3MP3A

Crystal structure of human lyase in complex with inhibitor hg-coa
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
TLPKRVKIVEVGPRDGLQNEKNIVSTPVKIKLIDMLSEAGLSVIETTSFVSPKWVPQMGDHTEVLKGIQKFPGINYPVLTPNLKGFEAAVAAGAKEVVIFGAASELFTKKNINCSIEESFQRFDAILKAAQSANISVRGYVSCALGCPYEGKISPAKVAEVTKKFYSMGCYEISLGDTIGVGTPGIMKDMLSAVMQEVPLAALAVHCHDTYGQALANTLMALQMGVSVVDSSVAGLGGCPYAQGASGNLATEDLVYMLEGLGIHTGVNLQKLLEAGNFICQALNRKTSSKVAQATC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase
publication title Functional insights into human HMG-CoA lyase from structures of Acyl-CoA-containing ternary complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 103
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 4.1.3.4: Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase.
pdb deposition date 2010-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mp3A00
4JTIA 2B0MA 3TX9A 2NX1A 4PA8A 1KM3A 3UWVA 2BX7A 2E1DA 4NU7A 2NV1A 3S1WA 2DP3A 2GQAA 3S1VA 2ZZ3A 1VRDA 3TJLA 1QR7A 4MVAA 1O5XA 5AFDA 5G2WA 3G18A 1L6YA 2V30A 3S9YA 1GTHA 4RJEA 1RQHA 4HSOA 3TQKA 1LDCA 1M7PA 3C2RA 3NQGA 1KTNA 1W1ZA 4K6AA 3SFKA 3CIWA 2A0NA 3S6DA 2CZDA 1J4EA 3NNTA 4CQAA 1QOQA 3DFSA 2C19A 4WXZA 4LUIA 4NJGA 1QPRA 4A2RA 4K8HA 4QAIA 1SO4A 5HR7A 3EWYA 1S3HA 1NF0A 1C29A 2I9EA 2QCDB 2ZZ4A 4Y9AA 1UUMA 2ZFAA 1Q6RA 3HF3A 1TIMA 1FY6A 3M7WA 4HSNA 2Y85A 1VLWA 1TPVA 2RDWA 4PCFA 1DORA 2V5BA 4NX0A 2VC6A 1OG0A 3GKAA 5CZSA 1PVNA 1VJIA 4FNQA 1KLZA 4M5PA 3UNDA 3LX9A 5AYXA 2ZRXA 1MEWA 1H7XA 2ALDA 1C9DA 2FDSA 5KZMA 3C6CA 5KMYA 1LRQA 3LXAA 3M5XA 4UTTC 2EKCA 4Z1BA 4FNTA 5F2GA 4C1KA 4K38A 1KFBA 2E5BA 1KFJA 3C2EA 3PVFA 2ISWA 4JX4A 3TSMA 3W2LA 3NQCA 2NWSA 1ZFJA 1QFEA 1V7YA 2ZDRA 3Q58A 3DFNA 1A53A 1DOSA 1P5BA 5D03A 3EX1A 4PTNA 4AMAA 2XN0A 1LCOA 1P0KA 3KVLA 1F7BA 3L5MA 4JX6A 3GXNA 3TXZA 2V82A 4QNEA 3MWAA 3QH2A 4ZMGA 1XC4A 1GJPA 3NZRA 1TQXA 5D02A 1XUZA 2VFGA 3P5ZA 1W5MA 1I2RA 3M5YA 1OYAA 3LRLA 1X6UA 1NF7A 3ABSA 2B7NA 4RV8A 2C14A 5D09A 2CU0A 4DO5A 3W7CA 3AO0A 4O1AA 3W22A 1ZHAA 5F4XA 2A2IA 1D3HA 3H54A 1TMHA 3NL3A 3NQFA 3RF9A 1EA0A 