3NM1A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
539
structure length
507
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGVTLVQIREKDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPVDYIGVGTLFPTLTKKNPKKAPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGYSATETRLLLNNLLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSTNGTSVEDIPCVAVEAGPIGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
source organism Candida glabrata
total genus 162
structure length 507
sequence length 539
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nm1A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nm1A02
3M0ZA 1KM0A 4FIQA 1SSDA 3PB0A 1DVJA 3C8FA 4KBEA 1H5YA 5G4WA 3PUDA 4O50A 2FQIA 3TH6A 4A21A 4K9IA 3UD6A 1W1ZA 3F03K 3TW7A 3MBFA 3QPZA 1H7PA 4XF6A 2H6RA 5D30A 3QJAA 4E69A 3M47A 4OT7A 3H54A 4JTFA 3SY5A 4KWVA 3RTAA 4XZ9A 5AOUA 1B57A 1GVQA 4JDBA 4XBKA 3LM7A 4WOZA 1JULA 3Q92A 3V1PA 4ZQOA 3TJLA 1YDNA 2NWRA 4YXGA 3BG5A 3UQNA 5C54A 3ELFA 4OWGA 3Q94A 4NZJA 3KRZA 3IVUA 2TYSA 1OK6A 3W1TA 3OEXA 3G0XA 4WJEA 4NQ1A 3W7KA 4Z1BA 3W23A 3LOTA 3PBWA 4HNNA 1YHJA 3NVTA 2E1DA 1L2UA 1KM2A 1WV2A 3R2GA 4OQVA 1TYGA 2XN1A 3VE9A 1K02A 3CWOX 3BGJA 4JX6A 5K4ZA 3K30A 3LX9A 1FWRA 3CPRA 4UC5A 3MJYA 3W1UA 3UQ9A 3N34A 3RT7A 3IN1A 5LHEA 5TQLA 1XKYA 3PL2A 4AXKA 1X6UA 4WY0B 4XWUA 4R53A 1KM3A 2YGYA 3GO7A 4XKYA 1VLIA 2X1TA 4GUHA 4PL1A 3CEPA 1TD2A 1ZAIA 3RRJA 2JG5A 1ADOA 1TTJA 5CZSA 1OABA 3W4SA 4TMCA 1EKQA 1EB3A 4YMZA 3AJXA 3HIJA 4FHAA 3LB0A 1Z41A 4AAJA 4KFPA 4WOQA 4ZQRA 1OX5A 2C15A 1L2LA 3W74A 2J24A 2H8XA 1KW1A 3N2XA 3RF9A 1LTDA 1QNVA 5HJLA 2B7QA 1GVFA 3L67A 5D09A 1OYAA 5D2WA 3W76A 4LOCA 4LS1A 4N08A 4UFJA 2XFWA 4IQLA 5EYNA 2OCZA 1VHCA 5CZTA 3GB6A 3TROA 3M9YA 3B06A 1D3HA 2NXHA 5DLCA 5C40A 4OV9A 5EPDA 2P10A 4UFMA 4FX7A 1UBSA 3QZEA 4NU7A 2A7PA 4X3ZA 5D2VA 3IGSA 3FJ6A 4DF2A 1ZENA 1H62A 3CU2A 1QPRA 4TU1A 1V1SA 4A22A 3PVFA 1TQXA 1RVGA 3GXNA 1LIOA 3UMOA 3E49A 3WFAA 4JTTA 3UWVA 1NFBA 3GXTA 2Y7EA 4AWSA 1FWWA 4DF0A 2CZEA 2Q8ZA 