3OS0A

Pfv strand transfer complex (stc) at 2.81 a resolution
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Recombination/dna
molecule keywords Integrase
publication title The mechanism of retroviral integration from X-ray structures of its key intermediates
pubmed doi rcsb
source organism Human spumaretrovirus
total genus 103
structure length 365
sequence length 365
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2010-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 3os0A04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 3os0A01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 3os0A02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3os0A03
3S3OA 1DTTA 2O4XB 3CG7A 3DB4A 1RTHA 4M42A 4DSKA 3ZSRA 1JL2A 5KE3A 3AVBA 3P5JA 2RF2A 3AO2A 2K3YA 3QERA 1L3VA 1L5UA 2PYLA 4AHVA 5FROA 1JLQA 2XY6A 1U49A 4KPYA 4CFAA 2DFEA 3MP6A 3LGFA 4FM0A 5IN1A 2B8AA 3SI6A 4WE1A 4NYNA 1DLOA 2Z1GA 4KHWA 3VQDA 1VSFA 4CESA 2FC0A 2KW4A 3DLRA 2D0BA 4PL6A 1FKPA 3MXIA 4DMNA 3CFRA 3SD4A 4K8ZA 1XHXA 2HHVA 1LWEA 4IUPA 3QNOA 3OYEA 1JXEA 4QQ6A 1ZBHA 1UWBA 3AVGA 4E3SA 4DLGA 2QQRA 2WOMA 4FW2A 3EZ5A 1WN7A 4CJ3A 4KTQA 4FZZA 4CJ5A 3LDSA 3ZSQA 4JS5A 3TAFA 4DG1A 4NCGA 4KHNA 3UWNA 4C8OA 4KB1A 3ASKA 3L3VA 4RG2A 2A1RA 3AVIA 5C25A 4FLVA 4ICLA 1I3AA 2D9TA 2WACA 3ASMA 3HT3A 3PMTA 2JLEA 1BCOA 1QHTA 3VQPA 3TAGA 3UT1A 4E7JA 1WJQA 1U45A 3VQ5A 3P8DA 4RG8A 1VSHA 4OKJA 4C8NA 3IG1A 1NK0A 3PX6A 2DFFA 4CHOA 4M45A 3ITHA 3MEGA 5J2NA 1B9DA 3V81A 3CM6A 3AVKA 3OYGA 2M16A 3U6FA 3QNNA 3AVLA 3NHGA 3RMCA 4CEFA 4CCHA 5HBMA 2GV9A 3PFSA 4LSNA 1TK0A 4BDYA 2YNIA 1TKTA 1Q9XA 4FCYA 1S1TA 3P1GA 1EETA 3A2FA 4KKOA 3VQ8A 3HK2A 4QCLA 1NJYA 4CK3A 4MFBA 2FBYA 3HSTB 4LD0A 3NDKA 1NKCA 4CF1A 1BHLA 2P51A 4J2AA 3HPGA 4DFMA 1IKVA 1NK7A 5HLFA 3L2WA 2VG5A 5KCHA 3QKJA 4RW7A 3ZSXA 3VQBA 5KGXA 1WSEA 3TAMA 2Z1IA 2VYTA 4DS4A 4A4EA 3ZT1A 1RT5A 4CF0A 4FLZA 3O3HA 4DU4A 5D3GA 2R5AA 2VWKA 4CFDA 1QTMA 1WLJA 4FLUA 1QSSA 1N6QA 3KUFA 4EDUA 1SL2A 3FDRA 3OYAA 1C1CA 4Z4CA 3AVAA 4NYFA 1WSGA 4II1A 3TAPA 4QW2A 2RHUA 3IAYA 4NCBA 2IG0A 1J54A 1H3ZA 3ALYA 3NCIA 5J1EA 2GFAA 1VSKA 2G8VA 3KLEA 2LTOA 2HVHA 1A5WA 3OYIA 3CYMA 4KFBA 2KQ2A 3DI6A 3K5LA 4BACA 3KKRA 1FK9A 3ZEHA 1RILA 3F73A 3DLEA 1KFSA 