3NA8A

Crystal structure of a putative dihydrodipicolinate synthetase from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
291
structure length
290
Chain Sequence
ASIHGIIGYTITPFAADGGLDLPALGRSIERLIDGGVHAIAPLGSTGEGAYLSDPEWDEVVDFTLKTVAHRVPTIVSVSDLTTAKTVRRAQFAESLGAEAVMVLPISYWKLNEAEVFQHYRAVGEAIGVPVMLYNNPGTSGIDMSVELILRIVREVDNVTMVKESTGDIQRMHKLRLLGEGRVPFYNGNPLALEAFVAGAKGWCSAAPNLIPTLNGQLYQAVLDGDLEKARALFYRQLPLLDFILRRGLPTTIKAGLGLSGLEVGAPRLPVQALDTEGCRYLQGLLEELR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords putative dihydrodipicolinate synthetase
publication title Crystal Structure of a putative dihydrodipicolinate synthetase from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 102
structure length 290
sequence length 291
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.1.52: Transferred entry: 4.3.3.7.
pdb deposition date 2010-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3na8A00
4X2RA 5K4ZA 4LY8A 4GWEA 4AWUA 2Y88A 5DELA 4DO5A 3P62A 3NQEA 3SI9A 1YDNA 5AHNA 3W2KA 4A2SA 1LRTA 2J24A 4UFIA 1G69A 1HG3A 2X1UA 2YX0A 4IMFA 1IGSA 1I2QA 3QPZA 1KA9F 3HJZA 4UTWA 3QYQA 1IXQA 4FX7A 3QW4B 5I3JA 2OT1A 3G0UA 2Q8LA 2F7FA 2E5DA 3KVMA 4UTTC 4I7UA 1R46A 1VYRA 2QAFA 3MWAA 2JKEA 3ZWSA 2V81A 1W3TA 2VOMA 1ICQA 3DBPA 1XBVA 5HULA 5FEXA 3W7QA 2EF9A 5DCEA 1Q3NA 1YPIA 4FNPA 4JR5A 4CQ8A 3C2EA 4LS1A 3BV4A 3NQ7A 2X16A 4HT3A 4LT9A 3ABRA 4HIBA 1XKYA 4JTFA 3N3MA 5AHFA 1JUBA 3EKZA 3M0ZA 3C3NA 1KM1A 3MBFA 1DOSA 1EUAA 3G1DA 3TSBA 1LLZA 3NQCA 4GFSA 2AQWA 3MYPA 3WJYA 3EKLA 3TH6A 1YYAA 2V0TA 3EX6A 2VEPA 4JN6A 4LV9A 2YFOA 3DFPA 3TW7A 3PG8A 5AFDA 1K03A 1TPFA 2J9XA 1TTJA 3QM3A 5TBOA 3S42A 5HWMA 3OBKA 1OFPA 4WOQA 1A5BA 4BWLC 3HMJG 1BEUA 2WJZA 3GNDA 5AHIA 1IF2A 4O1AA 4LU0A 3NM1A 1TTQA 2QCDA 3EWWA 3HGOA 1VS1A 4LVFA 1O95A 3HPZA 1G7UA 3BPWA 3N2XA 3E9AA 1W5QA 3Q58A 1MEWA 4K6AA 1OX6A 4BI7A 2WKJA 3L5LA 3OVPA 1P5BA 3BW4A 3HQ1A 1S3HA 3FFSA 3L0KA 2JBMA 4NJJA 4UTMA 2Q3OA 4A2RA 2X2GA 4QNWA 2R14A 5J5DA 1JUEA 1D3HA 4OV4A 4LVGA 3E12A 4KKXA 3E02A 3FKKA 3EWXA 3L0NA 1H7PA 3G1HA 1QOQA 3GKAA 1ML1A 4Q32A 1YTKA 