3MN9A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
371
structure length
360
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 119
structure length 360
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn9A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn9A03
1HKCA 1HX1A 3DXKB 3H45C 4BRPA 1LOTB 1TYQA 3LM9A 3M3ZA 2QXLA 5KPZA 3FLCO 5CE3A 4PKIA 4B1VA 2P9LA 4FO0A 5JLFA 3KZBA 4NO7A 3EO3A 4CZGA 4FPBA 3I33A 5EVZA 2P9PB 1BG3A 4M7XA 3WXLA 1D4XA 1RDWX 4CI6A 4CZIA 2D1KA 5BRHA 3GOIA 4K41A 4CBXA 1E4GT 2I7PA 1QZ6A 2Q1NA 1TYQB 4I6MA 2GEMA 3RSEB 5EX5A 4FWQA 4Z94A 4BRKA 1NGJA 3MN9A 3R8EA 3F9MA 3O5BA 2P9IA 1YAGA 1JCEA 1Q18A 2P9LB 3VF2A 2BTFA 3CIPA 3QBWA 3VGMA 5EXWA 4BRMA 4CD1A 5BN9A 4JD2A 1ATRA 3ZX2A 2CGJA 5ADXA 4LC9B 2PBDA 5KPTA 1GLBG 1BU6O 1NLVA 2E1YA 4I6MB 2FF3B 1IG8A 3ZETA 3EL2A 3QB0A 3O6WA 2P9IB 3L4IA 3FFKB 3BF1A 4BC3A 1NGDA 3HM8A 1HJOA 2H3GX 1MWMA 3J8AA 3UE5A 1BWFO 2PAVA 1E4FT 3U4LA 1NGIA 4JD2B 4FOIA 3A5NC 5BPLA 5AQXA 3ENOA 1OKJA 1GLFO 4CZLA 5AQPA 2HF3A 3H3OB 3M1FA 1S3XA 2QWPA 1NGFA 4GY2B 4H5TA 3R9PA 1HKBA 3W3DA 1WUAA 2HOEA 3H3NO 3A8YA 1U6ZA 3SLCA 2GELA 5FPEA 3B8AX 4KBOA 4ISEA 1Z05A 2Q2RA 4F9OA 5AZIA 4B1UB 2V51B 3EN9A 1MDUB 3FZKA 1TUYA 1KAYA 1C0GA 2IVPA 5AR0A 3GG4A 3VGLA 3O08A 2D0OA 2IIRA 4ISFA 3CJ9A 5JMVA 1QHAA 4YDUA 5FPDA 2QWQA 2BUPA 4EHTA 5BRDA 1YUWA 4BRQA 3OHRA 2P9NA 3VEXA 1QZ5A 3HTVA 3WUHA 4CZMA 1Y64A 4BR5A 4Y0WA 5AZIB 4BR2A 1DGKN 3VEZA 1NMDA 1GLJO 3O4WA 4AM6A 3QMLA 5B8HA 4H5VA 3VEVA 2OANA 4B9QA 4A2AA 1EQYA 1BUPA 3QDKA 3D2FA 4H0PA 3W0LA 2F9TA 2P9NB 3ENHA 1TUUA 2YHWA 2FSKA 4E1JA 4QS8A 1HPMA 3SMSA 2V7ZA 2FF6A 2P9UB 3IFRA 5AQMA 4H03B 1ZC6A 4FWOA 4AM7A 3CJ1A 3WEEA 3BF3A 4WYBA 5AFUA 2F9WA 5BREA 2ASMA 5AQWA 5BR9A 3D2FB 3FZMA 1V4TA 3I8BA 2QWRA 3GDQA 3CQXA 3UB5A 4BREA 2QM1A 4J8FA 3TU5A 2NRHA 4IXCA 4BR0A 5AQIA 3O1WA 2ZGZA 2E2NA 2YI1A 5E26A 4BG9A 3WEEB 4H5RA 3VEOA 1GLEG 2FSNA 4BRAA 5F2RA 3FZFA 1Z6RA 2UYTA 3VENA 1IJJA 1V4SA 4WQ4C 2FLOA 3BUZB 3HI0A 