3N2MA

Crystal structure of plasmodium falciparum orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with 5-fluoro-6-amino-ump
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
328
structure length
328
Chain Sequence
GLVPRGSMGFKVKLEKRRNAINTCLCIGLDPDEKDIENFMKNEKENNYNNIKKNLKEKYINNVSIKKDILLKAPDNIIREEKSEEFFYFFNHFCFYIINETNKYALTFKMNFAFYIPYGSVGIDVLKNVFDYLYELNIPTILDMKINDIGNTVKNYRKFIFEYLKSDSCTVNIYMGTNMLKDICYDEEKNKYYSAFVLVKTTNPDSAIFQKNLSLDNKQAYVIMAQEALNMSSYLNLEQNNEFIGFVVGANSYDEMNYIRTYFPNCYILSPGIGAQNGDLHKTLTNGYHKSYEKILINIGRAITKNPYPQKAAQMYYDQINAILKQNM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Crystal structure of Plasmodium falciparum orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with 5-fluoro-6-amino-UMP
rcsb
source organism Plasmodium falciparum 3d7
total genus 126
structure length 328
sequence length 328
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3n2mA00
4FNTA 5LNSA 1PL9A 1QR7A 3W1AA 1OF6A 3LCIA 3W7IA 2CLIA 2ZZ7A 3MBDA 1LBLA 1NF0A 3BW2A 5U7SA 4O1CA 1ZFJA 1O5KA 3NG3A 3TFCA 4FX8A 2EGZA 1K02A 2CLOA 1RPXA 2ZA3A 3EX2A 2ZRVA 2E6FA 1I2RA 2YR1A 4E2DA 3QYQA 2VENA 5F4XA 3LLFA 3IIPA 3W73A 4JTFA 4XKYB 4OU1A 1WBJA 2RDUA 3O6DA 3P5YA 1O5XA 1JCNA 4UFHA 3W1MA 2ATMA 4WY0A 3CT7A 3KXQA 4QITA 1SO5A 5F1VA 3QMRA 5KZDA 1KBJA 1V5XA 2QCGA 5G2IA 1MZHA 2P0OA 4UTLA 1IXNA 3TSBA 4NXKA 3WJZA 4GRSA 1G4EA 3P60A 3W7QA 2JKEA 3B06A 1NFBA 3O05A 4MY9A 2QCDA 4R34A 1TTIA 2FJKA 2Y63A 1GT8A 1T99A 1TCDA 3W70A 4UFIA 4O10A 4ZQRA 3NNTA 3EXTA 1VC4A 3WJWA 3HJZA 2C15A 4ML9A 1EB3A 3WJXA 3MHGA 2Z6JA 4RX0A 5BOOA 4IMCA 4K38A 5C6MA 1HTIA 4GWEA 3W9ZA 2FPTA 3QM3A 3UPWA 2ZFAA 2AAMA 3L21A 4NU7A 2Q3RA 1N8FA 1OVDA 5I3JA 1X8FA 3GYEA 4UUIA 1AMKA 1FCBA 5LNWA 3THAA 2H6RA 1H7NA 2J9XA 3MHUA 3Q58A 2AGKA 1P4CA 3M44A 2ALDA 1R2SA 2Y6ZA 3W2MA 3MI3A 5LNUA 2QCLA 3BO9A 1LRTA 3UD6A 1RZMA 2J27A 1SO4A 3B0UX 1LROA 5CPLA 2NV2A 5KITA 4MVAA 4PH6A 3MMTA 2C0AA 1H63A 2ZRWA 5KINA 1O60A 3L67A 4JN6A 3L68A 1YDNA 2CWNA 1JRBA 1QFEA 1L6WA 1YLVA 3ANYA 1U5JA 3N19B 2ZZ4A 4DF0A 3CTLA 3GAYA 4AWUA 3QJAA 3P67A 2EPHA 1FCUA 2YW3A 