1RTJA 4DTJA 4CEBA 3AVNA 1NJZA 3MP8A 1S6PA 3WNGA 3NBPA 3DOKA 2GBZA 4J2BA 5I42A 4GVMA 3K57A 4N76A 4M3TA 1IH7A 4FK2A 2F5KA 4B08A 4N41A 4B9TA 4DFPA 3BDPA 2X4WA 4C8MA 3NGZA 2ATQA 2XRIA 1U04A 3TANA 4JS4A 4CJEA 4B8CA 4DSEA 3M8RA 2RI5A 4K8XA 1X1PA 5KGWA 3FFIA 3WNHA 1Z25A 1VRUA 2K3XA 3T3FA 5C6SA 4KTZA 2IGIA 3I0RA 4FJJA 4KHUA 4F3OA 2D5RA 2X78A 1ASUA 1SL1A 4CGJA 3PX0A 3S3NA 2LRQA 4B3OA 4CEAA 4DU1A 3TR8A 3O8VA 2E6LA 1BI4A 4E7HA 1TGOA 1ASVA 1IO2A 3QESA 1HYZA 1XHZA 2RJDA 4Z4EA 3EY1A 2B5JA 3DRSA 4KTWA 4KO0A 1S6QA 2ETJA 2OPSA 4IUQA 4OGCA 3NF7A 3DOLA 2ZQBA 1WSFA 4QVZA 3WNEA 2HHQA 3PUFA 3HM9A 4I9LA 2RI3A 5M9OA 3RRHA 4CK1A 3L8BA 1QQCA 1WAJA 3C94A 1RT7A 3ZSWA 3P83D 3VA0A 3SV3A 3G10A 5KI6A 1RI0A 5J2PA 3AVJA 1T03A 1RT1A 3SYZA 3O3FA 3DLBA 4DTSA 4CERA 2G8FA 4LD6A 3NF9A 2X6SA 1TV6A 4N56A 4E7KA 3DLGA 4CEQA 4HTUA 3LP3A 1I39A 2PZSA 3TARA 1SV5A 3NTKA 1TVRA 2XDPA 4B9NA 5HROA 5HRRA 2XHBA 2F96A 1UOCA 1NOYA 1RCHA 1QSLA 4AHUA 1JLBA 1KFDA 4M3UA 2P0KA 3EAEA 2RJEA 1QE1A 3SZ2A 2YNFA 3V9ZA 2RO0A 1VSDA 1KCFA 4GY5A 3B6PA 3OS0A 2OA8A 3M8SA 1VRTA 1D9FA 3SUPA 3L42A 4DQRA 2XY7A 4CJSA 4CJKA 1HRHA 1TL3A 5KRTA 2OPRA 3ZT0A 3AVHA 1RTIA 1LAWA 1WGSA 3L2VA 3ZT4A 3LPUA 1C0UA 3SQ4A 4C5HA 3LAMA 4XIUA 4PUOA 3S9HA 3M9QA 2LDMA 1T7PA 3QIPA 1TK5A 1L3SA 1S1WA 1S1UA 4OVAA 1W9HA 3C95A 3OA6A 4RW8A 3FC3A 1U4BA 2KZMA 2HHUA 1LW0A 4HUEA 4E7LA 3AVFA 3B6OA 4CJWA 1BGXT 4R5PA 2O4IA 3OYDA 4IFVA 1JLAA 5CZ1A 2RKIA 2LSNA 4KAZA 3E9GA 4OVLA 4CHYA 1B92A 1DTQA 3VN5A 1SSFA 1UA1A 1ZBFA 1OYXA 2OYQA 2IDOA 1BIUA 3ULDA 4A4HA 3V1RA 4OPKA 3LWMA 3KTQA 4OKEA 5KH6A 4C8LA 3KJVA 2JTFA 1X9WA 4LY7A 4CF9A 4Z4FA 5HP1A 1BI4B 5CY4A 3T19A 1WJRA 4Y1DA 1A5XA 2RHIA 2NLUA 3RMBA 4FJIA 5HRSA 3SUQA 3T1AA 3ME9A 1EKEA 1N5YA 4PY5A 4CEEA 3KLFA 1HJRA 2I5JA 3DLHA 1RDDA 3LP1A 3AVMA 3E01A 1SKSA 4QAGA 2LCCA 5E41A 4FK0A 1RDCA 2IS3A 3S6WA 3LANA 4IFYA 3SCXA 4B9SA 1NK8A 3LGLA 4HCZA 4Z4IA 1RT3A 3HPHA 4EP5A 3V9UA 4IURA 3AO4A 5DK5A 4F2SA 4DQPA 4DS5A 4IUUA 4IG0A 4IUTA 3SQ2A 3AO3A 1RTDA 4CJFA 5CIUA 1KVAA 3OYKA 4M3ZA 4FU6A 1ZBUA 3BDLA 3PO4A 3NGIA 3CFPA 3L2QA 2DFHA 4KHQA 4CF8A 4CHZA 4FLXA 3RMAA 1L3UA 4DTNA 3OYHA 4DTOA 2P5GA 3AVCA 4CGGA 3CFOA 5FRNA 4HCBA 4CJPA 4IDKA 3Q1JA 3E9FA 5FRMA 3MXMA 3KK1A 2FHDA 4Z0UA 2P5OA 2D0AA 