3PA5A

X-ray crystal structure of compound 1 bound to human chk1 kinase domain
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
269
structure length
255
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
publication title Design, synthesis and SAR of thienopyridines as potent CHK1 inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 255
sequence length 269
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3pa5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pa5A01
4D2WA 4MQ2A 4F1OA 4B0GA 2OJJA 3IW5A 5EM7A 4O1OA 2VO3A 4NCTA 2IJMA 4NH1A 5DOSA 2QG5A 4EH2A 1EH4A 1PMNA 4YGAA 5EYKA 3CE3A 2IZSA 2PVKA 3C50A 3OT3A 4R7IA 4BF2A 4EHGA 1Q24A 5CXZA 3Q52A 2P2IA 4M67A 3O7LD 4JQ8A 4O1PA 3R7EA 4AF3A 3W33A 4DG3E 2Y6MA 2OJIA 1PXMA 3LFBA 2VTOA 4P2KA 4A4LA 2C3JA 2V55A 3EQRA 3IO7A 3REPA 4D4VA 1ZRZA 4IX6A 3AXWA 4FKTA 5AP0A 5AR7A 3QHWA 4UEUA 4RJ6A 3O96A 4XH6A 3VF9A 3HRBA 4DC2A 4EH8A 1JKLA 4FE2A 3RAHA 3DAJA 5AEPA 4GYGA 3NUUA 4P5QA 4WD5A 4D4YA 3BWFA 3R7IA 2DYLA 5HKMA 4DFUA 3V6SA 3OBJA 4DH3A 4EH3A 2HXQA 1GY3A 4MTAA 4OT5A 4EWHA 3EQFA 4OTPA 3BE9A 4AOJA 2P0CA 4J52A 5A4LA 1STCE 2NRUA 2XNMA 3EKNA 4NM7A 4XHKB 5HIDA 2WQOA 3Q9XA 4FV3A 3CQWA 4HPUE 2BAQA 4BCGA 4C0TA 4FZ6A 2R3GA 5D12A 1REKA 4TYEA 3EQIA 4FTCA 4W4WA 5GHVA 1KWPA 4BGQA 3QD3A 5AR5A 4FR4A 4OTGA 3PVBA 4EOJA 1R0EA 3AMBA 4EOMA 4QP2A 4RX7A 4GKIA 3DPKA 4FKPA 4IVCA 3PE2A 4E26A 4KS8A 2I0YA 3BCEA 4XV3A 2PU8A 1KOAA 2OZAA 3ACJA 3FI3A 3F3VA 4KSPA 3EQPA 4C59A 1R39A 1J1CA 5IQEA 3EQGA 1ZXEA 4O81A 4FL3A 3FLZA 3NUNA 4FKWA 4QQJA 2OKRA 4EOOA 5K4IA 3R1NA 1JAMA 3U87A 1JSTA 3BYVA 3MS9A 3LXNA 4ZSLA 2H9VA 3VBWA 4O7SA 1FVRA 2WTKB 3KRWA 2ZM1A 4FNYA 2OBJA 2ZV8A 4CGAA 4LRKA 2BCJA 2FB8A 3LFCA 3ZBFA 4FA2A 3FPMA 4GFOA 4WIHA 3AGLA 2XVDA 3FZ1A 3PUPA 4XG6A 4YC6A 4RIYA 5HIBA 2NNWB 2QKRA 