3MXIA

Trex1 3' exonuclease d18n familial chilblain lupus mutant
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
231
structure length
219
Chain Sequence
TLPHGHMQTLIFLNLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALESQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDVLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/dna
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
source organism Mus musculus
total genus 78
structure length 219
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxiA01
1T03A 2PZSA 5KGXA 4EZ6A 3TAMA 4CJ3A 4FLXA 3KKSA 3TABA 4N47A 3V81A 3I0RA 3KLGA 3AV9A 4CJUA 4KI4A 3AO4A 4CF1A 2E4LA 4DSJA 4OKJA 1EETA 4CJSA 4FK0A 3AVHA 4BWMA 3AVNA 3NHGA 2IGIA 2FC0A 4RW6A 1IG9A 3AA3A 2BGGA 4OGCA 4DMNA 4F3TA 4CEFA 2HHUA 3CG7A 1B92A 2G8WA 4CK3A 1NKEA 2I5JA 3HVTA 1RT3A 4DWIA 3SPYA 4I9QA 1NKBA 3LP0A 3VQAA 1U49A 1LWFA 3FFIA 1C1CA 2Z1GA 3CQ8A 4FJGA 1WSJA 3VQDA 3DM2A 3NGIA 4DS5A 1LWCA 4W5QA 3U3YA 5D3GA 3PO5A 4BE0A 1J54A 1VSMA 3CFRA 4QOZB 1T05A 4F3OA 1VSEA 4LH5A 4DSKA 2HVHA 1YVUA 2DFFA 3AVLA 1TK8A 1BHLA 2F96A 1KFSA 1QS4A 3EY1A 5HRRA 4DU1A 1EKEA 4CEQA 3F73A 2B4JA 5K14A 4HUFA 2D0AA 1KVCA 3BGRA 1JLGA 3VQ4A 3ZT2A 3KLIA 4BE1A 4IG0A 3NCIA 1SL2A 4DQIA 4F8RA 4CJEA 4AH9A 2KFNA 1VSIA 1SKWA 2YNGA 5KTQA 3AA2A 3SYZA 4ZHRA 1ZBIA 5CZ1A 3AVGA 1HYZA 3VQ7A 3AVMA 3A2FA 3QIPA 3VQPA 1NKCA 2HHQA 4CK2A 3RTVA 1UA0A 3TAPA 1KVBA 1C0MA 4PY5A 1GOAA 4DLGA 3SUQA 1TL3A 2GUIA 5KRTA 4ID5A 4DG1A 4FJJA 3HPHA 1TK5A 1EXQA 2EX3A 3IS9A 4DTOA 4K8XA 1S1XA 4J2AA 3HPGA 4KREA 1RTHA 3HSTB 2GV9A 4CJTA 1SV5A 3VA0A 2ZD1A 3K5OA 1BL3A 3SUOA 1S1WA 3RWUA 1TVRA 4JLHA 5J2QA 1SL1A 5HRNA 2G8HA 5JS1A 1VSJA 2Q3SA 3OYDA 3AA5X 1UOCA 1JL2A 3SV3A 3V1OA 1HJRA 4CK1A 4CIEA 