3NLBA

Novel kinase profile highlights the temporal basis of context dependent checkpoint pathways to cell death
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
266
structure length
261
Chain Sequence
VEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKRENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
publication title Context-dependent cell cycle checkpoint abrogation by a novel kinase inhibitor
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 261
sequence length 266
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3nlbA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3nlbA01
4BYJA 4IAAA 5CT7A 3F9NA 3FYJX 3NS9A 3TV6A 1G8SA 3AXWA 3VJNA 4L42A 1YXVA 5IH6A 3U87A 4OLIA 3UC3A 1REJA 4E4XA 5JFXA 4ANNA 2J5FA 4Z16A 4X0MA 1OIYA 3POZA 1YXSA 4UV0A 3S1HA 5IQHA 5G6VA 1P2AA 2GTMA 2CKPA 3HA6A 2XEYA 3WZJA 5I4NA 2WELA 3PSCA 4IM3A 4RVTA 4FBXA 5B2LA 3KRLA 2VO3A 2VWIA 4CQGA 3QWKA 5E1EA 3RAHA 3L9NA 4G6NA 3KXNA 4O7VA 4L46A 4RFZA 1IG1A 5LMBA 2AYPA 2F7XE 5FM3A 4RFMA 3UQFA 3UTOA 3FMLA 3Q9YA 5HCXA 4ANMA 4B9DA 4FGRA 3DDQA 4ZSEA 3QD4A 1FGKA 4F9WA 5CS6A 2PUUA 4NWMA 2GHMA 5A46A 5DEYA 3VUIA 4EH5A 4D2WA 1OPJA 3LCKA 5DNRA 3C4ZA 4FYNA 5CANA 4TPTA 5HVKA 5CU0A 3H30A 4IMYA 4WSQA 5B7VA 1J1BA 2BZHB 4GL9A 1RQQA 2ZDUA 3C0IA 3D9VA 3RGFA 3V5QA 5T3QA 1KE5A 2HYYA 3R2YA 3R7IA 1WMKA 3HA8A 3QALE 4IJPA 2BROA 4JQ8A 4Y95A 5HG9A 4FC0A 1DI8A 4XG6A 3NUYA 4QTBA 5E8SA 3TCPA 5KBQA 5IQDA 4UMRA 1AD5A 4RA4A 3DS6A 4DEGA 5IEXA 1W7HA 2B9HA 4RIWA 3VS1A 1WBNA 3CSVA 3ALOA 5DBXA 3FQEA 4O7RA 5HD7A 4F0IA 2ZDTA 3FDNA 4G1WA 4N6ZA 4GH2A 1BMKA 3D5VA 3OWJA 4IW0A 4I5PA 3EL7A 3NVMB 5AEPA 1Q8TA 4TYJA 4XCUA 3SAYA 4BCKA 4DTBA 1KSWA 4R3RA 2JDTA 2QQ7A 3QQKA 1OL7A 4FSWA 3VUHA 4AT5A 3LFAA 1AGWA 1X8BA 1J7IA 2EB2A 2BHHA 3PY0A 3BYVA 3ZLYA 3DK3A 1ZY4A 5ANOA 4USFA 2UUEA 