3MDZA

Crystal structure of human carbonic anhydrase vii [isoform 1], ca7
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
MHGWGYGQDDGPSHWHKLYPIAQGDRQSPINIISSQAVYSPSLQPLELSYEACMSLSITNNGHSVQVDFNDSDDRTVVTGGPLEGPYRLKQFHFHWGKKHDVGSEHTVDGKSFPSELHLVHWNAKKYSTFGEAASAPDGLAVVGVFLETGDEHPSMNRLTDALYMVRFKGTKAQFSCFNPKCLLPASRHYWTYPGSLTTPPLSESVTWIVLREPICISERQMGKFRSLLFTSEDDERIHMVNNFRPPQPLKGRVVKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 7
publication title Crystal Structure of Human Carbonic Anhydrase VII [isoform 1], CA7
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 63
structure length 259
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3mdzA00
3DA2A 3M40A 1I8ZA 4DZ7A 1CCUA 1YO1A 4LP6A 1ZSBA 5FNKA 5FLTA 2EU2A 4MDMA 3VBDA 4Q8YA 4RFDA 5FLOA 5LMDA 3V7XA 1BV3A 4G0CA 5FNLA 1CVHA 4Q99A 1AZMA 3DD8A 3IBIA 3MNHA 1BICA 4YXOA 1YDDA 1FQRA 2WD3A 1MOOA 4KNMA 4FPTA 5SZ1A 1RAYA 3HKUA 4XZ5A 4Y0JA 1RZBA 3ZP9A 4KNNA 4DZ9A 1G3ZA 4MDGA 5JG3B 1Y7WA 3MHOA 3MNJA 2FMGA 1G0EA 2CABA 5JEPB 2NWZA 3M14A 3N4BA 3S76A 1HEBA 1Z97A 5EKJA 5HPJA 5FDCA 4RIUA 4Q0LA 3RZ5A 3T85A 1TBTX 5FLSA 4E5QA 3M96A 5EZTX 3KKXA 4YVYA 2Q38A 1JCZA 5CLUA 5DSJA 4Z0QA 1HEAA 3C7PA 3S9TA 1YDCA 4RN4A 1JV0A 1CRAA 2FW4A 1ZFKA 1HECA 4N16A 3M5EA 1EOUA 4PYXA 4IWZA 4YWPA 5FNGA 2VVBX 3P55A 1UGBA 1UGAA 3EFTA 1DMXA 1KOQA 3P3JA 4QY3A 5BNLA 1CCSA 4E3FA 2IT4A 1LGDA 4QJPA 3FE4A 1G48A 4WUPA 2CBEA 1YO0A 4KAPA 4Q81A 4M2RA 4CNVA 5JQ0A 3LXEA 2X7SA 1Z9YA 4KP8A 3M98A 4RIVA 3N0NA 4Q9YA 5JEGB 5EOIA 2Q1QA 1FQMA 5E2RA 3HKTA 4YYTA 5A25A 2NXTA 4C3TA 3B4FA 3PYKA 4KP5A 4JSAA 3FW3A 4QSBA 1BZMA 4QJWA 1THKA 2VVAX 5DSOA 3UYNA 4LU3A 1G46A 3HLJA 3HS4A 3EFIA 1BNMA 4Q8ZA 1IF8A 2NNOA 3MNAA 3P4VA 5C8IA 4QK2A 3BL1A 3M2XA 3K34A 1FSQA 3MNIA 3MWOA 4G7AA 4K1QA 3RZ0B 1RZDA 3KIGA 1TG3A 2AW1A 3IBUA 4RH2A 1UGCA 4BF6A 1HVAA 1G45A 2CA2A 12CAA 5BYIA 3HKQA 1KWQA 3U47A 5DSMA 1CAZA 1G6VA 1JD0A 1XQ0A 3F7UA 1H4NA 1RZEA 2FMZA 1CNKA 5JESB 1RZAA 4XE1A 5JGSB 2EU3A 1CNJA 1TTMA 4QJOA 5DSNA 3OYSA 3BL0A 2EZ7A 1I9PA 5FNJA 4ITPA 3F8EA 5FL5A 1CNYA 1CVAA 1IF5A 4MDLA 1CNXA 5IPZA 2FNNA 4QJ0A 5E28A 5DSQA 4YXIA 3M1WA 2FNMA 2NNSA 1TG9A 2W2JA 3M5TA 5EH7A 4E4AA 1XEVA 