3GYEA 2YFOA 5D04C 3NNTA 3S5YA 4EVZA 1MEIA 2QCHA 4IOTA 3N14A 3P8IA 3G3MA 3BV4A 4ALDA 4O57A 5C3ZA 3O6YX 2ABAA 2OT0A 3U8GA 2ZA1A 3RFAA 4I7WA 4MY1A 2H90A 4LRSA 3MYOA 4PFMA 2ZBTA 4CNPA 2DZPA 2C0AA 3RNDA 1K7XA 2LLEA 1LM1A 4Y9AA 4NX0A 1Z42A 4LCAA 2CU0A 4I7UA 3UQEA 1W3NA 5HWNA 1A5BA 3UWZA 1GOXA 3EXSA 3KX6A 2Y7GA 3WK1A 1KTBA 4XF7A 3R89A 3HBLA 1YTKA 3S8HA 3PAJA 3W7LA 5LNSA 1YGJA 1W5MA 3NQ8A 2FB2A 2PC4A 3W7HA 4DBDA 3LRKA 1F2JA 1HTIA 3BW2A 1JQXA 1SO6A 4MJMA 2I6BA 3L5LA 2QDGA 4UMCA 5K9CA 3PBYA 2VFHA 4NNBA 1WX0A 2ZRXA 1LIKA 2AB8A 1KFLA 2IQTA 3MUXA 5EY7A 2I14A 3C56A 1F6PA 4CCCA 3I68A 5HWJA 3S42A 2G97A 4WX2A 3HG2A 4HN4A 3W07A 3W73A 4LT9A 1GTEA 3DFSA 4FNQA 3NQMA 1PV8A 4QAIA 2VEKA 3TQKA 3S0CA 2F84A 1XM3A 3EX4A 1JRCA 2WQPA 3T78A 3QQ1A 5BNKA 1A5CA 1MXSA 3CIXA 3UY7A 3N19B 1JUBA 4GRSA 3BF5A 1TCDA 1D9EA 3G1HA 4QNEA 2I6AA 3GDLA 2YYTA 1DBTA 2NX3A 3JR2A 4PTNA 2HMCA 2B0MA 1TV5A 2DZXA 3C52A 3M6YA 1U2XA 2QCCA 4O12A 2YXTA 1D3GA 3B1PA 3SGUA 1PHWA 1VM7A 2C16A 4WQ6A 1ZFJA 2QCDB 3G24A 3HOJA 2ZTJA 3WK2A 5G2IA 5EL1A 2JKPA 4QIUA 1JQVA 3BW3A 4J9JA 1OJXA 1O95A 3IGUA 1KA9F 2V2HA 4O4WA 3NC9A 2PKFA 1EUAA 4RV8A 1MSSA 2Z6IA 4GE8A 4JTHA 4H3DA 4FIRA 3JULA 3ABRA 5IM51 1TZ3A 2R14A 2V5LA 3H55A 3TFCA 3KVKA 3MI3A 5HR6A 4C5LA 4HPXA 2VENA 3Q2DA 4K37A 4ZQCA 1JCNA 4R33A 3BLEA 2DZUA 2C18A 3UZJA 1OFRA 1W54A 2BLEA 3HQ1A 2GVJA 2DJXA 3TK7A 1RKDA 2R3EA 1NAL1 4NNAA 1Z44A 1I2RA 3ATYA 3DFOA 2V2DA 3PM6A 4MKNA 3W22A 1ICQA 2J6XA 1YDVA 2Q3OA 3GXPA 5KTLA 5F1VA 1EIXA 3BLFA 4B8SA 2E6FA 2TMDA 2E5CA 1VQTA 4ZMGA 2DZSA 1W5QA 1TIMA 1WXJA 1HL2A 3O6DA 2JGVA 1ME7A 3PUOA 4XUGA 1SR9A 4HSNA 1L6YA 2R8WA 4WXZA 4NXSA 3RSFA 3G8EA 1TPFA 4QM1A 3A5FA 3RS9A 2FFCA 4M19A 3NL3A 4POCA 3WJXA 4C5MA 4M6PA 1UCWA 1TPEA 3NL2A 2EKCA 1OG0A 1K7FA 3OTXA 1F5ZA 2F02A 1T0OA 3VNDA 3PUEA 1WA3A 3W1PA 1IGSA 2XN0A 1JXIA 3WJZA 3PSWA 1EA0A 3S5NA 3A22A 3PSVA 1I4NA 2NUYA 3U2OA 1OFDA 2NWSA 3GIYA 4DPPA 1I2PA 1TMHA 2VELA 1K8YA 3TAKA 3TFXA 2QR6A 4O19A 1UA4A 3GO6A 4OGZA 2A9YA 1XDMA 3W7DA 1OFPA 3LGEA 5MHBA 2RH9A 