3MI2A

Crystal structure of human orotidine-5'-monophosphate decarboxylase complexed with pyrazofurin monophosphate
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
257
structure length
256
Chain Sequence
KELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
publication title Structural determinants for the inhibitory ligands of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 95
structure length 256
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2010-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mi2A00
3GXPA 5DBUA 5FI8A 1T8XA 5G2IA 3P61A 3M5ZA 3MHUA 3LLFA 1K8ZA 3WK2A 1F76A 4ZQPA 3RU6A 1OJXA 4WY0B 5FF2A 5LGXA 1TYGA 2YFOA 1TQJA 2H3DA 1JULA 2GJNA 3G22A 3N9RA 3YPIA 2VEMA 3E12A 1IIGA 3W70A 3G1DA 4PCFA 3Q2DA 1EP3A 3QMSA 1B9BA 3TFCA 4MKNA 3NM1A 1IXNA 4E38A 3NYZA 1N7KA 3A9IA 1NF7A 4ZQOA 1F74A 4AWTA 5HUPA 3TV8A 3N73A 4MVAA 2CLMA 4RX0A 5EKYA 2QAFA 3L5AA 1GWJA 3OBKA 4DF2A 3P82A 3U6WA 1ME8A 3NAVA 5CPOA 3LI0A 3I7SA 3S1XA 1R2RA 4OHQA 3TW6A 4UUIA 1XDLA 4UTUA 2QCNA 1YXYA 1XM3A 4ZQNA 5FEXA 4POCA 5AB3A 2GQ8A 3W83A 1TV5A 3MP4A 3E9AA 5F2GA 4NXSA 1YPIA 1KFBA 2NX1A 1HO4A 2X1UA 2NZLA 3EKZA 2Q8ZA 3DAQA 1OFAA 1K7XA 1K8YA 2FIQA 2PURA 3MO7A 3W2NA 3NPVA 4EIVA 1FBAA 4MJZA 3P80A 1ICPA 4GUGA 2ZZ3A 3BW4A 3TW7A 3EWYA 3MHGA 4E2BA 1FX6A 1WX0A 2Z2UA 1I45A 4LU0A 2ZZ4A 2RDTA 4FXSA 3KFTA 5K3VA 5BMWA 4DQWA 2CLIA 1RPXA 4PFMA 2DZWA 3C4UA 3BK0A 4RZ6A 5AN7A 1MSSA 2E5CA 2XFWA 4IXXA 3TCEA 1FXQA 1JCXA 5K9XA 1JRBA 2A7RA 2VFIA 3HB9A 2ZRYA 4IGHA 3CQ0A 1TPUA 5H2ZA 2J27A 2A4AA 4IMFA 4ZMGA 2CLOA 1SSDA 3C3NA 4ONVA 3O63A 2DP3A 4FNTA 3NQMA 2WO5A 4ORIA 2QEZA 3TH6A 5F1VA 3UXAA 3PM6A 3TE9A 2EF9A 4QM1A 3TR2A 3G8EA 1EWEA 3W1TA 3S0CA 2WNQA 3L5MA 1WBHA 5K7JA 1SO3A 3BLIA 3NQVA 3I68A 4JTGA 3G1AA 3P67A 1TTPA 5CKSA 1GYLA 3DXIA 1QFEA 3FLUA 1HTIA 2FQIA 2QAPA 1SFJA 4UFLA 1RD5A 1DOSA 5DY2A 