3MMW | Genus

Total Genus 130

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	130
sequence length	309
structure length	309
Chain Sequence	VDPFERNKILGRGINIGNALEAPNEGDWGVVIKDEFFDIIKEAGFSHVRIPIRWSTHAYAFPPYKIMDRFFKRVDEVINGALKRGLAVVINIHHYEELMNDPEEHKERFLALWKQIADRYKDYPETLFFEILNEPHGNLTPEKWNELLEEALKVIRSIDKKHTIIIGTAEWGGISALEKLSVPKWEKNSIVTIHYYNPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGSPDDQKHLIEEFNFIEEWSKKNKRPIYIGEFGAYRKADLESRIKWTSFVVREMEKRRWSWAYWEFCSGFGVYDTLRKTWNKDLLEALI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Endoglucanase
publication title	Biochemical characterization and crystal structure of endoglucanase Cel5A from the hyperthermophilic Thermotoga maritima. pubmed doi rcsb
source organism	Thermotoga maritima
total genus	130
structure length	309
sequence length	309
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date	2010-04-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3mmwA00

2J77A 2YA0A 2AAAA 2DSKA 1CBGA 2HISA 3BH4A 3NDYA 1HKIA 3GH7A 4V2XA 3K4DA 1BGGA 3EDKA 5A94A 2DGAA 4GI8A 1HIZA 4OJYA 3GH4A 3N04A 4JCMA 1E6SM 3WL1A 4AIUA 3WQ8A 3BLPX 2JF7A 4NSBA 4HPGA 4AEFA 3T08A 1JI1A 1Q6CA 1H09A 3A4WA 3NSXA 4DUXA 1UZ4A 1US3A 5FCZA 2XGIA 1W3KA 2J7GA 4EK7A 3VMPA 4IPLA 2VNCA 3W28A 1X6NA 3WUEA 1ISVA 4U33A 4FK9A 3THCA 1JDCA 5GNXA 3OB8A 3ZR5A 1GOMA 1JGIA 4D6HA 4BQ3A 5BWFA 1WPCA 4MB3A 1UZ1A 3WUBA 4BCEA 3CUIA 3K8MA 5JIWA 4UFJA 3SCVA 3GXIA 4NZCA 1K9FA 1LLOA 3BAJA 3DYOA 1KXQA 3MKKA 1N82A 2NT0A 3GH5A 3PTQA 4KH2A 1W9VA 2WC7A 1ODUA 3RIKA 3W0KA 4M1RA 1J0IA 3GBEA 4XX6A 1U30A 1LWHA 2Q8XA 3N17A 2D20A 2X2YA 2WVUA 3ZR6A 1CWYA 1XYZA 1W3HA 3ARUA 4LGXA 2OWWA 1OM0A 2GVYA 4GIAA 2WSKA 1HF6A 1G01A 1B3XA 1W9PA 3GNRA 4P8WA 4PUDA 2BVDA 1EQPA 1E4LA 2J47A 4URIA 5LA2A 3CHFA 1WNOA 2D1ZA 5ECUA 3CMJA 1CXHA 3VUPA 2Y8VA 4WJXA 2J79A 2XFYA 4A4AA 2FGZA 2J8FA 3UG4A 4F66A 1QI2A 1B31A 3OZOA 4LXFA 3WH5A 1GHRA 1AVAA 3I3BA 2W62A 1BQCA 1FA2A 1UKQA 2WC4A 1V3MA 1B2YA 1UKPA 3I3DA 1V3LA 3NUKA 4TTGA 3WQ6A 2X09A 3W4RA 5DFAA 2IXVA 1SMDA 3MV11 4J27A 