5FF7A 4WQ6A 4L4MA 4OWGA 3B8DA 1OYCA 1Z41A 3PBYA 2FQIA 3W1AA 2Z6JA 4O17A 4I7VA 3QMSA 2CLMA 3FEMA 4DO4A 5CZTA 3EX2A 3G1XA 5FI8A 5CGQA 5LNRA 3TH6A 5K4XA 3PSVA 1LRTA 5LZLA 3HG2A 3SECA 2ZA1A 3GXPA 4EVZA 3IEBA 1RPXA 3FYPA 5D2VA 5D38A 4Z1CA 3HPZA 1PE1A 1G4TA 3IRDA 3MI3A 3SW6A 3G0SA 3G1DA 1L2UA 3THQA 4GE8A 3A21A 3N2XA 4O28A 1ZY9A 3Q94A 2C16A 5I3GA 1FUYA 1K8YA 2WNQA 3P80A 3IIPA 5FEPA 5KSWA 2A6LA 3LCFA 3QW4B 1EP1A 3C2OA 2NX3A 1YYAA 1EUAA 4O16A 4UTLA 3EKZA 3TC6A 1IXOA 4DQWA 3PULA 4N6FA 2C6QA 3QPZA 3TE9A 2X1RA 3FKRA 3NAVA 4XZ9A 3FOKA 4Y96A 3W75A 1O95A 4K37A 5HUOA 2FJKA 3I7SA 4R34A 5FF4A 4ORIA 3C2VA 4FX6M 4RZ6A 2B7QA 3TAOA 2CLLA 3N2MA 3NO5A 3NPXA 3GB6A 4UXDA 3P74A 1FBAA 1VCVA 2WV8A 4IMCA 3E12A 5MHBA 4MKNA 1ZAHA 4HNVA 3TKFA 4O19A 2J9XA 2QCMA 3SIZA 2D73A 4CQ9A 5D05A 1TQJA 5AHFA 1WV2A 5HULA 2Y63A 5EPDA 4UFJA 3UPBA 3O6CA 4WD0A 4I7UA 4AWUA 1K8XA 4Z1DA 4G1KA 4FX8A 4XTIA 1OX4B 3V1PA 3C8FA 2GQ9A 5G1YA 2GVLA 3WJSA 2QCDA 1YLVA 4NJIA 1H7RA 4PODA 3QYQA 3W1RA 1AMKA 4ZQRA 3QC3A 1OF8A 1SO6A 4XBSA 3PBWA 2GVGA 3EX4A 2O7QA 5FEZA 5HUPA 2P10A 3ABOA 1TCDA 2DZSA 1WA3A 1OX5A 3S1XA 3NOEA 1TO3A 1QPQA 4AHPA 1TTPA 5DN1A 1UJPA 4RXGA 3TCEA 2QCHA 4UTMA 3W72A 4FF7A 4AWTA 2JKAA 1B4EA 4JTUA 3B0VC 3ATYA 2ZRUA 3W9ZA 5F2LA 4FXSA 2QJHA 1B9BA 2HS6A 1YDOA 4JY9A 3G0XA 4HIBA 4QIUA 3NEVA 4NZJA 3PG8A 1KM2A 1X8FA 2H90A 3EXSA 5D33A 1H1YA 3LCIA 3CPRA 1SZEA 5CSSA 1X1ZA 3NPVA 2R8WA 4NJHA 3S5NA 1ICQA 5SWUA 1G7UA 1HO1A 2WNNA 1VCFA 4DO6A 4S2CA 5K9CA 3CTLA 1JCNA 2YYUA 5L6UA 2GQ8A 5C54A 1G4SA 4LV4A 3HJZA 4NJJA 4J9JA 2DJLA 2G95A 3A9IA 3W1NA 3NQ6A 1ZAJA 3TW7A 5U7SA 1M5WA 3QPYA 4TIMA 3BK0A 2R94A 3ZWSA 1ZCOA 1H5YA 2E5DA 3MHUA 3FYOA 3MO7A 1FCQA 1LOSA 2BXVA 1WOBA 4H6KA 5C6MA 3N3MA 3N14A 3PUDA 1RV8A 4JTTA 3TQ0A 3LHVA 3UXDA 2FFCA 4S1FA 3HGJA 4YWIA 4FO4A 2O7SA 3SGUA 3PF3A 3KOFA 1H50A 4YCPA 5DBUA 3W88A 4JTFA 1GQNA 2J88A 5CSRA 4LVAA 4RZ4A 3S5YA 5F1UA 2A4AA 1MXSA 4ORMA 1GYNA 3BVJA 4XKYB 1TTIA 4O50A 1QDSA 3TR2A 2QCEA 1ICPA 4JYDA 1QPNA 1EEPA 2FB2A 5G4EA 2QCCA 3CC1A 4R7JA 4ADSA 2Z2UA 1QNVA 4MOZA 5KTLA 4OBTA 3BGGA 1DQXA 1JCJA 