1W5OA 4XUGA 5TIMA 5F2IA 4IOTA 1GVOA 1RQBA 1GVSA 3N19B 1KLYA 2LLEA 4A21A 3LCGA 4JY8A 1SW3A 4BWLA 2P10A 3GXNA 3H55A 1I2PA 1JUKA 2WNNA 4JTJA 4CCDA 4GUHA 2YDAA 5FF0A 5AHNA 3PB0A 2FTPA 1Q6RA 3QJAA 3QM3A 4LRSA 1JQVA 4AB4A 2VFHA 4PC8A 3FS2A 3TMQA 1WBJA 5K4XA 3UWYA 1AK5A 4GUFA 1YDVA 4RXGA 3NQFA 2JKEA 3LXBA 3DENA 1ZAJA 1L6YA 5DY3A 4FXRA 2Y61A 3EX2A 3T78A 2CZDA 2JKPA 5HUOA 4JR5A 1VYPX 1I4NA 4O16A 4XWUA 3M5VA 5IBXA 1W0MA 3LTYA 4AHOA 3MP5A 2E1DA 3PG8A 2VC6A 4O54A 3M9YA 1F7BA 4JYEA 2I14A 3NG3A 5KTLA 2C16A 1W37A 4PODA 4JTTA 4XTIA 4X3ZA 4YMZA 5D09A 3BLEA 3IGSA 1XC4A 5AC6A 2VFGA 4OWGA 3BGGA 4LC8A 3IVTA 4JX5A 3U8GA 1TPVA 5CG7A 1DQWA 1SZGA 1LBFA 5D37A 1M5WA 3CT7A 4E2DA 5KMYA 4YL2A 3OVQA 3DH7A 2CLKA 2C1HA 4KKXA 2Y85A 1W31A 1YTEA 1VYSX 1VCFA 2FPVA 1LORA 4FIRA 3B04A 3UWQA 3TSBA 4MY8A 4N9DA 2HS6A 3C6CA 5AHEA 5MHBA 4IMCA 5F2LA 3BVJA 3LV6A 4JNMA 4CLMA 4LVBA 2V82A 3W7IA 4O4WA 3PUEA 3PWAA 1OK4A 4AAJA 3W1XA 3W7KA 1S5TA 2YW4A 5E0KA 1O5KA 4G1KA 3EX1A 2DZVA 4LW7A 3JS3A 2CZ5A 3IRDA 5EYWA 5D02A 2NXGA 4A2SA 1FUYA 2CWNA 5GVJA 1FWWA 2TYSA 3HPXA 1E51A 3GAKA 3W9ZA 4O14A 1ZAIA 1AW2A 7TIMA 2I9EA 1A5CA 4K6AA 3GDRA 1KLZA 2R94A 3LCLA 3HQ1A 2V2HA 4NU7A 2ZRUA 2GUUA 1UJPA 4JTUA 4Y9AA 3TROA 4Z0SA 2OJPA 3QFEA 3EXSA 3MYPA 4Z1CA 1OHLA 1A5BA 4UCGA 1WYIA 4GXMA 3P8IA 4K38A 5H91A 1T96A 2NWSA 1TIMA 3BW2A 1KV8A 1TPEA 3QF0A 4ADUA 3EWXA 1DQXA 1SSGA 2B0MA 2PE4A 1N55A 3I7RA 2FLIA 4QNEA 1AW1A 2YX0A 1VLWA 3W88A 1H7NA 2JKAA 1VPXA 3THQA 3W2JA 3KHJA 3W3OA 3O16A 4HN4A 3TDFA 5LNSA 1LLWA 1QMLA 2XN1A 1YDNA 3FJ6A 1LYXA 3L68A 2QCCA 3MHFA 1A5AA 2QCDA 4NJJA 2ZFAA 3SGUA 5AHIA 1SPQA 4OQVA 2DZTA 3LBMA 1XL9A 5AYZA 4JXCA 1TB3A 5EL1A 4CQ9A 3ABOA 1C9DA 1XBVA 3BO9A 5I3GA 1VCVA 3SR7A 2ZZ5A 3QQ0A 4K7VA 3TFXA 4GUJA 2WSQA 5IBXC 4R33A 1EEPA 3EX6A 3KXQA 1G4TA 2ZDRA 1EPXA 1KFCA 1PHWA 2EPHA 1OFQA 1V5XA 4Z1AA 1JUBA 1Z48A 4K7YA 4JS3A 3W2MA 