1E0XA 3BSHA 5AYIA 4GO9A 2D0GA 4JFWA 5D9PA 4UOQA 3SCOA 2QV4A 2G3MA 1NQ6A 1YHTA 1JZ3A 1F4AA 3ARZA 4MJ2A 1V03A 4MB1A 3W24A 3VO0A 5CXPA 4UQBA 2WPGA 5C8BB 1TA3B 1UD3A 1C7SA 5CLWA 3BCFA 2WMIA 3AROA 3POHA 3VGHA 2WYSA 1US2A 3VX0A 1B3WA 3ZQ9A 3BC9A 5IXEA 2D3NA 4CD7A 3GXMA 2W63A 1UD5A 3L4XA 4U3AA 4AIEA 2DSZA 2DH2A 2IUZA 4DWSA 4AD1A 5ABEA 2D2OA 4HA1A 2A3BA 4MADA 1FFQA 2CIPA 4QCFA 4V27A 2YBTA 4QLLA 2DQXA 4MDOA 3WD0A 2OSXA 1C90A 4Q7NA 2EPMX 4BS0A 1V3KA 5IHRA 1TG7A 4GO8A 4YHEA 3VDBA 1E1EA 4S3KA 5EB8A 2Y4SA 1AQHA 2VZUA 2BHZA 2J7DA 2XHYA 2DPEA 1E3XA 4E8DA 1IT0A 3L4UA 4ZXLA 3AHTA 2OWCA 1UD4A 4W8LA 3VINA 2DSUA 3APGA 4PMNA 2J7EA 4L4OA 8CGTA 4P7QA 3U5YA 3RDKA 3WUGA 5A1AA 4ML4A 2DT1A 1NWSA 2YIHA 2CKSA 1CDGA 4AZ6A 3NYDA 2JEQA 2WNWA 3CZ8A 4P7RA 4ZE4A 3RJXA 3BXWA 4S3JA 3D5HA 2XGBA 2VOTA 2XTKA 3PZMA 5F7UA 4GINA 1UHVA 3FAWA 2O9RA 3THDA 1JAKA 4HA4A 4WLCA 5BCAA 2J4GA 3UR8A 2WANA 3WNPA 2XSBA 2ZUVA 3WL0A 2WCSA 4HA3A 3ZM8A 1H3GA 1JYWA 3CTTA 4D6DA 2W61A 1JNDA 1H2JA 4TOQA 3BAKA 4HOXA 1E0WA 1E72M 1QNPA 1CGYA 1BSIA 1KGXA 1XH2A 4H2CA 1PIGA 5D9MA 1VEOA 3T09A 5CQ1A 2WHJA 3AOFA 3BMVA 5BROA 1OBAA 2PB1A 4AMCA 1GJWA 4H8UA 1G9HA 5FD0A 1C92A 2WBGA 1F4HA 3AISA 3CUHA 4P7OA 1GOKA 3S6TA 2C8NA 2V3FA 3SUSA 3AXHA 2XG9A 3VVGA 3K4AA 1QBAA 3U7BA 4W84A 2D0HA 5E09A 3AIRA 3WQWA 5DMYA 1ECEA 3CZGA 5FKYA 4PTWA 1J10A 1HKKA 3WKZA 3O9NA 3VM5A 4TX6A 1A47A 3GNPA 1OIFA 4QDMA 3VM7A 1CGXA 1WB0A 4WIWA 1A3HA 3ZO9A 1B9ZA 1JG9A 1FOBA 2YLLA 2GK1B 2WWDA 2J74A 1JIBA 1D7FA 1E43A 2MANA 3QHMA 4ATLA 2V3GA 1G1YA 1GZJA 3KZSA 3NJ3A 1M04A 3M6DA 1TCMA 3N9KA 4W89A 4GZEA 3W29A 2ZOXA 3FW6A 3PZ9A 4JFTA 4WKHA 3QHNA 2GJXB 2BXZA 3OGVA 9CGTA 1DWIM 3DC0A 2ZUWA 4N42A 1KBKA 3NCOA 5I5RA 4D6EA 3AHYA 4LPCA 2VCBA 1KXTA 3PZTA 1QNRA 2VZTA 4R5EA 1GOWA 1GCYA 3SUWA 1PX4A 1UG6A 1UH2A 4XV0A 5A8PA 1ODZA 5HBFA 2E9BA 1JI2A 4ATDA 3FY1A 4PSRA 4TUFA 2UY5A 2BY2A 1UOKA 3ZJ6A 3L2MA 4JCLA 4AC1X 4J3WA 3AS2A 2WHKA 3CZEA 3VX1A 5HOSA 2WZHA 5A8OA 3VD4A 1EIBA 3ALGA 1J11A 2YLAA 4P7LA 1W3LA 1VAHA 1FP9A 1MQPA 1V6XA 1PIFA 2CXGA 2VVSA 4CCDA 3KL3A 2YJQA 