4E2BA 2ZRXA 1VYRA 4ZVJA 1AK5A 4BF9A 2PC4A 3NOEA 5HNRA 4IX2A 1EIXA 1OYCA 4NXSA 4R33A 2ZQ0A 1W31A 4LW7A 4MUZA 3NQGA 3JS3A 1AW2A 4I9AA 3TAKA 4JYFA 2OT0A 2V8ZA 3A21A 1KM6A 2C1HA 3GDLA 1J5TA 2JKAA 1P5BA 3G1AA 3UY8A 1H7RA 3WK3A 2FPVA 5IM51 3W1XA 1HUVA 4PEKA 4Z1DA 3WFAA 1ME7A 5HWJA 3M41A 2HSAA 2BZNA 3PG9A 1PE1A 2AQWA 2A4AA 1H51A 4JX5A 3L0NA 1KM3A 1ADOA 2E5CA 5AC8A 4JYDA 3KVMA 1F6KA 1DHPA 4ADUA 1GEQA 2YX0A 2CU0A 3EXSA 1CW2A 3NDOA 4AHOA 1R2RA 2Z6IA 4IGHA 5AHMA 4OBTA 1VPXA 5HULA 4JTHA 3R2GA 4RZ4A 3LCGA 1SFJA 3MP5A 3PB0A 3W1LA 1TPC1 3TW6A 3HOJA 3FFSA 3G0UA 1S5WA 3L5AA 5FF7A 1ZCOA 3QW4B 4DPPA 3A23A 4CNNA 5MHBA 4HSOA 1WBHA 3LM7A 4LUJA 4LVBA 1W8SA 3EWWA 3PBYA 4O0ZA 1DOSA 2QCEA 5AHNA 3BW3A 3N9SA 1F73A 1O95A 1KTNA 4RZ6A 4LVGA 2EHHA 3I7SA 3O8AA 2ZA1A 1GWJA 3E0IA 1QPNA 2X16A 2E09A 4UTWC 1EUNA 5CGQA 3W2LA 1FX6A 2WSYA 1LRNA 2ZDRA 2YGYA 2TRSA 5BW6A 2OCZA 3RU6A 4JGDA 4O54A 3QSTA 2VOMA 1XBXA 3SR7A 1Q45A 2CZ5A 3NAVA 3W1QA 4FX7A 3M47A 4JDYA 3DBPA 1ICSA 4FX6M 3F1QA 3QRHA 4FF7A 4LVFA 3OBKA 4Y96A 1DJNA 3EWUA 4A2SA 4LS1A 2DJLA 3P84A 3LHTA 1TB3A 3B04A 4O1BA 2YDAA 1WDWA 4ZL1A 3GR7A 3P80A 2YYTA 3ABOA 4BWLC 3W7LA 3W1TA 4MLRA 1TPVA 2YW4A 5F2IA 4WXYA 2JGQA 1CI1A 5FEWA 1OK6A 4AVFA 4K8HA 1FBAA 3A5FA 3GDTA 1TPEA 4MZYA 5TQLA 2Z0IA 4UFLA 2VFIA 3SW6A 3SGUA 5AOUA 4QSHA 3TA6A 2PRLA 4JTKA 1AL7A 3BLIA 1D3HA 4QIUA 5C54A 1E51A 5CZJA 1XBZA 1SSDA 1O94A 3KHJA 2JBMA 1HL2A 2W6RA 1VR6A 4AAJA 5FI8A 1ZAJA 1XUUA 1MEHA 3WJYA 2NV1A 1TSIA 3LGEA 1PIIA 4IJBA 1LDCA 2X1SA 3IGSA 3RLVA 4MFDA 3TSMA 4JTEA 4OHQA 5L9FA 1FDZA 2QCHA 3W71A 3PUOA 3RNDA 1W37A 3GXTA 4YMZA 5EL1A 4MJMA 1F2JA 4PFMA 5F4SA 2I9EA 3P5ZA 4EF9A 5DBTA 5EA9A 3TFXA 3PUEA 2QEZA 3M5VA 4P2VA 1LOSA 3DHDA 5HR6A 3L65A 2ISWA 1UB3A 1QCWA 3G0XA 1QPOA 1VHCA 3GVGA 3LB0A 2YCEA 2NXGA 1JUEA 1X1OA 3NVTA 3PVFA 3C61A 2V2CA 4O1AA 1M7OA 4ZQNA 4Z1CA 4ICNA 3QC3A 4ZQOA 2WJZA 2ZTKA 4TU1A 1SZEA 3G8EA 3I68A 1G67A 3HGSA 4GUIA 3W1UA 2B7OA 2NX1A 3TJXA 3S5NA 4PL2A 3USBA 1I2OA 4L4MA 5FF2A 1SR9A 4GBUA 3DGRA 1TJRA 3EWBX 3DFSA 3ZWTA 3R12A 3MI6A 1S5TA 3W2JA 3W75A 3W7RA 3L5MA 3SGZA 3STEA 2QR6A 