2F7FA 3I6RA 2TMDA 1SFJA 1TB3A 2QDHA 4LUJA 5FEXA 5DXXA 3RU6A 1R47A 2TYSA 3W7EA 2ZTJA 1SPQA 3UZ5A 3VCRA 1FCBA 3FLUA 5J5DA 2B7PA 1PIIA 1L6SA 3NZ1A 1EPXA 2ZRYA 2PCQA 5HQEA 3PAJA 1A5CA 1OF6A 3MBFA 3OA3A 4O13A 1I45A 2X1TA 1LM1A 4O10A 4RXFA 4K39A 3IGXA 3C56A 4N4QA 2VFDA 3WJWA 1PCWA 5DLCA 1I4NA 3FS2A 4WXYA 1LRNA 1H7NA 4DBEA 3CT7A 4UTWA 3BLIA 3B0UX 3NQ7A 1W37A 2VENA 4POCA 1K3UA 3L67A 4U28A 4E38A 4FHAA 1SSDA 4MFEA 3GDLA 2RFGA 3G1HA 4XBKA 3HB9A 1THFD 3WK3A 4JICA 3KAOA 1Z44A 3G24A 3NPUA 3KVJA 1DBTA 2A6NA 3DFOA 3G1VA 3O16A 1EWDA 1OX4A 1Q45A 5LNWA 3LRMA 5KZEA 3PR2A 3LLFA 1EX5A 1XBXA 3QSRA 5E0KA 2E6DA 3WJZA 1XFBA 2JKPA 4DF2A 2OT1A 4HN4A 1JUBA 1GYLA 1JUKA 4MJMA 4ADTA 3B06A 5HR6A 2YZRA 1IXNA 4K8EA 3W7DA 1ME8A 3SJ3A 3M43A 1R46A 4N9BA 2FPVA 1DJNA 1H7PA 3HBLA 3TMQA 2GPTA 1K7FA 3HG3A 5AC7A 2A21A 4CNPA 3NXFA 4DEFA 1YADA 4MLRA 5EMUA 1VC4A 4HNUA 2ISVA 4JTSA 3R5EA 4DF1A 2IQTA 2VEPA 2X30A 3W1TA 4MZ1A 4EOUA 1VZWA 1MSSA 5BW6A 2J27A 2VFHA 3Q2DA 2HTMA 3DU0A 1DJQA 3BG5A 4YCOA 1GTEA 3NVTA 3DZ1A 1JJKA 3SY5A 5EL1A 2E09A 2JK2A 1OABA 3W73A 4KFPA 2TPSA 3W84A 3DKJA 3LTPA 2QUTA 1SW7A 3GNDA 2C15A 5F2IA 3WK1A 5LHFA 5BOOA 2YXGA 3FA5A 3LHUA 3G0UA 2WO5A 3GR8A 3QRHA 3W7IA 4UTKA 2DJXA 2NLIA 3EB2A 3IIZA 1A5SA 3W2UA 5I3IA 3PY2A 2EGZA 1T99A 4MYXA 4KFOA 4OT7A 2NWRA 4S2BA 1OFAA 2VFEA 4BF9A 5AHMA 2NZLA 3VNDA 1BKSA 1CI1A 4X3ZA 4OQVA 4X22A 3TU9A 3RK8A 5K4ZA 2YW3A 3N34A 5TQLA 1YTKA 3EWBX 1GVQA 3MP4A 4NT0A 1VGAA 1K8ZA 1BWKA 2CWNA 6ALDA 1FX6A 4NNBA 1KFKA 1PHQA 4A2SA 2VEIA 3BV4A 1OFPA 4NX5A 5AHLA 1PV8A 3UQNA 4AB4A 1L6WA 4UTWC 1F5ZA 4HHPA 3WK0A 4AHOA 4E0CA 1VQTA 2NV2A 1A5BA 3BW4A 1KFEA 1MZHA 3OEXA 5IM51 3TA6A 4IMEA 4JIQA 2E77A 2V8ZA 3AJXA 5DBTA 5I3FA 4UR7A 4UTJA 2NXIA 4YXGA 3GXTA 3B0PA 3A5VA 3OIXA 5K9XA 1YPIA 1EUNA 1Q6OA 4IXXA 4BI7A 2QAFA 4NZFA 1TV7A 2BZNA 1H7WA 4D2JA 2B4GA 5BMXA 3E0IA 1MO0A 3P61A 4LY8A 3NQVA 3I65A 2H6RA 3QFEA 3PWAA 2GVJA 1MEIA 1OJXA 4LNYA 4NNAA 1TPWA 4FEZA 4LC8A 1SO3A 3F03K 2X1UA 4GUJA 1Q6QA 3T4CA 3ANYA 1XI3A 1LBLA 2PC4A 1SU5A 1AW1A 1H60A 3T55A 4P61A 2V2CA 3MI2A 4I7WA 3W2KA 3B4UA 4ZZ9A 4AEOA 