3PMEA

Crystal structure of the receptor binding domain of botulinum neurotoxin c/d mosaic serotype
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
417
structure length
415
Chain Sequence
INDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRLEGDVQVNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILYSAIYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIKQNSGWKLCIRNGNIEWILQDINRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSERIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYMINYNYIDRYIAPKNNILVLVQYSDISKLYTKNPITIKSAANKNPYSRILNGDDIMFHMLYDSREYMIIRDTDTIYATQGGQCSKNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSQYCSQIFSSFMKNTMLLADIYKPWRFSFENAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVEHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
molecule keywords Type C neurotoxin
publication title Crystal structure of the receptor binding domain of the botulinum C-D mosaic neurotoxin reveals potential roles of lysines 1118 and 1136 in membrane interactions.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 110
structure length 415
sequence length 417
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3pmeA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3pmeA02
3I4IA 4A7KA 1SFYA 3WVJA 1JT4A 3WUCA 2L5XA 1ISXA 3N7JA 2GO2A 1V00A 2ZQOA 1W3AA 3O12A 3ZXJA 3C9ZA 2MC2A 1C4RA 1IRPA 3BX1C 2P34A 2A6VA 3JRRA 2ZGMA 3AYEA 4GOYA 2UURA 4DPNA 1BFCA 5D62A 3AZZA 3HN1A 3H0OA 3UJ0A 1M16A 1WD3A 3IN9A 3B9CA 1SLIA 5AVAA 1R1ZA 3WCSA 5HPZA 4I6IA 3TB0A 4XXPA 1W0OA 2Y9WC 2DUQA 2D7RA 2ZGLA 1K5UA 1XYFA 2UWAA 1MACA 2VUAA 3OBRA 2D3PA 2YV8A 3WO3A 5BOWA 2D22A 2A5ZA 3V65A 4EFRA 3FGMA 1EPWA 1HQLA 1LHOA 4WVWA 2F2FA 4JKXB 3UJOA 1WW5A 5IT6A 1DQ0A 4GP0A 1QDOA 2VW0A 2PHUA 1ULCA 1DQOA 