3NQ2 | Genus

Total Genus 96

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	96
sequence length	249
structure length	247
Chain Sequence	DLKASSLRALKLMHLATANDDDTDEKVIALCHQAKTPVGTTDAIFIYPRFIPIARKTLKEQGTPEIRIWTSTNFPHGNDDIDIALAETRAAIAYGADGVAVVFPYRALMAGNEQVGFDLVKACKEACAAANVLLSVIIETGELKDEALIRKASEISIKAGADHIVTSTGKVAEGATPESARIMMEVIRDMGVEKTVGFIPVGGVRTAEDAQKYLAIADELFGADWADARHYAFGASSLLASLLKALG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	deoxyribose phosphate aldolase
publication title	Optimization of the in-silico-designed kemp eliminase KE70 by computational design and directed evolution pubmed doi rcsb
source organism	Escherichia coli
total genus	96
structure length	247
sequence length	249
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2010-06-29

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3nq2A00

2FTPA 3MP5A 4TMBA 3KVJA 2V8ZA 1W5NA 3W7OA 3O6CA 4NX0A 4NQ1A 5HQEA 3P5YA 5I3HA 1VRDA 2ABAA 1SR9A 3G0SA 4MFEA 5AYZA 5HWMA 2RHGA 3GKAA 3QFEA 2QDHA 1I45A 3KFTA 3PBVA 4FNSA 3P8IA 1WX0A 3UZ5A 4ZQOA 2A5HA 3WJYA 4O17A 3P81A 3HO8A 1GOXA 2C18A 3STCA 1NVMA 3KVMA 2B7QA 2Y63A 3W3OA 3TJLA 2FJKA 2QKFA 4ORMA 3LBCA 3LTPA 5D02A 4PH6A 1H62A 1LOQA 2VFHA 2QDGA 4O1DA 3HG5A 2NWRA 1IIHA 1I2QA 2FB3A 1M7OA 1GG0A 3NM1A 2CLMA 4KFPA 2ZYFA 3C2OA 4JTEA 3E96A 4H4IA 1P0NA 4O4VA 3TQ0A 2X1SA 5F2IA 3GNDA 1B4KA 4O52A 5FF3A 2FPVA 4JTGA 2OCZA 3TQKA 3W23A 3NYZA 2NXIA 1G7VA 2X1UA 4NNCA 4LUIA 4A3UA 4BFAA 3LHZA 4QQ3A 3NL2A 4AWTA 2QEZA 2H3DA 1UUMA 1RZMA 2BX7A 1GPWA 5E0KA 2PRHA 3N2MA 3NQFA 4GFSA 4M7SA 1K03A 2EF9A 1G69A 4JTUA 4LVGA 3NQGA 3DH7A 4E2BA 1QOPA 4CQ8A 1V5XA 1AW2A 3BK0A 3LXCA 3W22A 3FEMA 1NSJA 4MZ8A 1DQXA 3DI0A 5DCDA 1O5KA 3HJZA 4JYEA 5H2ZA 1OF8A 3NQ8A 4GUJA 4K36A 4NJKA 3QSRA 3G1HA 2GPTA 4DF0A 1EB3A 3MHGA 3WJXA 1GVSA 4GBUA 1Q45A 5DXXA 4TMCA 2P10A 1GJPA 4WY0F 2EHHA 1H7XA 4M6PA 1LTDA 1FX6A 2XN1A 3DBPA 3L68A 3NVTA 2YXGA 3EWWA 3HGSA 3OVRA 1JCXA 3LTYA 3TW6A 3W7RA 2Q8LA 2ZFAA 1FQ0A 3B8DA 5FF7A 4PL2A 5KITA 2OT0A 2CW6A 1GVOA 2WPBA 1OG0A 4DF2A 3NQCA 2CZEA 3S0CA 4IX2A 1EP2A 