1PHWA 3PM6A 2XFWA 1JR1A 3IV3A 4BI6A 3NQEA 1OX6A 2DU2A 3PC0A 3HMJG 2C0AA 4NXKA 4UR8A 3W83A 2G96A 3YPIA 3M0ZA 5EYWA 3LRKA 2EAWA 3VI2A 3Q37A 2CFFA 4JDBA 5L9FA 3OBKA 4CLMA 3NQAA 3RFAA 5D2WA 3SGZA 4M6VA 3IGSA 2H3BA 2PURA 3G1YA 2YR1A 3STGA 2EHHA 4HPJA 2HS8A 3HG4A 2GJLA 1GT8A 3R12A 1G67A 5D32A 3B05A 1OFRA 3CLMA 3W7PA 1GWJA 1LYXA 3GIYA 3M6YA 5F1VA 1WBHA 3L0KA 2VKZG 3NQ2A 4LVGA 3TK7A 1NAL1 3JR2A 1TRIA 3DFQA 1JVNA 3L5LA 1EIXA 4O18A 4JTEA 1IGSA 5CPLA 4WOZA 4UFKA 3UYCA 2EF9A 2C3ZA 1D3GA 4IJBA 1HL2A 3LCWA 3E49A 1XL9A 3ZS4A 2FIQA 4LVFA 2E6YA 3HGSA 1TSIA 3CB8A 4MYAA 1LORA 3EX6A 3STCA 2ZQ0A 1S5WA 2JKEA 5HINA 2VFFA 1WOAA 4GNJA 3G1FA 4JTHA 2ZZ7A 5CKSA 3UWYA 3UD6A 3DFTA 4R53A 2ZZ5A 2CLHA 4EWND 1FWWA 1KW1A 2Y89A 3N19B 3T44A 4RX0A 3GDMA 3IGUA 4MFDA 3R13A 2Z1BA 4UTHA 1LLZA 4Y90A 4M7TA 1GVRA 3A24A 1F73A 2W0UA 2QJGA 3QF0A 4QM1A 3CEPA 2ISSA 2E6FA 5D04C 3LLDA 1TPB1 4O0KA 1TPH1 4MPQA 3H55A 5CZJA 4MY8A 1KV8A 4KWWA 1ZJIA 5FESA 1LOLA 3P67A 4ZVJA 1LP6A 3A5FA 1HG3A 4FIQA 5D30A 4GBUA 4MIMA 4A21A 4DPPA 4HNTA 3MW7A 4Z08A 1KM6A 3NQMA 2TRSA 3DKLA 3G3MA 3IIVA 3PG9A 4ZL1A 3W7NA 1K03A 3DI0A 2QF7A 4IX2A 4M6QA 2UV8G 1WAUA 3W2MA 4O54A 3TMLA 2JGYA 5E93A 1RQBA 3PUOA 4ADUA 1OK6A 3ELFA 4Y8FA 3TW6A 1RD5A 3JS3A 5DELA 3G3DA 4LWWA 5CPNA 2BWGA 5AC8A 3QMTA 1TPC1 2V2HA 5I3JA 3EX3A 2TSYA 4DBDA 1QWGA 1SZGA 4DXVA 4H3DA 3O06A 4O53A 3LGEA 2CZFA 4GFSA 1GPWA 3L2IA 4GUIA 2YW4A 4IGHA 1NFBA 1WXJA 2GUUA 4FNRA 1TPUA 4IX0A 3SI9A 1EP3A 1KTCA 3G1SA 2KZHA 1RZMA 2VOMA 2FPTA 4UC5A 3W7RA 5EA9A 5LGZA 1JQVA 2QR6A 4LT9A 3NQ8A 3LCHA 4NJKA 4UTIA 4XWUA 2WQPA 3L21A 3C3NA 3G8EA 2VEMA 1L9WA 2QCFA 2JGQA 2WKJA 4UNLA 5I3HA 1Z42A 2WSRA 4JTKA 2ZRZA 1EWEA 1QO2A 1C8VA 1W8SA 1YTEA 1HUVA 5ABTA 2I1OA 3W7LA 1FCVA 5HWJA 5D2TA 1QOPA 3LCLA 1O5KA 5I3KA 4BWLA 1VLIA 3CEUA 3LB0A 1KBJA 1O94A 4N9EA 2J9YA 2J24A 3QZEA 4N02A 4LRTA 3QQ1A 5AHIA 5GVJA 4JR5A 2CLKA 4FNUA 3NL6A 4N2YA 1VCGA 3PB0A 3QW3A 4OGZA 3W7KA 1T0OA 3N73A 1XDLA 3T7VA 4Z1AA 3TDFA 1BWLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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