The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
36
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sequence length |
118
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structure length |
118
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Chain Sequence |
ASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEANDNTVRVSETLQRFAW
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Viral protein
|
| molecule keywords |
Nonstructural protein 1
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| publication title |
A Transient Homotypic Interaction Model for the Influenza A Virus NS1 Protein Effector Domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Influenza a virus
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| total genus |
36
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| structure length |
118
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| sequence length |
118
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-08-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RHK A; 3M5R A; 3D6R A; 3O9R A; 3KWI A; 3O9T A; 3O9U A; 3EE9 A; 3KWG A; 2KKZ A; 3P38 A; 4OPA A; 3OA9 A; 3O9S A; 3EE8 A; 3F5T A; 3O9Q A; 4OPH A; 3P39 A; 2GX9 A; 3L4Q A; 3RVC A; 3P31 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KQS M; 3M1F A; 4J2A A; 3NH2 A; 4AHV A; 4FVM A; 4CBW A; 1BQN A; 1SUQ A; 2NLX A; 1T8E A; 1BIZ A; 2HF3 A; 2Z1H A; 3QML A; 4O5B A; 5CE3 A; 1KVA A; 5AZJ A; 1C1B A; 4BC4 A; 2NNW A; 4JLH A; 3RRG A; 4DQP A; 1HKB A; 4FK2 A; 3TR8 A; 3EN9 A; 4FJG A; 2YNI A; 3C65 A; 3ZSV A; 4RW6 A; 4BG9 A; 3VMF B; 4DKW A; 3HBT A; 1D9F A; 2E2Q A; 4LH4 A; 4B3M K; 1TKX A; 5C15 A; 2O8E A; 5EU7 A; 3MAQ A; 4Z0U A; 5KQ8 A; 4B9T A; 2UUA K; 4CF9 A; 1D4X A; 3CM5 A; 2W6K A; 3VOV A; 3KLF A; 4EHT A; 3H1Q A; 3OS1 A; 2HND A; 1NJW A; 2GX9 A; 3S3O A; 4JI6 K; 2ZGZ A; 1RIL A; 3W0L A; 4C8N A; 4DQQ A; 1KVC A; 1JL1 A; 1KFD A; 1QHA A; 3W3D A; 2AJQ A; 4C23 A; 4JRP A; 3MN5 A; 1RT6 A; 3VN5 A; 1MWM A; 4CGH A; 4H5T A; 5E84 A; 3B6O A; 3A2F A; 4M3W A; 1OH8 A; 3QNO A; 4CGF A; 2FXU A; 2F9T A; 