The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
ACQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Membrane protein
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| molecule keywords |
Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor
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| publication title |
Crystal Structure of the Ectodomain Complex of the CGRP Receptor, a Class-B GPCR, Reveals the Site of Drug Antagonism.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
29
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-05-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AQE A; 3AQF A; 3N7P D; 2XVT A; 3N7S C; 2YX8 A; 3N7R C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1X2I A; 2Y9T A; 5AM5 A; 4F4K A; 3KTQ A; 4DSL A; 3QNM A; 1ZQY A; 1S0N A; 3IM1 A; 1HUO A; 3K1Z A; 3QEA Z; 4Y2S A; 3LWL A; 3PST A; 3H8M A; 4NM2 A; 3RJF A; 4M0A A; 1TK8 A; 2E8P A; 1ZQD A; 2ODG A; 5KT3 A; 3H0M B; 1ZD3 A; 4I28 A; 5J0O A; 4Q43 A; 1WWU A; 2OYY A; 1X9W A; 2B21 A; 3ISD A; 5ALV A; 2I9G A; 3T5H A; 4US9 A; 3NVV A; 4ECZ A; 5AIB A; 4IRD A; 5EE3 A; 3UPQ A; 4YXM A; 5ALO A; 3C5F A; 4UB2 A; 2FPL A; 4GXK A; 1ZQR A; 2ZUD A; 3SR6 A; 4BWJ A; 2Y0S F; 2JMG A; 2W04 A; 3OPX A; 5KFZ A; 3PW5 A; 1BNO A; 2D3D A; 5DBC A; 1TKD A; 4JWN A; 3HKZ F; 1NJW A; 2QB0 A; 3C29 A; 2EDU A; 5D49 A; 5AI8 A; 1X6I A; 3KZX A; 4NLG A; 4QZ8 A; 3FM9 A; 1KFT A; 2QLT A; 4IQT A; 3OHB A; 4YG2 A; 3N7S C; 5AI4 A; 1L3T A; 1SKR A; 9ICK A; 3NAS A; 1OXJ A; 2ZIV A; 5KFX A; 2VA2 A; 4CCH A; 4JV2 A; 4C7Y A; 4F8R A; 5KFK A; 2ASL A; 1Z4O A; 2ZIU A; 5DLG A; 1ZD5 A; 4HAI A; 1NNL A; 3JPT A; 5KFM A; 4YD1 A; 4RPZ A; 1URJ A; 1LKY A; 1HIW A; 3IDW A; 2NO5 A; 3PW0 A; 4RQ5 A; 1JN3 A; 2VA3 A; 1QCK A; 1SXE A; 1A77 A; 1ZQG A; 2JXJ A; 3A0H U; 1IG6 A; 1PK1 B; 3MR2 A; 2F44 A; 2JRZ A; 2H3F A; 5DG8 A; 2W9B B; 3AL0 B; 1L8L A; 3HRD D; 2JEJ A; 1XU4 A; 2RQ5 A; 1IIP A; 3H40 A; 4DSF A; 3G6X A; 4Y2Q A; 5DG7 A; 2K8A A; 1A6S A; 4EZ6 A; 2G5H B; 1KTQ A; 4Q8F A; 2LM1 A; 