3MN6A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 120
structure length 360
sequence length 371
chains with identical sequence F, K
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn6A03
3RSEA 3W3DA 2P9IA 3O80A 1SQKA 3GDQA 3SMSA 1J6ZA 5EX5A 4GY2B 3FZKA 4BRFA 2AP1A 2CGLA 5FPEA 5AQWA 1G99A 4A62A 4CZIA 4B1YB 1IG8A 3TPQA 4FWMA 1P8ZA 3A5NC 1V4SA 2J4RA 4BGAA 4BQLA 4JHDA 3LL3A 1JCGA 5BN8A 4XH4A 3A5MC 1HPMA 3LDNA 3VESA 4ISGA 4WYBA 1CZAN 4B1ZA 1KAZA 3C7NB 3D2EB 3SLCA 1OKJA 4FWPA 1WOQA 4FPBA 2QWRA 4CZGA 1LOTB 3HSCA 3FZHA 2E2OA 5AQQA 5AQNA 3H46O 3M3ZA 3VEXA 1C0GA 1R59O 4H03B 1TYQA 3ZEUB 5JLFA 1X3MA 3O1BA 4EIAA 3WT0A 2A40A 2FXUA 2VWBA 5JLHA 3D2FA 1HLUA 5AQIA 4PL7A 2BTFA 3QBWA 3DXMB 1XQSC 3QFPA 4BREA 2IVOA 2P9PA 3WQUA 2A42A 4XEIA 1NGEA 3WXIA 2GWJA 2IVNA 3VEVA 5JMVA 3QICA 3ENOA 2QWPA 5AQSA 1GLAG 4ISEA 5AQMA 2D0OA 3AAQA 4K42A 3IMXA 2F9WA 4BRQA 3L0QA 4H0OA 4H5RA 2P9SB 3DWLA 2Q1NA 2D4WA 4GNIA 5AZJB 4LC9B 3FZFA 3D2EA 3QDKA 4BC3A 4FWNA 3ID8A 3CJ9A 1GLFO 3FGUA 2FF6A 4MLEA 3SK3A 1E4GT 4JNEA 2Q97A 3S41A 3MN9A 2YJFA 2FSNA 3WXJA 1DGKN 1QQNA 3M6GA 3WXLA 3ZX3A 3R6MA 4WQ5A 3UKRB 4Z94A 4BRDA 4CZMA 4QS8A 5BREA 4BC5A 5AZIA 3VOVA 2GUPA 5ADXA 5EXWA 5TKYA 1NM1A 3UKUB 4MLHA 4H5TA 3DAWA 1JCFA 3DXKA 1MDUB 2ZGZA 1QQMA 3IDHA 1RDWX 3CQXA 4EFHA 5ELZA 4BRNA 3VEYA 3U9ZA 4DB3A 4B9QA 2W40A 3GBTA 5BPMA 3LDOA 1NGJA 4BROA 3EKUA 2E88A 2Q36A 1T6DA 2P9NB 4BRIA 1HKBA 1KAYA 2P9SA 1IJJA 2HMPA 5AQZA 5AQVA 1BUPA 4NB4A 1Z05A 1BWFO 1ATNA 4BRKA 1JCEA 1Z6RA 4BRLA 4DQ8A 4C23A 4RCHA 2E1ZA 2FSJA 4BRAA 2GWKA 4FWQA 4BRMA 1YUWA 2PBDA 2P9LA 4BRHA 3UKRA 3LDLA 5LJWA 4BC2A 5KPRA 4E1JA 3H6EA 4RTFD 1KAXA 1X9JA 1SZ2A 3UE5A 1BA0A 3WQTA 2FSKA 2YI1A 2QWMA 3WEEA 4FO0A 2F9TA 4MO5A 3FE1A 4QS7A 5AQTA 3ZX2A 3I8BA 2Q2RA 4FWOA 2YHXA 3BP8A 1QQOA 3LM9A 3CJBA 4JAXA 1KXPA 3R9PA 3L4IA 4BR9A 3H3NO 1K8KB 3MN5A 2QWLA 3CI5A 2CH5A 3GG4A 1ESVA 4HTLA 4IJNA 3VEOA 1T6CA 3AARA 3U9DA 3LDPA 2Q0RA 1V4TA 2P9UA 