3MJY | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	314
structure length	306
Chain Sequence	GSMSLQVNLLNNTFANPFMNAAGVMCTTTEELVAMTESASGSLVSKSCTPALREGNPTPRYQALPLGSINSMGLPNNGFDFYLAYAAEQHDYGKKPLFLSMSGLSMRENVEMCKRLAAVATEKGVILELNLSQVAYDFDAMRQCLTAVSEVYPHSFGVKMPPYFDFAHFDAAAEILNEFPKVQFITCINSIGNGLVIDAETESVVIKPKQGFGGLGGRYVLPTALANINAFYRRCPGKLIFGCGGVYTGEDAFLHVLAGASMVQVGTALQEEGPSIFERLTSELLGVMAKKRYQTLDEFRGKVRTL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase
publication title	Novel insights for dihydroorotate dehydrogenase class 1A inhibitors discovery. pubmed doi rcsb
source organism	Leishmania major
total genus	107
structure length	306
sequence length	314
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.3.1: Transferred entry: 1.3.98.1.
pdb deposition date	2010-04-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3mjyA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3mjyA01

4R53A 4LVDA 5EMUA 1MXSA 2ZRXA 4RKAA 4M6PA 2G5WA 5BNKA 3C2OA 4OV9A 1M7OA 3RF9A 3EEGA 1LDCA 4LOCA 3PF3A 2VENA 4GWEA 4NUWA 3UWYA 4LTSA 1SPQA 1DV7A 3N73A 3NQFA 4FIRA 3HO8A 5G2HA 1OX5A 2QCLA 2WSQA 4K8HA 3W22A 2GOUA 2NUWA 3D0CA 1RQHA 1OFPA 5F1VA 1ZAIA 5CGQA 4FNUA 1S5VA 1AK5A 4UFJA 2QUTA 3TV8A 2P10A 4GBUA 5LNSA 3DHFA 1KFKA 1QO2A 1TPEA 1GVQA 4NJKA 1Q6OA 3UWVA 3V75A 2V2DA 3BARA 2DJXA 1MEHA 3FOKA 5DBUA 1KV8A 1CX9A 1BWKA 1JCYA 3S1UA 2F7FA 1LRQA 1GZGA 3WJXA 4N6EA 3W70A 3NQ6A 3BLFA 4O1CA 3P8IA 4O17A 1PL9A 3M0ZA 3O05A 1ICSA 5D2WA 2O7SA 5CZTA 2CZFA 3E12A 1KFEA 3G1AA 3C2FA 5LGZA 4TX9A 1GVSA 3SJ3A 3DXIA 1AG1O 3UY8A 1P0KA 3TSDA 3WJSA 2JKEA 3MI3A 5K4XA 3TC6A 4QNEA 1K8YA 3LI0A 3U2OA 1LLWA 4FNQA 4R34A 1TTIA 3HQ1A 2NUXA 4UTUA 2ZA3A 2QCCA 5EL1A 4ORIA 4CCCA 4QITA 1YDNA 4O50A 1YLVA 2Y70A 3F03K 5HQEA 1FXQA 4CQAA 4GRSA 2XN0A 2CLHA 5K3VA 3C0JA 4NX5A 1GVRA 3NQGA 5HMSA 3B06A 3OG3A 1OK4A 1FCBA 5D02A 3DFTA 3VI2A 3PBYA 3R2GA 1K3UA 1G67A 2VFFA 5EKYA 1H61A 1SQ7A 2WV8A 4TO8A 4LS1A 3OVPA 4DEFA 4OV4A 3R8RA 3OVQA 3P8JA 4AB4A 3GNNA 5C54A 3CU2A 1SR9A 4QJ1A 3HPZA 2TRSA 2E68A 4Z0SA 4DF1A 3K30A 8TIMA 4JEQA 2QKFA 4PCFA 