3O8AA

Crystal structure of plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase bound with novel inhibitor genz667348
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
YNPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVSSPNTPGLRDNQEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNDEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase homolog, mitochondrial
publication title Novel inhibitors of Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase with anti-malarial activity in the mouse model.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 148
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2010-08-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3o8aA00
1JCNA 4NJJA 2PE4A 4TO8A 1TV5A 4ZQRA 5E0KA 1EA0A 3USBA 1EP3A 4QQ3A 3LCLA 3BVJA 1CI1A 4Y6GA 3F4WA 3STEA 2RDWA 4R53A 3DAQA 4LWWA 2WNQA 1LCOA 4NX5A 2V8ZA 5DCBA 4GUIA 2FQIA 1GJPA 4LUIA 3CB8A 4QNWA 2OCZA 2RDTA 4IWWA 5G1TA 4WUIA 1ICSA 5KZMA 3B8DA 2A85A 4OV9A 2EGZA 4UTTA 4A22A 1BEUA 1YDOA 4M6PA 1MEHA 1C29A 2NXIA 4FNRA 1SO6A 1LLZA 1VCGA 4DBEA 3LXAA 1N8FA 2DZUA 4WOQA 4GUGA 3FS2A 2ABBA 2XN2A 4AHQA 1V7YA 4XTDA 4FNSA 3NA8A 1WYIA 1YXDA 1RR2A 3DFQA 1EP2A 1ZJIA 5D33A 4AEOA 4WD0A 1K7EA 1VYRA 3K30A 2A4AA 4XTIA 3NQEA 1MZHA 4MOZA 1RZMA 5I3KA 2V30A 3QC3A 1R2RA 4RKAA 1FY6A 2H8XA 4KFPA 3CWOX 1GTEA 3TMLA 2Y89A 1VHCA 3TMQA 3DFOA 4LC8A 2DORA 4O1DA 1R2TA 3MHFA 4FX7A 1KFCA 2VENA 4H4IA 2JKPA 1HTIA 1TMHA 4Z0JA 5F1UA 4XBKA 3LM7A 3T78A 2V9DA 3C8FA 3UWUA 4ZMGA 4IXHA 3N34A 3QMRA 4NJKA 3T40A 3U8GA 2VEMA 1F05A 4HSNA 2QCCA 3U2OA 4PTNA 3LI1A 1JR1A 3FJ6A 1WV2A 3KRZA 1EWEA 1GEQA 3PF3A 1TIMA 1OFBA 2Y63A 3IVTA 1H7OA 1F73A 4A21A 4MIMA 4I7WA 1SU5A 3W76A 1FWTA 5FI8A 3BGJA 3L5MA 3B0VC 3KRSA 1G4SA 4U28A 3W2MA 3ZFHA 4JNMA 4NUWA 3NR0A 1H60A 4JY8A 4ADSA 5J5DA 3W1RA 1GVRA 5TBOA 1TTIA 1I8JA 4JIPA 2ZRWA 1SR9A 3KVLA 3DFNA 1G4TA 4AWSA 3GK0A 4JDBA 4QITA 2V2HA 3GAYA 4UCGA 4IX2A 4XKYB 1ZAIA 2C15A 3NG3A 4O1AA 2VXNA 3TR2A 1R2SA 2ATSA 3HGOA 3W84A 4AF0A 1NVMA 1L2UA 4LS0A 4JX5A 1TREA 