3M6GA

Crystal structure of actin in complex with lobophorolide
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Two molecules of lobophorolide cooperate to stabilize an actin dimer using both their "ring" and "tail" region.
pubmed doi rcsb
total genus 125
structure length 353
sequence length 366
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m6gA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m6gA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3m6gA03
2AA4A 3CQXA 4H0YB 1YVNA 3MCPA 5AQGA 5LJWA 2ASMA 4IO8A 1LCUA 4CZJA 3EL2A 4WQ5A 4JAXA 4BRHA 4H0VB 4HTLA 4CZLA 1E4GT 3A5MC 4CJ7A 4JD2B 4QS7A 5B8HA 4BGAA 5AQWA 2YI1A 4XEIA 2GTDA 5ADXA 3SJHA 4DQ8A 3WXIA 4BG9A 3AAQA 1BO5O 3ENOA 3LDQA 2Q0RA 1HJOA 5AQNA 1YUWA 3CERA 3LM2A 2FF6A 4L3QA 4O8KA 1KAZA 1K8KA 4FWSA 4BR2A 3QMLA 2FSJA 3VPZA 4BRDA 1Z6RA 3O8MA 1NGGA 1KAXA 3FGUA 3U9DA 4LC9B 3C7NB 4B1YB 4KBOA 2ZGZA 4CBXA 4CZKA 1BU6O 5AQLA 3EN9A 3H3OB 2CH5A 3W3DA 3A5LC 1MA9B 2E2NA 3D2FB 5CE3A 1NLVA 1HLUA 3OHRA 4H5RA 4BQZA 1IG8A 4O5FA 2V51B 4QS8A 4Z94A 2P9IA 3SMPA 4BVPA 1QQOA 2YHXA 1X3NA 4BVOA 3RSEA 2E20A 3U8XA 4CD1A 2GWJA 5AQJA 4YDUC 5FPMA 3ULEA 3DJCA 4Y0WA 1MWKA 4EFHA 4M7XA 5AQZA 2VCPA 3VEXA 3S41A 1T6CA 4BC4A 3R6MA 3H3NO 3KHYA 5ELZA 1J6ZA 2DPNA 4CZGA 1GLCG 1Y64A 3BEXA 3ZX3A 1NWKA 1RGIA 3ZETA 1NGIA 3IMXA 2QW9A 2BUPA 4IJAA 2ZF5O 4DCHA 4FL9A 5I9EB 4BRNA 1GLAG 2YJFA 2E1YA 1DKGD 3ZX2A 2FF3B 1TUUA 5AQYA 2A40A 4BG8A 3IDHA 2F9WA 1TUYA 4GY2B 4MLEA 1C0FA 4JD2A 3W0LA 5BPLA 3D7EO 4F9OA 3P4IA 3O5BA 2QWLA 4CI6A 1GLEG 3BUZB 1HPMA 3O08A 4FPBA 4PKIA 4B1UB 3VESA 4GNIA 2FXUA 3WXJA 2ASOA 2A42A 2GELA 3FZHA 3VOVA 3C0BA 1Q18A 3GBTA 2V7YA 2NRHA 1NGJA 1V4TA 3WXLA 3QFPA 2IIRA 1BA0A 2I7PA 1ZC6A 1TYQB 3C7NA 4B1ZA 1XUPO 5EY4A 3WT0A 1U6ZA 5AZIB 3MN6A 3MMVA 5KPRA 2W41A 3DXKA 5AQPA 3CETA 3D2FA 5KQDA 1OKJA 2CGLA 3VEZA 3QFUA 3SK3A 2W40A 4YDUA 4IZ9A 5EVZA 4CZIA 2E2QA 4H03B 3ID8A 2EWSA 3UKUB 3CHWA 4H0XB 4E1JA 1Z05A 4ISFA 4MLHA 1YXQA 2V52B 3KVGA 4BC2A 4DHYA 5JMVA 5FPEA 3O80A 3CQYA 5BRDA 3FZLA 5AZJB 