3PM6A

Crystal structure of a putative fructose-1,6-biphosphate aldolase from coccidioides immitis solved by combined sad mr
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
293
structure length
287
Chain Sequence
LKSNRALPLLTFARTHSFAIPAICVYNLEGILAIIRAAEHKRSPAMILLFPWAIQYADSLLVRTAASACRAASVPITLHLDHAQDPEIIKRAADLSPGFDSIMVDMSHFSKEENLRLTRELVAYCNARGIATEAEPGRIEGGEDGVQDTVDLEGVLTTPEESEEFVATGINWLAPAFGNVHGNYGPRGVQLDYERLQRINEAVGERVGLVLHGADPFTKEIFEKCIERGVAKVNVNRAVNNEYVKVMREKAGSLPITRLHEEVTNAMQAAVEKIMDMIDSTGKAEFM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Putative fructose-bisphosphate aldolase
publication title SAD phasing using iodide ions in a high-throughput structural genomics environment.
pubmed doi rcsb
source organism Coccidioides immitis
total genus 114
structure length 287
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3pm6A00
3W1PA 5CZTA 3VFLA 2O7QA 2O7SA 1MEIA 3N2XA 1XBVA 3BW4A 4K36A 3BG3A 4LNYA 1H5YA 1ME8A 3H54A 1OFOA 3BVJA 2QCMA 5C6MA 3S1XA 2JBMA 3W7KA 5AB3A 3HJZA 1W1ZA 4HKPA 4JY8A 4Z1CA 3W7EA 4RV8A 1GTEA 1PCWA 1ZFJA 2X1RA 2FDSA 3NGJA 4LC6A 1SZGA 2UV8G 2A7NA 2B7NA 4OV9A 4DELA 3NQEA 2QCDA 3OHIA 3KRUA 4UIOA 3B0UX 2ZRUA 3DU0A 3IIOA 3VNDA 4ADUA 4JTEA 2AQWA 3EKZA 1EUNA 3S1UA 4MOZA 1VYPX 1XDMA 1LDCA 5C5YA 4AH7A 2WNZA 2ZA2A 3F1QA 4O1BA 3TX9A 1FCQA 3Q2DA 5EKYA 3RU6A 4XWUA 5LNUA 2C15A 4JIPA 3G1XA 3W87A 1TPDA 1PVNA 3KVMA 5HJLA 1MZHA 4H4IA 3MP4A 4CQ8A 2G96A 5I3GA 1OFRA 1YDVA 2FTPA 3PB0A 1H50A 2FPVA 3RK8A 1XKYA 3UXAA 3LHVA 4Y90A 4GFSA 2C13A 5ABTA 1LP6A 4LWWA 5D2XA 5LNVA 1XDLA 1YTEA 5CGQA 4JXCA 4FXRA 2E5DA 1H7WA 4FIRA 3STGA 1UB3A 2JKAA 3SGZA 2C18A 3SECA 3W1NA 2E6FA 1SZNA 5D2WA 1W5QA 5F1VA 1U83A 2GOUA 3E49A 3FJLA 4YLWA 4RXGA 4M7SA 2EKCA 1ZAHA 2C6QA 4O13A 4UFKA 4JTKA 1V7YA 1VHNA 3IIXA 3S8HA 5DCEA 3W7NA 3EX6A 2PRMA 3LV6A 2V82A 1IIGA 4JR5A 4EF8A 2E6YA 3B0VC 2QCCA 3TMQA 3L5AA 1TJPA 3F03K 2AGKA 5AOUA 5G2WA 1F76A 4XBSA 5G4WA 2FB3A 3NQ7A 4M19A 2V2DA 2FFCA 4I9AA 4MJMA 4TO8A 3TJLA 3R2GA 3B03A 1DJNA 1Q6LA 3W1UA 1TPUA 2FLIA 2B4GA 3NG3A 3M0ZA 3LB0A 1TJRA 