1VQTA 3GXPA 1TPH1 3TU9A 4UTWC 4UTIA 3W7HA 1GG1A 4ADTA 3HF3A 3UWWA 3P67A 3KAOA 4MY1A 3DGRA 3IGXA 4CCDA 4JNMA 3M5ZA 1ZAJA 4ADUA 2VELA 1LCOA 3FKRA 3M5XA 1RQBA 1FDJA 1H7RA 4NZJA 8TIMA 1HL2A 2OCZA 3PBUA 3YPIA 4DBEA 4A29A 3MHUA 4BF9A 3PUOA 4KWWA 4XKYB 3BW3A 2XN0A 1SR9A 2WO5A 3OIXA 3S0CA 3PB2A 4QJ1A 5L6UA 4JTEA 3MYOA 5LGXA 3P5YA 2J6XA 3DKJA 3W73A 3TIMA 2QUTA 5AOUA 2VFIA 3F1QA 1WAUA 2GJNA 5BMWA 1ME8A 5LZLA 4YCOA 1A50A 3EB2A 2PRHA 1X7FA 3TQ0A 1KLYA 1DJNA 2E6DA 1KFEA 1YDVA 1I4NA 4JY8A 2P10A 1OFQA 4O18A 4TU1A 1DKWA 3IIOA 3W7MA 2QDGA 2ATMA 3W2LA 1LP6A 4LC8A 2Y7FA 3H54A 3STFA 3LRLA 1HTIA 1GQNA 5AYXA 3C2FA 3L21A 2C13A 2XN2A 4OBTA 4RJEA 2B7OA 1FWSA 1Q45A 1G4TA 5FESA 1PVNA 2ALDA 1VJIA 4IMDA 4ML9A 1TTPA 2H3BA 4N4QA 4JX5A 4UR7A 4LS2A 1XCFA 1RD5A 5DBTA 3R8RA 1DHPA 3KX6A 2O7QA 3W85A 1GTEA 3S5NA 1QPQA 3NL2A 4K7YA 3JS3A 5CPOA 1WA3A 2JK2A 4LOCA 1TV8A 4O1DA 1Q6QA 1U83A 1W3NA 1K3UA 4N9CA 1FQ0A 4Y9AA 1VHCA 3PF3A 1H61A 2WV8A 2Y62A 3HBLA 3GNNA 3PUDA 1SO4A 4UMAA 1GVOA 3E49A 1AL7A 1H7WA 1EP3A 5D2YA 3L65A 1VCFA 2VENA 1LDCA 3I7RA 4LUIA 3SZ8A 4O0ZA 3ELFA 3LHZA 3Q2DA 3L66A 5D05A 4Z08A 5F2GA 4RZ6A 1BKSA 2TRSA 3NOEA 3P80A 4PEKA 2F84A 4QQ3A 2YDAA 2BTMA 2ZQ0A 4O8RA 1Q6LA 2QCMA 3LHWA 5I3IA 4K37A 1GOXA 1KTNA 1IIGA 3TKFA 1TJRA 4LW7A 3T55A 2ZRYA 3LTSA 3K30A 2VFGA 4MLRA 5CPNA 3TK7A 1FXQA 2DZTA 4JTHA 1EA0A 5G5IA 4U28A 5LHFA 3FS2A 1S5WA 2RH9A 3FA5A 3LCLA 5G2HA 4IXHA 1BWLA 3LXBA 4S1FA 3W7GA 2ABBA 2A85A 4MY9A 3QZEA 4NJIA 4UIOA 3TR2A 5LNVA 3W84A 1WDWA 3SJ3A 3CWNA 4RZ4A 4L4MA 3N34A 3NL3A 4PL1A 3TCEA 3A9IA 4JY9A 3EXRA 4JTKA 5HR7A 2Y6ZA 5FEZA 5K3VA 1EEPA 4PC8A 3BG3A 4M6PA 2Y7GA 3MJYA 1FCVA 3B4UA 4IWWA 4WZHA 1DQWA 5D38A 5KITA 3CU2A 1M5WA 3LI1A 3FOKA 1N7KA 2E1DA 3H53A 5H91A 3ZFHA 3WK0A 1K8ZA 1JR1A 1TYGA 4QISA 2CZ5A 2DZVA 3W7PA 1N8FA 1YDOA 3G8RA 4MY8A 3PUEA 3LBMA 2A7PA 1P4CA 4RR4A 5CZTA 4O0KA 1EB3A 5IBXA 1IXPA 3F4WA 5D2TA 2QEZA 4JXCA 2V2HA 2P1FA 2NZLA 1SPQA 3EX4A 1V5XA 3CB8A 3NQVA 1F6PA 1T0OA 3ABQA 4MJZA 4R33A 2PRMA 4D2JA 4X3ZA 3H55A 5I3GA 3C52A 1K7FA 4AVFA 3UWYA 3NVTA 1S5VA 4PH6A 2R94A 4KFOA 4GJ1A 1KW1A 4FNTA 