4IOC L; 3SQ2 A; 3MEG A; 3K5M A; 1JCF A; 3OYE A; 3ZT2 A; 3D2F B; 4NB4 A; 4W5R A; 3G25 A; 1WSG A; 1XI1 A; 1ILY A; 1HLU A; 1RNH A; 1HQU A; 1N32 K; 4JI8 K; 3VEV A; 3NVM A; 3OJS A; 4IG3 A; 2KKZ A; 1A5W A; 3OTO K; 3O80 A; 3PX6 A; 4A5B A; 3EY1 A; 3M8S A; 3C6A A; 3CYM A; 1Q9X A; 1RTH A; 4BVO A; 1ASV A; 4WE1 A; 4BRL A; 5BN9 A; 4Y0W A; 1J9A A; 2DTU A; 2ZJP L; 1VQL N; 4BRA A; 4FZY A; 4N56 A; 3O4N A; 2Q36 A; 1UA0 A; 4I9L A; 1JLF A; 1MDU B; 3L0Q A; 4JK9 A; 1TKT A; 2FBV A; 1VQ4 N; 1L3T A; 4JI4 K; 1HPM A; 5D3G A; 3V9U A; 3VQ5 A; 1W7A A; 1L3S A; 1UAX A; 4CEF A; 4DSI A; 4FJ7 A; 1U04 A; 3P39 A; 3IFR A; 1U2V B; 3PO5 A; 1TK0 A; 1W9H A; 3AA3 A; 3SQ0 A; 5ADX H; 4WFN L; 3THW B; 2OZS A; 1NK7 A; 4GY2 B; 1ATN A; 3H45 C; 2NZT A; 4LF7 K; 1VK0 A; 5HRP A; 3D45 A; 2QXF A; 3LWL A; 4M3R A; 4FLY A; 3LPT A; 2DFE A; 4B9U A; 4CJT A; 2HBM A; 4H5W A; 3F5T A; 3ID6 A; 5HRR A; 4CEZ A; 2EWS A; 4IFV A; 1SAZ A; 4B1Z A; 1XQS C; 3BP8 A; 3TSU A; 3SUQ A; 1BL3 A; 3E01 A; 3UKU A; 3VQ8 A; 1SKR A; 1YHQ N; 2ETJ A; 4ID1 A; 3HST B; 3CCE N; 1HNX K; 4EAH D; 3T1Y K; 2YNG A; 4JI0 K; 4M41 A; 3O9T A; 3JS6 A; 4CES A; 4PL7 A; 3L2Q A; 4CFB A; 3VGM A; 1GOB A; 4B3T K; 4F8R A; 3V1O A; 4FSV A; 4K25 A; 3O3G A; 2BH1 A; 1KC8 O; 3VPZ A; 3L3U A; 5AQQ A; 4JN4 A; 3G71 N; 4FM1 A; 1M90 O; 1TK5 A; 4DV1 K; 3KD5 E; 3CHW A; 4C1N I; 2OPP A; 3L4I A; 2OPQ A; 2IS3 A; 2YJF A; 3AVA A; 1SKW A; 3OVN A; 4H4M A; 3EZW A; 2GUP A; 1GOC A; 4CJE A; 2RN2 A; 5AQZ A; 1YTU A; 3BY5 A; 4K41 A; 4ILG B; 4F2S A; 4JNE A; 4WF9 L; 3U6F A; 5C12 A; 1E4F T; 3HPO A; 3DLL L; 3U9D A; 4DU4 A; 3AGR A; 4DR2 K; 4BWM A; 5BRE A; 1HNZ K; 3ZSZ A; 3AAR A; 4RG8 A; 4CJU A; 2YHB A; 2HMP A; 5CZ2 A; 4DV7 K; 3HRG A; 5AQY A; 4DFJ A; 3OYB A; 4H0T B; 4KFB A; 3T1A A; 3HPH A; 2VYP A; 1J6Z A; 5HBM A; 4CEC A; 3WEE B; 1S3X A; 3CCV N; 2QWO A; 1NK9 A; 4CZF A; 3CFO A; 4JKA A; 3AV9 A; 4FJ8 A; 4FWR A; 4GKJ K; 1GLF O; 3V1Q A; 3V9Z A; 4IBN A; 3WT0 A; 1QQN A; 1X3N A; 2XY8 A; 4OLB A; 2A3Z A; 1S6P A; 3TPQ A; 1L3V A; 4CJV A; 4BR5 A; 1K8K B; 1KLM A; 3NBP A; 4KHY A; 5EY4 A; 4TSX A; 4LF5 K; 2VG5 A; 3ENO A; 4B9M A; 2QWQ A; 1WSJ A; 