3OIXA 3PS7A 1TPFA 3GNDA 1LRTA 2QAFA 4JGDA 1JQXA 4C1KA 2B4GA 1P1XA 3TE9A 3DFPA 3EX2A 5H91A 1JULA 1Q6RA 5LKYA 1GG0A 3IRDA 2ZTKA 2OZ0A 3ZWSA 2ISVA 4UNKA 3LV6A 4WJEA 2VFHA 4JTFA 4A2RA 2ZCGA 1JCYA 3M41A 4UR8A 2ZYFA 1P5BA 2ZFAA 3P7YA 2H8ZA 3LERA 1AW5A 1R46A 1KA9F 4IUOA 4FNPA 3TW7A 1E51A 2Y61A 3QW3A 1H1ZA 1HO1A 3M5YA 4XQ6A 1OX4B 3W86A 1DVJA 1B9BA 4XZ9A 2E68A 4NNBA 4CCDA 3L5LA 1H7XA 2YFNA 3W70A 4OU1A 4EWND 2WJZA 3W7LA 1DQXA 2V81A 2A5HA 4E0CA 3B03A 2FLIA 3HO8A 1TRDA 3TXVA 3LCIA 5AHNA 1EX5A 2CZEA 4GE8A 3TUUA 3IGUA 5HQEA 4ZL1A 4HPJA 3BO9A 4O0KA 4RR4A 2ZRUA 2I9EA 3GVGA 3TNOA 5U7SA 3QF0A 2Y7FA 2FFCA 2WSQA 1AL8A 1VC4A 3P62A 3MW7A 4UTUA 4EF9A 1O5KA 3O06A 1X8FA 4X22A 3FKKA 2QCDA 4JXCA 2ZZ5A 1DJNA 3T4CA 3TK7A 2R94A 5FF7A 3S8HA 3UYCA 3STCA 3C2OA 2HTMA 2B7PA 1B57A 3M47A 4YCOA 1TRIA 2E77A 4MVAA 3BG9A 1G4PA 1LZOA 4O53A 1MSSA 3NEVA 4J9JA 2VELA 4Y8FA 2WOQA 2V2DA 5EKYA 2O7QA 3TQ0A 3O8AA 4PL2A 3W7EA 5AFDA 5DBUA 4AVFA 1VYPX 5CSSA 5K2ZA 4ADUA 2A7NA 1IXQA 5AN7A 3T44A 1D9EA 3HOJA 2Z2UA 1X7FA 4P61A 1ZNNA 2ZZ2A 1UJPA 3G1XA 4WXZA 3TU9A 4CCCA 4CQ9A 2NV1A 4FXSA 3W9ZA 2ZTJA 4RX0A 4LNYA 1NAL1 3G1HA 3W2LA 2F7FA 1PCKA 2C19A 6TIMA 4JTSA 1JVNA 1OX5A 2YX0A 4QM1A 1G4EA 4BK9A 1W56A 3EX6A 4EVZA 5C55A 5EMUA 4Y9AA 3PUOA 3E0IA 1OYBA 1J4EA 1FXPA 3LRLA 3O6DA 1IF2A 4BR1A 4XBSA 1VZWA 3MBFA 2QDGA 3BW4A 4WZHA 1KM4A 1WBHA 1XI3A 1ME9A 1PV8A 1JCLA 2X1RA 2W6RA 2A6LA 3G22A 3LXBA 3OEXA 4CNPA 5BMXA 4N02A 2TSYA 4UTLA 1WX0A 5D03A 1ZCOA 4O28A 5D04C 1U5JA 5F4WA 3MP4A 1QPNA 2ZRXA 3FYOA 3L9CA 4I9AA 5DLCA 4CQ8A 4IMEA 1KFLA 3HJZA 3P8IA 1ADOA 2O7SA 2G96A 1TQJA 4NNCA 1J5TA 1C8VA 1OVDA 3HQ1A 4FNUA 3NZRA 3W1QA 4JYEA 1EEPA 1JCXA 4OWGA 1YXYA 7TIMA 5CPMA 1K03A 4UC5A 4YMZA 2QAPA 2QCEA 5LSMA 1QO5A 3NQDA 4UXDA 5HULA 1LRNA 2Y70A 1NEYA 5F4SA 4AB4A 2PRHA 1VCFA 4K37A 3VI2A 4RZ6A 4JS3A 1G6CA 3JR2A 4HHPA 1YYAA 2D73A 2VFGA 3LCXA 1DHPA 1J2WA 1V5XA 4ALDA 1SSGA 4HNTA 3VNDA 3HPZA 1W3NA 3G3MA 4DBDA 4OHQA 3C2FA 2A7PA 1P0KA 2GUUA 3QSTA 3SW6A 1FCUA 3G1SA 1QR7A 3JS3A 3MWAA 3MI6A 5BRBA 4DXVA 4PFMA 4MJZA 