3E02A 1XBXA 2Y7GA 3M5VA 4ZZ9A 5EY5A 3BARA 1VH7A 1H7XA 2ZRVA 3IVUA 5A5WA 5T26A 1KTCA 1K8XA 1W31A 4JYFA 4KWWA 2GVGA 3USBA 2YYUA 1F74A 1YADA 4MPQA 4IOTA 3VI2A 1L2UA 3OBKA 4HPXA 3UWQA 3UWYA 4UTMA 2EF9A 4EOUA 2CLFA 2GVJA 5HMSA 2YW3A 5DN1A 4K6AA 2QUVA 2Y85A 1QPRA 3LBCA 3NL5A 3I7RA 1O95A 5L9FA 4UNLA 4DO6A 3UWWA 1X8FA 2V0TA 2DJLA 1BWLA 3TAKA 5K7JA 2ZCGA 3R8RA 3I7QA 3NA8A 4IPJA 3EWZA 1ICQA 4N9CA 3W1RA 1WQ5A 3GLCA 3TAOA 5CSRA 4JDYA 3NQVA 1SO3A 1B9BA 1WXJA 3QW3A 1A5BA 1OK6A 2J88A 4K8EA 3EWWA 4R53A 3IVTA 2YPIA 4ORMA 4MUZA 2CLIA 2Q8LA 2C3ZA 4AAJA 3TROA 1JCLA 1RQEA 3P8JA 2GQ9A 1PHWA 2H8XA 4XUGA 2G97A 1N55A 4NNAA 3O16A 3G1HA 4GUHA 3GAYA 3WK0A 2I9EA 1TIMA 1F5ZA 5G1TA 3NR0A 1E51A 3RNDA 1U5JA 5LNRA 3W7PA 1X6UA 4DEFA 1SW3A 4PH6A 3W7LA 3BG9A 3PUDA 2RDTA 3JRKA 5AHMA 1VZWA 5AC6A 2C19A 1QO5A 3KVLA 4KFOA 3W1MA 1ADOA 4ZMGA 3DBPA 4AHPA 3U2OA 4O12A 1Z44A 2QAFA 1RQHA 4LY8A 1L6YA 5CKSA 2A6NA 2ALDA 3GDTA 1CX9A 3ANYA 1H1YA 3PUOA 4FNSA 5E1QA 1KTBA 1Q6OA 2XN2A 2CZDA 4YCOA 3JS3A 3LHZA 3L66A 4FNRA 3MI2A 3FEMA 2V81A 3NZ1A 4ADTA 2ABBA 2J9YA 4E0CA 1S5TA 2TSYA 2JKPA 2CLMA 1PCKA 1GVQA 3G3DA 3PWAA 4UTTA 3YPIA 3PM6A 3T44A 3QPYA 5CZSA 5DBUA 4A3UA 4ZVJA 3LTSA 1KTNA 2ZZ4A 3BO9A 4GUIA 3M7WA 1PL9A 3BK0A 3NQGA 3CM4A 1IIHA 3S5YA 5I3JA 4JX5A 3S1VA 5BRBA 1DKWA 1OJXA 4O0KA 2I14A 3IGUA 1LLZA 3N34A 5D04C 3TU9A 4CLMA 1OFAA 4A21A 4ZQCA 4N2YA 1EA0A 5CZ0A 1JRBA 1OK4A 1R47A 1L6SA 4UTWA 5AFDA 2QR6A 4O16A 1PIIA 1JCNA 2WPBA 3PG8A 3L2IA 4MFDA 1D3GA 4N9DA 1R2TA 1A53A 4FNUA 4AWTA 4MLRA 3CTLA 3EXSA 4MZ1A 3H55A 5K3VA 1RV8A 2VFIA 4FIQA 4ZL1A 4MIMA 4I7WA 1G4EA 2Q3RA 1DBTA 2ZZ2A 3ELFA 4O8RA 2Y7FA 6ALDA 5E0KA 3C2VA 3C2RA 3C52A 1K8YA 2QUTA 3INPA 1I45A 5LSMA 3MMTA 1IXPA 1KA9F 3KAOA 2A21A 5LHEA 3SR7A 4GBUA 3EXTA 5F2IA 2DZTA 3W76A 1GG0A 1K02A 4ZQRA 1KLYA 2QCDB 1YTKA 3TR2A 1UASA 4IUOA 1I4NA 4X9SA 3NPWA 1TTPA 4JTFA 1VYRA 4MVAA 1G7VA 3L0NA 4DXVA 3DHDA 3QEZA 4LVFA 1B4EA 1FX6A 1P4CA 4JD4A 4A29A 3MP5A 1C29A 2NV2A 1KFLA 5KMYA 3NM1A 1YPFA 1BWKA 1W5MA 3T40A 3K30A 3DI1A 1H1ZA 2VFDA 3DHFA 1EP1A 5D30A 2Y61A 4E38A 4XKYA 1H63A 4Y96A 4LOCA 