3P7Y | Genus

Total Genus 139

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	139
sequence length	363
structure length	363
Chain Sequence	AEKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Pentaerythritol tetranitrate reductase
publication title	A Site-Saturated Mutagenesis Study of Pentaerythritol Tetranitrate Reductase Reveals that Residues 181 and 184 Influence Ligand Binding, Stereochemistry and Reactivity. pubmed doi rcsb
source organism	Enterobacter cloacae
total genus	139
structure length	363
sequence length	363
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2010-10-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3p7yA00

1JCYA 2FQIA 4HHPA 4JTJA 1GVSA 2CWNA 3NZRA 3O05A 3W7GA 3INPA 4UTJA 1UB3A 4BWLC 3W7CA 4NXSA 1XCFA 4O11A 5BOOA 3Q94A 2GOUA 2A7NA 1OX4B 4OU1A 4JS3A 1DORA 3LDVA 3W1LA 1TQXA 3WK2A 3GLCA 2RKXA 3UY8A 4NUWA 4R33A 2YDAA 4KWWA 4YMZA 1JVNA 1WDWA 4O1CA 1W54A 2QCFA 5CPMA 2O7QA 5AC7A 1FCQA 1QOQA 4QM1A 3NQ8A 2VKZG 1B57A 5KZMA 1GVRA 5DY3A 1LM1A 3OVQA 1A53A 3G1AA 4AXKA 4P61A 4Y9AA 2DZSA 1W1ZA 4LVBA 1LZOA 4BI7A 2BX7A 2QCEA 1RQHA 4HPXA 3PULA 3HPSA 3L0NA 1LTDA 3EKZA 1DJQA 1KFLA 4GUJA 5E93A 5HWNA 5BMXA 3SIZA 1N7KA 5DY2A 2AAMA 3TAKA 2CLIA 3KX6A 1ZCOA 1LRQA 5C2XA 2QKFA 3W1XA 3BLIA 5F2IA 5LKYA 1SZGA 2FPYA 5D33A 3W72A 4JYFA 3W86A 4QJ1A 2D73A 2XN0A 1RR2A 3C8FA 5C54A 4RK8A 3LRLA 2Q3OA 1SW0A 5KINA 5D2XA 3TW7A 4IMDA 5KSWA 3C6CA 3EX1A 3GAYA 4BFAA 1EB3A 1XFBA 2ZA3A 4HSOA 3I68A 2V8ZA 4O0KA 2QJIA 3NQGA 5CZSA 3G18A 2CZFA 3N19B 5TBOA 3I7RA 4FX8A 2GQ8A 3PUDA 5KZDA 3TJLA 1W31A 3M5YA 2PE4A 5CKSA 5LNWA 2GVJA 3HG3A 1SO4A 2VEPA 2ZRXA 4KKXA 5G5IA 1VCVA 1G67A 1SQ7A 1UASA 4OQVA 1TRIA 3MP5A 2NV2A 2YX0A 4X9SA 3S5YA 4ZZ9A 3ZWTA 1OX6A 1IIHA 2C18A 3LLDA 2FPVA 4MYAA 2P0OA 5CGQA 2BXVA 3F4WA 3LHYA 5HINA 3NQ7A 3PY2A 4PL1A 3LCWA 2WNQA 