3P62A

Wild-type pentaerythritol tetranitrate reductase containing a c-terminal 8-histidine tag
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSLHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
publication title Focused Directed Evolution of Pentaerythritol Tetranitrate Reductase by Using Automated Anaerobic Kinetic Screening of Site-Saturated Libraries
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacter cloacae
total genus 138
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2010-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3p62A00
1DBTA 1W3IA 5CG7A 2V0TA 4MIMA 4JX5A 2C14A 4WXYA 2Q8ZA 2D73A 1OX6A 5FEZA 4O11A 4IMDA 1LBFA 3STEA 2ZTJA 2A85A 4A21A 3W7DA 1FBAA 1K02A 2X1TA 3TV8A 1WOBA 1YPFA 2O7QA 4IMEA 3PVFA 4PC8A 3M6YA 5IBXC 1UASA 3W1RA 2J27A 3SJ3A 5E0KA 1VH7A 3GDRA 1QAPA 3G0UA 4JEQA 1G4PA 1K3UA 3NQGA 3QMRA 4CNPA 3L0KA 2LLEA 4L4MA 5KZEA 1VYRA 1Q6QA 2IQTA 4GNJA 4CQAA 1F7BA 3SR7A 3W74A 1Z48A 1A5AA 1EIXA 3HGOA 3I7SA 4YMZA 3QSTA 4ADSA 1LZOA 4BI6A 4ZQOA 2PURA 3IIXA 1JQXA 3NQVA 4JX4A 3IGUA 1KBJA 4I7VA 3FOKA 4IPJA 4ZQRA 2F84A 2TMDA 2FIQA 2WKJA 1F2JA 1EWEA 2V2DA 3T7VA 2HTMA 3B05A 4LVDA 4LW7A 1KM5A 3O6DA 5DCEA 3O8AA 2WSQA 3GNNA 2CFFA 4MFDA 1OF8A 5TIMA 4RZ4A 1SR9A 4UFHA 3UWZA 5DBTA 4JDYA 1JRBA 5K9CA 4UFLA 4YL2A 4O52A 3LV5A 4U4MA 5DLCA 1H1ZA 5HQEA 5FF2A 2P10A 1JUKA 3FFSA 3TR2A 3ATYA 3B0PA 2O7SA 3C3NA 3EXRA 3DKLA 4AAJA 5AB3A 2WV8A 3L5LA 4UTIA 2JK2A 3GXPA 3TW7A 2CLHA 2CZDA 3EWWA 3TX9A 3NQAA 3QMSA 1GG0A 3USBA 3O05A 4ZQNA 1H61A 1UUOA 5D37A 1W31A 4FIRA 2GVLA 1FDJA 1TPEA 3LCLA 1KLZA 3CU2A 2ZZ2A 1TPC1 2EF9A 1LOQA 2ZFAA 1F74A 2BXVA 3PBUA 2C1HA 2E5CA 3BLIA 4M6PA 4FX6M 3R13A 2WPBA 3R2GA 3OA3A 3FYOA 3S6DA 1WBJA 3KVLA 3YPIA 1TPUA 3UXDA 4CCCA 3FLUA 1NF7A 3TQKA 1TTIA 3G1HA 4GE8A 3LHZA 1D3GA 4UNLA 1EA0A 2B7PA 3PC0A 1BWLA 3DFNA 1GYNA 6ALDA 4O54A 1CW2A 4ZL1A 3C6CA 3Q58A 2ZRYA 3MYPA 3UZ5A 3RNDA 3CEUA 3EX6A 4FEZA 3ZS4A 1RV8A 2A7NA 3TK7A 3PBWA 3L68A 5BMXA 3SGUA 4XTIA 3O6YX 4UC5A 1KFEA 