1C8VA 3W2KA 3TIMA 1GTHA 1R2RA 2QAPA 3W6YA 3GXTA 1AL7A 5H2ZA 1DOSA 3P67A 2QCGA 1RPXA 4WQ6A 3EX3A 1QDSA 1VCGA 4EVZA 3W7MA 1DJQA 3FKRA 2NWRA 1H61A 3DFTA 4HHPA 2WNQA 3DFNA 4O52A 1TPFA 1TPB1 1DVJA 1MEHA 2ZZ1A 2P1FA 1T99A 3Q37A 3VCRA 4GUGA 4CCCA 1FXPA 4P61A 4LS0A 2VFGA 2A7PA 4UFLA 3C56A 4K7VA 3MBFA 5SWUA 1LRNA 3P80A 3G24A 1DHPA 3SY5A 2Y70A 2PE4A 2OCZA 4PA8A 3LI0A 5KZDA 1N7KA 5H91A 3EX2A 1KFEA 3W7RA 2RHGA 2XFWA 1C9DA 2CLKA 4AWUA 2RDWA 3QW4B 1T96A 4JX6A 1G4TA 4ZQPA 3CQ0A 4UTJA 4IX2A 4UFJA 2ZDRA 4LVBA 2ZZ5A 4JTIA 5EMUA 3TV8A 3P81A 3GNNA 3CWNA 3W1AA 3W23A 2QCEA 1O5KA 5G2IA 4FEZA 4UTHA 2D73A 3LHUA 3SIZA 4MYXA 1FWSA 5BMWA 1TPWA 5HWMA 2QJHA 1X7FA 3GIYA 4OBTA 5D2TA 4U4MA 4NXSA 4D2JA 5D09A 1KFCA 2ABAA 4IMEA 4O1CA 2B7OA 4ADSA 4W9TA 4AB4A 3E9AA 3QSTA 3C61A 1FBAA 2TYSA 4XTIA 3S6DA 5IM51 4DF2A 1W37A 3BW2A 3FYPA 1O60A 2XN0A 1G67A 4O15A 1ZHAA 1H51A 3L0KA 2X1UA 1TCDA 4WUIA 4N4QA 1CW2A 1GWJA 2EGZA 1BEUA 1W5PA 2PRLA 1PHQA 4JIQA 3PSWA 4JYDA 3KVKA 3BPWA 4KKXA 1XM3A 4JYEA 1KV8A 1W5NA 1O94A 3HO8A 3GDRA 1RD5A 3PUEA 1KM5A 4UTKA 5CPMA 4A2RA 5D02A 2VC6A 3KOFA 2ZTKA 4JTTA 1TTQA 4MY9A 1GZGA 2CFFA 2DZPA 3WJSA 1OYBA 4HNUA 3IV3A 3N9RA 1J2WA 4NX0A 4JTGA 4JTHA 5BOOA 1OFQA 3TSDA 3GDKA 1TPVA 1QMLA 1AW2A 2WSQA 3VE7A 2QEZA 4N6FA 2QCFA 2NUXA 2RH9A 2WKJA 5I3KA 3O6YX 4QNWA 2VFHA 4MY8A 1KFJA 4DBDA 1SR9A 3ZFHA 3BGJA 2C1HA 4UMAA 1V5XA 3RFAA 5D38A 1HL2A 3B04A 2VEIA 5IBXA 1ICPA 1HO4A 1TSIA 1NAL1 3T7VA 4HNVA 1A5AA 4JY9A 2YSWA 4OV4A 4DPPA 3TC6A 1AK5A 3S5NA 2TMDA 5TIMA 3G0UA 1DQXA 1QPOA 2A85A 2HMCA 4BWLC 2ATMA 1YXYA 3B4UA 3G18A 1HG3A 3L65A 3F4NA 3TMLA 4E2BA 3CWOX 1FWRA 4PEKA 3KHJA 3FKKA 5KTLA 4Z0JA 3TFCA 1Z48A 2GJLA 4TMCA 1ZAIA 3LM7A 3MYOA 2BTMA 1N8FA 3W1XA 5HINA 3CPRA 1IXOA 3BGGA 1OX4B 1LM1A 2CLEA 1ME7A 4O17A 3G1VA 3GR8A 3P7YA 4J9JA 2DORA 4RZ5A 2V5LA 5J5DA 1GVFA 1H7RA 3W84A 3NL2A 3GDLA 3HG5A 1ZNNA 3QJAA 4BF9A 2ISVA 4IMDA 1DL3A 1SFLA 4NJGA 1T8XA 1EPXA 3UWVA 3HPSA 2HS6A 1L6WA 2JK2A 2P10A 4BK9A 2VENA 3IRDA 4OU1A 5C55A 2VFFA 2QJGA 1NEYA 3TDFA 3PR2A 3HPXA 1XI3A 3MO7A 4DO5A 4RXFA 3IEBA 3W2UA 2Z6IA 1P5BA 