3FUPA 3PA4A 5K5NA 2C0OA 3FSFA 3MIAA 2VWXA 4FR4A 4IX3A 4X3FB 5EDPA 2QNJA 4BTKA 4CRLA 4EH6A 4I3ZA 3F61A 3EFJA 4U6RA 4V0GB 3H0YA 4M0YA 5HVJA 4BDEA 2NPQA 2AUHA 5CF8A 5HO7A 5B2KA 4EOJA 3TWJA 5JGDA 4GMYA 4MKCA 3CCNA 3GU6A 3GBZA 5L8KA 1Y6BA 2JDVA 3QF9A 2R4BA 5AP2A 1WBWA 3SKCA 4FTOA 1CKIA 4CV8A 5J7BA 2VTSA 4U97A 1R0PA 3SOCA 3FHIA 1YXTA 4ZEGA 3ORTA 2W17A 3QU0A 1YDTE 3E88A 4BDIA 5TT7A 2RKUA 4PPBA 3OC1A 3QTSA 4BHNA 2HELA 3FMDA 2JBOA 1LEZA 3P7BA 4L6QA 5E90A 3V5LA 1CTPE 5HE2A 5HX8A 2C3IB 3NYXA 4A9RA 4MQ1A 3D7ZA 2OXXA 1ZYSA 5CU6A 4FVPA 1B38A 4JBVA 2WMXA 3DBFA 2B9JA 5D1JA 3RK5A 2YM5A 3P9JA 4JIAA 4QMMA 3E93A 4KSQA 2UW4A 4HOKA 2F57A 4O0RA 4ALUA 2VX3A 3EQDA 1RW8A 5LJJA 3KN6A 4X2KA 2P55A 5AUVA 3W1FA 4DA5A 1Q5KA 2WKMA 3KXMA 4O7TA 2VTNA 3PWDA 1MRYA 3VBXA 3VW8A 3ZO2A 1YOJA 5HIBA 4ZJJA 2PMIA 5JGBA 4L52A 3NUXA 3E62A 1OL6A 4U79A 4WIHA 4DGGA 1OBDA 3CTJA 5DR9A 5AP5A 2EUFB 2REIA 4I94A 4QPSA 4ZLZA 5DEWA 3WE8A 3OOMA 5EKOA 2ZJWA 2QOCA 3KA0A 4UB7A 2VO0A 2A19B 2R3RA 2J0MB 3HUBA 3CY3A 4AX8A 4OTRA 2VUWA 2UW0A 3BGQA 3GU7A 3PRFA 3F7ZA 2QLQA 4YZBA 3UIUA 2OJFE 5GJGA 3ZMMA 2XK4A 2VNWA 3C9WA 4FKWA 2GNLA 1H1QA 1H24A 4AQCA 4G34A 4ONAA 4RZWA 5M51A 2QOBA 2BIKB 3PRIA 2QURA 3HX4A 4RIYA 4BTMA 3EZVA 4UX9A 3V3VA 1XH6A 2KULA 4TN6A 4LL5A 4ANOA 2ZM3A 4PMSA 4QP9A 3UDBA 3WF6A 3P86A 1G8AA 3O51A 4CKRA 4BWXA 3W16A 4EYJA 3UP2A 3IW8A 5AR3A 5CQWA 4EOPA 2YFXA 5B0XA 4DFNA 1UWHA 2ERKA 1PXIA 2OIDA 4R6VA 4IACA 3RALA 3IECA 2QCSA 3WARA 1JKTA 2C6MA 3QXPA 3F69A 4JDIA 1GAGA 3BHUA 3BHYA 5E1SA 3NNWA 5EM6A 4CFVA 2FSLX 2XMYA 4J96A 4YZCA 4W8DA 4LUEA 4MYGA 3FAAA 1ZMUA 3EL8A 4XHKB 3E5AA 4R1YA 2OIBA 2VO6A 4PPAA 3D2IA 4BCQA 4B8LA 4AA5A 4OUCA 3G15A 3OXIA 3U6JA 2NRYA 3PPZA 2PMOX 3C5UA 4HPTE 5FRIA 4H58A 1LPUA 4FV4A 5HESA 3VS3A 2PVJA 4TWPA 1JBPE 2PVYA 2YM6A 2BAQA 3R8VA 3DPKA 2R5TA 1Q8YA 