3TTD A; 1WUA A; 3V81 A; 4BQL A; 4OO1 J; 4CFC A; 1BIS A; 1ASW A; 4LF9 K; 1D8Y A; 3CC7 N; 3DLR A; 5B8H A; 4YHH K; 3DI6 A; 5FPD A; 5GAH P; 4CGD A; 4EFH A; 3AO4 A; 1RT7 A; 5AR0 A; 3I33 A; 3CJC A; 4E7H A; 3VQE A; 3OBY A; 4GW6 A; 2XRI A; 3E1Y A; 4FOE A; 4DQI A; 3HK2 A; 3WXI A; 3QDK A; 5AQU A; 4CJR A; 5AQW A; 4BY9 C; 2OPR A; 4FJ5 A; 4DQS A; 4HTL A; 4DTU A; 4DTM A; 3U3G A; 4O55 A; 3R9P A; 1A5V A; 3UKR B; 1NBW A; 3IRX A; 4C8O A; 5GIN A; 2GEL A; 3TTC A; 2P51 A; 3DRR A; 2NRH A; 3A5L C; 5AFU A; 3MWP A; 3IUC A; 3R3L A; 5HRN A; 1QSY A; 1W97 L; 4NLC A; 1Q9Y A; 1BI4 B; 4N5S A; 4HUG A; 2HF4 A; 5BRF A; 2ZGY A; 3WNH A; 4FL9 A; 4BC5 A; 5AQM A; 2HVI A; 1WLJ A; 3HM9 A; 4CZK A; 2DPN A; 3O1W A; 2E1Y A; 3HTV A; 4FLV A; 4Q5V A; 2VQF K; 1NGH A; 4DB3 A; 3AA2 A; 4YDU C; 4H0X B; 1WOQ A; 3NMU A; 2IIR A; 2O4I A; 4NLB A; 3TAB A; 3ATU A; 2QWL A; 3AVB A; 5C25 A; 2YHX A; 1OH7 A; 3E9P A; 4FWM A; 5C10 A; 1DTT A; 1LW2 A; 4I2Q A; 3S9H A; 4JV5 K; 3CF5 L; 4B1V A; 2X6N A; 3G10 A; 2NRZ A; 4CEO A; 3FGU A; 2DY4 A; 1GLA G; 1N8R O; 1NJX A; 2E88 A; 2ZWH A; 4PL8 A; 4CJP A; 4JKH A; 1MU2 A; 4PKG A; 1VQ6 N; 4DF4 A; 1VSJ A; 3VGL A; 2Q97 A; 3ALY A; 2HNY A; 4A59 A; 3OYN A; 3D2F A; 1YXQ A; 4NO7 A; 4AQY K; 3OYD A; 1BWF O; 3CPE A; 1NGJ A; 4FW1 A; 3SBG A; 3QIP A; 1YI2 N; 1IBK K; 4DSJ A; 3VEX A; 1VQK N; 1FXX A; 4DR6 K; 1C1C A; 5LJW A; 4ZTJ A; 4CER A; 4A62 A; 5GAG P; 3QER A; 3RMB A; 1C6V A; 1P90 A; 4UQG A; 4NCB A; 3VGK A; 4HTU A; 5HOO A; 4XH5 A; 4EP5 A; 3MX2 A; 1ZBI A; 4O0J A; 3H3N O; 1KRP A; 1NOZ A; 1JLB A; 3LDL A; 1JLC A; 1J54 A; 2O8C A; 5KI6 A; 3EZ5 A; 3OYH A; 3SJJ A; 1VSE A; 1B92 A; 4AHC A; 4H0V B; 4KHS A; 3U4L A; 4G9Z A; 4LF8 K; 1I94 K; 3SK3 A; 5F0X A; 3H6E A; 2O4G A; 3VEN A; 5FLX O; 3WUH A; 2KFN A; 1U2V A; 4OPJ A; 3V1R A; 2OTJ N; 4BR7 A; 3THW A; 3CCU N; 3GE1 A; 4AHR A; 4JAX A; 4CEQ A; 5BRD A; 1GLL O; 2BTF A; 3F73 A; 3H1V X; 4B1W B; 4CVN E; 3T3F A; 2G8K A; 5AQO A; 3AVK A; 3SLC A; 2A41 A; 3GBT A; 4MO5 A; 3VA3 A; 1BGX T; 3AVH A; 2UXC K; 5ADX A; 1BIU A; 1ZBF A; 2YX6 A; 3I56 N; 3RR8 A; 2QK9 A; 5JVH L; 2NRR A; 4FM0 A; 3P38 A; 3SV3 A; 4M3Z A; 4DV4 