1J5OA 2G8IA 1RT7A 2B5JA 2GBZA 4Q0BA 2JGUA 1IKWA 2JLEA 3AA4A 3V9SA 1I39A 1FKPA 1ASUA 1LW2A 1QSYA 4QCLA 3T19A 3ASMA 4DTUA 1BGXT 3P83D 3IG1A 4PA1A 4FLTA 1TK0A 4ZTJA 4M3UA 2IOCA 4F4KA 4IG3A 3TANA 1CZBA 3L3VA 4DF4A 3OYNA 4MQ3A 4HHTA 2Y1JA 2G8VA 4DTNA 2RKIA 1W9HA 2FBXA 3QO9A 5DMRA 4B8CA 3RRHA 3SQ0A 3DYAA 4DSLA 4AHSA 4FJNA 3U3GA 5FRNA 4AHTA 4ICLA 1HYVA 4YFUA 4FXDA 2HMIA 1KLNA 4ELUA 4EP5A 1RDCA 1YT3A 1NK0A 4CF9A 3ULDA 2HNDA 2IS3A 3HVRA 2P5GA 3AO1A 4CIGA 2FBTA 4F2SA 4BDZA 4FW1A 1Y97A 4E7HA 4KHYA 3OS2A 3KTQA 3OYJA 1XC9A 3HL8A 4YNQA 3QEVA 3K5LA 4C8KA 4CJQA 4DTRA 3PY8A 5JS2A 4FJHA 3QETA 2F8SA 4RG8A 3KK2A 3S3NA 4KB0A 2OA8A 1SUQA 4CGJA 3SZ2A 1KSPA 4FJMA 4M42A 1DTTA 1WSHA 3TAGA 4GVMA 4R5PA 2HB5A 3ZT4A 4M41A 4FZXC 3LP2A 2IDOA 3OY9A 4KHWA 2IAJA 2BE2A 2G8KA 3HYFA 4GW6A 4HUGA 3LDSA 4Z4GA 3KIOA 4DTXA 3RMAA 1T8EA 1FKOA 4DU4A 3OYEA 1JLBA 3V6DA 3VQQA 3G0ZA 4Z0UA 3DMJA 4KHSA 1CXQA 3P1GA 3LWLA 4B9LA 1VRTA 4JRPA 4EP4A 4B8AB 3LWMA 2YKNA 3EZ5A 3WNEA 1ASWA 5HRSA 4M3TA 1NK8A 2HHTA 4OLAA 1RCHA 4CESA 3DLEA 4CGGA 4KTWA 2NUBA 4FZYA 4FJ8A 1TV6A 1WSFA 1EP4A 4HVJA 1RTDA 3RMCA 4DSIA 5C25A 3QINA 1JL1A 1JXEA 2ITGA 1C1AA 4AILC 3MAQA 3KLFA 3L3UA 3QLHA 3MECA 4FZZA 1N6QA 4KB1A 1XWLA 4LSLA 4DFMA 3LP1A 4FJ9A 3SQ1A 4JS5A 4KO0A 4KFBA 4LSNA 3O3GA 4CEZA 1QHTA 3ALYA 1GOBA 2QXFA 1BQMA 2Z1HA 1LAVA 2FBVA 3LAMA 3TR8A 3RMBA 3KD1E 1BI4A 3K59A 1NK5A 5CYQA 4O4GA 1CLQA 4CEOA 2VWJA 4KI6A 1WAFA 1LAWA 3WNGA 2RPIA 4FCYA 1L3SA 4ELVA 1BISA 4I2PA 1TKDA 3V9ZA 1RBUA 1IKXA 2VG6A 4KV8A 3EYZA 4DSEA 1XHXA 3O4NA 3S3OA 4KPYA 3MEDA 1Q9YA 4CIFA 5KRSA 3AO3A 4AHRA 4CFAA 1RILA 1VRUA 1U48A 4B08A 3NH2A 3SI6A 3OYAA 4RW4A 4DS4A 3SQ2A 2WONA 3KD5E 3PV8A 3LPTA 3HXMA 1QTMA 2BANA 3LZJA 2YNHA 3QNOA 4KRFA 4FVMA 5HP1A 1IKYA 