3OZOA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 complexed with ngt
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
572
structure length
572
Chain Sequence
EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTFHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERLVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords N-acetylglucosaminidase
publication title Crystal Structure of insect beta-N-acetyl-D-hexosaminidase OfHex1 complexed with NGT
rcsb
source organism Ostrinia furnacalis
total genus 190
structure length 572
sequence length 572
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2010-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ozoA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3ozoA01
4GO8A 1JZ6A 4AIUA 4GI6A 3QR3A 4MDPA 3WQVA 2VCAA 2UY4A 1GJUA 4ML4A 5A6JA 3O6AA 1V3LA 1W3HA 2VC9A 2VT0A 1JZ5A 3UG4A 1GHSA 5C71A 2CNCA 1VB9A 2CIPA 2CEQA 1XH1A 2V5CA 3M6DA 1G1YA 1X1NA 4OJYA 1FHLA 3N11A 1JAKA 5E0FA 3DYPA 1AQ0A 4JL1A 2Z1KA 2XFRA 1OCQA 5A94A 1HJVA 3VIOA 2OWXA 3AS3A 2AAAA 4EKJA 4J3TA 1TFVA 5IHRA 4OKDA 4AZCB 1UUQA 4BQ3A 2XM1A 4H04A 3HU7A 4CVWA 5HBFA 2GK1B 4QAWA 2WB5A 1QI5A 3CUHA 3S6TA 3T0DA 4IPNB 1J0ZA 2YLAA 1G94A 1L8NA 2HISA 3DYOA 2G4FA 2GJXA 4V28A 1K6AA 2FH8A 1JAEA 2QV4A 4P8UA 2JEQA 1E4MM 1PEZA 1UR9A 3WH8A 2FH6A 2A3HA 4PMQA 5A2BA 3W37A 2W62A 3A4AA 1J0YA 1UKOA 2ZOXA 4Z2HA 1PAMA 4ACZB 2WKLA 4BS0A 3U7BA 1IT0A 1R87A 4RE2A 3IAQA 3TONA 4BA0A 5BXTA 4OBRA 1JFHA 2E9LA 1VFFA 1CGWA 3W6MA 3AHTA 2J8GA 4ATWA 2G3IA 1CNVA 3AZRA 3AMGA 5E0CA 4DUXA 3M07A 2NSXA 3VIIA 1HKKA 1SMAA 2YJQA 4ZE5A 4AD4A 5ABFB 4AIOA 1ZL1A 3FW6A 1EGZA 2DH3A 4AWEA 3VGGA 3SIMA 2VX7A 2XFFA 1WE5A 3NSXA 1C8XA 5IDIA 3CZGA 4A4AA 3VVGA 4ACYA 3BLPX 1RP9A 5A6SA 3WNPA 4UQAA 3ARYA 5A95A 4HOWA 1BVZA 2Y8KA 3OBAA 2J78A 1GQKA 1EIBA 1R7OA 2W66A 4YHEA 1JGIA 2OWWA 2Y2WA 