3O9N | Genus

Total Genus 87

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	87
sequence length	272
structure length	272
Chain Sequence	GNLDIAVYWGQNFDERSLEATCDSGNYAYVIIGFLNTFGGGQTPALDISGHSPSGLEPQIKHCQSKNVKVLLSIGGPAGPYSLDSRSDANDLAVYLFNNFLLPPGHSENNPFGNAVLDGIDFHIEHGGPSQYQLLANILSSFRLKGTEFALTAAPQCVYPDPNLGTVINSATFDAIWVQFYNNPQCSYSSGNAEALMNAWREWSMKARTKKVFLGFPAHPDAAGSGYMPPAKVKFHVFPAAKKSYKFGGIMLWDSYWDTVSQFSNKILGDGV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase inhibitor
molecule keywords	Haementhin
publication title	Crystal Structure of a new form of xylanase-A-amylase inhibitor protein(XAIP-III) at 2.4 A resolution rcsb
total genus	87
structure length	272
sequence length	272
ec nomenclature
pdb deposition date	2010-08-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00704	Glyco_hydro_18	Glycosyl hydrolases family 18

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3o9nA00

2ZXQA 2WMGA 3WSUA 1K6AA 4GO9A 2WMHA 4D6EA 4QP0A 4GINA 3BAJA 2QF8A 2D22A 1E3ZA 4PTMA 4AISA 3OBAA 1KGWA 5BXRA 1JAKA 3BXWA 4OKDA 2X2YA 1L0PA 3K8LA 3S2CA 4AZBA 3WD3A 1WDSA 4GI9A 3VD5A 3VU2A 4AZIA 1EA9C 4UOJA 1MW0A 3J7HA 4ZENA 4XZWA 3W81A 1OD0A 1NH6A 4FMVA 3EDJA 3OB8A 3MS8A 4D71A 5A2BA 2OWWA 3GM8A 4PSRA 1AQHA 1RD6A 4C7GA 5JBFA 5D8WA 4UFIA 2UY2A 3PTQA 1NWTA 3TTSA 4Z2GA 2GFTA 2XWDA 1XCWA 4Q22A 4UR9A 3WEZA 1UUQA 3GDBA 4TXEA 1M01A 1VEMA 1XSIA 4PTVA 1PIGA 2ZUUA 4ML4A 1I1WA 4LYRA 4UQDA 1NWUA 3NJ3A 4WSJA 3QOMA 4MDPA 5GNZA 5AYBA 2YA1A 1RPKA 1XC6A 5AY7A 1ISZA 4NRSA 3EMZA 3CLWA 2YDQA 4AZ7A 4UFHA 2XFRA 2BY2A 2ZUMA 1Q6EA 2CEQA 2GK1A 5D9PA 2EPNA 4BQ3A 2W67A 4Z2HA 1KXTA 3M7SA 3WEOA 1HX0A 1WP6A 2ZUTA 2XVNA 1JFXA 3BCFA 5DF0A 1ZJAA 1J0KA 2WHKA 1ITXA 4CD8A 1J18A 2G8ZA 1TFVA 4M1RA 3VIGA 4JFVA 1KGXA 2VX5A 5I0DA 3ALFA 1TMQA 2CKRA 5CPTA 3CHFA 1GQIA 1D7FA 3WNLA 4ATWA 4JKKA 4X0NA 1E40A 2VCAA 5JIWA 3BAYA 3AMKA 