3WJZA 2H8XA 3LCHA 1JCXA 1GPWA 2H8ZA 3B0PA 4N6EA 4RKAA 4HSNA 1NEYA 1QNVA 2VFFA 1XUUA 2TMDA 1KM4A 2QUUA 2ZA1A 4Z1BA 3LLDA 5F4SA 4ZZ9A 5DY2A 1ICSA 4P61A 3DENA 3E96A 4MKNA 3GDLA 4RCXA 3FYOA 3TA6A 2QCCA 5CPMA 1ZAIA 3STGA 3NPXA 3LHVA 1TPWA 4MFEA 2NV1A 5T26A 2C15A 4WY0B 3W23A 1JQVA 3C0JA 3HO8A 2X1SA 2XFWA 1OFDA 4GC4A 3LV6A 3GVGA 5BOOA 1TTIA 5F4WA 1HO1A 5E1QA 1OVDA 2GQ8A 2BZNA 2HSAA 3LGEA 3TJLA 4LRSA 4ORIA 3WK1A 1UASA 5KZEA 4O54A 3BVJA 2FB3A 3PR2A 5KTLA 2RDWA 2DZPA 1DQXA 3UY8A 1M6JA 1KFCA 3SR7A 4JDYA 4NUWA 4FF7A 4CQAA 1QCWA 3BLEA 3G1AA 3TMQA 1RQHA 4O4VA 4LVAA 3C2OA 5CG7A 3AO0A 2FPYA 1GWJA 3FEMA 3M9YA 3WJXA 4FEZA 5AYYA 4O19A 1VH7A 4K36A 3FJLA 3DKLA 1XXXA 3G3DA 1VLIA 1GZGA 5IBXC 2QCNA 3KVJA 3EWBX 1VCGA 2ZYFA 1SUXA 3DI0A 3P81A 2PE4A 4XUGA 1SZEA 3S8HA 4DQWA 3S5ZA 2B4GA 4HHPA 2A5HA 4IQLA 4EIVA 2WSQA 3S1XA 4FNUA 4UFKA 5HUOA 3MHGA 3IV3A 1WX0A 3N9SA 3UY7A 3Q37A 4ZMGA 1LOLA 1OFOA 1AG1O 5D03A 3UPBA 2E6YA 3ABOA 1OFAA 3NPUA 4ORMA 5D33A 3TC7A 4AEOA 3NQMA 3DI1A 3RF9A 3P74A 2UV8G 4Z0SA 2W0UA 3C8FA 4JYEA 1WXJA 1NVMA 3GAKA 3MMTA 3M7WA 4JTSA 3ABSA 5CSRA 4KFPA 1LRQA 3I6RA 4IOTA 1W0MA 3UZ5A 5HMSA 3L9CA 2WSYA 2FQIA 4N9EA 3PBYA 1L6WA 1LM1A 1KFKA 1SZGA 4FXSA 1XDLA 3IIVA 4O53A 3CIXA 1KTCA 3TSMA 3LXCA 2VC6A 1KBIA 3W22A 4ICNA 3LRKA 1R2SA 1QO5A 1Y0EA 1ZJIA 3G8EA 5I3FA 2GUUA 5U7SA 4JTUA 4ZQNA 5IM51 1VPXA 1H7OA 1ZCOA 2ZTKA 3SSJA 5C54A 3U8GA 4MZ1A 4H6KA 1CI1A 3VE7A 4IMEA 2BSLA 3KFTA 3HG4A 4HKPA 4N6FA 3MUXA 1TIMA 3UWVA 2DJXA 2YZRA 3G18A 4LUJA 4NQ1A 5D32A 2YXGA 1JVNA 3HG5A 5KZMA 4O14A 1KFBA 3NGJA 1TSIA 1SSGA 2CLLA 2A6LA 4QIUA 2A21A 1JCMP 3I7SA 4LVBA 3LHUA 3MP5A 1ZNNA 1OX4B 5G1TA 4PL2A 3QMSA 2ISWA 3M5VA 4IX2A 3GK0A 3JR2A 3GZ3A 3MHFA 3LLFA 1X8FA 4Z1CA 3LXAA 3STCA 1ZHAA 2ZRWA 1JJKA 1CX9A 5AC6A 1I8JA 1UUOA 1OG0A 1QDSA 1FY6A 1GEQA 3HB9A 4YWIA 3NXFA 5KSWA 1GYLA 3M1ZA 4IUOA 1L6SA 5MHBA 1OX5A 4AF0B 5AHEA 3M5YA 1SFLA 3CLMA 1G4SA 5U4NA 2R8WA 2V5BA 1D9EA 3LRMA 3DFOA 3QC3A 2Q3RA 3W7IA 4AAJA 1YTDA 3M44A 1F2JA 2G95A 4FX6M 3W7DA 2O7SA 3HIJA 4GUIA 3UWQA 2CLEA 1C9DA 2EHHA 2BLEA 3GX9A 3HGJA 1TRDA 4O13A 1QPRA 3PULA 4WY0F 