3NSM | Genus

Total Genus 185

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	185
sequence length	572
structure length	572
Chain Sequence	EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTFHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERLVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	N-acetylglucosaminidase
publication title	Structural Determinants of an Insect {beta}-N-Acetyl-D-hexosaminidase Specialized as a Chitinolytic Enzyme pubmed doi rcsb
source organism	Ostrinia furnacalis
total genus	185
structure length	572
sequence length	572
ec nomenclature	ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date	2010-07-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00728	Glyco_hydro_20	Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A	PF14845	Glycohydro_20b2	beta-acetyl hexosaminidase like

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3nsmA02
3.30.379.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Chitobiase; domain 2	Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like	3nsmA01

1C3FA 3HU7A 1V3LA 2DIEA 4MB3A 3AIRA 3GM8A 2GK1A 1KQYA 4FK9A 5I2UA 3WQ5A 4UQAA 4D1JA 3AHXA 2VR4A 3AISA 3AMKA 1V6WA 1QNSA 1V3KA 1TE1A 1VF8A 2PB1A 2XPKA 1BF2A 3AHTA 3T09A 1GORA 1BQCA 1JD9A 1JDDA 3UCQA 4M81A 2D1ZA 2XFFA 3CBWA 3L4YA 1W1YA 1FH8A 2D24A 1QVBA 2VCCA 3G6LA 3WDRA 3MUY1 3ARTA 5HXMA 1HJXA 3N18A 5JUVA 1UKSA 2W92A 3UESA 3PBGA 1E4NA 1KGXA 5DT7A 3BCDA 1OCQA 3VX0A 4UOZA 2ZXAA 4BZYA 2EPOA 4TXEA 4EK7A 2Q8XA 2GJPA 2J79A 1H3GA 3WH8A 4GQRA 4LYRA 1LLOA 3VNYA 4TOQA 4U3CA 5M17A 3SCNA 4CD6A 2EEXA 4RE2A 1E6XM 1C8XA 5A8QA 4HZ6A 1JZ8A 3EMQA 4W85A 1HXJA 4HU0A 2VVNA 1BPLB 2E40A 2ZXBA 1JZ5A 3GNRA 2DH2A 2VMFA 5HBFA 1GHRA 3NUKA 1PBGA 3AIQA 5A94A 4QAWA 5EMYA 3VD3A 1J0JA 1VFMA 3PZVA 2WZHA 1B90A 3IJ9A 3RMEA 2CCRA 1CXEA 1BAGA 5C71A 1AQHA 3M07A 1OSEA 4TX6A 5FIPA 3SCPA 4FF5A 2CYGA 3POHA 2VZVA 1MFUA 1WDRA 5GPRA 2J4GA 4V2XA 5D4YA 2FGZA 3UEQA 3QOMA 3WD0A 1W9PA 5IHRA 1E9LA 1MXDA 2XUCA 3BC9A 1HVQA 2O9PA 5CLTA 5BCAA 4D72A 3GTNA 1R7AA 3CHEA 3MANA 