3MN5A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
354
structure length
347
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRVGDERTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 119
structure length 347
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn5A03
4C23A 2A40A 4BG8A 4WQ4C 3CQXA 4BC4A 4AM6A 3VGMA 4H5RA 1NGJA 1P8ZA 4FWNA 5ELZA 3WUHA 1EQYA 3BP8A 3TU5A 1CZAN 5AQZA 3WEEB 3VESA 2A6AA 3ZX0A 4BR7A 3M6GA 2DPNA 3CJAA 3VF6A 1KAZA 1GLLO 3QBXA 1C0FA 1JCGA 2FSJA 5E26A 2P9IA 5AQUA 5BN8A 3CERA 4XH5A 4BVPA 1NGCA 2IVPA 1QQMA 4FOEA 3BUZB 4IJNA 4CZKA 1X3NA 2V7YA 3IFRA 1YAGA 1NGIA 3R8EA 3GG4A 1XUPO 3GBTA 1GLBG 4WQ5A 4RCHA 1YXQA 3KHYA 5AFUA 4BRCA 1BG3A 2OANA 5JMVA 1GLEG 1C0GA 2E2PA 4RWTA 4H0YB 5FPEA 4MLEA 4BR5A 2FF6A 3J8AA 3F9MA 4GY2B 4QS7A 1DGKN 4FSVA 3QDKA 4O8KA 3VENA 5AZJA 2VCPA 1S3XA 2E2NA 4B1UB 4CD1A 3O08A 5LJVA 1K8KA 4B1VA 5E84A 3H3OB 3A0IX 3ZEUA 4FWSA 3W3DA 3WXIA 4F9OA 2QWOA 3D2EB 2P9SA 4FPAA 4LC9B 3ULEA 5AFUH 1E4GT 3EL2A 1HUXA 5AQMA 1BA1A 4CZEA 5ADXA 1IG8A 1LCUA 1RFQA 2V7ZA 1K8KB 3O4WA 2E88A 3MK6A 1T6CA 3ZEUB 2ZWHA 1GLJO 3EO3A 4FL9A 4I6MA 3DXKA 1BA0A 4DQ8A 4BC2A 4XEIA 2F9TA 2Q1NA 4O5FA 3U9DA 4JHDA 4ISGA 1NM1A 4IJAA 4AM7A 1R59O 4BRFA 4I6MB 5BRFA 5ADXH 3DXKB 1DEJA 2J4RA 3O80A 3AY9A 2P9PB 4JHDB 2Q2RA 3UKRA 3EKUA 5KQDA 1V4SA 1Z6RA 3GOIA 1KXPA 3FZKA 3H45C 5BN9A 1XC3A 3IDHA 2E2OA 2BUPA 3G25A 4A2AA 2ZGZA 4GNIA 3UKRB 1DKGD 3VGKA 2KHOA 3O1BA 5KPTA 3LL3A 3LM2A 1BWFO 2ZF5O 3MN6A 3CJBA 1J6ZA 3CJ1A 2Q0UA 3H6EA 2QWQA 4Z94A 1HX1A 2E20A 3H1QA 4NO7A 1HKBA 5BREA 2FSNA 4M63C 4CBUA 3ENOA 2A41A 2HF3A 3HSCA 3EKSA 2D0OA 3UKUB 1X9JA 2A5XA 3FZMA 2A3ZA 3AARA 4YDUC 3ZETB 3S41A 1BDGA 1ZC6A 3B8AX 3C7NA 4JNEA 3FLCO 3VOVA 5AR0A 3LDPA 3QB0A 5F1XA 3ID8A 4FWRA 3DWLA 2NLXA 4BQLA 3LDNA 4CI6A 4JAXA 4K41A 1D4XA 2FSKA 3GDQA 3VF2A 2QXLA 1T6DA 3P4IA 2P9NA 1KAYA 4EIAA 3O1WA 3CETA 1QHAA 3C0BA 4MO5A 4B1XB 1Z05A 2WUSA 5B8HA 3GE1A 4RTFD 2D1KA 3CHWA 3OHRA 3CIPA 1NLVA 2W41A 