3MUXA

The crystal structure of a putative 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase from bacillus anthracis to 1.45a
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
TNIQKRFYKGRVALNVLANNIENAKDIFEAAEGYVVVGVLSKDYPTVEEAVTAMKAYGKEIDDAVSIGLGAGDNRQAAVVAEIAKHYSGSHINQVFPSVGATRANLGGKDSWINSLVSPTGKVGYVNISTGPISAAGEEKAIVPIKTAIALVRDMGGNSLKYFPMKGLAHEEEYRAVAKACAEEGFALEPTGGIDKENFETILRIALEANVEQVIPHVYSSIIDKETGNTKTEDVRELLAVVKKLVDQYA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords putative 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase
publication title The Crystal Structure of a putative 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase from Bacillus anthracis to 1.45A
rcsb
source organism Bacillus anthracis
total genus 95
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07071 KDGP_aldolase KDGP aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3muxA00
2QCDA 2GVJA 1B57A 1JUBA 5LHEA 4BFAA 1RVGA 2YDAA 5K9CA 2BZNA 1FBAA 1RV8A 2GVGA 4YCOA 3CIXA 1G7UA 2OT1A 4J9JA 3FJ6A 3DH7A 3GVGA 4MY1A 1O60A 4AMAA 3UYCA 3P7YA 5D2TA 2BSLA 4IUOA 4JTIA 4WQ6A 3W2NA 1C8VA 3N9SA 1OABA 3HG4A 3WJWA 4Y8FA 1EA0A 2KZHA 3DI1A 1LRNA 1I2RA 2Y85A 3CC1A 5AYZA 1O4UA 3E02A 3FOKA 1K8YA 3CTLA 2ZZ2A 3TQKA 1L6YA 3BV4A 5CZTA 5G2HA 2WKJA 1IF2A 2QCHA 5D37A 3NAVA 4NX5A 2CZ5A 1MEWA 1OYAA 4WZHA 4LY8A 1ZAHA 5LHFA 3W70A 1PCKA 3ZS4A 1CX9A 3EB2A 1NEYA 2FB2A 2QCGA 3I7QA 3BARA 1SZEA 3F1QA 4RZ5A 3P61A 4WD0A 5H91A 3IVTA 5CPLA 3RLVA 1V7YA 2Z0IA 2E1DA 3W88A 3JRKA 2WV8A 3O6CA 5D04C 3NOEA 2OCZA 5K2ZA 3UPWA 4DO6A 3MI3A 5L9FA 3W7LA 3O15A 1ML1A 1G4SA 4LOCA 3EX1A 2R94A 4O10A 3W1QA 3C2RA 1I2PA 4O1AA 5EPDA 4CCDA 1F6KA 3NPUA 4IWWA 4KWWA 4UTWA 4WXZA 3TAKA 4JTFA 5AHFA 3NPWA 3EX2A 1JCYA 4GC4A 2EF9A 3W75A 5K4XA 5IBXC 3M5VA 5IM51 2E6FA 4PH6A 1WOBA 4OV9A 2DORA 1FCBA 4FNPA 1KM1A 3TQ0A 1OFPA 3B03A 4AF0A 3PF3A 3R2GA 