2G8HA 1CXQA 4H8KA 2OPQA 2G8KA 5IAYA 3V4IA 2QKKA 2R7YA 4CF2A 4C8KA 5T7BA 5D6WA 4E1NA 4FVMA 4CE9A 1WSHA 3K58A 1RT2A 3KLGA 2X6NA 2OZSA 4KV8A 1WNSA 3WNFA 2XO7A 2RPIA 1YT3A 4CEOA 1C1BA 2QK9A 3NTHA 3HYFA 4KI6A 4YNQA 3V9WA 1VSJA 3PX4A 4DTMA 3MEEA 1IKWA 4CIGA 2M1HA 3C6TA 2GF7A 3OYLA 3TI0A 1MU2A 4GMJB 4BDPA 4IUVA 2R58A 4RW9A 1BISA 1EP4A 2ZD1A 4UQGA 4UC4A 2ZE2A 2GFUA 4OKKA 4I2PA 1CZ9A 2E5QA 2D0CA 3NF8A 3OJUA 3QIOA 4W5TA 1LAVA 2EQJA 2KTQA 3RR8A 3BGRA 2FBTA 4I7FA 4CJLA 3SUOA 2BE2A 4PQUA 4JRQA 2RHZA 4CIEA 4DFKA 5J2MA 4F3TA 3JYTA 3ZSZA 3AA4A 3LP0A 4DTXA 1UAXA 2DIQA 3KIOA 1JXBA 1G15A 4OPJA 3VQAA 1SKWA 4FLTA 3NAEA 2HHXA 2QQSA 3D0PA 1NKBA 1KLNA 3DRRA 4BD3A 4PLLA 4FJ9A 4FLYA 1C1AA 1HYVA 3O4QA 2QKBA 5KRSA 2X35A 4FW1A 2DIGA 2L89A 3K59A 3SNNA 3AV9A 1VSLA 2RHYA 4FJ5A 4HUFA 4FJNA 3CQ8A 3MEAA 4IBNA 1F21A 4X34A 3DMJA 4DSJA 1NKEA 3L3UA 2HHSA 4A4GA 4Q5VA 4CGHA 4N4GA 1ITGA 1ASWA 3GOXA 3NH1A 1W0HA 3OMCA 3LZJA 1LV5A 4DF4A 3QEXA 5HRPA 4BE2A 2YHBA 4DQSA 2BIVA 4O55A 4FJXA 2HNYA 2BANA 3HVRA 3G0ZA 3RTVA 1S9GA 4G1QA 4CJVA 3NH0A 1RT6A 1VSIA 3C4SA 4IG3A 2FBXA 2CKKA 4JRPA 1K6YA 1TKZA 4ZHRA 1HQUA 2IAJA 1RT4A 4DTUA 1XC9A 4E19A 3RWUA 1S1VA 1HMVA 1ZBIA 3PO5A 3NF6A 1D9DA 4B9LA 4ID5A 4FJLA 1IG9A 5JS2A 3META 1GOBA 3IRXA 1TAUA 2QXFA 4AHSA 2YV0X 4C5IA 3K5OA 1GOCA 1VSMA 3NNQA 3TAEA 4BE0A 4JLHA 4L59A 3QBYA 5JS1A 1TKXA 3LWLA 3HXMA 1JLEA 1HNIA 5SZTA 3NE6A 3PMIA 3H6ZA 1HQEA 2NUBA 1Q9YA 1L3TA 3MP1A 5KCOA 3SQ0A 5KE2A 1C6VA 3OQ5A 2HW3A 2DY4A 2HNZA 4Q0BA 4CHNA 4J2DA 1B9FA 2PQWA 4E1MA 1JLFA 2BGGA 2RHXA 1WSJA 2IC3A 5C0MA 3L2RA 4M3YA 3SV4A 5J39A 5C24A 4W5RA 2EHGA 4CGDA 4B9XA 4B9WA 3OYBA 1G5VA 2P1JA 2Q3SA 2A1SA 3I8DA 1JLCA 3HVTA 1HPZA 4EZ9A 2XK0A 4FJHA 1NK6A 3V9SA 4M41A 3CEYA 2X74A 3AA2A 1REVA 3VQCA 3SUNA 3S3MA 4HCCA 3MECA 1VSEA 3VQ9A 1NJWA 1IKXA 3OMGA 3H8ZA 3KK3A 5C42A 3QO9A 4LH4A 2DTUA 3IS9A 3PNWC 3RR7A 1TK8A 3QEPA 4HHTA 2GUIA 3K2PA 3QIIA 1UA0A 3U3GA 3F70A 1T05A 2BDPA 4M3WA 4F4KA 2MWPA 4CRIA 1Y97A 1R0AA 2KFZA 1LWFA 5HRNA 4ZTJA 4FLWA 4MQ3A 3VQ4A 3SQ1A 5CYQA 1OI1A 3K5NA 3ZSYA 4DU3A 1CLQA 1YTAA 5I3UA 4DSIA 2VG7A 4EP4A 4Q5WA 1GOAA 2F8SA 1VK0A 3V1QA 4CIFA 2XY8A 3OS2A 1KVCA 1CZBA 3AA3A 4E7IA 2VG6A 4N4IA 2HVIA 4N4HA 2HB5A 2X4XA 2W42A 2Y1IA 2E6NA 3AO5A 3F9KA 1ZYQA 