1WUD A; 5J0W A; 2Y1J A; 3ORY A; 4OO1 J; 4FS2 A; 4IS7 A; 4F4X A; 7ICH A; 1GO3 F; 1QQ5 A; 3DV9 A; 4DFK A; 2P6R A; 3T3F A; 3MR5 A; 1ZXI A; 1RDF A; 4I2A A; 4PHD A; 3D2S A; 2OXO A; 3OTQ A; 2MAX A; 1NK5 A; 4YD2 A; 8ICZ A; 1T3Q A; 1S8O A; 3FDS A; 2Q4T A; 2LMR A; 5KFY A; 1ZQZ A; 3NUQ A; 5AKL A; 3UXP A; 4FBT A; 5D46 A; 2K4H A; 4YMN A; 4DL4 A; 2NV3 A; 2UVR A; 3QUC A; 3VCB A; 3Q8S B; 3GIM A; 2PFN A; 5DQH A; 3N97 B; 1RQN A; 2K60 A; 4NV0 A; 4M04 A; 1KW4 A; 5EWF A; 3IN5 A; 5BPC A; 2HHV A; 1RQL A; 2NO4 A; 5D4B A; 1L7P A; 3PX0 A; 3F53 A; 1OW5 A; 5HMM A; 5L1M A; 5HHI A; 1EXN A; 3EW9 A; 2I5H A; 5JUM A; 4IC9 A; 1TV9 A; 3B9J A; 3EWA A; 3KOO A; 3ZI4 A; 1V38 A; 2RRD A; 3SAG A; 1WWV A; 1T94 A; 4IL6 U; 5ALE A; 5J0S A; 1B22 A; 2BCV A; 5ALN A; 3FC4 A; 4C4T A; 1TVA A; 3Q8L A; 2XGP A; 4QZA A; 4R63 A; 1CEZ A; 5CHG A; 2KOB A; 1JIH A; 1SV4 A; 1X42 A; 4BXO B; 5ALT A; 4ED8 A; 2FMQ A; 2FPK A; 2HHQ A; 4US8 A; 5GTI U; 2EZX A; 5ALZ A; 9ICV A; 5J2K A; 9ICI A; 3V7K A; 4F5N A; 9ICG A; 2GLE A; 3KFU F; 1SB3 C; 1A76 A; 3V7J A; 1XSL A; 2KIC A; 4QZH A; 1ECW A; 3SI8 A; 5ALH A; 2ZIX A; 4QWB A; 4R64 A; 1NJY A; 3PO5 A; 3AU6 A; 5J2G A; 4DQI A; 3QU5 A; 2UVU A; 3ZDB A; 1ZQB A; 1ZQH A; 4GLX A; 1L8O A; 8ICO A; 4ELT A; 3BQ2 A; 4A8E A; 3SQI A; 4J9O A; 9ICP A; 2RHF A; 4QWD A; 4RQ4 A; 4ED0 A; 4E0D A; 3A0B U; 1ZQE A; 2UVW A; 2LYB A; 2G08 A; 4Y2X A; 2I6X A; 1JXL A; 3J81 j; 4DL3 A; 3PX4 A; 4MFF A; 3DDH A; 2DPI A; 4KLJ A; 5KFQ A; 5EWE A; 3MFH A; 3PY8 A; 5J2J A; 5DB9 A; 2GH1 A; 1T3N A; 3RF9 A; 2IHN A; 3D6J A; 1ZQA A; 8ICJ A; 3ZD9 A; 2R18 A; 4FE3 A; 5CP2 A; 4YN4 A; 2C22 A; 3UMB A; 3QUQ A; 3GU3 A; 3F5A A; 3ISC A; 4TUR A; 5DGB A; 4QZD A; 4K4G A; 2KIW A; 4DOB A; 4XRH A; 4KLI A; 2FI1 A; 4PGQ A; 3H8S A; 4FBU A; 3LVV A; 4J9L A; 3R9K A; 2KEY A; 3RBE A; 5KFF A; 4I2D A; 7ICF A; 4RQM A; 3K1R B; 4BDP A; 1ZQX A; 4RNO A; 3KHR A; 2ZTC A; 4F2R A; 4KX5 A; 4TUS A; 5C0Y A; 5ALK A; 3EYZ A; 1BPE A; 3QYP A; 1L5U A; 3RR8 A; 3M6Z A; 8ICU A; 1NK4 A; 4UQG A; 3PNC A; 4PHE A; 5DKW A; 1X9S