1Z41A 2WSYA 4EWND 3P5ZA 1B4KA 3FLUA 3MW7A 4O52A 5KINA 1FQ0A 3G1VA 2BX7A 5TIMA 5G2IA 4TMBA 2ZTKA 4JNMA 5G1TA 1ME8A 3NQ2A 4LC6A 5TQLA 4HNTA 1FUYA 2R8WA 2Q3RA 4XKYB 3G1HA 1FWRA 1EWDA 1F74A 1KFKA 3WJSA 4H4IA 4M5PA 5SWUA 1I8JA 3UWWA 2QAFA 4E0CA 1H7PA 1ZNNA 2VEMA 3TV8A 3PG8A 4O18A 1WBHA 2ZFAA 4RZ4A 1HL2A 2VEKA 1A5BA 5E93A 4CQ9A 3F4NA 2E5CA 1ZAJA 2GVLA 1KV8A 3NM3A 4GUJA 1WAUA 4ADTA 4PODA 5KSWA 3NO5A 4PEKA 3DXIA 2C6QA 3IGUA 4MY9A 2QJGA 5TBOA 4MZ1A 3W74A 1S5WA 1W1ZA 3W7RA 3P62A 3V1PA 4N9CA 2Y6ZA 1DKWA 3IVSA 4WX2A 5AC8A 4CCEA 2CU0A 2ZDRA 3W7NA 3NPVA 5F4SA 2WNQA 1JCMP 3SIZA 3P8JA 2BWGA 2BXVA 4LNYA 2B4GA 3GDMA 4NNAA 1ONRA 4DXVA 1X7FA 3O63A 1ZJIA 2C15A 3EWXA 1QO2A 3QEZA 4O8RA 1TQJA 1DQWA 1ME7A 2UV8G 3O6YX 2CLLA 4XQ6A 1KBJA 4JR5A 1LRTA 4ALDA 5U7SA 5K9DA 4JTEA 1NVMA 4O0KA 3S1WA 1KBIA 2PRHA 3W22A 4QITA 2DZWA 3P67A 4C1LA 1SFJA 4E38A 3A24A 4UTUA 1JRBA 1QCWA 3GAKA 3S5OA 3BW2A 5EL1A 4O16A 1GVFA 1ZENA 3EXTA 2QUUA 4K6AA 3LXAA 2W6RA 3HGJA 3QYQA 1OX5A 4PC8A 3S6DA 4JTJA 5DLCA 1L9WA 2AGKA 3WFAA 5LNWA 1YTKA 1YXDA 1IXNA 2QKFA 3Q2DA 3UPBA 3KVJA 3R12A 3C56A 1PS9A 3HPZA 4WXYA 3STGA 3TXVA 1JCXA 3PVFA 4XKYA 4IMGA 4DO5A 1GYNA 4PFMA 1TYGA 1YTEA 3LHZA 2CLMA 5GVJA 3LOTA 4NQ1A 1FXPA 1LTDA 4IX2A 4U28A 4JTLA 1XCFA 3NYZA 3W72A 1MO0A 1Z48A 5CPNA 4FIQA 4MZ8A 1AL8A 3S0CA 3HGRA 4O28A 1OX4B 2VENA 2NX1A 4NNBA 5G4EA 4JTGA 3PULA 1HG3A 5AFDA 4GFSA 4UTIA 2Y61A 3GX9A 2ZRUA 3B0PA 1FCQA 2VEPA 4UR7A 3WK0A 2ZBTA 3PR2A 1OHLA 3LHWA 4GJ1A 3W1MA 3LXCA 4ZQMA 4ZQRA 4LTSA 2H3BA 5LGZA 2X16A 4LRSA 1ADOA 3CQ0A 3W7HA 1W8SA 2QDHA 1EUAA 1XBXA 2J9XA 4R34A 4UUIA 4W9TA 3THQA 3G1DA 1Z42A 4Y96A 3USBA 2Y70A 1OVDA 4MYXA 4DF2A 3W85A 2G97A 3T4CA 3PBWA 3TFXA 4QJ1A 1QAPA 1LOLA 1JQVA 4KFNA 2ZZ1A 5E1QA 5LKYA 1PVNA 4X9SA 3MHFA 4K36A 1AMKA 4O54A 3C8FA 3MBDA 3CWNA 3W2KA 3O05A 4RX0A 5KMYA 1SSDA 4DQWA 3VFLA 3L5MA 3PUEA 1K7EA 3LBMA 1SZFA 1AW1A 3H54A 2IQTA 1YXYA 