5EU7A 4J2EA 2JZ2A 3LZIA 4IKFA 3KD5E 4C5GA 3OYJA 4DTRA 4KI4A 3RRGA 1TAQA 2WONA 2HHWA 3VQ7A 3DM2A 4C5EA 2KFNA 3K5MA 3MAQA 1HYSA 1WSIA 3QINA 1J5OA 4FXDA 4ELVA 4CJRA 1RNHA 3LH0A 3U3YA 1NJXA 1C0TA 4AHRA 3UIQA 4QQDA 4AHTA 3NGYA 4YFUA 4OLBA 1RDAA 1Q8IA 1KHCA 2E4LA 4O44A 5FDLA 2RI2A 1SKRA 4AH9A 2JGUA 4ELUA 1OZ3A 3MO8A 1J9AA 4M3RA 1T8EA 3ZT3A 1TL1A 1BQNA 2EKOA 1QSYA 4DSFA 2AJQA 3QETA 1LW2A 2YRVA 4FJGA 3AO1A 4O5BA 4FL6A 1KTQA 3LX7A 2EX3A 3OYCA 1RBVA 3V1OA 1CXUA 4OLAA 1S9EA 2DAQA 4RW6A 4CHPA 4DQIA 3ZCMA 3M8QA 3NFAA 3NH2A 3RMDA 5KTQA 3QJ6A 1RBTA 3LALA 2RN2A 1NK9A 4B9VA 3TABA 2YNHA 2E6MA 3V9XA 1N27A 4B9UA 3MXJA 5DMRA 2LVMA 1FKOA 3OS1A 4KHYA 3LYIA 2YKMA 4AHCA 2O4GA 3D45A 4BDZA 5J2QA 4FZYA 4N5SA 3I0SA 4NZGA 5D6XA 4FZXC 4E0DA 4QOZB 1ZBLA 2EQUA 3MEUA 3CM5A 1KRPA 3O3GA 3QEIA 4LSLA 4CJUA 4HUGA 2HHTA 3ZSVA 4M3XA 4CEZA 5CYMA 1JKHA 4DWIA 3KLHA 3HP6A 1BCMA 1BQMA 2R5MA 4HVJA 2B6AA 3ZT2A 1TKDA 2Y1JA 3H08A 4FM2A 3LPTA 2YKNA 1IKYA 4L8RB 4KREA 2YHAA 3C6UA 3VA3A 3HP9A 5J26A 4B9MA 4LH5A 3HPOA 4FJ8A 2HQXA 4CJTA 3SPYA 3VQEA 3SPZA 3KLIA 4KRFA 3OJSA 4QQGA 1HNVA 3HJFA 2O4XA 1A5VA 1J53A 2PY5A 2HQEA 3TWHA 1O1WA 3MEVA 3KK2A 3QEVA 4PA1A 4Z02A 1XI1A 5D6YA 2OPPA 3LAKA 2Z1HA 2KZZA 1NK4A 4CFCA 3V6DA 3DYAA 1U48A 2L3RA 3NTIA 4W5NA 4O0IA 4BWJA 4I9QA 1X9MA 3ZSOA 2RJCA 4CK2A 4KHSA 4OGEA 4RW4A 4DLEA 1RDBA 3FEOA 4PLIA 1KVBA 2R57A 2FBVA 2EQKA 4CECA 2XY5A 3OYFA 2BKDN 1JL1A 4FM1A 4I2QA 1BIZA 4BWMA 1SUQA 4EZ6A 1C0MA 2MWOA 4ID1A 3VQQA 3MEDA 2G8IA 4FJKA 1X9SA 4W5OA 1LWCA 4FYDA 2EQMA 1S5JA 3O4NA 3KKSA 4CHQA 1RBRA 3OYNA 4OJRA 3M8PA 2X4YA 4Z4GA 4NCAA 4TSXA 1SL0A 4CGFA 2Z1JA 2B4JA 4W5QA 2ITGA 4F8RA 3PY8A 3OB9A 4NS5A 4O0JA 4FK4A 1MHNA 5CZ2A 4H4MA 1WAFA 4ZTFA 3P8HA 1D8YA 4DF8A 4DSLA 3HL8A 3OY9A 1WJSA 3FLGA 2G8WA 1FXXA 4H4OA 1EX4A 3PV8A 2YNGA 1YTUA 4DQQA 3LLRA 1EXQA 4O4GA 1YVUA 3EYZA 1D5AA 4CJQA 2M0OA 4FJ7A 4CJ4A 1KLMA 3THVA 2BUDA 4F2RA 1U47A 4KB0A 3ISNC 1QS4A 1S1XA 1RBSA 2RJFA 1NOZA 1BL3A 1NK5A 4CGIA 2HMIA 2EFIA 4DFJA 3DLMA 2VWJA 4B8AB 4Z4HA 2G3RA 4DTPA 5SWMA 4CFBA 1XNIA 3AA5X 1RBUA 2OZMA 3SJJA 1KSPA 3OVNA 4A4FA 2F8TA 4BE1A 3QEWA 2G8UA 4FJMA 3LP2A 4N47A 4ELTA 3L2UA 3DB3A 2PYJA 4Y1CA 4PWDA 2HNDA 1JLGA 4CEDA 1OZ2A 3MEWA 1Z26A 4AILC 3TAQA 3VQ6A 3OYMA 1XWLA 2IOCA 3HO1A 5K14A 4GW6A 2L8DA 3JSMA 3QLHA 3DRPA 3DLKA 4E89A 3KD1E