A; 4M9H A; 5AKZ A; 4P4P A; 4YVZ A; 4NXZ A; 4OCZ A; 3RFA A; 4KLH A; 3MGI A; 4NM1 A; 3SV3 A; 5HHH A; 2RDJ A; 4B9V A; 3D2N A; 4KX3 A; 3OJS A; 1Z3E B; 1ZD4 A; 4MHV A; 2G07 A; 2RLT A; 4DF8 A; 2DGZ A; 2HDO A; 1LB2 B; 1QTM A; 4C8M A; 4KN4 A; 2F76 X; 3T5L A; 1RPL A; 1SL0 A; 8ICQ A; 5KG0 A; 1N5W A; 1JXE A; 5AK3 A; 2F1J A; 5ALI A; 3OJU A; 4UAY A; 1KSP A; 9ICT A; 2NRX A; 1ARO P; 3I1Y A; 5J0U A; 3TFR A; 4EX7 A; 5AKI A; 2EQY A; 2G5I B; 4NL9 C; 4M6W B; 2A1J B; 3CP8 A; 3C5G A; 1YZ6 A; 3KHL A; 4ELV A; 4OJL A; 4I2G A; 4ED1 A; 4ELU A; 5J0P A; 2HHU A; 1ZJM A; 5DGA A; 5K4L A; 4B6J A; 3M1Y A; 2Q0Z X; 3OSN A; 1S77 D; 3RTV A; 5ALG A; 2XIC A; 4M9L A; 2JHD A; 1FFV A; 1JX4 A; 5J2H A; 2PMZ C; 2KHV A; 2PKE A; 8ICM A; 4YR3 A; 1RYU A; 5C5J A; 3BDP A; 2VJ5 A; 2F1I A; 1XO1 A; 2IA6 A; 4KLL A; 1ZET A; 3BQ0 A; 4R8U B; 8ICL A; 5KFC A; 3NTU A; 3LYS A; 1OUQ A; 2E1E A; 3JPS A; 1B0X A; 3MC1 A; 2WFA A; 5KTQ A; 3RB6 A; 7ICR A; 1DXS A; 2YX8 A; 4EYI B; 1QQ6 A; 4IQU A; 2LKY A; 4PHP A; 5ALP A; 1ED1 A; 2KD1 A; 4KLQ A; 1NOM A; 3F2D A; 2KJ9 A; 2JEG A; 4EEL A; 1O03 A; 4MFA A; 5AK6 A; 1J2N A; 3HPO A; 2QAR B; 4EX6 A; 4JK1 A; 2E5S A; 1Y88 A; 2AJQ A; 5J8Y A; 3IG5 A; 4DSK A; 2E8O A; 5L9X A; 1S0O A; 2BR0 A; 2IOF K; 2ZIW B; 5AKY A; 2KHQ A; 1SL1 A; 2JH7 A; 2ZJA A; 2KJ5 A; 2L5Y A; 4YXJ A; 1M6Y A; 1X40 A; 2ASJ A; 1SXD A; 4MFC A; 5ALW A; 2KZ3 A; 2QKQ A; 4CGZ A; 2BPF A; 1D8Y A; 4JWM A; 4MF2 A; 5KFU A; 4RQ1 A; 4DEZ A; 4F5R A; 2WAQ F; 4U6P A; 1SWW A; 4KLM A; 1KEJ A; 2BDU A; 1SGG A; 4YCX A; 4UAZ A; 1PUZ A; 4F50 A; 3M6K A; 1MQ2 A; 2ZUB A; 1QSS A; 3RAX A; 1QSL A; 1F44 A; 3JPO A; 4RUA A; 4IR1 A; 5KG5 A; 4XUS A; 1ZQV A; 3T5K A; 3H0L B; 2KSO A; 3JPQ A; 3RH5 A; 5AIC A; 2EAP A; 3H4D A; 4ED3 A; 4Y2J A; 1T4G A; 2FLN A; 3ALR A; 1SL2 A; 1C20 A; 1DK2 A; 3QE9 Y; 2DPJ A; 3LWM A; 4Z6D A; 3IG8 A; 4F3O A; 4C4R A; 4YP3 A; 2WB1 C; 4OJ6 A; 4OJ5 A; 2R8H A; 4JUZ A; 3HIL A; 2PI4 A; 3KZI U; 5J0Q A; 3IV6 A; 1RXW A; 4DFD A; 3GDX A; 1JAL A; 2BKE A; 2D8C A; 4ECV A; 2WF8 A; 3TAR A; 5IIM A; 4O3R