4MB3A 1KBBA 4ZE4A 2Y24A 2RGLA 3N13A 2E9MA 1A3HA 3MUY1 3AICA 5FL0A 5CPQA 5A6MA 1PZ2A 5HPCA 1KCKA 4AC1X 1E0XA 1MQRA 1V08A 1OB0A 4RE4A 8A3HA 3AI0A 3LMYA 2WWCA 2E3ZA 4JFWA 2VZUA 2UY3A 6TAAA 1HP5A 2EJ1A 4P7RA 2Y2WA 5IHSA 4LYQA 1GUVA 1UKPA 3NYDA 2BNJA 3OLIA 1UR2A 2J8GA 3WELA 3VIMA 3KL0A 1BFNA 4BA0A 3N18A 1BLIA 4JIEA 4AW7A 1EOMA 1E70M 3OGVA 3A4AA 5M03A 1W3JA 4WSKA 1PEZA 5FD0A 1ESWA 1QHOA 5EFDA 5A8OA 3NSMA 3OIHA 1WZLA 1JG9A 4XB3A 2G3IA 3E1F1 3WBAA 3ALGA 1I1XA 1VFMA 2OSYA 2VR5A 3POCA 4R27A 4CVWA 4MNMA 2WXDM 2DH3A 2AMGA 2FH6A 3RMEA 4D6DA 1CXKA 3ZT5A 1HKKA 4TTUA 3WMCA 3FHQA 1VBRA 4AD1A 1E1FA 4C7FA 4QCEA 3WNMA 1B3XA 3QHMA 4W7VA 1IZKA 2BHYA 3AZTA 4W89A 3I3BA 5JIPA 5CPSA 3U7VA 1C8QA 1TA3B 2DSUA 3U7BA 3WUEA 3ZSTA 1QI0A 1BSIA 5E09A 4EAMA 3QR3A 5AC4A 1B30A 2B31A 2CETA 2QV4A 2YL6A 3EMQA 3II1A 1U2YA 2WZEA 2FH8A 4XV0A 1QNQA 3WKZA 4ZXOA 1VJSA 3SCWA 2VURA 1UWIA 1E6NA 2CBUA 3IK2A 1UD6A 2PWHA 3RDKA 3VM5A 2YA2A 5A6KA 1MW2A 3NUKA 1OIFA 6CGTA 3VGDA 4JKLA 3DYPA 1LJYA 5F7UA 4NRRA 1PX4A 3WDHA 3WL0A 3ZJ6A 2DSKA 4PTWA 2HVMA 2VZOA 2WPGA 1H5VA 4CU6A 3U57A 4FLSA 2O9TA 2WKLA 3A47A 5EFFA 4GIAA 2WVTA 3SUUA 1XCXA 3WUGA 3TA9A 3BMVA 3G6MA 2WMIA 1HP4A 1O7AA 2CCRA 2CERA 3AIVA 1W3LA 4CVUA 1E1EA 3WNOA 5A94A 4M24A 4CN1A 3VD9A 2O92A 1VIWA 3ARYA 2VX6A 2JF7A 3CZ8A 4KGJA 4AMCA 5FL1A 3OZOA 4KWUA 1J0ZA 4FLRA 3IJ9A 2QMJA 4DWSD 2D2OA 4HMCA 1BF2A 1EGZA 1FA2A 4QCFA 1PX8A 3T0DA 2JALA 1WPCA 2XVGA 5A2AA 1VF8A 3BAKA 1TG7A 1AQ0A 2ZICA 1Q6CA 1HJSA 3RM4A 1V3HA 1H0GA 1UHVA 2VQUA 4PMXA 1UR1A 4IM4A 4RE3A 1DWHM 2DSZA 3RILA 1OBAA 1J12A 4AD2A 3WQ4A 1JDDA 4W88A 3KE0A 4AEEA 3BSGA 5A2CA 4PTXA 3L4UA 3K8MA 1FOBA 3WMBA 1LF1A 1GVIA 3N15A 1E73M 3RM8A 3PHAA 3PTKA 4HP5A 3TTQA 1G1YA 3GBEA 2Q8XA 1WDPA 2J7FA 1VEPA 4UOZA 4V2XA 2W61A 3AIQA 2X1IA 3ZOAA 7CGTA 1J11A 3FY1A 5CLWA 3T08A 3AMLA 3CBWA 5BYWA 3VGBA 2J25A 4HPHA 1H41A 3WD0A 1H49A 2FHBA 3PTMA 2WVSA 