1UWQA 3PZ9A 1KXQA 2BHZA 1HJVA 4AZCA 1I75A 3ARXA 5A8NA 7TAAA 2V5CA 3N12A 3WNMA 5A6SA 1CWYA 1ZBKA 2VOTA 3W6LA 3ZMRA 2ZIDA 2XIIA 4UFIA 5HDRA 1EQPA 1MQPA 4A3HA 5IDIA 2PBGA 4UZUA 4W8LA 3GH7A 2F61A 2VRQA 4XZBA 4DUWA 1VBUA 1AQ0A 1SYTA 2VRJA 1CPUA 3WQVA 1E0XA 1J01A 2YL8A 5JIPA 1CDGA 3WF0A 1G5AA 4AY1A 2EPMX 1UR2A 2BHYA 2AMGA 2YLLA 1OGSA 2G41A 1JGIA 4ATDA 5FD0A 2YL5A 4XV0A 5AYIA 4JCLA 2WM0A 3WUBA 4AD5A 2W62A 1WZMA 2VZSA 4CKQA 3VUPA 1IV8A 2RGMA 4PTXA 3CIVA 4C91A 2PC8A 1GNXA 1TMQA 2XJ7A 4P7OA 4IISA 3VMOA 3T08A 4AZIA 3AMLA 2XYLA 2WSPA 1HIZA 4D6EA 3CUGA 4JFUA 1CXIA 3L4XA 5E0CA 5DT5A 1H4PA 1CZ1A 3VD5A 1E73M 1UR4A 1CTNA 2XM2A 1QNQA 1WP6A 2UY2A 1G9HA 1QI0A 2E9LA 4P7QA 1D2KA 1EHNA 1C7TA 1X1NA 4M80A 1JG9A 1XH0A 3PZNA 4ML4A 1QHZA 4JFTA 2OSYA 2YOCA 3WDPP 3RILA 2QV4A 3ARWA 1E55A 1AVAA 1BLIA 3AMGA 1J10A 4K68A 3I3EA 5A8MA 5BWFA 1CEOA 3OG2A 2CHNA 4MAZA 3TOPA 1UOKA 1LWJA 1B30A 1EH9A 4CUCA 1ODUA 1BYBA 2WYSA 4UFLA 4LYQA 2WK2A 5DO8A 4JL2A 4LYPA 1PZ3A 2VX7A 1UWRA 1VEOA 2WMIB 3N11A 1UR9A 2ZX8A 5I24A 3IAQA 5EBAA 2AAAA 1NOFA 2DT0A 2E8YA 2QMKA 1GUVA 3K4AA 1F4HA 1CYGA 2WSKA 3T0AA 1NP0A 2VNCA 1LWHA 1B9ZA 3SUUA 1UH2A 4IPLA 4BA0A 3WNOA 3F5LA 1JIBA 4KRUA 1O6IA 4QDMA 7CGTA 1FH7A 1VIWA 4H04A 3CO4A 1L8NA 4ACZB 1W9UA 3WH5A 1UD6A 2VC9A 1C93A 4D6CA 1C7SA 3EMCA 1ZBCA 4OIFA 2WB5A 3AMDA 9CGTA 3SCQA 1J0IA 3GDBA 1FHLA 2BVTA 3K8MA 1WB0A 1XD1A 4AD2A 1VB9A 4HMDA 4HMEA 1XRVA 3PZOA 1XH2A 2WNWA 3WMCA 1WAWA 4BQ3A 3T2QA 4FLOA 3PZQA 2YJQA 3VVGA 1QI4A 5A69A 3K8LA 4BQ4A 2VUYA 5A95A 4P8UA 4H8UA 4HA4A 1OD8A 3BSHA 4U3AA 2DT2A 4YHEA 3AS2A 2J62A 4MNMA 8A3HA 1VBRA 1PZ2A 5I23A 2F2HA 3IK2A 3ARSA 3GH4A 3ARUA 1DTUA 1K9FA 2VQTA 2D0GA 2PF0A 3CZKA 3OLDA 3WH7A 4PSRA 3PZIA 2D0HA 4D6IA 3U7VA 2WZEA 2WLYA 4AW7A 5GNXA 3GH5A 2C0HA 2EJ1A 4HOZA 1OB0A 5HNNA 2BY3A 1HX0A 1US3A 3TP4A 3ZJ7A 2ZXQA 1H5VA 4IUGA 2XWDA 2GJRA 2VX4A 2Z1SA 5D8WA 2ZOXA 1XC6A 3ZO9A 4F66A 3BLPX 5AYBA 1B31A 2G3IA 2GVYA 2XVPA 2YL6A 4Z2GA 5C8BB 1CGTA 5A2BA 3AZSA 4B16A 3DYMA 5A8OA 3T0BA 5I6SA 4TTGA 1E71M 5CXPA 1IZKA 3GBEA 3VIFA 3DC0A 2WLZA 1XSKA 1EDTA 1VJSA 1WDSA 