3NY9A

Crystal structure of the human beta2 adrenergic receptor in complex with a novel inverse agonist
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor, Lysozyme
publication title Conserved Binding Mode of Human beta(2) Adrenergic Receptor Inverse Agonists and Antagonist Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 162
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ny9A02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3ny9A01
1T8FA 3X3BA 2VT4A 212LA 3HASA 3DN6A 3GUNA 139LA 120LA 1LYEA 3SB8A 4MD1A 2NTHA 3C82A 255LA 3S8GB 1L15A 5JJEA 5H2LA 1L46A 1CWQA 1L84A 1L41A 143LA 1P2RA 3UTXA 164LA 4J4QA 1L67A 248LA 1L33A 205LA 1MGYA 1L25A 201LA 2Q9EA 1IW6A 1C3WA 5B6VA 125LA 1X0K1 3SB7A 4YXCA 3BVDB 4HYJA 3C9LA 140LA 3SB6A 1QTDA 4WAVA 1L86A 5B6XA 5KKHA 104LA 1G07A 1XEPA 2B6XA 3QBGA 4XTOA 1KW7A 3HDFA 1P36A 4L6RA 1C62A 239LA 1KS3A 5AX0A 1P3NA 3DN0A 1L75A 1X0I1 1C64A 3C7YA 3VVKA 1L30A 4N6HA 1R84A 188LA 5LWEA 3C8QA 253LA 2OU9A 3A7KA 162LA 1DYGA 5FJGA 4GYCA 2WJLA 3RUNA 1M0MA 4MQSA 131LA 4ARQB 3UZAA 1LW9A 3GUPA 4OV0A 2I21A 1LI2A 1DYCA 184LA 4MD2A 3ZPQA 1WTHA 4AQNA 2LNLA 3QJVB 1C6HA 1L24A 3GUKA 4NC3A 5AHZA 2B6ZA 3L2XA 4GP8B 1L97A 1L21A 1TLAA 1JGJA 1L81A 2ZIYA 2YCXA 4KNFA 3WQJA 1QTZA 1CV3A 1L91A 247LA 3QJRB 3S3CB 1TN5A 244LA 215LA 1L50A 2B74A 211LA 3HTFA 1L12A 3GUJA 4I7MA 5I14A 1PQKA 1OWZA 1C65A 3UTWA 1L0JA 4GBRB 4I7RA 1L53A 1LN6A 1L45A 223LA 254LA 214LA 1L18A 1S52A 187LA 1L01A 3HAQA 163LA 258LA 1L05A 1CX6A 2Z6BA 4I7NA 5BR2A 2B6TA 3OAXA 3HWLA 4K5YA 3K2RA 2ANVA 1QT5A 174LA 5ITCA 1P6YA 1OVKA 1SX2A 3DN2A 196LA 1D2WA 1L0KA 5H2HA 1P5CA 3C7WA 4XT3A 1L06A 243LA 5A44A 229LA 1G1VA 231LA 1C6AA 1QUDA 4ZPUA 1XJIA 3PBLA 4W59A 2WJKA 3ZPRA 4FA7B 3HTBA 4W52A 1C60A 1KY1A 3CAPA 1C63A 1LPYA 5G53A 3GUOA 2OE4X 1D3MA 1KW5A 3VW7A 1LI6A 217LA 4ARPA 1LGWA 4EKQA 1OYUA 156LA 256LA 3CDVA 3QBLA 4FBZA 1P46A 2LCBA 3HH6A 2HULA 1OVJA 4I7QA 2M3GA 5G36A 1L64A 166LA 245LA 3FI5A 3OE9A 4BEYA 3VG9A 145LA 172LA 4BEZA 2RAYX 1OV5A 1LYHA 3UG9A 3HAOA 5B6YA 1G0JA 5BR5A 3CDOA 3HT9A 1C6TA 2QPEB 1LGUA 7LZMA 1L88A 1L92A 3ODUA 1L00A 260LA 4PXFA 3ABWA 4EPFA 5JJNA 4ARMB 3DKEX 1C6NA 3QJQB 3QJUB 4I7SA 5G54A 130LA 2F95A 4OO9A 1KMEA 4XTNA 4BVNA 1L93A 1L29A 1VGOA 192LA 1I6SA 