3N4TA

Apo aph(2")-iva form i
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
297
structure length
297
Chain Sequence
MRTYTFDQVEKAIEQLYPDFTINTIEISGEGNDCIAYEINRDFIFKFPKHSRGSTNLFNEVNILKRIHNKLPLPIPEVVFTGMPSETYQMSFAGFTKIKGVPLTPLLLNNLPKQSQNQAAKDLARFLSELHSINISGFKSNLVLDFREKINEDNKKIKKLLSRELKGPQMKKVDDFYRDILENEIYFKYYPCLIHNDFSSDHILFDTEKNTICGIIDFGDAAISDPDNDFISLMEDDEEYGMEFVSKILNHYKHKDIPTVLEKYRMKEKYWSFEKIIYGKEYGYMDWYEEGLNEIRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Unknown function
molecule keywords APH(2'')-Id
publication title Crystal structure and kinetic mechanism of aminoglycoside phosphotransferase-2''-IVa.
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
total genus 106
structure length 297
sequence length 297
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3n4tA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3n4tA02
4QMOA 4DC2A 4DH7A 4KBAA 3FY0A 3HV4A 3TCPA 2OXXA 2UW7A 4FL1A 3RTPA 4YHTA 3ZLXA 3TV4A 4IDVA 4Q2AA 5F95A 1P4OA 3QTXA 4Y5HA 3U87A 1JWHA 2HXLA 2YM8A 5HCYA 4NKSA 1DM2A 4YPSA 2BAKA 2W1DA 3C4FA 4PL5A 4BDJA 4DT8A 3DJ7A 2CKPA 2QOFA 3DKFA 3UOKA 1FOTA 3WZDA 5BVFA 3U9CA 5I5ZA 1MRUA 3UOHA 1DI8A 2X1NA 3LCKA 3QL8A 3A99A 4FSZA 5BYLA 2QI8A 4BCMA 4DFLA 2WELA 3FJQE 3CKXA 3V5QA 3UE4A 3UZTA 4FTTA 3R1NA 1OI9A 3QTSA 2X39A 3UP2A 2Y4IB 4WNPA 4CG8A 3CCNA 4YJOA 5JGDA 3CY3A 2XP2A 4E4NA 3N4TA 3QQJA 4NW5A 4IVAA 1VZOA 4QMPA 4AQCA 5J8IA 1ZMWA 3DT1A 4E8AA 5J9YA 1YOMA 1ZYDA 1H27A 1TQIA 4BF2A 1YHWA 4FT9A 1J1BA 3FI8A 4H05A 4F1OA 5AP7A 2OH4A 3SXSA 1XH6A 3FL5A 4QYGA 3F5GA 2FYSA 4FTJA 5DOSA 5EQYA 4EHEA 3MI9A 1YOJA 4LV8A 3PZEA 1M2PA 3VC4A 2PVJA 5D10A 3SOAA 1WVXA 5TT7A 2QLQA 3OG7A 4I24A 5DVRA 5IUIA 4G6NA 4TWNA 4NM3A 1CKJA 1DAYA 1URWA 2IZTA 4H3BA 4RX9A 5AV3A 3UODA 4PL3A 5CALA 4IX4A 4P7EA 1U59A 2BIYA 2B4SB 2QKWB 2J0JA 4OTFA 3RPOA 4NL0A 4TYHB 1H24A 1OL2A 3BPRA 