3NA8A 1VS1A 3NO5A 3MW7A 3BVJA 4MZ1A 1KFJA 1YDOA 4NNCA 3RLVA 1IXQA 3W3OA 4LU0A 3I6RA 3NC2A 3KTNA 3C2VA 1PL9A 3M5YA 2CFFA 3LCLA 2NXGA 5D33A 4HIBA 3GAKA 4KAHA 3FOKA 5EKYA 4S1IA 3M5ZA 3I7SA 1OHLA 5F11A 1EKKA 3HG4A 4Z1DA 4Y90A 1QFEA 2CLMA 5IBXC 2C49A 1RFVA 3W6YA 1XI3A 3T44A 1T96A 3B0UX 1YPIA 4LY8A 4MFDA 3PY2A 4Y6GA 1JUKA 1XXXA 4ZL1A 2FIQA 3KVJA 4Z08A 3RTCA 1RQHA 3EX3A 1K8XA 4L4MA 5AB3A 1QPNA 4DU5A 2I1OA 4PEKA 4ADUA 1QOPA 3NQGA 3QM3A 4GNJA 3NG3A 2YW3A 3TR2A 1PVNA 4AHOA 3UY8A 3W1NA 5BOOA 1NSJA 1FWTA 1P5BA 3RT9A 2CLFA 4MYXA 3TKFA 3RRFA 4EIVA 3SECA 5AHEA 3KXQA 3QW4B 1LRQA 3LLFA 2YX0A 3P84A 2RBCA 3TIMA 5CPMA 3KZHA 1LDCA 1F73A 4YWIA 3G8RA 3LJSA 1OFAA 4JTEA 3A23A 3RM5A 2WJZA 3M5VA 5BYEA 1AW5A 1R2TA 3DGRA 3LV6A 3PULA 4KFOA 1XDLA 4UXDA 5G4EA 1DJQA 1JUEA 1FCQA 1WQ5A 1ESJA 1ZNNA 2ZA3A 3JS3A 4HPJA 4I9AA 1QWGA 2PCQA 5FF4A 2DORA 1LORA 3SGZA 5DBUA 3UWUA 3EWXA 4AHQA 4PVVA 4HSOA 1J5TA 1B3OA 3KHJA 2A9ZA 4JR5A 3G3DA 3RQHA 3IKHA 2E5BA 3UPBA 5AHLA 2Y85A 3UNDA 3RQXA 2HS8A 3N1CA 2YSWA 1FCUA 4BF9A 3PZSA 4PODA 4Q33A 3T40A 3A5VA 5G1YA 3UWQA 3PWAA 4BI5A 4AMAA 1OF8A 5BMWA 3NL5A 2Y70A 1VCFA 2W0UA 4JTUA 4TMBA 2A7RA 4XTDA 1DV7A 4MY8A 4PH6A 1GQNA 1SQ7A 3W1RA 4EWND 3STCA 3TU9A 1X7FA 4WY0F 4FX6M 3LHTA 3W7OA 4LS2A 2V9DA 3H74A 3UBOA 4UTWC 3FS2A 4LVGA 4N4PA 3M41A 2VARA 3S1VA 1OX4B 4YWRA 4UUIA 2Y89A 3ANYA 4JX4A 2DZTA 4UNKA 3W71A 1M7PA 4FEZA 2A1YA 2Q5RA 3NQ7A 3O63A 5KZDA 3W7CA 3STGA 2QJHA 5DN1A 4YCOA 3LERA 3IE7A 1VJIA 2EGZA 2VFDA 4K8PA 1F76A 3FJLA 3QC3A 5DXXA 2X30A 2GQAA 3PG8A 2PRHA 2CLIA 4IPIA 2D73A 1TV7A 3QEZA 3E0IA 5AHMA 5AFDA 5K2ZA 1LOLA 3MYPA 2QAPA 1OFOA 3RREA 5I3KA 3SFKA 3HPSA 3NQEA 4LNYA 4O1GA 1BTMA 2V82A 3IV3A 1EPXA 2V5BA 3HGRA 3MHGA 3W7PA 3B04A 5CKSA 5E93A 3LHWA 3VE7A 3GK0A 1TPWA 1H7RA 4IMCA 1LCOA 5F1UA 4LRTA 3E12A 5I3IA 4LVAA 3RO4A 3TXZA 3LV5A 3KEUA 4O10A 2ZCGA 1H7WA 3MO7A 4X8FA 3KRSA 3HGOA 2CLEA 2EHHA 4ZZ9A 5ABTA 1YXDA 3HGSA 4N4QA 3UQDA 4LV4A 3M5XA 2E77A 3UZ5A 1TREA 1FBAA 3HG5A 4M7TA 4U7XA 1NVMA 1KBIA 3RTGA 1KV5A 2DDWA 5TIMA 