4NX5A 1G7VA 1HO4A 1L6SA 1GZGA 4PCFA 3W7LA 3BV4A 3L5MA 3DZ1A 1ME7A 1JJKA 3W1XA 2PRHA 3MP3A 4JY8A 1OYCA 2HS8A 3F4WA 2PE4A 3DFPA 4ZQCA 4OBTA 1KM6A 4O19A 5FESA 1X7FA 1W3TA 4O0ZA 1FWNA 3TXZA 4XBSA 3BGJA 3HGRA 1MSSA 1SUXA 3NM3A 1RR2A 4DQWA 1ZNNA 5D2YA 3MI6A 5HR7A 1PE1A 1QFEA 3PBVA 3W6YA 3P80A 3HB9A 3L9CA 4N9EA 4KWWA 2H8XA 1MEIA 1TPFA 5D38A 3LV6A 4BFAA 3LTPA 2CW6A 1VLWA 4TMCA 4XBKA 3R5EA 4N6FA 1YLVA 2WOQA 3HMJG 2VFIA 1LM1A 5D2XA 4LUJA 1BEUA 4GUGA 1KM0A 4DO4A 4NJGA 3RLUA 5KZDA 2CZEA 5HWJA 2JGQA 3T40A 4HPJA 3STCA 4S2CA 2OT0A 5F1UA 4Z0SA 3HG4A 3GR7A 3TFXA 3QYQA 4K7VA 4UFMA 2DJLA 1ZHAA 4LVGA 1QO5A 2FJKA 2ZTKA 3QPZA 4TO8A 3TUUA 4EVZA 3NAVA 4K8EA 3W7GA 3CEPA 3H54A 3LCXA 4IMCA 3GIYA 2Y7EA 3GX9A 3DAQA 1H5YA 1H62A 2CLKA 4FIQA 1XXXA 3N9SA 3P67A 3NL5A 4AWTA 4WXZA 2Y61A 2H3DA 1SW3A 5K2ZA 3OBKA 2JKAA 5CZSA 5AYZA 1TMHA 1H7PA 3DH7A 3EXSA 2E1DA 1R30A 3O16A 3T44A 5HNRA 3MYOA 4IQLA 3NZ1A 4RXFA 5CSRA 1PV8A 5D02A 1TV7A 2AGKA 3P8IA 3E96A 3N73A 5I3GA 4X22A 1XL9A 1SU5A 1I4NA 4XZ9A 2E6DA 1EPXA 4X9SA 4RJEA 1LLZA 1KTNA 5AHNA 3NQ6A 1W8SA 2AQWA 3IGXA 1F76A 3BG3A 2X16A 3NQCA 1ME8A 3LX9A 5KTLA 2WSRA 3G18A 1OX5A 1KTCA 1MEHA 4RXGA 5K3VA 3A5VA 3W7EA 4JDBA 2ZZ3A 5C5YA 1TB3A 4Y90A 3W1UA 4C1LA 1FWWA 5C2XA 2BZNA 4DF0A 1G4SA 1R47A 2C6QA 3KVKA 1OVDA 1YXCA 3PG9A 3TA6A 3LHUA 3VCRA 1B4KA 3ABOA 1AL7A 3K30A 3G1VA 3W1TA 5CSSA 5ABTA 3GR8A 3LRLA 5K9XA 1KFLA 3I68A 2YYTA 4JIQA 1OK6A 1X6UA 3M5VA 3HIJA 3MMTA 4IXHA 5C6MA 2V8ZA 1E51A 1A5CA 2Q3RA 2YFOA 4AF0B 3HG3A 4RZ5A 4OE7A 4JYFA 3M0ZA 3TFCA 2BWGA 4NVTA 5EKYA 4O1DA 3P8JA 3W7PA 2VEMA 1YADA 4FXSA 1T99A 1YXYA 4PODA 2QDGA 3TKFA 3LTSA 5AHFA 3MHUA 1G6CA 1QOPA 5F2GA 1SPQA 3P84A 3R12A 1QWGA 1IXNA 5F2LA 3W1AA 5EYWA 3C61A 2JGYA 4GWEA 4JTEA 4LV9A 4AB4A 1X8FA 3QFEA 4O28A 4JY9A 2ZA2A 4GXMA 3W86A 1TV5A 2YDAA 4NNAA 1P4CA 3S0CA 3G8EA 2VEIA 3W1MA 1T0OA 3DI0A 3W07A 5LGZA 4NZFA 2J6XA 2X2GA 3L2IA 3W7OA 4FNRA 4JTSA 4M6VA 2YR1A 3U6WA 2A1YA 3N34A 1DQXA 2V5BA 4CCEA 1N8FA 3IVUA 1GVFA 2BLEA 3MP4A 1OJXA 3UPWA 