4RK8A 5DY2A 4XTDA 3W1LA 1BWLA 1LTDA 1Y0EA 4WY0F 4DO6A 2G97A 1OYBA 1W3IA 4N02A 1YXCA 2WOQA 1HO4A 5DCDA 1TPC1 4LVGA 2ISSA 3N19B 3IVTA 4I7UA 3A5FA 4JIPA 4UC5A 1TTPA 5DXXA 2VFIA 1IXOA 1VC4A 2YR1A 2R8WA 2X1UA 3PY2A 3EKLA 3GKAA 1OHLA 1FWTA 1K7FA 3HG3A 1GYNA 4O1DA 4NNCA 5D2TA 3NPUA 2E6DA 1JQVA 4AHOA 3M41A 4XBKA 4UTTC 3TXVA 1K8ZA 1RQEA 2YYUA 1P4CA 1P1XA 3MYOA 2A5HA 1G4PA 2NLIA 4LT9A 3NZRA 3NO5A 4AVFA 4A22A 1QOQA 1SW0A 4QQ3A 2YXGA 3MP4A 3NPXA 2QCEA 1A5BA 3QRHA 1Z41A 3W76A 4O28A 4TU1A 1VLWA 1LP6A 1JRBA 4E2BA 3A21A 2OCZA 4UFKA 2QAPA 3C2EA 3PS7A 3SFKA 2CLFA 1YADA 4QNWA 3LRKA 1Z48A 4XUGA 5DLCA 3EB2A 4CCDA 4GNJA 2E77A 3QPYA 5F2GA 3NYZA 5G4WA 1LBMA 4JYEA 3TMLA 3W73A 2KZHA 5FF2A 3TJLA 1TO3A 4MZ8A 3EWBX 3LHTA 1QWGA 1WA3A 1X1ZA 2I14A 2NX3A 1SUXA 2V0TA 3NVTA 4IX2A 3HG4A 4DPQA 2Z1BA 1GWJA 2QEZA 2YDAA 2HTMA 1G4EA 2NXIA 2Z6JA 1ZCOA 2YFNA 1GQNA 2X1TA 3HG2A 5HR6A 3CEUA 1UB3A 1VGAA 1QO5A 4JX6A 3UD6A 3IGUA 2NWSA 1DKWA 4HKPA 1JULA 2RKXA 4LWWA 3DFNA 3G3MA 3QZEA 3W2KA 3B0PA 2GQAA 3TA6A 2PCQA 4LVAA 1ICPA 2ABBA 3SW6A 3T4CA 1BEUA 3NDOA 1YPIA 3MMTA 1YDOA 1Q45A 2AQWA 2FB3A 4UR8A 3MO7A 3W7QA 3SSJA 1O4UA 5HINA 3KXQA 1EA0A 3TIMA 5KMYA 2Q8ZA 5A5WA 1S5TA 1UCWA 3THQA 1A5AA 1WXJA 3UY7A 3CT7A 3USBA 1G6CA 2DJLA 3MP5A 4FB7A 4PFMA 1W31A 1W5QA 3PUOA 3CM4A 1JCLA 3FIGA 5HJLA 2X2GA 1JJKA 3IEBA 4UXDA 2BXVA 5E0KA 1TSIA 3GDTA 3W2LA 1FCQA 1Z44A 2OT1A 2ZZ6A 3KVKA 4JX4A 3BO9A 4P2VA 1Q6QA 3VE7A 1IGSA 4MLJA 4O13A 1KBIA 2TMDA 1F05A 3BPWA 5K7JA 3GVGA 3CLMA 1FY6A 4O1AA 3EX1A 3BW2A 1GEQA 1AW1A 3W83A 1FDZA 1KA9F 4MVAA 3SECA 4JY9A 1VQTA 2H3DA 4A2SA 1TV5A 1XCFA 3LXBA 4ZQCA 4AF0B 1OK6A 1O60A 2HMCA 2QUVA 3CWOX 2ZTKA 3EXSA 1TPFA 1QPQA 3DI0A 3M6YA 3NEVA 2HS6A 3QF0A 1H1YA 2A0NA 4K37A 1ML1A 2ZZ2A 2UV8G 3FLUA 3TW7A 1RR2A 3BGGA 1EIXA 4S2BA 3BLEA 4LV4A 3MP3A 3TNOA 2C16A 3O15A 1EP1A 1KLZA 4TMBA 1UUOA 5C6MA 4GJ1A 5DCEA 3S1VA 3LDVA 1R30A 4K7YA 4JGDA 3NQCA 4D2JA 3KHJA 3HOJA 1VR6A 1R47A 2EPHA 4IMCA 5LSMA 1JUEA 2BLEA 3STFA 5LNUA 4PA8A 4E2DA 1TJRA 3L68A 3PB2A 3IIZA 3FKKA 3GB6A 1W5PA 4HHPA 5FEPA 3CC1A 4OGZA 3I7RA 4LS2A 1XBVA 3N9RA 2VELA 3BW4A 