A; 7ICQ A; 1WCN A; 3RJK A; 2KKP A; 7ICO A; 1RG6 A; 3TFS A; 3HWT A; 5CWR A; 5JU5 A; 1N56 A; 1Z19 A; 4O5K A; 5HNK A; 2H3Z A; 2ISP A; 1P7D A; 2MRL A; 9ICX A; 4ACO A; 3QU2 A; 3M9O B; 4DS5 A; 2DKX A; 3ZDC A; 1LVH A; 3PR5 B; 3PO4 A; 2YMM A; 4K4I A; 2G0A A; 1K5O A; 1NK0 A; 4B9S A; 5III A; 4UW9 A; 3RJE A; 2XCP A; 1HUZ A; 3N7P D; 1UPH A; 1DOQ A; 4ECW A; 2JZB B; 2NRT A; 4KIT B; 2GWS A; 7ICJ A; 4DQS A; 3RRH A; 5B5E U; 5AKH A; 3BJY A; 1L3U A; 2O6K A; 1QQ7 A; 4RT2 A; 4GC6 A; 2CXY A; 5KFV A; 3CYM A; 2R8K A; 2YB4 A; 3Q8K A; 4DQQ A; 8ICW A; 3BQ1 A; 4O3O A; 1NK8 A; 9ICH A; 2C28 A; 1K1Q A; 3QUT A; 1ZQW A; 4QZF A; 5KFH A; 3GZF A; 2Y0S C; 1RYS A; 5KFJ A; 2FMS A; 1F5S A; 4FZN A; 3HKZ C; 3M8S A; 2EAM A; 2ATL A; 2M0N A; 2P6U A; 2YY6 A; 1UHU A; 4PL1 A; 1S97 A; 3MGH A; 4JV1 A; 3KD3 A; 3E0F A; 3RJI A; 2EH9 A; 2QB1 A; 3TAQ A; 4DL7 A; 3AM9 A; 8ICA A; 4O3P A; 2WTF A; 4DLG A; 2LYH A; 3AU2 A; 3UMC A; 4KLT A; 4F72 A; 1JRP A; 2KIV A; 3NVY A; 2XY7 A; 3RJJ A; 4DOC A; 1CUK A; 3C21 A; 4JV0 A; 2DWQ A; 5E79 U; 1Q3U A; 3PVX A; 3K4G A; 3JPR A; 3HT3 A; 4QIW C; 2VAN A; 4KMO B; 2PFQ A; 4B9T A; 4Q45 A; 3N4M B; 1NJX A; 4P0Q B; 2YMQ A; 1UT5 A; 3NVW A; 1J2M A; 5H2F U; 1KBU A; 4PZO A; 5DLF A; 4RT3 A; 2W7O A; 4NY8 A; 5KT7 A; 1PZN A; 3TKA A; 2BQR A; 2VJ4 A; 4NLK A; 5HR7 A; 8ICR A; 5AIA A; 1ZQN A; 3BQT A; 1ZQK A; 4F4W A; 4OJO A; 8ICS A; 2WHE A; 3B0Y A; 3M9N B; 5AKJ A; 4NWI A; 1ZQT A; 5B66 U; 1QH9 A; 1YT3 A; 2BHN A; 3EPG A; 1ZQM A; 3MDA A; 1ZQC A; 1L7M A; 2KE7 A; 3AQF A; 4J9S A; 5F9L A; 1VDV A; 1U47 A; 5TZV A; 5BOL A; 3M9M B; 1CI4 A; 2VKQ A; 1ZJN A; 4QZE A; 4FFD A; 1TAM A; 1TAU A; 2F8L A; 5DDY A; 1BPY A; 4Z6C A; 2HBM A; 3TAP A; 2W9M A; 5AI9 A; 1DK3 A; 4I2E A; 1VLB A; 7ICU A; 1TAQ A; 4QZG A; 1UA0 A; 1J97 A; 5DB7 A; 3PZP A; 5ALQ A; 3PW7 A; 3PW2 A; 4ECS A; 7ICT A; 4O3S A; 2EZY A; 4LJX A; 4F93 B; 3WK8 A; 3SAF A; 5DB8 A; 4O9M A; 3I28 A; 3RR7 A; 3H8W A; 1ZQO A; 2LPE A; 8ICB A; 3LK9 A; 3IRU A; 4C8N A; 4PPX A; 4O5E A; 1FEZ A; 2FE9 A; 1Z00 B; 2XGQ A; 2C2D A; 2XC9 