3FA5A 2E09A 1WAUA 5F2MA 1QPOA 1OK6A 2NUWA 2WJZA 4LRTA 3TQVA 1VHCA 4GFSA 3LRLA 2VXNA 2NWRA 1D3GA 3CWOX 4NNBA 3LCFA 2WSYA 3G1SA 2BWGA 4R53A 2ZRVA 4CNPA 3GX9A 1WXJA 2BXVA 1KFLA 3L66A 4Q4KA 3ZWTA 4LV9A 1Q45A 3LLDA 3NO5A 4YCPA 2RHGA 1DVJA 2YGYA 4WOZA 5D05A 4CNOA 1PHQA 4K37A 1XBYA 3ABQA 3M47A 3NQDA 1RV8A 3TSMA 5A5WA 2E6AA 3BPWA 4AHQA 3NL3A 3M16A 1NF0A 1KTCA 3G3DA 4S1FA 2CFFA 1UUMA 1OFEA 3DKJA 3IIVA 3CLMA 3TQKA 2OX1A 3TC6A 1ZJIA 2R91A 2HMCA 1D3HA 1XI3A 4YLWA 2G5WA 1LP6A 4CCEA 3LCIA 1F2JA 4UFJA 5BMXA 4JTSA 3CIWA 2FB2A 3W75A 3ATYA 2E6YA 1FWTA 1GJPA 1RR2A 1ZFJA 3HF3A 3QZEA 1NEYA 3LOTA 4DO5A 3C2EA 3C61A 5TQLA 5HR7A 4GUIA 3QPYA 3H54A 2C13A 3QH2A 4JD4A 5K9DA 3KVMA 1Z44A 4GE8A 4WD0A 3KVKA 1M7PA 3RK8A 3EEGA 4NNCA 4R34A 1LOLA 3RLVA 1L6WA 5DLCA 3DFPA 3HJZA 1QPRA 3EKLA 1LROA 1L9WA 3DFQA 4JX6A 1O60A 3DFNA 3QSRA 4EF9A 3O8AA 3NPXA 4KWVA 2QCDB 3LX9A 4UNKA 5KZEA 2YW3A 4QITA 3TSDA 3CWNA 4OV4A 2J24A 5I3KA 1ZHAA 1NVMA 1DBTA 2XN2A 1SO4A 4HPJA 5D33A 5L9FA 4N4QA 4NVTA 1Y0EA 3W7PA 4O19A 1TPB1 1OYCA 2VELA 1VQTA 1B4KA 5D2TA 2QDHA 3W7JA 3UQNA 1ICSA 2DORA 2X1SA 5LNWA 3RMJA 2W0UA 1WOAA 4LVFA 4ZQCA 3NNTA 3SGZA 2IQTA 3C2VA 1P4CA 3G1VA 5A8GA 3L0NA 3UY7A 3STGA 4M5PA 4O0KA 3BG3A 4A29A 4WXYA 4WQ6A 3Q37A 4UR7A 1KM1A 3NQ7A 3QYQA 1B57A 1JR1A 4PTNA 4RV8A 4JTHA 1H1ZA 1W5MA 3IVSA 2NV1A 2NXHA 2H3BA 2Y7EA 3N9SA 2CW6A 3PBYA 1S5WA 4BK9A 2Z6IA 3L65A 1ADOA 1GTHA 5I3IA 2EKCA 1VLIA 3THAA 2J9ZA 3CHVA 4NJHA 3NQ8A 4PL1A 4C1KA 4UTJA 1X6UA 4KFPA 1UCWA 1JCLA 1GT8A 3AO0A 3T55A 5LSMA 2JK2A 1N8FA 4LC6A 4CCCA 4W9TA 2NUYA 3LTSA 4DEFA 1EA0A 5DCBA 4AHPA 3KAOA 4Y6GA 3W7LA 3QW4B 3IIOA 3QMTA 2G97A 4WZHA 1VH7A 4M6QA 3PY2A 3N14A 1H60A 3NVTA 3QMRA 1KTNA 4O1CA 4FNRA 3S42A 4EF8A 4EVZA 3HMJG 3QEZA 3LXCA 2A6NA 2V5LA 2ATSA 1PVNA 2ZA3A 4NX5A 4DPPA 4ZL1A 3HGSA 3W7DA 1ALDA 3W1NA 2V9DA 5CPLA 2EAWA 3RF9A 4RCXA 3NL2A 3IV3A 3G3MA 