3NCOA

Crystal structure of fncel5a from f. nodosum rt17-b1
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
VDKSSAFEYNKMIGHGINMGNALEAPVEGSWGVYIEDEYFKIIKERGFDSVRIPIRWSAHISEKYPYEIDKFFLDRVKHVVDVALKNDLVVIINCHHFEELYQAPDKYGPVLVEIWKQVAQAFKDYPDKLFFEIFNEPAQNLTPTKWNELYPKVLGEIRKTNPSRIVIIDVPNWSNYSYVRELKLVDDKNIIVSFHYYEPFNFTHQGAEWVSPTLPIGVKWEGKDWEVEQIRNHFKYVSEWAKKNNVPIFLGEFGAYSKADMESRVKWTKTVRRIAEEFGFSLAYWEFCAGFGLYDRWTKTWIEPLTTSALGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endoglucanase FnCel5A
publication title Crystal structure of FnCel5A from F. nodosum Rt17-B1
rcsb
source organism Fervidobacterium nodosum
total genus 119
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2010-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ncoA00
1G0CA 1CGWA 3WNOA 1FFQA 4CVUA 4B16A 1E0VA 3AISA 5I0DA 3HN3A 4BQ2A 4M56A 2DT2A 3WQ8A 2PWDA 3VNYA 3GNOA 4R27A 4PMNA 2XVPA 2AOSA 1DHKA 4MB5A 3HU7A 5JIPA 1FA2A 1JXJA 4PEEA 4CVWA 4JHZA 4U5KA 4LYQA 5DFAA 3ZM8A 4ATDA 2WC7A 4J3SA 4EK7A 1O6IA 4UZUA 3SIMA 4HPGA 3M46A 3AROA 2QMJA 1E4IA 3M7SA 1FHDA 2D22A 3A4AA 3K8KA 3T0DA 1GVYA 3U7VA 1CXHA 3BAIA 1VJSA 2OWXA 3HMCA 3AIUA 4A4AA 1S46A 2GJXB 2ZX9A 1MXDA 1H5VA 1B0IA 1JZ7A 2YDSA 4FLRA 1JL8A 3AFBA 5EFFA 3WH6A 1OIMA 3ZIZA 3WELA 1UWIA 5CPTA 3OLEA 3WUEA 5EB8A 3THDA 1JG9A 5BCAA 3DHUA 4QCEA 5BXTA 3IJ8A 4N42A 3MUY1 2WCAA 4UOZA 7CGTA 1NWSA 3GXMA 1NP2A 2WMKA 2BHYA 1KCLA 1E43A 2ZXBA 3BAJA 4UQEA 2FHCA 2D24A 2GSJA 3ALGA 2YIHA 3PZNA 3I3EA 1MVYA 3WN6A 1PZ2A 1UWQA 1QHOA 1ZBKA 2O9OA 2X09A 3RDKA 1QPKA 1MQRA 1UA3A 4AZHA 3UG5A 2EEXA 2CNCA 2X05A 2YKKA 5A6KA 3KL3A 5BRQA 3WY1A 2XGIA 3RM8A 5A6MA 1JDAA 8CGTA 1MYRA 4MJ4A 5IDIA 1G1YA 2Y2WA 3AXHA 2E40A 2VO5A 1MFUA 1U33A 1UWRA 4S3JA 4M29A 4GQRA 4UQDA 3QOKA 3ZT5A 4HTYA 2BVDA 2GK1A 4YPJA 2AMGA 2WHJA 5EFDA 2XHYA 2QHAA 3W0KA 1CXLA 4W87A 4MB1A 4DWSC 4UQ9A 3A3HA 