3MO7A

Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 2'-fluoro-6-iodo-ump
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
publication title Novel interactions of fluorinated nucleotide derivatives targeting orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 98
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2010-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mo7A00
3LXAA 2A6LA 2WSQA 3Q2DA 3QFEA 3M1ZA 3INPA 3DENA 4UTMA 4FNUA 2FB2A 4K39A 3S5NA 1JJKA 1F2JA 5I3JA 4K8EA 3QM3A 3NEVA 1EP3A 1IXQA 2FFCA 2E09A 2W0UA 4O1AA 2VEPA 4N9EA 5HR7A 3JRKA 2VC6A 2A7RA 2YDAA 3MBDA 2TMDA 2JKEA 2DZTA 4BI6A 1WOAA 4OV4A 3BG9A 2C1HA 5EKYA 3AJXA 1JR1A 1TIMA 3TROA 3UQNA 3W83A 3NQ8A 4QIUA 1VYPX 3E02A 4MZ1A 5FF3A 4A22A 2X1RA 1FXPA 2FTPA 4K7YA 1ICQA 3LRMA 3W71A 1QO2A 1LROA 2X1UA 1H7XA 1FBAA 5K9CA 2NV1A 2PRLA 4OU1A 1X6UA 4K36A 1UASA 3TUUA 3EX6A 1TPEA 2QCHA 3STEA 1QAPA 3PAJA 4YLWA 5AHIA 4L4LA 5BNKA 1OFQA 4M5PA 3E49A 3ZWTA 4LVDA 1MEWA 5F2GA 2Y7EA 3C2OA 3N73A 4FIRA 3TJXA 5EPDA 3NXFA 2TYSA 5DBTA 1SQ7A 1FWSA 1OYAA 2NXIA 3E9AA 5DELA 4X9SA 3LXCA 4OGZA 3P7YA 1DBTA 2X16A 2OJPA 3IV3A 4Q4KA 3SR7A 1M7OA 2QCNA 4N2YA 3W74A 4O52A 2YGYA 4BI7A 3MMTA 1HUVA 1AW1A 2A5HA 2Z1BA 1X1ZA 2LLEA 4WZHA 3VNDA 1S5WA 3LHWA 3RF9A 3V75A 1VS1A 2H3BA 2Q8LA 5D02A 3QRHA 1TQJA 4M7TA 3B04A 3UWUA 1VLWA 4UTJA 1BKSA 3RFAA 1TQXA 1W3NA 2V5BA 4FIQA 4Q32A 4NJIA 4O16A 4DQWA 4LVFA 2WO5A 1VRDA 1VYSX 2QUVA 4O28A 3ATZA 3LCXA 3W1PA 3R89A 1PS9A 4UNKA 3M16A 1GVQA 2ZRVA 3IIZA 4POCA 3WK1A 1RQHA 1QWGA 2WQPA 1K7EA 1XUZA 3GAKA 3SSJA 1DKWA 1W5QA 4FF7A 1DL3A 1OFEA 4DO4A 3SECA 2P10A 4FNPA 4JTSA 1DJNA 3GZ3A 3TA6A 2CW6A 5HUPA 3QJAA 1FWTA 1OFRA 4DPQA 1SW3A 1I8JA 3GNDA 3ATYA 4NU7A 3S1UA 4UFKA 3NVTA 3GXNA 4GJ1A 2QAFA 3GAYA 5LGZA 4C1KA 