4Y20B 3UDAA 3V0AA 2AGSA 1YRZA 2P3KA 5BVPI 4DFSA 1M2TB 5JDBA 3AKHA 2DV9A 4OWLA 4WBCA 1V6KA 1YXWA 5BQUC 1BQPA 1WLWA 4ZOTA 1MR5A 1AXYA 1QOTA 3ZC8A 2HZ9A 4LO0C 3OYWB 1JT7A 4G6MA 2AUYA 3D6EA 1CQ9A 4P6AA 1QXMA 3BODA 2Y9GA 1ILR1 1LOAA 5T5PA 4GKXA 4HANA 5FREA 3CRHA 3ZSKA 2PHTA 2AQZA 2R0HA 4HL0A 2YXSA 2P37A 3CA6A 3NV2A 3D4KA 4I8MA 1T9FA 1AZDA 1LGCA 1IOAA 3PMEA 2WBCA 1W0PA 3CNAA 3N0KA 4AN6A 3BB2A 4YW1A 1FN0A 1IILA 2K4AB 4LBNA 2AR6A 4FPOB 1RMLA 4X39A 1NZKA 4WV8A 2VH9A 1A78A 2R0FA 4EB2B 1SZ6B 5EG6C 5G00A 1CPMA 1AVXB 1FMZA 3VT2A 3RTJB 4PCRA 4DRVA 1EYLA 1GNHA 4XOGA 3UD9A 4WVVA 4YW4A 1HWNB 3PVOA 4AVTA 4ZLBB 3N7MA 2NN8A 2ZGUA 3LSDA 5L73A 1QU0A 4Y1ZA 2KKIA 1LESA 4LBQB 4GKYA 5DZEA 4XIOA 5SV8A 2GNTA 4LBOA 3V0BB 2TEPA 2YUGA 4I3NA 1VIWB 1S0EA 3IPVA 3RG0A 4NOTA 1MS5A 2DRZA 3R4UA 4LBQD 2E51A 9ILBA 6I1BA 5GM0A 2P39A 3ATGA 2J3PA 2EXJA 2AAIB 2B7YA 3F1RA 1CIWA 1Y7BA 2D6MA 3IM5A 1J0SA 1N1YA 2R16A 4JAWA 3GALA 4IY8A 4FQ4A 1J1TA 2W52A 3POKA 1KDKA 1BLDA 4QALA 1PZZA 2DVGA 3B00A 4EFPA 1HKNA 5GLWA 1MS0A 1QMJA 1VALA 2UU8A 1GZWA 1IOBA 4JC1A 1DYPA 2JKBA 3O5WB 1JOJA 3VUOA 3HBWA 4DENA 3AJYA 1G9AA 2ES3A 4AGGA 1W3GA 2Y9XE 1N3PA 4U2AA 1TEIA 1YF8B 2GZBA 1KQRA 1G9FA 1AJKA 4IYBA 4A7YA 1ABRB 1JT3A 1GICA 4P0LA 4I4PA 5T5JA 3WV6A 4P9WA 3CA1A 4BOWA 4JQ0A 5BXTA 1CN1A 2AYHA 4I4SA 1W6NA 5FZYA 2CL2A 3PVNA 3NV4A 1GV9A 4ATFA 2YMZA 3ZSLA 1DBNA 5T52A 4XBLA 2DTYA 5HCFA 3UJQA 1X50A 3FJJA 4QBVA 2A71A 1S0DA 3BTAA 4AN7B 4LO1A 1IJTA 1BA7A 2LTNA 4J2XA 3UJ4A 2WKKA 1QOSA 4QC4A 4Q9PA 1FGAA 3VT1A 3B69A 1QNWA 2YY1A 3IM0A 1SBDA 1LGBA 4C1XA 4Q9GA 2FHRA 4ZFUB 2ZMNA 4YGBA 4YFWA 3BAGA 4GWNA 2V73A 3QCWA 4D69A 4XJZA 1AVUA 1BKZA 3H6SE 4JKQA 2ZGQA 1L2HA 3WOGA 5GAQA 4WZFA 3IKWA 3ZYPA 3FJDA 2ZA9A 4LBLA 3BAHA 4M3CA 1DLLA 4XFTA 5FZZA 3ZVXA 2I1BA 3VKMA 3N35A 2A6WA 4M3CE 