4Z2KA 2G8ZA 2ZWZA 4BQ2A 1JDDA 3CZKA 1HIZA 4JAWA 1E72M 3I3DA 1LLOA 2VR5A 3VTRA 3WMBA 3VOCA 1E6SM 4R27A 2WMJA 1CLVA 2JFEX 3TP4A 5A69A 3WF3A 2Q8XA 4M81A 1UA3A 3BAXA 1CGUA 1W32A 1E73M 1NOUA 4D6CA 4HOZA 4WLCA 4AD5A 1JD7A 2BV9A 4HMCA 4E8CA 4BZYA 1MXGA 1OGBA 2E8ZA 3FXYA 1VJZA 5FIPA 1JIBA 3BMVA 1BTCA 1GOIA 1EHNA 1N82A 3ZSSA 2WM0A 1WZAA 2CXGA 3N9KA 1US3A 3CZEA 3AI0A 1HP4A 2VQTA 2EPMX 2WMKA 2O9PA 3VUPA 1NWUA 1W9DM 1JZ4A 3PHAA 5A6LA 1UWTA 1CXLA 1J12A 2PWEA 2J74A 4MNJA 2EPKX 3U57A 1NOFA 1VBUA 4P7QA 4C7GA 1W2VA 4EE9A 4HU8A 1XCXA 2VZUA 1KGXA 3K46A 1E5NA 2JIEA 2WANA 2VNCA 3FNDA 1UWSA 5ECUA 3SUUA 4HMDA 1DWGM 1LG2A 2UY2A 4M24A 3RM8A 1UWQA 1WCGA 4M56A 1V02A 2WHLA 3T2OA 1W9PA 3W0KA 1MW1A 4PTXA 3BSGA 4H41A 2J7FA 2J4GA 5ABHA 3ARWA 2WSPA 3KWXA 3LPPA 1NARA 3G6MA 1UWIA 1C3FA 3D5HA 5TD4A 4AZGA 5LA0A 1TVPA 3KE0A 2DSZA 4LX4A 1JNDA 3VKKA 1ECEA 3L2MA 4MNLA 4UQCA 4Z2LA 5BRPA 5A2AA 1B3ZA 2VO5A 1ZBWA 1NWSA 1KR1A 1V0KA 1TG7A 3ARQA 3WL1A 1VFUA 4CD7A 3QHMA 4RE4A 2YL9A 1QW9A 4S3KA 1E55A 3VM5A 4D6IA 2O92A 2DT2A 2ZX9A 1TUXA 4HPHA 4P7OA 1B31A 3KEHA 1R8LA 4AZHA 4JKMA 3GXIA 1MW3A 5M5DA 3BLKA 3WH9A 2C0HA 2WMFA 1H09A 1UZ1A 1ZBVA 2YL5A 4KMQA 1ODZA 1JI2A 1E70M 3CIVA 1XSJA 3T08A 4GIAA 2WMGA 3AHVA 2WVVB 3HJEA 4M29A 5IHSA 1LWHA 1CENA 1XH0A 3DC0A 4CN4A 1ISXA 2VL4A 1HL9A 4JFSA 3WBEA 3BH4A 1V6UA 5AC5A 1QNSA 2EJ1A 3F4VA 1UOKA 3L4YA 4MNKA 2FDMA 3NIYA 4MAZA 4W88A 4UZSA 4MB1A 3BGAA 3AIVA 4OUEA 2WXDM 3HMCA 3ARRA 1TE1A 1OT1A 5FD0A 2G41A 1CGVA 5D9MA 1TA3A 1E43A 2CITA 1BAGA 2WBGA 3RILA 3VMOA 1J11A 1NWRA 5JIPA 3GH7A 1BGGA 3MMWA 2WWCA 2OYLA 1MVYA 3N12A 1WNOA 3THDA 2PBGA 1E9LA 4F79A 4LYPA 4CD8A 4QCEA 4DM2A 1ITXA 2PB1A 2YLLA 4YN5A 2ZUMA 4XUYA 3NUKA 1XRVA 1VFOA 3UG3A 4AD0A 3U7VA 3M7SA 4D72A 2WHKA 4QFUA 2WC3A 5M03A 3T0BA 1LL6A 1EXPA 3WD1A 4IPLA 1JZ7A 5GNXA 5LA2A 2XG9A 2ZUTA 2A3CA 2X09A 4UOZA 1CWYA 1XH2A 2A3BA 