4BRCA 3WXJA 4MLHA 1JCGA 1YVNA 4MLEA 3ATVA 1SZ2A 5JICA 4FWSA 2GWKA 4CZHA 3O80A 1WOQA 1HUXA 1HKGA 3VETA 2V52B 1P8ZA 4H5NA 3U9DA 5LY3A 1ZBSA 2GUPA 4CJ7A 4H0OA 4DHYA 3MN6A 3KHYA 4BRHA 4B1WB 4FL9A 1KAXA 4QS9A 1NGCA 3QBXA 5AQGA 3WQTA 4BR4A 3DXMA 3FGUA 3QFUA 5AQFA 2DPNA 2ASOA 3L0QA 3H1VX 1BOTO 4FPAA 3ULEA 5AQLA 3G25A 3H46O 4BQLA 3ZETB 3P4IA 5AQSA 3MMVA 2ASPA 5EY4A 4RWTA 2QWNA 5AQNA 3IUCA 3DXMB 3ATUA 2CGLA 1SAZA 4XH1A 4BVOA 5KQ8A 5AZJA 3FZHA 4BQZA 5F0XA 4JNEA 2AP1A 3ULEB 1NGAA 2Q36A 4K42A 3VESA 2FXUA 4CZJA 3AAPA 1K8KA 4JAXA 4XH4A 3U8XA 1QQNA 5FPMA 3VERA 2YHYA 3ZEUA 4IJNA 3A5MC 1S22A 2GWJA 4CBWA 3MK6A 5AZJB 4H5WA 4WQ5C 4PL7A 2E8AA 2W41A 2VWBA 5JLHA 3BEXA 5FPNA 4QS7A 5AQQA 4B1YB 3D2EA 3WXIA 1GLAG 2I7NA 3WT0A 4A61A 2FSJA 3R6MA 1K8KB 3CQYA 4JHDA 1NBWA 4YDUC 2J4RA 1GLLO 3BP8A 4K43A 3ZEUB 3HZ6A 3CETA 3MN7A 5AQRA 3VPZA 4FWRA 1BDGA 4BGAA 1QQMA 1KAZA 2CH6A 2WUSA 4NB4A 5BPMA 5LJVA 4DQ8A 3FR0A 4H0XB 4CD3A 5I9EB 3D2EB 2HF4A 5BN8A 4H0YB 3CI5A 5LJWA 1NGEA 3UKUA 4CBUA 2VYPA 2IVNA 4JHDB 2E2OA 3LDQA 3LM2A 3QFPA 2A42A 3H6EA 4CZFA 3O1BA 1BA0A 4EIAA 1XC3A 3VEWA 4BRLA 4H0VB 4EHUA 5AQHA 3LL3A 5ELZA 4RCHA 4IO8A 4XH5A 3UKUB 3IMXA 2A40A 2A5XA 4O5FA 5BPNA 4BRDA 3L6QA 3A5LC 5KQDA 2D0PA 1LCUA 4BGBA 5E84A 1ATSA 5AQZA 4WQ4A 2YJFA 4BRIA 3RSEA 1KXPA 1GLDG 2Q97A 3IDHA 3LDOA 1R59O 3GE1A 2ZWHA 3DWLA 3S41A 3CJAA 3FE1A 2D4WA 3CHWA 5AQYA 2A3ZA 2QWMA 4O8KA 4FWLA 4ISGA 5EOYA 3LDLA 3C7NA 4PKHA 2P9SA 2YHXA 3LDNA 1T44A 3JS6A 4A62A 3D7EO 4BRFA 4CZEA 1CZAN 4B1ZA 1J6ZA 3SMPA 1T6DA 3AY9A 5ADXH 4BC4A 1HLUA 4BG8A 3AARA 3U9ZA 1G99A 1ZXOA 4M63C 2HMPA 1GLCG 1T6CA 3C7NB 4FWPA 2E1ZA 2P9SB 3KVGA 2GTDA 2QWLA 3EKUA 4IJAA 1BA1A 1ATNA 4JN4A 4K25A 2QWOA 4A2BA 2QW9A 4HWIA 2IVOA 3GBTA 1RFQA 4CZKA 4H0TB 2AA4A 2Q0UA 3VOVA 2CGKA 2W40A 3A5OC 2YJEA 3WQUA 3DJCA 4GNIA 1MA9B 3ZX0A 1XQSC 3JXUA 1X9JA 4BC5A 2A6AA 2NZTA 4FWMA 3FZLA 5AQKA 4IZ9A 4XEIA 1NGGA 1H1VA 2ZGYA 4FWNA 4PKGA 4BR7A 2Q0RA 5AQUA 1MWKA 3H1QA 3C0BA 2YCHA 