4PCSA 3AIVA 4R5EA 3QGVA 3GXIA 1TR1A 1D3CA 4AD0A 3VGDA 1X6LA 2BFGA 5EFDA 4CN6A 2BS9A 4RE3A 1GHSA 3AXIA 3ARRA 1TG7A 3RJXA 1Q6GA 1UQZA 3OLEA 1JFHA 3TA9A 2X1IA 1J18A 5ABGA 2A3HA 3WBEA 1OGGA 3VGGA 4UNIA 3VIJA 3NIYA 5ABFA 3VKKA 3VD4A 1MQQA 2DQXA 3W26A 1LL4A 3LPPA 2VX5A 1BHGA 5A2CA 1QNPA 3W24A 4B15A 1UZ1A 1UR0A 1V3JA 2EPLX 1JZ2A 1HJUA 3PTKA 3AZTA 2JEQA 7A3HA 1E1FA 1XHGA 3CGTA 3WKZA 3OGSA 5A6AA 3MUAA 3WNNA 3HMCA 4BF7A 2GDVA 3ZM8A 2W67A 3CHDA 4PTMA 1WZAA 3AOFA 3MSDA 4BQ5A 2WC3A 2OWXA 1PAMA 4F8XA 1HNYA 4B3LA 3WQ6A 3U5UA 1V3HA 4AISA 1CGYA 4CD8A 1JDCA 2A3CA 3VIGA 5I78A 1MXGA 1BVZA 1JI1A 1PPIA 4HP5A 3RIKA 3WMSA 3AS0A 2G8ZA 4C7DA 2VRKA 3MKKA 2G4FA 4MNJA 2E9BA 1ISWA 4WKHA 1JXKA 1CXLA 1MQRA 3RM8A 2W4XA 3WF4A 1DWAM 1R8LA 2D23A 4RE4A 3VTRA 4CVUA 2DSVA 3A4XA 3QHOA 3THCA 3WD1A 3WUGA 3K8KA 3PHAA 1V0MA 3WDIA 1Z32X 1V6VA 1QBAA 3A6OA 4U5IA 3FAWA 2DIJA 5FL1A 3WEZA 4RL3A 1JZ7A 3MMWA 2GSJA 1PX8A 4H8HA 3WN6A 1TA3A 4W5ZA 1HJQA 1OBAA 4NZCA 4H8VA 3CZEA 4MNLA 1Q6FA 4JFSA 5M03A 2WWCA 4F9JA 4JCMA 2O92A 4OKDA 1DWHM 1JZ3A 3AIEA 2FH6A 3WQ8A 1HL8A 2QHAA 3MMUA 3IAPA 1OT1A 1XV8A 4D6HA 4MPKA 1VFUA 4M29A 2A3BA 1CXFA 4FLSA 2XGBA 2YDSA 1UKTA 2GJXB 4JHZA 3MU7A 2GDUA 2NT1A 5CPQA 5ABHA 5BRQA 2XIBA 4QFUA 1G0CA 3VMPA 4J3SA 4D6GA 3OIHA 3WF2A 2YKKA 5AC4A 1GPFA 1UQYA 3LPOA 3RM4A 1NQ6A 2OYLA 1J9YA 4MAVA 3SCTA 4P8WA 2WPGA 3N17A 1HF6A 1E43A 2J78A 2JEPA 2WHJA 3A3HA 2V3FA 3WNPA 3AS1A 1XSIA 3D3AA 4NF7A 3ARYA 4X0VA 5E0FA 3RM9A 4UZSA 3ZR5A 1B1YA 1E3ZA 2A3EA 4HMCA 4AD1A 1KFWA 4J3XA 1UKOA 3ALGA 2VO5A 4YN5A 5A8PA 4E4PA 2PWEA 4M82A 2WVUA 2WMGA 1M7XA 1ZBVA 4TVDA 3ARQA 2CERA 4P8XA 1AQMA 3SCWA 2YA2A 3CH9A 3PZMA 4KGJA 4DWSB 3U7BA 3MO4A 2XWEA 4W88A 1KBBA 2DDXA 1GW1A 3ZOAA 1E72M 4ZE4A 1ITCA 1JF5A 1U30A 4PYSA 1HVXA 2VZOA 5A6BD 2E8ZA 2WMJA 5GNZA 2VI0A 2J7CA 1VRXA 2WC7A 3W4RA 3U5YA 2CXGA 1ESWA 2YDRA 5A6MA 1E6NA 3L4TA 1J11A 1HN1A 4UFMA 1W3JA 3AYSA 4TUFA 1AMYA 3EMZA 4PMVA 4D6DA 2DSKA 2X2YA 4YPJA 2XSBA 3OGRA 4ACYA 5M5DA 1EHAA 2VURA 2OYMA 4LPCA 1HKKA 1WCGA 3AXHA 5E70A 5GQBA 1DWFM 4AEEA 4C7GA 8CGTA 4JKLA 1CLVA 2WVTA 3M46A 1NARA 