2QPSA 3LMYA 3AI0A 3I3BA 1UH4A 3AXXA 4PMDA 2DSUA 1H2JA 3LPFA 2PWHA 3WQ5A 2ZUUA 2ZWYA 2J7CA 3L2MA 4FLQA 2WANA 2CETA 2OWCA 1QOXA 1KXQA 2FH8A 4QLKA 3OG2A 3VGDA 3DYOA 3MSDA 3WEOA 1TG7A 2FGZA 1GHRA 4UTFA 2GDVA 4UOJA 4NZCA 3GDBA 4OBSA 3CHDA 2W62A 3GTNA 1ZJBA 4V28A 1M7XA 3N9KA 2F61A 1JF6A 3EYPA 1KGUA 1NOUA 2XJ7A 1A3HA 4J3WA 3VIKA 4AC1X 3NIYA 1V0NA 1B31A 1XGZA 3RJXA 3VDCA 3WUBA 1NWRA 3WBAA 4PCSA 1BPLB 2ZUVA 5M03A 2CEQA 2UWFA 3DYPA 1VBUA 2NT0A 4UFIA 4NRRA 3SCWA 1H11A 3T2QA 1LLOA 1QVBA 3GH4A 5E9AA 1GNXA 1VRXA 4GPNA 1E3ZA 4PCTA 1SMDA 5I24A 3ARUA 1EHAA 2ESCA 1PPIA 4OBRA 3PTKA 5A3HA 2W61A 2WPGA 2OYKA 3CBWA 3AMDA 2W63A 2VOTA 1UR1A 1V6UA 4PTWA 3CZGA 3PBGA 1C91A 3KE0A 1D7FA 3QHNA 4TVUA 3AHTA 4IM4A 2XVGA 1J0JA 4ZE5A 3BMWA 3RM9A 1NP0A 2V3GA 1DWFM 1W2PA 1KWGA 1MWOA 4ZXOA 1E15A 2E9BA 3VD5A 4DWSA 4HPHA 1H0IA 4RE3A 4AD1A 1FHLA 1B30A 3N17A 1UQYA 3ZOAA 4JCLA 1WZMA 3W38A 1H49A 5IXEA 3FXYA 4CD4A 1V0LA 2MANA 1OINA 3M07A 1TCMA 4M1RA 2DSVA 3U5YA 1UWSA 5HOSA 5CJ5A 3G6LA 1F4HA 2X0HA 1US2A 4U31A 3T09A 3OZPA 3UCQA 1E5JA 4J27A 3WDPP 4PTXA 4DUVA 2VT0A 5CSYA 2VCCA 4LX4A 1NOWA 1R85A 3J7HA 3PZUA 2FGLA 2BV9A 3WMCA 2D0FA 3GXIA 3BGAA 3K4AA 1RPKA 2YL5A 1GVIA 3F5LA 1E4NA 3RMEA 4BQ4A 1GW1A 3EDFA 1E1FA 4QLJA 3A4XA 3AZTA 3CPUA 3BAWA 3T2OA 1FH8A 1IV8A 1GONA 3W29A 5CGMA 1JZ2A 4TVDA 2WSKA 2VRQA 4L4OA 4ML4A 1E72M 3WDIA 1UH2A 5HBFA 1QNRA 2WMFA 3RPMA 1W1YA 1K9TA 2DIEA 4P8XA 4XZBA 2JF6A 2UY5A 3BSGA 2WHKA 1W9PA 3GH5A 3SCUA 3B9DA 1C8QA 1DWAM 4Q22A 1E70M 1Q6FA 3LPPA 5E6ZA 1C7SA 2V3DA 3WFZA 3GXDA 2PI6A 3K1DA 1Q4NX 3VO0A 2YL6A 1BVNP 2YOCA 1E6ZA 2XWDA 4AD3A 2WLYA 3KEHA 2J7GA 6A3HA 3FY1A 1Q6GA 3II1A 1XCWA 2WLZA 1LJYA 1E56A 3A4WA 4AD0A 5AC5A 3AIBA 2PWFA 2VQUA 3VM7A 1V08A 2WBGA 1H1NA 1E73M 3WUFA 4D71A 1KQZA 1FP8A 5LYRA 5A94A 4YHGA 4W86A 4OOZA 5DT7A 2D0GA 1HJSA 3VX1A 1OIFA 2QPUA 1JXKA 1WDSA 2YA2A 2WBKA 3VIIA 