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RH2A 2VPRA 2O4XB 3DB4A 2LLKA 1RDWX 2FMLA 3I59A 3J81K 4GYIA 2HNHA 4M42A 2OCCH 1SEMA 3P5JA 3AVBA 1XCVA 3AO2A 1VQ5I 2P9IA 2VJ4A 2W24A 3NRVA 2FX0A 3VTHA 4KPYA 3KWIA 2NS8A 2DFEA 1K4US 4NHJA 2VQEK 5LJ5j 1ZAOA 4LFUA 5IN1A 5E3OA 2R5ZA 1A0NB 4FWRA 3FHNA 4WE1A 4NYNA 4RCCA 3ZQ7A 2EZHA 2VQHA 4LUEA 4O3MA 1PUFB 3D6RA 2DRKA 3VQDA 4EIAA 4M63C 3C12A 2JK3A 2IGNA 2FC0A 2O8CA 2KW4A 3HOYJ 5CQXA 2D0BA 3DLRA 4B3TK 4PL6A 1FKPA 2O6GE 1XNQK 4DMNA 2A68F 5H20A 4A3IJ 1ZH5A 1I27A 4GXOA 3INZA 1ZBHA 1VQMT 2X6OA 1UWBA 1VQNQ 4B3AA 4E3SA 1B1BA 3M8EA 3EZ5A 4DV1K 1WVRA 3QYFA 3A4CA 1ETKA 4MO7A 1Q7YR 4CJ3A 4DQ2A 4CJ5A 1RI9A 3TAFA 2HNIA 3ZQQA 1N5ZA 1BO5O 4JBAA 4C8OA 1RAIB 3J8AA 5H1SQ 2PN6A 2A1RA 4CZJA 1T3SA 3LA7A 3M53A 2Y69H 1YX5A 2P5KA 2D9TA 3ASMA 1O3SA 4J5YA 1RRQA 4F7UA 3VRZA 1DUXC 1UEBA 3O9SA 2QYZA 3V7CA 2L02A 5CKHA 1P92A 1RESA 4HV6A 1Z0XA 1GLDG 3S8PA 1M3QA 5HKCA 3VPRA 3VPZA 4RG8A 2AZSA 5DM7L 3R8EA 1DPRA 2FRYA 3IG1A 1NK0A 4PDKA 3GBQA 3PX6A 3VERA 3HKSA 1VQ5A 5J4VA 2H94A 4QLCU 1CKBA 4DZPA 3JR9A 2CREA 4M7XA 4YDUC 2DTOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3FLG A;  2G8W A;  1FXX A;  4H4O A;  1EX4 A;  3PV8 A;  2YNG A;  1YTU A;  4DQQ A;  3LLR A;  1EXQ A;  4O4G A;  1YVU A;  3EYZ A;  1D5A A;  4CJQ A;  2M0O A;  4FJ7 A;  4CJ4 A;  1KLM A;  3THV A;  2BUD A;  4F2R A;  1U47 A;  4KB0 A;  3ISN C;  1QS4 A;  1S1X A;  1RBS A;  2RJF A;  1NOZ A;  1BL3 A;  1NK5 A;  4CGI A;  2HMI A;  2EFI A;  4DFJ A;  3DLM A;  2VWJ A;  4B8A B;  4Z4H A;  2G3R A;  4DTP A;  5SWM A;  4CFB A;  1XNI A;  3AA5 X;  1RBU A;  2OZM A;  3SJJ A;  1KSP A;  3OVN A;  4A4F A;  2F8T A;  4BE1 A;  3QEW A;  2G8U A;  4FJM A;  3LP2 A;  4N47 A;  4ELT A;  3L2U A;  3DB3 A;  2PYJ A;  4Y1C A;  4PWD A;  2HND A;  1JLG A;  4CED A;  1OZ2 A;  3MEW A;  1Z26 A;  4AIL C;  3TAQ A;  3VQ6 A;  3OYM A;  1XWL A;  2IOC A;  3HO1 A;  5K14 A;  4GW6 A;  2L8D A;  3JSM A;  3QLH A;  3DRP A;  3DLK A;  4E89 A;  3KD1 E; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5FU7 C;  5CJ9 A;  5BRF A;  2H1L A;  4II2 A;  4CYD A;  1TUD A;  1HBX G;  5CVV A;  3I0X A;  5AQR A;  1SAU A;  3FMS A;  1OI1 A;  5GAN 5;  