3REPA 3V8TA 1R0EA 5IA4A 4Q9ZA 4IANA 2WHBA 4IX5A 3TNWA 5FUTA 2YM7A 4LGGA 3I5NA 5IZFA 3AD5A 5KX8A 2F9GA 2F4JA 2UW8A 2VWWA 3ZLWA 3JS2A 3EL7A 4RC2A 4S31A 4MQ2A 3VBVA 4RA4A 1ZZLA 1U46A 3GI3A 1UV5A 5CU3A 3BU6A 5DLSA 5L2WA 5GNKA 1WBVA 3FZ1A 2QOIA 4FTAA 3FMNA 1QPCA 5FTGA 3VJNA 5IA2A 2QNJA 4XHKB 5AV2A 2RFSA 3KN5A 3S2PA 4K77A 2YWPA 4N4SA 3UZPA 4E6QA 2OBJA 5CSPA 5EOBA 3QTRA 1ZLTA 3COKA 4RJ7A 4RWLA 4YNOA 3WYXA 3FXXA 4ASZA 3R01A 2C0IA 3TG1A 3ODZX 5EK7A 3P0MA 5M4IA 3MY5A 1OL6A 4R7IA 4D4YA 1GY3A 5EDRA 3MFRA 1K3AA 2PSQA 2A19B 4AOTA 2EB3A 4KBCA 4MYGA 3CGOA 2F7ZE 3UVQA 4AG8A 4X0MA 3WE8A 3MA6A 1YXTA 5JK3A 1UKIA 4JIKA 1ZOHA 2VTJA 3FEGA 4PUZA 4ZY4A 3ACJA 2C3LA 5HNGA 5IA5A 3R71A 4DCAA 4BICA 4ZJJA 3H9OA 3JVRA 4ACDA 5JGAA 2H96A 5GIPE 3L9PA 2CGUA 3U4WA 3V5PA 2ITVA 3W2SA 5AUXA 4QMYA 2J4ZA 5CEMA 5CSWA 4M97A 4NU1A 1TKIA 2WMAA 4DGMA 1ZOGA 2ERZE 2W06A 2Z02A 5E8ZA 2QONA 3F88A 3TIZA 3R7UA 4EK6A 4EZ5A 4CKRA 3EN6A 1XH9A 2QO9A 5I4NA 2G15A 3JY9A 3TDWA 3MYGA 4X2NA 3A8WA 1XBBA 4FE2A 3CY2A 2WZJA 3AQVA 3KCKA 2WMUA 3MY1A 3TUDA 4BR3A 5EDQA 3LFNA 4KKHA 4U44A 4CZTA 4J1RA 3OTUA 4JS8A 5JRSA 4L52A 2X4ZA 3COIA 3TM0A 4Y8DA 3E93A 3GU6A 1YDTE 2X9FA 1R0PA 5HIBA 5CASA 3GCSA 3COMA 4IH8A 5JH6A 4CQEA 4BHZA 1Q41A 1UWHA 3AC5A 2QLUA 1WBSA 3DLZA 3EZVA 2C0TA 4IAIA 4L45A 3OZ6A 1RE8A 3EQFA 3Q9YA 2C6TA 3LFFA 3BHTA 1IAHA 2PZ5A 4H39A 4RWJA 4X3FB 5EG3A 3DNEA 3ET7A 5FDPA 3E5AA 4C34A 5KUPA 2FUMA 2PY3A 1K2PA 2VTRA 2PVRA 3VIDA 5HICA 3TJCA 4C3PA 5LMBA 2IVVA 3R9OA 3NUXA 4FV9A 4AU8A 4IZ7A 3OBGA 3UNKA 4LRJA 4OR5A 1OB3A 3OTVA 2BFYA 3UJGA 3VUMA 4CT1A 4EJNA 3KULA 3QTQA 5CEQA 1WMKA 2HELA 1Q24A 2Z7QA 5CSVA 3DCVA 3I6UA 5CENA 4L9IA 2ITWA 1IR3A 4PDOA 3PE2A 4EOOA 4EONA 3B8RA 4QYFA 4W4XA 2W5AA 4I0SA 2XYUA 4GVAA 2CNVA 4G16A 4MXZA 1W83A 2X2MA 3NYNA 2F57A 4G6OA 2GS2A 4R3CA 5GINE 4S2ZA 2DYLA 3OROA 5KKRC 3F66A 2X9EA 1V0OA 2WQOA 1TQPA 2VWBA 