3NAVA 2NXGA 1TO3A 2J88A 3I65A 3W3OA 3HPSA 4CCDA 2C13A 5HNRA 1W3TA 4HNUA 4JYEA 3G8RA 4WY0F 1VZWA 3CM4A 1KFEA 3OHIA 1ZALA 1VLIA 4MOZA 4UCGA 2B0MA 4O1CA 4CQ9A 3SGZA 3PS7A 3BLEA 1WV2A 3B0PA 4NXKA 2ISWA 4BWLA 1I2RA 2A7NA 2J9ZA 4HSNA 1SU5A 3CIWA 3L21A 1TB3A 4AF0B 1XBXA 3MWAA 4CCCA 3BV4A 3TW7A 1H50A 2J27A 5F2LA 2JKAA 3DI0A 2GQAA 2CLOA 4NNAA 3EXTA 1N8FA 1W5MA 1ONRA 1PCWA 4BWLC 2PE4A 1G7UA 3IVTA 3HG5A 5AYZA 1DHPA 3LBCA 4NJGA 3FFSA 1RZMA 1KM5A 2Q3OA 2QUUA 5DXXA 1TSIA 1C29A 1FXQA 3W07A 1QCWA 1LYXA 1FWWA 4PA8A 3BG3A 4R33A 4IMDA 1YYAA 2DORA 1VCGA 4NVTA 3W7GA 3DXIA 5G1YA 1B57A 3NPXA 5TIMA 2J6XA 2E6DA 4RZ5A 4H3DA 4JTLA 1XBZA 4P2VA 3B05A 5AYXA 3M5YA 1GZGA 2CLHA 1GOXA 3W22A 3YPIA 1EUNA 2ZBTA 4GXMA 2QF7A 3NQEA 3GVGA 3TXVA 1GVFA 5G4WA 1A5SA 2CZ5A 4PFMA 1N55A 2BLEA 5I3HA 1P1XA 4WXZA 3MYOA 1BTMA 2ZQ0A 2V82A 3W7HA 4WJEA 1DQXA 1H61A 2DZWA 2JBMA 2WV8A 3G1FA 4A2RA 2GJNA 3W86A 2C19A 3O1NA 1OX6A 1T8XA 3P8IA 4GE8A 4E38A 1FUYA 3KHJA 1KM1A 2E5BA 5CG7A 1EB3A 4RV8A 5HMSA 2NX3A 4AEOA 5KSWA 4K37A 4TU1A 4UMAA 1SO6A 4RCXA 3SJ3A 3PM6A 5U4NA 2B7NA 2QR6A 4RXGA 5HULA 1XL9A 3CWNA 2BX7A 1XBYA 3LCLA 2DP3A 3WJZA 4FXRA 2JKPA 4IXXA 4GUJA 1YPIA 4UMCA 3G0SA 2ZTKA 4UXDA 1JCNA 3CTLA 3TR2A 4GUIA 2Y6ZA 5HQEA 1VGAA 2DZVA 1MSSA 4CCEA 3SGUA 3F1QA 4MJMA 1XBVA 1VHNA 2V2CA 3BG5A 3PSWA 3PBUA 3G8EA 3FIGA 3R12A 3W1AA 1JRCA 4IMGA 4LOCA 2Y7GA 2PC4A 3UWWA 4S2BA 4I7VA 3A5FA 3H55A 2WPBA 2ABBA 4KFOA 1TCDA 1TV7A 3HF3A 1EP1A 2VEIA 3A21A 2XN2A 1FCQA 5AHLA 5HWJA 3PG9A 3P5YA 5KMYA 4KWVA 4WUIA 4UMBA 3W88A 1Y0EA 3SZ8A 4NNBA 4IMCA 1SZEA 1Z41A 1X8FA 2H8ZA 6TIMA 2TSYA 3G0XA 4EVZA 5KZEA 1TTPA 3UPWA 4EWND 3NYZA 4WY0B 3LDVA 4LRTA 1WAUA 3G3DA 4R7JA 4RLIA 1N7KA 1LORA 4Z1CA 1ADOA 4I9AA 3W7OA 1OG0A 2I14A 3NPVA 1JQXA 3OA3A 4JICA 5F2IA 3N2MA 5G1TA 4RKAA 