1HNYA 1E56A 3GXMA 2EO7A 3B9AA 2DH2A 3N11A 1OINA 2VR4A 4B3LA 3K8KA 4DWSB 4P7NA 5BRPA 1GZJA 2F8QA 9CGTA 4KGLA 2WZIA 4B15A 2FDMA 2XGBA 2IXVA 3NSXA 2NT0A 1R87A 4H7VA 3SCPA 5HOSA 4M8UA 4YPJA 4WIWA 1UWRA 2CYGA 1PX3A 1QBAA 1H0IA 3SUWA 2WMJA 1VJZA 3A6OA 3WH6A 3LPGA 4YN5A 2VZTA 4AZCB 1E4NA 4PMRA 2WNWA 3VIHA 4WKHA 3ARZA 3RO8A 3U5YA 1KQZA 1L8NA 2E8ZA 1W1VA 3L4YA 4CUCA 3OLEA 3CUGA 1TE1A 3AIBA 2X09A 1FHDA 1JDCA 2JEPA 3AJ7A 4W87A 3MKKA 1W2VA 2D0HA 5CG0A 3THDA 2BY1A 1KR0A 2J7GA 3VIFA 5BRQA 5A1AA 5M17A 3FN9A 1V0LA 5DO8A 3FNDA 3DC0A 2WVVB 4P8VA 3L4ZA 3O6AA 2VRQA 3VIKA 2J47A 1R8LA 3MV01 3PZMA 1UWUA 2WBKA 1NOWA 4PCTA 2UWFA 2BV9A 1K9EA 3GH4A 1JI2A 2XIIA 2ZUNA 4X0VA 2UY5A 3PZGA 3W25A 3GXDA 1DWJM 1JZ2A 1GHSA 2GK1B 1VFUA 1HIZA 4KH2A 3AOFA 1JZ7A 4JL1A 1H4PA 5E0FA 1RH9A 3WH9A 1E0VA 3L4TA 1JZ3A 1C90A 1TZ7A 1HKMA 1AVAA 3WMSA 3ZIZA 1K9FA 4JL2A 1H09A 4GZJA 5CGTA 4PUEA 1EO5A 4DUXA 1JZ5A 3CZKA 1ZJBA 4KRTA 1W9UA 3NSNA 3K4AA 2J7CA 1UOKA 2V3EA 3EDDA 1QNOA 4GI6A 3FXYA 1EIBA 3PZQA 2CPUA 3CZJA 1LWHA 1B90A 2WWDA 2D1ZA 3T09A 1JXKA 3K4DA 1JZ4A 4QDMA 3F4VA 1NM9A 5FKYA 2GJPA 3M46A 1E6RA 2CESA 3AMGA 3VGGA 1WAWA 2W5FA 3CUIA 4UQAA 1XH1A 1E0WA 2G4FA 2GJXA 2WVUA 2J74A 4U2YA 3UESA 3AS0A 2YBTA 1QNPA 2DT3A 2DQXA 3MSDA 1ISVA 3VGHA 3SUSA 2DDXA 4UCFA 3CO4A 3N9KA 4HZ6A 2WLZA 5BXPA 2W4XA 1EHAA 2J7HA 1ZB5A 4HU0A 2OWXA 3CHDA 1HVQA 1JNEA 4EKJA 2QMKA 4X9YA 3TP4A 1HJQA 3SEPA 3SCOA 4ACZA 1V0NA 4W86A 1V6VA 1VBUA 2WLYA 4BZYA 3M6DA 4HMDA 4TVUA 3VIJA 4DM2A 3T2PA 1ISWA 4W93A 3SCVA 5ABFA 4TUFA 1U33A 3IANA 4UZSA 2D24A 4NI3A 1E72M 3AHYA 3AHVA 2CBIA 4AD0A 1PIFA 1JXJA 4UNIA 4J3UA 2ZX8A 4JKMA 1CXIA 4Z2JA 1W3KA 2OSWA 3VUPA 2E0PA 4MB4A 4WF7A 1CGTA 3BAXA 1C8XA 3SURA 3FHAA 1OGGA 1PPIA 1UWTA 1GQJA 1FP9A 1CDGA 3WQ5A 2ZUWA 3FW6A 3OLGA 1CBGA 5E70A 4BQ4A 2ZX7A 1BG4A 2CHOA 2GJRA 5E9AA 2EPKX 4IPLA 2VVSA 3WDRA 1BYDA 1BTCA 1QW8A 2ESCA 5LA1A 2DIEA 