4CV9A 2Z7SA 3IW7A 4FSYA 4O82A 4YZ9A 2BKZA 3EKNA 4LUDA 4XJ0A 3EZRA 4JDJA 2OFVA 4EHVA 3ZXTA 2FSOX 4L68A 4QT1A 2C6KA 3WIGA 2RG6A 4G3DA 3WIKA 4X7QA 5CS6A 3D7TB 3TKIA 3DXNA 4P4CA 4W4WA 3BHHA 4D9TA 2WIPA 4ERKA 1JSUA 3GU4A 4DFUA 4E6DA 2C4GA 1ZMUA 4E4LA 3MS9A 3QUDA 3LM0A 3PXFA 4JVGA 4QP7A 5AUUA 2BR1A 4FGRA 2F49A 2HW6A 4YP8A 3I6WA 3ROCA 3PG3A 4XG3A 4BDKA 3SHEA 3RM6A 1Q62A 3I1AA 2C30A 3MV5A 4QMWA 2ZVAA 4RIXB 2PE1A 3E7OA 4IC8A 3QHRA 4DG3E 2XK9A 5ETFA 1A06A 4BCNA 5J7HA 4YU2A 4TWPA 3JVSA 2B52A 4RZVA 2PZYA 3RWPA 2GTNA 3QZFA 2HZIA 4HGSA 5LCJA 2DS1A 2B0QA 3EKKA 3LMIA 5E7RA 3UYTA 5JRQA 5LOHA 4WUAA 2FSMX 4IE9A 3QXPA 4O21A 4YO4A 4YJSA 4F1MA 1OZ1A 2B9FA 2PZRA 1DS5A 2W96B 4BCGA 4MHAA 2IN6A 2X2LA 4ZZOA 2VTOA 3SRVB 5DWRA 3I7BA 2XUUA 2SRCA 3C4EA 4D5KA 3TI1A 4B99A 1CMKE 4W8EA 1SM2A 4H1MA 3FXZA 4AW5A 2ETKA 5AWMA 3HP2A 1U54A 2WKMA 2JKMA 3VHKA 5CEIA 4XS2A 4KNBA 4FZ6A 4LI5A 3PVUA 4OTGA 4E20A 5KMLA 2WMVA 4OTWA 4YSJA 4H36A 4QQ5A 3T9TA 3AMAA 3E7VA 3PIXA 3OD6X 4MBLA 3NNVA 1PHKA 1VYWA 3VBQA 1PXIA 2R3NA 4XP0A 4B8MA 4DG0E 4EUTA 4EOKA 3OEZA 3UQFA 4KD1A 4I5PA 4LRMA 3KCFA 2EWAA 3AD6A 3F3UA 2J0LA 2OW3A 5ANDA 3AT4A 4TPTA 1J7UA 3FQEA 3IW6A 3NYXA 5A6OA 2VD5A 3PXYA 5E9EA 2YISA 5EM5A 2WNTA 3TZ8A 4IWOA 4TNBA 4RLLA 3KC3A 4DF3A 1TQMA 4TYEA 3WBLA 4FIFA 2WMRA 2ITTA 3FL4A 2PHKA 3IGGA 4GW8A 4RX7A 3SW4A 5FP5A 4RX8A 5HTBA 3VUDA 3RI1A 4XG8A 3GBZA 3BWJA 1DAWA 1OKZA 4RFYA 5AADA 3Q4UA 5IQHA 4RIOA 2C6OA 2WQMA 3QZGA 2ZM1A 3W2CA 4U80A 1H8FA 2XM8A 4K18A 4ANQA 4BDDA 3EMGA 3QGYA 4IVDA 3QALE 2IZSA 3PIZA 3Q9WA 2CN5A 4BY9E 1CM8A 4F09A 5FQDC 3CPBA 5CT0A 5AM6A 3F7ZA 5IMXA 4PV0A 5DT3A 3ZUVA 3OWPA 4LQMA 5J1WA 3QHWA 4JQEA 4FVQA 2JAVA 3ZM4A 3CXWA 2OICA 3FI4A 4FKVA 5EI2A 1HCKA 3F3VA 4O91A 2X81A 4ACCA 3ORNA 2Q0BA 1OIQA 4FMQA 5F1ZA 1STCE 4BDCA 3GCVA 3R63A 1JBPE 2CN8A 3HAMA 3BEAA 2OJFE 3PVGA 4X2KA 3QCQA 1Q97A 3PA5A 3V3VA 1T46A 