3OHRA

Crystal structure of fructokinase from bacillus subtilis complexed with adp
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
294
structure length
281
Chain Sequence
AMLGGIEAGGTFVCAVGREDGTIIDRIEFPTMPDETIEVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDTSQTYGTITATPAGWRHYPFLQTVNEMIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPIILGGGVMQQQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Putative fructokinase
publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 76
structure length 281
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2010-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ohrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ohrA01
2W40A 1WUAA 2A42A 1SAZA 2I7NA 3HBTA 5AQZA 5AZIB 2PBDA 3ZETB 5FPEA 5AQPA 4MO4A 2YHWA 4C23A 1E4FT 1U2VA 3GOIA 4CBWA 4CZMA 1QQMA 1EQYA 1T6CA 3M6GA 3S41A 2D1KA 4MLEA 3ZX3A 1BO5O 3A5LC 3UKRA 2GTDA 4QS7A 4WQ5C 2EWSA 3QDKA 4PL7A 4M7YA 3A5MC 2ZGZA 5AQKA 3D2FB 1HUXA 3WQTA 2Q0RA 3AARA 4B1ZA 5LY3A 4K41A 3ID8A 1QZ6A 2P9LB 5FPMA 2GEMA 1V4TA 5CE3A 4MO5A 3P4IA 3VF2A 3EN9A 3QB0A 4WYBA 5AQTA 4J8FA 2P9NA 5KPTA 3GL1A 4B1VA 3WT0A 2P9PA 4BQLA 4IJNA 4JD2B 5LJVA 4FPBA 1MWKA 3DXMA 4EFHA 2ASPA 1Q18A 3VGKA 3L4IA 5LJWA 3ATVA 2DPNA 2V52B 3U8XA 1IG8A 1KAXA 4BR5A 4I6MB 2HOEA 1LCUA 3FR0A 3VF6A 4B1WB 5TKYA 5BRDA 4IO8A 4JHDB 3BF3A 4BG8A 4CZGA 1R59O 3A0IX 3LDQA 2E1ZA 3RSEB 2CGJA 1SZ2A 4H0OA 3EKSA 4F9OA 2HMPA 4PKIA 5KQDA 3GE1A 4FWQA 4DCHA 2D0OA 4K43A 3BF1A 1ESVA 2QWRA 5BN9A 4QS8A 1TYQA 3DXKB 3MK6A 3MCPA 3CQXA 4BC3A 3L0QA 3WQUA 4BRFA 4ISFA 3A5OC 2CGKA 4BVOA 1H1VA 3O1BA 2P9KB 2FF3B 2CH5A 3M1FA 1JCGA 3U9ZA 3WEEB 4CZEA 4BRMA 1NGIA 2P9UA 3CJCA 1HLUA 2Q2RA 2Q31A 4BRPA 3WXIA 5AQJA 4GY2B 5EXWA 3U4LA 2IVOA 3WXKA 4XH5A 3KHYA 1J6ZA 4H0XB 3LDLA 4BR2A 4BR7A 3VPZA 1D4XA 2QWLA 3IMXA 1NLVA 2I7PA 3IFRA 3H45C 1ATNA 3MN7A 4BC4A 1P8ZA 4BRDA 2ASOA 2D0PA 5F1XA 3MN9A 4PKGA 4FWOA 3DJCA 3U9DA 3VERA 4A62A 4BRHA 1XUPO 1HX1A 3C7NA 2P9SA 3FZMA 5KPZA 1GLBG 1U6ZA 3O6WA 2FSJA 1GLFO 4Z94A 4JAXA 4GNIA 1BA1A 3EZWA 4MLHA 1ZC6A 3TU5A 