3T55A 4XTIA 4LOCA 3Q37A 1WOBA 4MJMA 1BTMA 1KLYA 2EGZA 3WJXA 3M43A 1EP1A 1VYPX 3W2KA 1JCXA 1XBZA 4CNOA 1SO5A 3KOFA 5BNKA 4JTUA 2RDTA 1DL3A 1VHCA 4OBTA 3QSRA 1JQXA 1QAPA 3M1ZA 1L6WA 3Q2DA 2JKEA 1IXQA 2E5CA 3BLEA 2ZZ3A 4UTLA 1PCWA 3NVTA 4UIOA 4ONVA 3HGRA 5D2WA 2I14A 1KM0A 1DOSA 3EXTA 2DZXA 4P2VA 1TTJA 5DBUA 4R34A 5G2WA 2E1DA 1ZAHA 4JY8A 4O16A 3VE9A 4EIVA 3LCGA 2YR1A 4J9JA 2V0TA 4NQ1A 3W83A 3GKFA 3DFTA 1L6SA 1EUNA 4CQ8A 1SFLA 4LUJA 5AHLA 1YXDA 1J4EA 4DF2A 5K7JA 3QPYA 2B0MA 4XBKA 3GVGA 3S5NA 3QRHA 1H61A 4ZQRA 3G0UA 4UFIA 2CLFA 5G1YA 5LNRA 2CLLA 1TPDA 4JYDA 4N9EA 4LVFA 1RZMA 3LHWA 1X8FA 1VC4A 3W87A 3QW3A 4MFDA 3TW6A 3G1SA 5G4EA 1GG1A 3TSDA 5KMYA 1IXOA 3NEVA 4UTIA 3RFAA 3IEBA 3IVSA 1YPFA 3GDKA 5I3KA 2Z1BA 3JS3A 4MLJA 1VR6A 1KTNA 2QAFA 3GB6A 4XQ6A 2WSYA 3TK7A 3D0CA 3FA5A 1O5KA 3NL2A 5DELA 3TAOA 4JEQA 3W23A 4A21A 1PHWA 4O1BA 3L0GA 1PHQA 2NX9A 1MXSA 4JIPA 5AN7A 3C0JA 5CZJA 2PCQA 1WBJA 1B4KA 1WV2A 4D2JA 1QOPA 3CQ0A 1ICPA 2CW6A 3LHZA 5E0KA 1HL2A 1GT8A 3NQEA 3CWNA 2H8ZA 2Y7DA 3OBKA 1UBSA 2DZWA 4GNJA 4K7VA 3SGUA 4FO4A 3MUXA 1KM6A 5L6UA 3P8IA 2OT1A 4A2RA 2H8XA 4Q33A 4UMCA 2OT0A 1ICSA 3G3MA 3S1UA 2ZCGA 4Q4KA 4BF9A 4I7UA 1ZALA 2B7PA 5LNSA 2ZZ2A 3F1QA 3QQ0A 4GXMA 4CQAA 1XI3A 1NF7A 2DORA 3DAQA 2WNZA 1CX9A 2NLIA 3B0VC 2WJZA 3TKFA 1ZAJA 4K6AA 5AOUA 2Y88A 4QNWA 2FLIA 4OE7A 1LROA 4RXFA 4M6QA 1TCDA 1X1ZA 4MY9A 3OIXA 4O4VA 5AFDA 1EEPA 3EX2A 3W75A 1D9EA 3DHFA 1V7YA 3YPIA 1VPXA 5EL1A 4JYEA 3GDRA 2R8WA 3BW3A 4O10A 4LS1A 3P7YA 1RPXA 2DU2A 4AVFA 1Z48A 1SZNA 3M5ZA 3L2IA 2QR6A 2NWSA 1XM3A 4DPQA 1W5OA 5DLCA 4L4LA 4N6EA 5GVJA 5I3FA 1R2SA 3P61A 3TQKA 2XFWA 2VFIA 3QW4B 3TC6A 1L9WA 3GIYA 4MJZA 1DVJA 2NX1A 1ZENA 1TV7A 5CG7A 4N02A 2VFHA 4IPIA 1AW1A 3O07A 3EWYA 2PRMA 4WUIA 4MLRA 5CPOA 4AEOA 1R2TA 2CU0A 1IIGA 2EPHA 2YYTA 1FCVA 1YDVA 3DI0A 1F2JA 1U5JA 5FEZA 3LHUA 4S2BA 