The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
151
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structure length |
151
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Chain Sequence |
TTLTNPQKAAIRSSWSKFMDNGVSNGQGFYMDLFKAHPETLTPFKSLFGGLTLAQLQDNPKMKAQSLVFCNGMSSFVDHLDDNDMLVVLIQKMAKLHNNRGIRASDLRTAYDILIHYMEDHNHMVGGAKDAWEVFVGFICKTLGDYMKELS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin II
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| publication title |
pH-dependence crystallographic studies of the oxygen carrier hemoglobin II from Lucina pectinata
rcsb |
| total genus |
63
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| structure length |
151
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| sequence length |
151
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-11-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y7G B; 1O1M B; 3PI4 A; 4M4B B; 2V1J A; 1SHR B; 4HHB B; 1CH2 A; 4ZVA A; 5E83 A; 1PBX A; 1QI8 A; 1XZ4 A; 4N7P A; 1YEN B; 1C7D B; 1GCW A; 2NSS A; 3WHM B; 2NX0 A; 1Y09 B; 1YIE A; 1GBU B; 1BZ0 A; 1IBE B; 4YU3 A; 3EU1 B; 1YZI B; 2LH2 A; 1RSE A; 1SI4 B; 1QSI A; 1Y85 A; 1XZ2 B; 1Y4Q B; 1ABY A; 3AQ5 A; 1YEU A; 5CNF A; 1IWH A; 1CO9 A; 1Y4G A; 2H8F B; 1J7S A; 1Y0W A; 3OO4 A; 3UGZ A; 4MQH B; 1Y8H B; 1C7C B; 4YU4 B; 1S61 A; 3R5I B; 2LH3 A; 2DHB B; 1WLA A; 4MU5 A; 5E29 A; 2ZSY A; 1THB A; 1NQP B; 3WR1 B; 1DM1 A; 3SDH A; 3QM8 A; 4DC7 A; 5EYJ A; 1XZ7 B; 3PI8 B; 1GJN A; 1Y46 A; 1MWD A; 2QFK A; 1YMB A; 3PIA A; 1Y4V B; 2ZS0 C; 1LFY B; 3UHN A; 3ARL A; 2BLH A; 2ZSX A; 1J7W B; 1S5Y A; 2QRW A; 3FS4 A; 1COH A; 3MJU A; 2BW9 M; 5AB8 A; 1V4X A; 3LHB A; 4M4A B; 3HXN A; 1A3N B; 1JZM A; 2HCO A; 1ECD A; 1KR7 A; 4NZI A; 3H58 A; 3UHT A; 104M A; 3PI9 A; 1O1O B; 1Y35 B; 1FSL A; 2VLX A; 1RQ3 A; 3QJB A; 1A4F B; 1FAW B; 2G3H A; 2C0K A; 4NI0 B; 4NI1 A; 1RVW B; 1MNI A; 3D7O A; 2D2M C; 3LB2 A; 4MQG A; 1O1N A; 1Y0T B; 1Y4R A; 2QSP A; 3VRE A; 4U8U A; 1JZK A; 1MOA A; 3D1A A; 1YHU A; 3WFU A; 3AT6 A; 4UZV A; 4WJG 1; 2ZT3 A; 2R1H B; 3ZH0 A; 3S65 A; 2D60 B; 4N7N B; 1XCH A; 110M A; 1FN3 B; 2MYE A; 1JY7 A; 1A00 A; 1HV4 B; 1UX8 A; 5HY8 B; 1Y8I B; 4U8U D; 1VWT B; 3HEP A; 1U7S A; 1DXD A; 1BBB A; 3ZJI A; 1YHU D; 3AQ6 A; 1HSY A; 1S5X A; 2WY4 A; 1R1Y A; 1BVD A; 1YEO A; 1I3D A; 2DN3 A; 