4RL7A 1WBFA 3WO2A 2ZR1B 4RA0A 1WBCA 1GNZA 4Q26A 4ASMB 4F34A 2PELA 4XJ8A 4Y22A 2F8XC 3VKLA 1PUUB 2XOAA 1QQLA 2R1BA 1KDMA 4ZXKA 3WDXA 3ZXEA 1JN2P 4OW4A 1GYKA 1AXKA 4Y1VA 1Q8VA 2P23A 4FQZA 4IZXA 1YO8A 2ZGKA 1HIBA 3SNMA 1W6OB 2SLIA 3W9TA 3AP9A 5E88A 3FJHA 3ZSMA 1IS3A 2E53A 1AX1A 4FPKA 2VW1A 3AZYA 4UW4A 5DZUA 5HCBA 3SITA 4G1RA 4LBKA 1FMMS 3A07A 4M01A 4LO3A 4L4IA 1OFSA 1HWMB 3AKGA 2YROA 1JLYA 3M3EA 1DJSB 1LOGA 1FV2A 1S0CA 1Q56A 4H04A 2DRYA 1Q8SA 2BFHA 1SCRA 4FPLA 5KXCA 4YW2A 3FJ8A 2D1ZA 5BP5A 5LK5A 1WW6A 2X2SA 1ZA4A 1B09A 2GALA 1IS4A 2UWCA 5CAZA 2BEBA 1V6JA 4UW5A 4QKSA 5FZUA 3I2XA 3WG2A 2IHOA 1GZCA 4TYSA 1T4QA 5KXBA 4Q1RA 1EVTA 1AVBA 2Z49A 3I29B 3O4DA 4G6JA 3UL2A 1JBCA 4YM1A 1JXNA 3AYAA 2A6YA 2ARXA 2KI6B 4GWMA 3AP7A 3S8JA 3AP5A 1W6MB 2RHPA 1V6MA 3OPZA 1NXD1 5HCAA 2M49A 4XFSA 3A0NA 1MS9A 4H9WA 3WDYA 5GLUA 1A3KA 1W6QA 2E4MA 1CJPA 2NYYA 3GNEA 1TOOA 2FGFA 4TLPA 4HJJA 3O49A 2JECA 3O0VA 1DQ4A 1IS5A 3O4AA 1O4ZA 1MS1A 4OZXA 1RZOB 5FNXA 4YGCA 4FPHA 3OBTA 1FNYA 3FJAA 1RG8A 3WMUA 2ZGOA 2CTVA 3ZSJA 2DYCA 1Q8QA 3VKFC 2WRYA 4FP2A 4XBNA 4EKXB 1DZDA 3K1XA 2OUJA 5F90A 4J2SA 2ET2A 4M3CF 1CVNA 2CWSA 2ZGTA 2D6OX 3SH4A 3BIWE 4Y24A 1SR4A 4YLZA 2Z42A 4AVSA 3APBA 3CA0A 4JPZA 3M1HA 3W59A 2D6PA 1ZM1A 5GZCA 5DSSB 2EXKA 3AXEA 1HWOB 4HA2A 4H55A 1ENRA 3O4OA 4BQ1A 4PQ9A 3M3OA 4XHXA 3ZPYA 4FPFA 1QNYA 2EXIA 2JE9A 1WLCA 5KXEA 3A21A 1N1VA 3AZVA 8I1BA 2GNDA 4I7IA 1S1AA 1JYIA 4X3AA 3CA3A 4Y20A 3I2AA 2DVBA 1I1EA 1G9DA 1ONKB 1S0FA 4XJWA 4OWJA 1WBAA 5F8SA 1G7YA 4I4OA 3WDVA 4AYUA 3VWCA 4EEEB 4XE9A 1BYHA 4XIKA 5DUVA 1FV3A 3OY8B 3NBEA 3AH1A 1N47A 3Q9OA 1PUMB 1BFGA 3INAA 1CVSA 3OYWA 3AK0A 3FJ9A 4Y26A 3BAOA 4GXLA 4G9MA 1LJ7A 4HR6C 2NP0A 3E8LC 2FFVA 3M2MA 3AXDA 4KBBA 5T54A 4XKIA 2FMDA 2HWMA 3IIRA 4JRAA 7I1BA 4PF5A 1JT5A 3P6JA 4CZSA 3D5OA 