4U33A 2WMHA 4Z2LA 5CG0A 3BCDA 3PZ9A 4P7NA 3RILA 4A3YA 3OLDA 5E70A 3WNLA 4BA0A 3CLWA 1TVNA 2DDXA 3O6AA 4MADA 2J7HA 2W91A 4CN1A 1UA7A 3AHZA 1V3KA 3AXIA 4P8UA 3B8SA 4J3VA 1BYBA 1HIZA 3EDKA 3N04A 1XYFA 5KZ6A 1R8LA 4MNKA 1CGUA 4JL2A 1LL4A 3WF2A 5A6SA 5JIWA 2XIIA 4W8LA 3UG4A 3ARTA 3BLKA 1KGXA 1CNVA 1XSIA 1BF2A 3VIOA 3K8MA 1EO5A 4B15A 1OSEA 2A3HA 4Z2KA 4RL3A 3GXFA 3CUGA 4W7VA 2VRJA 3L4ZA 2VR5A 1E3XA 1HKMA 2YDRA 3KWXA 2FH6A 4WIWA 2EBNA 3DYMA 1GQKA 1E9LA 5LA1A 2WVSA 4DUWA 2TAAA 3SEPA 2QLYA 1HP4A 3WFLA 1JYVA 4U2YA 1AVAA 4XUYA 3VIJA 1CGVA 3W37A 4H2CA 3OLGA 3KL5A 4GZJA 1JI1A 5M3WA 3AOFA 4GIAA 2VX6A 2WB5A 4DM2A 2ZUNA 3VDAA 2VX5A 2C0HA 1E0WA 1TE1A 3CHFA 1HVQA 4XZWA 1UWUA 3CZJA 1JD9A 1TVPA 4D72A 3WD4A 4L4PA 4YHEA 4UQAA 3S2CA 1ZBWA 2JE8A 1B9ZA 3AQUA 1GHSA 4F9JA 4C7DA 4GI9A 2V3EA 4C7GA 1FFRA 1K9FA 1IT0A 1RP9A 2EXOA 5DMYA 1JNDA 4TTGA 3ZJ8A 4WKFA 4PMOA 3ALFA 3CUHA 2FHBA 2XFYA 2ZX8A 4Z2JA 1AQ0A 3VIMA 4JFSA 5A8PA 2CBIA 2A3CA 3AIRA 1JD7A 3CO4A 3IAPA 1C93A 1BGAA 2ZX7A 3D3AA 4BQ3A 1QHPA 1SMAA 1VFUA 2ZXDA 4KMQA 1C7TA 3E1F1 3MV11 4KRUA 1FH7A 2YBTA 1A47A 3DECA 4WK9A 2ZUSA 4PMZA 3W82A 1EIBA 2GVYA 2OWWA 3CIVA 6TAAA 4UFKA 5A6JA 1GJUA 2CPUA 2EPMX 2CHOA 1V3MA 1UG6A 4JFWA 5CPQA 4H8VA 2HVMA 3L4YA 3SUWA 3POCA 2BFGA 5FCZA 2FHFA 3UR8A 4WSKA 1GPFA 4KRTA 5M17A 4K68A 1KBKA 2G4FA 3OIHA 3VIFA 3B9AA 4R5EA 1X6LA 3FAWA 1UR2A 3MKKA 2CKRA 3AIEA 2D3LA 4HZ6A 1WNOA 3NSXA 1LWJA 3TA9A 4AXNA 1NWTA 3ARRA 2E9MA 4CU7A 2YA0A 4HMCA 4JKLA 3OGSA 1QI5A 4UCFA 1J01A 2D2OA 4AZBA 2GK1B 2Q8XA 4H7VA 4MB3A 3CMGA 2XG9A 2PC8A 3MMDA 1V02A 3CZKA 2BY2A 1Y7VA 3GBDA 1ISXA 2PB1A 4D6JA 1BTCA 4GO9A 1MFVA 2UY4A 1RP8A 1CEOA 1QI4A 1Z32X 3ARVA 4HU8A 4PMYA 1E40A 4W7WA 3EDDA 1XH2A 1QW9A 3WDJA 4QAWA 5A1AA 2QF8A 1GORA 1C8XA 5BXSA 1V3JA 3WD0A 1PEZA 3BAXA 3QGVA 2F2HA 1B2YA 1J0IA 4E8CA 2BNJA 2WMIB 1R7AA 2D23A 3EDJA 3T0AA 4JKKA 1LF1A 