4A6E A;  1YTA A;  4DSI A;  1EFN A;  1W5T A;  5E26 A;  3CQT A;  3GLL A;  2HF4 A;  1UHW A;  3CBO A;  1STZ A;  1KZH A;  4KUL A;  2XY8 A;  3OS2 A;  1ABO A;  4RB1 A;  2L3P A;  3TTF A;  3G71 I;  1A04 A;  2E34 A;  4M71 A;  1Q81 C;  2YHT A;  4N4I A;  1R77 A;  2HVI A;  4N4H A;  2ZZD A;  1H88 C;  4J6Y A;  4CYC A;  1XMA A;  5FLX Z;  4JNE A;  3F9K A;  1NLO C;  2O8D A;  4BB7 A;  4ABZ A;  5EU7 A;  3J7Z O;  2VOD A;  1Z9Q A;  3LZI A;  3KD5 E;  2V6C A;  2FPE A;  3KVG A;  2P4W A;  3BG9 A;  4FL9 A;  4I98 B;  3F8M A;  4J00 A;  4M75 C;  1TS9 A;  3NAR A;  3W3C A;  4IOA L;  1RLP C;  2QWN A;  5GAM g;  1X1B A;  2KRO A;  3K5M A;  1IN4 A;  2DER A;  1WSI A;  2KYB A;  3K2Z A;  2ZSH B;  4B8X A;  3BR0 A;  3FJP A;  1YWP A;  1W7P B;  3LH0 A;  3EEQ A;  2RAE A;  2W40 A;  1ORP A;  2I7N A;  3U3Y A;  1NJX A;  1C0T A;  3BJO A;  4JKG A;  3QG1 A;  3ZEU B;  1L0O C;  3NGY A;  4YFU A;  4CZH A;  4OLB A;  4WX9 A;  5EEG A;  1KD1 O;  1X4P A;  1ONV A;  4B44 A;  4YOV A;  1W4M A;  1OR7 A;  4N9H A;  4MFD A;  5FJ8 J;  1KHC A;  5FDL A;  3H9J A;  1V3F A;  2NOE A;  3ZMV A;  1UFM A;  3OBY A;  4XTW A;  1OZ3 A;  1QKW A;  1FC3 A;  3HTU A;  1T8E A;  4FOE A;  3ZYY X;  1GVJ A;  1ATN A;  1TL1 A;  1E3H A;  4XRS A;  3W2A A;  4HCK A;  1VQL Q;  3SDB A;  3EG3 A;  2AJQ A;  1DT9 A;  1N9R A;  4EAH D;  1LW2 A;  2W6L A;  2MCN A;  2HL5 C;  4C8Q B;  1HNX K;  2CDT A;  4FWM A;  3JV3 A;  1T6S A;  4FL6 A;  4D1Q A;  1Z91 A;  1K73 C;  1KTQ A;  3M4G A;  2K86 A;  1IXR C;  1P6R A;  1YS6 A;  2ZJR F;  3OYC A;  4EW4 A;  4EVI A;  4AF1 A;  3BZK A;  2CFX A;  4L9N A;  4OMQ A;  3ZCM A;  1OFC X;  3NFA A;  3NH2 A;  3ZET B;  1FIP A;  2KLO A;  5KTQ A;  3K7A J;  5IH2 A;  3MN7 A;  2RN2 A;  1NK9 A;  3I56 N;  3HL2 A;  3EO3 A;  1E6H A;  1XQO A;  3JB9 H;  1KG4 A;  1Z7L A;  4B9U A;  1FP1 D;  2LVM A;  3F2K A;  5KN9 A;  1XDU A;  1NJI R;  2E64 A;  1F4K A;  4AUX A;  2YKM A;  4BDZ A;  1I1S A;  1JJ6 C;  2HQN A;  2JTM A;  5E8I A;  2DVJ A;  3QSU A;  1KG5 A;  3NFC A;  2EQU A;  2Y0S N;  2M51 A;  3ZLJ A;  3RTR A;  1PWT A;  1U1T A;  3O3G A;  5IPA A;  4U0V A;  2MFZ A;  2E4H A;  4HUG A;  2HHT A;  3QP6 A;  1YI2 N;  1YCY A;  4IHV A;  1WEG A;  5GAN 8;  1E3O C;  1SHG A;  3BZC A;  2BHY A;  2WAQ N;  4FYY B;  1T6C A;  