2O63A 3ZUVA 1PMUA 3SD0A 5HOAA 4K18A 5CI7A 3A8WA 3V5TA 3AOXA 4CMUA 2X7OA 5DR6A 5L6WL 4WRSA 2ETMA 1W84A 4FEXA 4PP7A 5DG5A 3FMEA 3IONA 4XRJA 2VTMA 2C3IB 3L9NA 3PE1A 3DXNA 4IVAA 3D2KA 5HD4A 2XNPA 5AM7A 5LMKC 4ZXTA 3ANRA 4ERKA 3KU2A 2XIRA 3PJ2A 4UN0C 5BQ0A 2Z60A 3KXNA 4KINA 5B2KA 2QR8A 3A7HA 3GFWA 2XA4A 2QOQA 4BIBA 1DI9A 3UDBA 5K5XA 1ZYSA 2XNBA 5AWMA 4RJ3A 2W7XA 5FLFA 1AGWA 1H1PA 3ORIA 5LWMA 2HZNA 3F3UA 4YJTA 4RMZA 2F4JA 3H0ZA 4YJRA 1RW8A 2VGOA 3OMVA 3Q5IA 5DR9A 2WMTA 4TWCA 1BL7A 3R9NA 4EONA 2IZRA 2C3LA 2E9OA 2WKMA 4JBVA 2JAMA 4C4GA 5GJGA 3ET7A 1SVEA 3GENA 3ZSHA 3QC9A 3VS0A 5CANA 4OR5A 4FV2A 3UJGA 4OBQA 2UW4A 3KCFA 2YZLA 4FKIA 3V04A 3TV6A 1KE7A 3LFSA 2YWPA 3PJ8A 1M14A 2JIIA 2WPAA 5M44A 4F6SA 1OIYA 2BIYA 2W4KA 4EH4A 5J7HA 4JBPA 3OS3A 5DMZA 3TM0A 1XJDA 2XKDA 5EI8A 5HHWA 4ERWA 1H1WA 3PDTA 5DBXA 2Q83A 3U9NA 5JFSA 5D41A 3QQGA 1Q62A 5HNBA 4AN3A 1DAWA 5AV4A 3KQ7A 3S1HA 4FKLA 3GEQA 1YOLA 4P90A 4CZTA 1XHAA 4IB3A 3U6JA 4RZWA 4IFCA 4FZ7A 5HO8A 2HZIA 2X81A 4FT7A 5D9HA 4YMJA 4QYEA 2XH5A 4QP3A 4WT6A 4BI1A 2J5EA 3DU8A 3IDCA 4FT5A 1PXOA 5DIAA 2VRXA 2GDOA 3PVUA 1UA2A 2UVZA 3L8XA 4MYGA 5IUHA 2W1CA 3PXZA 3NS9A 1PMVA 3RMFA 5E91A 4UY9A 4MD8E 3BE2A 4IM3A 4HOKA 4O6LA 4BDJA 3AC2A 4O27B 2I6LA 3BLQA 3QQLA 4D1SA 2BIKB 2YCSA 4YZMA 3WF7A 3ORKA 4C8BA 5A6NA 5EKNA 5HTCA 3NVMB 3KF7A 3ROCA 4D4SA 3KRXA 3VS1A 2R5TA 4FVRA 3LCTA 4FOBA 4BTFA 5BUEA 3C0IA 1BL6A 2BTRA 5L4QA 4BN1A 1E1VA 5L8LA 5EQYA 4NTSA 3CLYA 3QKLA 3SVVA 2WMWA 3QGYA 2QD9A 2QQ7A 1XH8A 4DH7A 5CAQA 4RX8A 3QTZA 5ANIA 4CYIA 4JL9A 3BHVA 5BUIA 2ERKA 2WD1A 4X3FC 4TTHB 4FV6A 1OMWA 3ZZWA 4FIEA 3PVWA 2E9PA 2ITTA 3OCTA 2YIRA 2ZDUA 3EH9A 3QL8A 3PY1A 3TV7A 3U54A 2BALA 4RQKA 4U97A 3RGFA 3IQ7A 3JR1A 3MVLA 4PRJA 4AUAA 2JIVA 4R3RA 5B7VA 3A2CA 4O0WA 2QI8A 2C6OA 3FWQA 4B99A 4E7WA 3G9LX 4XV9A 4HPTE 