2P9IB 2QWRA 3U8XA 2YJFA 1NGEA 2CGKA 1G99A 1JCFA 2P9NB 2ZGYA 1E4FT 5AQKA 3UB5A 2HF4A 3HZ6A 1S22A 3JS6A 1BO5O 1NWKA 3HM8A 3AAQA 5AQWA 1YVNA 2GWJA 3MCPA 3SJHA 4H0XB 4QS8A 3LM9A 5AQSA 1XQSC 1KAXA 3R9PA 3DJCA 3VEXA 5FPMA 4HTLA 1OKJA 4KBOA 3MMVA 4A61A 3TPQA 2QWNA 4H0OA 5EOYA 3VEZA 5AZJB 3BF1A 3DXMA 4FWMA 4PKHA 2GELA 4FWPA 5AQFA 5AQLA 3U9ZA 2P9SB 1QQOA 3ULEB 1ZBSA 5AZIA 1TUYA 5JLHA 1SAZA 1NMDA 3DXMB 3LDQA 5JICA 1V4TA 2F9WA 3L6QA 4EHUA 1GLAG 2PAVA 4BR2A 3A5LC 1MDUB 1GLDG 3SK3A 4BRHA 4FWOA 4DCHA 2P9UA 3I8BA 1Y64A 2E1ZA 5AQQA 1T44A 4Y0WA 2VWBA 4H03B 5F2RA 2Q0RA 3CI5A 4BGAA 1SZ2A 1HKCA 2QWMA 4H5VA 1IJJA 2VYPA 3A5OC 2P9UB 3DAWA 2Q36A 3FZLA 4BRGA 2P9KA 4ISEA 3CJ9A 1U2VA 3EZWA 3WT0A 4A2BA 4FOIA 4YDUA 3O6WA 4CZFA 4BR9A 1QZ6A 3L0QA 5AQVA 3SMPA 2D4WA 4PKIA 3R6MA 3VERA 3HTVA 3WQUA 4CZGA 3D2FA 2P9KB 5AQTA 1TYQA 3MN7A 3ATVA 4BR4A 3FE1A 4BQZA 1NGGA 4MLHA 4CZMA 4DB3A 2Q31A 4DHYA 4M7XA 5AQGA 5KPZA 3ZX3A 1MWMA 2HMPA 1MA9B 4H0VB 2QM1A 5AQJA 1HKGA 3CQYA 2ITMA 1TYQB 3VETA 2E8AA 3UE5A 2CH5A 4B1ZA 5BRHA 1GLFO 2UYTA 3MN5A 3I33A 4CZJA 5KQ8A 4J8FA 3SLCA 3VEWA 2CGJA 4H0TB 4XH4A 4CZHA 3BF3A 3HBTA 3VGLA 4K43A 3VEYA 2AA4A 2D0PA 3JXUA 4M7YA 5CE3A 3RSEA 2EWSA 2ASMA 5KPRA 5LJWA 3ZX2A 3H3NO 1Q18A 3O8MA 3C7NB 4B1WB 1ATRA 1NGAA 3AAPA 3FGUA 3WXKA 4FO0A 2GEMA 5AQIA 2W40A 3WXLA 5I9EB 3RSEB 2YHXA 2IVNA 1ATNA 4H5NA 3W0LA 2YHWA 3FR0A 1X3MA 1MWKA 3HI0A 4BRMA 2NZTA 3L4IA 4B9QA 5BRDA 2E2QA 4XH1A 2IIRA 3QBWA 5BPNA 2H3GX 2FLOA 2V52B 3H46O 4H5WA 5EY4A 3SMSA 3LDLA 4WYBA 4BRKA 1YUWA 5AQHA 5BR9A 2GWKA 4PL7A 2P9LA 3IUCA 3FFKB 4IWVA 3WXJA 4BVOA 3VF4A 5EX5A 1TUUA 2NRHA 5FPNA 3QICA 1BU6O 3VEOA 2E1YA 5BPLA 1HJOA 2P9LB 2HOEA 3A5MC 4JN4A 5TKYA 1NBWA 3CJCA 3MN9A 3D2EA 3VPZA 3KZBA 3WQTA 3A8YA 3IMXA 4BGBA 1SQKA 4ISFA 1NGHA 2QW9A 1WOQA 1QZ5A 2GUPA 3EN9A 3O5BA 4BC5A 5JLFA 4EAHD 5F0XA 1QQNA 4H0PA 2ASPA 2FXUA 4QS9A 4CBWA 5AQXA 3M1FA 4IXCA 4FWKA 4A62A 1LOTB 4BREA 2QWLA 2Q97A 4L3QA 5EXWA 3MDQA 4PKGA 4K25A 2I7PA 4WQ5C 