4MO4A 3VGKA 3O8MA 4IWVA 3EZWA 5F1XA 4WQ5A 2KHOA 4L3QA 1NWKA 2Q31A 3TPQA 4EAHD 4BRGA 3MN5A 3QICA 4BRNA 3VF4A 4EFHA 3SK3A 4DB3A 3AAQA 3MCPA 4FWKA 3M6GA 1QQOA 2P9KA 3WXKA 5AQVA 5AQJA 1DEJA 4BROA 2CH5A 1NGHA 3VEYA 3CJ7A 2VCPA 3HSCA 4B1XB 5AQTA 2ITMA 5BRFA 4BC2A 4BVPA 2P9UA 1YXQA 2A41A 1U2VA 4BR9A 1NM1A 4M7YA 3VF6A 3A0IX 1X3NA 3GL1A 3UKRA 3LDPA 5AQOA 5TKYA 2E2PA 3HBTA 2NLXA 3ID8A 1X3MA 4C23A 2P9KB 3CJBA 1XUPO 4FSVA 1BO5O 3DXKA 1JCFA 4DCHA 1SQKA 3MDQA 2ZF5O 3DAWA 4FOEA 4MO5A 5AFUH 3SJHA 2EWSA 4PL8A 2V7YA 4RTFD 5KPRA 4HTLA 1U2VB 1NGBA 3CJCA 1RGIA 2E88A 3CERA 3EKSA 2P9PA 3UKRB 3ZX3A 2E2QA 2E20A 1ESVA 1C0FA 1DKGD
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HX1A 3DXKB 1LOTB 4EZ9A 4LH5A 3KLGA 2D0AA 4N41A 2QXLA 5KPZA 4KTWA 4NLBA 2D0CA 4FO0A 5K14A 4OVLA 3K59A 1RBUA 2P9PB 4F3OA 5HOOA 3C65A 4CZIA 1IO2A 4G1QA 5BRHA 1RTJA 4K41A 4O0JA 2DFHA 3MCAB 4KO0A 1TYQB 4BE7B 4I6MA 5IT9O 3AGKA 3J80O 3MN9A 2RN2A 3F9MA 2JWLA 1YAGA 1Q18A 4CESA 3VF2A 3BZCA 3HPGA 3K5MA 3CIPA 4Z4CA 5JS1A 3E01A 4BRMA 4JD2A 1ATRA 4LC9B 2E1YA 2FF3B 4FLWA 3ZETA 3NH1A 3QB0A 1D9FA 1TGOA 2P9IB 2F8SA 3AO5A 1BHLA 3FFKB 3BF1A 3L4QA 4JKDA 2H3GX 1MWMA 4O8UA 3NAEA 1BIZA 3AVMA 3SV4A 3QLHA 2P1JA 4FOIA 5AQXA 3CC7N 4W5QA 4CZLA 3P31A 3LANA 4KAZA 3M1FA 4KI4A 4CJQA 4GY2B 4B9NA 1TKZA 4Y1CA 5A2QO 3V9ZA 2HOEA 3TTDA 3F5TA 2KKZA 5FPEA 1X1PA 4I2PA 3CFOA 3SYZA 4F9OA 3TAMA 1HNVA 4ILGB 5AZIA 4X62K 1BGXT 3FZKA 1OH5A 1KAYA 3CCLN 3ZCMA 4CGGA 3WXMB 4J2DA 4ISFA 1LWEA 1QHAA 3DI6A 4YDUA 4GVEA 3MXIA 2QWQA 2YNIA 1RDUA 3HM9A 3HO1A 4FJLA 3N4QA 3DRRA 2P9NA 5BR8K 1QZ5A 3LPTA 1TK8A 3KD5E 4IKFA 1Y64A 4BR5A 3G71N 4DTSA 4Y0WA 1Q86O 4YOTA 4DR5K 2KTQA 2I5JA 4GV6A 2OANA 1X9MA 4W5OA 4FK4A 3O4QA 2YX6A 4JI4K 2UU9K 3W0LA 2F9TA 4DSFA 4C8KA 2FBVA 4AHSA 4CJPA 3SMSA 2P5GA 4AH9A 3U3YA 2OA8A 3O3GA 1S1XA 4E72A 2WONA 4KTZA 3BF3A 5AFUA 4DSJA 1UWBA 2ASMA 1C0TA 3D2FB 4DUYK 2ETJA 1V4TA 1XNQK 2ZJQL 3TU5A 3ZT3A 3V9UA 2F96A 4KV8A 4JI5K 3ZSOA 1EWQA 1KFSA 4KH4A 