2CGKA 3SLCA 1SZ2A 5FPDA 3VENA 3LDNA 2YHYA 3CIPA 3L0QA 1ATSA 1KAYA 1RDWX 1JCFA 5FPNA 2AP1A 2GUPA 4RWTA 2QWOA 3QDKA 1JCEA 4FWLA 1NGDA 4A2BA 1S3XA 3TU5A 4B1WB 4BQLA 4M7YA 4CZFA 3H1QA 4BRQA 2PBDA 1D4XA 3GL1A 1G99A 3EZWA 1LOTB 3FZMA 4DB3A 5JLHA 2QM1A 4K41A 3VEYA 3ZX0A 1DGKN 5AQRA 5AQUA 3ENHA 4BR5A 2ASPA 5JICA 1BWFO 2QWMA 3FR0A 4K25A 3R9PA 4JHDB 2E8AA 3H6EA 1XC3A 2P9UA 2Q97A 1ATRA 3AAPA 3VGMA 4FPAA 4IJNA 2BTFA 5AQIA 1SAZA 2Q36A 1T6DA 3CJ9A 1HKCA 4H0TB 2Q0UA 4K42A 1NGFA 3H45C 3WEEB 1T44A 1HKGA 4RCHA 3BF3A 1NM1A 4BRCA 1TYQA 3M1FA 2FSKA 5AZIA 4WQ4C 2PAVA 2P9SA 2ZWHA 2QWQA 4H5TA 3CJBA 4RTFD 1BA1A 1DEJA 1BOTO 1RFQA 2ITMA 4BGBA 5AQQA 3HM8A 2H3GX 3D2EB 4FWNA 3ATVA 3DWLA 2NZTA 4H5WA 3B8AX 3UKUA 4EIAA 1XQSC 4PL7A 2A6AA 3I33A 4MO5A 5TKYA 5AQMA 3I8BA 2D1KA 3M6GA 2E2PA 5AQTA 3VEVA 5EOYA 4BR7A 3ATUA 2E1ZA 5AZJA 1NGAA 3FZFA 5AQFA 2P9LB 3LDLA 2A41A 1ESVA 2QXLA 2P9NB 2CGJA 1ATNA 1BG3A 5EXWA 2UYTA 4BRFA 2D0PA 4I6MB 3GE1A 3A0IX 3DAWA 1IJJA 5BR9A 3WQUA 2WUSA 1X3MA 3AARA 2OANA 1U2VB 4BROA 4FWRA 4C23A 2YHWA 4JNEA 2YJEA 3O1WA 1H1VA 3CJ1A 1NGBA 2NLXA 3O6WA 2Q2RA 4EAHD 3VGLA 3FE1A 1GLFO 1P8ZA 3HBTA 5AQOA 1QHAA 2FLOA 3EKSA 4JHDA 2D4WA 4XH4A 3BP8A 4MO4A 4CBWA 3R8EA 5AQSA 4B1XB 1QZ6A 4FOIA 3UKRB 3ZETB 2P9PB 1BDGA 3O1BA 5LJVA 2HF3A 4FWKA 4WQ4A 1MWMA 3EKUA 4ISGA 3WEEA 1NGEA 2A3ZA 1GLJO 4FWQA 3ZEUB 4BRLA 4NB4A 3CJ7A 3DXMB 4BRGA 1KXPA 5LY3A 3JXUA 4H0OA 4PKGA 1HX1A 1NGHA 3QBXA 2QWRA 3FZKA 1MDUB 1V4SA 4HWIA 3MK6A 5F2RA 3CI5A 1X9JA 5AFUH 5BN8A 4PL8A 1E4FT 3U4LA 5F0XA 4BREA 1NGCA 3D2EA 5BREA 1GLDG 3CJCA 4FO0A 4H5NA 3LDPA 2IVPA 2QWNA 3VERA 3MDQA 3JS6A 3GG4A 2YCHA 1HUXA 1QZ5A 3WQTA 3LL3A 1S22A 2KHOA 4M63C 4B9QA 2Q1NA 4CD3A 3U9ZA 4BC5A 2IVOA 5E26A 4H0PA 2E2OA 2P9KB 3IUCA 2P9LA 3VF6A 3L4IA 4ISEA 4A61A 4AM6A 3QB0A 2V7ZA 3KZBA 4FWMA 2VYPA 4FOEA 4BRIA 5BPMA 1C0GA 3AY9A 2P9NA 2VWBA 3DXKB 1HKBA 1SQKA 4I6MA 3GOIA 5E84A 4K43A 4CZEA 5BPNA 4FWPA 5F1XA 4CBUA 2CH6A 2GEMA 3H46O 1U2VA 3SMSA 4A2AA 2I7NA 3A8YA 5ADXH 3QBWA 4QS9A 1GLBG 4WQ5C 3UE5A 5JLFA 1WOQA 1ZXOA 