3INPA 2X1TA 3C4UA 3BW2A 3QMTA 4HPXA 4KFNA 3B0VC 1NSJA 2J9ZA 1TV5A 4K8HA 5K4XA 3DFNA 4UFLA 3W72A 4PFMA 2GQ9A 3NG3A 1XC4A 4NNCA 2FLIA 4OT7A 1ZFJA 3S5YA 4L4LA 1KM5A 3QJAA 4HNUA 2EPHA 2DJLA 2ISSA 4TIMA 4Z0JA 1PIIA 3U2OA 1YPFA 4EOUA 3PM6A 3A24A 2E77A 2XN1A 2I14A 4ZQRA 5BMXA 2I9EA 2J9YA 4AH7A 1W5OA 4IMGA 2D73A 3DAQA 3GIYA 1I45A 2HMCA 4E2DA 4CNPA 5LNRA 1W54A 4S2BA 2ZZ2A 5AYZA 3OEXA 2DP3A 4BR1A 3LBCA 1PHQA 2NUXA 4JD4A 4MVAA 5D2WA 4TX9A 5ABTA 1XL9A 2ZZ1A 4NU7A 3SY5A 1BTMA 3W1XA 2E5CA 3O8AA 1AMKA 5I3KA 1AK5A 3IVUA 2QCEA 4QNEA 2RFGA 5KZDA 1F73A 5LNUA 1ADOA 3MP3A 5K2ZA 2CFFA 5G2IA 2ZZ6A 3QPYA 4JDBA 4Y8FA 3LTPA 5D37A 2VKZG 3SW6A 3O15A 3NQ2A 3T7VA 3CPRA 2CLFA 4LRTA 4UXDA 2OMAA 5CZJA 3QFEA 4R7JA 3ZR4A 4O15A 3DFQA 3BG9A 4I7WA 4RLIA 3EXSA 3W1TA 4O1CA 2AAMA 2DU2A 5F2MA 2OT0A 3RFAA 5DLCA 3PSWA 2E5BA 2QJGA 3HOJA 4UR8A 3NQAA 3M41A 2CLIA 1DL3A 1PCKA 1R2RA 2E68A 2VFEA 3W6YA 2E6FA 1L9WA 5BNKA 5HJLA 3R5EA 1KV8A 1QO2A 2A0NA 5C55A 2C3ZA 1ZAHA 3LCWA 3NPVA 5H2ZA 3GKFA 1P0NA 3MI2A 3TXZA 3PWAA 4TR9A 3VFLA 3F03K 3W1UA 4GUGA 4OV9A 3TE9A 1KM3A 1JCYA 2FPVA 3B8DA 2A6NA 5LNSA 3IEBA 1ZENA 4ZQMA 5K9XA 2BX7A 3NYZA 1EPXA 5EY5A 1LOSA 3N2MA 3S1VA 4AHQA 1W37A 4XKYA 3FJ6A 5AN7A 2HS6A 4JX4A 3W7OA 3B0UX 2P0OA 3P5ZA 3QQ1A 1DV7A 4YCPA 3QH2A 4N2YA 4YL2A 3L0GA 3V1PA 3LDVA 5FF4A 3I68A 3BO9A 2GPTA 3N19B 1H60A 3QRHA 4IMCA 1EUNA 2RKXA 3PC0A 5CSSA 1HO4A 3NA8A 5EKYA 4M6VA 3TROA 4H4IA 3CQ0A 3DXIA 4CCEA 4AWTA 3W7EA 7TIMA 2I1OA 5KMYA 4XTDA 1X1OA 3TFCA 4RK8A 2C19A 4B5NA 3DFTA 1WOAA 1EP1A 2YFNA 3THAA 1HFBA 3EXTA 3QW3A 4FIQA 4Q33A 5C5YA 5EPDA 4RX0A 3W74A 1H50A 2X30A 1WOBA 2TYSA 2G96A 3GLCA 3NNTA 4RV8A 3BGGA 3LB0A 2WSRA 2ZZ5A 5HWJA 1OFEA 3W87A 2Z2UA 2QCLA 1KBJA 3CT7A 4ALDA 1LBMA 1HUVA 5K9DA 3W2UA 3HPXA 3GXTA 4LC6A 3ATZA 5G4EA 1OHLA 4A21A 2ABAA 2X1RA 2J27A 1FCQA 2IQTA 4BI5A 3LHTA 4MUZA 5F4XA 2CLHA 1M7OA 2GOUA 1LBLA 3R13A 1GVRA 3RK8A 3USBA 1R30A 1MEHA 4JIQA 4DF1A 1TJPA 3W7LA 3R12A 5BRBA 4LNYA 2Q8ZA 3L67A 3VKJA 3SGUA 3CHVA 5A5WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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