4MYXA 1TIMA 3D0CA 1UCWA 1VC4A 2B7NA 4FHAA 3UWWA 5BMWA 3IVTA 3GR8A 5IBXA 3ZR4A 6ALDA 1NF0A 3I7QA 3KRZA 1VZWA 2FFCA 3RLVA 5DCEA 3T44A 4MZYA 1YLVA 4LVAA 2RDUA 4AAJA 4JTHA 3GDKA 4MLJA 3ATYA 4NNAA 5E93A 3LM7A 4MYAA 4WOZA 3NL6A 4QJ1A 5D32A 2FPYA 2JK2A 2JBMA 4O53A 1QOQA 1KM6A 1QPQA 2BTMA 2J6XA 3OVQA 4IMGA 3DKJA 4N6EA 4BI5A 2CLFA 1GEQA 1D9EA 5EMUA 4HN4A 2ZZ2A 1K7EA 3W85A 3TSMA 3UD6A 2UV8G 1ONRA 3GKFA 1HFBA 1W56A 4LU0A 1QFEA 5DCBA 2PRLA 3NDOA 5A5WA 1R47A 2QCFA 5AC6A 1AG1O 1W5OA 2JKAA 3CWOX 3UZJA 3C2EA 5E1QA 1UUOA 3LCHA 3QMRA 3DFPA 1ICQA 4LY8A 3S5NA 4HNUA 1QNVA 1KM1A 1H61A 4C1LA 2NWSA 2Y85A 5HWNA 3EKZA 5AC7A 2C1HA 3L9CA 4AF0B 5BNKA 4UFKA 2VKZG 1N8FA 1MSSA 3DHFA 1L6SA 4AWUA 1HL2A 5G2WA 4FX8A 2NX9A 1J2WA 5HINA 3CEUA 5C6MA 2E6YA 1CI1A 3SR7A 3JS3A 2E1DA 1NAL1 1JCLA 3H54A 3IIZA 1YDNA 2NUWA 3M43A 3IGUA 4CCDA 1TPC1 5IM51 3MYOA 1OFOA 3MBFA 3W1UA 3HG3A 4EIVA 2X1RA 3LLDA 4B5NA 1O4UA 3QF0A 2CLOA 5KZEA 2WQPA 1JUBA 4AMAA 3G1XA 1TV8A 1DHPA 1R2RA 3UWQA 3C4UA 3PBUA 2O7QA 2A21A 4GXMA 5D37A 4WY0B 4P61A 2CLHA 3PY2A 2NV2A 1HTIA 1KM2A 3L21A 2TSYA 5F4SA 4POCA 1DV7A 4WZHA 2A7PA 4O28A 4LVBA 4OHQA 3N14A 2YPIA 4JYDA 4S1FA 3PB0A 3R5EA 1I2PA 1GG1A 3QQ0A 3TE9A 1GVQA 4UTMA 2CZDA 4LV9A 2Q3RA 4BWLC 3QW4B 4NUWA 4RV8A 3CQ0A 5I3GA 2QCDB 1RQEA 1VYRA 3GX9A 1JUEA 1IIGA 4OE7A 4QISA 4LS2A 3W9ZA 1Z41A 4HHPA 2GVJA 1H51A 2QCEA 3B03A 4AHOA 4KWVA 4CCCA 3BLFA 2VEIA 4ML9A 1CX9A 2Z0IA 1UBSA 2A0NA 1FCBA 5H91A 3BG9A 3G0XA 4ICNA 4D2JA 2V5LA 3S1WA 5EKYA 4Y8FA 4UTLA 5D05A 3C2RA 3SY5A 4K8HA 3EWUA 1SQ7A 3THAA 1LYXA 4NXKA 1MO0A 4AXKA 4R53A 2CLKA 3G1AA 2FIQA 1OX5A 4A22A 2AQWA 1W3TA 2ZZ4A 3CEPA 4DO6A 5D30A 1VCGA 2W79A 1JCYA 4JX4A 4QSHA 5FESA 2ZCGA 3W7DA 3E49A 5U4NA 4LC8A 2NUYA 3QRHA 4ADUA 2R91A 1IXNA 5LNUA 4GE8A 1TTJA 1QPRA 2BLEA 1XCFA 1BWLA 3MW7A 4JS3A 1T99A 5EL1A 3THQA 4PTNA 3LERA 2PURA 4AEOA 1YADA 4H3DA 4XZ9A 2DZXA 3UWZA 1LZOA 2C13A 2NX3A 4NJGA 1A50A 4FNUA 3KRSA 5K7JA 3CHVA 6TIMA 2OT1A 1QPOA 3W74A 1G4PA 3GXTA 4JEQA 3T4CA 5CZJA 1ADOA 3O15A 1JCJA 4JTSA 4NJIA 2WO5A 3DKLA 1KTNA 2G95A 1Q6LA 2NLIA 3AO0A 2TRSA 4FNQA 