1DWAM 2BVYA 1HJWA 2FH8A 3WF1A 3L4ZA 3AHXA 2D23A 3VIMA 2YBUA 5E70A 1XSJA 3CMGA 3UG5A 1DWFM 1JFHA 1XC6A 3WDRA 3SCTA 1OT2A 3LMYA 3U7VA 2YL8A 1JAEA 3ARXA 1E4MM 3SCSA 2CPUA 4JAWA 3RCNA 1NOFA 1H4PA 4OOUA 7A3HA 1CXLA 4AZ5A 3EMCA 3BAXA 3TTOA 4W5UA 5M3WA 2ZIDA 4UFMA 3B9EA 1WKYA 2QMKA 3A6OA 2F61A 1W2VA 4FLOA 3BAWA 3OGRA 3BAYA 2QLYA 1VB9A 5M17A 1WO2A 2HVMA 4ZEPA 5ABFB 3KE0A 5I23A 2WCGA 4UFLA 1DWJM 3FN9A 3ZJ7A 1QHPA 1W9UA 4UZSA 6TAAA 4C7DA 3HMCA 3FHQA 3MSGA 2O9PA 2IXUA 1OWQA 3KL0A 1EDGA 2XVNA 3LPOA 1FH7A 4ACZB 1RP8A 4J3UA 2VCCA 3AJ7A 4FMVA 1J0HA 1WE5A 3BMWA 5I77A 4K68A 5A6BA 1GPFA 1ZB5A 5BYWA 1WAWA 3WNNA 2BS9A 4D6GA 5AC4A 1M53A 5HPOA 3JUGA 1JZ5A 4W88A 4AD0A 3WEZA 3W81A 1GQIA 3VIIA 3OA5A 2GJRA 1W1VA 3ARTA 1BFNA 3W25A 3OLDA 4ZXOA 1HL8A 4W7VA 3D3AA 2VCAA 2WW5A 1W32A 2ZUSA 1BG9A 2XWDA 4Z2GA 3ECQA 3WH8A 3N18A 1QVBA 3QOMA 2PBGA 3PN8A 4M24A 5HXMA 5FOOA 1KWGA 4EKJA 1Q6EA 1TVPA 4M8UA 3CZJA 3E1F1 3GDBA 1EGZA 4PRWA 4WKFA 4UFHA 4WF7A 3A4XA 2WKLA 3AIEA 3HN3A 1R7AA 1QOXA 4J3XA 3RMEA 3AMKA 1H0GA 2G41A 2XSAA 3AMCA 5E6YA 3WD2A 5IHSA 1OINA 4JKKA 5HPCA 3O6AA 5A8NA 4OOZA 3MMUA 2DIEA 3PZGA 3PZVA 1XD0A 2V5DA 2ZWZA 3AIBA 2BHUA 4J3VA 1EQCA 1ISXA 2ZUUA 2VZVA 1JYXA 4Z2KA 3SCUA 5CG0A 3AQUA 2WM0A 5CJ5A 2EQDA 5DEZA 2WMHA 4KMQA 2J75A 3CUGA 4UFKA 4E4PA 5EMYA 3WBAA 2QMJA 1DWHM 2CERA 4UR9A 1H41A 4R27A 1JZ6A 4OKDA 3K46A 4XUYA 4FLRA 2WCAA 3AXIA 4ZE5A 3SCQA 1S46A 4D71A 2VX5A 3ZOAA 4W5ZA 1VF8A 1U33A 2BY0A 1D2KA 4QLJA 4LYRA 1W91A 3J7HA 2VRKA 1GORA 1J0KA 4M29A 3A3HA 5CLTA 4Z2HA 4UNIA 3AS1A 1JF5A 1XSIA 1UQYA 2AMGA 4FF5A 3UR7A 1H11A 1CNVA 1HJVA 1K9EA 3ZT7A 4PBGA 2EPNA 3NIYA 3EDJA 5FIPA 5BXTA 1MW0A 1ESWA 1UWQA 2EEXA 1JZ4A 4AZGA 3VIHA 2J7FA 4CD8A 4XZBA 1BF2A 1O7AA 2CKRA 3SIMA 2JE8A 1CENA 1ZBVA 5JBFA 5CSYA 2GK1A 4OZOA 1MQQA 1R85A 4LX4A 4PCSA 2A3AA 3O2LA 1C8QA 1V02A 3VGBA 2VZOA 1PBGA 3AMDA 4KRUA 2GJXA 1EA9C 3K8LA 2WHMA 4IISA 3MMDA 1E1FA 3LPGA 5I2UA 4MNMA 2BHYA 4U31A 4AD3A 1UWIA 1BVZA 3UETA 2ZX5A 3IJ7A 1ZU8A 1WZAA 2BVTA 4KRTA 1E6NA 4OUEA 1HP4A 1E4NA 1JNEA 1VBRA 4W7UA 1E70M 4RE3A 