1UD2A 3BH4A 1KGWA 4TTUA 1UD5A 2WBGA 2BXZA 1RPKA 4AD4A 4GO8A 4J3WA 1M53A 3TTOA 3OGVA 4W84A 1FFQA 1UH3A 2ZX5A 5HOSA 1NH6A 2XHYA 4U33A 4WJXA 4XX6A 3CZGA 1R87A 1BYCA 1FOBA 1H0IA 2ZWZA 2ZUMA 4YHGA 1EIBA 1WKYA 1TZ7A 2VL4A 1KGUA 1HL9A 1KR1A 2X05A 4X9YA 1J12A 3WH6A 5AY7A 1BG9A 4WKAA 4NRSA 3CHFA 4L4OA 2Y4SA 4W93A 4MJ4A 4JAWA 1C92A 3GZAA 1CIUA 4UFJA 4ZENA 4GIAA 2NW0A 1PX4A 3FHAA 1CGUA 4ZE5A 4LGXA 1I1XA 3S6TA 3VILA 2WW5A 3WEOA 3OLIA 1ISYA 2WVVB 3AIUA 3UERA 1DWJM 1MW0A 4JL1A 3CUHA 3W27A 4AZHA 1LG2A 4UR9A 2IUZA 3VD7A 4AC1X 4CU8A 4CCCA 2DSZA 2EQDA 4PBGA 1ZJBA 3RCNA 1TUXA 2X09A 3U57A 1B3YA 1E56A 1HP5A 3AI0A 1H1NA 4M8UA 3WNLA 1XD0A 1KBKA 2ZXDA 4MB5A 4PUEA 4IM4A 3ARZA 2ESCA 3RO8A 1FA2A 4M1RA 3PZUA 4HPGA 2GJXA 3WELA 4HPHA 3ZT7A 4Y7EA 3WY1A 3UETA 1Y7VA 5I79A 3DECA 3CUFA 2CIPA 3K4DA 1JZ6A 2EPNA 5HPCA 2CKRA 2Y5EA 2BY2A 1E4LA 1C90A 1TFVA 2J7FA 4IPNB 1S46A 1W3KA 3CUJA 3BSGA 3MS8A 4CD5A 1US2A 2V3GA 1MVYA 4BS0A 2D3NA 1GJUA 1J0YA 2VJXA 1KWGA 4NRRA 4C7FA 4W87A 4PUDA 5HPOA 3II1A 5A6LA 4N0RA 1W9DM 1GOWA 4PRWA 3WNKA 2V38A 2D22A 3CPUA 1J0KA 2PBOA 1H0GA 3RPMA 3KL5A 4OJYA 1PIFA 4Z2IA 1W9XA 3DHPA 3OB8A 4NI3A 1XH1A 4ATLA 3QHMA 2FHFA 4QLLA 3LPFA 1V0NA 4N42A 2VQUA 4AZBA 3WD4A 1C8YA 1ECEA 1EA9C 1G01A 3BAKA 3ARVA 4PSPA 1OM0A 3SCRA 4OBRA 5CQ1A 3KZSA 1GVYA 1M04A 3VMNA 2D2OA 3OBAA 4R27A 1CBGA 4Z2KA 5I77A 1VFOA 5LA0A 2DT3A 2DH3A 3AHZA 1K6AA 4AZ7A 2XFYA 1JF6A 3EYPA 4PMXA 4GKLA 4QCFA 2GK1B 1JDAA 2PWFA 2BY1A 3FHQA 1XYZA 4C90A 1V02A 2FGLA 3EDDA 4WF7A 2BY0A 4D6JA 5KEZA 1V03A 2E9MA 3F5KA 4XUYA 4JFWA 1OD0A 1DWIM 2ZX6A 4WSKA 2FH8A 2WVSA 1UD8A 4J28A 5CSUA 4WKFA 2VT0A 1WDQA 1OWQA 5DEZA 2XG9A 1KXHA 3DHUA 5CGTA 4UFKA 4D71A 4QLKA 5E09A 2CESA 2JIEA 5IFPA 2EO7A 4WK9A 1CECA 4U31A 4W89A 4F79A 1W91A 3RDKA 2EPKX 1ZB5A 1UD4A 3ZSSA 5CLWA 1TVPA 3AICA 4GI9A 3W38A 1QW8A 4OZOA 1V3MA 4FLRA 2J7HA 1HJWA 4MDPA 3GYCA 4B9YA 4UOQA 2WMFA 3MV01 1RP9A 2XVLA 2J7EA 3SUSA 4PMOA 2Z1KA 4CN4A 3AIWA 1CGXA 4CU7A 1V6XA 1G1YA 4GINA 4J3VA 1NP2A 3WEMA 1B0IA 4UOJA 1O7AA 3SCOA 3TTSA 1EQCA 1GQKA 3CZLA 3OLGA 2Y8VA 3MV11 1GOQA 3UG5A 2RGLA 