2QVSE 3LFSA 4KKGA 1VZOA 1U5QA 4U44A 1OL1A 1XBBA 1OB3A 2BALA 1WBPA 4IB3A 2PPQA 3IW6A 4AGWA 5EM8A 1H4LA 4CCUA 4GIHA 3L1SA 2PUPA 2QR7A 4R8QA 5AIKA 2ERZE 4A07A 5M07A 3VQHA 3WZUA 3G5DA 4H3QA 4ZZOA 5DGZA 4K18A 2WTWA 3AC1A 5C1QB 2C4GA 4W4WA 5CSHA 4DCAA 3GNIB 3FMKA 4S33A 5HCZA 3JR1A 5D7AA 3TUDA 1OVEA 2VAGA 4IWDA 1OPLA 3ODYX 4K0YA 2HAKA 4UXLA 1U46A 4FKLA 3WIGA 5EQEA 5CU4A 2PVFA 4YPSA 2Q0BA 4R5YA 4FKGA 2XNEA 3CBLA 3W2OA 5D9HA 4FE2A 4BI0A 4I6QA 2H6DA 5LWMA 3LFNA 2WNTA 4CCBA 2XF0A 2O5KA 4J7BA 4KA3A 3SRVB 2IN6A 4BF2A 1H0WA 2R7BA 3OTUA 3TUBA 4GRBA 3ZBXA 2BRNA 3EN7A 4RFYA 4ZJVA 4NFMA 3OVVA 4QMWA 2PWLA 3QTRA 4IVAA 4O86A 4C02A 4FSNA 3ZRKA 4GU9A 3NLBA 3D5UA 3R7YA 5DPVA 2LGCA 4QTEA 4BDBA 4M67A 3TZMA 4X2NA 5CI7A 3ET7A 4I6BA 4J71A 3PVWA 4RIXB 5I9ZA 3KKVA 4EQUA 1ZWSA 4TZRA 2WD1A 2Z7SA 5J5SA 2V22A 2B0QA 3KXHA 3GQIA 5IQIA 2ETRA 2WEIA 1ZARA 3EH9A 4QT1A 4RX8A 5EHLA 1R0EA 3RZBA 4DINA 4ENXA 2Z02A 4FKVA 4MCVA 4F09A 5I0BA 4BC6A 2WFYA 2R3PA 3GCUA 2WXVA 3KF4A 3MFRA 2V7OA 4I22A 3B8QA 3ZFYA 4JRVA 4AZWA 4B4LA 3IKAA 2C68A 1OUYA 2XK6A 3A62A 3QYZA 4HVDA 4YHTA 2PL0A 5AP0A 4G5PA 5DT4A 4ANQA 4YJRA 3BV3A 4NW6A 1URCA 3MPAA 3P23A 4FSRA 3OCBA 2ZAZA 3MWUA 3IK3A 2JAVA 3PG1A 3ZYAA 3HV5A 2XBJA 4ZTLA 2NNWB 5FG8A 3A7GA 3UQGA 4XBRA 3DFAA 1MUOA 2F2CB 5ETCA 3MIYA 1UKIA 4I21A 4X3FA 2R3LA 2YIRA 4M15A 2R0UA 2QR8A 4M97A 3DB8A 2GFSA 4OAUC 4MEDA 4HYHA 2NO3A 2G9XA 3RAWA 4V0GA 3GQLA 4L01A 5AJQA 5BMMA 1UNLA 5CU2A 5KE0A 4EHZA 5EFQA 4D4VA 4FIFA 3DV3A 3UYSA 5HX6A 3C4CA 3ENHA 4PY1A 3VNTA 4U8ZA 2XYUA 4MH7A 3ROYA 1BLXA 4TY1A 3BHHA 3D0EA 4FEXA 1S9JA 4RLKA 4E1ZA 4UALA 4M7IA 4Z7HA 4GU6A 5H2UA 1OM1A 4FA2A 1SYKA 2YWVA 1KOBA 3R9NA 1IRKA 4Q9SA 3R9OA 4HVHA 4AFEA 2F4JA 4Z3VA 3Q52A 2OXYA 3TTJA 1O9UA 2YABA 3GCVA 1RE8A 5ACBC 3QQGA 2Y4PA 4BDFA 4X2FA 2C1AA 3WF5A 3PJ1A 3QD2B 5F95A 4YHJA 3QRKA 