5I3JA 3R8RA 1HG3A 1S5VA 1R46A 3S42A 2TRSA 1F5ZA 1QCWA 4RZ6A 2QJGA 4HNUA 7TIMA 5AYYA 1NVMA 5CPLA 1OX4A 4LY8A 1C29A 1DQXA 4NXKA 2PURA 2ZRVA 3G24A 1DQWA 4FB7A 2G5WA 5SWUA 5J5DA 1W3IA 4JTKA 4JNMA 3DXIA 2C16A 2GUUA 3MW7A 3UYCA 1OYBA 4PH6A 3MBDA 3NQDA 2V2DA 1O60A 4JY9A 1UCWA 3C2VA 4IXXA 4WXZA 4O54A 1M5WA 4UTHA 1SW3A 2C1HA 4RZ4A 5D38A 2QCNA 4WOQA 1R2RA 4IGHA 4NJKA 3FJLA 4NNCA 1RD5A 3RU6A 5I3GA 1HO4A 4LV9A 3W71A 3LTYA 1JUEA 2JGYA 1O4UA 2J9XA 3IIOA 4O1DA 4JIQA 5DCEA 4LNYA 2CLEA 3I65A 1RV8A 3ABQA 3VCRA 5MHBA 4AB4A 5KTLA 3EXRA 3SR7A 5EYWA 3UWYA 4O8RA 1IXNA 2CLOA 4CCCA 3N34A 5BW6A 3RLUA 4PTNA 5G4WA 2ZRUA 1JCMP 1TV8A 3A9IA 3P84A 1X6UA 3G1YA 3GR8A 3ELFA 3PSVA 1FWRA 3PUOA 1H7WA 3UWQA 1GPWA 5D04C 4HN4A 2YYUA 3DFOA 5I3IA 1WBHA 1BKSA 5LHFA 3W76A 4IMGA 1H7PA 4M5PA 4O1AA 1MSSA 1QO5A 5D2TA 5EBUA 2FFCA 3LV5A 3R12A 4LU0A 4BR1A 3QJAA 4LUIA 1OK6A 3LB0A 3GAKA 2H6RA 3O1NA 3W1AA 1KFBA 3W7HA 1CI1A 2YW4A 4RR4A 1DV7A 4NX5A 1WQ5A 1QPOA 2WSQA 5FESA 4PODA 2CLMA 3L21A 3TNOA 2ZZ5A 3L68A 4TR9A 4C1KA 4WX2A 4FXSA 3FFSA 4TMBA 4FNRA 4FX6M 2Y85A 2H90A 3W1NA 1YTKA 1G4PA 1K8YA 2Y7GA 1IF2A 5I3HA 1SU5A 3LCLA 3TDFA 4M7SA 2ATMA 2I1OA 1F6KA 4UTWA 4XWUA 1K03A 1OFDA 1WX0A 1PS9A 4FNUA 3P80A 2C14A 3EWBX 2P10A 3FKKA 1GZGA 3IGSA 4NX0A 5EA9A 3EXSA 1YPIA 2GVGA 4PCFA 2V2CA 1FY6A 3W7JA 3BW4A 1E51A 4JTFA 3MYPA 3L0KA 4N9CA 3W7NA 1JRCA 4E2BA 5G1TA 3W7QA 1K3UA 2Y62A 3B03A 4TIMA 5AHNA 3WJSA 1XXXA 5AHMA 3LERA 4UTTA 2GQ9A 1H50A 4ZQNA 2V5BA 3ZR4A 2DZUA 3BV4A 2ZQ0A 4LC8A 1MEWA 1R47A 1TQJA 1N55A 1OFAA 3GDTA 3ZS4A 3P74A 2ZTJA 1GYNA 4MUZA 3SZ8A 4IUOA 1N8FA 2TMDA 2C0AA 1YADA 2A1YA 3IV3A 3G8EA 3OA3A 4XKYA 5HR7A 1YDOA 4O14A 5HNRA 2OCZA 4WZHA 4ADTA 2VFGA 3G0XA 3ABOA 3E0IA 3MP4A 2Z6JA 1XBYA 1P0NA 4ADUA 5FF0A 2YCEA 4WY0F 3S8HA 3F4NA 4ZQMA 4JTHA 4JTEA 1QPQA 1JUBA 4UFHA 2QCMA 2X1SA 2ATSA 3EKLA 3PC0A 3UWVA 