1LM1A 4OT7A 4O4WA 2ISSA 3VI2A 1TTPA 3IIVA 2G96A 3EXRA 1P4CA 5LZLA 4NNCA 1G69A 1PCWA 2NXIA 4KWVA 5AHMA 3M7WA 3N2XA 5CKSA 4LVDA 1T8XA 1P5BA 2ZA2A 1KFCA 1K3UA 4DBEA 2I1OA 3DI0A 3NQDA 4I7UA 2ZZ7A 1EB3A 1TPB1 4XWUA 1KLZA 5DN1A 2HS8A 3VKJA 3FS2A 3TDFA 3GR8A 1W5QA 1R2TA 3L66A 3A22A 3PWAA 3NL5A 4IJBA 4UC5A 3TUUA 2XN0A 4N9BA 1P0NA 2W79A 1G4PA 1OX4A 4JIPA 3INPA 3G22A 4KFOA 4BWLC 4K37A 4UTTC 1Q45A 1WV2A 3QC3A 1XL9A 2VFIA 3QSRA 4K8HA 3PB0A 1JCNA 3CLMA 4DO4A 3DFNA 3WK1A 2NXGA 1ICQA 3LTSA 3B04A 1L6SA 1GQNA 2V5LA 2J9YA 4L4LA 4HKPA 3P84A 3GAYA 2E6AA 2V82A 4TMCA 1SW3A 1SPQA 1SQ7A 2DJLA 2GJNA 3L9CA 1HUVA 3C3NA 3NDOA 3G8EA 3P82A 2QCDB 3CIWA 3EXSA 4O15A 3KRUA 4IOTA 5DXXA 1JJKA 4ZVJA 1VHNA 3UD6A 1TJRA 3SFKA 5EBUA 5D2YA 2VXNA 5D09A 3CWOX 3N9RA 1QR7A 4I7VA 3W7OA 3TC7A 2A2IA 3LRMA 1XDMA 2F84A 1VH7A 4O1BA 5I3KA 5CPOA 4Q32A 3LGEA 3C0JA 1SO3A 5F4WA 1PV8A 3NQ7A 3EKZA 4UTWC 4O12A 1HFBA 2RKXA 2B7NA 3GDLA 6TIMA 2TSYA 4LS0A 4FNRA 4S2BA 2FIQA 3OG3A 3RK8A 4JTTA 3G0SA 3TU9A 4GUGA 3ABQA 3GKFA 1FXQA 1TREA 1JRCA 4A29A 5FI8A 3MI2A 3M6YA 2FJKA 3CT7A 2Y88A 4PTNA 4C1KA 3PBVA 3QFEA 1L2UA 5D2WA 2R91A 1UUMA 4ML9A 5EY5A 5HR6A 3UQNA 3QMSA 3LDVA 4OHQA 4JDBA 4U4MA 4EIVA 1I2NA 4BF9A 3PUDA 5U4NA 2QAPA 2VEIA 3RF9A 3EWYA 2ZRVA 3VE7A 2RFGA 4DELA 2TMDA 3GLCA 1G7VA 1M6JA 2RHGA 3G0XA 4YLWA 2NUYA 1H1ZA 3A5VA 1RQEA 3G1YA 3A5FA 3BLEA 4YWIA 1YPIA 5FF7A 5EYWA 4FXSA 4Z1BA 3Q58A 5F2MA 1R46A 2GQ9A 4X2RA 4A22A 3L0NA 3MJYA 5A8GA 1LOQA 1XBZA 4E2DA 2YW4A 1VR6A 4ZQPA 1U83A 4O11A 4HSNA 3DFPA 1AW2A 3IV3A 3S5NA 1T96A 2TYSA 2WSQA 4O14A 3SSJA 4AF0B 3NQAA 4JYFA 1Q6QA 1SUXA 4HNUA 4GXMA 3UZ5A 1GTEA 1LBMA 3C2EA 1JVNA 4BWLA 2VFEA 4UTTA 3UY8A 1J4EA 3W2JA 4N2YA 4A2RA 2YYUA 4S2CA 4GBUA 3EX6A 5HULA 4LWWA 4AHQA 3NQMA 3WJZA 4JX5A 3W1AA 4N6FA 1S3HA 1DBTA 2E09A 5DCBA 2J27A 1B9BA 4UMBA 3R5EA 2ATSA 5EMUA 2C18A 4UNKA 4HN4A 4NZJA 3PB2A 4EF8A 4DPPA 4WOQA 1GG1A 4Z08A 