GMK e; 3N5B B; 3SWN A; 2CYZ B; 1K9M C; 1IXD A; 2J6K A; 4RCB A; 4F7U A; 3MET A; 3L2W A; 4AG2 C; 3I56 T; 2HCK A; 3OB9 A; 4NL2 A; 1WHJ A; 3HRS A; 1GXI E; 2ZGW A; 5HKC A; 4ZTF A; 4PL6 A; 2JVV A; 3EG2 A; 2LDM A; 4C0D B; 4PK4 A; 4F17 A; 4RG2 A; 3F70 A; 2O9S A; 4J6Y A; 2DET A; 2DD5 A; 3TRE A; 4FYY B; 5EC7 A; 2IPO B; 3OYN A; 4M77 D; 3PMI A; 4JDS A; 3UT1 A; 2E41 A; 4N4H A; 2KRN A; 2RHU A; 1XQH A; 4XK8 E; 5I11 A; 3EGD A; 2KI7 A; 3JCM b; 2FEI A; 2MWP A; 4XU1 A; 1I0C A; 4JRI A; 5L23 A; 3CME Q; 2C0I A; 1VIE A; 3JCM J; 1K73 U; 3LGF A; 1IO6 A; 2KK4 A; 5GAM d; 1U1T A; 2COY A; 2K7A A; 1XNI A; 4BI3 A; 1UJ0 A; 4A63 B; 1VQ4 T; 1VIF A; 3CCS Q; 5A2Q E; 1YWP A; 1NM7 A; 2MWO A; 1ZUY A; 2YUN A; 2D8J A; 3EGX B; 1B07 A; 2H3E B; 2RPN A; 3L2Z A; 4D6W A; 1QVF A; 4E7Z A; 2ENM A; 1RAA B; 2RK1 A; 3MP6 A; 4BAC A; 3WXM B; 4A4F A; 1KK7 A; 3V7S A; 3IQL A; 2W10 A; 2QQA A; 2JMC A; 1IRE B; 3DB3 A; 4HVW A; 3RNJ A; 1WFW A; 4ZGE B; 3CMA Q; 4XU2 A; 2EYZ A; 5IHI A; 4OML A; 4M7D G; 4QT7 A; 3WVD B; 2E4H A; 5J26 A; 1UTI A; 2CP5 A; 5HCK A; 1R0B G; 2QDY B; 2DK3 A; 1FX7 A; 3G7Z A; 3C0C A; 1E6G A; 2X3W D; 2FPD A; 2NUP B; 1ZBX A; 4F14 A; 1N8R R; 1JO8 A; 4GLK A; 1UHC A; 1X75 C; 3JB9 G; 2RA2 A; 4HVU A; 4IUQ A; 1I8F A; 5GJV B; 3OS2 A; 4F7U E; 3CCQ A; 5GAN f; 4M78 F; 5A0G A; 4E7K A; 1QW1 A; 2DZ9 A; 4EMH A; 4XTV A; 3SFM A; 4X1V A; 5I2S A; 3M4Y A; 3EHR A; 1FMV A; 3CC7 Q; 4JS5 A; 2CZ0 B; 3JB9 J; 2EJF A; 3JAM E; 1YIJ T; 2LQK A; 4LUE A; 1M90 U; 2MMP A; 2CH4 A; 1KD1 U; 1Z9Z A; 5KYW A; 2YRC A; 1AOJ A; 1MMD A; 4X9C A; 4C92 C; 4JLI A; 4J9B A; 4PNO A; 3OYE A; 3S3M A; 2KRS A; 4VUB A; 2E12 A; 1OPL A; 3EGD B; 1TOV A; 2QQB A; 4WCI A; 2KAF A; 3GLX A; 3A1P A; 2QA4 T; 3CC4 T; 1OI1 A; 3M0P A; 1NYF A; 3A8O B; 4LDU A; 3JCM c; 1SRL A; 2JNG A; 2BIV A; 4C8Q F; 1WHH A; 2CP6 A; 3V8L A; 2CH4 W; 1WHL A; 3OYA A; 3ZL7 C; 4CC2 A; 2M0Y A; 2NUT A; 3ULR