3BAUA 5DXDA 2PHFA 4ISRA 3AJ6A 3PJQA 1C1FA 4GAFA 1LOEA 5IK5A 2VSEA 1S0IA 2LIEA 1WD4A 2E7QA 3FLRA 1CONA 4XTMA 3PVEA 2W08A 2AENA 2D6LX 1AXMA 5JOWA 3CA4A 4YGDA 1UPSA 4I4RA 2DVFA 4YM0A 5D61A 2EAKA 2A70A 3LTQA 1KJLA 2C9AA 2CWMA 3BRFA 1RY7A 1BASA 4Y1UA 2DS0A 4LO1C 5GZFA 1JY0A 1SBEA 2DVDA 3IM6A 1APNA 2Q5TA 2WJSA 1LHWA 3M3QA 4Q8KA 3FJBA 2CYFA 4LBQA 2CNAA 1JQZA 4P9XA 3O0WA 3ZC9A 1LEMA 3N36A 3WMVA 4QD2C 1V6LA 1ULEA 4ZA3B 5DUXA 3V0BA 5F8YA 4LO0A 3S8KA 4XJAA 3NWKA 2ZGNA 4Q1PA 2DVAA 2XG3A 3B3QE 4DEPA 2WT2A 1N1SA 4BPZA 1OQ1A 1BFFA 2ENRA 2DWRA 2GNBA 1PC8B 3B01A 4IY9A 4ENDA 1SLCA 2NMNA 4U36A 2FDBM 4X37A 3ZXLA 3U4XA 3ENRA 4OUJA 3AZXA 2ZMKA 4YGEA 3FJIA 4KEKA 2YZ4A 1IT0A 4QBCA 1R8NA 2HW9A 1XZZA 1FX5A 1DQ5A 1ULFA 5DVHA 3AFKA 3RS6A 1VLNA 2V5YA 3BAVA 1II4A 5BXSA 3FJKA 1G82A 1DQ1A 3FUQA 3KQRA 1GZ9A 3NJ5A 3QLQA 5GZEA 3D7WB 3RQ0A 4UW3A 1U0AA 3RRDA 4IONA 2ZBJA 2GMPA 2VXTI 1V6XA 5H9PA 2D3RA 1SACA 4XJUA 1AXZA 1LGNA 3IMNA 4AWDA 1KJRA 4KEIA 1YBIA 3SNVA 5H9QA 2K8RA 2VXRA 3AKIA 2OW4A 3HMYA 4I4UA 3H6RB 5E24E 4DCKC 5JMCA 4D0TA 4YW5A 5IK4A 5T5LA 3T2TA 4Q91A 2I2SA 1FYUA 2EALA 1TIEA 4FOWA 4I4VA 1UL9A 5T55A 1D0HA 2Q3NB 1GKBA 1LOFC 4BLJA 4P0JA 3BA4A 3BRDA 1V6WA 1DHKB 1GBGA 1NLSA 3WINA 1DZCA 3OJMA 5CBLA 3DUIA 5BP5C 1H9WA 3A22A 2A3WA 1UZYA 3OGGA 4YM2A 1W3FA 4F83A 3SH3A 2AH2A 3NBNA 1XG6A 1RINA 5DUWA 3O3QA 1AF9A 2ZAAA 1ENSA 1LECA 1G8WA 2ESUA 1TFMB 2D6KA 5B2HA 2FO1A 3BA5A 1Z2VA 1BZWA 4OWKA 1Z4SA 4ISQA 4P0KA 1W6PB 5EWSA 2D24A 5IK7A 4XHBA 3W58A 2W68A 5T5OA 2E4MC 4DRRA 4Q2FA 1LODA 3MW3A 1ITBA 1JUIA 1IKQA 3SH5A 4BMEA 1HLCA 1SLTA 4D0ZA 1QF3A 2GMMA 2JE7A 2Z48A 1WLDA 3ILNA 3O5SA 3USUB 1YI7A 2DUPA 3I8TA 3KM5A 4XMIA 1UN1A 5BXPA 2OUHA 2Y9FA 3OJBA 1LU2A 5DG1A 4GA9A 4USPA 2ZGRA 1ISYA 3LSEA 1BFBA 2ZHKA 2LIQA 2VY0A 1K5VA 2Q9XA 1KRIA 5CA6A 3HR9A 