1HG3A 3FOKA 3EWXA 1R30A 1VCVA 3NYZA 4Q32A 1W3IA 2H3DA 4U4MA 2GQ8A 3RLVA 1TV8A 1DV7A 4R7JA 5EL1A 1WOBA 2DZVA 2F84A 4WX2A 1KW1A 1G7UA 4OT7A 3OA3A 2E6FA 1CX9A 3M43A 2I14A 4RCXA 5HINA 3S9YA 1EB3A 4PA8A 3LTSA 1TPVA 3EWWA 5F2LA 4MKNA 5ABTA 4AWTA 4K7YA 3W7OA 2ZZ3A 3IVUA 3BLFA 1OFEA 1T0OA 2NX9A 1ONRA 3G1YA 5U4NA 3U6WA 4JTEA 5HR6A 2E5CA 3O05A 5D37A 3DI0A 2X1SA 4KKXA 3MI2A 2ABAA 3W7CA 3W1UA 3UWVA 5J5RA 1AK5A 4M7TA 3FJLA 1JUBA 1QPQA 3B06A 5D2TA 1JRBA 3CTLA 5K4ZA 3W1NA 4K6AA 2TYSA 5IBXC 4TIMA 2BLEA 4Z1DA 1LDCA 1T96A 4Y90A 3CEUA 4RJEA 1GT8A 1L9WA 2GJLA 3EKZA 4EOUA 3HGJA 3HG2A 2R8WA 1A50A 2X1TA 1IXNA 1Q3NA 3LCHA 3SY5A 2XN0A 2CZFA 3QJAA 1A5SA 3BLEA 3MYOA 2CLFA 3MHGA 1MO0A 2DP3A 1TCDA 3D0CA 5CKSA 2NV2A 2C18A 1K02A 5EYWA 1KM2A 5DBTA 3OVPA 4M6VA 1ME8A 2QCNA 2OMAA 2BWGA 1ZAHA 2VFFA 1FWNA 2DZSA 3GR8A 3R8RA 3W88A 3ATZA 4FEZA 1RD5A 3LGEA 4CLMA 4LS2A 4QIUA 4X3ZA 2J27A 2Z6JA 3W7QA 1OX4A 3PULA 3ANYA 5LNSA 4BF9A 3WK3A 3L68A 3N9SA 3GB6A 3H55A 1XXXA 2PC4A 1I4NA 1BTMA 3C2RA 3E12A 3KRUA 2E6DA 1QCWA 1W3TA 3QRHA 3NNTA 3EWBX 4UTWC 3GXTA 5FEPA 1CW2A 3RLUA 1IGSA 4GUHA 4HNNA 1K8XA 4Y96A 3P61A 2Q8LA 2Q3RA 4GBUA 1ME7A 3IGXA 3W2KA 1H7PA 3NOEA 4UNLA 4OGZA 4ZQOA 3HBLA 5HWNA 3TFXA 1C9DA 1SW0A 2Y88A 2CLEA 4FNTA 4FXRA 5DN1A 1PHWA 1RV8A 2JKEA 2QCFA 3EWZA 2ALDA 4O15A 1NFBA 4MFEA 4NZJA 4EF8A 1NSJA 3KVJA 5LNVA 2FTPA 3W7JA 4GFSA 3A23A 3S1VA 3SSJA 1PE1A 4JTUA 4Z1CA 2B0MA 3F03K 5DY3A 3GR7A 1SZNA 3SZ8A 1TSIA 1YPIA 2RFGA 1DOSA 3UZ5A 2E5BA 3TSMA 1W8SA 2YW3A 1H62A 4N9EA 3M0ZA 3HIJA 4IMCA 3LOTA 3I68A 3DENA 3QQ0A 3SR7A 4O18A 3M16A 1QFEA 3L65A 3TCEA 4DPPA 3TDFA 3ZS4A 3P81A 1DORA 3IIOA 5AHMA 2Y6ZA 2CZDA 4FHAA 4JN6A 4RZ4A 3H53A 3L67A 4A2SA 2WNNA 2DJLA 4S2BA 3LX9A 3TC7A 5F2GA 3LCFA 3QPZA 3WJZA 3H54A 1LOSA 4OQVA 3NPVA 1BKSA 1N7KA 3S1WA 1SO5A 3IIPA 3LB0A 4ONVA 5DELA 4K7VA 1LBMA 2RH9A 1I2RA 3UXDA 1UBSA 4A3UA 4RXGA 1H7WA 2QEZA 4YL2A 4ICNA 4MFDA 3EXRA 1B4EA 3C6CA 2CU0A 1W5NA 1F74A 2WO5A 3NDOA 3QSRA 3B0PA 1JQVA 3G18A 4RV8A 1PHQA 5AYXA 1VGAA 5HMSA 3A21A 3FIGA 1QOQA 2ZZ7A 4UFKA 