3DLKA 1YTUA 2RN2A 4CECA 4CHQA 3NH0A 3OYHA 4FJ5A 4JRQA 1SL0A 1RBSA 1NJWA 4DF8A 5EU7A 1X9MA 3ISNC 4OPKA 2X78A 4KHUA 3OYMA 4E7LA 4KTQA 1ZBUA 2OPRA 4BWJA 3KLEA 2YHAA 3SQ4A 3P5JA 2KFZA 4DTJA 2PYLA 3AVAA 3K57A 4HUEA 4M3WA 1WN7A 4O55A 3CFPA 4W5RA 1L3UA 4IDKA 3OYFA 4DQSA 1RTIA 4LD0A 3L2RA 4Y1DA 4CJKA 3S3MA 4CJLA 1A5XA 4C8NA 3NF9A 1WSIA 3CFOA 4N5SA 4LH4A 1KRPA 4CGFA 1HRHA 4FW2A 3K5MA 3L8BA 1D5AA 1HQEA 4KTZA 1QQCA 2XRIA 3LZIA 2YNFA 1BCOA 3RMDA 1U47A 1HMVA 3DRRA 5SWMA 4CHYA 4CHZA 1X9SA 4DTPA 3AVCA 3K2PA 1ZBFA 2D0CA 3G10A 3NFAA 4PWDA 3WNHA 1WLJA 1TGOA 3NGZA 4CERA 3SUNA 4FM1A 2P5OA 5DK5A 5FROA 1B9DA 3ZT3A 1KCFA 4O44A 1BCMA 1RDAA 1S1VA 4E3SA 1DTQA 1VSDA 3TAQA 3SNNA 4CJWA 1WAJA 3TAEA 1Z25A 3DRSA 3PX4A 1D8YA 2DY4A 4WE1A 3L2QA 1SKSA 1S6QA 3RR8A 3ZSRA 4FYDA 2WOMA 3QERA 3ZCMA 3PX0A 1JKHA 3TARA 4FJKA 1HNIA 3HJFA 4OKKA 3NF8A 3UIQA 1QSSA 4CJ4A 4CHOA 4OJRA 3V4IA 4IFVA 4C8LA 3HPOA 3SJJA 4FLVA 4CHPA 2OPPA 3VQEA 3NDKA 1NOZA 3DLHA 2P1JA 5J2NA 3IRXA 3QEWA 1T7PA 1NJYA 4RW9A 5HBMA 3ZSXA 4UQGA 4N76A 4CGHA 4DQRA 1RDBA 4C8OA 1XHZA 4JS4A 1JLQA 4OKEA 4RW8A 4FLUA 1TKZA 3OYIA 3MXIA 2HHSA 3QEPA 3OS0A 4AHCA 3SUPA 5CZ2A 2QKBA 1TAQA 5J2PA 3V9WA 1RT1A 4FJLA 3D0PA 1HNVA 1BIZA 3LPUA 3M8QA 3AVKA 3VQ5A 2XY7A 1S6PA 1ITGA 1UWBA 1JLFA 3VN5A 3F9KA 3QESA 3AVFA 2X74A 4E7KA 3V1QA 2HNZA 4ZTFA 4OLBA 1CXUA 4HCCA 4N56A 3DRPA 4DQQA 1LWEA 1I3AA 4CEDA 4CFBA 3QEIA 4FJIA 4I7FA 4FJXA 4FM0A 3LP3A 3V9XA 3VA3A 4M3XA 2HW3A 2FBYA 1X1PA 1XI1A 3LAKA 1UAXA 2DFHA 1FXXA 1RT4A 1FK9A 2YKMA 5KI6A 5HRPA 3K5NA 4KHQA 5CYMA 3ZSVA 1KVAA 3VQBA 4B9VA 2HHWA 2EHGA 2PYJA 1RT6A 1VSLA 4K8ZA 1RT5A 3T1AA 1EX4A 5J2MA 2X6SA 1L5UA 2W42A 4NCAA 3SV4A 3LANA 3VQ9A 4N41A 4CGIA 3K58A 4FM2A 2LSNA 4FLZA 4DTSA 4Z4CA 1S5JA 3CYMA 