3CA5A 4YW3A 3B9UA 2F2FC 3OJ2A 2WT0A 2A6XA 1WW4A 1SR4C 3MEPA 3BA7A 2A3YA 4NO4A 3L2YA 1W6OA 3WDUA 3OGFA 3FLTA 4YG6A 4OEFA 1FWUA 1DQ6A 3RSJA 2AFGA 3NBDA 4ZKTB 3F62B 2KLLA 3R05A 1DGLA 1F9KA 4YG0A 4Z8BA 1TTUA 4XFUA 1ISZA 2GN3A 4ZGRB 1DZQA 2WNEA 1LEDA 4YFZA 2WT1A 1TWMA 1LULA 1SCSA 5EXOA 2AXMA 2QYIB 1Z78A 3MW2A 1MC9A 3FBYA 1MZ5A 5E89A 3M3CA 2NVHA 3WHUA 2ZGSA 2D6NA 1PZ8A 3TAYA 5IK8A 4BMBA 1N3QA 3ASIA 3ILAA 4YZ1A 3NV3A 1BXHA 2A3XA 3ZYRA 3SLIA 2PHXA 1AJOA 1LU1A 1TWEA 1VAMA 3AH4A 2GDFA 2ARBA 3NV1A 4I2SA 1R8OA 2W39A 2SBAA 3A4UA 4YZ2A 1YIFA 4II0A 4ATEA 4J2KA 3CRGA 4I0YA 3PHZA 4JCKA 3RMYA 3PUBA 1Z0HA 1S0JA 4USOA 1W6MA 3CQAA 1TP0A 5EC5A 3BRGC 4L4HA 1V6OA 4R6UB 3IM7A 3FFZA 5CNAA 4G9NA 4UW6A 3V0AB 5FNWA 3AYDA 4I4YA 1P63A 1AFCA 2A7AA 1G9BA 3ZXFA 1MS4A 4R9BA 1OKQA 3AZWA 3ZX7A 1URXA 2VU9A 2DTWA 2D20A 4LO2A 2DURA 2P3IA 2CY6A 3UD7A 2K43A 3TC2A 1ULDA 4ZFYB 5I1BA 3FJEA 4QO3A 3AYCA 3SISA 2E7TA 5GLVA 1ENQA 1GSLA 4GALA 3H6QA 2RQ9A 1FNZA 1YYNA 4FPCA 2DU0A 2NTDA 4OEGA 2ZQNA 4FGFA 31BIA 3A0KA 1ONAA 1GANA 2ZMLA 3POSA 3WG1A 4W65A 1Q1UA 3AJZA 2OVUA 4KEJA 1C1LA 3JUTA 5EYXA 4JP0A 1IS6A 2A6ZA 3AKFA 5JOZA 3ZXGA 1BJQA 5JOXA 2A75A 2D43A 2KI4A 2R49A 4XXAA 2WSUA 1V6UA 4AGVA 5BXRA 4XZPA 3C2UA 3WDTA 3AP6A 1S0BA 4BM8A 2WLQA 4IHZA 3Q7XA 5F8WA 2ZGPA 5GLZA 3IAGC 4FOQA 5F5QA 1BLAA 1HWPB 5EHAA 3QR5A 2NZ9A 1V6IA 2ZZJA 3WLUA 3WNXA 5FRAA 5T50A 3VKOA 3VSFA 3POYA 4K20A 4LBMA 1WCSA 2P3JA 1RITA 1DFCA 5GALA 2PHWA 1UX6A 4ZBVB 2D7IA 4PC4A 2ZKNA 1VAVA 2AREA 4J23B 3OY8A 1GLHA 3JU9A 5JLVA 3O4BA 3WCRA 3VSZA 3WO4A 1E0OA 5E8AA 3JUUA 3IPVB 1FATA 1MZ6A 2H0BA 4CTEA 2PHRA 2D44A 1S0LA 2DU1A 2KM2A 2G4IA 1DQGA 1GGPB 4XYXA 1YTOA 3LCPA 1ISVA 4GP3A 1MVEA 3WUDA 3BADA 3MALA 4XDQA 1ISWA 1KNMA 5DG2A 4QKRA 1DYKA 1MS8A 4MYEA 3PG0A 2VLCA 4ZFWB 3WG3A 1LHVA 5GZGA 