3M0Z | Genus

Total Genus 92

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	92
sequence length	248
structure length	248
Chain Sequence	NAMKLTPNFYRDRVCLNVLAGSKDNAREIYDAAEGHVLVGVLSKNYPDVASAVVDMRDYAKLIDNALSVGLGAGDPNQSAMVSEISRQVQPQHVNQVFTGVATSRALLGQNETVVNGLVSPTGTPGMVKISTGPLSSGAADGIVPLETAIALLKDMGGSSIKYFPMGGLKHRAEFEAVAKACAAHDFWLEPTGGIDLENYSEILKIALDAGVSKIIPHIYSSIIDKASGNTRPADVRQLLEMTKQLVK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	putative aldolase
publication title	Crystal structure of putative aldolase from Klebsiella pneumoniae. rcsb
source organism	Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae
total genus	92
structure length	248
sequence length	248
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date	2010-03-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07071	KDGP_aldolase	KDGP aldolase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3m0zA00

5D03A 4UTIA 5EMUA 2VEPA 2NUYA 3W1TA 4L4LA 1YADA 1TTJA 1HUVA 4UFJA 3UPWA 4FNSA 3IV3A 3TK7A 1GT8A 2V82A 3L9CA 4LVGA 1LRTA 4HT3A 3IIVA 2QR6A 4NQ1A 3GDRA 2Q8LA 1R2RA 4PTNA 3N9RA 3QC3A 3NA8A 3HBLA 2ZRVA 4HNUA 5G2WA 1M7OA 5K9CA 1S3HA 3LXAA 3TAKA 2P1FA 4IXXA 3W7GA 4EIVA 1ICPA 1GVRA 1QNVA 2QCFA 5AHEA 3CEPA 2ZZ6A 3SIZA 2G5WA 1TRDA 3EWBX 5LHFA 2HMCA 1ICSA 1JCYA 2JGYA 4ZMGA 3CIWA 3RK8A 3THAA 4JTFA 4UTTC 2CLEA 5AYZA 2X16A 3YPIA 1D3HA 3DI1A 1IXPA 4IMFA 3KAOA 3KOFA 3MW7A 3IVUA 4AWSA 3EWWA 3NL2A 4M6VA 2ISSA 3STCA 5EBUA 1C9DA 3SW6A 3EKZA 4FX7A 3RU6A 3QMSA 1FX6A 4OE7A 4H3DA 4WY0F 3UXDA 4WOZA 3WJXA 3T4CA 3HPZA 1FWWA 2E77A 5J5DA 3S5ZA 2Y61A 3UWWA 1K8ZA 1FCUA 4QSHA 2QCEA 5AC8A 4U4MA 3W9ZA 3O16A 4RLIA 3GX9A 5FEWA 1VLIA 1ZALA 1LZOA 2GVLA 3TXZA 4ORIA 4GFSA 2P0OA 2V9DA 5BMXA 4GNJA 2I14A 5CPMA 4POCA 1QPNA 1SU5A 4UXDA 1DJQA 3PULA 3VKJA 3PF3A 1ZY9A 3ABRA 2A5HA 2VKZG 1CW2A 3NOEA 3PVFA 4JN6A 4FXRA 4O17A 3CM4A 3UD6A 1MXSA 2PE4A 3W75A 3S5OA 1DQXA 4XWUA 3RMJA 5IBXC 4NXKA 2GQ9A 3LRMA 3BPWA 3FYPA 8TIMA 1OK4A 3LBMA 2NWSA 5BW6A 1K7EA 4LRTA 1L6WA 2HS6A 3TUUA 3EXSA 3PBWA 4MLJA 2FB3A 1H7RA 1NVMA 1Q45A 3LCHA 4AB4A 3MBFA 