2VRQA 1NH6A 1SYTA 4PMDA 2XWEA 2WCAA 2GDUA 3WMSA 3AMKA 2WVSA 5HXMA 1UKSA 2OYKA 4EAMA 5BYWA 2G3NA 2ZUWA 2X05A 4WKAA 1OGGA 1W3KA 4ZEPA 4FLOA 4PEEA 5CXPA 4W85A 1HVXA 4B9ZA 1Q6FA 4JIEA 2YDSA 5ABGA 4AD3A 3VO0A 3AIWA 1CXKA 4C7DA 4DWSC 2VX4A 2V5DA 3DHPA 2DSUA 2J7CA 4RL3A 3BAIA 5GQBA 1ZB5A 2RGLA 1QVBA 4ZFMA 2WSKA 1HP5A 3ZR5A 3A4XA 2BHYA 2CPUA 1V02E 1UQYA 2WMHA 2Y24A 4X9YA 3VMPA 3SUVA 2BVDA 1W1PA 3N15A 3ZJ8A 2XIIA 2D20A 3OG2A 3AHZA 2DSWA 1FA2A 4ATLA 3WD0A 3BAYA 1V3HA 1QI4A 4JL2A 1PJ9A 4JCMA 3WKZA 2V3GA 1B3XA 4ZXLA 1JG9A 1WB0A 5A8MA 1H2JA 5A6AA 3WD3A 4MB4A 3PZTA 4UFHA 3WL0A 3CZLA 1D7FA 1JYVA 1V6YA 3VDBA 4HZ7A 1W1TA 3CGTA 2CKSA 4L4OA 2J7BA 3FN9A 1GQIA 3RPMA 1JF6A 2VZOA 3CZJA 3VX1A 3VILA 1AQMA 2JIWA 2NT0A 3GNRA 1QNPA 1J01A 2OWCA 1PIFA 2Z1SA 4NSBA 2HVMA 4U3AA 1O7AA 4UQ9A 4E4PA 4W7UA 1NOWA 1J9YA 1V08A 3VIMA 4P7LA 2PWGA 2VQUA 2J79A 1PZ3A 5E70A 1W2PA 3PBGA 4GI9A 3K4DA 2J77A 4YHGA 1NWTA 4AEEA 3LMYA 1GHRA 1GQJA 1RH9A 1QHPA 5HPOA 2VVSA 1XYFA 4C7FA 2YKKA 4HU0A 4LPCA 1LG1A 5BXRA 4TX6A 1E40A 3ZJKA 1JDCA 4CD6A 3ARPA 4QLLA 1I75A 1W9BM 2WPGA 2DSKA 4PN2A 2CBIA 3WN6A 1ZS2A 1JI1A 3AHYA 5D9PA 2BY2A 2J7HA 3IJ8A 5GNZA 5CJ5A 4WSJA 1H41A 1FP8A 4W7WA 1RP8A 3WUGA 4HA1A 2WAGA 2ZWYA 4GZIA 2G3MA 1JZ8A 1OT2A 3VIFA 3N1AA 4WKFA 3OGRA 1H11A 4TVCA 1M01A 1MYRA 2GJRA 2VCCA 1B3VA 1K9DA 4UOQA 3SUSA 3K4AA 6CGTA 4P7RA 1JL8A 2BS9A 2WWDA 3EMQA 2BY0A 1QNOA 5D4YA 3F5KA 2GDVA 1ZU8A 1CXIA 1H0IA 3PZVA 1W91A 1FP9A 3O2LA 1MXDA 1OD0A 3WMCA 6A3HA 1BQCA 1E4LA 5JBEA 2E9BA 2OYMA 2VRJA 1KWKA 1B1YA 1W9UA 1C8YA 3F5JA 4CUCA 3GDBA 1QI0A 1RD6A 3TTOA 3FHQA 4UNIA 1V3JA 1ZJBA 1QI2A 4L4PA 1J10A 4RE3A 3VPLA 3SCTA 1W9XA 1CGTA 1AMYA 2G3JA 3D3AA 3AS1A 5A6KA 3WNNA 8CGTA 1CXEA 1HXJA 2JEPA 1FOBA 2ZIDA 1Q6CA 4JFWA 5D9NA 3WDQA 1A47A 3L4WA 3WQ6A 3WY1A 3GH5A 3VIJA 5JUVA 1JYWA 1EDTA 4MAVA 2DPEA 1WAWA 3UEQA 1NP0A 1ZJAA 3POHA 2WLYA 