3H1VX 3HZ6A 5KQ8A 3VEOA 2A5XA 2ZGYA 5BRFA 4BR4A 3VF2A 4BC3A 4FWOA 5AR0A 4J8FA 2Q31A 3G25A 4CZMA 1K8KB 3UKRA 3FLCO 4BRAA 2P9PA 1NMDA 3GDQA 4BRMA 5KPTA 1QQNA 3UB5A 1CZAN 3ZEUA 2F9TA 4EHUA 2E88A 3DXMA 1EQYA 3FFKB 3VEWA 1BUPA 3A5NC 3EO3A 3VGKA 4BR9A 1YAGA 4BRKA 2HF4A 4CZHA 4BR0A 2GWKA 2FSNA 3HI0A 3L6QA 3QICA 3HTVA 4NO7A 4BRPA 3IFRA 4EHTA 3MN7A 5BRHA 3HSCA 2P9IB 4XH5A 4A62A 1QQMA 5AFUA 5BN9A 2P9UB 1R59O 2J4RA 3RSEB 3M3ZA 1JCGA 1WUAA 3J8AA 4H5VA 4B1VA 4JN4A 3ULEB 3VF4A 3LDOA 5AQKA 4AM7A 4XH1A 1GLLO 5AQVA 4IXCA 2IVNA 3WXKA 3MN5A 3TPQA 5AQXA 3O4WA 3BF1A 5AQHA 4FSVA 3VETA 2P9KA 2D0OA 4PKHA 5EX5A 3LM9A 4IWVA 5KPZA 3CJAA 1NBWA 2HOEA 1ZBSA 3A5OC 3WUHA 2P9SB 2HMPA 2QWPA 3MN9A 3F9MA 4WYBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H0YB 3OS1A 1B9DA 1K9MO 5AQGA 4E72A 3LP3A 2QEXN 4JKGA 3P39A 4JAXA 4DTPA 2YX6A 3QEPA 4JD2B 3T7ZA 2HBJA 4QS7A 4FJHA 4ELTA 5FRMA 2YI1A 3ZSZA 2GTDA 4BWJA 4ID5A 1TVRA 4MDAA 4R5PA 2HHTA 1UWBA 4BEBA 3ENOA 4KHUA 2HMIA 2D0AA 4LSLA 5HRRA 1M1KO 1YUWA 3LM2A 2FF6A 2QI2A 4L3QA 4WFNL 1ZBIA 1XNQK 1JKHA 5HOOA 2HHWA 4KFBA 4JK7A 1WAJA 4KKOA 1KAXA 1HNVA 4DFMA 1S1VA 3TWHA 2VWKA 2ZGZA 1WAFA 5AQLA 3H3OB 5TKWA 2HHIA 4KHQA 4BACA 3NH2A 2F7TA 3A5LC 4Z4CA 2E2NA 4H5RA 4BQZA 3TAEA 2FC0A 3OYJA 4CECA 1XC9A 2P9IA 1C1AA 4A5AA 4BVPA 3Q7CA 1X3NA 4DR7K 5AQJA 4AHUA 2G8FA 2UXDK 3DOKA 4Y0WA 1MWKA 4EFHA 4M7XA 3KLEA 4LF6K 3EE9A 1TV6A 5AQZA 3S41A 4J2EA 2NRRA 2DPNA 4CZGA 1NOYA 3MXJA 3VTHA 1M90O 3DMJA 1Y64A 4FLTA 3AVLA 2EHGA 3EY1A 1RGIA 2OYQA 3ZETA 5AJ3K 4B9NA 2QW9A 4FLWA 2ZF5O 4E7HA 4CGHA 4DTRA 1Q9YA 1TGOA 2E1YA 4FJ8A 3ZX2A 4BG8A 4F8RA 3AO4A 3W0LA 4FJMA 2PYLA 3O5BA 4CI6A 3S3NA 2HW3A 4CEDA 2O8EA 4MDBA 1YITN 3VESA 4GV6A 3CCUN 1TAUA 4GNIA 3WXJA 4DUYK 2ASOA 4YY3K 2RKIA 2JLEA 1U04A 3PUFA 1IKWA 5JVGL 1NGJA 2YV0X 4FLXA 4FZYA 4JI8K 3MEGA 4AHCA 3WXLA 3C7NA 4JKHA 4CHYA 2LSNA 1I39A 5KPRA 1SKWA 3P38A 2WBNA 4CHPA 4FLZA 3DLLL 3CETA 5KQDA 2CGLA 3VEZA 5I3UA 1QSYA 3DOLA 3HP9A 4CFCA 4IZ9A 4CZIA 3JAMO 3T19A 2QKBA 4I9LA 3ISNC 4RW6A 3ID8A 3OYEA 4GMJB 