2FH9A 3VW6A 4NM5A 3T9TA 5CX9A 4AS0A 5AP6A 5BMSA 4FGBA 4KWPA 3LJ2A 5IQCA 3EMGA 3POOA 4NIFB 3ZBFA 5GZ8A 3FMEA 4GT5A 4ZP5A 3O8PA 2W06A 5A9UA 5JQ8A 4LFIA 4N70A 4MF1A 2A1AB 4D2RA 4O7NA 3OCGA 4KABA 1PXJA 3OG7A 4QYGA 5ICPA 2B7AA 4ZS0A 1MQBA 4FV7A 4GT4A 4LMUA 2PZPA 2JLDA 2OH0E 3MBLA 2WQBA 2DS1A 1WVXA 3QTUA 5IPJA 1IASA 3PXZA 1WFCA 3R8ZA 2HENA 3RM7A 2WAJA 1JVPP 1M2PA 4JXFA 4BKZA 2F2UA 4FT9A 4WNPA 5EI8A 2CKEA 3V5TA 4WUNA 4ZSLA 4S2ZA 1PMEA 5DLSA 1BKXA 3N9XA 3V8WA 3E87A 3EN9A 2GNJA 5HG5A 1PYXA 3KVWA 3GI3A 1YOMA 2I0VA 4QO9A 4JX7A 1OL2A 3A60A 4IEBA 3HMPA 5IG1A 3CP9A 4ZLYA 4U0IA 3PJ8A 4YNOA 1KE9A 1LUFA 2R3IA 3HVCA 2BDJA 3MJ1A 4KAOA 5CQUA 5EYKA 5H8EA 4ITJA 1G3NA 3A4PA 4L45A 4G2FA 4O6EA 5EM7A 4FF8A 4H1JA 5M4FA 3NRMA 4F99A 2FA2A 3JYAA 3FV8A 2O3PA 1SNUA 3WBLA 3LQ5A 4MXOA 4M8TA 3EKNA 3PXRA 4IDVA 4P2KA 5IQGA 4BBFA 3DU8A 4JBOA 4KIPA 3ZFMA 3FQSA 4K1BA 4O7WA 2OIQA 4MXAA 3UPZA 4JBQA 4CFXA 4FEWA 2C6OA 4YC8A 4DGOA 3I1AA 4H3PA 3EYGA 3SDJA 5M4IA 3FI3A 1NVSA 4NM0A 2X9FA 4L53A 3C50A 4FOCA 2J9MA 4APCA 3BIZA 1OITA 4FV2A 2WMQA 2RF9A 2YLFA 3MFUA 4TTHB 3VS7A 4DG3E 4O0XA 3MESA 3FZTA 4BGHA 1PHKA 3CTQA 3UOLA 5KNJA 3G0EA 5FP6A 4RVKA 1T46A 2XA4A 2BFXA 2RFEA 2ITWA 2XJ2A 4QMNA 5E4HA 5HE1A 3R8LA 3W8QA 1FQ1B 1QL6A 4C35A 5LVNA 1GIHA 2XM8A 2G01A 3B2WA 3H10A 3LE6A 3MN3A 4IBMA 3RCDA 2VTAA 5AAEA 3RZFA 4UN0C 5IUHA 5LXMA 3RKBA 3Q9ZA 3TM0A 4FICA 1L3RE 1V1KA 5HNIX 2OO8X 3OXZA 3Q4CA 3W2SA 3LQ3A 2BRHA 2XNMA 2QG7A 4PMMA 3WZKA 3VWAA 1CM8A 2P0CA 3WYYA 3DKGA 4C2VA 4DGLC 1Y8YA 5IA1A 3F3ZA 4Z9LA 5L2IA 1JKKA 3QAME 4EH9A 1J7UA 3GFEA 4YHFA 2PK9A 3VJOA 1YXXA 3HRFA 1CSNA 2WMBA 4FTIA 3DK6A 3SRVA 3FSKA 4WOVA 4O21A 3D7TB 4TWOA 2VWVA 5GZ9A 2CNQA 1ZLTA 1E1XA 2O8YA 2UVXA 4FIEA 4M66A 3W10A 3Q5IA 2WMRA 5K5XA 2YAAA 2HIWA 3L8PA 4FMQA 3BYMA 4EZ3A 2V5QA 4FKPA 1SM2A 4BL1A 4RIXA 5C01A 4YURA 