1N9H A; 1LJW B; 5HLU A; 2NSR A; 1M6C A; 1HCO A; 2WTH A; 4G1V A; 2GKM A; 1NIH A; 2HBE B; 1QSH B; 1O1K B; 2ZSR A; 3LR9 A; 1HDA A; 2HBS B; 1ECO A; 5B84 A; 2HHD A; 5EQM A; 4FWX A; 1JW8 A; 1JP9 A; 3M3A A; 1GLI A; 3G46 A; 3UHX A; 1XZ5 B; 1NZ2 A; 1Y5K A; 5CN6 A; 1N9F A; 3HRW A; 1B0B A; 1DO7 A; 2ZST A; 3GOU B; 2RAO A; 4F4O A; 1A6G A; 1Y4F B; 5CND A; 1YMA A; 3ZJQ A; 2VYZ A; 105M A; 3S1I A; 1CG8 B; 1XXT A; 3GQP B; 1MBA A; 4UIQ A; 1OFJ A; 1S69 A; 4ILZ A; 1K0Y A; 1HBB A; 3GQG A; 2ZT1 A; 5CN5 A; 1LFL A; 5EUI B; 3V2V A; 2ZLT B; 1Y31 A; 2V1G A; 2PEG A; 1YGF B; 1RQ4 B; 2O5T X; 3WCT B; 4IT8 A; 1A6M A; 1G09 A; 3BCQ B; 4ODC A; 3B75 A; 4ROM A; 3QMA A; 3HF4 B; 1MWC A; 1MBI A; 2ZLW B; 1IRD A; 3A59 B; 3E5I A; 5CNE A; 1YVT A; 2HZ1 A; 5JOM A; 3S66 A; 1MLH A; 2GTL A; 4IRO A; 2G11 A; 3NL7 A; 3UHC A; 1MYZ A; 1V07 A; 2G12 A; 2MYA A; 4HRT A; 1BIJ A; 1A0U B; 2D5X A; 2GNV A; 4XS0 A; 1YDZ A; 1F63 A; 1FLP A; 2HBC B; 2ZSO A; 1YEQ B; 5E83 B; 2PGH B; 4NK1 A; 1Y0C B; 4N7P B; 1YCA A; 4ZVB A; 1X9F C; 2GTL D; 1I3E A; 5C6E A; 2HHB B; 1V4W B; 3G4W A; 1Y8W B; 1BZ0 B; 2VEB A; 1CQX A; 1Y85 B; 2ZSS A; 4G51 B; 1MNH A; 4B3W A; 1T1N B; 1Y22 A; 2V1I A; 3WCU C; 1DXU A; 1M9P B; 4UUR A; 1CH3 A; 1B86 A; 3PEL A; 1Y83 B; 3O7N A; 5KDQ A; 2FRJ X; 3BJ2 A; 3UHI A; 2EKT A; 2ZLX A; 2V1E A; 1LH1 A; 3D17 B; 1OR4 A; 5ILR A; 2W72 A; 3G52 A; 1GDK A; 1UMO A; 4L7Y B; 3GDJ B; 3UH6 A; 3V2Z A; 1YG5 B; 4MBN A; 3G4Q A; 1GZX B; 1MLR A; 1O1P B; 1ECN A; 2GDM A; 1UFP A; 3BOM A; 1J40 A; 4HBI A; 1LFT A; 1BZR A; 3HXN B; 5E6E A; 1QXE B; 1IOP A; 2ZWJ A; 2D2N C; 1HLB A; 1Y5J A; 4WCH D; 1Y01 B; 1AJH A; 4NK2 A; 5AZR A; 1FHJ B; 3NML A; 5D1V A; 3M3B A; 1MLF A; 1YH9 A; 2ZSQ A; 1OR6 A; 2DN1 A; 4F6G A; 2H8D B; 3S48 C; 2HBD B; 1O1I B; 3U3E A; 3D4X A; 2ZFO B; 3G53 A; 1RQA B; 1Z8U B; 1O1N B; 1CPW A; 2VLZ A; 3DHT A; 2QSP B; 2ZLU A; 4X0L B; 3AQ9 A; 1BZZ B; 1SDK B; 107M A; 3TLD A; 3KMF C; 4MQC B; 1NPG A; 4DWT A; 3QJE B; 3IC0 B; 2MGC A; 2D5Z A; 2EKU A; 2DXM B; 1C7B B; 4MBA A; 2ZT2 A; 1YHR A; 6HBW A; 3QJC A; 5C6Y A; 1XYE A; 1JPB A; 2G0X A; 1JY7 B; 1N9X A; 1UFJ A; 4FC3 A; 3WCV A; 1QXD A; 1CBL A; 1HHO A; 1LHT A; 1YFF B; 3PT7 A; 1CG5 A; 2MGA A; 3HC9 A; 1BBB B; 1LA6 A; 1YVQ B; 4PQB A; 2XKG A; 3A5G A; 3EOK A; 2OH9 A; 2QFN A; 4TWV A; 4F6F A; 1WMU A; 1X9F A; 1Y2Z B; 1A3O A; 3OZV A; 2AA1 A; 3EDB A; 