3KRUA 3LBCA 4LRSA 1EEPA 3P62A 1L6WA 1FDYA 2B7NA 5E93A 3QC3A 2EKCA 5D2YA 4TMCA 3KVLA 3LXCA 3PSVA 1U5JA 1QPOA 3IVSA 3A23A 1K7XA 3LTYA 3C4UA 1O5XA 2Y63A 2HS8A 5TIMA 1H7NA 4O0KA 4FX6M 4JICA 4KKXA 3DKLA 3R12A 2CU0A 2O7QA 1H60A 1DVJA 1TCDA 5AC8A 3NOEA 1XDLA 5FEWA 3P80A 4UMAA 1VRDA 4HIBA 2YPIA 2ISWA 1T99A 5EA9A 1H7OA 3G1FA 3OA3A 2E5CA 2NXHA 3I7SA 1TPWA 1V5XA 1DHPA 4NU7A 4LVBA 1JCMP 1T8XA 4AWTA 1KM1A 5LZLA 5C5YA 3L0NA 1LRTA 2XFWA 1F6KA 1ZAHA 3MHUA 2QCFA 3NZ1A 1IXNA 3HIJA 2CLKA 4G1KA 2Z6IA 1XM3A 4AWUA 2OT0A 3DFQA 2E6FA 1KM4A 4N6FA 4O0ZA 4IMEA 3GYEA 4EF8A 2NWRA 1UJPA 4WOZA 3MI2A 1F2JA 4NNAA 4YWIA 1H7XA 6ALDA 2HSAA 3FA5A 2WPBA 4M6QA 1DORA 3ZWSA 2ZRUA 3LV5A 3A22A 3KRSA 3TSBA 3GKFA 3JS3A 1M5WA 3NQDA 1SU5A 1I2RA 3R13A 1W1ZA 1ZALA 3S0CA 3EWYA 3IIOA 4CQ9A 4NZJA 2TPSA 3BK0A 3EWUA 7TIMA 1IF2A 2BZNA 3MHGA 1TPH1 3R5EA 1HG3A 3C61A 1DQWA 3NNTA 1LROA 3VFLA 3RK8A 1YXYA 2ZZ3A 4KWVA 2FFCA 5IM51 1A53A 3M5YA 3ZFHA 3W7KA 3LHVA 3NQ8A 3W2JA 5FESA 3M43A 4QISA 3UXAA 3M47A 4DBDA 2V9DA 3LTSA 1W8SA 2FPVA 3BW3A 4XWUA 2P1FA 2GVJA 3G1SA 4IOTA 1R2RA 3HGSA 3LM7A 3M7WA 2JGQA 4O53A 1THFD 1QDSA 3C2RA 4AWSA 1XBXA 3WK2A 4O8RA 4KWWA 5FF3A 4IMFA 3G18A 4Z1BA 1GG0A 4O19A 5CPMA 4K7VA 1OX4A 3PBUA 4XTIA 5F2MA 2NXGA 1HUVA 2Y88A 2NV2A 3AJXA 3PBVA 4N9EA 2C18A 3N9SA 1LOSA 1TRDA 5K9DA 4QSHA 3F4WA 4OE7A 3GXPA 2B7QA 2Y89A 2A7PA 4ZQRA 3FS2A 4JTFA 4WUIA 3YPIA 3W1PA 1VHNA 4Z08A 4Y96A 3TAKA 5HUOA 4UTHA 2W6RA 4BWLC 4H4IA 1WBJA 5DBTA 5EBUA 4TR9A 3L66A 1KTCA 1F5ZA 1FWWA 1RD5A 1EUAA 1TPUA 1K8XA 1SW7A 4K6AA 2WO5A 4DPPA 1MZHA 2RHGA 2WNNA 1EWDA 1YTDA 3CEPA 4OWGA 1WOBA 4UMBA 1G7UA 1PVNA 3SZ8A 1KM5A 2Y85A 3E96A 4YL2A 3OEXA 4A29A 5DN1A 1KFJA 3SIZA 5H91A 4QM1A 3TXZA 3GK0A 1SO3A 1L9WA 1XBZA 1JUKA 4GXMA 1SW3A 3LHUA 2JK2A 1KM6A 3EXTA 4B5NA 1SZGA 1PE1A 3TH6A 3W7IA 2ZRWA 3HPXA 4FNSA 2NZLA 1N55A 2Z2UA 4YLWA 3MYPA 3EWWA 1WYIA 4AH7A 3N3MA 4KFOA 2RFGA 3S8HA 1QMLA 4K39A 4IMDA 4MZYA 4CNOA 4IMGA 1TMHA 4RLIA 3TMQA 3W7DA 1YDVA 3L5MA 1GT8A 4GUGA 4O12A 1TRIA 3QEZA 3I7QA 4IJBA 5L9FA 4J9JA 4Z1AA 3PG8A 2BWGA 4MFEA 1XI3A 4BR1A 1KV5A 1B3OA 5D04C 5GVJA 4LC6A 