4YCOA 2DZVA 3SSJA 1S5WA 3LXBA 3ABSA 3TXVA 5HWMA 3M5VA 1HFBA 1O94A 1OFPA 1LBMA 1A5AA 5TQLA 3UWWA 1Y0EA 3PAJA 4S2CA 4Z1DA 1TJPA 5AYXA 4K8HA 4WXYA 3EX4A 2J9YA 1Z42A 4JX4A 1QR7A 2RDUA 2ZZ1A 3HG5A 3MJYA 1RVGA 3WK1A 4NNAA 4UMAA 4N2YA 1IXPA 4MZ8A 1YDNA 3NQ2A 2WV8A 2RHGA 3KHJA 3U8GA 5IBXA 3O6DA 2G95A 4LT9A 4DF1A 4K36A 4UR8A 1OFBA 3QMSA 4Z0JA 1GG0A 1K7EA 2R14A 3LBMA 3S1WA 3U2OA 1LRNA 3TV8A 3TX9A 5D30A 3L9CA 3LBCA 3N9RA 1H62A 3HOJA 4CQ9A 2OZ0A 2V30A 4XUGA 3TJXA 1T96A 3HB9A 4O12A 2A7RA 1TRDA 1XUUA 2DZPA 4IMFA 2QCLA 3DFQA 4PEKA 4IQLA 2CZEA 4ZQPA 4AWTA 3S6DA 1O95A 3DI1A 3LRKA 3VNDA 1AL7A 2OJPA 2ZRYA 3P82A 3MYOA 3S1VA 3NL5A 3R5EA 2X16A 1RQBA 1KTCA 1KV8A 1LORA 4HIBA 1H1YA 1BWLA 2CLKA 4GUHA 3B0UX 4DO5A 3W2NA 4Y6GA 4WY0B 2QCDA 3RK8A 1A50A 3M16A 3NG3A 1LBLA 4NU7A 5A5WA 1U83A 2F7FA 3IIPA 2C15A 4Y90A 2WO5A 3HGSA 3LGEA 3C61A 1GOXA 4HT3A 3CT7A 5CZTA 4W9TA 4DEFA 1OFQA 2YXGA 3TXZA 5F2MA 1GQNA 5LNUA 1PIIA 4O53A 1ML1A 3W22A 1AL8A 5F4SA 1H60A 2RFGA 4UC5A 3V1PA 1X7FA 4X22A 3W73A 1SSGA 3HGOA 5EMUA 2ISSA 3C56A 4GUGA 1TSIA 4ORIA 2B4GA 3P62A 1W8SA 3W1MA 4UTKA 1JR1A 3RF9A 2J6XA 3NR0A 4OV9A 3CHVA 3E96A 1QMLA 3QQ1A 1FCBA 3SI9A 3BW2A 3EX6A 1V5XA 4YXGA 4RJEA 4MY1A 3KVKA 1UUMA 4IMEA 2DJLA 1ZHAA 3BG3A 4NJHA 2V2HA 1GYLA 1I2RA 1OF6A 5F2LA 3TE9A 1GTHA 3WJWA 2GJNA 2VFEA 1YXCA 3QMRA 2FJKA 1ME8A 4XKYB 3ANYA 1TTQA 2XN2A 3DU0A 3PR2A 2BZNA 3FKRA 3PBWA 2Y7FA 1W56A 3PM6A 3PG9A 2Y6ZA 1F6PA 3IGXA 3RMJA 1T0OA 3CWOX 4JX6A 4FNSA 4LWWA 3NZ1A 4A2SA 3L5AA 3ZFHA 1I45A 4PA8A 2VEKA 3TUUA 3G1DA 3QM3A 3MP3A 1T99A 3NA8A 1DJNA 1FDJA 3GZ3A 1HTIA 2Q3RA 1JUKA 1H7RA 4JDYA 1S5TA 3M5XA 5CPNA 4LVAA 3IGUA 2Q8LA 2Q8ZA 1H5YA 5D37A 1KM5A 1MZHA 1NFBA 5BMWA 4RXGA 3U6WA 3GR7A 3USBA 4PL2A 1ZJIA 3B8DA 4JTTA 4XBSA 5KITA 3UXDA 3HBLA 2NUYA 1C8VA 1EPXA 3ATZA 1X1OA 3CB8A 4JTIA 4UNKA 1D3HA 1LLZA 1XBVA 1TREA 3STEA 