3CETA 4AM7A 2A6AA 1X3MA 2QWOA 2YJFA 4HWIA 5AZIA 5AZJA 1OKJA 1KXPA 4CZJA 4CI6A 1BOTO 2ZWHA 3KVGA 5FPDA 5AFUH 1BA0A 1DKGD 4CD1A 1JCFA 1X3NA 4E1JA 2P9IB 4CJ7A 4B1UB 2E1YA 2YI1A 4BRCA 1HKCA 4BR4A 3CERA 3ZEUB 5KPRA 3I8BA 2BUPA 3VEYA 3H3OB 3HI0A 4ISEA 4XH1A 4FWKA 4YDUC 1WOQA 4FOEA 4CZIA 3MDQA 3AAPA 3IDHA 1NWKA 3G25A 3CJ1A 2VCPA 3OHRA 3H3NO 4A2AA 2E20A 4FWMA 1GLLO 1NGCA 5B8HA 2WUSA 4BRNA 1LOTB 1RGIA 3ENOA 3L6QA 4H5WA 4BG9A 1Z05A 1XC3A 5AQIA 3MMVA 5ELZA 3QMLA 5BR9A 3CI5A 4WQ4A 3QFPA 3GDQA 4M63C 1NGEA 4H0VB 4IJAA 1YAGA 2Q0UA 4JD2A 5AQXA 3VGLA 4K42A 2E2OA 3H1VX 4H03B 3TPQA 1X9JA 4Y0WA 3VETA 4FSVA 4B1YB 3ULEB 2QW9A 2Q36A 3HZ6A 3LM2A 4BC5A 3R6MA 2E88A 4BROA 3ZX2A 1NGGA 3CJ7A 4DB3A 4I6MA 2ZF5O 2P9PB 3D2EA 3VEZA 2E8AA 2ZGYA 5AQHA 1NGJA 2V7ZA 3CIPA 3IUCA 1CZAN 2Q97A 4JHDA 3WXJA 1NM1A 1HKGA 1NGBA 4BRQA 3VEXA 3RSEA 5AFUA 4IZ9A 1ATSA 3QFUA 2ITMA 1YXQA 5AQGA 5BPMA 3SJHA 5F2RA 1NGFA 4NO7A 2A41A 3GBTA 4CZHA 1BUPA 3VGMA 5BREA 4ISGA 3LM9A 1E4GT 1YVNA 1XQSC 3DXKA 1G99A 5BN8A 4EHUA 2QWNA 4BREA 4H0YB 2FLOA 3FZFA 1IJJA 2P9KA 3WEEA 3VF4A 2QM1A 2YCHA 3J8AA 3SMPA 1BU6O 5FPNA 3I33A 3LL3A 4BGAA 4EHTA 3B8AX 4FWPA 1TYQB 3BUZB 4IWVA 4M7XA 5AQMA 3FLCO 4B1XB 2QXLA 2V51B 5AQSA 5AR0A 5JLHA 2BTFA 5BRHA 3W0LA 5AQVA 2IVPA 2A3ZA 1ZXOA 1BG3A 1KAYA 3KZBA 4FWLA 1NGDA 1K8KB 3FE1A 4CBUA 3O1WA 5AQLA 3M3ZA 1YUWA 5AQNA 3UKUA 1TUUA 2E2QA 4CZKA 5ADXH 3R8EA 4H5VA 1JCEA 3D7EO 4RCHA 5AQUA 2A5XA 3HTVA 1NBWA 4CZFA 2HF4A 3HSCA 5KQ8A 3A8YA 3ENHA 3JXUA 1NGHA 2NRHA 3JS6A 3ZETA 5JMVA 4BRAA 3QBXA 4BRIA 2HF3A 3H6EA 2IVNA 1QQNA 2QWPA 3O5BA 4FPAA 4IXCA 5EOYA 3VESA 3VENA 2H3GX 3O4WA 1ATRA 4BRGA 3C0BA 2F9TA 3WXLA 4A2BA 3SK3A 2E2NA 2P9IA 2YHYA 1S22A 3EL2A 1BWFO 4H0PA 3ZEUA 4WQ5A 2J4RA 2UYTA 1S3XA 3EKUA 5AZJB 5E26A 2D4WA 2YHXA 2CH6A 4KBOA 4YDUA 4EIAA 3D2FA 5AQOA 3H46O 1U2VB 2F9WA 2P9LA 2NLXA 3AY9A 3UKRB 2PAVA 3LDOA 3CJ9A 3UB5A 4DQ8A 3FZHA 5AQRA 2ASMA 2FSNA 4H5NA 2AA4A 3F9MA 1GLJO 4BGBA 1HPMA 4BR9A 3O80A 1HKBA 1GLDG 1V4SA 1DEJA 3BEXA 3CJBA 3MN5A 5ADXA 2FXUA 5JLFA 2P9NB 4EAHD 5AQYA 5AQFA 1SQKA 2W41A 1DGKN 4BVPA 4PKHA 