3L2IA 3M5ZA 3W71A 3M43A 1FCVA 5CG7A 1GWJA 3KFTA 4BI5A 1SW0A 3W76A 3UNDA 2V0TA 4PL1A 1VHCA 4WJEA 1N8FA 1LROA 1OYBA 1R47A 4LUIA 1WQ5A 2AAMA 5FF0A 4MJMA 1TPH1 5D2XA 3G8RA 3I6RA 1UJPA 1VCFA 1YXCA 3M47A 1MEHA 4IGHA 3B8DA 1VCVA 3R89A 3LCXA 2D73A 3TR2A 5KTLA 2B7QA 1LLZA 3LB0A 2ZCGA 1I45A 4UFIA 3LM7A 2O7QA 4ORIA 4HT3A 4BI7A 1P1XA 1W56A 1TMHA 3RLUA 1TTJA 2Q8LA 2V30A 3QMTA 2JKPA 3QW3A 2FQIA 4UTHA 3THAA 3NNTA 2X1SA 3W1TA 2C19A 1H7XA 4FF7A 3SI9A 3DHDA 2QCNA 3LHUA 1SW7A 3CHVA 3L0KA 4GE8A 4NJIA 3UWQA 3QW4B 3UXDA 1R30A 4FNQA 1DQXA 3T55A 5AYXA 1W3TA 2X1UA 3DFSA 3M16A 1FX6A 2C0AA 4O57A 2V2HA 2GPTA 1SR9A 4CQ8A 4XBSA 1HO1A 3FYPA 5I3HA 4LU0A 1KM0A 3WK3A 3KRZA 3RU6A 3P8IA 1TB3A 1MZHA 2H6RA 2V9DA 2Y7FA 1QO5A 1QWGA 3MBFA 1UUOA 2XN1A 2Q8ZA 4HIBA 3H53A 1JUEA 2QJIA 1XBYA 4K39A 2Z6IA 2ZZ6A 4LVAA 3TW6A 1B3OA 3LTPA 1KW1A 1HTIA 2NUWA 1KM2A 2ZRZA 3GYEA 3W86A 4QAIA 1KTNA 2A0NA 1QPRA 2GOUA 4JICA 3HBLA 2X2GA 2V5BA 2GQAA 3OEXA 4K7VA 4ORMA 1DL3A 1VYSX 3GDRA 4O50A 2A6NA 4H3DA 2QEZA 3LLDA 2ZA1A 4Z1AA 5HJLA 1NF0A 2DZPA 5BMWA 1TQXA 3VNDA 3IIXA 4UTMA 5EA9A 4BK9A 3M0ZA 4IX0A 3KAOA 2V81A 1TV8A 4MUZA 2H3DA 1OYCA 2A7RA 5E0KA 5AC7A 2BLEA 3EWZA 3CPRA 3VE9A 3O6DA 4N4PA 2FDSA 1H7WA 1QFEA 3W84A 4R33A 2VKZG 2ZZ3A 3LCFA 1VYRA 1W31A 1VLIA 4MFEA 4AHOA 4MFDA 3UXAA 2DZTA 3N19B 1TRIA 3A23A 5A5WA 3LV5A 3E12A 3STEA 4IMFA 4UMCA 3DBPA 3LCGA 2CZEA 3F4WA 4DEFA 3S5ZA 1H7NA 4TIMA 5C55A 5HMSA 1OFOA 5LSMA 4MY8A 1YADA 4NUWA 2C13A 1TPC1 4G1KA 3D0CA 2NV2A 1TPFA 3TQVA 5BOOA 4M6PA 3P74A 1IXQA 1DORA 4UTJA 3L0GA 1F5ZA 3B0UX 2CZFA 4AHPA 4O1DA 4LVGA 5H2ZA 1LZOA 2PE4A 4LT9A 4RV8A 2Y63A 1O95A 2QDGA 2FPYA 1LORA 3I68A 3ELFA 4IXXA 3PBUA 3S1VA 4QNWA 4QSHA 3HJZA 4NZFA 2GQ8A 5FF4A 4OE7A 1G4EA 1DHPA 2FB3A 1FWTA 4OQVA 3P60A 4TX9A 5DY2A 4EOUA 1BEUA 3P5YA 2J6XA 4EVZA 1W5MA 3JR2A 1D3GA 5FF3A 3G3MA 4TU1A 4OGZA 2H8XA 3QQ1A 5DBTA 3SECA 3HQ1A 1MEIA 1F73A 1TPEA 4TR9A 3QH2A 