5EH5A 5G01A 6CA2A 1HCBA 4HEYA 4BF1A 3IEOA 3V3IB 3DCCA 1UGDA 4K0SA 2X7TA 1CVFA 4M2VA 2OSMA 4Q7SA 2POVA 1I9NA 4WUQA 3R17B 4JSWA 1I9MA 1CNHA 1CAJA 3DAZA 5G03A 1KEQA 2WEGA 4MTYA 3TVOX 4X5SA 1TB0X 1A42A 2WEOA 3RZ7A 3P5LA 2QO8A 1UGFA 1FSNA 1G4JA 3RG4A 4WW6A 1BNTA 2NMXA 3KS3A 1H9QA 2F14A 4XFWA 4YXUA 2FOVA 4MO8A 3MHMA 3RGEA 3S75B 3DBUA 1G52A 3T5UA 4Q6DA 5SZ4A 1CNWA 4BCWA 5FLQA 2NWYA 2H4NA 3V3HB 5G0CA 3SAXA 1HUHA 3NB5A 3RYXB 4HBAA 1LUGA 3DCSA 3KWAA 4KUYA 4YX4A 1FR7A 3OIKA 1CNCA 1I91A 5BRWA 3Q31A 1HCAA 3OKVA 4MLXA 3GZ0A 2OSFA 4Q7VA 3MMFA 1UGEA 4Z1NA 4E3GA 1CNBA 1V9IC 1I9QA 2ILIA 1CA3A 1G0FA 5JGTB 1DCAA 1CA2A 1ZSAA 3V3GB 3V3FA 3KONA 1F2WA 4HEWA 2NWPA 1I90A 1V9EA 3M2YA 3T83A 4E3DA 2WD2A 1H9NA 5DSLA 5FL4A 3RZ1B 3ML5A 5E5UA 1LG6A 3DV7A 2HFWA 4JSSA 5AMGA 1BN1A 4YGNA 1DMYA 3PO6A 3M67A 3OYQA 3T5ZA 4KV0A 4GL1X 1I9OA 1FQLA 4HT2A 1BNUA 1KOPA 2POUA 4Q07A 3JXGA 5G0BA 5DSIA 2AX2A 4PZHA 1ZH9A 1ZSCA 3KOKA 5DOGA 1RZCA 5SZ0A 1ZGFA 1CVCA 2HL4A 2QOAA 2FOSA 4TWLA 4E9OX 4ETQC 4K0ZA 3K2FA 3D8WA 5JQTA 2HNCA 1CAMA 1AM6A 1FQNA 4KNIA 4Z1EA 5SZ7A 1G1DA 1TEQX 1ZNCA 3P5AA 3IBNA 3TVNX 3M2NA 4Q49A 2FOYA 3S74B 3DVBA 3S78B 3S71B 3N3JA 4HEZA 3FFPX 4JS6A 4YHAA 3RG3A 1LG5A 1CCTA 4HT0A 5SZ5A 4M2WA 4PQ7A 4R5AA 3S77B 2POWA 1BNWA 4ITOA 5SZ3A 4Z1JA 1CVDA 5E2KA 2FOQA 2NXSA 3CZVA 4FVNA 5EKHA 3SAPA 4RUYA 2FOUA 2CBBA 5L3OA 3SBIA 1J9WA 5J8ZA 1CRMA 3P58A 5JDVB 3D92A 1CAKA 3IBLA 3MHIA 3MNUA 4WR7A 3RYJB 4ZWIA 3DD0A 1BNVA 1FSRA 5FNHA 2CBAA 3UYQA 4E3HA 1OKLA 1TE3X 3DCWA 2WEHA 1YO2A 3V3JA 3T84A 3D0NA 3MHLA 5CA2A 3N2PA 5BRVA 1MUAA 4Q09A 3RYZA 4FRCA 4PXXA 3P44A 4HF3A 5BRUA 5L6KA 1OQ5A 1CAYA 5EH8A 1DCBA 3S72B 5DRSA 3DC3A 3RJ7A 1XPZA 1FR4A 5EHWA 5DOHA 4ZWYA 5FDIA 1CINA 1HUGA 1XEGA 2NNVA 4FVOA 2O4ZA 1BCDA 4CNWA 4LHIA 3D93A 4WL4A 4IDRX 1T9NA 5CACA 5EHVA 3S97A 1HEDA 1ZE8A 4FL7A 4UOVA 3U3AX 1CNGA 5FNMA 4TWMA 5E2NA 3MYQA 1TH9A 3W6HA 1Z93A 3ZNCA 4QIZA 4Z1KA 1KWRA 5FNIA 3OKUA 1ZGEA 5AMDA 1CVEA 1G54A 4CA2A 1CAOA 3K7KA 2ABEA 1AVNA 3MNKA 3V2JA 5DSPA 1YDBA 3S73B 1CZMA 4E49A 5CJFA 1G53A 3W6IA 3CAJA 4R5BA 3S8XA 2NNGA 1OKNA 3KNEA 2NWOA 4WW8A 4QSAA 4RUXA 5EIJA 8CA2A 3R16A 4YGFA 1CAIA 3NI5A 3OILA 3PJJA 4KUVA 4QTLA 3F4XA 