1L48A 1LLHA 250LA 4QRYA 1L07A 1L42A 1XIOA 4G70B 224LA 4JQ6A 199LA 4W54A 4Y9HA 3SN6R 1L23A 4XXJA 1AT9A 198LA 2BRDA 4W53A 4GPOA 1LGXA 1QUGA 4I7LA 1F88A 3C7ZA 3HT6A 3KJ6A 1CU3A 3PWHA 3QJTB 160LA 5H2PA 111LA 1Q5IA 3HU8A 4G7SB 4EKSA 3HH5A 2I1XA 129LA 2KSBA 1LI3A 4I7JA 1ZURA 5AWZA 5B35A 114LA 1LWGA 1L54A 3UTVA 2QARC 1C6QA 6LZMA 2RBQA 3AYMA 181LA 1C6GA 168LA 1CV4A 1L35A 3D4SA 1GZMA 209LA 3RFMA 1C6CA 1JTMA 1CUPA 227LA 1QT7A 2B70A 5C1MA 3PDSA 4G7RB 1KY0A 5B34A 2PEDA 4BV0A 128LA 180LA 113LA 1LYGA 242LA 1CV0A 2F93A 1L03A 1L55A 5B2NA 3DN3A 141LA 1M0KA 5A45A 1S8JA 4W57A 1L95A 2YDVA 4QIDA 251LA 150LA 3QAKA 1PXRA 1QSQA 1L62A 3EH4B 4ARQA 1QHJA 1CX7A 220LA 159LA 2F47A 142LA 1DYDA 4DJHA 1T97A 5ITEA 3DQBA 3PXOA 1K28A 4PK0A 127LA 3NY8A 2RB0X 1G0PA 3F9LA 2B6YA 1QTHA 2F32A 2B6WA 2RH1A 1L76A 1G1WA 1QSBA 249LA 5AHYA 1NHBA 5AX1A 190LA 5AZDA 4EIYA 4IB4A 4X32A 1CV1A 1C6KA 4EPIA 118LA 3COCA 1S54A 2X72A 1HZXA 1QKOA 221LA 1KGBA 1S53A 3OE6A 1BRRA 226LA 1C6EA 2NTGA 1C6FA 2QB0B 4GBRA 3DMZA 4LDOA 1KNIA 2JAFA 3HUAA 1SWYA 3HUQA 2I35A 151LA 1H2SA 1L43A 2G87A 1L61A 1L51A 3EH3B 4LDLA 1L20A 3QBKA 4TL3A 1BM1A 4I7PA 1C68A 3JR6A 3DN8A 1F4ZA 4DAJA 5H2JA 3UTYA 1L63A 3HTGA 2Z73A 1L85A 2LZMA 3CDQA 1L58A 1CVKA 2CUUA 1IW9A 1S8LA 4UG2A 4XTLA 1E12A 186LA 237LA 1C6DA 1C8RA 246LA 1KG8A 5B0WA 1L69A 1CU5A 1L87A 3X3CA 1L19A 1L27A 5DHHA 149LA 222LA 107LA 261LA 2EI4A 2QPDB 2YCYA 4PJZA 3DMVA 1L34A 3UZCA 3REYA 3SBBC 4E97A 197LA 1C6PA 1EHKB 4I7KA 2Y00A 2Z55A 5LZMA 5G2CA 3V2YA 1D3JA 4I7TA 1L09A 4EKRA 1L37A 1ZYTA 4LZMA 1QT8A 3DMXA 1XMEB 1L57A 4JKVA 3SB5A 1PQOA 1L82A 1T8GA 1C61A 4G71B 2A4TA 3CODA 1L40A 2OTYX 1G0QA 2RB2X 5G28A 2F2QA 119LA 216LA 2OEAX 2R4RA 4PXKA 1L70A 1L60A 1BRXA 1CV5A 2AT9A 2J4YA 1L56A 3HH3A 3G3WA 1QS5A 1L89A 4IAQA 4ARMA 4X1HA 252LA 1L36A 3FADA 5A8EA 1C66A 167LA 1CUQA 228LA 1PQJA 2OE7X 1L66A 3P0GA 4BUOA 4W58A 1IXFA 1GUEA 115LA 146LA 1L08A 1CU0A 2OTZX 1L79A 4IAPA 1FBBA 2HPYA 1L28A 1SX7A 3NY9A 262LA 1DYFA 1PXSA 1L52A 1D9WA 1R2NA 210LA 1L38A 178LA 2HUMA 3HDEA 3QAPA 3V2WA 1VJMA 3CDRA 3DNAA 1D3NA 1L17A 3MBVA 3HT8A 3RZEA 1L13A 3HU9A 4EKPA 3AYNA 3QDCA 1L26A 5H2OA 3VI0A 2RAZX 4BWBA 2OE9X 3C81A 4L35A 3UONA 2LC9A 2R4SA 3HAPA 1DYAA 1QT4A 4G7QB 4JR8A 1AP9A 1L0MA 1L9HA 1L44A 5JJJA 2RBSA 1G0GA 3C8RA 5H2NA 1JV7A 157LA 112LA 3FA0A 1L16A 2ANXA 2RBRA 1DZEA 1D3FA 4GRVA 235LA 1CU2A 225LA 1D2YA 5G2DA 5B6ZA 2Y01A 103LA 4MQTA 1PY6A 1LYFA 137LA 2B72A 1M0LA 3DDLA 5DHGA 1QTBA 3HUKA 1G0LA 3EH5B 3SBAA 2L6XA 170LA 1XJUA 1LYIA 2B73A 3DN1A 3SB9A 148LE 1GU8A 1CTWA 1P2LA 2RBOA 2YCWA 4S0WA 4W56A 4HWLA 241LA 2I20A 1C6MA 4HYXA 1L32A 110LA 4WW3A 1X0SA 5EN0A 189LA 3C83A 5F8UA 4AMIA 1OWYA 147LA 155LA 1KG9A 4W55A 1L04A 3G3XA 1F50A 5H2KA 5J7AA 176LA 4EJ4A 1P64A 1OVHA 2Y02A 1L72A 1C69A 126LA 182LA 1FBKA 238LA 4W51A 3S8FB 3C8SA 5H2MA 3G3VA 123LA 2B75A 4MBSA 3HTDA 3HARA 1L68A 4ARLA 2Q9DA 177LA 3OE8A 200LA 2OU0X 234LA 1ZWNA 1L39A 1CV6A 5G2AA 1PQMA 2KSYA 144LA 1B6IA 3OE0A 1C6JA 1L98A 1LYDA 259LA 4LDEA 122LA 2Y03A 2RB1X 1QTVA 2OU8A 2YDOA 3C80A 1L94A 5TGZA 1L65A 218LA 1LYJA 4X31A 1SSYA 1Q5JA 233LA 1C8SA 2B7XA 3T45A 185LA 1QUOA 1P8UA 4DKLA 2ZZLA 1QKPA 3QBIA 1SSWA 4I7OA 5B6WA 1QUHA 1QTCA 1XJTA 4GP5B 3VHZA 2ZFEA 1UCQA 3LZMA 1PQIA 1QM8A 138LA 4FPDA 1L11A 5DYSA 173LA 1L83A 4XT1A 158LA 1L14A 1G06A 3CDTA 1P8HA 1P56A 3NSBA 102LA 3C9MA 3S3BB 152LA 1DYEA 2IGCA 3HT7A 4ARJA 1C67A 1L80A 3F8VA 1U19A 2Y04A 1L99A 2YCZA 4QI1A 4EXMA 4EA3A 3GULA 109LA 1L59A 1L71A 4GP4B 1JQUA 108LA 1L96A 1JFPA 1L74A 2KS9A 4FAAB 183LA 169LA 4YXAC 1H68A 1L77A 1BRDA 191LA 195LA 219LA 2RBNA 3ZEVA 1L73A 232LA 2O4WA 1L31A 3QJSB 1TN0A 3S3DB 3DN4A 2JAGA 1P7SA 1CU6A 2KSAA 1C6LA 1P8IA 1E0PA 1C6BA 2O7AA 240LA 1P37A 3HH4A 1JV6A 4N4YB 3EMLA 1C6IA 3HANA 1JTNA 3GUIA 171LA 165LA 213LA 2RBPA 1L02A 5ETZA 1QS9A 161LA 175LA 1G0MA 3L64A 1L49A 1OV7A 1T6HA 1UAZA 4N4WA 3NS0A 4AMJA 4KLYA 1L47A 1QT6A 4G72B 4A4MA 1S51A 1L10A 1PQDA 4UHRA 1QT3A 2NTWA 5H2IA 1EPYA 2L78A 1SWZA 3VGAA 3AM6A 1L90A 1L22A 4YX7C 3PQRA 1T8AA 2HUKA 1G0KA 236LA 3NYAA 206LA 2NTUA 1DYBA 230LA 3GUMA 4IARA 2O79A 1LWKA 1O0AA 257LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2LYZA 3P68A 3HASA 4ETEA 139LA 4PJ2C 3WPLA 4MD1A 4IASA 3TXGA 5JJEA 1DI4A 5H2LA 1GAZA 4G49A 1GB7A 1L41A 4LT0A 4YEMA 4J4QA 1L67A 4B4EA 205LA 1WQOA 201LA 2Q9EA 1X0K1 4LYTA 1LSPA 1XEPA 4HJZA 1P36A 1BGIA 5HNLA 1B5UA 1LHLA 1YAPA 3ZVQB 4H9BA 4N6HA 1R84A 5LWEA 3C8QA 2OU9A 4GN4A 2Z39A 1DYGA 4E3UA 3WPJA 5L9JA 4ARQB 3AJNA 3GUPA 184LA 1ALCA 1C6HA 1VDQA 1HNLA 3L2XA 4BAPA 