4TTGA 4CN4A 4P8UA 3SCNA 1ZBCA 1GHRA 4J3VA 2W92A 3WF2A 1UD3A 1WNOA 5HDRA 3DHUA 3AISA 1ZS2A 1JI1A 1W1PA 2E9BA 2PWGA 2YL8A 7TAAA 1JZ8A 1RP8A 5AC5A 3D5HA 1GW1A 1E6PA 4FLOA 1KFWA 3ZMRA 1BGAA 1U30A 1J0HA 3CHEA 3MMUA 4BS0A 2V3GA 1EQPA 5BROA 1GJUA 5BXSA 3ARPA 2X0HA 1BYAA 2G3NA 1ODZA 3VDBA 4AIUA 5A3HA 5GPRA 3ZJKA 3MSGA 1BYCA 1JAEA 4OIFA 1NWRA 3ARUA 1XH0A 4PMUA 1G5AA 3WFLA 5BXTA 4MADA 2QPSA 2EBNA 2ZXDA 1G01A 2YDSA 1XV8A 5C8BB 4CCCA 2V3FA 3ARRA 4XX6A 5I2UA 1MFUA 2XPKA 3N1AA 2XYLA 3BMWA 3AYRA 3OA5A 3VIPA 1QHZA 3W38A 3AROA 4PMVA 1QI5A 3AHTA 4DM1A 4IISA 3MUIA 4LPCA 1UD2A 1C92A 1CIUA 4M56A 4AD5A 5LA0A 3SIMA 1V6YA 3VDHA 4HOXA 2CBVA 1NOUA 2FHFA 2OYKA 1US2A 4J27A 4W85A 4D1IA 1SFSA 4D6JA 3NDZA 4HZ7A 1GNXA 5HNNA 4J3WA 1ZL1A 3S6TA 4XUYA 2CIPA 2XVLA 3BSHA 1VENA 3I3DA 3GH5A 3IJ7A 5D9NA 3WN6A 1JDAA 3AS2A 4JHOA 3CHCA 1UWSA 4N42A 5JBEA 1E6ZA 5A6AA 4AY1A 2WHJA 2D23A 4CU8A 2E8YA 3FAWA 1HL9A 2G3JA 5A6LA 2GVYA 2VT0A 5HPOA 2MANA 1EO7A 3WQ6A 4MAVA 3M07A 3VMPA 1EH9A 1WDQA 3N12A 3KZSA 1CENA 1R85A 3L4XA 1LLOA 1UR4A 3IAPA 3A4XA 2XUCA 3VX0A 1DHKA 4UQ9A 4AZ6A 4F66A 1XD0A 3UR8A 2DEPA 3UG3A 3TTYA 1UQYA 3AIRA 1NP0A 1HN1A 3A4WA 2E9LA 2JFEX 1R7OA 3THCA 4E4PA 4CD6A 1D3CA 3BCDA 2VL4A 4JCLA 4YHGA 4M82A 1QNSA 4HTYA 4MJ2A 5M3WA 1B1YA 5LYRA 4H2CA 4GO8A 5A8PA 1J10A 5A6JA 1X6NA 2WK2A 3IJ8A 5E6YA 2A3EA 1X1NA 3W6LA 5BCAA 1VAHA 3AIUA 4PCSA 3SUVA 4PMZA 1WCGA 1EXPA 2C8NA 2WB5A 3MU7A 4MNLA 3W53A 1J0YA 2EPOA 1TR1A 1GONA 2C0HA 1UR9A 2E4TA 2OSXA 5CJ5A 1M53A 1HJVA 3PBGA 2A3CA 1UQZA 5I6SA 4OUEA 4J3TA 2W66A 2Y8VA 2PBOA 1J9YA 2RGMA 4B3KA 4PMOA 1WO2A 4BQ2A 1VFFA 1TVPA 4Q7NA 5FCZA 1WDRA 1EDQA 3RCNA 2GSJA 2J7DA 4OBRA 4A3HA 4D6FA 3EDKA 2XSAA 4WKAA 4KMQA 1MVYA 1Q6FA 2VJXA 3UR7A 4F9DA 1E43A 1UKOA 2DIJA 3RPMA 1FFQA 3WUBA 4AYSA 1GVYA 4U3AA 3W24A 3VIIA 2FGZA 1EDGA 1K9DA 2O9PA 4EK7A 1C7SA 4P7QA 3WQWA 4DUVA 4GQQA 5CGMA 2PWEA 5FIPA 4HU8A 3W4RA 