1WDQA 3CUJA 3ARSA 1W9DM 1C93A 3W37A 1CEOA 5CPTA 3K8KA 2W92A 4AY1A 4HZ8A 5A2BA 1EO7A 4AD2A 5JUVA 2XYLA 1DHKA 1I1WA 2ZUMA 2D22A 3PTKA 2DSWA 1JXKA 2VX6A 2VC9A 2W66A 2VMFA 3QHOA 4W86A 1UR0A 3QR3A 3AS0A 1CXKA 4GI9A 3CUFA 4B3KA 3LPFA 3U57A 1GHSA 1E4IA 1QPKA 4HP5A 5A6LA 1SYTA 3AIQA 4JZ5A 3VGFA 1E9LA 3WF3A 5KZ6A 1GOIA 3POCA 1LG1A 1V6WA 4IPNB 1Z32X 1NOUA 4UQAA 4AZIA 3WDHA 4QLKA 1VIWA 4W8BA 2ZE0A 1EOKA 1JFXA 3M07A 1UH4A 3VIKA 1J0ZA 5HNNA 1B3VA 5A95A 1KGWA 1E40A 4CD4A 3CIVA 4HU8A 1UQZA 1XCXA 4U3CA 3IJ8A 1H1NA 4GZIA 1HVQA 1J18A 2YA2A 3MUIA 5I78A 3TTYA 1UD6A 5AC5A 3AZSA 3VIGA 1H49A 2XFRA 4PUEA 5I0DA 1XGZA 2CHOA 1LL4A 3WQVA 5DT5A 5A8QA 4B16A 1K9DA 4AZBA 1E6QM 3VDHA 5E0CA 1GONA 2YOCA 2CITA 4NRSA 5ABFA 4H8HA 3VNYA 3PBGA 1EDTA 1KQYA 2YKKA 4PYSA 4FLQA 3T2QA 3GZAA 1QW9A 3WELA 3WD3A 3AFBA 4CU8A 1QBBA 1BHGA 3T0DA 2EO7A 5A6SA 3AS3A 3KEHA 4PMRA 1R7OA 4PEEA 4X0VA 4F9DA 1IZJA 3ARQA 3AHZA 2VR4A 3MO4A 3DECA 1E56A 4PCTA 1AMYA 1HNYA 4U5IA 3AHVA 2ZXBA 7CGTA 4MNKA 3T2PA 3CZKA 1H5VA 4JHZA 4DWSD 1GQJA 1OT1A 1JZ2A 1ZL1A 2NT1A 2VJXA 1XRVA 2YL5A 4TVDA 1WZLA 3F5JA 1PZ2A 5BXRA 3PZQA 2XM2A 2FHBA 1ITXA 1OCQA 4BF7A 4CVUA 2J62A 4CN4A 1UKOA 1DP0A 3W6LA 2ZX6A 4D1IA 2WWCA 2X8RA 1OSEA 4M81A 4DM1A 3T2OA 4HZ7A 3IJ9A 4ZFMA 2XPKA 5GPRA 1IV8A 3MUZ1 1ZBWA 2PWFA 2X1IA 4PMYA 2GSJA 4JFSA 1O6IA 3VILA 1JD9A 4TXEA 1UKSA 2QPSA 4GQQA 4W87A 2WMJA 5C71A 4W85A 3L2LA 4CU6A 3IAQA 4JHOA 3ZIZA 4TVCA 2CHNA 4B15A 3WIJA 1QHZA 4H04A 3DYMA 4UQCA 2ZUNA 3FXYA 3VPLA 4ACYA 2YL9A 3WH9A 3EMZA 4QAWA 1TR1A 5A6KA 2ZICA 1GQLA 3GYCA 4QP0A 5CPQA 2D24A 3M46A 1E0VA 1V0KA 4C7GA 5M5DA 1CGWA 3GTNA 4D6CA 2G3NA 4F8XA 1VEMA 3HJEA 1UWRA 4YHGA 4F79A 4C7FA 4D1JA 4WSKA 4PMQA 1V3IA 2J78A 1UR8A 4PMZA 5A2AA 5ABHA 3B8SA 1PZ3A 3VIPA 2DDXA 1E6ZA 2A3HA 2VTFA 3ARVA 4CN6A 2ZX7A 4DM2A 3CGTA 1WP6A 1X6LA 3F5LA 1VFOA 1LL7A 1OIMA 2WKGA 2XIIA 4EAMA 2G4FA 3PHAA 2JALA 1W1YA 3DHPA 2FHFA 3CBWA 3OLIA 4MDPA 4AZCB 3L4VA 1GNXA 1HJSA 5M03A 4A3HA 1E5NA 2XWEA 2Z1KA 5CGTA 3VIFA 1J9YA 1RD6A 2WVTA 4UQDA 1BAGA 1MFVA 2YDQA 3CHEA 1AQ0A 1UYQA 3WENA 