2HOCA 1CIMA 4Q6EA 2ZNCA 4KNJA 2WEJA 1UGGA 1LZVA 3B1BA 5FL6A 4COQA 5DSRA 4QSIA 1FLJA 4FU5A 3OY0A 4CACA 5AMLA 1IF9A 3RYVB 3M2ZA 3NJ9A 4N0XB 1ZFQA 3DVDA 4CNRA 4ZAOA 5FLRA 4XIXA 2NN7A 4ILXA 3OIMA 4QEFA 5EKMA 3L14A 4RFCA 3M1JA 2NN1A 3U7CA 3ML2A 3JXFA 4XIWA 4Q08A 4YGKA 1G4OA 2NXRA 2HKKA 1CANA 1BNQA 5EHEA 3MDZA 3QYKA 4ZWXA 3DVCA 4QJXA 3HFPA 3IAIA 1IF4A 5E5RA 1CAHA 3CA2A 4L5UA 4L5WA 3SBHA 4QSJA 5A6HA 2GEHA 1URTA 3T82A 4Q8XA 4R59A 3M1KA 4Q7WA 4QIYA 3M04A 4QK3A 3M5SA 5E2SA 3D9ZA 5FLPA 4CNXA 4Q06A 4ZX1A 1IF7A 3KLDB 3M1QA 4Q83A 1RJ5A 4Q78A 1BN4A 1BNNA 3JXHC 3F7BA 5DSKA 5SZ2A 4RUZA 4L5VA 4YGJA 3RYYA 7CA2A 4Q7PA 3BETA 3RZ8A 2GD8A 1CILA 3P3HA 1TEUX 4MLTA 4QK1A 1I9LA 2X7UA 4QJMA 3RLDA 3U45X 1RAZA 2CBDA 3CYUA 4Q90A 3IGPA 4YGLA 5DVXA 1OKMA 3V2MA 3MHCA 3DC9A 2FNKA 3V5GA 1BN3A 4FIKA 4ZWZA 1YDAA 4KUWA 3KOIA 2HD6A 5JEHB 4CQ0A 1RJ6A 5E2MA 3TMJA 1CALA 1IF6A 4HU1A 4JSZA 3HKNA 4K0TA 4Q87A 9CA2A 5SZ6A 2H15A 4M2UA 2QP6A 1CVBA 4PYYA 2CBCA 3M3XA 2Q1BA 4K13A 1CNIA 4ZX0A 5JG5B 3MZCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DA2 A;  3M40 A;  1I8Z A;  4DZ7 A;  1CCU A;  1YO1 A;  4LP6 A;  1ZSB A;  5FNK A;  5FLT A;  2EU2 A;  4MDM A;  3VBD A;  4Q8Y A;  4RFD A;  5FLO A;  5LMD A;  3V7X A;  1BV3 A;  4G0C A;  5FNL A;  1CVH A;  4Q99 A;  1AZM A;  3DD8 A;  3IBI A;  3MNH A;  1BIC A;  4YXO A;  1YDD A;  1FQR A;  2WD3 A;  1MOO A;  4KNM A;  4FPT A;  5SZ1 A;  1RAY A;  3HKU A;  4XZ5 A;  4Y0J A;  1RZB A;  3ZP9 A;  4KNN A;  4DZ9 A;  1G3Z A;  4MDG A;  5JG3 B;  1Y7W A;  3MHO A;  3MNJ A;  2FMG A;  1G0E A;  2CAB A;  5JEP B;  2NWZ A;  3M14 A;  3N4B A;  3S76 A;  1HEB A;  1Z97 A;  5EKJ A;  5HPJ A;  5FDC A;  4RIU A;  4Q0L A;  3RZ5 A;  3T85 A;  1TBT X;  5FLS A;  4E5Q A;  3M96 A;  5EZT X;  3KKX A;  4YVY A;  2Q38 A;  1JCZ A;  5CLU A;  5DSJ A;  4Z0Q A;  1HEA A;  3C7P A;  3S9T A;  1YDC A;  4RN4 A;  1JV0 A;  1CRA A;  2FW4 A;  1ZFK A;  1HEC A;  4N16 A;  3M5E A;  1EOU A;  4PYX A;  4IWZ A;  4YWP A;  5FNG A;  2VVB X;  3P55 A;  1UGB A;  1UGA A;  3EFT A;  1DMX A;  1KOQ A;  3P3J A;  4QY3 A;  5BNL A;  1CCS A;  4E3F A;  2IT4 A;  1LGD A;  4QJP A;  3FE4 A; 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