5EYCA 3UNZA 4WSQA 4EJ7A 1SYKA 1WBOA 3N9XA 2C6LA 4NT4A 2W5AA 4IE9A 5CI6A 1H1SA 1WAKA 2OXXA 4GV1A 2CLXA 2QO7A 3DFAA 3LHJA 2I0EA 4FEWA 5BPYA 4U79A 2PMOX 3TUCA 3E7OA 4C4IA 5DVRA 3UC4A 1W0XC 4KBCA 4MNEA 4PY1A 3TKIA 1BUHA 1P4FA 1TQMA 4IZYA 3K2LA 2WTKC 2CKPA 4PPBA 1ZMWA 5AAGA 4QP4A 4JX7A 3CP9A 4RIXA 4O7VA 4XEYA 5CXHA 4S30A 4M69A 5LJJA 3K5VA 3R8ZA 3ZO1A 2GHLA 1OITA 5FGKA 2CNUA 4ASXA 5FDPA 2GQGA 3OTVA 4FBXA 3BLHA 1JSUA 2VWUA 1VJYA 3PA4A 4HVDA 5LARA 3M42A 4U8ZA 2XK3A 4ZAUA 3TDVA 4YUQA 5C4LA 2B9JA 2GPHA 4EL9A 4QOXA 3VQHA 5HORA 3RJCA 4CFNA 1M2PA 4MXOA 3P7AA 1K3AA 4YTFA 3FLWA 4FSNA 3OUKA 2X2KA 5ANDA 3QBNA 3D7TB 5KHWA 4KS7A 3I0QA 3NWWA 3VS5A 3TI1A 3QA0A 4ZZMA 3M1SA 4LOPA 4AA4A 2OG8A 1LUFA 5DR2A 4PV0A 5IUGA 3QWJA 1CTPE 3EZRA 3NUYA 2WMXA 4FV4A 1T45A 4ANOA 3ZLSA 3E87A 3NGAA 3R8MA 1GZNA 2PZ5A 5CT7A 3T3VA 4I6BA 4IAZA 3OROA 4Z7GA 5DWRA 3IW8A 3GU8A 3KK8A 4QMMA 5DNRA 4A9TA 4A9RA 5JSMA 3DNEA 2I0HA 4I41A 4DGGA 4FEUA 2YIQA 2V5QA 2VTHA 3KVXA 3D14A 3OUNB 3FUPA 4R1VA 3WF6A 4CZYB 3UZTA 4ASEA 2CJMA 2NP8A 2QHNA 4RIWB 4WG4A 3A7GA 3R9RA 3QHRA 4PPCA 2PL0A 4O83A 4W4YA 4EYMA 4PP9A 4E73A 4BDHA 3LXKA 5CF8A 4CFFA 3V5QA 3QLGA 3D9VA 4ZLOA 1LEZA 4G5PA 4M8TA 4MXXA 3QQKA 2J50A 4ZTMA 3K3JA 4PWNA 3SG8A 3ENHA 3RWPA 4JBOA 2IVTA 3L9MA 3QF9A 4UMQA 1LEWA 4DITA 4JI9A 4FG7A 5A54A 5DLSA 3DKOA 4CTBA 4FKSA 2R3IA 3TJDA 5IH4A 5HE2A 3FYJX 4IB1A 4XG9A 3PPKA 1F0QA 3G6GA 2OZOA 2OIQA 4RX5A 4FZAB 3UO6A 2VTQA 3WOWA 3CBLA 1Y8YA 1LPUA 2XIYA 2XNOA 4FODA 2X8DA 4IW0A 4RFYA 3UODA 1ZMVA 3GCVA 3G6HA 3D5XA 3OG7A 4BCPA 4CFUA 2HZ4A 5JGAA 3TIZA 4H1JA 1ERKA 3I6WA 4DCAA 4EHEA 3BEGA 5IQBA 4WNPA 4DTBA 1YI3A 1H00A 3AD4A 3WF5A 2QONA 1UWHA 3CKWA 3D5VA 1R1WA 1HCLA 3F69A 4PMTA 1V1KA 3PLAE 3DK7A 4GW8A 4RWLA 3LOKA 2EVAA 4FIIA 4I92A 4CVAA 3A7FA 5HGIA 3BU5A 4WA9A 4GL9A 2R3LA 5LXMA 