3ULEA 5EY4A 1MWMA 5AQQA 1C0FA 4NB4A 5EX5A 3EO3A 1C0GA 4WQ4C 3DXMB 2A40A 4FL9A 1T6DA 4JNEA 4FWSA 2GELA 4FWNA 5BRFA 2VYPA 1Y64A 5F0XA 4FWRA 3VEVA 3O8MA 2YJEA 4B9QA 4A61A 3D2EB 2AP1A 3FZKA 1QQOA 3DAWA 4XEIA 1RDWX 4PL8A 3CQYA 3LDNA 4QS9A 5E84A 5AQWA 4RTFD 1GLAG 4H0TB 3BP8A 3SLCA 4BRLA 4BRKA 2OANA 5BPNA 4RWTA 1BDGA 2QWQA 3HM8A 2GWJA 1T44A 1NMDA 2VWBA 1GLEG 3VEWA 3VOVA 5JICA 1GLCG 3LDPA 4O8KA 2GWKA 4H5TA 3VEOA 4L3QA 2QWMA 3WUHA 3R9PA 3CHWA 2GUPA 2FSKA 2E2PA 4H5RA 4FOIA 3DWLA 2KHOA 2P9UB 2V7YA 3ATUA 1QHAA 3UE5A 5BPLA 3QICA 4HTLA 5EVZA 1MA9B 4CD3A 1HJOA 1K8KA 1QZ5A 4CBXA 4FO0A 3GG4A 5I9EB 1ZBSA 4AM6A 3MN6A 3FZLA 4JN4A 4O5FA 4XH4A 3CJAA 3ZX0A 3SMSA 2FF6A 3H1QA 3O08A 1Z6RA 1MDUB 3UKUB 4CZLA 3C7NB 1RFQA 2NZTA 2P9SB 3AAQA 4DHYA 4K25A 1TUYA 3FFKB 2CGLA 3W3DA 3A5NC 2IIRA 2Q1NA 3FGUA 1NGAA 4BR0A 4BQZA 4BC2A 1KAZA 3QBWA 4LC9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WUAA 1WB9A 3OS0A 1N6QA 1SAZA 2I7NA 5AZIB 2PBDA 1FXXA 2VG5A 4MO4A 2O8CB 2KKZA 2JGUA 3BDPA 2YNGA 1HQUA 4JI0K 4CFCA 4ILHA 1U2VA 3GOIA 1OH6A 1LW2A 1YITN 3A5LC 3MWPA 2GTDA 1YHQN 5LL6Z 1KVAA 2QI2A 3A5MC 4FJ8A 2ZGZA 1G15A 1B9FA 3D2FB 4B1ZA 2P9LB 1S72N 3QESA 4Z4FA 3SUQA 4PQUA 3E9LA 2UU9K 3L2VA 3WT0A 3LPTA 2WBNA 1FKOA 4GKKK 3MX2A 2DPNA 1KAXA 2IAJA 1NKBA 3LAMA 1VSJA 3JAMO 3MXJA 3S3MA 4CZGA 4DSJA 4JK7A 1R59O 3A0IX 3RSEB 4QAGA 5J2QA 4CHYA 2CGJA 2X74A 3SNNA 1SKRA 2HMPA 3CM5A 3KD1E 2WONA 1JL1A 2KTQA 1W0HA 4LFCK 3H08A 1LWEA 4OKJA 1ESVA 4W5TA 3M8PA 2ZM6K 4DFKA 3L0QA 4ISFA 2CGKA 1D8YA 1K9MO 1H1VA 4NCBA 3M1FA 3U9ZA 4CZEA 4MQ3A 1NGIA 2P9UA 2Q31A 4FLXA 4B9MA 4KH6A 4GY2B 3SI6A 2IVOA 3WXKA 3ITHA 4H0XB 2P5GA 4BR2A 1RDCA 4E7IA 2RKIA 4HUEA 1C1AA 4YOUA 1NLVA 3PX6A 3CFPA 4FJ9A 1P8ZA 4JRQA 5M1FA 4PKGA 4DF8A 3NF9A 4A62A 1LWFA 3RVCA 1N33K 3OS2A 3PO5A 1VSIA 4Z0UA 4A5AA 3EE8A 1GLFO 4Y1DA 4KREA 2DFHA 2ZJQL 3HOSA 3IS9A 4DV1K 3K5OA 5J2PA 4ELVA 4KHQA 4IEIA 3NH2A 1DLOA 4CK3A 4OPHA 1HYZA 2YJFA 3SAGA 1NU0A 4IOCL 1OKJA 4CEOA 4CZJA 3BZKA 1BOTO 2ZWHA 4DV3K 5AFUH 4AHRA 5KTQA 4CF1A 1DKGD 2P9IB 4CJ7A 4BRCA 3QIPA 3AVNA 4X62K 5HP1A 4WE1A 