2G8HA 2FBTA 4CFBA 4LF8K 1YTUA 3TWHA 3VENA 1CXUA 4DR2K 2FLOA 3BUZB 2HNYA 1JLGA 1JCGA 4KFBA 4DR1K 4HUGA 3OYDA 2DY4A 5JICA 1NJXA 4IOXA 1UOCA 1WOQA 1HUXA 1HKGA 3VETA 2V52B 4TSXA 5LY3A 4A5AA 4FM1A 4JS5A 3R1XA 2G8WA 2XRIA 2W6KA 3CFPA 5KGXA 5AQGA 2OTJN 4BR4A 3O9RA 5I42A 3AVCA 3DXMA 5AQFA 5HRNA 4X64K 1VSHA 4QOZB 4F2SA 3OYJA 4ZTJA 5AQLA 3P4IA 5EY4A 4IDHA 1HNIA 2CGLA 3HRGA 2O4IA 4NCGA 4XH1A 3T19A 4CEEA 3M8QA 1LW2A 5AZJA 1QVFM 5F0XA 5KTQA 3C95A 3DLBA 3ULEB 1NGAA 4Q5VA 3P83D 3O9TA 2PFUA 4CZJA 1RILA 3LWMA 4YFUA 3T1HK 1K8KA 1QQNA 5FPMA 3NE6A 1RT7A 4BEBA 3A5MC 2FBYA 4BE0A 1S22A 1MU2A 2HNZA 1EO1A 4CBWA 4H5WA 1BI4B 4PL7A 3QNOA 2E8AA 2W41A 3G6EN 3V4IA 4QS7A 5IWAK 5AQQA 3D2EA 3WXIA 4UQGA 1HJRA 1GLAG 1RBRA 1ZBUA 2NUBA 1NJWA 4ELVA 3R6MA 4E7KA 4RW7A 1NBWA 3PX0A 4K43A 5LMNK 2C1IA 3NBPA 3HP6A 4AHVA 4FWRA 1BDGA 3CCQN 4BGAA 5LL6Z 2CH6A 4LF9K 3QEVA 4LD0A 4DV2K 4DQ8A 4DFJA 2PY5A 2F4VK 3CI5A 2Y1IA 4CBUA 4CEDA 1S1UA 2E2OA 2XY5A 4FXDA 1RNHA 3RWUA 1QTMA 3H6EA 3M8SA 3MWTA 4CF8A 2O8DB 4H0VB 2UXBK 4CGIA 4IOAL 5BPNA 2VG7A 1HYSA 3B6PA 5J2QA 5AQZA 4EP4A 1RBSA 3TARA 3SV3A 3IDHA 2Q97A 3QEXA 4FW2A 2HSTA 2YKNA 4DTRA 2D4WA 4DFKA 2QWMA 3THYB 4ISGA 1D8YA 2KFZA 2XO7A 3LDLA 3C7NA 3PSFA 1VSEA 3PV8A 1T44A 4A62A 3IS9A 4BRFA 5M1OA 4O55A 4B9MA 2VWKA 4DTOA 1G99A 2HMPA 3RTVA 4JK9A 1RDCA 2GTDA 3EKUA 1BA1A 4YOXA 2E4LA 1HMVA 4FCYA 4JKGA 4H0TB 3KKRA 2AA4A 1U48A 4ELUA 1CZ9A 2KLAA 4DTUA 1MA9B 1K8AO 2A6AA 2NZTA 1N8RO 1S6PA 4CJSA 1X9WA 3HJFA 1TL1A 1W7AA 4IBNA 4BR7A 3PIOL 5AQUA 1MWKA 2RF2A 4M3RA 1O13A 2RKIA 5GIOA 4KHPK 1HQEA 4JRPA 3HPHA 1NKEA 4IWVA 4B3SK 3T1AA 4CGDA 2VGMA 1U04A 4L3QA 3AA3A 1LAVA 3TPQA 3QINA 4GKJK 4BRGA 1RT5A 4BRNA 2FC0A 4DTJA 3P5JA 5HBMA 3AAQA 3MCPA 4FWKA 1KD1O 4NCAA 5FROA 4FZYA 5AQVA 1NK4A 1K6YA 4BROA 1JKHA 1NGHA 1JJ2M 3TR8A 2VCPA 5BRFA 4BVPA 1Z26A 1YXQA 4BR9A 1NM1A 4RW9A 2XY6A 1HNWK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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