5DCBA 4FNPA 3NNTA 5LNSA 2DZVA 1VLIA 2FJKA 4QISA 1GT8A 3MUXA 1K03A 4O18A 1F2JA 3MW7A 5DCDA 2V2HA 4LVAA 3BLIA 4HPJA 5D32A 1WX0A 3A21A 4Y9AA 1A5CA 3I6RA 4LTSA 2Q3OA 3MHGA 3PULA 3LTYA 3CEPA 1OG0A 5HWJA 2NX1A 3R89A 5AC8A 2G5WA 4PTNA 4U28A 3P60A 4N9BA 1QFEA 4HNNA 5G4EA 2NUYA 4FF7A 3NVTA 1FXQA 4ICNA 2QKFA 3A22A 2A7RA 3Q58A 1H7OA 2ZRWA 1JR1A 1I2RA 2A0NA 5FF0A 4FNTA 2R8WA 3TUUA 4BWLA 3TQKA 1KFKA 1X1ZA 3H53A 1XFBA 2B7QA 3L67A 4EF9A 2V2CA 4RLIA 1AG1O 3R5EA 3FIGA 1OFPA 2VEMA 5K2ZA 2WSRA 2QUUA 1TPEA 2ZRYA 3RF9A 2Y7EA 1KBJA 2FB2A 2PCQA 2VFEA 4LV9A 4UTLA 4TU1A 2YW4A 4JTJA 1G6CA 4YL2A 1EP3A 3L5MA 1JJKA 4Z1AA 3DENA 1OX6A 2WV8A 2YFOA 4MJZA 2DZUA 1LBLA 4AHOA 4MZYA 3OIXA 5F4XA 4WX2A 3W07A 3PC0A 4O1AA 3LI1A 4XKYB 2OZ0A 3STCA 5FESA 3AJXA 5K4ZA 2EHHA 2W6RA 4GUJA 2DZXA 1GJPA 3NQFA 1SFJA 4C1KA 1CI1A 5EL1A 3LLFA 1W8SA 5MHBA 1YXCA 2NWSA 4LW7A 3TA6A 3QQ1A 5J5RA 3ABRA 4JN6A 2A1YA 1S5VA 3CLMA 3W7OA 3UQNA 4NJHA 5BNKA 3W74A 2WNNA 5KITA 3TH6A 1JUEA 2Z0IA 3W7HA 1A5SA 4FNQA 2CLHA 3QZEA 2X16A 4R7JA 2NX3A 1QNVA 3QPZA 4WY0A 3HMJG 1VHCA 3P5ZA 1SQ7A 3THAA 1R2SA 3FJ6A 3PBUA 2DJXA 4UTUA 3VKJA 3WJZA 4A2SA 3CEUA 1OF6A 1UBSA 3G1FA 1KFBA 1T0OA 1J4EA 4OE7A 4YWIA 3QFEA 4BI6A 2X30A 1XBYA 4S2CA 3UY7A 5HR6A 4S1FA 3STFA 4QSHA 4KFNA 1AW5A 3EXRA 4I7UA 4RJEA 3UNDA 1QOQA 5KINA 1RZMA 2R91A 2W0UA 2C16A 1WBJA 4LRSA 3U6WA 3NDOA 1I2OA 6TIMA 1SZFA 4TIMA 1QPQA 5G2HA 1NVMA 3OG3A 1GOXA 2CLLA 3WFAA 1XC4A 1H7PA 3LRLA 1YDOA 3FFSA 3LV5A 1FCBA 1WBHA 3LCIA 4AWSA 4JICA 2H3DA 1ZCOA 2GQAA 2QCNA 1TV5A 3B8DA 4MZ8A 5AHIA 2QJIA 2RFGA 3TW7A 3GR7A 3G0XA 4FHAA 4B5NA 3W2JA 4JNMA 3EB2A 4GE8A 4PCFA 4XTDA 3PAJA 4RR4A 1JVNA 2EPHA 3LXBA 2IQTA 3W2MA 3W71A 1TB3A 5C2XA 1OFBA 2YZRA 1UCWA 4Y8FA 5D2YA 4NXKA 4BI7A 1EP2A 1F6KA 2GUUA 3NO5A 1K3UA 1WDWA 5CSSA 1S3HA 3G8RA 3N19B 3HGRA 3S5ZA 2DZWA 5TBOA 1YTDA 3TXVA 4O57A 2ZA1A 1TPH1 4DO4A 3QC3A 4K38A 3OVQA 4O4VA 4UCGA 5C54A 1VJIA 3W1LA 1TMHA 1G4PA 1SU5A 4ALDA 1HUVA 4Q32A 1MO0A 3NYZA 3LOTA 2R94A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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