4O52A 5D09A 2G5WA 5FESA 3MHUA 2X16A 2YFOA 2GPTA 3M44A 5C54A 4HIBA 3TQVA 2E5DA 4M7SA 3EWYA 5G2WA 2QJHA 1ALDA 5I3IA 5DCEA 3M5VA 3LRKA 3MO7A 5AHIA 4MPQA 3GDKA 2TMDA 3N3MA 4HNUA 3PB2A 4LVAA 3L2IA 3DFTA 3GDRA 5F1VA 5AOUA 4MLJA 4IMDA 4O8RA 4N9CA 1QO2A 1W54A 4UIOA 3HG5A 1GVSA 4Z1BA 1IXPA 3LRMA 3OVRA 4IPJA 3W1MA 3LHVA 3BG3A 5D38A 2QKFA 4O4VA 3N2MA 3KHJA 3WFAA 1OX6A 2YGYA 2GVGA 4TX9A 3TFCA 3TQKA 2PRLA 3O15A 1ICPA 1ZENA 3V1PA 2UV8G 4LUJA 3W85A 5AC6A 3C3NA 4GWEA 4MZ1A 4O11A 1OF8A 1EPXA 3HPSA 2VKZG 4L4LA 2NXHA 1A5BA 1K7XA 2EKCA 1H5YA 2QUTA 5C5YA 2CLHA 5K7JA 5GVJA 3QMTA 4JTLA 4IQLA 3W7RA 5CSRA 2AGKA 4YXGA 4EIVA 1W5QA 4UTIA 2HSAA 3O63A 2BSLA 3NL2A 3OBKA 3R2GA 1XM3A 1ZHAA 1S5VA 3B05A 3ZWTA 3UD6A 1VQTA 2ZDRA 5K9DA 3OHIA 3SFKA 1M7PA 2A1YA 3KFTA 1GYNA 3PR2A 1G7VA 2RDUA 3IVSA 3QM3A 1LROA 2Q3OA 4ZQNA 4R33A 6ALDA 2CLOA 1KFBA 4IPIA 1H7RA 1QMLA 3UNDA 1JRCA 1LLWA 4MLRA 1ICQA 4UR7A 2LLEA 3A9IA 1KBIA 1L6SA 3VE9A 3VKJA 1SZFA 3UWWA 1YDNA 4AWUA 1W5PA 3GX9A 4IXXA 1I2OA 4RXFA 4BWLC 1B4KA 1LBLA 1GVQA 4E2BA 1R47A 3I65A 3UQNA 2WSRA 4UTWA 5FF3A 3WJSA 3NO5A 4GUFA 5AC7A 1SW3A 4LVFA 2VFEA 1PS9A 2DZTA 1JJKA 2ZA3A 4IJBA 4IX0A 2QCLA 4JTJA 1SSDA 3NM1A 2OJPA 3O07A 3ATYA 1TYGA 3P67A 4FX6M 5TIMA 1X6UA 3NQ8A 3GKAA 1I2PA 1UASA 1G69A 3W7HA 3BW3A 1QPRA 4M19A 2H90A 5D2WA 3TAOA 2ATMA 2QCHA 5D2YA 4WOZA 3HB9A 1FX6A 4UMBA 4NVTA 5K9XA 5LHFA 1SO4A 1N55A 3GZ3A 3MMTA 1FWSA 2J9YA 3MYPA 4UFLA 3RFAA 5SWUA 1KFKA 2NWSA 4LW7A 5FF2A 1F6PA 3QQ1A 3HG4A 3BLIA 3V75A 3C52A 1PVNA 2HMCA 2YZRA 2JGQA 3A24A 4NT0A 4ZZ9A 3THAA 5DXYA 5FEXA 1KTCA 5G1YA 4QAIA 3PBUA 3ABOA 5C2XA 1FUYA 4NQ1A 5AYYA 2YR1A 4O54A 5AC8A 4OV4A 4ZQMA 5D2XA 3DBPA 3CEPA 1VHNA 4R34A 3FEMA 1A53A 2ISSA 1O60A 2HS6A 1GQNA 3O6YX 2FB3A 4JTHA 2OT0A 3LHTA 3PBYA 1YLVA 2VEIA 2Y62A 2DZWA 2NUYA 1OF6A 3INPA 1AG1O 4O13A 2NZLA 3FLUA 2Z6IA 5KMYA 1ML1A 2A0NA 5TQLA 3TAKA 3BW2A 4LT9A 4DEFA 3TXZA 2GQ9A 4JEQA 3DKJA 2B7OA 1TB3A 4E2DA 5E1QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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