2UW3A 3KL8A 5ANEA 2PVFA 4DH8A 3A7JA 5FTOA 4BZDA 1Z5MA 3WILA 4EOLA 3KC3A 3U4UA 3WZKA 3ZM4A 1U5QA 2QOBA 4ZMEA 2RF9A 2QKWB 3I4BA 2P4IA 4IC8A 4D0XA 3II5A 4B7TA 5A4QA 1UU3A 4YU2A 2OK1A 3KCKA 4M15A 1VYWA 2B9IA 3EN5A 1OUYA 3MH0A 5HESA 4XJ0A 2WQNA 5ETIA 4ZK5A 2QU5A 3CY2A 4I5CA 1XQZA 4I4EA 2ZMCA 5A4EA 4BDIA 5M4FA 1OL6A 5KMNA 4G3EA 3W55A 4RVLA 2OJ9A 3EQDA 4I0TA 3NNWA 3MJ2A 4FV1A 4R5YA 2QOIA 4BICA 3SW7A 3O0GA 3R9HA 1Y6AA 3BBTB 1URWA 2WEVA 4LMUA 4UZHA 5B2LA 3VUKA 4WUAA 4QP7A 5HBHA 4IZAA 2Y4IB 3EQHA 4U9AA 2XK7A 2HIWA 5AM6A 3E93A 1ZY4A 3QD0A 1PMEA 4U0IA 2J5FA 3C0GA 3NDMA 3JY9A 4KD1A 3UBDA 3F5XA 2VN9A 4I5HA 1JKKA 4OTWA 3AMAA 4DFXE 1K2PA 2EXEA 4ALVA 5FM3A 3HP2A 3ZCLA 2UUEA 3VUHA 2SRCA 2XK8A 1FOTA 2YACA 4TWPA 3B8QA 4F64A 1YOJA 2JLDA 4UXQA 5AP6A 2WTCA 4DEAA 3KXXA 4WG5A 3BV2A 4D5KA 4R7BA 2YAAA 2WMSA 4PTGA 5LOHA 4F08A 1GIHA 5ACKA 2CNQA 5E8XA 2W1IA 4FKOA 3TXOA 2G2HA 4BCJA 5JKGA 3HAVA 5EI6A 3UIXA 3IDPA 4F09A 2P33A 3PPJA 3TTJA 4JG8A 4X21A 2VO7A 2W17A 3H30A 4BCNA 2JDSA 2V0DA 5JMSA 1H0VA 4USFA 3NNXA 4TRLA 5CAOA 2IZTA 2YEXA 3VO3A 1PXLA 4U80A 5JZJA 2XIXA 3QX2A 2J51A 4N6YA 5E8VA 4G3FA 3UYTA 4D1ZA 3LFEA 5I5ZA 4DGLC 3UIBA 2C6EA 3GCPA 3MA3A 1IRKA 4DN5A 4I5MA 4N0SA 2C6TA 2F7XE 4NIFB 4YBJA 4J97A 4ZTRA 3PSDA 3P78A 5AR8A 2QOCA 1I09A 3EZVA 3LZBA 3B2TA 4ZP5A 4TYHA 2RG6A 4JG6A 4BHZA 4QMSA 4RZVA 1NY3A 5J95A 2XUUA 1JVPP 3EFKA 2FSTX 3BGQA 4WRGA 4WSYA 5L2QA 5IISA 2A0CX 3FQHA 2OICA 3LCSA 3VBVA 3R22A 3CSVA 5TKDA 2A27A 5G6VA 3SV0A 1OKZA 4IJ9A 3F5UA 4ZLZA 4IM0A 4DYMA 5AUWA 4AZVA 3VQUA 4BIDA 1JSVA 4PDSA 5KMKA 5D7VA 1P14A 3DXQA 2PY3A 1CKPA 1M52A 2B52A 2FUMA 3OEZA 3RALA 1X8BA 3LXPA 4CKIA 4DEHA 2JEDA 2YM6A 2A19B 4FVPA 2ESMA 2JDRA 2UZUE 1URCA 1WVXA 3HNGA 3LVPA 4U6RA 4BL1A 3IW4A 3Q53A 1TVOA 4YZDA 4O2PA 1CMKE 4ANMA 4LGHA 4PQNA 3H9FA 4CRLA 4BDBA 