B; 2RI3 A; 2KYM A; 2OTJ A; 1QVF P; 2O2O A; 1YCS B; 5GAM f; 1TS9 A; 1NE8 A; 1KIK A; 2BZ8 A; 2NWM A; 2XID A; 2RJE A; 5FRN A; 4KH1 B; 4C92 B; 4O5V A; 4QVD A; 1PM3 A; 2VGM A; 4ORZ A; 1LCK A; 4PJO G; 1QKW A; 3NTK A; 1RAF B; 2YLC A; 2KSS A; 2DRM A; 4J7I A; 1VQM A; 4E7H A; 3VS3 A; 5KCH A; 2H8H A; 4BI4 A; 3UA6 A; 1PD0 A; 3A98 A; 4N4I A; 2RHY A; 2DL8 A; 4M7D A; 1Q82 U; 3CCV A; 3JCM X; 1YIT T; 3KUF A; 4QKU A; 3M9Q A; 4M7A D; 5GAN g; 2CZ6 B; 5CIU A; 1R77 A; 1W6X A; 4N0A C; 3P8D A; 3LH0 A; 3O8V A; 2WSC E; 2EW3 A; 1K0X A; 3SHW A; 1VQ6 A; 2ED1 A; 1SSF A; 2L5Q A; 3T9N A; 1R0C B; 3OY9 A; 2GTO A; 5GJW B; 6AT1 B; 4E2F B; 3LWH A; 3M55 A; 2D0N A; 3CCQ Q; 1H3H A; 2KXC A; 2EJ9 A; 5CKH A; 1PCX A; 2YWW A; 5KYW B; 4DA4 A; 2K9G A; 1PD1 A; 1C6V X; 5GAO p; 1FXX A; 1YHQ A; 4OB1 B; 4CC7 A; 3HFO A; 3VRZ A; 2L3Q A; 4M75 A; 1EZZ B; 2D9T A; 2JW4 A; 1D3B B; 2JS2 A; 4JZ3 A; 4PLL A; 1QWF A; 3L1A A; 4B9X A; 2JM9 A; 3MPU B; 1TUD A; 3CBO A; 1NBE B; 3OMG A; 3M56 A; 1ZLM A; 4IUV A; 1K73 R; 3I55 T; 1M3C A; 2CZ7 B; 3G71 T; 1OX8 A; 1ZBJ A; 2WSE E; 5LJ3 e; 1UJY A; 2JS0 A; 3H8Z A; 2I2L A; 2NUT B; 3SDZ A; 5CQX A; 2J05 A; 3VYG A; 2J6O A; 4UC4 A; 1KQS S; 8AT1 B; 4QVC A; 1KQ1 A; 2RJF A; 3BY7 A; 4M78 C; 3JCM Q; 5GAM g; 4JJC A; 5KYU A; 3O5Z A; 3TSZ A; 2ZAE A; 1X2Q A; 3MEW A; 4EMK C; 1M8V A; 2PU9 B; 2QEX Q; 1JJ2 S; 5LJ5 e; 2EGA A; 4HKE A; 4FCY A; 4XTX A; 3REA B; 2OTJ Q; 1AD5 A; 3M4G A; 2R57 A; 3H0H A; 3OW2 A; 4KUI A; 1I1J A; 1M4Z A; 1W2B S; 1K9A A; 2QAS A; 1G5V A; 2RHX A; 1NLP C; 1HSQ A; 1X6O A; 4M7D D; 2QQS A; 1QVG S; 5IH2 A; 2DL5 A; 1PHT A; 1SKU B; 3JCM e; 1RAE B; 1U3O A; 3UF4 A; 3BE3 A; 3TVT A; 2MOX A; 3S3O A; 4HVV A; 5EG2 A; 3CCU T; 3I56 A; 4M7D E; 1NPR A; 2D1X A; 3A8H B; 1JB0 E; 1VQM Q; 1RAI B; 5D6X A; 3JB9 D; 1I81 A; 2JMA A; 4JS4 A; 1WJQ A; 2F5K A; 2LCL A; 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