4RTW A;  5GIO A;  5GAO l;  1NG6 A;  3U23 A;  3B8A X;  1WYX A;  1RAB B;  1MV3 A;  2OU2 A;  2P0P A;  1FY7 A;  1E3P A;  1ZR2 A;  1WCM J;  4FM2 A;  1YHQ A;  1M2V B;  4CUG A;  3OYY A;  2ZB9 A;  4L8R B;  4KRE A;  2CV1 A;  1HKT A;  4MNU A;  4I6Z A;  4BR5 A;  4ESR A;  2HPM A;  3JCM g;  4X6A J;  3VA3 A;  4MLH A;  5IP7 J;  4B9M A;  2ZF5 O;  3A2K A;  3DF8 A;  1DP7 P;  4FJ8 A;  3T1B A;  1YYV A;  1IRF A;  2FB7 A;  4OX9 K;  3M8J A;  3VQE A;  4BU2 A;  3SPZ A;  2P7V B;  2DL8 A;  1GFD A;  2QA4 N;  4KRF A;  4HPQ A;  4XOP A;  1VQ4 I;  3OJS A;  2IBD A;  2BYV E;  4N0A C;  3OW2 S;  2JHJ A;  3QO3 A;  3CME N;  5TKW A;  4DV7 K;  4R56 A;  4ZDL A;  1SAX A;  1QW1 A;  1PSF A;  3HPW A;  5BPI A;  1A5V A;  4H4K C;  3A5L C;  2R7T A;  1S8N A;  4JKA A;  3M5A A;  3CJR B;  3ASN H;  4B3M K;  2O88 A;  3KK2 A;  3QEV A;  2GEM A;  4M7D G;  1V5G A;  4Z02 A;  4JRK A;  1EBM A;  2M1B A;  3DV8 A;  3LAK A;  2X1E A;  4EJY A;  3UPU A;  4CFC A;  5GMK i;  3DYA A;  4JX4 A;  3NTI A;  4BRO A;  4JV5 K;  2BVL A;  4M77 B;  1FLI A;  3M1F A;  4ASN A;  1R8O B;  1X9M A;  1BA1 A;  2ROT A;  2XHK A;  4OFA A;  1B9N A;  4RTT A;  2HWV A;  2RJC A;  4XU3 A;  4KHS A;  4Y7N J;  1YQA A;  3UKG A;  4OGE A;  4RW4 A;  5F27 A;  4C0D B;  4M78 E;  3RMQ A;  1YO5 C;  1KVB A;  4OB2 B;  3I3L A;  3O8M A;  3PGG A;  1HNZ K;  2RK2 A;  1NBW A;  2Q0U A;  2HKQ B;  4FM1 A;  3FLC O;  4BRL A;  2JM8 A;  4DV3 K;  4FSS A;  3GTK J;  2CYZ B;  4JJD A;  2QGG A;  4IZZ A;  5KAF C;  4FJK A;  1X9S A;  2YSR A;  3QFP A;  2PBD A;  1IN5 A;  2QKM B;  2HKN A;  4U7B A;  3GLX A;  4WK8 F;  3OYN A;  1M1K O;  5JR3 A;  1IN8 A;  1P4W A;  2AIR B;  2JN0 A;  3HKZ N;  4C0G A;  3W6K B;  1X1C A;  2W04 A;  2VJ5 A;  1TWB A;  3M3Z A;  3PO2 J;  4MLE A;  2ITG A;  4F8R A;  1VQ6 Q;  1M90 R;  5LRS A;  2LT1 A;  2O0Y A;  1ETO A;  1R59 O;  3VS0 A;  4FK4 A;  1MHN A;  1LWV A;  4Z94 A;  1YVN A;  4E7Z A;  3MKW B;  3GTP J;  2KRF A;  2J7I A;  4ZTF A;  2J6F A;  4DBH A;  1AWW A;  4B47 A;  3ABK H;  2LVS A;  2CQN A;  1ZRF A;  4XLN F;  2HSE B;  2KRC A;  4YOQ A;  2MG4 A;  1N3C A;  1FXX A;  1K8A U;  3CMA N;  1RLQ C;  2P9L A;  1EX4 A;  3PV8 A;  2YNG A;  1JUM A;  2V6E A;  1MJ9 A;  4G7Z F;  1WXB A;  2DJQ A;  4IIO A;  2IVO A;  4PZJ A;  1W36 C;  2P9S