4A3UA 2VFHA 3DZ1A 3DFTA 4Y90A 5D2WA 3UNDA 4DO6A 3T4CA 1YDOA 2EHHA 2E77A 1TPVA 4LW7A 3C4UA 2DZSA 4G1KA 3KVJA 2YW3A 1W8SA 2A4AA 4GUGA 1IGSA 4JD4A 4ONVA 2GQ9A 3UPBA 5LHFA 5LSMA 5AYYA 2VXNA 2H90A 1SFJA 1LOQA 2ISSA 4JIQA 2CU0A 3DFOA 3U8GA 3DHDA 3GB6A 4HSOA 5CPLA 3C2VA 1WQ5A 4Q33A 3UD6A 5K4ZA 2CLMA 4O1BA 1H7OA 3M9YA 1GVRA 3E0IA 1SFLA 1SSGA 4N02A 3EWZA 3GXPA 3IGSA 2G5WA 3O6YX 3NO5A 2FLIA 3VCRA 4PEKA 3O8AA 1H7PA 3MHFA 2QCDB 3O06A 3EXSA 1XDLA 3KRZA 4AXKA 3BW3A 1TTJA 2QCCA 5BMWA 2QJGA 2YYUA 1JCJA 1KTNA 3EX1A 1TRDA 2GVLA 1W1ZA 5CGQA 2QCEA 4EOUA 3SIZA 3IIOA 3P61A 5BOOA 2Y85A 1SW0A 3H53A 3VE7A 4IPIA 4O53A 1ZHAA 4HNVA 5LHEA 1LBLA 3KAOA 4M6VA 3Q94A 2Y89A 1MEHA 1TYGA 2A21A 4HHPA 1Z44A 3S5YA 3T55A 2CLIA 3DFNA 2B4GA 4O18A 4LS1A 2B7PA 1KTBA 4IMEA 3IVUA 1TPC1 5K9DA 1KLZA 3W73A 5MHBA 1R47A 3MHGA 4UFIA 2NX9A 3SI9A 3W2LA 2ZZ1A 4N9BA 1YXCA 4O54A 1GTHA 1KV8A 1JCMP 1UJPA 4JTKA 2YYTA 3HJZA 3HGOA 3GDTA 3NR0A 3SW6A 2C3ZA 2FPVA 5F1UA 1ZFJA 2D73A 2W6RA 3GR7A 3NPUA 4TX9A 1OABA 1I2QA 4U28A 2X30A 3W1TA 4XBKA 1TPDA 3LERA 2WSRA 4E0CA 1LZOA 5FEZA 4LVAA 2NWSA 3LI1A 2RKXA 3I7SA 2A6NA 1H7RA 3N3MA 1V7YA 3LXBA 2Y88A 2YW4A 3MP5A 1G67A 1EUAA 4JNMA 2A0NA 1FWRA 4QQ3A 2F84A 1AW2A 4LWWA 1K8ZA 3UYCA 3L0NA 4NZJA 5D05A 4W9TA 2GJLA 3M41A 2ZRZA 4UR7A 4XKYB 4N6FA 1WOBA 1M5WA 1YLVA 5D2TA 1GVOA 3PVFA 1WDWA 4XWUA 1J2WA 3C2EA 5AHFA 1YPFA 1ME7A 5EBUA 5HWNA 3HMJG 2ZZ7A 5HJLA 4UTWA 1D3HA 1TPWA 3AO0A 3NQVA 4ZQMA 1G7VA 4YXGA 1C9DA 5BW6A 4AVFA 1GEQA 3PBVA 4NJHA 4NJKA 4UTKA 5U7SA 1G4EA 1K7FA 5CZ0A 4QNEA 5HUOA 1G4PA 2QCLA 5FF7A 1RV8A 4M6PA 3M6YA 3PC0A 4UTWC 3C56A 1F73A 5FESA 3W1NA 5LNVA 3NZRA 3P8JA 1P5BA 2A2IA 3L67A 5D2YA 3S5ZA 3UWQA 4AF0A 4Z08A 3W1XA 3A22A 3O16A 2NUXA 3ABRA 1TTQA 3B0UX 1FWNA 4NT0A 2O7QA 1K8XA 3GXTA 1AG1O 3P81A 1ML1A 1PE1A 3WK2A 1E51A 5T26A 4NUWA 4OBTA 1BEUA 2X2GA 5FF2A 5DY3A 5HR6A 3G0UA 3WJYA 3RK8A 2VFFA 1CI1A 5IBXC 2WSYA 2V8ZA 1DORA 3HGRA 1O5KA 1OYCA 3QF0A 4FNSA 4FNQA 3FJLA 1VCFA 2H8XA 1NEYA 3EB2A 2ZRWA 4LT9A 4N4PA 3W75A 4AHPA 5D37A 1W37A 3NNTA 4UUIA 3O6DA 5E0KA 1AK5A 1W3IA 5C55A 4Z1DA 1W5NA 1W5PA 1SO4A 2CZDA 3G18A 4XQ6A 3EWBX 2EF9A 3HO8A 1TPH1 3LHVA 2V5LA 1G4TA 1LBMA 1WXJA 2ZZ6A 4AWUA 1QNVA 1H7WA 1L6YA 3S6DA 2AAMA 4D2JA 3HOJA 1IXOA 3KXQA 1L6SA 1D9EA 1YTKA 3G1SA 4WQ6A 3P5ZA 4RZ4A 1IF2A 2BWGA 3OEXA 3C61A 4FX6M 1PCKA 3EKLA 2TRSA 4TO8A 2FIQA 3F4WA 1KLYA 3H54A 2ZDRA 4ML9A 3C6CA 4QAIA 2WNZA 3S5OA 3KRUA 4HNNA 3FYOA 4LTSA 1M6JA 3STCA 3TIMA 3TAOA 4UTHA 2R91A 4MY1A 3DU0A 4N9CA 3TC6A 3OVPA 2VEKA 3W70A 3M5VA 3P62A 3QQ0A 1NF0A 4DEFA 3BARA 4Z0JA 4LY8A 1F76A 3O15A 3OVQA 3LTYA 4XTDA 6ALDA 1ZCOA 3ZR4A 2YFOA 1XCFA 4JXCA 2J9YA 1PL9A 3N14A 1QPRA 3ABSA 3RU6A 1AL7A 1KM0A 4MLJA 5CZJA 5D2VA 1OFBA 1KA9F 5DLCA 3KVMA 5I3FA 1TJRA 2OX1A 3FEMA 3HGJA 4C1LA 1RD5A 4QNWA 4ADTA 3A5VA 1F6PA 1YTDA 5E93A 1JCYA 5BRBA 2YXGA 1LM1A 3FKRA 3CU2A 2RFGA 1TTIA 1GYLA 1ZAJA 3IIXA 1MO0A 4ZMGA 4YL2A 5FEWA 2CFFA 2JGYA 3BW4A 3UXDA 3L0GA 1GPWA 5CPNA 3B06A 3CLMA 3NQ7A 1J4EA 1PV8A 1KFJA 3PUDA 1QOPA 1H51A 5AC8A 1KBIA 2ZZ5A 2YFNA 1TPUA 3A23A 1UUOA 4HIBA 1PHWA 4WY0A 3L66A 4DBEA 2C16A 5DXYA 1EWEA 4JR5A 4JX5A 2I1OA 5EY5A 2ZRUA 4PH6A 4FNRA 4FX8A 2VEMA 2C14A 4ZQRA 5L9FA 3UZJA 2Z0IA 4E2DA 2NUYA 4CQAA 3GIYA 3NQGA 2QUTA 2BTMA 1EA0A 1JRBA 1AW5A 3T78A 3JR2A 3R5EA 4ZQOA 1IXPA 3UZ5A 2A7PA 4ALDA 1RQEA 1UBSA 4O14A 4JYFA 3IIPA 2ABAA 2VOMA 3I68A 3CQ0A 3MI6A 3W7EA 4JTHA 3LTPA 5AHEA 2W79A 4RJEA 2A1YA 3TAKA 1JVNA 3WJXA 1PHQA 1MXSA 1TRIA 1W56A 1RVGA 2BXVA 2CZFA 4DF0A 4FNTA 1D3GA 2OT0A 4K8HA 1ZY9A 3GR8A 2R14A 1XDMA 1WYIA 2ZFAA 3G1DA 3LV6A 3W84A 3TX9A 