2E5DA 2QF7A 3TQ0A 2XFWA 1OHLA 1GT8A 5DBUA 5LHEA 2Y85A 3O15A 4JYEA 1FWRA 3W2NA 4ORIA 4CQ9A 2A0NA 3FYPA 2QCCA 4LOCA 4K7YA 2NXGA 4M19A 1HL2A 1NFBA 3C56A 2V81A 2VXNA 4DPQA 2E5BA 5HWNA 2BTMA 3HGSA 2Q8LA 4LC6A 4UTHA 1XUZA 3S5ZA 3UWVA 3UXAA 5F1VA 1LOSA 3GKAA 1O4UA 4UCGA 3C2OA 1TRIA 2YGYA 4HSNA 1RD5A 4IWWA 3EWBX 4DBDA 4O0KA 3W87A 3BW4A 1G67A 5C55A 5L9FA 4RLIA 1JCNA 5J5DA 2GQ8A 3AO0A 1H7XA 3NL2A 5LNUA 1Z41A 3KRZA 2VFGA 2Y70A 3A22A 1R2RA 4OU1A 1PCKA 4QITA 4FX7A 3W2MA 1BTMA 5BNKA 1VCVA 4O1AA 2XN1A 3P82A 4GC4A 4MLRA 3TJLA 3FS2A 1S5TA 2QCNA 2YCEA 2F7FA 1U83A 3NXFA 2RDUA 4ADTA 3NOEA 3GKFA 4C1KA 4EWND 1Q6LA 1WX0A 2Y62A 4R34A 1JCMP 1HTIA 5SWUA 2G95A 1XM3A 3BVJA 1ZCOA 3IVTA 1LRTA 3HG2A 5KZMA 5C54A 3HF3A 2V2CA 1TPB1 1JULA 2VFHA 5KSWA 3W76A 2P0OA 3OHIA 3L66A 3OIXA 4DXVA 4HNUA 3E0IA 2R8WA 5AHLA 1H7NA 5KITA 3N2XA 1FCVA 2CZFA 1IXOA 4OHQA 1H51A 3BK0A 3G1FA 3MI2A 4ZMGA 4UTUA 1G4TA 4N9BA 1UUMA 1Q6RA 3GAKA 1SSGA 2DJXA 1OX4B 4K8HA 1DQWA 4QNWA 1TPH1 3SZ8A 4UMCA 1A5BA 3RU6A 5FF3A 1JCXA 4JYDA 3QM3A 5DELA 4QNEA 1B4EA 2H3BA 3THAA 4ADUA 4LU0A 3CTLA 5CPMA 3DFOA 1TRDA 4Z1BA 3LCIA 3TSMA 3QQ0A 3IIOA 5BOOA 2PC4A 5LKYA 3PM6A 1EEPA 2CLEA 4MYAA 2QKFA 4HT3A 1KLYA 2X1RA 4NJHA 4G1KA 2CLLA 3C2VA 1KTBA 2ZRZA 2QCDA 1TYGA 2Y6ZA 1WDWA 2PCQA 3W7HA 5AC6A 1OFDA 1F05A 4AMAA 5CGQA 1FCBA 2RKXA 4HSOA 5LGXA 1JR1A 1QPNA 2Q3OA 1HFBA 3A21A 6TIMA 1ZY9A 1UBSA 4E2DA 2YZRA 1JUEA 4XTDA 4MOZA 3W23A 1KM1A 1G69A 3W1PA 2ALDA 4N02A 2VFEA 4UR8A 2ZZ5A 4I7UA 4MUZA 1JRCA 4DBEA 1K8YA 3DU0A 4FXRA 3LCGA 1YXDA 1SZGA 5K7JA 4BI5A 1UJPA 1I8JA 4K36A 2NUXA 3W2JA 3ELFA 3FKRA 1X1OA 1VRDA 4P2VA 1GQNA 1NEYA 2C0AA 4B5NA 2QCEA 1HG3A 3QEZA 3WJWA 4A2RA 4NXKA 1QMLA 3LLDA 1SFJA 3W7MA 2PRLA 4D2JA 2GUUA 4ICNA 4DF1A 1TTQA 3EKLA 3QSRA 5LHFA 4O1CA 4XKYB 2VELA 4WJEA 4OT7A 4UTWA 3RF9A 3TJXA 1KW1A 3U2OA 5DN1A 2Z6IA 4N4PA 4FHAA 3RMJA 2R91A 2XN2A 3DENA 4PH6A 3GDKA 3FKKA 4AWSA 3P5ZA 5MHBA 1OABA 3TMQA 5HUPA 3DBPA 4FNTA 3G24A 3HG5A 4MLJA 4MZYA 4QAIA 4LRSA 3E9AA 3W84A 4QISA 3HPSA 3P60A 