5AZIB 3BEXA 5AQYA 4CZIA 1BUPA 5AQRA 2GTDA 2A42A 3GL1A 4BRQA 1BOTO 2YCHA 4BC3A 2P9PA 3M3ZA 3LDOA 4EFHA 1H1VA 4BRAA 1NGFA 2AP1A 4FWLA 3ATUA 3FZHA 5EVZA 5FPDA 3D7EO 5LY3A 1RDWX 1JCEA 5AQNA 4CBXA 4CD3A 3QFUA 2IVOA 3VEVA 1HLUA 4JD2A 1RGIA 1U2VB 1HPMA 5AQOA 2YJEA 2ASOA 1U6ZA 4E1JA 4EHTA 3U4LA 4WQ4A 4FWQA 1ZXOA 4BRLA 4BRPA 3A5NC 2QWPA 4BROA 3KVGA 4HWIA 4JD2B 3D2FB 4IO8A 1ATSA 4K42A 2BTFA 4PL8A 2YI1A 3QMLA 1WUAA 2V51B 4MO4A 5AQPA 1NGDA 3FZFA 4BRNA 3UKUA 1GLCG 3H1VX 4BG9A 2YHYA 3ENHA 4BRIA 4CZLA 1ESVA 4H5TA 2CGLA 2CH6A 2I7NA 1NGBA 2FF3B 4BR0A 2PBDA 4CJ7A 3ZETA 4FPBA 3CJ7A 4NB4A 3WEEA 4IZ9A 5BPMA 3QFPA 4BRDA 4B1YB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2A40A 3NCIA 4BC4A 4AM6A 4F4KA 3VQQA 4CJKA 3KTQA 4DSLA 4CEOA 5HOOA 1NGJA 1P8ZA 1TVRA 5I3UA 4Z4EA 4F3TA 1EQYA 3BP8A 3TU5A 3WEEB 2OPQA 1WNSA 3LWLA 1IG9A 4IFEA 2DPNA 1TK8A 2ZE2A 2P9IA 1X9WA 3RMDA 4Z4CA 4XH5A 3SBTA 2IVPA 1QQMA 3VQDA 2VG7A 3ITHA 1UAXA 3C95A 4CZKA 3AA3A 2HHHK 2NNWA 3QO9A 5I42A 4CHZA 3GBTA 1GLBG 4WQ5A 2OYQA 4CHYA 3J81O 4X66K 3NH1A 4BWJA 4DTOA 4BRCA 1BG3A 2OANA 5JMVA 2YKNA 1C1CA 3QERA 4NCGA 1T03A 1TKDA 2O8BA 4BR5A 4A5AA 1Q86O 1NJWA 5LJVA 4B1VA 5E84A 3H3OB 3ZEUA 1WSJA 3W3DA 3WXIA 3ZSXA 4F9OA 5CYMA 4FJIA 3EL2A 1L3TA 1SKRA 5AQMA 1QVGM 1K9MO 4LSNA 1EETA 5C12A 1IG8A 1K8KB 3HPGA 2WFBA 4CIEA 3MK6A 2WC9A 4CCHA 2ZWHA 4E89A 5KRTA 4FL9A 4DR1K 4F8RA 3TAFA 5MLCQ 3L2VA 4IFVA 3P5JA 2QTDA 2PY5A 1NM1A 4M42A 4FJHA 5IWAK 1OVQA 2YHAA 1JLFA 5JVGL 1DEJA 4DG1A 2J4RA 1JLEA 1S1UA 2P9PB 4RW9A 2Q2RA 5HRRA 1V4SA 3L2QA 4Q5VA 4DV0K 2E2OA 2ZGZA 3SPYA 3AGRA 4DSFA 3KLEA 5KPTA 2RF2A 4J2BA 4EZ6A 3ZCMA 2ZF5O 3NF7A 1KTQA 4CHNA 1J6ZA 3QINA 2Q0UA 2QWQA 2Y1JA 4Z94A 1HJRA 2UUAK 4OO1J 4KV8A 3CCLN 3OYIA 3O9QA 2A41A 5HRPA 4CEAA 1Q9YA 4DFKA 1W9HA 3T3FA 3UKUB 1NK5A 3AARA 2GBZA 4CECA 3MXMA 4FK4A 2E4LA 1ZC6A 3C7NA 4N56A 4JNEA 4CJUA 1YTUA 5AR0A 3TSUA 3T1AA 3CMAN 4CI6A 1DT9A 1XHXA 3BGRA 3K5LA 3VF2A 1T6DA 4M3ZA 3T69A 3O1WA 4MO5A 1QHAA 