4R34A 4H6KA 1N8FA 4JX6A 1A53A 1JCJA 3CIXA 2CZDA 1GWJA 1FUYA 3GKAA 4EVZA 3M44A 3TC6A 4PCFA 1OX4B 3ELFA 1SO4A 1LBLA 3GLCA 3L66A 3QRHA 2DZTA 1QFEA 4BFAA 2NV2A 1L2UA 4ZZ9A 1YPIA 1BKSA 4JDBA 3LRLA 3C2EA 1IXOA 3AO0A 2C15A 4PA8A 1WA3A 3HG2A 3BGGA 3L21A 4KWWA 5AN7A 3ABOA 1KM4A 1H1YA 3IVTA 1EP2A 1YYAA 5T26A 2FDSA 5I3FA 3MHUA 5F4XA 1KM5A 1TYGA 4JTLA 3W1NA 4RK8A 1OK6A 3E0IA 3STGA 3HG3A 2GUUA 2QUVA 4AHQA 2YR1A 3Q37A 2WKJA 1ML1A 1T8XA 5C54A 3QH2A 2KZHA 2WNZA 3W1PA 1L6SA 4O0KA 2GOUA 2X1UA 3QW3A 3NQDA 1W31A 3R89A 4YCOA 2EAWA 5HWJA 2A6LA 4P61A 2HSAA 4CCDA 2PRHA 4IWWA 1VYSX 4N9DA 3LCIA 4PC8A 3SR7A 4ALDA 1LRNA 1QOPA 1JULA 5G4WA 4O16A 1EWEA 1DHPA 1QAPA 3HB9A 1XCFA 2FPYA 1TPDA 1GJPA 1I2RA 5KINA 4M5PA 3M1ZA 2A0NA 3LLDA 5ABTA 2QF7A 4FX6M 3QYQA 1OF8A 2DORA 2H6RA 2ZTJA 4JTJA 1V7YA 3C61A 5D2XA 3GNNA 3N14A 3B06A 3IEBA 3W70A 1KLYA 4MJZA 2VFIA 1RPXA 1YTKA 1B4KA 3I7SA 3SFKA 1O95A 3C56A 3DHFA 4FNTA 2VEMA 3GZ3A 4GUHA 1XKYA 1FCBA 1TTQA 3DGRA 4UTJA 2WO5A 4ADUA 5IM51 4E2BA 3N2XA 3LHYA 3G1SA 3WK0A 3S1UA 3W7KA 2F7FA 4QISA 1OHLA 3FEMA 4Y90A 2YW3A 4JTTA 1SZGA 4QNWA 3CEUA 4LNYA 3K30A 4OHQA 1S5WA 2R91A 1XI3A 4OWGA 5TIMA 3WK2A 3A9IA 1PV8A 3GYEA 4ML9A 3LCFA 3W2UA 5D05A 3G3DA 4IMGA 4Z1CA 3W1RA 4E38A 4UCGA 1O94A 3F4WA 3GDMA 2QUTA 2ZZ5A 4JTIA 2YFOA 2TRSA 5FEPA 4WD0A 5HQEA 2VXNA 4KFPA 3N34A 3PUDA 2GJNA 4UFLA 4MY1A 4JYFA 2CLFA 2ZRZA 3O05A 3O6CA 3P60A 3W7NA 1A50A 4O1AA 2CW6A 4JX5A 2ZBTA 4RXGA 1G69A 1GG1A 3IVSA 2WV8A 1ZFJA 2WQPA 3C3NA 4BI5A 3QSRA 4JYDA 1BWLA 1QOQA 4Q4KA 3BGJA 3GDTA 3G3MA 1U83A 1DJNA 3BG9A 4RJEA 2G96A 2PRMA 1K7FA 4Y6GA 1B9BA 3USBA 4WXYA 3LB0A 4PODA 3EX4A 3UZ5A 4LU0A 2YW4A 1X8FA 5FESA 4IUOA 4FXSA 3L67A 4HNTA 5DXXA 2HTMA 4JTUA 4AXKA 4E0CA 4UTWC 1FXQA 3PC0A 1ZNNA 1TV8A 4DPPA 3NQCA 5C6MA 4YCPA 1XDLA 5AHLA 1SQ7A 1W3IA 1YTDA 2H8ZA 3W1XA 3HIJA 3CQ0A 3W2NA 2VFGA 3Q58A 5A5WA 1F7BA 1FWSA 3FYOA 4FX8A 1I4NA 1XBXA 2V0TA 4O11A 1WOBA 2PC4A 1TREA 1LRQA 4RZ5A 3WJWA 4N2YA 1RD5A 2QJIA 3PWAA 2QUUA 1EB3A 1L6YA 4WZHA 4PL2A 3NO5A 3NQEA 3SECA 3NEVA 2VENA 3UQNA 4O1BA 2YCEA 3U2OA 2FTPA 1KM2A 2DP3A 4NT0A 5D2TA 3TH6A 4UR8A 