3C4UA 3S1XA 4RLIA 3W3OA 4X3ZA 3NQFA 5AB3A 4Z08A 5KZEA 2ZFAA 3GX9A 2NXGA 1TPEA 4MPQA 1WXJA 4OGZA 1Q6QA 1VLWA 3WFAA 1AW2A 3L5LA 3NDOA 4K7YA 3GDMA 1TPC1 3M44A 4R53A 2E68A 4IWWA 3LCFA 3DFNA 3GNNA 1W37A 3BK0A 1H7NA 2ZA1A 3G3DA 1TPUA 5D2YA 2FDSA 2R91A 3H55A 3EWWA 2VOMA 1FCUA 3IIZA 4MZYA 2B7QA 4M19A 3AO0A 3UZ5A 3M0ZA 3TMLA 2GPTA 3THQA 1AMKA 4IPJA 3TQ0A 4I7WA 3TR2A 4WJEA 4DF0A 1ZY9A 1K8ZA 2FIQA 4FIRA 4Z0SA 1NAL1 1OK4A 3IIXA 3NM3A 3LV6A 4HKPA 1PV8A 3N9SA 2WOQA 3ZWSA 1OYAA 3B06A 3UD6A 5HJLA 4N9DA 2QCDB 3DGRA 1WAUA 3MHUA 4G1KA 2YFNA 4NJGA 1VHNA 3QC3A 4MFEA 1TMHA 4E2DA 2VFDA 1PVNA 4N9BA 2FB2A 4R7JA 4UTMA 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4TO8A 4WY0A 3BO9A 2QCHA 3GXPA 3HO8A 3LHVA 3W85A 3FEMA 3W84A 1YLVA 4AHQA 4Z1AA 4LS2A 4LRSA 1K8XA 3GDLA 2ABAA 2VC6A 1W5PA 3K30A 3C2FA 2BWGA 1TV5A 4N6FA 3C2RA 3W7KA 3G1HA 1ALDA 1SZEA 5AHIA 5C6MA 1YXYA 1TPH1 4GJ1A 1KFEA 2Z6IA 5DXXA 3QSTA 3NQAA 4AH7A 5LGZA 3LCIA 1FWWA 1XC4A 3UXAA 5EKYA 1VYRA 2A7PA 4CCDA 4Z1BA 3FS2A 1ICQA 2W6RA 1FXPA 3HPZA 5FF2A 5HWJA 5C5YA 2ISVA 3SGZA 1C9DA 3SFKA 3SY5A 3DFSA 3E02A 4M7TA 5LZLA 2QUTA 2QUVA 2X1TA 4LVGA 4DO4A 4QITA 4U28A 3DKJA 5LSMA 3P81A 5F4WA 4DO6A 2E5DA 4QIUA 4YWIA 4O52A 3TH6A 2PC4A 3LCHA 3BGJA 3O6YX 3OHIA 1L2UA 1P1XA 4M6PA 3WJYA 1A5BA 3CIWA 1EWEA 1FUYA 4Y96A 3PVFA 1EX5A 3KVMA 4NZFA 2QDGA 2FPTA 4UFKA 1OHLA 3LLFA 3EB2A 3GK0A 4NZJA 5HR6A 1KBIA 2A5HA 4QNEA 1P0KA 1LLWA 2UV8G 3EX3A 4ADSA 1KLZA 2DZTA 3G1XA 3PF3A 3P5ZA 3W88A 4JGDA 3G8RA 5D05A 3UQNA 1ZNNA 2QCCA 4PFMA 2TPSA 3S0CA 4OWGA 2E6YA 2NUWA 1KM2A 2OMAA 3C52A 1R30A 3UWUA 3IIVA 3P60A 3TU9A 3F03K 1LOLA 4MOZA 2C6QA 1TJRA 4H4IA 4RX0A 1VGAA 1SO6A 3DZ1A 2G96A 4FHAA 4O50A 3GYEA 1KFKA 2HS6A 1TPB1 2B7NA 1ME9A 4FNQA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3P7YA

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