3PJJA

Synthetic dimer of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGCAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLESVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title One Interface Stabilizes Linear Chains in All Polymorphs of Crystals of Human Carbonic Anhydrase II
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 69
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3pjjA00
3M1JA 3RYYA 3DBUA 4Q83A 3SBHA 5BRWA 1H9NA 3M96A 4Q09A 4Z1NA 4E49A 1FR7A 4BCWA 1CNIA 4HEYA 2WD3A 4Q0LA 3RZ1B 1HCBA 3S73B 1HEBA 1BV3A 3OIKA 4FPTA 3DD8A 1DCAA 3MNIA 3M04A 3U45X 4ZWYA 4LHIA 1FSRA 5FDIA 3V7XA 3IBIA 1TH9A 3M5SA 3V2MA 5FLSA 3MHIA 3NB5A 2POWA 4QSIA 4Q8YA 2EU2A 4MLXA 5JG5B 3KONA 3CYUA 1G1DA 4QJPA 4FIKA 4E9OX 5G0CA 2CBBA 3P3JA 4MDMA 5DSKA 1F2WA 3MHLA 4YWPA 3VBDA 3MDZA 1UGEA 3P44A 1G46A 2NNSA 3U7CA 5DSJA 1G0FA 5FNKA 2VVBX 2OSMA 3BETA 3MNUA 4RFDA 1CNCA 5SZ6A 4E3GA 3MHOA 1G48A 3HKUA 4YYTA 2QOAA 4E3FA 1AZMA 2WEHA 1CILA 4M2VA 4QSJA 3B4FA 3RJ7A 2FMZA 5DSLA 1JD0A 3S74B 4DZ7A 12CAA 3M5EA 5EIJA 2NNVA 5IPZA 3DD0A 1HVAA 4N0XB 2CBEA 3ML5A 1I8ZA 2NNGA 4XZ5A 5FL5A 4Q8ZA 4YXUA 3D92A 5E2MA 1BN3A 3KNEA 1CNJA 4IDRX 1MOOA 4KNIA 4HF3A 4L5UA 3MZCA 5EHEA 1AM6A 3DA2A 3DV7A 5E2NA 3V3HB 2FNNA 3S97A 1RZDA 1YO2A 4QK2A 4YGNA 1ZNCA 4DZ9A 3DVDA 4K0SA 3HLJA 4UOVA 1IF7A 2NN7A 4JSZA 1TG3A 5FLOA 4Q81A 1EOUA 1TB0X 3SBIA 1CNYA 1LUGA 4FU5A 4K0TA 1CVDA 4Q9YA 5G0BA 5CJFA 4CNRA 4QK1A 5FLQA 1CANA 4C3TA 3N2PA 3DCCA 2O4ZA 1T9NA 1UGCA 2CA2A 5DOHA 3S76A 5DOGA 3M2XA 3M98A 3HKTA 3OKUA 1H4NA 1OKLA 1BZMA 5BNLA 2IT4A 1BN4A 3DAZA 1CAJA 3F7UA 3S9TA 2H15A 2ZNCA 4FVNA 4RIVA 2GEHA 5FLRA 3S71B 5BRUA 4IWZA 1KWRA 1BN1A 4E3DA 4YVYA 3HS4A 2FNMA 1ZE8A 1V9IC 1YO1A 1I9QA 1HEDA 4Q7PA 5JQTA 4HEZA 3DCSA 2NWPA 4PZHA 3D0NA 3V5GA 1I90A 4X5SA 3V3FA 4PYYA 2HNCA 5A25A 1Z93A 1FSNA 1CVEA 3PO6A 3RYZA 4CNXA 1BNQA 1IF9A 4Q99A 2NN1A 3T84A 2QP6A 2ABEA 5L6KA 4ETQC 4BF1A 3V3GB 5C8IA 3S8XA 4E4AA 1YDDA 3F8EA 4LU3A 2NWOA 3OILA 2POVA 2WEJA 3RYXB 3KKXA 4GL1X 3IAIA 3M3XA 1G3ZA 4XE1A 1LGDA 5DSQA 1UGDA 2ILIA 4FRCA 4Q8XA 3K2FA 3L14A 1TE3X 4KP8A 1BNUA 