K; 3HP9 A; 5BR8 K; 4DTP A; 2BE2 A; 2V7Y A; 3EO3 A; 3LDN A; 4BG8 A; 1C0T A; 1MWK A; 1XMQ K; 3LZJ A; 3IAY A; 1S1W A; 3HJF A; 3FR0 A; 2G8V A; 4FZZ A; 1CZA N; 4J8F A; 4F9O A; 4CHY A; 1HPZ A; 1YIT N; 3T19 A; 4FJI A; 3J8A A; 4YOW A; 1MA9 B; 1QTM A; 1SV5 A; 3QO9 A; 3E66 A; 4I2P A; 5AQX A; 4LF6 K; 4DTS A; 1YJN N; 4QAG A; 3KLG A; 1K6Y A; 5TKY A; 5AQJ A; 4KH4 A; 5I3U A; 3V9W A; 1U6Z A; 4MLH A; 4KBO A; 3J81 O; 4NYF A; 3NGZ A; 3ULD A; 3PLA A; 3ZX0 A; 2VWB A; 1J5O A; 4FVU A; 5BRH A; 3CJ7 A; 4YOY A; 3HOS A; 2QEX N; 2HHU A; 3U9Z A; 3D0P A; 5EX5 A; 3LP1 A; 1QHT A; 4IDH A; 2CGJ A; 3OYI A; 5JIC A; 1NGB A; 3NF6 A; 4DU1 A; 3A5O C; 1VQN N; 1VAZ A; 4E0D A; 3SAF A; 1S1V A; 1XNR K; 4CF2 A; 2FSN A; 3GL1 A; 2YHY A; 3WEE A; 1N36 K; 5JLF A; 2FSJ A; 4X66 K; 4AH9 A; 4FWN A; 3CCS N; 4E7K A; 2G8H A; 4FJ9 A; 2FLO A; 3N4Q A; 4DMN A; 2VG6 A; 4DS4 A; 4Q0B A; 5KTQ A; 2FSK A; 3NCI A; 3NF8 A; 5C42 A; 3SQ4 A; 3FE1 A; 4KHQ A; 2D1K A; 3DAW A; 4GV3 A; 2V7Z A; 4FJN A; 3MX5 A; 2IVP A; 2KZM A; 1K8K A; 5FPE A; 3CIP A; 4FXD A; 3AO3 A; 4HCC A; 1WB9 A; 2QWN A; 3CCL N; 3C6U A; 3VTI A; 3A5M C; 4CZI A; 4GMJ B; 4OPK A; 1LCU A; 1Q8I A; 2YNH A; 3KZB A; 4KHP K; 3AVL A; 4EHU A; 2HOE A; 2P9N B; 3QEI A; 1TKZ A; 4B3R K; 3MXM A; 3KLH A; 1LWC A; 1RTJ A; 1IJJ A; 3IG1 A; 3IMX A; 1KTQ A; 5KRS A; 4YOV A; 4BC3 A; 1FKO A; 5CYM A; 3SUO A; 4CHQ A; 1DGK N; 2FF3 B; 3QFU A; 4EIA A; 3CJ9 A; 4DTO A; 3B8A X; 4DLG A; 2HVH A; 1RT1 A; 1GLJ O; 3TU5 A; 4DLE A; 2JGU A; 4H0Y B; 5C2F A; 4AM7 A; 2KFZ A; 1KSP A; 3M8Q A; 4B08 A; 1LWF A; 3M8P A; 3OW2 M; 4YY3 K; 2A1R A; 1Q81 O; 3JXU A; 1HUX A; 3CCM N; 4KKO A; 4MQ3 A; 4JKD A; 3TI0 A; 4QOZ B; 1RBU A; 4H5R A; 3UKR A; 3CC4 N; 2UYT A; 3MEE A; 1VQM N; 3ZET B; 5EVZ A; 4FLW A; 4EZ9 A; 1YTA A; 3P1G A; 3ZSY A; 3ZT4 A; 2IVO A; 2AA4 A; 2OPS A; 4W5Q A; 4DFP A; 2HHW A; 4A2B A; 1TL1 A; 3N4P A; 3SPZ A; 4PUO A; 3DMJ A; 1XC9 A; 3E9L A; 3K59 A; 3FZH A; 4OGC A; 3EKU A; 3G6E N; 1BI4 A; 1RT5 A; 4GVM A; 3DWL A; 4H8K A; 4AHU A; 1X1P A; 3OYC A; 3HO1 A; 1O1W A; 4E1N A; 3FFK B; 4FO0 A; 4M3U A; 5TKW A; 1CLQ A; 1IKY A; 1SL1 A; 4JHD B; 3ZX3 A; 4O8U A; 