4NYNA 4E19A 3KLHA 4BDPA 4HCBA 4H4OA 4I9LA 3MEGA 2G8FA 4CFCA 5FRMA 2DFEA 1WSEA 2OPQA 3KK3A 4OVLA 4PUOA 3B6OA 1ASVA 2RF2A 3O3HA 4DSFA 1TAUA 3THVA 4DFKA 5FDLA 4CHNA 1QSLA 4B9MA 2B6AA 1NJZA 3C94A 3NH1A 4EZ9A 1MU2A 1U4BA 2XY5A 4CFDA 4E7JA 4OGEA 4Y1CA 2HNYA 2OZSA 3HO1A 5E41A 1VSKA 1WSGA 4M45A 2DTUA 3NF6A 2KZMA 4FLYA 2Z1JA 1Q9XA 4CF2A 3DI6A 4CEAA 3PX6A 4ELTA 1NK7A 3OYKA 1NK4A 3HT3A 3OJUA 3M8SA 2F8TA 3HP9A 3OVNA 2KZZA 4E1MA 3L2VA 4IKFA 3NAEA 3MXMA 2O4IA 4M3RA 1R0AA 3PUFA 3QEXA 3WNFA 2HHVA 1U45A 2HHXA 4OPJA 1A5WA 3OS1A 1TL1A 3O4QA 3M8RA 4Z4IA 2ATQA 5KGWA 1O1WA 2X6NA 1BIUA 3NBPA 1RT2A 3AVJA 2Y1IA 5J1EA 1VSHA 2D0BA 3KKRA 3AO2A 2HVIA 1KLMA 4CGDA 1TKXA 1X9WA 2XO7A 3OYCA 4B9SA 4PQUA 1LW0A 1IH7A 3NGYA 3QNNA 4J2BA 3SCXA 4AHUA 4J2EA 4O0JA 4FK4A 4KKOA 5C42A 2AJQA 3I8DA 4Z4EA 1IO2A 3DLGA 4E7IA 3ZT0A 4Q5VA 4XIUA 3T3FA 1C0TA 4GMJB 1C1BA 4J2DA 1Q8IA 1B9FA 1KFDA 2YHBA 3VQ6A 1F21A 4DTMA 3OYGA 4MFBA 4CF0A 1GOCA 3B6PA 1RDDA 5T7BA 4DLEA 2XHBA 2A1RA 3ZT1A 4E0DA 5HROA 2YNIA 4TSXA 3VQCA 5I3UA 3VQ8A 4CJ5A 3SPZA 1NK9A 1REVA 4IBNA 4KAZA 1VK0A 1ZBHA 4DFPA 4FLWA 4E1NA 2O4GA 3E01A 3QIOA 3L2WA 1RBVA 1S1TA 3OYLA 1NK6A 1S9GA 4DU3A 4NCBA 4RW7A 4HTUA 1S1UA 3TI0A 1IKVA 1YTAA 1UA1A 2BDPA 3ZSZA 4B3OA 4W5NA 1RBTA 2YV0X 1SKRA 2ZQBA 4CJVA 1QE1A 3JSMA 1L3TA 3V1RA 4NYFA 3C6TA 4CE9A 1ZBLA 3DLBA 2VG7A 4B9NA 2VG5A 4BE2A 3ZSWA 2KQ2A 2IC3A 1TKTA 2OYQA 1NJXA 3DLRA 3MXJA 1WNSA 1K6YA 4BDYA 1RNHA 2XY8A 1G15A 3AVIA 2QKKA 3KJVA 1KTQA 5C24A 1D9DA 3L2UA 1U04A 1J53A 4W5OA 4CEBA 2R7YA 3HK2A 3D45A 4NCGA 2OZMA 4M3ZA 4L8RB 3DOKA 3DOLA 1RBRA 4CEEA 3RRGA 4KHNA 2E6LA 4FK2A 4M3YA 2D5RA 4O0IA 3NE6A 4B9TA 2A1SA 4CJRA 4FJ7A 2VWKA 3ZSQA 1BI4B 3ITHA 1HPZA 2ZE2A 4CJFA 4H4MA 1CZ9A 4ID1A 4LY7A 4BACA 3CM5A 5I42A 