5F4XA 3G1SA 3NQVA 2FFCA 2WOQA 2HSAA 1YDNA 5KZDA 3W9ZA 3DFQA 4UMAA 1G6CA 1LYXA 4XBKA 3QRHA 3MP3A 4O0ZA 4I9AA 4Z0SA 5HR7A 5FESA 2YX0A 3SGUA 3BPWA 3BG5A 3QPZA 1F76A 3I65A 1ZFJA 2ZA3A 3K30A 3LCIA 4MIMA 3IGSA 3FJLA 4MKNA 2V2CA 4XTDA 2X30A 3NQFA 2HTMA 2EGZA 1YYAA 2ZTJA 1A5CA 1QDSA 3BW3A 3Q37A 5KITA 5KZMA 1SZGA 3PUOA 4UFHA 3FEMA 3PY2A 3IIPA 3L65A 4OV4A 1PHQA 1K7XA 3I7RA 4YMZA 2JK2A 1H51A 3DFTA 4CNNA 4MYAA 1IXPA 3T40A 2Z2UA 5AHLA 2QUTA 1NSJA 2C16A 4HSOA 1YPFA 2WSRA 3NM1A 1GVSA 1XXXA 2ZQ0A 3LCWA 1GG0A 1IXOA 4NJGA 5D02A 2HMCA 1T99A 3P81A 1TV7A 5CSSA 4K8EA 3CEUA 4DF1A 2WNZA 1W37A 3PC0A 1VPXA 2NXHA 4RCXA 1JR1A 1N55A 4M7SA 3HG2A 4QIUA 3G1XA 3FFSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5LHE A;  4BFA A;  4M81 A;  2FMO A;  2XH2 A;  5C9Z A;  1J12 A;  3CIX A;  4J9J A;  3PJT A;  3GVG A;  1O60 A;  3T08 A;  2BSL A;  4JTI A;  2EO7 A;  3VD7 A;  4TV6 A;  3MS8 A;  2Z1V A;  4ZO8 A;  2KZH A;  1EGV A;  1LRN A;  3BE7 A;  3FOK A;  2W9M A;  2ZZ2 A;  3TQK A;  2VX4 A;  5CZT A;  2WKJ A;  4UQ9 A;  4DJF C;  1BF2 A;  2ISF A;  3TNB A;  4Z2I A;  2IKH A;  3NAV A;  4AZ6 A;  1M7X A;  4XZW A;  4WZH A;  2CEQ A;  1ZAH A;  2FGL A;  3EB2 A;  3K1D A;  1NEY A;  2FB2 A;  1RP8 A;  3URA A;  4HPH A;  4F79 A;  4RZ5 A;  4OZO A;  1TKK A;  5H91 A;  4GAC A;  1V7Y A;  2OOF A;  1A49 A;  3WD2 A;  2J74 A;  2XIS A;  4IIF A;  4HTY A;  4DYK A;  3FCP A;  5K2Z A;  3UPW A;  3L4T A;  1RCO B;  3QHO A;  1S39 A;  1VFS A;  3OGV A;  4CCD A;  1RPK A;  3AYT A;  4UTW A;  1DQU A;  3TAK A;  1W1P A;  2V69 A;  1PX4 A;  5AHF A;  3NPW A;  1XPY A;  3QGV A;  3WH5 A;  1XPG A;  1FP9 A;  1WOB A;  4OV9 A;  2BXY A;  1CGX A;  3HFY A;  4FNP A;  4IGS A;  4J3U A;  1OFP A;  4WKA A;  2A79 A;  4AF0 A;  4JPG A;  1N8I A;  3PF3 A;  4J3S A;  2BY2 A;  4EWN D; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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