2V7YA 2P9NA 2YCHA 3EKSA 2ASPA 4YDUA 3C0BA 4MO4A 4QS9A 3VGLA 3H1VX 2V52B 3HTVA 4H0YB 3BEXA 3U4LA 3WUHA 1BU6O 2E1YA 4BG9A 2I7PA 3D7EO 1WUAA 5AQLA 4CBWA 1YAGA 4YDUC 4HWIA 2E2PA 5BRHA 4B1XB 3HZ6A 1HUXA 2QM1A 3CJ1A 1S3XA 4H0VB 2NRHA 3SMPA 4BR5A 3O08A 4PL8A 4M7XA 1GLCG 1YXQA 2IVPA 3ZX0A 1X3NA 3IFRA 3JS6A 4BVPA 1QZ6A 2A41A 4I6MB 5JICA 1H1VA 3C7NA 2P9KB 3H1QA 1TUUA 2ZF5O 2CH6A 4DCHA 3QFUA 4EAHD 1YVNA 3O5BA 5AFUA 1ATSA 3UB5A 4BR2A 4IZ9A 2A5XA 3CERA 3GOIA 3O6WA 4BR0A 3ULEB 3BF1A 1NGIA 1HKCA 5FPMA 4BQZA 2AA4A 3ZEUA 3H45C 5F2RA 1BG3A 5AQKA 3RSEB 4FSVA 4O8KA 5B8HA 5AQYA 4CZKA 5EVZA 3A0IX 3DXMA 3ATVA 1MWMA 3FFKB 3MCPA 4JN4A 3VPZA 3WXKA 1GLJO 4NO7A 3CHWA 2QWQA 3O1WA 2GEMA 4JD2B 4H0TB 3QB0A 3QMLA 4FWLA 5LJVA 4JHDB 3CQYA 1GLLO 3J8AA 3HI0A 1ATRA 4IWVA 2E20A 4BGBA 1NMDA 1ZXOA 4FOEA 5AQGA 1HX1A 1BDGA 3VF2A 2KHOA 3LDQA 3U8XA 3BUZB 3FZMA 4BR7A 1NGAA 3M1FA 3VERA 4BRGA 1LCUA 1XUPO 3MK6A 5AZJA 3DJCA 3O8MA 2P9KA 1HJOA 2CGJA 5BN9A 4CI6A 4BVOA 3VGMA 2VYPA 1DKGD 1NGBA 4DHYA 5AQXA 4M63C 4PKIA 5BPNA 4O5FA 1NGFA 1NLVA 5KQ8A 5AFUH 3MDQA 2V51B 2UYTA 3MN7A 4WQ4A 5BPLA 3G25A 3CJAA 3ZETB 2A3ZA 1MA9B 2P9PB 4ISFA 3UKUA 4AM6A 4CBUA 5ADXH 4H5VA 1GLEG 4WQ4C 1GLDG 5AQHA 4A2AA 1SAZA 5BR9A 2FLOA 4FPAA 2ITMA 3GL1A 1RFQA 3HM8A 4FWRA 4BRPA 3VF4A 4JD2A 2VCPA 4H0XB 2NLXA 2E2QA 1RGIA 4XH5A 1E4FT 3CJ7A 4K43A 1Y64A 3BF3A 3L6QA 3W0LA 3GE1A 3EL2A 2CGKA 4H5NA 3A5LC 1C0FA 3MN6A 3A5OC 4CD3A 2I7NA 2E8AA 2HF4A 2ZGYA 2WUSA 3SJHA 3TU5A 3EN9A 1DEJA 2GELA 1MWKA 2FF3B 4EHTA 4FWSA 1HKGA 2A6AA 5EOYA 3P4IA 5KQDA 3ENHA 5LY3A 2D0PA 2W41A 1NGCA 2BUPA 3JXUA 4H0PA 4BG8A 1NGGA 4H5WA 4IXCA 3B8AX 3H3OB 2YHYA 5AZIB 4B1VA 1QZ5A 2QWNA 5AQOA 2D1KA 1TUYA 3EZWA 3ZETA 2Q31A 3QBXA 4M7YA 4K41A 5AQFA 5CE3A 1U2VB 3LM2A 4CJ7A 4F9OA 3KHYA 1NBWA 3KZBA 2NZTA 1U6ZA 5E26A 3DXKB 4J8FA 4KBOA 2QWOA 4BRCA 4A2BA 3VEZA 2OANA 2IIRA 1K8KA 3HBTA 4CZLA 3VGKA 3CIPA 2QW9A 5AR0A 4FOIA 1Q18A 2HF3A 5AQJA 4EHUA 5KPZA 4PKGA 3O4WA 3FZLA 