3PF3A 3UNDA 4MZYA 5EBUA 4NJIA 5HR6A 3PULA 3GXTA 1CX9A 3TA6A 2ZRXA 3A5FA 3TQ0A 3OHIA 1J5TA 3LM7A 3MYOA 3WJXA 1QWGA 5D04C 1H1YA 1GPWA 1LTDA 3EWUA 4O12A 4LT9A 4HSNA 3CTLA 1XXXA 3W1MA 5CSRA 1MEIA 2V2DA 5D2WA 5BNKA 1H7XA 3Q58A 3W23A 2QJHA 3VNDA 1K7FA 2PCQA 3DI1A 3NQGA 4IPIA 1TSIA 4FEZA 5CGQA 1I8JA 2A6LA 5AC7A 1EUAA 4L4MA 1D9EA 2Y62A 3LRKA 3WK1A 5AC8A 3HBLA 4AVFA 1I2QA 1H5YA 1XKYA 1OFBA 1FWNA 5SWUA 2GVGA 1SQ7A 3B0PA 3OVRA 5AHMA 3C52A 3TUUA 3W76A 5AHFA 4U28A 2O7SA 5C5YA 2QDGA 4HSOA 5U7SA 2CLLA 5K2ZA 3P62A 1YYAA 3ABRA 3NDOA 1P0NA 1OYBA 3PUOA 3GNDA 2WOQA 3W7CA 4I7UA 1JJKA 2A1YA 4B5NA 4QNWA 2YR1A 2G95A 1LBMA 3VKJA 3SZ8A 4ZZ9A 3W84A 2BTMA 3T44A 1GEQA 4NT0A 1CI1A 3OA3A 1K02A 2TPSA 4Z08A 2KZHA 3E0IA 3DFSA 5HWMA 4JIPA 4FO4A 2V0TA 5J5DA 3ELFA 3QSTA 1P5BA 3S5OA 3HOJA 1BTMA 5F4WA 4IQLA 2ZYFA 4RLIA 3CU2A 4N4PA 4HNVA 4Q32A 1LOQA 4PH6A 1X1ZA 1LRNA 4IUOA 4KFOA 1GTEA 2F7FA 1O4UA 3A22A 3EWZA 4OGZA 2C6QA 3NOEA 5KSWA 3W7NA 4IJBA 3I7QA 2GJLA 3NZRA 3DFOA 3G0XA 2QJGA 3N3MA 1H7RA 3L0GA 3GDLA 3RFAA 4WY0F 4XQ6A 1VGAA 5DN1A 3I6RA 3N2XA 2CU0A 4QJ1A 2R8WA 3H53A 1SW0A 3IIXA 3PBVA 2JBMA 5E93A 5CPMA 3I65A 5BOOA 1JRCA 3GKAA 3STFA 3M43A 5CSSA 3USBA 4X22A 3SJ3A 1I2NA 1G6CA 1ZY9A 3UZ5A 1TPWA 4UTIA 5AOUA 1R2SA 3MBDA 4AWSA 1TPFA 3VCRA 4IX2A 3PVFA 4GJ1A 4XBSA 3NM3A 4DF1A 1GOXA 4MOZA 3R5EA 4M6VA 2A7PA 5DCDA 1H51A 4N9CA 4CQ8A 4HT3A 3TXZA 4IXHA 4K39A 3LCWA 3F4WA 2QUTA 3PC0A 2ISSA 5J5RA 3QQ1A 3N34A 4PL2A 3P84A 4LY8A 4O53A 2ZRZA 2ZZ6A 3STCA 4MYXA 1QCWA 1EIXA 2ISWA 3UD6A 5LHFA 1OX4A 4O28A 3NQ2A 2E5DA 3L9CA 4Y8FA 1W5QA 4P2VA 4UTTA 4I9AA 1Q3NA 4OE7A 3TNOA 2Z0IA 3W1QA 2FPYA 1FWSA 4M6PA 3EX4A 5CPNA 4I7VA 1ZCOA 3NQAA 3ZS4A 5TBOA 1KV5A 2HTMA 3HG3A 3BARA 1JCJA 5EA9A 3PG9A 4LVAA 1TV8A 3CIXA 1Q6LA 3IIPA 3WFAA 4MPQA 1SZFA 2OT1A 3VI2A 4JDYA 3O6DA 2XN0A 3B05A 3OIXA 1OF6A 3L0KA 4NJKA 1ML1A 4JX4A 3P5YA 2J9XA 1C29A 