3UOKA 4UX9A 4L9IA 1FINA 2WOUA 2J0JA 2UW7A 2BZJA 2W9ZB 2XS0A 2ZAZA 3LM0A 4FK3A 4O0VA 4RA4A 1PW2A 3QTUA 5E8ZA 3B8RA 2CKQA 4AACA 5ETCA 4EOQA 4GT5A 4JRVA 4DG2E 3P86A 4MK0A 3D83A 5IG1A 4LM5A 1U5RA 2CCHA 3BV3A 5AUXA 3T9TA 3TWJA 5CF5A 2IW8A 4II5A 1XH5A 1YXUA 5HLNA 3W32A 5I0BA 3GU5A 1U54B 5KBRA 3OW3A 4RA5A 1BI7A 2B53A 1JLUE 4I20A 2YFXA 3KMWA 1B38A 4G2FA 4GK3A 2VUWA 2YCRA 4DH1A 4DT8A 3R7YA 1WVWA 2ITWA 2VX3A 3PJ1A 4FUXA 2NRYA 4QMTA 3VUDA 2C1BA 4CKJA 5CENA 3W16A 3DCVA 2XJ0A 1W8CA 2WB8A 4HYUA 5L2IA 2AYPA 4B8MA 3KREA 3NZ0A 2HENA 3EL7A 4RWKA 2A2AA 1SMHA 3LW0A 3Q5ZA 5L2SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1R0P A;  4CFW A;  1H4L A;  1TQI A;  4NM0 A;  2XNE A;  3LPB A;  4PDY A;  5KMI A;  3JY0 A;  3VS6 A;  5DN3 A;  4O22 A;  3OY3 A;  5KML A;  3MES A;  3CEK A;  2PVN A;  4PUZ A;  5JFX A;  1NT2 A;  3KK9 A;  2Y4I C;  2R3J A;  3M2W A;  5LWN A;  3R8P A;  4CT1 A;  3W8Q A;  4RSS A;  4AZT A;  4ITI A;  3UVR A;  2BKZ A;  2IN6 A;  3L9P A;  1REJ A;  1IG1 A;  2X4Z A;  3G2F A;  3ITZ A;  2Y4P A;  4FKV A;  2W96 B;  1NW1 A;  3P7B A;  3PRI A;  3R63 A;  4YJU A;  5AFV A;  2CN8 A;  4TN6 A;  4EHZ A;  5KE0 A;  3P7C A;  2EXC X;  2WTI A;  3TNP C;  4CQE A;  4HYH A;  5DI1 A;  2UZB A;  5HTI A;  3C13 A;  2FSO X;  1GIJ A;  2XMY A;  3R8L A;  1QPJ A;  5BVE A;  2GHG A;  2OSC A;  4GCJ A;  4F65 A;  4CXA A;  3HL7 A;  5M4I A;  3MPM A;  1PRY A;  1Q3W A;  4EH9 A;  4PDP A;  5C03 A;  3QUD A;  3ZUT A;  3QD2 B;  4P4C A;  4AGC A;  4LUD A;  4C62 A;  2WQE A;  1MRY A;  3ERK A;  3GOP A;  4CFM A;  2XBJ A;  3R02 A;  2CGU A;  2WTW A;  3D5U A;  4KIO A;  4QMN A;  3HDM A;  4USD A;  3W2P A;  3E3B X;  2O2U A;  3R9D A;  4IBM A;  4QP1 A;  3MY5 A;  3Q6W A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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