4IPIA 4FHAA 3CU2A 3NQAA 5CPMA 3GXPA 2QAFA 2X1RA 4K6AA 3KVKA 2A7NA 3CHVA 2DZVA 2BWGA 4OWGA 5I3GA 1VRDA 2Y7GA 3MP3A 1VLWA 1XFBA 2EF9A 2PRMA 3S5ZA 4JEQA 4QJ1A 2B7NA 2Y89A 3BG3A 1VCGA 4JTJA 3BPWA 3N14A 2R8WA 3VE9A 2CZEA 2GJLA 4K8EA 1H1ZA 3W2KA 3EB2A 3QEZA 4O4WA 3IGXA 4N4QA 4AF0B 1L2UA 4WOQA 2A7PA 2FB3A 3GX9A 2ZZ5A 3T44A 3E9AA 1WAUA 1QAPA 2ZZ6A 1SW7A 3M9YA 2QDHA 2JK2A 4G1KA 1GTEA 5FF0A 2FDSA 4WUIA 1W56A 4N6FA 3BARA 4OGZA 4RV8A 5AB3A 3L0GA 3TUUA 2ABBA 1GG0A 3HPSA 4FEZA 4RKAA 3W7OA 4FXSA 1T8XA 2ISSA 4O53A 2H8ZA 1K8ZA 2A1YA 4M5PA 1RR2A 3H54A 1BKSA 2GPTA 2E6AA 4GC4A 1JUKA 5D2TA 3UZ5A 1JR1A 2VFFA 4I7UA 4S2BA 2R94A 3N9RA 1XL9A 1VYSX 2NUXA 4DBEA 1DVJA 3SJ3A 3BG9A 4OQVA 2VFHA 2A7RA 3GLCA 1IIGA 1XDMA 6ALDA 1KM0A 1TIMA 1SQ7A 2RFGA 3N34A 4AMAA 3TC7A 4N6EA 4PC8A 1DQWA 3B0PA 5D32A 5D30A 3HGRA 1V7YA 2VFGA 2XN2A 5FEZA 1JCYA 4K37A 5KSWA 1OFPA 3TMLA 3UZJA 2J88A 1D9EA 2TSYA 4K7VA 3MW7A 3OA3A 5AN7A 3TXZA 2NXIA 4FXRA 3W2NA 3RLUA 2GVLA 3W88A 2DORA 3VNDA 2QJGA 2EKCA 2A21A 4X22A 3LTYA 4UTWA 3C4UA 1XUZA 4IMEA 2GJNA 3M6YA 4LS0A 4JTUA 1M5WA 2DZXA 1TTQA 2C13A 1YADA 3NQDA 3Q2DA 3IV3A 5CPOA 5AYXA 2C3ZA 1OX5A 2VFDA 1OFBA 1PCKA 2A6LA 3SECA 4MYXA 3GB6A 1Y0EA 4LUIA 4XWUA 2Y62A 1IXOA 2EAWA 3HG4A 3OVPA 2V0TA 1UJPA 4L4LA 2V30A 2R14A 1K03A 3QMSA 3LBCA 4WX2A 1BEUA 3P7YA 4R53A 1FDJA 5A8GA 5D37A 3R8RA 2NX3A 1MEWA 2CFFA 2WOQA 3UWZA 2GOUA 2B4GA 3NM3A 1VGAA 1Z48A 4WQ6A 4M6VA 4JTTA 4ZQPA 1WX0A 2FB2A 4WZHA 2FQIA 2QCDB 3FOKA 3N3MA 3KRZA 4QISA 4OT7A 4JY9A 1HFBA 3C3NA 2Q8ZA 4MOZA 2BSLA 5BMWA 4BI5A 3FLUA 1WXJA 5G1YA 3WK1A 3HO8A 3W7DA 3BVJA 5D2YA 3ABSA 4ORIA 3ZR4A 2V5LA 4LV9A 3HMJG 3TKFA 1LCOA 1Q6LA 2E68A 3TJLA 3TDFA 5AHIA 5FESA 5KMYA 1LOQA 4C1KA 2X30A 4EIVA 2JGYA 2QCMA 3UYCA 4UMBA 1KA9F 2J9YA 3WK0A 1Z41A 1TTJA 4XKYA 1GVQA 1YTKA 3W72A 3FKKA 5BMXA 1TJPA 1N7KA 3CWOX 5KTLA 2C6QA 3ZWSA 1JCXA 2WKJA 4UNLA 1LRQA 3HGJA 2KZHA 3LXCA 5K9CA 1VCFA 1GYNA 3O16A 5F2GA 1IF2A 1D3GA 3G18A 3TQKA 2QCFA 1KM1A 4DBDA 4HIBA 4WOZA 3I7QA 4OV4A 3T7VA 5H91A 1QDSA 1PHWA 3S1UA 3NPVA 5DXYA 3T55A 3TK7A 3NZ1A 4Z1BA 3YPIA 3M16A 1DV7A 1A5CA 3B0VC 