1L0PA 4AD5A 1HJXA 1W3HA 2BVTA 1KWKA 3MSGA 1GUVA 3W25A 1KFWA 3PZGA 1NM9A 1PBGA 3AMCA 3SUUA 1JZ8A 2E4TA 1V3IA 4X0VA 1WAWA 2VZSA 4MJ2A 4QFUA 3F5KA 1HKKA 3FAXA 1V02E 5D8WA 2WK2A 5A8OA 3BCFA 2J8FA 2JEPA 4M80A 3F5JA 2V3FA 1EDQA 1X1NA 1MW3A 2F8QA 1L8NA 3NUKA 3WD1A 5FL1A 4AZ7A 1I1XA 4EKJA 1O7AA 4HP5A 2ZX6A 2Z1KA 1W2VA 2ZICA 3AHYA 4XB3A 4CU6A 1QNSA 9CGTA 4LGXA 4D6HA 3SUTA 3VM5A 1ZBCA 4J28A 1CDGA 1GZJA 1UR4A 5HDRA 4LXFA 5E09A 4CD7A 3NDZA 4X9YA 4DWSB 4UOQA 4W89A 4AIUA 2YLAA 2WMGA 2VC9A 4GI8A 2J7FA 4GKLA 1PIFA 1ECEA 1I75A 1EQCA 2J25A 4UQBA 1TA3A 1UOKA 2VVNA 3OZOA 1UYQA 4M82A 1DWIM 3CZ8A 3IJ9A 1JI2A 2C8NA 2VRKA 1EDGA 4Q7NA 1W3LA 4JCMA 1WKYA 3IJ7A 5AY7A 4D6CA 1J18A 1DTUA 2VX7A 4Z2GA 3N13A 3O9NA 2OYLA 5ABFA 2WC4A 3VX0A 3AS3A 4TX8A 3AJ7A 1QHZA 1WZKA 3WDRA 4AD2A 2VJXA 2PBGA 3VGGA 1SFSA 3ZJ6A 1PX3A 2Z1SA 2ZWZA 3WL0A 1CWYA 3ARXA 3WH8A 3W81A 4FK9A 4LQ1A 2X8RA 1GQJA 4OUEA 2XFFA 3WF0A 3QHMA 1E4LA 4H41A 1B3ZA 1GOWA 3VD3A 3W53A 3PZMA 4J3UA 1GQIA 1UZ1A 1W9XA 2IUZA 3BLPX 4H8UA 3EMCA 2WVVA 3GZAA 5C71A 2J47A 2E3ZA 4PBGA 1AQHA 1TFVA 4PYSA 1CYGA 3I3DA 1XSKA 3WF3A 1CBGA 2GJRA 1CIUA 2V38A 1CXEA 5FL0A 2WKLA 1MQQA 4AIOA 3WEMA 2YDQA 4GI6A 3FHQA 2YL9A 1KXTA 4TTUA 2WW5A 4W5ZA 4CN4A 2DH2A 1V0KA 4YN5A 2ZUMA 1EA9C 2CITA 1M04A 2J78A 4JKMA 1M01A 1G9HA 2DH3A 3U5UA 4EAMA 3VVGA 3WD2A 3L4VA 1AQMA 5D9NA 4WF7A 3DHPA 3CUJA 6CGTA 1K6AA 4AZGA 1HF6A 1VEMA 3ZT7A 1E55A 2DIJA 3WQWA 1E0XA 5IFTA 4BCEA 5A8QA 3L4UA 2J75A 1JFXA 1QNQA 4IUGA 4AZIA 2GUYA 2A3BA 1J11A 3UESA 1CENA 3ZR6A 1BHGA 4JFVA 1B90A 3AIVA 1QBAA 1CXIA 4E4PA 2BHUA 4FMVA 1XSJA 2DSKA 2J7EA 3BAYA 3IANA 4AZCA 1C8YA 1KR1A 5HPOA 1D2KA 1V6YA 4NSBA 3WEZA 5JBFA 2VTFA 3AMKA 4PUDA 4D1JA 4IISA 1SYTA 2ZE0A 1K9DA 1G5AA 4ACZA 1G01A 5E0FA 3RO8A 1LWHA 1QNOA 1BYAA 1UD4A 4WKHA 2QMKA 1GOOA 1LG1A 2XPKA 4B3LA 4BF7A 3MUIA 3WDQA 2EPLX 3UERA 1GOKA 1EOMA 1Q6DA 3ZSTA 