3NF7A 4G1QA 2PY5A 3OJSA 4B9UA 2ETJA 4W5TA 4IFYA 4AHVA 1VSFA 1BQNA 3LALA 3M8PA 3V9UA 5CY4A 4CF8A 3S9HA 3ZSOA 5SZTA 3H08A 4CCHA 5HLFA 4Z4HA 1HYSA 1C0UA 3C6UA 3O3FA 4Z4FA 3RR7A 3CM6A 1JLEA 2KW4A 3JYTA 3HM9A 3TAFA 1L3VA 1S9EA 4E89A 1C6VA 1J9AA 3AO5A 4QAGA 1NOYA 1JLAA 3BDPA 1D9FA 3PO4A 2QK9A 1JXBA 3MEEA 3U6FA 1ZYQA 1N5YA 2XY6A 3HP6A 1A5VA 4DFJA 1Z26A 1HQUA 2G8UA 3C95A 3OYBA 1RTJA 3IAYA 4I2QA 1DLOA 3TWHA 2E6MA 2OPSA 2Z1IA 3ZSYA 2KTQA 4H8KA 4CJPA 4F2RA 2P51A 3AVBA 3KK1A 1LV5A 4DQPA 3I0SA 1JLCA 4O5BA 4C8MA 1W0HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKGB 5KQDA 1T03A 3SAFA 1MDUB 3V81A 3KLGA 4CF1A 3J7YP 4CJSA 4A2BA 4Z94A 3R8EA 2IGIA 2FC0A 3F9MA 2BGGA 4CEFA 2P9LA 4YDUC 4I9QA 1LWFA 3FFIA 1C1CA 1WSJA 3VQDA 1VSMA 1T05A 4LH5A 1YAGA 2H3GX 3AVLA 3CC2N 1TK8A 4CZGA 3QDKA 1XUPO 3EY1A 3CJBA 5HRRA 2B4JA 1YI2N 3NCIA 4CJEA 2UUAK 2KFNA 2YNGA 4JI5K 1ATNA 5KTQA 3AA2A 3QBXA 1G99A 3LM9A 5CZ1A 3AVGA 1HYZA 3A2FA 2HHQA 3VQPA 1NNEA 3RTVA 3TAPA 2QWQA 1O13A 4A57A 3DJCA 5C12A 1Z6RA 4JKGA 3I56N 3CPEA 4M63C 1EXQA 3HPGA 4BRQA 4CJTA 4DV5K 4O8UA 3K5OA 3SUOA 1S1WA 3FZMA 4NXMK 2G8HA 5HRNA 3PSFA 2Q3SA 3OYDA 3AA5X 1JL2A 3SV3A 2G8IA 2GBZA 3EE8A 5KPRA 3T19A 3UKRA 3P83D 4PA1A 4BQZA 4K41A 4JKEA 1CZBA 3HI0A 1X3NA 3J8AA 4DTNA 3ZX3A 3MMVA 2BTFA 3J80O 1P90A 4G9ZA 3VEXA 1IBMK 1HYVA 3C6AA 4YFUA 4FXDA 1XNRK 4PKIA 2AP1A 4F2SA 5FPEA 2NRZA 3VEZA 4PKGA 1N32K 3HOSA 5AQPA 2WFBA 1Q82O 5JS2A 5AQHA 4NLCA 4KB0A 1SUQA 2GX9A 1HPMA 4R5PA 4FVUA 1OVYA 4M41A 4FZXC 3LP2A 4KHWA 2V7YA 2HBMA 5EX5A 4BRHA 2P9NB 1FKOA 3OYEA 4LFBK 4ISFA 3VQQA 4KHSA 3P1GA 1VRTA 2Q0RA 3H46O 5GADP 1GLLO 2YKNA 1ILYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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