1JLQA 2X6NA 1KD1O 5HROA 1KC8O 1RT2A 1ZBFA 4CF9A 4JKEA 1YXQA 2V52B 4BC2A 1YJNN 1VSLA 1IKXA 2O8CB 3FZLA 5KGXA 5FPDA 3VENA 3PX4A 2QTDA 3SAGA 2YHAA 1JCFA 1RBUA 2GUPA 2Z1IA 1NKBA 4RWTA 1VQLN 4K8ZA 1W9HA 3B6PA 1JCEA 2YKNA 1NG9A 1S3XA 3RRGA 4GV3A 4WFAL 3SBTA 3CCMN 3K9JA 4LFCK 4BQLA 4DMNA 2ZM6K 1RBSA 5C2FA 4DV1K 1W7AA 4KB1A 1ZBHA 4DSEA 1TL3A 3QNOA 1G99A 5DM7L 1NJXA 4FZZA 3VQ6A 4DB3A 5JLHA 3MXIA 5KRTA 3KK2A 4ELUA 1BWFO 3FR0A 4K25A 2E5LK 1SV5A 3L2QA 4DSIA 2FBXA 3AAPA 1N8RO 3CM6A 2FBYA 1SAZA 2D0BA 4GVEA 5HLFA 4H0TB 3ZCMA 1TKXA 1NGFA 1HKGA 4BRCA 1TYQA 1JXBA 4DV6K 3AGRA 2JGUA 3HM9A 1VK0A 1RFQA 4BGBA 5AQQA 3H08A 4YOXA 3TSQA 4FWNA 3K5NA 4FJJA 2NZTA 4IEEA 3LWMA 1J9AA 3UKUA 3LZIA 2A6AA 2FBTA 5AQTA 3QEIA 1LWEA 2XY7A 5AZJA 3PV8A 3L4QA 1NGAA 3FZFA 3CC7N 3LDLA 3NFAA 2E4LA 3SAFA 3OY9A 2A41A 1ESVA 3MXMA 4BY9C 4QOZB 3VMFB 1BG3A 5EXWA 4DSLA 3IG1A 1BCOA 4I6MB 3PIOL 1JL1A 5M1KA 3WQUA 4C8OA 3SV4A 4JNEA 1H1VA 3LPTA 2NLXA 4NCBA 3KK7A 4FM1A 1EX4A 3NCIA 1GLFO 4KHWA 1P8ZA 2KTQA 3O4QA 5KGWA 4JHDA 4CBWA 4MO4A 4JK9A 1EWQA 3NE6A 1S5JA 1XHXA 4FOIA 4IEIA 3ASMA 4B3TK 2XRIA 3HPGA 3LAMA 3CYGA 3ZETB 4PHTX 3O1BA 4WQ4A 4O44A 3EKUA 4CJVA 4ID1A 4XJXA 3FFIA 3KKSA 3CJ7A 5LY3A 3S3OA 4E89A 1UA1A 3BDPA 4JKCA 1HRHA 4DFJA 2QWRA 2KKZA 4CIGA 3ZYYX 3CI5A 5GAEP 2FBVA 4PL8A 3J81O 4RW9A 3NF6A 1NGCA 3OJSA 4LF4K 3D2EA 3SZ2A 4FJ7A 3L3VA 3CJCA 2B6AA 1XHZA 1LW0A 3JS6A 3SQ2A 1SKSA 3ZSYA 1QZ5A 3LL3A 2Q1NA 5E26A 4H0PA 2P9KB 3NF8A 3IUCA 4B3RK 2P9LA 4CFAA 1XWLA 4ISEA 4FW2A 5KI6A 4AQYK 4KHSA 1U4BA 3PY8A 1JLFA 3AY9A 1IV0A 2P9NA 5CR4A 2VWBA 4YNQA 1SQKA 2GBZA 4DS5A 3WNGA 4K43A 1DT9A 3CQ8A 1U2VA 5FRNA 1N33K 1ZBUA 5ADXH 4PQUA 4QS9A 1GLBG 4OPKA 3H1VX 3VTIA 4OPJA 4CERA 1VQ5N 3R1XA 2YNHA 3VF2A 1O13A 2F8SA 1Z25A 5CYMA 1VQNN 2Q31A 3G25A 4GVMA 1K8KB 4PA1A 3UKRA 3FLCO 3OS2A 1RT6A 1N6QA 3O9SA 2O8DA 1QQNA 2ITGA 4EHUA 2E88A 2P5OA 4K0KK 4DFKA 2Z1JA 4X65K 4FJLA 2D0CA 3PIPL 4Q0BA 1YAGA 4BRKA 5H1SQ 2YKMA 3HOSA 3NHGA 2OPPA 3CPWM 1XMOK 2FSNA 3E1YA 3HI0A 3L6QA 4B8CA 4PUOA 1VSKA 3IKMA 4AILC 4BRPA 