1KV5A 2QAPA 3LI0A 4NQ1A 4OE7A 1RPXA 3W23A 3W7QA 2Y62A 4JYDA 3B4UA 1O95A 1LOSA 2GVJA 1QPOA 1W31A 3VFLA 4DF2A 3PWAA 1XI3A 2WNQA 2OZ0A 3GDMA 5D32A 2CLFA 3F03K 2QCDA 3LCIA 5EYWA 1OJXA 5D09A 4XBSA 4Y9AA 2YSWA 1T96A 1A50A 3P82A 1YDVA 3ZS4A 1OYBA 2QJHA 2EKCA 3EWXA 3NQFA 3FJ6A 2PRMA 1R2SA 4OQVA 3R13A 1GYNA 3UY7A 1JUEA 4JN6A 4R53A 4UNLA 3LOTA 3P67A 3G1YA 1H60A 2EPHA 1GWJA 3IVSA 3QSRA 3GYEA 4O57A 4O50A 5D33A 1WA3A 3USBA 2WJZA 4MVAA 1YTEA 4O13A 4OHQA 1WX0A 1THFD 4R34A 2ATSA 1KFKA 2YX0A 4I7WA 3TFCA 2VENA 5DY2A 3S42A 1I2OA 2ZA1A 3G1XA 4ZZ9A 2YR1A 3LV5A 5KINA 1GG1A 1FCUA 3W7DA 2GVGA 3MO7A 1LOLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3BJS A;  2D3N A;  2WSQ A;  3QFE A;  3M1Z A;  1E6S M;  1BG4 A;  3NZP A;  4F40 A;  2FB2 A;  1JJK A;  1F2J A;  4HOW A;  3HFY A;  3OOD A;  3U48 A;  1HL8 A;  4HMN A;  1W8G A;  2FZ8 A;  2X0Y A;  1XYF A;  1GQI A;  3WFL A;  4C6B A;  1B54 A;  5HNN A;  1KBK A;  2VVS A;  2YDA A;  2JKE A;  3VNZ A;  3B0Y A;  5E09 A;  3PHA A;  2ONE A;  1D8C A;  2C1H A;  2PGE A;  3WNP A;  1XKJ A;  4A8L A;  1VYP X;  2WMI B;  5HK4 A;  1FXP A;  3KE0 A;  1QO2 A;  1LRO A;  1C7S A;  1H7X A;  2F2K A;  4UQ9 A;  5K9C A;  4OU1 A;  1L8N A;  2ZX9 A;  3D47 A;  3WML A;  1TPE A;  4KCW A;  3WH7 A;  3N4A A;  1A5O C;  5AHI A;  1SVD A;  4IP7 A;  5BNK A;  1OFQ A;  2XH0 A;  4LVD A;  1MEW A;  1QI0 A;  4FIR A;  1TX0 A;  2XVL A;  3R8H A;  3VIL A;  1G01 A;  4N42 A;  4AIS A;  1FWS A;  5CPT A;  3H4G A;  4DJE C;  2X16 A;  3M6D A;  5I00 A;  4WR3 A;  3WF3 A;  3IV3 A;  2CYG A;  1KWG A;  1V6V A;  2ZUW A;  1XWY A;  4O8A A;  4O52 A;  5LIU X;  3MMT A;  3PTQ A;  3UET A;  2LLE A;  3VND A;  2NQJ A;  4WVX A;  3RF9 A;  4H9U A;  1VS1 A;  3QRH A;  1ZJB A;  1ISV A; 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