3A22A 1TQXA 3LXBA 1KM6A 3WK1A 2Q3RA 1PHWA 2RDUA 3V1PA 1YTEA 3KVLA 2TMDA 4DPQA 4AEOA 4UIOA 2X2GA 3W1AA 3HG5A 2FB2A 2FLIA 1FQ0A 3GVGA 4CCCA 5F1VA 1LLZA 3ZS4A 2TYSA 3M7WA 1RVGA 1RR2A 1DQWA 4O4VA 5D09A 2GPTA 1NF0A 4GRSA 3TJXA 2OMAA 5C55A 3G1VA 3EKLA 3GXPA 4CQ9A 3CT7A 5HR6A 3NPXA 3S5YA 1A5AA 3O07A 3TMQA 3A21A 3MHGA 5AC6A 5KTLA 1AL8A 2X1RA 4UFMA 4OT7A 1EUNA 3P61A 1XBVA 3F03K 3O8AA 1H7PA 2A7PA 1XBYA 1NAL1 2QCDB 3NAVA 3RNDA 2VC6A 3EX6A 4NZJA 4O0ZA 3FS2A 3TXVA 4MUZA 2A21A 3TSMA 3S8HA 3G8EA 3PG9A 1V5XA 1W56A 4TX9A 4NJJA 5AHNA 4XKYB 1TRIA 5CGQA 2BLEA 1KA9F 4YL2A 2FQIA 2EHHA 4JYEA 2NZLA 4GC4A 3IIPA 2QCMA 2NX1A 2Z6IA 1JCMP 3W7EA 3A24A 3BW4A 2RDTA 3TMLA 4IX2A 3LI1A 4R33A 3A23A 2DZPA 1YLVA 5CZTA 2QCGA 3KRZA 1JJKA 1PL9A 3W23A 1XDMA 5AHMA 3W73A 1UJPA 1FDYA 3U6WA 2CLMA 3LTPA 4Z0SA 3S1WA 1DOSA 1UUMA 3NZ1A 3OVPA 3U8GA 2C0AA 1I2QA 5U7SA 3OIXA 5G1TA 2XN1A 4LS0A 3C2VA 4QIUA 5D2VA 4DXVA 2ALDA 3GAYA 2A7RA 2Z2UA 3PAJA 2GVJA 3W72A 3GDLA 3V75A 3BLFA 2RDWA 1LYXA 3C4UA 2C16A 3E9AA 1D9EA 2OJPA 3H53A 3HJZA 4I7UA 4AWUA 4N9CA 4JXCA 2D73A 4FIQA 1OJXA 1I2OA 4AAJA 3M5VA 2Y7FA 2EPHA 2ABAA 1KTNA 4UC5A 1MZHA 5F1UA 1H63A 1AW2A 4MY9A 1PVNA 2DZWA 2ZZ3A 3TQKA 3DFPA 1VRDA 3CPRA 2Y62A 1W3NA 4LW7A 3NQFA 3I65A 4OGZA 2ZRXA 3KX6A 4BR1A 4EF9A 1JUKA 4JDYA 1OX6A 3TKFA 2J9YA 3UY7A 3HOJA 4AH7A 2WNQA 1GYNA 4CNNA 3GKFA 3L0GA 3NR0A 5D2WA 4K39A 4O13A 1R30A 1PIIA 5LZLA 4TU1A 1QCWA 4O1DA 2FFCA 2IQTA 3GB6A 4ZL1A 4HNVA 1ZAIA 3FJLA 3STEA 5HUPA 2VFEA 3VNDA 4R7JA 3ZWTA 1WYIA 2VEKA 5KZMA 2BXVA 5LGZA 2B0MA 3NZRA 3KFTA 3UNDA 2ZQ0A 3O15A 4MZYA 3TW7A 3I7QA 1OFDA 2ZA2A 3KXQA 4OV9A 3PBUA 3NPVA 4XBKA 1THFD 3TSDA 4C1LA 2FPTA 4ONVA 4JY9A 3QW4B 3Q2DA 1O4UA 5EKYA 3G1HA 1H51A 4HPJA 5HWMA 3W7MA 3MI2A 1SZEA 3LV6A 4RXFA 3MP4A 2E68A 3NM3A 2AGKA 6ALDA 1Z41A 4NUWA 2ZZ1A 1WBJA 2E5BA 4LC8A 2Y63A 5H91A 1QWGA 3QF0A 4J9JA 2C6QA 2ISWA 4KKXA 3LV5A 5DBUA 1TJRA 5DY3A 3EWZA 1D3GA 1WQ5A 1KBJA 2ZRWA 5K9DA 1B57A 1OVDA 2ZDRA 2ZRUA 1TQJA 3B0VC 3OG3A 1FWTA 4GE8A 3DFSA 3NDOA 4MLRA 1MEWA 3HGOA 4DBDA 1GQNA 3CHVA 3UWYA 1VH7A 4YXGA 2CFFA 5U4NA 2E6YA 3EEGA 1OF6A 