5LNVA 4JGDA 1JQXA 2HSAA 3NO5A 4R34A 1TPB1 1KV5A 1RD5A 4U28A 3TW7A 1EEPA 1O94A 3BW4A 3QZEA 2J27A 3ZS4A 3LLFA 3NNTA 2VENA 4JIQA 2CU0A 3IVUA 4NU7A 3V75A 3OIXA 1TPWA 5F4XA 1K8XA 1WXJA 2Q8ZA 3W71A 3A23A 2V2CA 2G5WA 4NXSA 3I65A 1S3HA 3M0ZA 3OG3A 5HMSA 3GDMA 2KZHA 5BMXA 3WK3A 4XTDA 1S5WA 1ZENA 4Y96A 3UY7A 1ZHAA 3M1ZA 4TR9A 2XFWA 4DF1A 3PWAA 3TKFA 3TFCA 1SO4A 5HUPA 3B04A 3Q37A 4GJ1A 2E6DA 2ZZ3A 2WKJA 2EGZA 2ZQ0A 3S5YA 4QIUA 4N9DA 4WUIA 3B0PA 2Z6JA 3DI1A 3QC3A 4M7TA 3GNNA 4Z1AA 3W70A 1FY6A 4AF0A 1OYBA 3O6YX 4IJBA 1ME9A 1MEWA 3P84A 4DXVA 1ZAIA 2RH9A 4FEZA 1FWTA 1ZALA 4MZ1A 2Y88A 3W7LA 1KBIA 2A7RA 7TIMA 5AHFA 1NF7A 3M6YA 3BG5A 4IOTA 1LOLA 1VS1A 3TROA 3BO9A 4ZQRA 2DZWA 3L5AA 4RJEA 3TSBA 2BWGA 1YXYA 3N73A 3G8RA 1KFBA 3GIYA 5AHLA 3TH6A 1H7WA 1S5TA 3HB9A 3N19B 1ZJIA 4LW7A 3N9SA 1F2JA 2NX1A 4RX0A 2V0TA 5EYWA 2QCMA 1M5WA 2CZ5A 1KV8A 3TXZA 3NA8A 2FPTA 4R7JA 3MJYA 5AFDA 1ZCOA 2QCLA 1R46A 4MY9A 1OFQA 3UPWA 3LCWA 4PEKA 3DFNA 1PHWA 1GYLA 4U4MA 1I2NA 5F1VA 3E0IA 3MI3A 2I1OA 4K7VA 1PS9A 4WD0A 5DN1A 3S5OA 2RDTA 1W54A 1H1ZA 2V82A 2QUTA 2QCDA 3OBKA 4JTTA 1A53A 4CCEA 5F4WA 1YDVA 1WOBA 2YGYA 1TV5A 2PC4A 3O63A 1G4EA 4LTSA 3CM4A 4NVTA 3VFLA 1LBFA 3DGRA 1OK4A 3PUDA 1YPIA 4X2RA 2NUXA 3G1FA 1FWSA 4HNVA 1ICSA 1U5JA 2CLIA 3G3MA 4O16A 4UTWA 1LROA 3VKJA 2ZBTA 1OJXA 3FJ6A 3VCRA 3M47A 4O8RA 2CLEA 3W7PA 4IPJA 3FYPA 4UTHA 1OX4B 1N7KA 1SU5A 2B4GA 3QJAA 1EUAA 1ZFJA 3TIMA 5G1TA 3RK8A 2WSQA 4IMEA 2OZ0A 3B4UA 3BW3A 5IBXC 4ZQNA 4FNTA 1SSGA 3NPXA 3UXDA 1KFJA 1FWWA 1H60A 3M5VA 3U2OA 1O60A 5HNRA 4K38A 5FEXA 3W7NA 2YYUA 5G1YA 5AHMA 1AW5A 4GUFA 3QPZA 3TR2A 2NV1A 1G6CA 3EWXA 3DXIA 2YW3A 1PE1A 4NJHA 3GAKA 3GAYA 3NM3A 2J9XA 4GUIA 1A5CA 3HBLA 4UFLA 1MZHA 1JRCA 1IXQA 3EB2A 4WOQA 1FWNA 5J5DA 3NAVA 4EWND 1ZNNA 3USBA 3C61A 1KFLA 2X2GA 2CLLA 1K8ZA 3W1LA 1NFBA 3W07A 1O5XA 2E09A 2XN2A 3F4NA 1AK5A 3M9YA 5HWJA 1FCUA 2JKPA 3LI0A 5D38A 1C8VA 5T26A 5LNSA 3LHUA 3FKKA 1XI3A 4HT3A 1XXXA 2CFFA 1TJPA 5K9DA 3CTLA 1VR6A 3B05A 3P60A 1TYGA 3EXRA 4UR7A 2C14A 2ISWA 1JVNA 2JKEA 4ZQMA 4RKAA 2E68A 1ZAHA 3QW3A 1FCQA 3SSJA 1EP1A 