4ZQRA 5FEZA 5F4SA 3O05A 3LHWA 3S5NA 1GVFA 3R89A 2CLFA 3GKFA 2GOUA 3M6YA 5FF4A 1OFDA 3DHDA 5EY5A 1OF8A 3GDTA 1GZGA 3A23A 4QAIA 4O18A 1IIHA 4FX7A 2FB3A 3UWVA 5G4EA 1S5VA 4DF0A 4UC5A 3EWBX 1RZMA 4NZJA 5KZDA 4A22A 3GDKA 5KINA 4DBDA 4BWLC 3DZ1A 4MY1A 1THFD 4LS1A 3NQCA 1TQXA 3TMLA 1SR9A 2FFCA 2YYTA 3LRMA 3K30A 1EP2A 3G8RA 2GPTA 1ONRA 3W85A 4JEQA 4UTKA 1K8XA 3ZWSA 3W7MA 2W79A 3W74A 2FPTA 4JTLA 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 2Y7G A;  4MFE A;  4ICN A;  4DXV A;  4BI5 A;  2QUV A;  1W5P A;  4LOC A;  3E02 A;  4OU1 A;  1KM3 A;  1C8V A;  4QQ3 A;  1FCQ A;  1GYN A;  4RK8 A;  2PC4 A;  1ME7 A;  3FFS A;  3KVJ A;  3UXD A;  3NL5 A;  1ZNN A;  8TIM A;  1JCY A;  5DCE A;  3QC3 A;  1UUO A;  1X1O A;  2VKZ G;  3E96 A;  1MEH A;  1O5X A;  1WV2 A;  3NR0 A;  4MUZ A;  3EWW A;  3HGR A;  3B03 A;  1S3H A;  2QCG A;  3SY5 A;  3LGE A;  4EOU A;  3LHZ A;  1WOB A;  3GB6 A;  3NPW A;  4JGD A;  5FES A;  4AEO A;  1HFB A;  1W3N A;  4AMA A;  2J6X A;  1M6J A;  4JYD A;  4NX0 A;  3MP3 A;  3G0U A;  1KA9 F;  1VRD A;  1XBX A;  2VEK A;  1VZW A;  3G1H A;  4TX9 A;  1KFJ A;  1TPC 1;  1TRI A;  3MBF A;  4TMB A;  4O1B A;  4TU1 A;  4UTM A;  3O1N A;  3CPR A;  1OFR A;  3WK0 A;  3G0S A;  3JRK A;  2H90 A;  2GVL A;  4GWE A;  1YLV A;  1SZN A;  3QRH A;  5C54 A;  3GK0 A;  3TAK A;  1NFB A;  2ZTJ A;  1SZE A;  5HJL A;  2ZZ1 A;  2AGK A;  1PS9 A;  2NX3 A;  2OT0 A;  4UMC A;  3HO8 A;  4FX8 A;  2C0A A;  1F6P A;  2PRH A;  4YXG A;  3IEB A;  3JR2 A;  3DFT A;  4K36 A;  3BG5 A;  3LHY A; 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 1IGS A;  1VHN A;  2YXG A;  1SW7 A;  3FYP A;  3PBW A;  3DKL A;  4KFN A;  3PAJ A;  1XDM A;  4DEL A;  1SUX A;  2YPI A;  4MLR A;  3PB2 A;  3S6D A;  4FHA A;  3SSJ A;  2HS8 A;  2B7Q A;  4XBK A;  2BLE A;  4UMA A;  4AWU A;  5LKY A;  4HNU A;  1EP1 A;  3O15 A;  4DPQ A;  1L2U A;  