A; 1U48 A; 2MUT B; 3G6Y A; 3SEN A; 4Y2V A; 1COO A; 2D6F C; 4CF5 A; 3ZDE A; 1L3S A; 3GV8 B; 2EAO A; 4DWI A; 5HP4 A; 4Y2R A; 3MFI A; 2JEI A; 5JRT A; 3RH4 A; 7ICK A; 1ZQI A; 1PVQ A; 4DSJ A; 4J9M A; 2HCF A; 3DEE A; 4KLD A; 4UBB A; 2W11 A; 5KFO A; 5KFB A; 1SV0 A; 2HHS A; 4PHA A; 3KBB A; 3EZ5 A; 2WF9 A; 9ICQ A; 4OJP A; 2BDP A; 1JMS A; 4UAS A; 5AK4 A; 5KT5 A; 3UMG A; 2HMX A; 3GIK A; 4RUC A; 2PFP A; 2DKZ A; 1JUD A; 5IIO A; 5L1I A; 3JPN A; 4QZI A; 3L5K A; 4C8O A; 4I2H A; 2WF5 A; 5AKX A; 4Z6E A; 3BS5 B; 3AEV A; 5J2C A; 2W03 A; 1SV0 C; 4YFK A; 7ICI A; 3HJE A; 1S5L U; 8ICY A; 4QJF B; 3F2C A; 5KG1 A; 2HBK A; 1N48 A; 1IM4 A; 2AHO B; 2ZJ8 A; 4J9N A; 2H3V A; 2FDR A; 5J2A A; 1D9F A; 2H3I A; 8ICC A; 2W3R A; 3WK7 A; 4UBC A; 2Z7J A; 3PMN A; 3TAN A; 2IHM A; 4KLG A; 3LDA A; 4F2S A; 4U7C A; 3N28 A; 7ICM A; 2W8K A; 2XY6 A; 2WF7 A; 2LM4 A; 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4YQW A; 2ALZ A; 1WCL A; 4RQ3 A; 2OH2 A; 4I2J A; 5AM4 A; 4I27 A; 3KHH A; 3ZDD A; 4M2Y A; 2I1Q A; 9ICJ A; 5KT2 A; 4RPX A; 5KAI U; 5CR0 A; 4M47 A; 1UCV A; 5KAF U; 3S6J A; 4RQ2 A; 9ICU A; 3WKD A; 1D9D A; 4BXO A; 5CEH A; 5ALX A; 2FJ6 A; 4UB6 U; 2YMP A; 2LBO A; 4ED7 A; 3PW4 A; 4C8L A; 3WK6 A; 3U26 A; 7ICV A; 5KFG A; 3I76 A; 5AM3 A; 5DBA A; 4J03 A; 4P0P B; 4ED2 A; 3GIJ A; 1FFU A; 1BNP A; 4MEX A; 4KLE A; 4LVS A; 4NLC A; 3GQC A; 1Z00 A; 2OM6 A; 3QX7 A; 1RYR A; 3RB4 A; 5IIL A; 2P35 A; 3NRW A; 3OSP A; 4QNL A; 1XS9 D; 2WB1 F; 3C1Z A; 1UA1 A; 4Q8E A; 3OHA A; 1WG8 A; 8ICF A; 2GOL A; 2F1H A; 3HP6 A; 2BCR A; 4DLE A; 4O0I A; 3ETR A; 2AGO A; 4FS1 A; 3SV4 A; 2OWO A; 1BVS A; 5J2B A; 2JH1 A; 4FZM A; 2R8G A; 3QU4 A; 4NLN A; 8ICP A; 3C28 A; 4O5C A; 4QWA A; 4LZG A; 5KNI A; 1ZQ1 C; 9ICF A; 2HOI A; 1B4F A; 1L7N A; 2HHW A; 4R65 A; 2KG5 A; 9ICA A; 4CE6 A; 5AK5 A; 4B9U A; 1ZD2 P; 2N1R A; 3IHQ B; 1MC8 A; 1JRO A; 4ICA A; 5T14 A; 2FMP A; 9ICO A; 5ALJ A; 3Q8R B; 4ECX A; 2E8M A; 2M9N A; 1N5X A; 3THV A; 3BS5 A; 3WK9 A; 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