1I1XA 4E2OA 1VEPA 2V3DA 4RE2A 2Z1SA 2OYMA 5DO8A 3TA9A 1UWSA 1PJ9A 4AD4A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1NWT A;  1PX3 A;  2VI0 A;  5HDR A;  1UR2 A;  1QI5 A;  4TX8 A;  1KB3 A;  1SR0 A;  3WEM A;  5BXP A;  2WZI A;  4IM4 A;  3EMQ A;  1FH9 A;  2EPL X;  3AXX A;  1LG2 A;  2W5F A;  2J7B A;  3S2C A;  1G94 A;  3N15 A;  2WMI B;  1CLV A;  3EBV A;  2OYK A;  1JYN A;  1FHD A;  3IAN A;  3B9A A;  1XCW A;  3ARR A;  4UTF A;  3ZT5 A;  4HU0 A;  2VQT A;  5DF0 A;  2CCR A;  3SUV A;  4D6J A;  5A8M A;  4WK9 A;  1RP9 A;  1ISW A;  1ZBC A;  1W3J A;  2WC3 A;  2VR5 A;  3WFZ A;  2DH3 A;  1V6Y A;  3VMO A;  3TOP A;  5C70 A;  3EDF A;  8A3H A;  4PSP A;  1VJZ A;  3AIU A;  3MUA A;  3N12 A;  3TON A;  1BVN P;  1HJX A;  2NW0 A;  2AOS A;  1V0N A;  2WVV A;  3IAP A;  1UUQ A;  2YA1 A;  2RGL A;  4GZJ A;  1CPU A;  1HL9 A;  1W1T A;  1B1Y A;  3OLG A;  4HOW A;  3N1A A;  2WB5 A;  4CCC A;  3N11 A;  3ZST A;  3AZT A;  4OBS A;  3RIL A;  1RPK A;  4U2Y A;  1TUX A;  4AZ7 A;  1GJU A;  3MUY 1;  3SEP A;  3WF0 A;  1V6V A;  2V38 A;  1QNQ A;  3ZJK A;  2PWE A;  2O9T A;  3SUU A;  2WHL A;  1KXH A;  4D6I A;  2GDU A;  2X0H A;  5E6Z A;  1WZM A;  3ZSS A;  5JIP A;  3GM8 A;  1LWJ A;  2PWH A;  4Y7E A;  3CH9 A;  4MJ4 A;  1ZBK A;  1HT6 A;  4JFU A;  4UOJ A;  1W9X A;  1W1P A;  1MVY A;  4JKL A;  2XJ7 A;  3PZO A;  2NSX A;  4OIF A;  1MW2 A;  1MWO A;  1LQ0 A;  4RL3 A;  2E9L A;  1JYV A;  4H7V A;  2ZX9 A;  4Z2I A;  1NWU A;  1XH1 A;  2J25 A;  2EJ1 A;  2OSW A;  2RGM A;  1BTC A;  3WD4 A;  2CBJ A;  6A3H A;  2WMK A;  4NRR A;  3AIV A;  3SCP A;  3HU7 A;  4OBR A;  2DT2 A;  1OGS A;  4YPJ A;  1EXP A;  5AYB A;  1WDP A;  1BYB A;  1CIU A;  2WVS A;  2E4T A;  1Q6D A;  4PMU A;  3BSG A;  3VD5 A;  2XVK A;  5AY7 A;  2JEP A;  2J8G A;  4N0R A;  1D3C A;  4E8C A;  2ZXA A;  1QI0 A;  4AIO A;  2WLY A;  2D0F A;  3VGE A;  3WY1 A;  1MW1 A;  5KEZ A;  1HKJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3MMWA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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