B;  3MAJ A;  1V5F A;  3HSE A;  4CJQ A;  4CZL A;  4CI6 A;  3THK A;  2EZL A;  5DM6 F;  1NM7 A;  1Z3X A;  2L9S A;  3THV A;  2BUD A;  4PHT X;  1QWE A;  2CP2 A;  4Q4Z F;  1O9S A;  2EZI A;  4M75 G;  3JRA A;  3ID6 A;  2A36 A;  4CA0 A;  5ICC A;  1RBS A;  3QWY A;  1E2X A;  3RNJ A;  1FWZ A;  2QDL A;  1VQK N;  4WCG A;  2CG4 A;  2CFO A;  1OPK A;  1A35 A;  1BB9 A;  2LOO A;  4I2O A;  4Z4H A;  2R3S A;  4XQ3 A;  1K9M O;  3OH6 A;  3GIB A;  5LHH A;  1VYV A;  3AA5 X;  2Y48 A;  4XKC A;  2VBX A;  4GV6 A;  1VQN T;  1UGV A;  4PJN A;  4G94 A;  3TTD A;  4RCB A;  5IYD J;  3SJJ A;  3E5U A;  3BR5 A;  5AN4 A;  5DDG A;  2D0P A;  4BE1 A;  1NMN A;  2E7X A;  1HKQ A;  5D5V B;  2QTX A;  4FJM A;  2A07 F;  2M4G A;  3LP2 A;  5LJ5 d;  1D3Y A;  4ISG A;  2DPU A;  1LE8 B;  1VQP A;  3GX4 X;  1BOA A;  2HND A;  1JLG A;  3HBT A;  2QWW A;  2OTL N;  3JCM J;  4BRG A;  5KPR A;  4AIL C;  3TAQ A;  1QZZ A;  4MIM A;  3OYM A;  2DK5 A;  2BE9 B;  1UE9 A;  3F21 A;  1XC5 A;  1T3V A;  1ZG1 A;  3Q7C A;  2L3Q A;  5K7F A;  4DV0 K;  3JSM A;  3QLH A;  3DLK A;  3KD1 E; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 4QQ6 A;  1ZBH A;  1VQM T;  4Y33 A;  1UWB A;  2FYK A;  3AVG A;  4E3S A;  5EG2 A;  2PVG B;  1Y07 A;  2QQR A;  4DLG A;  3QOD A;  2WOM A;  4FW2 A;  3EZ5 A;  3G4S A;  3QYF A;  2XG8 D;  3A4C A;  1WN7 A;  3H5A A;  4CJ3 A;  4KTQ A;  4DQ2 A;  2OC6 A;  4FZZ A;  3TEE A;  4CJ5 A;  2HAX A;  3URG A;  3LDS A;  3ZSQ A;  3ZFJ A;  4JS5 A;  3TAF A;  2HNI A;  3ZQQ A;  4DG1 A;  4NCG A;  4KHN A;  3CCM T;  2L9N A;  3UWN A;  4C8O A;  4KB1 A;  3ASK A;  4NQW B;  5GAO r;  2RB6 A;  3L3V A;  4CCN A;  4RG2 A;  2A1R A;  3AVI A;  5C25 A;  2XDD A;  2VJI A;  3M53 A;  4FLV A;  3OL3 A;  1PSE A;  3X25 B;  1YX5 A;  5LJ5 h;  4ICL A;  1I3A A;  2D9T A;  2WAC A;  2QQA A;  3ASM A;  3A8H B;  4J5Y A;  2DTI A;  1MND A;  3PMT A;  4F7U A;  2JLE A;  3HT3 A;  4TVR A;  1BCO A;  1QHT A;  1UEB A;  3VQP A;  2V75 A;  2MAM A;  3V7C A;  3TAG A;  4PNO A;  3UT1 A;  4E7J A;  1P92 A;  5CKH A;  1WJQ A;  4QPQ A;  2DD5 A;  3S8P A;  4P1W A;  1RL2 A;  5HKC A;  1U45 A;  3CME T;  3HSB A;  3VQ5 A;  1BI3 A;  3P8D A;  4RG8 A;  3M59 A;  1VSH A;  4M7A D;  4OKJ A; 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