3QMSA 3S5ZA 4UTTA 1H7RA 3HGOA 3MMTA 1DVJA 1TV7A 1KFEA 2A4AA 2ZTKA 1F5ZA 1C29A 3HGRA 3IVSA 1OYAA 1B9BA 4Z1DA 2X16A 3PAJA 2YFOA 1SO3A 3BGGA 3CPRA 1AW1A 4N9EA 3I7RA 1X7FA 3L0NA 4H6KA 5FEZA 4FXSA 1TPEA 4PODA 1LP6A 3C6CA 3EKLA 1F6PA 3W1QA 2BSLA 4E38A 5K9CA 1TSIA 4O57A 5HULA 2ZA3A 3PBWA 4ORIA 4OBTA 3OEXA 4RXFA 2VEPA 3NEVA 1P0KA 3UXAA 4LS0A 3IGXA 1HUVA 1SW0A 2HTMA 3NXFA 2DP3A 4EOUA 2A7NA 1W37A 2QUUA 2FQIA 1OYCA 2C15A 3QMTA 4UFHA 5K4ZA 3MP4A 4N2YA 2QCNA 3CB8A 4YLWA 5TIMA 2C19A 3MI2A 5C2XA 3FIGA 3MUXA 3V1PA 4UMAA 1LRNA 3EWBX 1PL9A 4GWEA 4K6AA 2IQTA 4HSOA 4LNYA 3TV8A 1B57A 2DZUA 1JJKA 1LDCA 1QWGA 4JY9A 3CLMA 3FFSA 3RF9A 1DORA 3LCGA 4O19A 4Q32A 4UFJA 5DXYA 4IXHA 5G5IA 2Y7GA 4BI6A 3PUEA 4PC8A 1EIXA 4IWWA 1WQ5A 1M6JA 5TBOA 4ZZ9A 3P5ZA 2VXNA 3QM3A 2E5DA 2J9ZA 2YFNA 1GWJA 4X22A 3KVLA 2WNNA 3RU6A 4UNLA 2J9YA 3PVFA 4RLIA 1SSDA 3PSWA 1UJPA 4GUGA 5D2VA 3P82A 5C5YA 3FKRA 3C56A 1OVDA 1YTEA 3A22A 1VH7A 1FDYA 2Z6IA 1YTKA 1UB3A 5KZDA 3L65A 3STEA 3NR0A 3TXVA 4HIBA 4K37A 4XTIA 4RK8A 3PR2A 3W7QA 4ONVA 3SFKA 5C54A 3C2FA 3SI9A 2PE4A 3W2LA 1PCWA 3TX9A 3NZ1A 3W73A 3TU9A 3GZ3A 4UMBA 5D2YA 3S9YA 4UIOA 1KLZA 1AMKA 3M44A 3EX6A 4XKYB 3ZWTA 3G3DA 5CZTA 2DZPA 3PG8A 4XQ6A 3I7SA 1XDMA 4UUIA 4LC6A 3MP3A 3E9AA 3L0GA 5KSWA 3NQVA 1ME7A 2GQ9A 5KINA 5AYXA 1OX4A 4O50A 1L6YA 3LBMA 3NL3A 4ADTA 3ATZA 4W9TA 4NX5A 5AHEA 2VOMA 2TMDA 5CGQA 4AHPA 3RNDA 1H5YA 3ELFA 3GK0A 5I3FA 3WK1A 3B0VC 1J5TA 1JUKA 2RFGA 1DKWA 4BK9A 5DY3A 4KWWA 4FO4A 1K7FA 2NXHA 4MFDA 2DU2A 1Y0EA 3OVPA 4YCOA 3TK7A 1PHQA 2A85A 3E12A 5DBUA 5G2IA 5FF2A 1U83A 2NZLA 1FUYA 4JX5A 4IMDA 5F2GA 2E5CA 4OGZA 3LCIA 2ZRYA 4AVFA 5MHBA 3AJXA 2X30A 4LV4A 3LRLA 2QF7A 3SGZA 1LBMA 5U7SA 5EY5A 4UTIA 1GQNA 1VPXA 3CWNA 3HIJA 5BRBA 3NOEA 1G7UA 4I7WA 3EWZA 3ABSA 3BGJA 1O95A 4OWGA 5K9XA 5D2TA 2YZRA 2C6QA 3O16A 1WV2A 4JNMA 3UY8A 2NXGA 4IX0A 3WK2A 1F76A 5G4WA 4JX6A 4QM1A 3S42A 3EX2A 2ZA1A 1EP3A 2ABBA 4GC4A 2J24A 1BKSA 1TCDA 3N34A 3S8HA 5K4XA 2WSYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3NQ2A

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