3C0BA 4CHQA 3AA2A 2D1KA 3C65A 3MX2A 5JS2A 4KRFA 2QWRA 2YJFA 1N33K 4BE2A 5AQKA 2P9NB 3ZSOA 1E4FT 5C2DA 4M45A 4KB1A 1TKZA 1C0MA 2HHVA 3AO5A 3PX0A 1BIZA 3ID6A 1YVNA 3SJHA 4N41A 3MCAB 4NCBA 1XQSC 1KAXA 1S1XA 4E1MA 5KRSA 1T05A 3R1XA 4HTLA 1YTAA 4RG8A 3OA9A 3V9UA 1LWEA 1C6VA 3SAGA 4H0OA 5EOYA 3VEZA 1QE1A 4HHTA 1NOYA 3CC2N 4DU4A 2XY8A 3ASMA 2P9SB 1QQOA 1C0UA 4J2EA 4FZZA 3VQPA 5AZIA 1REVA 1ILYA 3DXMB 4H8KA 3P39A 2F9WA 3L6QA 4EHUA 3NGYA 3VQ9A 2R7YA 1GLDG 3SK3A 4FWOA 2HHQA 5M1FA 4JKGA 1Y64A 1RCHA 1T44A 4Y0WA 2VWBA 4H03B 3Q7CA 1YJNN 1SZ2A 1OH8A 3A2FA 1HKCA 4LFAK 1VQPN 3EE8A 4CGGA 2VYPA 3A5OC 3F2KA 4BACA 1WAJA 3THWB 1ASWA 1D5AA 1I94K 4JI2K 3CJ9A 1U2VA 3WT0A 3CCQN 4FLZA 3KWGA 2G8WA 4CZFA 3OYKA 3QETA 3NVMA 1FXXA 3HTVA 1NJYA 3PO5A 4CZGA 4LF5K 3VQ6A 4BR4A 4DQIA 4CZMA 4KTZA 2Q31A 4DHYA 2O8FB 4HUFA 4FXDA 4U67L 5AQGA 5KPZA 4CFDA 4ELTA 3KK1A 2ITMA 2E8AA 3NAEA 4E0DA 3CPEA 4B1ZA 1WSEA 4OPKA 4CZJA 5KQ8A 3LP0A 3SLCA 1UWBA 3VEWA 3OYLA 2CGJA 4XH4A 5HL7L 3HBTA 3VGLA 1HR0K 2O8DB 2RHKA 3KIOA 4K43A 2D0PA 3PX4A 3JXUA 4M7YA 5D3GA 2YHBA 2HHIA 3KWIA 4KFBA 2W42A 3THYB 1JLQA 4DV5K 3HM9A 3E01A 4JKCA 3PY8A 1RDBA 1S72N 2KLAA 3P31A 1WSHA 3AV9A 4BE1A 5C2FA 5E41A 4M3YA 5GIOA 1VSEA 2YHWA 1BISA 4IEIA 3HI0A 4LF6K 2NZTA 5BRDA 4B9QA 3O4NA 1HPZA 3SQ1A 2E2QA 3QBWA 1Q8IA 2H3GX 2V52B 4DTJA 5BR9A 4R79A 5AQHA 3K0SA 4DTXA 4FVUA 4ILGB 4JYAK 1S6QA 2ZQBA 4LH5A 3OYFA 4CK1A 1MU2A 3QNNA 1TUUA 3SUNA 4BDPA 1RT3A 1HJOA 4FJ9A 3MEEA 4F2RA 3MN9A 4BDZA 5C0YA 3EE9A 3IMXA 3EYZA 3VA0A 1L5UA 5M1NA 2GUPA 3RR8A 1NK4A 4UQGA 3J7YP 2OZSA 2FC0A 2FBVA 1X9SA 3S3MA 1TGOA 1LOTB 3BY5A 4JS5A 3TAEA 5GADP 1GOCA 5JS1A 2Q97A 4L3QA 4OPHA 1YHQN 1J54A 3J7ZO 4CJ4A 4OGEA 3SV3A 1W97L 1WLJA 3O9RA 4B9VA 5C25A 2A42A 4WFAL 4YOVA 4FLUA 3OJSA 1WSFA 4AILC 1HNZK 2B5JA 4AHSA 4BC3A 2P9PA 3M3ZA 4DF8A 3HPHA 4FJJA 1QTMA 4C8MA 4JV5K 1SL0A 4A5BA 3FZHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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