4M2RA 5DSNA 5JEHB 3Q31A 3ML2A 3M1WA 2FW4A 1RAYA 4YXIA 1HECA 4HEWA 1BNWA 4RUXA 1I9LA 1OKMA 4QSAA 4QJXA 5LMDA 3OIMA 3T83A 4Q7WA 3JXHC 4XFWA 4KNJA 2FOVA 5FLPA 1RZEA 2W2JA 1Z9YA 3F4XA 4Q7VA 4G7AA 2X7SA 2NWZA 1CRAA 3KWAA 7CA2A 4QTLA 4CACA 1G0EA 4YXOA 5EH7A 1YO0A 5EKJA 4G0CA 5EZTX 1I9PA 1ZGEA 5E28A 4E5QA 2WEOA 4RUZA 3UYNA 4JSAA 1LZVA 1XEVA 3W6IA 4HT0A 4Q08A 3K7KA 4RN4A 5SZ7A 4M2UA 3M2ZA 4CNVA 3DVCA 3IBUA 4BF6A 1HCAA 3HKNA 4KUWA 4HU1A 5JGTB 5JQ0A 1FQLA 2NWYA 1TTMA 3P5LA 2NXTA 3S77B 3ZP9A 1IF8A 4QJMA 4PXXA 1Z97A 3M67A 4ITOA 3RLDA 3MNHA 5SZ2A 3IGPA 4L5VA 1XEGA 3RG4A 4XIXA 3N0NA 3TVNX 4ZWXA 1CVBA 4MDLA 3U47A 1FQNA 5AMLA 5FNLA 4LP6A 3P58A 1KEQA 1FLJA 5JDVB 3SAXA 3S72B 1G6VA 2WD2A 3MWOA 1CA3A 3RG3A 1BNTA 3MNKA 5E5UA 2F14A 2HOCA 3MHMA 4HBAA 4KUVA 3ZNCA 2AX2A 1CNXA 1CZMA 5JESB 3CA2A 4M2WA 2EU3A 3RZ7A 1I9NA 4RFCA 2CABA 5G03A 4Z1KA 1JCZA 2FNKA 3MHCA 8CA2A 1KWQA 5SZ1A 5CACA 2NXRA 4ITPA 3C7PA 3S78B 1Y7WA 4ZWIA 3QYKA 4KUYA 3OY0A 5EHVA 1TBTX 2GD8A 1G4OA 2CBCA 4Q78A 4MDGA 1RJ6A 4MLTA 4Q07A 5EKMA 3S75B 5SZ5A 3D93A 4YHAA 5JGSB 1CVHA 1V9EA 3RZ0B 4Q87A 1CVFA 3JXFA 2HD6A 4YGLA 3T82A 5FLTA 5AMDA 4PQ7A 3LXEA 2HFWA 1J9WA 4Y0JA 2NXSA 3RZ5A 1YDCA 2X7TA 3D8WA 5E5RA 4E3HA 3PJJA 4FL7A 4L5WA 2VVAX 2CBDA 1ZGFA 3IBNA 4COQA 4CQ0A 4R59A 1UGFA 3IEOA 1I9MA 1BNVA 5BYIA 1FQMA 3P4VA 5DSRA 3K34A 4K0ZA 3SAPA 1UGAA 2HL4A 4PYXA 1MUAA 1H9QA 1CALA 3FFPX 1IF5A 4MTYA 4WW6A 3P55A 5DSIA 4Q06A 3NJ9A 4WUQA 3EFIA 3W6HA 1XQ0A 1RJ5A 3KOIA 5JG3B 3M1QA 4KV0A 4RH2A 4QIZA 3T5UA 4ZWZA 4KNNA 3M2NA 2Q38A 3M5TA 5SZ4A 1CCSA 5L3OA 1ZFKA 1AVNA 1FSQA 2AW1A 3RGEA 3KOKA 2FOUA 1CAOA 3RZ8A 9CA2A 5FDCA 3M14A 1XPZA 1RAZA 5G01A 3FW3A 3TMJA 2FOYA 2POUA 3B1BA 2CBAA 3F7BA 1G52A 3V3IB 1LG6A 2FOQA 4Q90A 4TWLA 2X7UA 1IF6A 1DMYA 1ZSAA 4N16A 5FNIA 5E2RA 5EHWA 3P5AA 1HUHA 5JEPB 3DVBA 1HUGA 1CVAA 3T85A 3M40A 2FMGA 1BNMA 4JS6A 5A6HA 1TEQX 1CA2A 1CNBA 5FNMA 1ZSCA 3HKQA 4Q7SA 1CAKA 4Q6DA 3U3AX 4KNMA 1KOQA 1CCTA 1CINA 4WL4A 3UYQA 5HPJA 4JSSA 1BICA 4KP5A 2QO8A 4CA2A 2NNOA 1FR4A 2HKKA 4Q49A 5FL6A 1I91A 5DVXA 4MO8A 4TWMA 5FNHA 3V3JA 3OKVA 1RZCA 4WW8A 4XIWA 3BL1A 5DSOA 