3BZ3A 4YJQA 2CJMA 4KRDA 3MA3A 5LVOA 3TKUA 4QTDA 1CTPE 5D41A 1LR4A 2OIDA 5J9ZA 2ONLA 4NW6A 4J7BA 4P5ZA 2W1EA 3EFJA 4YGAA 4BTFA 3MH2A 3NVMB 4PDPA 4E5WA 2BZJA 4EH3A 1OGUA 3V8SA 5GJGA 4CFWA 2GTMA 3R2BA 4AW1A 5M57A 2QURA 2QVSE 3F3WA 4U98A 4CG9A 3NYOA 3PLSA 2W4KA 4PMMA 3LIJA 5IEVA 3C9WA 1FINA 4EHGA 5L6WL 2I6LA 4K2RA 4PWNA 2W05A 2DUVA 1FMKA 2YCFA 3DBDA 3W18A 1WBWA 4IZ5A 3HMIA 3ZZWA 2GHMA 2OWBA 5J9LA 3CJGA 2VGPA 2BCJA 3G15A 4C02A 2YM6A 1GNGA 3CLYA 3VS1A 2X2KA 3A7FA 3M1SA 3WOWA 5BYYA 1SVEA 2OG8A 3I4BA 3EQCA 4CMTA 3RK9A 1UVRA 3NCZA 1J91A 3Q53A 4L43A 4RC3A 1SNXA 3DLSA 3Q5IA 1PKGA 4O0SA 2XNPA 4IZAA 2J51A 2OIBA 2HIWA 2WTJA 1JOWB 4I21A 2YCRA 1OL7A 5CNNA 2GFCA 3QAME 5BVEA 4A7CA 4WBOA 5L2IA 3CKWA 5FXRA 4O2ZA 2H34A 5HBHA 1A9UA 4BDFA 4RLKA 3HEGA 4F6SA 3ZEWA 2YITA 1QL6A 1UNLA 3UNZA 2WQNA 4O0RA 1XH4A 3OVVA 4IBMA 4MBJA 4XG6A 3VUGA 4YJVA 2J5FA 2HYYA 5J95A 4CMOA 3R2YA 3RCDA 4AAAA 3KXMA 3VW8A 4TYHA 5L2SA 5ANJA 2PUIA 5HG9A 3T8OA 1AD5A 3QCYA 4YHJA 3SAYA 3U6JA 3RVGA 3O96A 4HW7A 5KHXA 1Q99A 2GS6A 4FV3A 3BE2A 5L6OA 3NUAA 1KE7A 1QMZA 3KK9A 4C4EA 4OTRA 3KMWA 1OM1A 5LARA 3QD2B 2GNIA 3GT8A 4AGUA 2PVKA 4XBRA 3QD3A 4C58A 4ITJA 2HW7A 4U42A 4RQVA 3RK5A 5FG8A 3O17A 2JKOA 4FICA 3UVRA 4GEOA 5EQPA 3RMFA 3WYYA 5LVMA 1YWVA 4CZUA 4BKJA 2VTNA 2CNUA 3IDBA 2A27A 2XIZA 3ZFYA 4F08A 1WAKA 2C5OA 3FZOA 1YDSE 2JFLA 3CQEA 2QO2A 4GSBA 4N6YA 5C8MA 1FMOE 1M52A 5H8EA 2V7OA 5FEDA 1YW2A 4HVIA 4F1TA 4RMZA 3KULB 5FXQA 3UO5A 1H28A 3FHIA 5AA9A 3L8VA 3QKLA 5C9CA 4FNYA 3L8XA 2GS7A 5E91A 3EFKA 1G8SA 5EI6A 4YR8A 4Q9SA 3TN8A 4DFYA 4E1ZA 5EHLA 4EQUA 5AP1A 2YN8A 3FKLA 3BHYA 4QTBA 2BRGA 3W32A 3NLBA 3W0PA 2X4FA 4FV0A 2RL5A 3BYMA 2H8HA 2NP8A 4IVBA 4XV2A 4TTHB 3VNTA 4GFMA 3M11A 3OW4A 4YNEA 3ZZEA 3E3BX 2YIXA 2XKDA 4JRVA 5A54A 5T68A 2ITPA 2OF2A 2XIKA 5E90A 4CFNA 4FKQA 2I1MA 3C13A 3MESA 4IJPA 3CPCA 4XG9A 3OMVA 3S3IA 3BIZA 3DAKA 