2QCLA 4OV4A 1OFQA 4R7JA 1UB3A 3WK3A 3CWOX 1LOLA 1TV8A 3BLEA 2YSWA 3W88A 3W22A 1QOQA 3ABQA 3ZWTA 4AH7A 2QDHA 4TIMA 2FQIA 3NQFA 2OX1A 5T26A 2TPSA 4PTNA 4Q4KA 4NJIA 5I3IA 1O5XA 4Z08A 3DHFA 2DU2A 4I7WA 3INPA 3P61A 4RX0A 4FNUA 4M7TA 1ZJIA 3CT7A 1N7KA 1H63A 3QC3A 1VCGA 2GJNA 1T8XA 3EXTA 3DFSA 4IX0A 5EPDA 1YTEA 3FEMA 2ZZ6A 5FEPA 1OFOA 5FF7A 4MY9A 3C2EA 4YCOA 1KBIA 4ZVJA 4QJ1A 3MJYA 4EIVA 4PFMA 1W0MA 2I1OA 4FNQA 1B9BA 4Q32A 4MY1A 2B7QA 3NEVA 1A5SA 3TC7A 1WBHA 8TIMA 5KMYA 2GVGA 1LRNA 3M1ZA 2ZA3A 4O16A 4QQ3A 3S5NA 1AL8A 4UTMA 4JTTA 2ZRWA 5D2VA 3T55A 2X30A 1Q6OA 1DJNA 1ICSA 1GEQA 3HO8A 4RKAA 4UUIA 2V82A 3H53A 2FB3A 3WFAA 1GPWA 2W79A 4JTKA 4WY0F 2I9EA 3W7KA 1EUNA 3WK0A 5TBOA 3MI3A 2RDTA 3DXIA 3SECA 3MBDA 4E0CA 3S1WA 4GFSA 4DPPA 3E12A 1Q45A 3KOFA 1XCFA 1TPVA 1UCWA 3JS3A 3M43A 3VI2A 2G96A 2V30A 4MPQA 3CIWA 4UTTC 3MUXA 1FX6A 3O06A 3UNDA 1H60A 2C16A 4KWVA 2EAWA 3R8RA 3LM7A 3W7JA 1Q3NA 5AHMA 3MO7A 5D2TA 3RK8A 3KFTA 1GTHA 4NJKA 4RV8A 1AMKA 4NJJA 5U4NA 2ZZ7A 4O17A 4E2BA 1ZALA 3E49A 1EUAA 3A5FA 3UQNA 1KV5A 4Z0JA 3LBMA 3S8HA 1LTDA 4LC8A 3PAJA 3ANYA 5L6UA 2TRSA 3NQDA 1M5WA 2FLIA 4AXKA 3C52A 1TTPA 2C3ZA 2CLOA 1PVNA 3LDVA 2ZBTA 3NR0A 5DY2A 3A9IA 2FDSA 3LTYA 4OV9A 3W7CA 3V75A 2ZA1A 3C2FA 3PB0A 4OGZA 1XFBA 2ATMA 5DXXA 2QCGA 1M6JA 4HNNA 4UFJA 1S5WA 1DL3A 1TQJA 3EWUA 2YFNA 2VENA 3GAYA 5F2IA 3PY2A 5IBXA 1N55A 4TU1A 1OFBA 1FCUA 1V7YA 3G1SA 1OK4A 2I14A 4HPXA 1MO0A 4LNYA 3CPRA 5EMUA 3TCEA 1K8ZA 4E38A 2TYSA 4UTJA 1DKWA 1QNVA 3DFQA 1GG1A 2J9XA 1DV7A 4EOUA 3NDOA 1K8XA 1RVGA 2R14A 3CIXA 3NQMA 3NPXA 4ORMA 4A3UA 1HUVA 3MHFA 1TPWA 1YYAA 1PS9A 1JQVA 2EGZA 1ZAJA 1X1ZA 1OG0A 4MFEA 5F4XA 3QPYA 3LGEA 3ZFHA 1TTJA 2AAMA 1H7WA 4TMBA 3LCHA 3Q37A 4KFPA 4LVAA 2Y63A 1FWTA 3BPWA 2B4GA 3WK1A 4WY0B 1K7FA 1G4EA 1J5TA 4U28A 2DZVA 1M7PA 1VJIA 2E6YA 5A5WA 3LXCA 1LORA 4R53A 2CLMA 3DGRA 2E6AA 4N6EA 5E1QA 5FEXA 2JKEA 3IV3A 2HSAA 3O1NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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