3IVUA 2H8XA 4MPQA 1TPDA 4ZQMA 1G4PA 3NQCA 5AYZA 4IWWA 3LBMA 2E5BA 3GDMA 4TMBA 3OHIA 4QAIA 3UY7A 4YXGA 4AEOA 4Y8FA 3B05A 4ONVA 1EX5A 1WV2A 3MYOA 3O06A 3PF3A 1KLYA 2H3BA 4RZ5A 5F2MA 5K3VA 2NWRA 2E6DA 3EWZA 2QF7A 5DN1A 3L66A 1I2PA 3HPZA 4ZMGA 3GIYA 4GUFA 1TPUA 3HGOA 5AYYA 5E0KA 4NX5A 4FNQA 2QJHA 4U28A 3C0JA 3W1NA 5H2ZA 1TPH1 4UTTC 2A85A 1OG0A 2CZFA 3W7MA 4DXVA 2V5BA 4KFPA 4HNUA 3SIZA 1OYBA 1GZGA 3H53A 4YCPA 1TV7A 4O0KA 1TPFA 3LV5A 3HPXA 3LDVA 1FQ0A 3ATZA 4IX0A 1ALDA 3PBWA 1TRDA 1SFLA 4UMCA 3W3OA 3W7GA 2H3DA 2QCNA 2QKFA 3UXDA 5K2ZA 1G7VA 4O19A 1QO5A 4FIQA 5HMSA 3W83A 1GQNA 5BRBA 1W5NA 3TC6A 2WNZA 4J9JA 3W7EA 3CIXA 3OEXA 3NA8A 4LTSA 2HTMA 4OE7A 2A5HA 3TROA 4KFNA 4MKNA 3G8RA 2J24A 3DAQA 2VXNA 1VYPX 4CCEA 1QOQA 5AHEA 4UTIA 3QSRA 5EMUA 3PSVA 3E02A 2ZZ3A 4NZJA 3DFOA 2E5DA 2GVJA 2I1OA 5I3HA 1A50A 1KFCA 1FXQA 1ICPA 3GKFA 5DELA 3MJYA 4NT0A 2Y7DA 1EUAA 4PL1A 1OX4B 3DFPA 1YTEA 4UMAA 4OV9A 1FWNA 3CB8A 1LLZA 5BNKA 4FNSA 5EYWA 1TREA 3EEGA 4RJEA 3S0CA 4MLJA 1P0NA 2VEKA 1TYGA 4M6PA 4UFJA 4ZZ9A 5D03A 1Q3NA 2QUUA 2G95A 4PTNA 1FWRA 3F4NA 1FDYA 1QNVA 1KV5A 5K7JA 1KLZA 2DZPA 3NPUA 1K3UA 1FWTA 4N9BA 4IXXA 1G7UA 3SY5A 1YYAA 1X1ZA 1L6SA 3PB2A 1B4KA 3HQ1A 1C8VA 5DCBA 1YXCA 1PHQA 4XZ9A 4UR7A 5DCDA 4XQ6A 4LU0A 3D0CA 4M19A 3M5XA 4K36A 5LNVA 1ONRA 7TIMA 2F7FA 1KFKA 2LLEA 1NSJA 2PCQA 4N9EA 4HN4A 3LCLA 3HG2A 5DY2A 3R5EA 1G6CA 4RXGA 3TV8A 3DU0A 1YPIA 4DO6A 3UWYA 1OFOA 3PM6A 4AXKA 3P82A 3EX3A 5AFDA 4QNEA 3GNNA 1YXYA 5I3KA 3O07A 3W85A 1W0MA 1YTDA 3QPYA 3S9YA 1JCMP 2V81A 5FEXA 3N73A 3NO5A 3NZRA 4A2RA 4X9SA 4KFOA 1WQ5A 4NNBA 5G5IA 1R46A 2UV8G 5CZTA 5F4WA 5LKYA 3G0SA 1Q6QA 2G97A 2A0NA 3SI9A 5HUOA 5CSRA 3LTPA 3MYPA 2HS8A 3GR8A 3KAOA 1W54A 1F76A 2Z2UA 1DJQA 2Q3OA 4GFSA 1YXDA 3LRLA 1OF8A 1FCQA 2JKPA 1ME8A 1HO1A 3M0ZA 4LNYA 5K4ZA 1TQXA 2HMCA 2ZRZA 3DZ1A 4YCOA 1N55A 4E0CA 1K8YA 3NQEA 3TIMA 4CNOA 3N2XA 4MZ1A 2Y88A 4RK8A 3LRMA 2FIQA 4MZ8A 1CX9A 4DEFA 2X1TA 2V2HA 2YSWA 1WOAA 3TCEA 3QQ0A 3W6YA 1RVGA 2W0UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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