2E2Y A; 1MLN A; 1LH7 A; 1RTE A; 1FDH A; 1A9W E; 2O58 X; 3UHD A; 2QLS B; 5EOH A; 1HDA B; 1UIW B; 3E55 A; 1X9F D; 1CBM A; 2EVP A; 1V75 A; 1G0A B; 3TM3 A; 4AVD A; 1O1J B; 1NS6 A; 2SPM A; 3UHS A; 1MNJ A; 1G0B A; 1CH9 A; 3QJD B; 1Y8K B; 4FH7 A; 3BJ3 A; 4G1B A; 3PI2 A; 1YE2 B; 2MGB A; 2W6V B; 3WCP A; 1GCV B; 1Y0D B; 1Y5F A; 2O5Q X; 3QQR A; 1XZV B; 4QAU A; 4MQJ A; 5JGG A; 4GZG A; 1D8U A; 2BWH A; 1XQ5 A; 1CH5 A; 3UHU A; 3PI1 A; 2O5O X; 1BUW B; 1NWN A; 1MWB A; 3UBV A; 1K0Y B; 2B7H A; 2D2N A; 1UT0 A; 2DC3 A; 3S1J A; 2OHB A; 3WCW C; 5SW7 B; 2BK9 A; 3FH9 B; 4ESA B; 2V1K A; 1ABW B; 2ZLV A; 5CNB A; 3G4V A; 2GRZ A; 1LFZ B; 2OH8 A; 1QPW A; 4ODC B; 1EWA A; 3WFT A; 4H2L A; 2W6X A; 2D2N D; 3LQD B; 1LH2 A; 2ZS1 B; 1NS9 A; 1O1L B; 1NEJ A; 2NRL A; 3WI8 A; 3KMF A; 1J3Z B; 1JF3 A; 5CHR A; 4H07 A; 1R1X B; 108M A; 1YEV A; 5CNC A; 4MQI B; 2H35 B; 3GQR B; 1DLW A; 1UX9 A; 1ECA A; 2HHE B; 2R80 B; 3NMM B; 2KSC A; 1SPG A; 1MLO A; 3LB4 A; 2OLP A; 106M A; 4FWZ A; 3DHR B; 1CMY B; 3W4U B; 1A01 B; 1CH4 A; 1G9V B; 1EBT A; 3NFE B; 2YRS B; 3OJ1 A; 4NXC A; 4ROL A; 1J7Y A; 3QM5 A; 5CN4 A; 3G4R A; 3UHV A; 2QU0 B; 3ONZ A; 1YGD B; 3PT8 B; 1Y22 B; 1XY0 A; 2O5S X; 1LH5 A; 3MKB B; 1JEB A; 1Y7C A; 3ZOL A; 3HHB A; 4O1T A; 1UVY A; 1DXT B; 1SPE A; 1VXA A; 4SDH A; 2LH6 A; 4N8T B; 1DWR A; 3ZJM A; 3A2G A; 1HGA A; 2M6Z A; 4OF9 A; 1Y7Z A; 1HBA A; 3WFW A; 3E4N A; 1Y0A A; 2AV0 A; 5KER A; 1SDL A; 5HAV A; 1J41 A; 1FCS A; 3ARJ A; 1KFR A; 3BOM B; 1CH7 A; 2LH1 A; 2RI4 A; 1MTK A; 3TM9 A; 5E6E B; 3VRG A; 1X3K A; 2EB8 A; 1Y7D B; 3DUT B; 1HBR B; 3D1K A; 1GBV B; 1Y4P B; 1LTW A; 4F6B A; 1RPS B; 1HGB A; 1A9W A; 1Y4B B; 1YHE A; 2Z6N A; 1LFQ A; 1DXV B; 3ODQ B; 1HBS B; 2V1H A; 3UHE A; 1NPF A; 3VHB A; 2VHB A; 2MYD A; 3CY5 B; 3DHT B; 3P5Q B; 5EU2 A; 4FH6 A; 1BJE A; 3MJP A; 3VRF B; 1OUU A; 1XZU B; 1A0Z A; 1G08 B; 1YIH A; 1HAC A; 1ABS A; 1HGC A; 3QM7 A; 2DN2 B; 3IXF A; 1S0H B; 3SZK A; 1CIK A; 1YHR B; 3BJ1 A; 3A0G B; 4MQK A; 1LFV A; 1FSX A; 3MYN A; 2IN4 A; 2ZFB B; 4HRR B; 1DKE A; 3WCV B; 4DWU A; 3CIU A; 4N7O B; 1MLM A; 5HU6 B; 3IC2 A; 5F2A A; 1HBH B; 1BZ1 A; 3KUO A; 1V4U B; 2ZS0 A; 4B4Y A; 2G0R A; 1C40 A; 3VAU A; 1YOI A; 1VXC A; 5AZQ A; 2HBF A; 2AV3 A; 1PMB A; 3ORD A; 1HDS B; 1MLG A; 1IDR A; 2GRF A; 1MBD A; 2QMB B; 2EVK A; 2MGE A; 3ZJO A; 1BIN A; 2ZS0 D; 4C44 A; 1Y7G A; 