1C0MA 4EZ6A 4A62A 5AFUA 5E41A 1RILA 4ILGB 4KH6A 1WUAA 3ZLJA 3G6EN 1RDUA 3ZSVA 4B1VA 4B9LA 1FKPA 1RDAA 1S9GA 1Z26A 3LZJA 1XNRK 3O3FA 4AHVA 1VQ6N 1ASWA 3BF1A 1EKEA 4DU4A 4PKHA 1VQ7N 3C6AA 1VQ8N 1U49A 2O8FA 1VRTA 3MN9A 4JS5A 4IFEA 3AO1A 1YVNA 3K5OA 1L5UA 2AJQA 2ASMA 1RBTA 4WQ5A 3K5MA 4Q5VA 2HHUA 4BRHA 1Q81O 1WSHA 1W0HA 4NYFA 4ZTJA 1J5OA 1K6YA 5AQWA 1FW6A 4XEIA 4DTMA 3SJHA 3AAQA 4DV7K 1C1BA 3THVA 4FJ5A 3P31A 4O8KA 1QSLA 2YHBA 2FSJA 4CW7B 1NGGA 2P5GA 3FGUA 3U9DA 4CBXA 4CZKA 4HCCA 5C25A 1X9MA 4CEZA 1B92A 4E19A 2CH5A 3AA5X 2DTUA 4OVLA 1MA9B 3HT3A 5JS1A 3OHRA 5MLCQ 3LP0A 3NGYA 4JI6K 4Z94A 4LH5A 4IOAL 1IKVA 3OYBA 4BVOA 1KQSM 2BANA 2GWJA 3ULEA 4CJTA 4IO9L 3PX6A 3VEXA 5GADP 2IDOA 4JI4K 3H3NO 3HXMA 3KHYA 4KHYA 4M3WA 1GLCG 4YORA 3QO9A 4N56A 1YTAA 1NWKA 4DQIA 4CF0A 3IMXA 1TAQA 3TTDA 4IJAA 1B9FA 4U67L 3HSTB 1KFSA 4Z4FA 4NXNK 1RBVA 4BRNA 3QEXA 1GLAG 1HYVA 3TAFA 1DKGD 4H4MA 3DLHA 2FF3B 4B9TA 1TUYA 3AA3A 4HUFA 3SPZA 4J2DA 3N4QA 2Y1IA 3P4IA 3J7YP 3OYLA 3VQEA 4DV5K 4ILHA 4JLHA 2UUCK 1C6VA 3BUZB 4PKIA 4DU3A 3PX0A 1W97L 3L2RA 4DKWA 2A1SA 4CJSA 1IKYA 4DU1A 3VOVA 2A42A 4DV3K 1VSFA 3I0SA 1JL2A 1Q18A 2HBKA 4E7LA 1NKCA 3AV9A 4KV8A 3QFPA 4I9QA 2DY4A 4YOWA 1XUPO 3DI6A 1QE1A 3KTQA 3OBWA 3QLHA 3TAGA 4PY5A 4J2BA 4YHHK 2HNZA 1KVCA 3OYNA 4JYAK 1O1WA 1FJGK 3RMBA 3D2FA 1WB9A 4OPAA 4HUEA 3SUPA 4YDUA 5EVZA 1QS4A 4H03B 1IO2A 3OA9A 4NCAA 1RDCA 1Z05A 2P51A 1NNEA 1ILYA 4IBNA 4DHYA 3C95A 2O8DB 3AA4A 3O80A 2W6LA 4OKEA 3SLCA 1K73O 3M8PA 3CFOA 4AHTA 3LDNA 2YHYA 4X62K 1EP4A 3L0QA 1T8EA 1RDWX 4M3XA 2QWOA 3OS0A 2NRXA 2RE2A 4A2BA 2KFNA 3TU5A 3ULDA 3THYA 4JI1K 1WSFA 4CZFA 4DV4K 2UXCK 3CFPA 1S1UA 2ZJRL 3T69A 3VQBA 1D4XA 1VQ4N 3EZWA 1BGXT 2QA4N 3VEYA 3PLAA 1DGKN 4B9UA 5AQUA 4M45A 2QWMA 4CE9A 1XC3A 2P9UA 3VQAA 1S72N 3Q7BA 3ZSWA 1ATRA 2G8HA 4JS4A 4FPAA 1S1WA 1HQEA 3DLRA 2O8FB 5AQIA 1SUQA 2Q36A 1QVGM 3CJ9A 3P1GA 1HNWK 3D45A 3E9OA 3DRSA 4FJ9A 3BF3A 4EP5A 4CHOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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