3FFSA 5C2XA 4B5NA 2TSYA 3SSJA 3O63A 1LP6A 1H1ZA 6TIMA 3GAKA 1FY6A 4IPJA 4WXZA 3MI6A 4UTMA 1X1ZA 3L68A 2V2DA 3L5LA 1F73A 2B7NA 5EY5A 1TMHA 3H54A 4LY8A 4LT9A 1TJPA 2CZFA 3NVTA 2YYUA 3W7IA 2EGZA 3DFTA 3G1FA 4BI7A 3MJYA 1SFLA 3EX1A 4N4QA 1MSSA 3TCEA 4O15A 3HG4A 2QKFA 5H2ZA 3MMTA 3DU0A 3SY5A 1AG1O 3W84A 2E6DA 1DL3A 3CWNA 4O18A 3W76A 2Y89A 4IX0A 3UXAA 5LGXA 1OYAA 3FLUA 2G97A 4O54A 1KV8A 3IGUA 4JIPA 3S9YA 1FDJA 5AYYA 5BRBA 5LSMA 1Z42A 3W83A 3INPA 2B4GA 1SZNA 2C14A 5CKSA 5DN1A 3TNOA 4JNMA 1UUOA 3ZFHA 5HUOA 4NNAA 1DVJA 2QCDA 3W2JA 2ZZ4A 3MP5A 3G24A 4ZVJA 1OYBA 4A2RA 1T96A 1YXYA 2NX3A 2QCHA 1FBAA 2H8XA 1OX5A 1LCOA 2X1TA 3FA5A 4XKYA 1G67A 1OFAA 3LXCA 5FF7A 1XUZA 3ATYA 2J27A 5D04C 4HPXA 5AB3A 1OFPA 3HGSA 5HNRA 2X30A 2C1HA 4K37A 1F05A 2E5DA 4RKAA 1QDSA 1KFEA 3BK0A 4NJIA 2B7PA 3GR8A 3KRSA 3G1XA 5HWNA 5AYXA 4M7SA 5SWUA 4E2DA 4QJ1A 3WJYA 2BSLA 1XBZA 3DENA 3N3MA 3C8FA 1EIXA 1G7VA 4ICNA 2C18A 3EB2A 4ZQPA 1DORA 4WY0B 1WOAA 2NXGA 3TJLA 2XFWA 1H50A 1LOQA 1W37A 2CU0A 1WV2A 3O6DA 3DHDA 3DI0A 2YPIA 4K8HA 1S5VA 3NQAA 4XUGA 3CTLA 4AWTA 3IIZA 4EF8A 1H61A 3HQ1A 5TQLA 2J9XA 4GXMA 4MPQA 3QFEA 3C2RA 1FXPA 3PBYA 1J4EA 4K8EA 5DCEA 1GEQA 4AF0B 1GTEA 3LCLA 1LROA 1VHCA 1ZHAA 1JVNA 3IGSA 4QM1A 4FB7A 5KITA 3LHUA 3MYOA 4JX4A 1SUXA 1J2WA 3P7YA 3C6CA 4IMDA 4MKNA 4YLWA 4WQ6A 3HO8A 4LV4A 3LCWA 3IRDA 1U5JA 2PCQA 1SW3A 3OBKA 1EWDA 4LTSA 1R2SA 1H7NA 1PCKA 2CLOA 1AK5A 1F76A 3ANYA 4P2VA 5EL1A 1WXJA 3NL6A 2R8WA 1ALDA 3DKJA 1VHNA 1BTMA 4S1FA 1ICQA 5DELA 1LDCA 1R2TA 3LDVA 5F4WA 1ME8A 3O1NA 3DFOA 1BWKA 4JICA 1SO5A 3QPYA 1QPOA 1F6PA 3E02A 2QAFA 2E1DA 4NU7A 4NX5A 4DF0A 2NV1A 4X9SA 3DXIA 4S2BA 3GR7A 4NXSA 4AHPA 3NQ8A 1SPQA 3W22A 1IGSA 4BF9A 2H3BA 3O6YX 2ZFAA 2NXIA 3LHTA 2V30A 2Q3OA 3TFXA 4LWWA 2QDHA 2YFNA 4X3ZA 4A21A 2DJXA 2JK2A 3BLEA 3EWYA 4JTKA 2A1YA 3QJAA 3B0UX 2JBMA 4QQ3A 3SJ3A 2Z0IA 5K3VA 3HPXA 4OV4A 3B8DA 2I1OA 1AMKA 4N02A 3JRKA 3KVJA 1GVSA 4HKPA 1SW7A 2GVGA 3W07A 1EX5A 3W6YA 4QNEA 4KWVA 1DKWA 3FOKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3M0ZA

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