4YZ5A 2ERMA 4I30A 4K1ZA 1JW6A 5BQUA 2BQPA 3ZXKA 1C57A 1Q8PA 1D2SA 4FPEA 1GZWB 4R9AA 3WINC 2C5DA 3NBCA 3N3HA 2DUOA 1I1BA 3UD8A 1UAIA 3CRIA 3N7LA 4LBJA 4LO8B 2WSVA 4BLIA 1EV2A 3Q7YA 3HSMA 2GNMA 2ZHNA 1FWVA 2FFUA 3MPPG 5DZFA 2LALA 3WZ1A 3WDWA 4LO7C 4P9YA 4DS0A 4I4XA 2NMOA 1AX0A 4YG3A 1N1TA 3T1MA 5JVVA 2D23A 4GAIA 1N4KA 4Y1XA 1FAYA 4XJ9A 2ZACA 1IRAX 3FJCA 1JHNA 3O44A 1O4YA 1W6NB 3N7KA 2D7FA 1SLBA 1DQ2A 2D3SA 4Z9WB 2HYKA 3O0XA 4L8QA 4I4QA 1HKDA 5H9SA 5GZDA 1IHKA 5GJ6A 4D8HA 1LOBA 1QQKA 3ILFA 3EF2A 3FLPA 3P6IA 2GMEA 1WW7A 1MD6A 1CPNA 1MVQA 4XMAA 2VW2A 4GOVA 4Q8LA 4YZ3A 3BAQA 5D63A 1CESA 3V79C 3MW4A 4C1WA 1SBFA 4QD2B 4Y1YA 5H9RA 1Q03A 3HOMA 1F5FA 3O4CA 1PWAA 1UMZA 2EXHA 2XB6C 4P14A 4LO3C 4PBPA 1LTEA 21BIA 4K1YA 4X38A 4AGRA 2ZABA 4FP3A 1JLXA 1WUVA 3BOPA 3A23A 3CU1B 3KMVA 1WBLA 1N3OA 3VEQA 3RTIB 1DFQA 3H6RA 5KXDA 1QGLA 4EFQA 1AX2A 4XILA 4LO7B 3QYDA 2E6VA 4M3CB 3ZXDA 2R1DA 1IKPA 1H9PA 2UUSA 4XTPA 1HCEA 5DUUA 2EF6A 3T1LA 3P53A 3V64A 3AP4A 1BARA 1UKGA 2EIGA 1LCLA 4PBOA 3LLPA 2WQZC 1VCLA 4CRQA 3T8SA 4Y22B 2DREA 3Q7WA 1HQWA 4ITCA 2RSTA 1S0GA 5EYYA 3HALA 1LOCA 3WA1A 1HDKA 4AVVA 4K21A 2KH2A 1QOOA 5GLTA 1HCDA 3UK9A 5DZGA 4R9DA 4KC3A 2ZHMA 1G9CA 1DIWA 5IUQA 4SLIA 1XQNA 2BEAA 2GN7A 1QDCA 4FPGA 3CAHA 4IQPA 2ERFA 3AX4A 2HWAA 4OEEA 3ILRA 1JTCA 3VKNA 3AH2A 5JOYA 1W6PA 4Q27A 2R9KB 2RG9B 5F9TA 1UZZA 2P2KA 3VV1A 4A7ZA 3VT0A 4FVVA 1PZ9A 1MS3A 3FUOA 2VSAA 1Q04A 1LHUA 1JYCA 1V6NA 1PZ7A 4YM3A 2JDZA 1LENA 2MIBA 4I1EA 4FPYA 2JJ6A 4FOYA 4R9CA 1SLLA 4IZEA 1H30A 4I96A 1CE7B 3RMXA 4I37A 4Z8SB 1QKQA 2UWBA 3OJVA 2MLLB 4CJMA 4LO2C 3USUA 1I3HA 2X2TA 3FJFA 3WHTA 1Q8OA 1LOFA 4FOVA 2IWTB 1SLAA 3R4SA 4FPJA 3WG4A 4J2YA 4XBQA 2ZHLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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