3M1KA 4R5AA 5SZ0A 4HT2A 5J8ZA 3DCWA 1CIMA 3KLDB 1G53A 3OYQA 1DMXA 4JSWA 4QIYA 1CNGA 1TEUX 4QJ0A 3DC3A 3R16A 3EFTA 5DSPA 5JEGB 3JXGA 1OKNA 3V2JA 5E2SA 4ZX0A 1CAIA 3CAJA 4K1QA 3RYJB 4RUYA 3FE4A 1CAYA 1LG5A 1FQRA 3BL0A 1RZBA 5BRVA 3MNJA 4YX4A 3N4BA 4QSBA 5DSMA 1RZAA 1THKA 3N3JA 3P3HA 1G4JA 1CAZA 4QEFA 3GZ0A 5EKHA 1YDAA 1G54A 4K13A 5SZ3A 3T5ZA 4YGJA 3DC9A 1UGGA 3R17B 1CCUA 2FOSA 4Q6EA 3RYVB 4YGFA 1DCBA 1URTA 4WR7A 3NI5A 4YGKA 4R5BA 2H4NA 4QJWA 1G45A 4Z0QA 1CRMA 4ZX1A 1BCDA 1TG9A 1ZH9A 4CNWA 3TVOX 5EOIA 3OYSA 2EZ7A 4ZAOA 3MMFA 1ZSBA 3MYQA 1CNHA 4Z1EA 1BNNA 2Q1BA 3CZVA 1A42A 1IF4A 3MNAA 4FVOA 1OQ5A 5FNGA 4QK3A 2NMXA 5CLUA 4Z1JA 5FL4A 5EH8A 3KIGA 3KS3A 5DRSA 5CA2A 1HEAA 1YDBA 4ILXA 4RIUA 1KOPA 1CAMA 3IBLA 1CVCA 5EH5A 1UGBA 1ZFQA 3HFPA 4QJOA 1JV0A 2WEGA 6CA2A 1I9OA 5AMGA 1CNWA 5E2KA 2Q1QA 4KAPA 3PYKA 4QY3A 4WUPA 5FNJA 3M2YA 1CNKA 2OSFA 1CAHA 3D9ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3M1J A;  3RYY A;  3DBU A;  4Q83 A;  3SBH A;  5BRW A;  1H9N A;  3M96 A;  4Q09 A;  4Z1N A;  4E49 A;  1FR7 A;  4BCW A;  1CNI A;  4HEY A;  2WD3 A;  4Q0L A;  3RZ1 B;  1HCB A;  3S73 B;  1HEB A;  1BV3 A;  3OIK A;  4FPT A;  3DD8 A;  1DCA A;  3MNI A;  3M04 A;  3U45 X;  4ZWY A;  4LHI A;  1FSR A;  5FDI A;  3V7X A;  3IBI A;  1TH9 A;  3M5S A;  3V2M A;  5FLS A;  3MHI A;  3NB5 A;  2POW A;  4QSI A;  4Q8Y A;  2EU2 A;  4MLX A;  5JG5 B;  3KON A;  3CYU A;  1G1D A;  4QJP A;  4FIK A;  4E9O X;  5G0C A;  2CBB A;  3P3J A;  4MDM A;  5DSK A;  1F2W A;  3MHL A;  4YWP A;  3VBD A;  3MDZ A;  1UGE A;  3P44 A;  1G46 A;  2NNS A;  3U7C A;  5DSJ A;  1G0F A;  5FNK A;  2VVB X;  2OSM A;  3BET A;  3MNU A;  4RFD A;  1CNC A;  5SZ6 A;  4E3G A;  3MHO A;  1G48 A;  3HKU A;  4YYT A;  2QOA A;  4E3F A;  1AZM A;  2WEH A;  1CIL A;  4M2V A;  4QSJ A;  3B4F A;  3RJ7 A;  2FMZ A;  5DSL A;  1JD0 A;  3S74 B;  4DZ7 A;  12CA A;  3M5E A;  5EIJ A;  2NNV A;  5IPZ A;  3DD0 A;  1HVA A;  4N0X B;  2CBE A;  3ML5 A;  1I8Z A;  2NNG A;  4XZ5 A;  5FL5 A;  4Q8Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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