5MHBA 2FIQA 1S3HA 2WNZA 3G3DA 3PUDA 1KFCA 2WQPA 3QMTA 1QFEA 1RVGA 2W0UA 5FF4A 3TUUA 2PRHA 3TCEA 2YYTA 1DJNA 4WXYA 5LNRA 4NXSA 2DZTA 4PTNA 2XN2A 3W2NA 3HGOA 3LHYA 2VXNA 3MW7A 5I3FA 3NAVA 1A5SA 2QCDA 2TYSA 2R94A 5BRBA 3N14A 3THAA 2ZDRA 3TE9A 3GDLA 3E0IA 4JTSA 1ME8A 3QMRA 5TQLA 4E0CA 4ICNA 3GAKA 5F2IA 5ABTA 1OFOA 4OQVA 4AEOA 1PCKA 3G24A 1X6UA 1T0OA 3BG3A 5AOUA 1WX0A 1NF7A 1MO0A 1SO6A 4ADUA 2WJZA 1SO5A 1W54A 3O16A 4C1KA 5HR7A 1ZY9A 2GUUA 4Q4KA 1MSSA 2B7PA 3S5ZA 4PEKA 1TTQA 4NXKA 5I3HA 3PM6A 3IGSA 4BFAA 4NJHA 5AHIA 1LBFA 3B05A 3TX9A 4GUFA 3I65A 5F1UA 3B8DA 5DELA 3W7RA 4WXZA 3LLFA 4YCOA 1QR7A 3ATZA 3P74A 2A7RA 2B7OA 3LCLA 3OBKA 1ZAJA 3P7YA 1Z42A 3LTPA 4FO4A 3NM1A 4JS3A 3W2UA 2A85A 1H50A 3TSMA 4H6KA 1W3TA 3DFSA 4K8EA 3PSWA 3C52A 3LHZA 4ZQMA 5HNRA 1OFQA 2QCGA 4MFDA 1R46A 3NM3A 3B0UX 4IPJA 5DY3A 4FXSA 1Q3NA 3N2XA 1PHQA 2W79A 4ZZ9A 1ICQA 1W3NA 2I9EA 4WD0A 3ZS4A 4UTTA 3TDFA 2YCEA 3ABQA 5FEXA 3W07A 3G0XA 3LCFA 3S1XA 3P5YA 3PB0A 4IUOA 5DXYA 4C1LA 3AO0A 2A21A 1FUYA 2RH9A 3STCA 2Y7GA 3KAOA 5D03A 3H53A 3B04A 1ME7A 1NEYA 3O8AA 5I3KA 4HN4A 2A2IA 1P5BA 2Q3OA 5CPOA 5F4XA 3PR2A 2OMAA 3TQKA 4HPXA 1KW1A 4XKYB 1RZMA 1QOPA 1GYLA 2YW3A 1AL8A 3T40A 3INPA 1LCOA 4AMAA 1OYAA 1GTEA 4Z1CA 3STEA 4O4VA 2C0AA 3W87A 4MIMA 1ONRA 3FJ6A 4UFIA 3P84A 3VCRA 2WNQA 1AMKA 1XFBA 4WY0A 2IQTA 3S42A 4NX0A 4UTMA 2E09A 2CZDA 2ZA1A 1MEWA 3L0GA 3N34A 3W7HA 1UBSA 1MEIA 2GJNA 1RQBA 2NX9A 1I2PA 4FNRA 5EY5A 2CLMA 4O52A 1G4SA 1U83A 3W7MA 1PHWA 4ML9A 1I2NA 3S5YA 4CNNA 3B03A 3FYPA 2E6AA 4AHPA 3DU0A 4CLMA 1IXPA 3UPBA 3OVRA 1KM2A 3LERA 1J4EA 1VJIA 4K36A 2FPTA 1H62A 5CZJA 3KVJA 4FXRA 4BK9A 4M6VA 4ZL1A 5F4WA 3P82A 1BTMA 4NZFA 3CB8A 3O1NA 3G1VA 1KLYA 3LCGA 3NQEA 5AHLA 4LVFA 4YMZA 1J5TA 3BVJA 3C56A 3NA8A 4NJGA 2AGKA 2QUUA 4FX7A 4BI7A 3DGRA 5EPDA 1LORA 1B57A 3GAYA 1H7WA 1VYRA 2ZZ7A 3FEMA 2A1YA 1LLZA 4N2YA 1TPDA 3P60A 3PULA 3QPZA 3WJWA 3ATYA 2NV1A 1E51A 2G96A 1TREA 1VHCA 5D30A 1TV8A 1TQJA 1UASA 3KVMA 5AYZA 2OZ0A 1OFDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3MJYA

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