2ZUVA 1JYVA 5C70A 4WIWA 3WQWA 1KB3A 1E0VA 1KR0A 2ZUTA 3CTTA 1E6SM 1OINA 4GXPA 5A1AA 2J8GA 4CD4A 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2HISA 2NT0A 3BAXA 3VD9A 3VX1A 1JD7A 5D9NA 5JIWA 3WUEA 3MUZ1 1FP8A 3A47A 2WCAA 4AEFA 1K9TA 4CU6A 3N13A 4P7NA 4WLCA 1W3HA 4GO9A 2V3DA 2DT1A 3VGEA 3FN9A 3VDHA 4ZXOA 3VIPA 2J77A 1PJ9A 2WKLA 1E6QM 3EDFA 3VIHA 5IXEA 4PMQA 2Y8KA 3AROA 2G3NA 2J7DA 3CLWA 3N04A 3TONA 1KCLA 3BLKA 4ZXLA 1VEPA 3CZJA 2QLYA 3ZJ8A 1UKQA 2CNCA 2ZX9A 1MYRA 5E6ZA 1NWTA 4EAMA 1LQ0A 3VIOA 3A4WA 1WNOA 2XVGA 2IXVA 2QPUA 1EOKA 3WMBA 5D9MA 3BMWA 1UA7A 2O9RA 1JXJA 2WKGA 3VIIA 4E2OA 1M01A 3TTQA 1JYWA 5LA2A 5BXPA 1E4IA 1BG4A 2Y2WA 3B9AA 2WHMA 1DWGM 1NOWA 5IFTA 3OZPA 1SMDA 1NOUA 2CEQA 1SR0A 3BCFA 2X0HA 3ZIZA 3KWXA 1ISZA 1V3IA 1J0HA 1CNVA 3SURA 1QPKA 4CD7A 5FCZA 2AOSA 5JBFA 1C8QA 3IANA 3AHYA 2W5FA 3QR3A 2QPSA 1QBBA 3AMCA 4XB3A 1VFFA 4XZWA 5CGMA 4HTYA 3F4VA 3VIKA 4GQQA 1W32A 4AYSA 2MANA 4HOWA 5A3HA 5I3DA 3KL3A 1QNRA 2F8QA 3PZTA 3CZ8A 1IZJA 1FFRA 2BVDA 1YQ2A 3AIBA 6A3HA 2VZUA 5ABEA 3JUGA 1P6WA 1ISVA 4AIOA 1SMAA 2JIWA 3L2LA 3OZOA 1UWIA 1B2YA 1YHTA 4V28A 3PTMA 4JKMA 1E1EA 1TCMA 2WWDA 4LX4A 3EDJA 2WC4A 4E8DA 1NWRA 4MTVA 4FLQA 1MWOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4AWE A;  3QHN A;  3SCU A;  5EB8 A;  4DUX A;  1MW1 A;  2DGA A;  4UTF A;  2V5D A;  5GNY A;  3SIM A;  1CLX A;  1W1T A;  4UFH A;  1BVN P;  1E5N A;  3ZQ9 A;  1NWS A;  1UUQ A;  1K9D A;  3WIJ A;  3SUW A;  4QLJ A;  4KMQ A;  2PWG A;  3ZT5 A;  2FDM A;  1CXK A;  1UA3 A;  4UQC A;  3VOC A;  3W25 A;  4AZ5 A;  3W81 A;  3ZST A;  1U2Y A;  1HP4 A;  1E6Z A;  4MB1 A;  3WDH A;  4JIE A;  3VM7 A;  2X8R A;  1BFN A;  4ZFM A;  2J7G A;  5LYR A;  1H11 A;  3APG A;  2VTF A;  4BQ2 A;  1QI5 A;  3W53 A;  3O6A A;  1EGZ A;  2DSW A;  1WE5 A;  2WCS A;  3W28 A;  1CGV A;  2YDQ A;  3IJ7 A;  1FH9 A;  1GQI A;  3G6M A;  4LXF A;  2XGI A;  5BXR A;  1GQL A;  1H41 A;  2VZT A;  5ECU A;  1LF1 A;  2ZUU A;  1OIF A;  1EXP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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