2EWSA 3A8YA 1ZC6A 2ASOA 1NGHA 4CZHA 2DPNA 2P9IB 5FPDA 3R8EA 4B1WB 5AQRA 3EO3A 4CD1A 2H3GX 5FPNA 3CETA 2ZWHA 4CZEA 3I33A 5BRDA 4B1UB 2YJEA 1NGDA 4BC4A 4FL9A 3VENA 1T44A 4AM7A 4L3QA 4K25A 4CZFA 2HOEA 2P9LB 2V7ZA 3ATUA 3KVGA 3MMVA 5F1XA 2PAVA 5F0XA 1XC3A 3AY9A 5I9EB 1QHAA 1ZBSA 3OHRA 2E2NA 3WEEB 5BRFA 4WQ5C 1U2VA 4I6MA 2Q0UA 3F9MA 4A61A 4IO8A 1BA1A 1D4XA 3IUCA 5E84A 4PKHA 4BR4A 1EQYA 4IJAA 2GTDA 1NWKA 5EY4A 5KPTA 3VEWA 1S22A 3CJCA 5AQUA 3AAPA 2ASMA 2QXLA 5AQPA 3VETA 1TYQB 3ULEA 3FLCO 4RWTA 4Y0WA 2P9UB 3FR0A 4CBXA 3VF6A 1GLBG 1BO5O 2YHWA 4XH1A 4CZJA 3D2FB 4FWKA 1BOTO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XY8A 3O9UA 3O80A 3F2KA 1SQKA 4CHYA 3SMSA 1J6ZA 4GY2B 1KFDA 1XNRK 2PYLA 4FZYA 1IH7A 1V4SA 4BGAA 4LFCK 1DT9A 4OKKA 1RTIA 1JCGA 4XH4A 4E19A 1YVUA 4I7FA 4ISGA 3HL8A 1IKVA 1CZAN 3M8PA 4DQSA 1SKSA 4DSKA 4KI4A 1S72N 5H1SQ 2QWRA 4CZGA 3NH0A 2E2OA 4NLCA 4W5QA 4OPAA 1R59O 1EP4A 1TVRA 4JK9A 2OCEA 4DTUA 5JLFA 1X3MA 3O1BA 4CEEA 2A40A 2VWBA 2HHHK 5AQIA 3SJJA 1XQSC 3LZJA 3QFPA 4BREA 4DR1K 4IEIA 4DSFA 1VRTA 4OKJA 3QICA 3ENOA 3RRHA 4B9UA 5AQSA 4DR4K 3LP0A 4ISEA 4XJXA 2QXFA 4CK3A 3OBWA 2O8EB 4BRQA 4E72A 3SAHA 3K5LA 2NUBA 1B92A 2P9SB 2Q1NA 3T1AA 3I55N 4JRPA 4KB1A 4YY3K 3AVLA 3ID8A 1KSPA 4DMNA 3CJ9A 1GLFO 2FF6A 3SK3A 4JNEA 3L4QA 4FM0A 3MN9A 3DLBA 4BY9C 3THWA 1J9AA 3WXLA 3R6MA 4PWDA 4CZMA 4AHCA 3NVMA 1TGOA 1ZBUA 2ETJA 2EHGA 1HJRA 3C6HA 4KO0A 2HHUA 3DLGA 1VAZA 2D0BA 1QQMA 4DKWA 2C1IA 2DFHA 2ZJRL 4DB3A 3NGIA 3LDOA 1Z25A 2HHSA 4DU3A 1OH6A 1KAYA 1HKBA 1IJJA 1N5YA 2YV0X 4JKDA 5AQZA 4BE7B 5AQVA 4NB4A 4M3XA 3PO5A 1Z05A 4Z4FA 4M42A 3L2VA 4M3YA 3ZT1A 1S5JA 3PUFA 4BRLA 4G9ZA 2NRRA 3O9SA 4FWQA 1YUWA 4DTSA 3LDLA 4BC2A 4LY7A 5HROA 3QO9A 1X9JA 1SZ2A 3WQTA 2RPIA 4FO0A 5AQTA 3I8BA 2G8FA 3PX6A 3BP8A 4JKGB 1KXPA 4JI2K 1F21A 2DFFA 3R9PA 1WSIA 2KFZA 4I2QA 3GG4A 4HTLA 2DTUA 4CHZA 2RE2A 2P9NA 2YCHA 4FCYA 1C1AA 3EKSA 4C8MA 3TAQA 2ASPA 4YDUA 4MO4A 4QS9A 3OS2A 