3KMWA 1REKA 2PVNA 3UO6A 2XNPA 3GCQA 2YCQA 2YEXA 3FPQA 1P4OA 4LM5A 4XP3A 3MB7A 5CY3A 3BEAA 3PSBA 5IA2A 5BYLA 3FXXA 2OI4X 4C38A 4D0WA 4CSVA 5HI2A 4GFMA 1F0QA 4O6LA 1YI6A 3TTIA 2QKRA 5CEQA 4ASEA 2VGPA 4XP0A 2CGUA 3R1YA 4EK4A 3LFBA 1PW2A 4ID7A 4YJNA 4OT5A 1MRUA 3EN4A 1ERKA 1PXPA 5JZNA 4D5KA 4X21A 4ACGA 2IW6A 4Y72A 4EK8A 4O0SA 4YJOA 3QXOA 3LJ0A 4KBCA 4LMNA 5JFWA 4L3LA 3FQHA 4XG7A 2RG5A 2CLXA 3CLYA 4KBAA 5EI6A 2BZIB 4HVGA 4RJ6A 4D2VA 3RPOA 5J9LA 2J0IA 2YERA 4FKIA 3ZXZA 4BGQA 2VO7A 5CEPA 4BIEA 4EBVA 4U81A 1U4DA 5LMAA 1YI3A 3D14A 5BUJA 2JDOA 3MA6A 4IAIA 2C6TA 3TT0A 5A4QA 4P90A 2W5AA 4D4RA 4Z7GA 3ZDUA 4AW0A 4BRXA 4I0RA 3IDBA 4ZXTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4BYJ A;  4IAA A;  5CT7 A;  3F9N A;  3FYJ X;  3NS9 A;  3TV6 A;  1G8S A;  3AXW A;  3VJN A;  4L42 A;  1YXV A;  5IH6 A;  3U87 A;  4OLI A;  3UC3 A;  1REJ A;  4E4X A;  5JFX A;  4ANN A;  2J5F A;  4Z16 A;  4X0M A;  1OIY A;  3POZ A;  1YXS A;  4UV0 A;  3S1H A;  5IQH A;  5G6V A;  1P2A A;  2GTM A;  2CKP A;  3HA6 A;  2XEY A;  3WZJ A;  5I4N A;  2WEL A;  3PSC A;  4IM3 A;  4RVT A;  4FBX A;  5B2L A;  3KRL A;  2VO3 A;  2VWI A;  4CQG A;  3QWK A;  5E1E A;  3RAH A;  2XAM A;  3L9N A;  4G6N A;  3KXN A;  4O7V A;  4L46 A;  4RFZ A;  1IG1 A;  5LMB A;  2AYP A;  2F7X E;  5FM3 A;  4RFM A;  3UQF A;  3UTO A;  3FML A;  3Q9Y A;  5HCX A;  4ANM A;  4B9D A;  4FGR A;  3DDQ A;  4ZSE A;  3QD4 A;  1FGK A;  4F9W A;  1OGY A;  5CS6 A;  2PUU A;  4NWM A;  2GHM A;  5A46 A;  5DEY A;  3VUI A;  4EH5 A;  4D2W A;  1OPJ A;  3LCK A;  5DNR A;  3C4Z A;  4FYN A;  5CAN A;  4TPT A;  5HVK A;  5CU0 A;  3H30 A;  4IMY A;  4WSQ A;  5B7V A;  1J1B A;  2BZH B;  4GL9 A;  1RQQ A;  2ZDU A;  3C0I A;  3D9V A;  3RGF A;  3V5Q A;  5T3Q A;  1KE5 A;  2HYY A;  3R2Y A; 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