1UD2A 4JHZA 4PSRA 1E6RA 5BCAA 4LQ1A 5I6SA 1XV8A 3GXMA 2VTFA 4IISA 2DIEA 1EQCA 1CIUA 1KCLA 4BF7A 2CESA 1HF6A 1JXKA 1WDPA 2OSYA 4B3KA 2AMGA 4B15A 3VD9A 4M1RA 5GPRA 3L4VA 5FCZA 5I78A 1TZ7A 4QLKA 1HN1A 3PZQA 3B8SA 3ARUA 3VGBA 1UYQA 1FH7A 4OOZA 3NJ3A 1OIMA 4PBGA 2O9TA 1UD6A 3EMCA 4M8UA 4U33A 5JIWA 5I0DA 2UY3A 3AS2A 3ARVA 2W63A 4DWSA 3GXFA 4U31A 4MJ4A 1DHKA 3PZMA 1BG4A 1VBRA 1PIGA 1JZ2A 5FL1A 4N42A 3W4RA 2E4TA 4AZIA 4MPKA 3VD5A 3K8LA 1V3IA 1X6LA 4HOXA 2FHBA 2VVNA 1QHOA 2WZHA 3T2PA 3KL3A 4JFVA 1E0XA 2BHZA 3WH7A 3OLEA 1F4HA 1HJXA 3CHFA 4P8WA 1JYXA 3OLGA 3GNOA 3AQUA 4E8DA 1DWIM 4HZ8A 3VGHA 1PBGA 2PBOA 1K9TA 5CSUA 2BFGA 1OWQA 5A8OA 3AOFA 1UKQA 4AW7A 1LQ0A 2J7GA 3WD2A 5AYIA 2NT1A 3UR7A 1UD8A 5D8WA 3O9NA 4IM4A 3MUIA 3EBVA 2X1IA 2X8RA 4PYSA 3CPUA 3WBAA 2D0FA 3GBEA 1GNXA 1KCKA 2E9MA 3I3BA 4BQ5A 1C8QA 5M3WA 4MDOA 1Z32X 2X2YA 3AZTA 3VGDA 2WC4A 1C92A 3ZT5A 2VR4A 3WENA 1ZBKA 1KWGA 3CHCA 1KXVA 4AZ5A 2ZXQA 2WZIA 4PMNA 4D6FA 2CERA 3WFZA 5BRQA 4NI3A 1VJSA 1HJWA 1U33A 3CBWA 5DT7A 2WCGA 4WIWA 1UR8A 5E9AA 4W7VA 2VX6A 3WH6A 2VZTA 1J0JA 1H5VA 4WJXA 2ZUVA 3PZUA 1TCMA 3GH4A 1C7TA 4U5KA 2XTKA 4F66A 5IFTA 2JE8A 3W26A 2MANA 4FLSA 4U3CA 3VDHA 1U2YA 2XVLA 3EDDA 4OZOA 4HA3A 4TVUA 1PX4A 2Y4SA 3VNYA 1UR1A 4GQQA 1JXJA 1BLIA 2XWDA 4OBSA 6TAAA 3EYPA 3GZAA 1B0IA 1PX3A 4K68A 5FKYA 1CEOA 3QHNA 3BSHA 1OB0A 1BF2A 5A8NA 4B3LA 4PRWA 3AFBA 5HNNA 1UR0A 1QPKA 2WZEA 5A1AA 3MKKA 4NRSA 4FF5A 1V0MA 1E0VA 2ZXDA 3N17A 5I5RA 2W61A 2EO7A 3PTMA 1KXHA 1E3ZA 4Q22A 4OOUA 3MANA 3PZNA 2ZUSA 5FL0A 1OGSA 2V3DA 2IXUA 4H8VA 4PTWA 2IUZA 3W53A 4CU8A 3LPOA 3NSMA 1PZ2A 1UG6A 4AZ6A 4PMOA 2EPLX 4TX8A 3VIGA 2WYSA 3RMEA 3WQWA 3VGFA 1BG9A 3MSGA 2OLHA 2D2OA 2Y5EA 3WEZA 4J3UA 1UD5A 4M82A 5IXEA 4D6GA 4UQDA 3CHEA 2VRKA 4Z2GA 4CCDA 3IJ9A 4AZCA 3MSDA 3WF2A 4HMEA 1VEPA 2GK1A 2UWFA 1W1VA 2CBUA 3ALFA 5DMYA 2WNWA 3A3HA 3ALGA 2VURA 2YIHA 2DT3A 3WELA 4ZXOA 1C93A 5AYBA 1FHDA 1GOWA 2WKGA 1EDQA 3RO8A 3SEPA 3W82A 4C91A 1GOMA 3ZMRA 5BXPA 1FFQA 1HNYA 4ACZA 5CPTA 4LYRA 4TTGA 1VAHA 3MV11 4J7RA 1BFNA 5BXSA 2WMIA 3N18A 2GFTA 4JCLA 4R5EA 2FHFA 1B90A 1O6IA 2VJXA 1J0HA 3BXWA 3ZR6A 3DHUA 2PWDA 2OSWA 3WDHA 3CUGA 1US2A 5DO8A 5ABFA 2YOCA 3GM8A 3K8MA 1I1XA 3AIRA 5I2UA 1DWFM 1KBBA 3ARXA 2GJPA 2GJXB 2FHCA 2EBNA 3L2LA 4PUDA 5DF0A 5AY7A 3VIKA 5BROA 4P7NA 3WF0A 4UOJA 1BVNP 1YQ2A 1ISVA 2VI0A 3W38A 4AD1A 1DWJM 3A6OA 3DYMA 3GNPA 1C91A 2XGBA 3HN3A 2VOTA 3AS0A 2XUCA 5A3HA 1PX8A 5EMYA 3IK2A 1GOKA 4PSPA 4GQRA 1R7AA 3AIBA 2J62A 2CCRA 1JNEA 1V0LA 2RGMA 1HVQA 4URIA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4GO8 A;  1JZ6 A;  4AIU A;  4GI6 A;  3QR3 A;  4MDP A;  3WQV A;  2VCA A;  2UY4 A;  1GJU A;  4ML4 A;  5A6J A;  3O6A A;  1V3L A;  1W3H A;  2VC9 A;  2VT0 A;  1JZ5 A;  3UG4 A;  1GHS A;  5C71 A;  2CNC A;  1VB9 A;  2CIP A;  2CEQ A;  1XH1 A;  2V5C A;  3M6D A;  1G1Y A;  1X1N A;  4OJY A;  1FHL A;  3N11 A;  1JAK A;  5E0F A;  3DYP A;  1AQ0 A;  4JL1 A;  2Z1K A;  2XFR A;  1OCQ A;  5A94 A;  1HJV A;  3VIO A;  2OWX A;  3AS3 A;  2AAA A;  4EKJ A;  4J3T A;  1TFV A;  5IHR A;  4OKD A;  4AZC B;  1UUQ A;  4BQ3 A;  2XM1 A;  4H04 A;  3HU7 A;  4CVW A;  5HBF A;  2GK1 B;  4QAW A;  2WB5 A;  1QI5 A;  3CUH A;  3S6T A;  3T0D A;  4IPN B;  1J0Z A;  2YLA A;  1G94 A;  1L8N A;  2HIS A;  3DYO A;  2G4F A;  2GJX A;  4V28 A;  1K6A A;  2FH8 A;  1JAE A;  2QV4 A;  4P8U A;  2JEQ A;  1E4M M;  1PEZ A;  1UR9 A;  3WH8 A;  2FH6 A;  2A3H A;  4PMQ A;  5A2B A;  3W37 A;  2W62 A;  3A4A A;  1J0Y A;  1UKO A;  2ZOX A;  4Z2H A;  1PAM A;  4ACZ B;  2WKL A;  4BS0 A;  3U7B A;  1IT0 A;  1R87 A;  4RE2 A;  3IAQ A;  3TON A;  4BA0 A;  5BXT A;  4OBR A;  1JFH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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