1VSMA 4YFUA 1UA1A 2E1YA 3C6UA 4CBWA 3DLHA 2JWKA 1RBTA 1YTAA 4B1XB 3S9HA 5CYQA 3HZ6A 4BDPA 4E1MA 4H0VB 3MX5A 3SQ4A 3O08A 1NJYA 3ZT2A 4M7XA 4KRFA 4A5AA 1XWLA 1X3NA 3KKSA 4DSJA 2E6MA 4O0JA 3IFRA 2OTJN 2O8BB 2A41A 4ID1A 5JICA 2D0CA 2O8DA 1UOCA 3NBPA 1KVAA 3H1QA 2CH6A 2YNHA 2UUCK 2G8UA 1ZBHA 2PZSA 1W9HA 1SL0A 3C6TA 4FZZA 2FBYA 3O6WA 5DM6L 3ULEB 3BF1A 2ZD1A 1NGIA 2IAJA 1HNXK 1WNSA 3H45C 4EP4A 5LL6Z 3RSEB 5B8HA 1NK7A 5EVZA 1VQON 3A0IX 4O44A 4PHTX 3ATVA 3MCPA 1VSEA 3DYAA 4JN4A 2OPRA 3EZ5A 4FK0A 5IWAK 1U4BA 4FM2A 3NCIA 4N41A 4CEBA 2QWQA 3ZSWA 4A57A 3SUQA 3J8AA 3LDSA 2WBNA 3G6EN 3CYGA 2VG5A 4IDHA 4B3TK 4E7JA 3KJVA 4BR7A 2W6LA 4GV3A 3AVJA 4WFNL 5HRPA 3D45A 1U45A 1HYVA 4BVOA 3VGMA 4DS5A 2VYPA 2O8FB 3HP6A 1RILA 1NGBA 3M8SA 4M63C 1SL1A 4NCGA 3TAGA 1LW0A 3DMJA 1QQCA 1FKOA 3EYZA 1Q9XA 1W0HA 3CJAA 4YHHK 2NRTA 4AHUA 2P9PB 3OJSA 4J2AA 1OH7A 1EKEA 5ADXH 2PFUA 4WQ4C 1GLDG 3AGKA 2FLOA 4FPAA 2BE2A 1ASUA 3OY9A 4M41A 1WN7A 4IKFA 4HCBA 3VQPA 3P38A 1NK8A 2HW3A 4ELUA 3GE1A 3EL2A 1VSJA 4H5NA 4DV3K 4DSEA 4GMJB 4DWIA 1WB9A 4CE9A 4RG8A 2WUSA 2UXDK 3EN9A 1DEJA 2GELA 1RT6A 1MWKA 1VQKN 4V19S 1HKGA 2A6AA 3KTQA 5CYMA 4NXNK 1FXXA 3CMAN 1EO1A 4DUYK 1NGCA 1M90O 4H0PA 4IOAL 4AQYK 4B1VA 3H3OB 2YHYA 1N6QA 3ASMA 1G15A 1SS6A 2RN2A 5AQOA 2D1KA 2KZMA 3P39A 5CE3A 1U2VB 3LM2A 3KHYA 4I9QA 3T1YK 4KBOA 4N76A 4BRCA 3OVNA 4M3UA 4F8RA 4CJPA 5KRTA 2GV9A 4JS5A 2QW9A 5AR0A 3ALYA 4IFVA 4LSLA 3F73A 4DTRA 1HNZK 5LMUK 5KPZA 3MX2A 4CZHA 3NMUA 2D0AA 5FPDA 1QVFM 3HK2A 4BEBA 3OYKA 4CD1A 4PQUA 3CETA 3EE9A 2ZWHA 2G8KA 1J5OA 4CZEA 3I33A 5BRDA 1NJZA 3HJFA 1NGDA 4AHRA 3CCEN 1CLQA 2V7ZA 1O1WA 3ATUA 4Z4IA 3J7YP 2PAVA 2X6NA 1VQ6N 3AY9A 1KC8O 4Y1DA 3RTVA 2C1GA 3WEEB 5BRFA 1KVBA 4WQ5C 2O8BA 4IBNA 2Q0UA 1I94K 1Y97A 4HHTA 3MAQA 1SKRA 1NK9A 4CGHA 3VEWA 1S22A 3AAPA 2QXLA 4X65K 4DV1K 3ULEA 2UU9K 3FLCO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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