4GCJA 1UWJA 1Q8UA 2ZV2A 5KKRB 1XQZA 3ZO1A 3ZSIA 5DT0A 2IVTA 1YXXA 1OIUA 5EYKA 5EYCA 5H9BA 4CKIA 4ITHA 3QF9A 4EH6A 1SYKA 4EOLA 3CSVA 3G6HA 3GOKA 5DEWA 5EOLA 5I9UA 4DTKA 4HZSA 3EFWA 3G0EA 4U3YA 4C3RA 4IX6A 5EHYA 3FMLA 2IJMA 4ORKA 3FZPA 4I4EA 5KZIA 4EK3A 4B6LA 4YMJA 1UU3A 3L9NA 1OL5A 4ZLOA 1E1VA 2ZDTA 3FMJA 3LFEA 3PY0A 4G3CA 3SVVA 5M44A 3HA6A 5EFQA 4FKUA 4QMZA 3CGFA 2JDOA 4M8TA 3UPXA 4O83A 4G6LA 3TKHA 4AFEA 3P5KA 5BMMA 2E9OA 2WU6A 2XBAA 4UYNA 4HNIA 4NK9A 2W17A 3EQDA 2QOCA 2R3RA 1WBTA 3HGKA 3P4KA 3ID6C 3LFBA 3A7GA 3PVWA 4FG7A 4NT4A 4XV3A 3WARA 4BTJA 4DE4A 3EN7A 4G3EA 4LGHA 4ZZNA 4IADA 3EYGA 4PMTA 2B9JA 3KXHA 3EL8A 5DR9A 5H8GA 4ZY5A 3TWJA 2WTVA 3A7JA 4YC6A 3RKBA 3DPKA 4ENYA 2IZUA 4HYSA 3PSBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CEK A;  3RPV A;  4F0F A;  3F69 A;  4G9C A;  4EK4 A;  4RSS A;  4FL3 A;  4A07 A;  4JR3 A;  3MY0 A;  5DR2 A;  3NUU A;  5D7A A;  5C8N A;  4QTC A;  5LVP A;  2XF0 A;  4FKJ A;  4ALV A;  4FIJ A;  5M4F A;  3VF9 A;  4R7B A;  5F94 A;  3W0O A;  3QZH A;  3FC1 X;  3MVL A;  3VVH A;  4HVG A;  4EOI A;  1JVP P;  4TYI A;  4DCE A;  3TV6 A;  2WEV A;  3Q2M A;  3PIY A;  3GCQ A;  1BL6 A;  5HI2 A;  5C1Q B;  1OPK A;  3R22 A;  2YCS A;  4AN9 A;  2PML X;  1NXK A;  4ACM A;  4CFF A;  1AQ1 A;  4H3P A;  3WF7 A;  2ITX A;  2DQ7 X;  4BBM A;  4WRS A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4QMO A;  4DC2 A;  4DH7 A;  4KBA A;  3FY0 A;  3HV4 A;  3TCP A;  2OXX A;  2UW7 A;  4FL1 A;  3RTP A;  4YHT A;  3ZLX A;  3TV4 A;  4IDV A;  4Q2A A;  5F95 A;  1P4O A;  3QTX A;  4Y5H A;  3U87 A;  1JWH A;  2HXL A;  2YM8 A;  5HCY A;  4NKS A;  1DM2 A;  4YPS A;  2BAK A;  2W1D A;  3C4F A;  4PL5 A;  4BDJ A;  4DT8 A;  3DJ7 A;  2CKP A;  2QOF A;  3DKF A;  3UOK A;  1FOT A;  3WZD A;  5BVF A;  3U9C A;  5I5Z A;  1MRU A;  3UOH A;  1DI8 A;  2X1N A;  3LCK A;  3QL8 A;  3A99 A;  4FSZ A;  5BYL A;  2QI8 A;  4BCM A;  4DFL A;  2WEL A;  3FJQ E;  3CKX A;  3V5Q A;  3UE4 A;  3UZT A;  4FTT A;  3R1N A;  1OI9 A;  3QTS A;  2X39 A;  3UP2 A;  2Y4I B;  4WNP A;  4CG8 A;  3CCN A;  4YJO A;  5JGD A;  3CY3 A;  2XP2 A;  4E4N A;  3N4T A;  3QQJ A;  4NW5 A;  4IVA A;  1VZO A;  4QMP A;  4AQC A;  5J8I A;  1ZMW A;  3DT1 A;  4AXF A;  4E8A A;  5J9Y A;  1YOM A;  1ZYD A;  1H27 A;  1TQI A;  4BF2 A;  1YHW A;  4FT9 A;  1J1B A;  3FI8 A;  4H05 A;  4F1O A;  5AP7 A;  2OH4 A;  3SXS A;  1XH6 A;  3FL5 A;  4QYG A;  3F5G A;  2FYS A;  4FTJ A;  5DOS A;  5EQY A; 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 4OBO A;  5B2L A;  5CF6 A;  1OMW A;  2IVS A;  3N4V A;  4ZK5 A;  1UNG A;  3POO A;  4R5Y A;  4MNE B;  4FSQ A;  1F5Q A;  4TY1 A;  3RAK A;  3A62 A;  4XP3 A;  3V01 A;  5EDP A;  4KAB A;  4GU9 A;  4LMU A;  4AW2 A;  4FKG A;  4FOD A;  5E8X A;  2JIU A;  4IWQ A;  3UIU A;  3UVP A;  1OUY A;  3C5U A;  3CE3 A;  2VRX A;  4FNX A;  4AA5 A;  4NWM A;  1JST A;  4E4M A;  5ICP A;  2Z8C A;  2R7I A;  2W1Z A;  3Q52 A;  4RIX A;  5E8S A;  4BBF A;  1KOA A;  2VNY A;  2YIW A;  2P2I A;  1YOL A;  1ZXE A;  2O8Y A;  1QPD A;  3FLQ A;  3P86 A;  3ZBX A;  2BDW A;  3ALO A;  3CEK A;  3RPV A;  4F0F A;  3F69 A;  4G9C A;  4EK4 A;  4RSS A;  4FL3 A;  4A07 A;  4JR3 A;  3MY0 A;  5DR2 A;  3NUU A;  5D7A A;  5C8N A;  4QTC A;  5LVP A;  2XF0 A;  4FKJ A;  4ALV A;  4FIJ A;  5M4F A;  3VF9 A;  4R7B A;  5F94 A;  3W0O A;  3QZH A;  3FC1 X;  3MVL A;  3VVH A;  4HVG A;  4EOI A;  1JVP P;  4TYI A;  2XAR A;  4DCE A;  3TV6 A;  2WEV A;  3Q2M A;  3PIY A;  3GCQ A;  1BL6 A;  5HI2 A;  5C1Q B;  1OPK A;  3R22 A;  2YCS A;  4AN9 A;  2PML X;  1NXK A;  4ACM A;  4AXC A;  4CFF A;  1AQ1 A;  4H3P A;  3WF7 A;  2ITX A;  2DQ7 X;  4BBM A;  4WRS A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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