1RBT A; 2H3G X; 4BRP A; 3DJC A; 1RDD A; 3TAN A; 2D0A A; 2NRT A; 5HL7 L; 4KTZ A; 1KAX A; 5AQT A; 4CZG A; 1U49 A; 1DT9 A; 3ZT1 A; 4B1U B; 2O8F B; 3H46 O; 4DTR A; 2G8W A; 3L2W A; 3AAP A; 4BC2 A; 5FPN A; 3ID8 A; 1CZ9 A; 3ZEU B; 1FW6 A; 4NCA A; 4LSL A; 4CBU A; 3IS9 A; 5J2Q A; 4BE2 A; 4A5A A; 3CC2 N; 2ZJQ L; 1NGF A; 1IKW A; 2ATQ A; 4JKE A; 5AZI B; 4ELT A; 4IKF A; 1I39 A; 1K73 O; 2O8C B; 4CJF A; 3HYF A; 4JKF A; 4YFU A; 5AQP A; 1TYQ B; 1L3U A; 1KXP A; 5J1E A; 2YJE A; 4ISE A; 3KTQ A; 4ILJ A; 3L2U A; 5KGX A; 1T6C A; 4DV6 K; 3FZM A; 5HP1 A; 1T03 A; 3VQP A; 1JCG A; 1NGE A; 2GTD A; 1SQK A; 1X9S A; 4ELV A; 1J5E K; 4J2B A; 2X78 A; 2DFF A; 3AAQ A; 4BQZ A; 2HMI A; 3AO5 A; 4FCY A; 3ZSR A; 2JWK A; 4M7X A; 4XH4 A; 4L8R B; 2QA4 N; 1S22 A; 1TUU A; 2JLE A; 1T6D A; 2E1Z A; 2RKI A; 4CJL A; 4HHT A; 2XY5 A; 1HJR A; 4FWK A; 1TGO A; 5DM7 L; 2IOC A; 1NK8 A; 4O5F A; 4CHO A; 1JLG A; 3CCJ N; 2B5J A; 3Q7C A; 4M42 A; 3BZK A; 2ZF5 O; 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3AO1 A; 3OYF A; 1QVG M; 3VQA A; 3ATV A; 2B4J A; 3V9X A; 4HCB A; 3PY8 A; 1TKD A; 3LAM A; 3WNF A; 3HL8 A; 1RT4 A; 4OJR A; 1O13 A; 1VRT A; 2CGL A; 2NUB A; 3CER A; 3OBW A; 4U7B A; 1NJY A; 3LP2 A; 3DRP A; 1X9M A; 1GLC G; 1SL2 A; 4IJN A; 1EX4 A; 3F9K A; 3ISN C; 2W41 A; 1RDU A; 3JYT A; 4UY8 O; 3EE8 A; 4OX9 K; 4AIL C; 2A5X A; 2YHA A; 4FYD A; 4PHT X; 2KZZ A; 1NGA A; 3TAP A; 2NRX A; 1WSE A; 3NVK A; 4V19 S; 3V9S A; 1NG9 A; 3L2R A; 1DKG D; 1YJ9 N; 2PAV A; 5JMV A; 5MLC Q; 5M1Q A; 2P9N A; 3DXK B; 3KWI A; 2YKM A; 4PY5 A; 4CCH A; 4PKH A; 4RW9 A; 4BDZ A; 4YOT A; 3HSC A; 2E2N A; 3AVJ A; 5JS2 A; 5AQS A; 1JXB A; 3O4W A; 4YOU A; 1V4S A; 2ZJR L; 4I9Q A; 4IO8 A; 4IEE A; 5E26 A; 2ZD1 A; 3VQC A; 1J53 A; 3O5B A; 3WQT A; 5FDL A; 3ZCM A; 1IO2 A; 4YNQ A; 3LP3 A; 2W6L A; 4BRD A; 4E1M A; 4XIU A; 2F4V K; 5M1P A; 4BR9 A; 4RWT A; 2Q1N A; 5BPN A; 3K57 A; 3DLB A; 3ZET A; 2VGM A; 5GIP A; 3OHR A; 2XHB A; 4Z94 A; 3CI5 A; 3KHY A; 4CJW A; 3ZLJ A; 3TAQ A; 4X64 K; 4KI4 A; 2YNF A; 5CY4 A; 4LFC K; 1HQE A; 5H1S Q; 2YV0 X; 1NGG A; 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