1L97A 1L21A 1TLAA 1KXYA 2DQJY 3A6CY 3AW7A 3WYHA 1JUGA 1MELL 4DYGA 3AW6A 3G3AB 1PQKA 4WL7A 2RSCA 2EKSC 4G4BA 4I7RA 3P64A 1LN6A 4HP0A 1HEMA 3QE8A 1LJJA 1GF6A 5BR2A 3LN2A 2D91A 3WUNA 1LSFA 1IOTA 3M3UA 5ITCA 2BAAA 3AGGG 1SX2A 134LA 1TDYA 4DDCA 4XT3A 4HJVA 3A34A 5AMYA 4ZPUA 3PBLA 4NWHA 3CAPA 1C63A 1LPYA 2OE4X 1KW5A 1LI6A 217LA 2Z12A 1OYUA 2YDGA 1LYZA 3B6LA 1YKXX 2MEDA 1FDLY 1BWIA 4I7QA 4R6CA 4IATA 1HSWA 2D4KA 1UIDA 4OW1A 3UG9A 1WVVA 3KAMA 1G0JA 1BWJA 1C6TA 1LGUA 1LSGA 1LZ1A 3ODUA 3ABWA 1WQNA 5I53A 1D0KA 4I7SA 5G54A 4OO9A 1KMEA 1IP1A 4GLVA 4BVNA 1UIFA 192LA 5C6IA 1XIOA 4LT1A 5D5CA 2A7DA 4Y9HA 1L23A 4DT3A 4XENA 3WVXA 4WO9A 4XJBA 2BRDA 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 2ZZL A;  1QKP A;  3QBI A;  1SSW A;  4I7O A;  5B6W A;  1QUH A;  1QTC A;  1XJT A;  4GP5 B;  3VHZ A;  2ZFE A;  1UCQ A;  3LZM A;  1PQI A;  1QM8 A;  138L A;  4FPD A;  1L11 A;  5DYS A;  173L A;  1L83 A;  4XT1 A;  158L A;  1L14 A;  1G06 A;  3CDT A;  1P8H A;  1P56 A;  3NSB A;  102L A;  3C9M A;  3S3B B;  152L A;  1DYE A;  2IGC A;  3HT7 A;  4ARJ A;  1C67 A;  1L80 A;  3F8V A;  1U19 A;  2Y04 A;  1L99 A;  2YCZ A;  4QI1 A;  4EXM A;  4EA3 A;  3GUL A;  109L A;  1L59 A;  1L71 A;  4GP4 B;  1JQU A;  108L A;  1L96 A;  1JFP A;  1L74 A;  2KS9 A;  4FAA B;  183L A;  169L A;  4YXA C;  1H68 A;  1L77 A;  1BRD A;  191L A;  195L A;  219L A;  2RBN A;  3ZEV A;  1L73 A;  232L A;  2O4W A;  1L31 A;  3QJS B;  1TN0 A;  3S3D B;  3DN4 A;  2JAG A;  1P7S A;  1CU6 A;  2KSA A;  1C6L A;  1P8I A;  1E0P A;  1C6B A;  2O7A A;  240L A;  1P37 A;  3HH4 A;  1JV6 A;  4N4Y B;  3EML A;  1C6I A;  3HAN A;  1JTN A;  3GUI A;  171L A;  165L A;  213L A;  2RBP A;  1L02 A;  5ETZ A;  1QS9 A;  161L A;  175L A;  1G0M A;  3L64 A;  1L49 A;  1OV7 A;  1T6H A;  1UAZ A;  4N4W A;  3NS0 A;  4AMJ A;  4KLY A;  1L47 A;  1QT6 A;  4G72 B;  4A4M A;  1S51 A;  1L10 A;  1PQD A;  4UHR A;  1QT3 A;  2NTW A;  5H2I A;  1EPY A;  2L78 A;  1SWZ A;  3VGA A;  3AM6 A;  1L90 A;  1L22 A;  4YX7 C;  3PQR A;  1T8A A;  2HUK A;  1G0K A;  236L A;  3NYA A;  206L A;  2NTU A;  1DYB A;  230L A;  3GUM A;  4IAR A;  2O79 A;  1LWK A;  1O0A A;  257L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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