2Z1GA 3KLGA 4CJ4A 3H3OB 4ISEA 3L3VA 4OVLA 4DV7K 1NOYA 3NMUA 4FOEA 3MDQA 3AAPA 3NF6A 1S6PA 3G25A 3G6EN 3CJ1A 1KFSA 4KI6A 2E20A 1GLLO 3V9SA 4OX9K 5B8HA 4ILGB 2WUSA 1XC3A 3VTIA 2G8FA 3DRSA 3QMLA 3T3FA 3CI5A 1CZBA 4LF4K 4WQ4A 3QFPA 2P5OA 4CEEA 4MDAA 4IJAA 3AVFA 3LAKA 1YAGA 2Q0UA 4K42A 1FJGK 5SWMA 4LY7A 4B1YB 3LM2A 4BC5A 4CIEA 2E88A 3CJ7A 5FDLA 3UIQA 4DR4K 3OYEA 4BE2A 4YOVA 1ZBHA 4I6MA 1KCFA 1WSGA 4AHCA 1IV0A 3C94A 1WLJA 3VQPA 1ASWA 2ZGYA 1W7AA 2V7ZA 1SUQA 3KKRA 3IUCA 3K5NA 4JRPA 1HKGA 1WBDA 3VEXA 2OA8A 4M45A 3QFUA 3L4QA 1YXQA 5BPMA 1NK9A 4FJLA 4FW1A 2A41A 2YHBA 3VGMA 1E4GT 5LMUK 4J2DA 4HUGA 4FJNA 3A2FA 3DXKA 1BIUA 2FBYA 1G99A 5BN8A 4CFDA 4IDKA 4Z4HA 3WEEA 4HCBA 5FPNA 3ZLJA 3LL3A 5GIPA 4EHTA 2B5JA 1X1PA 3RMDA 3EE9A 1RT6A 3HP9A 2BTFA 5JLHA 3CMEN 3HOTA 1ZXOA 1LWCA 4FWLA 1RT5A 5AQLA 4N56A 2QTDA 1RT4A 3G0ZA 1X9WA 1J54A 4CZKA 1JCEA 3AO4A 3VQDA 4CW7B 4B3OA 5T7BA 1W9HA 2HF4A 3HSCA 5KQ8A 4AQYK 1DTQA 2G8HA 2W6LA 3TANA 3CPWM 5JMVA 3MCAB 3CCMN 3P31A 2HF3A 5DM7L 2IVNA 3VENA 2QWPA 1OH5A 4BRGA 1ILYA 1LW0A 4A2BA 3MEEA 1S22A 3PO4A 3EL2A 4R5PA 4BDPA 4CHOA 4H0PA 4FJIA 4DFPA 1HMVA 3EKUA 1DT9A 1J5EK 4KRFA 1O1WA 4JI2K 1UA0A 4CE9A 3KJVA 1O13A 3RR7A 4NLCA 5JS2A 3LP3A 3KIOA 2NLXA 3LDOA 4CJKA 4FJHA 1TV6A 3NH1A 2WTUA 1BHLA 1SL1A 4BGBA 3OYCA 1BQNA 2ZJPL 5CYQA 5FRMA 3Q7CA 4JKAA 3RWUA 4GW6A 4B9UA 3OJUA 1UWBA 1I3AA 2FXUA 2P9NB 4RG8A 4EAHD 5JLFA 5AQYA 1DGKN 4ID5A 3KWGA 3KK2A 1QHTA 2O8DA 1P90A 2Q3SA 1C0GA 4WQ4C 4DSFA 4F8RA 3JYTA 1I94K 1T3VA 1C6VA 3LP2A 2F7TA 5I42A 3I0SA 4DSIA 1S6QA 4DU3A 1U48A 4A61A 5A2QO 4DLGA 3P83D 3KK7A 3CQYA 3DLGA 4H0TB 5BPNA 4FK2A 3VQ6A 1BDGA 2QWQA 4CHZA 4JI7K 3HM8A 4C8MA 1T44A 1TKTA 2BE2A 2VWBA 3HP6A 4EP5A 4FXDA 4A59A 4CIFA 3CHWA 2GUPA 2E2PA 3ENBA 3ZSQA 2NRTA 2XHBA 2V7YA 2F8SA 4JV5K 2PFUA 4KAZA 3AVKA 2O8FA 4Q5VA 1BGXT 3DYAA 4HTLA 4O0IA 5EVZA 1MA9B 4CD3A 2HHTA 1SL0A 1K8KA 1S1WA 1KLMA 4JI1K 4DS4A 3S3OA 3E9OA 2RF2A 4OPAA 2O8BA 5I9EB 3CCJN 4JS4A 3FZLA 3RTVA 4O5FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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