3B0V C;  3W1L A;  3UPB A;  1IF2 A;  3SEC A;  4YCO A;  5ABT A;  3W1P A;  3FKK A;  3DGR A;  1YTD A;  2A7N A;  2NX9 A;  5U4N A;  4JY9 A;  3CM4 A;  3M44 A;  3NPU A;  1X7F A;  1A5S A;  2YSW A;  2RFG A;  3S1U A;  3NXF A;  2VFE A;  4NJG A;  1ME9 A;  4HIB A;  3D0C A;  4ADS A;  2WKJ A;  1GG1 A;  4AF0 A;  3OVP A;  2AQW A;  2X16 A;  4LUJ A;  4LNY A;  3N2M A;  3FKR A;  5LNU A;  4FNS A;  2B7P A;  3STE A;  2J9Y A;  3SW6 A;  1FCU A;  1LLZ A;  3HGO A;  3LHU A;  4OT7 A;  4EWN D;  3NZ1 A;  3IVU A;  2D73 A;  3W86 A;  4DO4 A;  4HHP A;  1W8S A;  4JN6 A;  4GNJ A;  3GNN A;  3S1V A;  4NXK A;  3DHF A;  3WJY A;  1H50 A;  1LOS A;  4N2Y A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4AQL A;  3GYC A;  3GS6 A;  5FI8 A;  2EQD A;  3OZY A;  4KWU A;  3M5Z A;  3MHU A;  4CN4 A;  5CAK A;  4QGC A;  4TV6 A;  1X1N A;  3RU6 A;  1OJX A;  2PDQ A;  1JUL A;  2GJN A;  3ZLH A;  3YPI A;  1EGV A;  2VEM A;  3E12 A;  3OPS A;  3W70 A;  3Q2D A;  2Z1K A;  4I6K A;  4NZ3 A;  3VUP A;  4EKJ A;  5I24 A;  2BVD A;  1IXN A;  4E38 A;  1OEP A;  2DW7 A;  4BQ5 A;  3OOQ A;  1N7K A;  4HGX A;  5HNT A;  2GWN A;  2DZB A;  3RYS A;  5HUP A;  4W5Z A;  3TV8 A;  4MNJ A;  2QAF A;  4DF2 A;  3U6W A;  2EPK X;  1ME8 A;  3RM4 A;  3NAV A;  1XG4 A;  2VR5 A;  3VIK A;  1S2W A;  3KP1 A;  2IPJ A;  4UTU A;  5H1W A;  2WCS A;  1ADD A;  2HK1 A;  4MAD A;  1UH3 A;  4XAP A;  4GYP A;  1J01 A;  2OWC A;  3E9A A;  5F2G A;  4NXS A;  5GNY A;  1HKI A;  2YL9 A;  1VFF A;  2CHN A;  3EKZ A;  3QKZ A;  3DAQ A;  1VPQ A;  1K8Y A;  3AYS A;  4DBW A;  4FK9 A;  4RDZ A;  1XIE A;  3W2N A;  4M1R A;  4X2P A;  4ZE5 A;  1FBA A;  3GVQ A;  3QYS A;  2QPU A;  2OEK A;  4HA1 A;  4GUG A;  4E2B A;  5DML A;  3D5H A;  3TEV A;  1FX6 A;  2Z2U A;  1SJD A;  1I45 A;  4FXS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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