1MQQA 2YBUA 1CXEA 4MTVA 1FFRA 4CU7A 4AZHA 2QLYA 3WH7A 2PB1A 4LYPA 1E4MM 3WUFA 1HF6A 1LWJA 2DSWA 1UA3A 4J28A 3WD1A 1QVBA 2NW0A 3OGSA 3AS3A 2EXOA 5KEZA 1KR1A 1Q4NX 2ZWZA 5IFPA 1JL8A 2YLLA 2YKKA 3AFBA 3MMDA 1JD9A 1TA3A 2WW5A 4U33A 1X6LA 3HN3A 4WJXA 4LXFA 4H8HA 3I3EA 2NT1A 2BXZA 1UG6A 3EDFA 2XFFA 1FH9A 1E4IA 1F4HA 1C93A 2O9RA 2XVPA 2OLHA 3RIKA 4HPGA 1JYXA 2WSPA 2E40A 5CZKA 3W29A 3UEQA 3VD7A 4W84A 5JBDA 1C91A 2DT2A 3PZTA 4S3JA 1QI2A 2IUZA 3CH9A 1E15A 3AMCA 5A8QA 4QLKA 5M5DA 2VQTA 4AD3A 4CN6A 1UR8A 4RL3A 1BPLB 5D9OA 3BAIA 1WE5A 4CKQA 1OT2A 2BVYA 4OJYA 4ATLA 4J7RA 3NDYA 1SYTA 5A69A 4JCMA 1EOKA 1HJWA 1DWGM 4Z2LA 1KXQA 2J8FA 5D4YA 1VRXA 3QHNA 2YJQA 1OCQA 2CHNA 3VTRA 5A8MA 4W8LA 1W1YA 2WHLA 3VILA 4F9JA 5EB8A 2Y4SA 3VGFA 1XD1A 2VMFA 1IZJA 1JYVA 5AYIA 1ODUA 2VOTA 4HA3A 2QPUA 3SCSA 1JYNA 3WD2A 3PZIA 1E55A 1V3JA 3ARWA 1XHGA 3UETA 2WSKA 2FGLA 3O9NA 2J4GA 3VNZA 3VINA 3VDAA 1KB3A 3WENA 1VEOA 5IFTA 1V3KA 1ISXA 1BQCA 1PJ9A 3ARTA 3W26A 2OWCA 2X8RA 2WMKA 4PMNA 1FH8A 3T0AA 5IXEA 3ARVA 1PZ3A 2XJ7A 4KRUA 1BYBA 1ZU8A 1UD4A 1OGBA 5I78A 3DHPA 1Q6DA 2WC4A 3VVGA 4UTFA 5GNYA 4EE9A 1CYGA 3WF1A 1V3MA 4PRWA 4Z2KA 3CZGA 4ZXLA 3ARQA 4PMQA 1GQLA 4B9ZA 6A3HA 3AYSA 4IUGA 4HOZA 3W37A 2XM1A 3EBVA 3VNYA 3WIJA 1DWAM 3ZT7A 3T0BA 4AEFA 2J79A 2ZUVA 4J3SA 3ZJ8A 4QLLA 3MUAA 4Y7EA 1B0IA 4BF7A 4MJ4A 1KWKA 4B16A 2YLAA 4UZUA 1OSEA 4HZ8A 3WQ8A 1HXJA 5E6ZA 1BAGA 4CGTA 3MV11 1M04A 4AXNA 3UCQA 1E6SM 2WKGA 3WDIA 4H8UA 1BGGA 3AS1A 2Z1SA 4PN2A 5DMYA 3ZO9A 4GKLA 4TVCA 1E5JA 3SCTA 2XVKA 1CGXA 3CMJA 2J78A 4E2OA 2WCGA 4F8XA 2YL9A 5KZ6A 2GDVA 4CCEA 2XM2A 3KEHA 5ABGA 1MW3A 1QI4A 1V02A 4P7LA 3W82A 5EMYA 1NQ6A 2YA0A 1EDTA 4QLJA 1E6QM 2D3NA 3WF3A 3GTNA 3KWXA 4J3XA 3RM9A 4DWSA 3F5KA 2BVDA 3EMCA 4UQBA 2W63A 3CUFA 3O2LA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3O9NA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations