3NZ1A

Crystal structure of kemp elimination catalyst 1a53-2 complexed with transition state analog 5-nitro benzotriazole
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAAYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLAIATEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMWDFIVKESQIDDAYNLGADTVALIVKILTERELESLLEYARSYGMEPAIVINDENDLDIALRIGARFIEIASRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAWQGISERNEIEELRKLGVNAFGIGSSLMRNPEKIKEFILGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Indole-3-glycerol phosphate synthase
publication title Iterative approach to computational enzyme design.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 99
structure length 249
sequence length 249
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nz1A00
3QMRA 5FEPA 3SZ8A 5CKSA 3LCHA 3W1RA 4UXDA 3LB0A 3W07A 1LM1A 3W2UA 5D05A 1JCMP 1G7UA 1JCJA 3G8EA 5CSSA 5DBUA 4RLIA 1P4CA 1A50A 4MJZA 1HO1A 4LNYA 3MP5A 2B7OA 3UWZA 4B5NA 2DZXA 4FX6M 2QUTA 5T26A 5U4NA 1TTPA 4GXMA 3BGGA 3DFPA 5HWMA 1L6SA 5EL1A 4DF1A 1EWEA 1G4EA 2VFDA 3DFSA 2PCQA 2R94A 4PA8A 4FNQA 1M7OA 1SFJA 1KM5A 2VEKA 3MYOA 2CLIA 3UNDA 1G7VA 1WOBA 2WSRA 3HB9A 3CT7A 3Q2DA 4RZ5A 1Z42A 3LGEA 4IMGA 5AOUA 1K03A 2A6LA 2Y88A 3VCRA 1QOPA 3S9YA 4ALDA 1NFBA 1RPXA 3PUEA 2YGYA 3R12A 3PB2A 1LBMA 3IGUA 2R14A 1QFEA 4EOUA 1KTCA 3MO7A 1OFOA 2CWNA 3LBCA 4CQ8A 5LNSA 3BG5A 2H90A 5AYYA 1QMLA 3W75A 4UFHA 2A0NA 2EGZA 1QO2A 3W1XA 4QNEA 1TTQA 1DORA 3W7LA 3NQ7A 2NXGA 2YW4A 3NXFA 4IWWA 1N55A 1Q45A 3TMLA 2X1SA 5KSWA 5CPLA 3QPZA 5J5DA 3FKKA 3HGJA 2QCMA 4M6VA 5E1QA 1X7FA 3IGXA 3I7SA 3P62A 1H50A 5C2XA 4Q32A 5DY2A 1ICQA 3N19B 4FXSA 5CPNA 1Q6RA 3M9YA 2A4AA 4IX2A 1JR1A 1R2TA 4XKYB 1ZAHA 3LCGA 4JX4A 5LNVA 4BI7A 2A5HA 3TH6A 1L2UA 5LNWA 4N4QA 1QDSA 4KFPA 1LP6A 4N2YA 4O12A 3W74A 5DY3A 3G3MA 1RZMA 1YYAA 1OX6A 3PBYA 1VLIA 3EB2A 2ISSA 1GVOA 2G96A 3W2KA 7TIMA 1ML1A 2W0UA 3DZ1A 3U8GA 1LRQA 3LHWA 4O4WA 5H91A 1OK6A 3LLDA 4NQ1A 1NSJA 3W1AA 1Z44A 2DORA 4Y8FA 4UFLA 4ADSA 3BV4A 4R34A 2Q8LA 1KLYA 3NM1A 1VYPX 1RQEA 2CLEA 5EBUA 2H3DA 1XCFA 1ZAJA 2X2GA 1UUMA 5CZ0A 3S42A 3G0XA 3MW7A 1YXYA 3KVMA 3HPZA 4E2DA 1G4TA 3C52A 2BTMA 1SO3A 4EVZA 1VHNA 1YDNA 2GVLA 5D30A 5C5YA 2QR6A 3LV5A 1D3GA 4IXXA 5F1VA 4LVFA 4N6FA 4K36A 1KM6A 3B0UX 1EWDA 3C4UA 1QPQA 5KINA 3QSRA 5AHFA 4AF0B 4YWIA 3TFXA 4BF9A 3LHVA 3HG2A 5HULA 3UY8A 3BG9A 5L6UA 2GOUA 2J6XA 3UY7A 3W71A 1SZNA 1DQWA 3EWWA 4O10A 4N9BA 4WY0B 2ZTKA 4O50A 3LV6A 2WSYA 4AMAA 5IM51 1JCNA 1ZCOA 4ZQPA 2B7QA 1MEIA 1TJRA 4IPJA 4CQ9A 2B0MA 1KW1A 1B4EA 2E5BA 1RR2A 3NO5A 4IQLA 1W5OA 5E0KA 3U2OA 3W1QA 1VH7A 1I2PA 4LS2A 3W7RA 1O95A 2C15A 1VCGA 3PC0A 3C2RA 4QNWA 4YLWA 3FS2A 1W3IA 4AH7A 1VCFA 4LVBA 1HO4A 1OFPA 1SFLA 4NJIA 1G69A 3EWYA 1VGAA 2FPTA 1GYNA 1GOXA 1CW2A 4A3UA 3QZEA 3W1MA 5EMUA 3CIWA 3PG8A 1OF6A 1Q6LA 3NL2A 1H1YA 3P81A 1PHWA 2VEMA 3W7QA 4Z1AA 3ZS4A 2QUVA 3HIJA 3G22A 2JBMA 2E6YA 1FWNA 4NNAA 1H7PA 3CIXA 1Q6QA 3HJZA 4GWEA 4IOTA 2ZZ1A 1GEQA 1J4EA 3GYEA 2J24A 1C8VA 1KFBA 3IVTA 1W0MA 4P2VA 4BWLC 1ICSA 4ADTA 3IV3A 3BK0A 5I3HA 2VFHA 4UFIA 1ME9A 1EUNA 2YYUA 3N2MA 1LCOA 1F7BA 2CLHA 3I7RA 3L68A 2A85A 3TSDA 2FPYA 2ZRWA 3C61A 4FX7A 2HMCA 2JK2A 2YFOA 3B4UA 3BG3A 1YTDA 1QOQA 2Z2UA 4O57A 5D2TA 2FB2A 4TR9A 5G2HA 4K8HA 5D04C 3C2FA 1UCWA 2G95A 2QEZA 4WD0A 2A7RA 4WY0F 2H3BA 5TQLA 3MP3A 1TV5A 3LCWA 4IGHA 1KM3A 3WK0A 1XI3A 1GZGA 3MI6A 3NPUA 4CQAA 1T96A 1JCXA 2XN0A 4ZQRA 5AB3A 4N4PA 1PS9A 1U83A 5D2YA 1TREA 4JD4A 5HWNA 2E6FA 5FEXA 2C3ZA 2X16A 1WBJA 3DXIA 1M7PA 4UFJA 5AHEA 3TJXA 2VKZG 2GUUA 2QKFA 3HG4A 2C1HA 5U7SA 2VEIA 3M6YA 2Y61A 3RK8A 1SSGA 4UTTA 5DBTA 2TSYA 3NQFA 4M19A 1TPVA 2QCNA 1XM3A 5AYXA 1W8SA 4O16A 3C2VA 3L5MA 1TCDA 3NZRA 5J5RA 4JYFA 1EP2A 3LHTA 4LS1A 3MJYA 2FJKA 4EWND 2WNQA 4WX2A 2DZPA 3W7CA 4C1LA 2TPSA 3LRKA 3FYPA 1LORA 2OZ0A 1GQNA 3A9IA 1BWKA 3R13A 3M44A 3AJXA 1LOLA 2NX9A 5K3VA 3NQGA 1JULA 3TUUA 3LCFA 4W9TA 2PC4A 4NZFA 3CM4A 5DXYA 1SW0A 3W1TA 1LRTA 3STCA 3M5XA 3VI2A 1QO5A 1I4NA 4X22A 2CLLA 3PF3A 4OBTA 2ZZ5A 2BX7A 3C2EA 5K4XA 5FF0A 3S1WA 3P7YA 4YXGA 3W23A 5EKYA 2BXVA 3T55A 3W84A 3B0VC 1OFQA 3STFA 3HG3A 4NNCA 3DHFA 1DJQA 3G0UA 1H7NA 2YCEA 4ZL1A 6TIMA 4MYAA 1VC4A 1WV2A 1HTIA 1WXJA 3ZWSA 1XXXA 4FNRA 4N9DA 1FDZA 2V2HA 2YR1A 1Y0EA 3O06A 1M5WA 3P80A 4HN4A 4A2SA 2RFGA 2ZRUA 5DXXA 4OU1A 3Q94A 3EX6A 3QQ1A 1L9WA 4WXZA 3WFAA 2Z6JA 3IVUA 2ZZ2A 2Y7DA 3P5ZA 4FNTA 1GVRA 1VS1A 1U5JA 2J9ZA 4QIUA 1F76A 3WJWA 4MFDA 3WK3A 2ZA1A 4XWUA 2VFEA 1XFBA 4FNSA 5AFDA 1KV5A 3GDLA 4S1FA 1SZFA 3HMJG 2OJPA 2CZDA 4HKPA 5C55A 2ZZ6A 3BW2A 1PHQA 3PVFA 1JJKA 3M0ZA 4M6PA 3C8FA 4LUJA 3JRKA 3HQ1A 2C6QA 4LWWA 2XFWA 5DLCA 3VNDA 4CLMA 4Z08A 3DH7A 4JTTA 2EHHA 1KFJA 1W3NA 1YTKA 2DZUA 2FB3A 1E51A 4A2RA 3PWAA 4ICNA 3SECA 3HPSA 1F05A 4FHAA 4LV9A 2X1RA 5EY5A 3ZFHA 5D32A 4TMCA 4LVAA 3MHFA 1SU5A 3TC6A 3KVKA 2AGKA 2J9YA 1TQJA 3TIMA 1AMKA 3NQMA 1JUKA 4JNMA 4FO4A 3PY2A 3EKZA 4DF2A 5BRBA 5KITA 2WNNA 3W1NA 3NA8A 1GTEA 3Q37A 4JY9A 1WBHA 3W7NA 2V2DA 4O53A 1OYCA 4MOZA 2LLEA 2P0OA 3DFOA 3ABRA 2V30A 2NV1A 3T78A 5CGQA 1JCLA 2Z6IA 1FXPA 3GKAA 5F4SA 3SSJA 1G67A 4YMZA 1IXPA 1LZOA 3SW6A 4IMCA 3TSBA 3THQA 4R53A 1P0KA 5G1YA 5AC7A 1XBVA 3CLMA 2CLKA 1W3TA 1YXDA 1D9EA 4O1CA 4JTFA 3MUXA 1FCVA 1OJXA 2V8ZA 1ME8A 2V5LA 4JY8A 2WQPA 3N14A 3GB6A 3W85A 1OFAA 4A22A 3TC7A 5FF3A 3UXDA 4AWTA 3UPBA 1G4SA 2TMDA 4IMFA 4JTHA 1S5WA 5HQEA 2ISWA 2VEPA 4JXCA 5D37A 5A8GA 4GUHA 5F2MA 3P5YA 2G97A 4XKYA 4BI6A 4CCEA 4QAIA 1OX5A 1H60A 2FLIA 3FA5A 4NU7A 4LRTA 3LTSA 4ZQMA 1A5AA 1PL9A 3HG5A 3ELFA 4UTLA 3DU0A 1KFEA 3NOEA 1XKYA 1IF2A 1FQ0A 2DZVA 4I7UA 3LHYA 3TQKA 4S2BA 2WV8A 1SZEA 1TV7A 2EF9A 4AXKA 3E96A 4POCA 5KMYA 4G1KA 2C14A 2ISVA 4UFKA 3NVTA 1AL8A 4NZJA 2NLIA 3O6CA 3MHUA 2YSWA 4O18A 3OVRA 3A21A 2NX1A 4RXGA 2RDUA 1K02A 3D0CA 1HFBA 4XBKA 4I9AA 4CCDA 1AW2A 1HUVA 2EKCA 2QCLA 2HS6A 3R2GA 3QMSA 1IXOA 4XQ6A 1RQBA 4HNVA 1ZJIA 2YFNA 1H1ZA 2CZFA 3H54A 1I45A 5LHEA 4GRSA 1VRDA 1R30A 2KZHA 3WJYA 4QISA 3SGZA 3C2OA 3TAOA 1R46A 1ADOA 3A22A 1OFDA 3V75A 3TW7A 5KZMA 2AQWA 2RKXA 1CX9A 4UTIA 2F84A 5BNKA 2CFFA 2JGYA 2VXNA 3I68A 1F73A 3FEMA 1DV7A 1G4PA 4ZVJA 2I14A 5FESA 3TX9A 3EX2A 4MY9A 3RF9A 4U4MA 1H7WA 1VR6A 3QPYA 4ML9A 2YXGA 1JRCA 3F4WA 1TPDA 4PCFA 3WJZA 1MO0A 5G2IA 1THFD 1LDCA 1HG3A 2E09A 4WUIA 2QJHA 4K37A 4XTIA 3C0JA 5D33A 5MHBA 2P1FA 5SWUA 2D73A 3PULA 2NZLA 5DN1A 3DKJA 4XTDA 2QDGA 5HUOA 3Q58A 2C16A 1V5XA 1OG0A 3W22A 1I2NA 4R33A 1R47A 2FFCA 1EEPA 2V2CA 5D2WA 5FF2A 3P74A 2O7QA 4CCCA 1PCWA 1NVMA 3DFQA 2W6RA 5D2XA 5FF7A 4JEQA 4PTNA 1EA0A 5LSMA 1X1ZA 3BLFA 3W7GA 3W2NA 3MBDA 3O07A 4AB4A 5AHLA 3TQ0A 5ABTA 1TTIA 3MYPA 1TJPA 3NGJA 4UTTC 5LHFA 4O52A 3O6DA 5KZEA 3HGSA 3OVPA 2QCDB 1D3HA 3KFTA 1A5SA 5DELA 5K2ZA 4GUJA 5AN7A 3PM6A 1NEYA 3KX6A 3TNOA 4Z0JA 1GVSA 2C18A 3EWUA 3EXSA 2ZQ0A 5I3JA 3KOFA 1X8FA 4DXVA 1FWSA 4LC6A 3L66A 4OWGA 4X3ZA 4ORMA 1J5TA 4DF0A 1TTJA 4D2JA 3T40A 4CNNA 2Y62A 1LOSA 2EAWA 4KKXA 2P10A 1YDVA 2R91A 2ZRVA 4BFAA 1W1ZA 3QC3A 4GJ1A 5FI8A 4NX5A 4MLRA 3VE9A 1OFRA 3N2XA 4PFMA 2H8ZA 4MKNA 3NM3A 3LHZA 5KTLA 2DP3A 3INPA 1P0NA 1FCBA 5CZTA 2C19A 3TMQA 3IEBA 3LXCA 2WKJA 2Y7EA 4IXHA 4JS3A 5G4WA 1I8JA 3EWBX 3LDVA 4JYDA 5F4WA 3HBLA 3S1VA 4NT0A 1VLWA 3EEGA 3N73A 5LGZA 2A7NA 1QAPA 4XBSA 4UNKA 2RH9A 3KVJA 1SPQA 2X30A 5IBXC 4XUGA 3TROA 4YL2A 1MEWA 4UFMA 1B9BA 1W5NA 3TV8A 3ZR4A 5CSRA 4QITA 3LCXA 2ATSA 4JTJA 4DO6A 3W86A 3B06A 2QF7A 1XL9A 2R8WA 2OX1A 3OEXA 4I7WA 4WQ6A 3W6YA 1N8FA 1KBJA 2G5WA 2NXIA 1LTDA 2XN2A 2ABAA 4NJJA 3KVLA 1EP3A 2FDSA 1QPRA 3M5YA 3QM3A 2E6DA 4DBEA 3PR2A 3G24A 3QFEA 1FX6A 4O0KA 3W7OA 4A29A 4RV8A 5AHMA 2BZNA 3A5FA 4UMCA 1QPNA 5FEZA 4DO5A 4JN6A 3STGA 4XZ9A 2VC6A 1TPWA 1LOQA 1W56A 3S5NA 4UC5A 5HMSA 4AWSA 3HOJA 1A5CA 3GR7A 3LTYA 2A7PA 3UZJA 3M1ZA 1I2QA 4Y6GA 3UWYA 1VCVA 1F6PA 3TW6A 1H7RA 2WNZA 1SW3A 4IUOA 2ZRZA 3ATZA 3SR7A 3G1FA 4RCXA 3BLEA 8TIMA 3NAVA 5BMWA 3S5ZA 3GDMA 3W1LA 5LGXA 3OG3A 4UTUA 1ZENA 3IGSA 4O14A 4MJMA 3KRSA 4NJGA 3UPWA 5CPOA 1FCQA 4GUGA 1FY6A 3N9SA 3CEUA 3TAKA 3ZWTA 3HO8A 3M7WA 4FNUA 3UXAA 4OT7A 3OVQA 3R89A 4AHQA 1JQXA 3N9RA 3DHDA 3GDKA 3SFKA 4DPPA 1TRDA 1LBLA 1GWJA 5G1TA 3PS7A 2OT1A 3PUDA 5F2IA 3A5VA 1GT8A 2YW3A 2VFGA 1QNVA 4UMBA 3IIZA 1KFKA 3IRDA 5I3IA 1XDLA 3MMTA 3FJ6A 4PODA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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