1H51A 1W5OA 4LBXA 4DELA 3ABQA 3NQCA 2VFIA 1FUYA 4JICA 1W8SA 1GYLA 2PRMA 3W2MA 4XDAA 3WJWA 1LBLA 4JY8A 5K9XA 3S1UA 5K4XA 3RQ5A 4WUIA 3GX9A 5I3JA 2BWGA 1H1ZA 3C0JA 2Q3RA 4LWWA 1GG0A 1RPXA 1Q6OA 1Q45A 1T8XA 1RR2A 2ATMA 3PC0A 3DXIA 3FA5A 5F2GA 4P61A 4HHPA 3P80A 3T4CA 1Y0EA 4MZYA 1ZAHA 5F2MA 3B05A 3MHUA 2B7NA 1P0NA 3QMRA 4UIOA 3W7MA 1KFCA 1ICPA 3GKAA 4ZVJA 3ZFHA 5LNUA 4JN6A 2E09A 2X2GA 3UWWA 4JIQA 3W7IA 4BI6A 3WK3A 4OV4A 3GKFA 4UTUA 2WKJA 3QSRA 3HF3A 3ZR4A 1VZWA 2O7QA 2VOMA 1H7XA 2YXGA 1GT8A 4XBSA 3S1WA 3B1OA 5D02A 2AQWA 4EBUA 2HW1A 3NQDA 2WOQA 4N9BA 3CB8A 5AN7A 3CQDA 3C6CA 1UB0A 2E6YA 2JG1A 2TSYA 6ALDA 3USBA 4BR1A 4WXYA 3O06A 4UR7A 2ISWA 1J4EA 3W7QA 3L0NA 2FDSA 1JCMP 1EEPA 1S5TA 2B7PA 1RV8A 3ABSA 1H61A 4ZQMA 3DFQA 2AAMA 3EWUA 1VC4A 2C1HA 2VKZG 4A2SA 3C61A 1WOAA 1ZCOA 1PCWA 5AC6A 4KWWA 3MBHA 2RKXA 1YADA 3HGJA 3VI2A 1TJPA 3MP3A 4W9TA 1K3UA 4K8KA 2WSRA 5HMSA 1V5XA 5DY2A 3LDVA 5CSRA 5C55A 4K8CA 5J5RA 1SW7A 5HINA 2Y88A 4K8EA 4C1LA 3IEBA 1DOSA 1G4PA 1GTHA 3GDKA 4MUZA 2NV1A 3RSQA 3TQVA 3LLDA 3EWBX 4DPQA 3NZRA 4OE7A 5EMUA 1O5XA 3L0KA 1B9BA 1IF2A 1L9WA 4ONVA 2FPVA 4M5PA 5C2XA 3SIZA 2WNZA 1QDSA 2CLOA 4L4LA 4MY9A 4GM6A 2BZNA 3GAYA 2Y63A 2YR1A 1F05A 3LXAA 1A5SA 2NZLA 4HNVA 3GDRA 4LBGA 1TPB1 4CNNA 1RKAA 1TB3A 2A85A 2CZ5A 1VCVA 2A0NA 3P5ZA 5A5WA 4FNRA 5HULA 4GUFA 2FLIA 3LCHA 2W6RA 5B6AA 3LCFA 3NQAA 3B3LA 5LSMA 1FDYA 1KLYA 2V30A 3LI0A 3PR2A 3S5ZA 4K8HA 3GZ3A 4BWLC 5D03A 3SSJA 1WOBA 3CLMA 1FWNA 3DKJA 3BPWA 4DO6A 5I3GA 1ZALA 3LXCA 5BRBA 1H60A 1V7YA 2WO5A 5G1TA 3RSSA 4N9EA 3LBCA 1MZHA 1W37A 3DBPA 3P81A 4JTSA 5E1QA 1YPFA 3P61A 1VYRA 1Q3NA 4FNSA 3OHIA 4K7YA 3VFLA 3MI6A 1O94A 3P67A 4FNPA 1YXCA 2OJPA 4JTIA 2ZRVA 1WAUA 1G4EA 4KFNA 1PHQA 2C13A 5F4WA 3O15A 3MHFA 3TCEA 5AYYA 3W7JA 1RK2A 8TIMA 1MO0A 4S1HA 5HR7A 2V2CA 3DENA 3STFA 3MP4A 2QCFA 5HNRA 4NJHA 1C29A 1OK4A 1AMKA 1W5PA 3UWYA 4I7VA 4JNMA 2C14A 3W7GA 2QJIA 5C41A 3EWZA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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