2XUCA 3T0BA 2W92A 1DWGM 3GNPA 4ATWA 4X0NA 5D9OA 3ZO9A 4BZYA 4JL1A 3ZT6A 4TOQA 3AIQA 4AY1A 5IHRA 3K8LA 4ATLA 2EPOA 4D1IA 1EH9A 5BYWA 3MS8A 1FH9A 4QP0A 1YQ2A 1W1VA 2Y24A 2ZUWA 2BY3A 2DSZA 1VBRA 1IZKA 3U57A 4QCFA 3VUPA 1ISWA 2Y8VA 4W7UA 4CCEA 1JAKA 4PMXA 5CXPA 4JZ5A 3SUSA 1WE5A 1CXFA 3VDBA 2PWEA 2DT0A 1WO2A 5A8MA 1AMYA 2JF7A 3AHXA 4OIFA 3UETA 4LYPA 1PX8A 4F79A 5CPSA 3AMLA 3BXWA 4CGTA 1XRVA 3KL0A 4H8HA 4OZOA 3W27A 3WUGA 4NI3A 5A8NA 2J74A 2E8ZA 3VINA 2VZTA 2NSXA 1NH6A 2CYGA 2XGBA 5EMYA 3AS2A 1J9YA 4RE4A 1BYDA 3GM8A 3PTMA 5HPCA 3TP4A 1WCGA 2CXGA 3CMJA 3ZSSA 1I1WA 4CU8A 1E6NA 4MTVA 1OT1A 2YJQA 4PN2A 4AMCA 1JYNA 3SCPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1G0C A;  1CGW A;  3WNO A;  1FFQ A;  4CVU A;  4B16 A;  1E0V A;  3AIS A;  5I0D A;  3HN3 A;  4BQ2 A;  4M56 A;  2DT2 A;  3WQ8 A;  2PWD A;  3VNY A;  3GNO A;  4R27 A;  4PMN A;  2XVP A;  2AOS A;  1DHK A;  4MB5 A;  3HU7 A;  5JIP A;  1FA2 A;  1JXJ A;  4PEE A;  4CVW A;  4JHZ A;  4U5K A;  4LYQ A;  5DFA A;  3ZM8 A;  4ATD A;  2WC7 A;  4J3S A;  4EK7 A;  1O6I A;  4UZU A;  3SIM A;  4HPG A;  3M46 A;  3ARO A;  2QMJ A;  1E4I A;  3M7S A;  1FHD A;  2D22 A;  3A4A A;  3K8K A;  3T0D A;  1GVY A;  3U7V A;  1CXH A;  3BAI A;  1VJS A;  2OWX A;  3HMC A;  3AIU A;  4A4A A;  1S46 A;  2GJX B;  2ZX9 A;  1MXD A;  1H5V A;  1B0I A;  1JZ7 A;  2YDS A;  4FLR A;  1JL8 A;  3AFB A;  5EFF A;  3WH6 A;  1OIM A;  3ZIZ A;  3WEL A;  1UWI A;  5CPT A;  3OLE A;  3WUE A;  5EB8 A;  3THD A;  1JG9 A;  5BCA A;  3DHU A;  4QCE A;  5BXT A;  3IJ8 A;  4N42 A;  3MUY 1;  2WCA A;  4UOZ A;  7CGT A;  1NWS A;  3GXM A;  1NP2 A;  2WMK A;  2BHY A;  1KCL A;  1E43 A;  2ZXB A;  3BAJ A;  4UQE A;  2FHC A;  2D24 A;  2GSJ A;  3ALG A;  2YIH A;  3PZN A;  3I3E A;  1MVY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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