3AT5 B; 1NS6 B; 4KMV A; 2G0V A; 4HHB A; 1AJ9 B; 3OZW A; 2D2M A; 1OUT B; 2HBG A; 2XKI A; 2R4W A; 1JL6 A; 3OO5 B; 4F6I A; 1DO4 A; 3G4Y A; 1DO3 A; 1YEN A; 1GVH A; 3A5B A; 3WHM A; 1Y09 A; 2QSS B; 1EW6 A; 4MQJ B; 1DXC A; 1JDO A; 1GBU A; 1IBE A; 3EU1 A; 1YZI A; 1SI4 A; 3BA2 A; 3ZJH A; 5ILP A; 1MYT A; 1Y4Q A; 2VLY A; 1URV A; 2D2M D; 2H8F A; 1PBX B; 1QI8 B; 4MQH A; 1C7C A; 2AUQ A; 1XZ4 B; 4YU4 A; 3ECZ A; 3R5I A; 102M A; 1GCW B; 4PQC A; 3ZJL A; 1YIE B; 4AVE A; 1NQP A; 3WR1 A; 3RJ6 A; 4YU3 B; 1QPW B; 1KD2 A; 1Y45 A; 1QSI B; 1GDI A; 1XZ7 A; 3QM9 A; 2SPN A; 5CMV A; 5M3S A; 1ABY B; 1YEU B; 1IWH B; 1Y4G B; 1Y4V A; 1J7S B; 1LFY A; 1Y0W B; 3OO4 B; 3ZJJ A; 1J7W A; 3DR9 A; 2VEE A; 4HSW A; 2MGF A; 5E29 B; 1THB B; 4M4A A; 1YCB A; 3GK9 A; 3UHZ A; 1A3N A; 1MNO A; 3NG6 A; 1DTM A; 1Y46 B; 1VXF A; 1DWS A; 1O1O A; 3PIA B; 2IG3 A; 4O35 A; 1MTI A; 1A4F A; 1FAW A; 1VXG A; 1HAB A; 1S5Y B; 2BLI A; 4ROL B; 3WTG A; 1V9Q A; 4O4Z A; 3WCT C; 3FS4 B; 5ILE A; 1COH B; 3K8B A; 1RVW A; 3MJU B; 1V4X B; 3ONZ B; 2HCO B; 1Y0T A; 1OBM A; 3KUN A; 3WFX A; 2MGJ A; 3PI9 B; 5JDO F; 1YOG A; 1RQ3 B; 3QJB B; 1MBO A; 1VXD A; 5CN9 A; 1JZL A; 1ITH A; 4NI1 B; 2W6Y A; 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3A59 A; 1LFL B; 1Y31 B; 3R0G A; 1UC3 A; 2PEG B; 3GYS A; 1OJ6 A; 1A0U A; 3WCT D; 3UHY A; 3SDN A; 2HBC A; 1G09 B; 3AQ7 A; 3UHQ A; 3B75 B; 4ROM B; 1YEQ A; 2D2M B; 2PGH A; 4KJT A; 3LB3 A; 4MAX A; 1Y0C A; 1MLS A; 1IRD B; 5CNG A; 1EMY A; 1YVT B; 3S66 B; 1MYM A; 2GTL B; 2HHB A; 1V4W A; 4IRO B; 1Y8W A; 4MPM A; 3NL7 B; 4KN3 A; 5JDO C; 4HRT B; 1BIJ B; 1EBC A; 1JWN A; 2D5X B; 5MBA A; 4G51 A; 4NXA A; 4XS0 B; 112M A; 1YDZ B; 1J3Y A; 5CN8 A; 2MGD A; 1T1N A; 1NZ3 A; 1H1X A; 5CHQ A; 1YE0 A; 3ZOM A; 1DO1 A; 2EB9 A; 1M9P A; 1MOH A; 1Y83 A; 5C6E B; 1ASH A; 3MOU A; 1MLQ A; 1KD2 B; 1Y45 B; 3D17 A; 3MVC A; 5CN7 A; 3HYU A; 4L7Y A; 4LPI A; 1IT2 A; 3GDJ A; 3LB1 A; 1YG5 A; 1DXU B; 1GZX A; 1O1P A; 2BKM A; 5EE4 D; 1B86 B; 3PEL B; 4O2G A; 1YOH A; 2GLN A; 3GKT A; 1LUE A; 5KDQ B; 1BVC A; 3BJ2 B; 1QXE A; 1F65 A; 2ZT0 A; 2ZLX B; 3NG6 B; 3OGB A; 3G4U A; 2W72 B; 4HSX A; 2G0S A; 1FHJ A; 1CP5 A; 1JP8 A; 1HAB B; 1AJG A; 3WTG B; 5HBI A; 3ZHW A; 1BZ6 A; 2H8D A; 2HBD A; 1O1I A; 1J40 B; 1DWT A; 3K8B B; 1LFT B; 2ZFO A; 1RQA A; 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