3PUPA

Structure of glycogen synthase kinase 3 beta (gsk3b) in complex with a ruthenium octasporine ligand (os1)
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
348
structure length
346
Chain Sequence
SKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSEKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Glycogen synthase kinase-3 beta
publication title Structurally sophisticated octahedral metal complexes as highly selective protein kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 95
structure length 346
sequence length 348
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3pupA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pupA01
2ITPA 3BKBA 4OLIA 3CIKA 4AZEA 4DH7A 4DEIA 5E8YA 4HCUA 4BDBA 5JSMA 1ZOGA 2ITZA 1REJA 2Y7JA 3NGAA 3QQGA 4YJNA 2BAKA 3ULZA 4QMLA 3GFWA 2OBJA 1FBNA 3OT3A 4C3RA 5KZIA 5F20A 2OIDA 3JS2A 4UWCA 2PHKA 3EZRA 4ZTNA 4RLKA 2C5VA 2UZBA 3MJ1A 2HXLA 1JLUE 2CJMA 2W4OA 3BHYA 4O0UA 3SLSA 4MNEA 3UP2A 2O5KA 3NMUF 3LW0A 2XP2A 5L2TA 4EORA 5EKOA 1XH6A 4GJ3A 2V55A 2B54A 3R1SA 1H1QA 4O27B 3UG2A 4FZ7A 3ZZEA 3SG9A 2C0OA 5AUXA 2RG5A 3BI6A 2C3KA 2ZB1A 3PY0A 5CY3A 3C51A 3EYGA 5AR7A 4BGGA 5I9XA 3IECA 4MXCA 4G17A 4Z55A 4BDAA 5M51A 1CSNA 3L1SA 2J0IA 4AU8A 2EXEA 5EM5A 1XHAA 2QCSA 5CT0A 4PUZA 2V0DA 2WKMA 5D1JA 1Y91A 3PA5A 4GIIA 5HGIA 5EM8A 4DYMA 2BROA 2X4ZA 3FYKX 5DG5A 5LVPA 5FGKA 4F9YA 1LR4A 4HJOA 2W5AA 4F7LA 2XK6A 4AUAA 3FLYA 1JSTA 2YM3A 3R1YA 1GIIA 2ETMA 4U3YA 4KRDA 4X2FA 2XCKA 4DLIA 3OF0A 4S31A 2GFCA 2BKKA 4A9RA 2BZIB 2R3HA 2GPHA 3OBGA 4C3PA 3PXZA 1WZYA 5BVFA 5K4JA 5E1SA 1UNLA 4YBKA 4QP8A 3FI3A 2XK9A 5TE0A 5CZHA 5CTPA 1TVOA 5FDPA 2Y4IC 4FX3A 4YPSA 4ACDA 1KOBA 3UQGA 2PMOX 3ERKA 3W10A 4NFNA 2BRMA 4QYYA 3FMLA 3O2MA 4EC8A 4K9YA 3ZUUA 2F7EE 3MY5A 4NCTC 4Z7HA 3KXMA 2HXQA 3BE9A 4ARKA 4HVIA 2OIBA 3UP7A 4D55A 3V8SA 3F3VA 4ZLZA 3F3UA 3DZQA 3LJ1A 4XHKB 4Q5HA 2Z7QA 1OKVA 1HCLA 1U46A 1K2PA 4GT3A 3VO3A 3QGWA 1RE8A 4W4WA 4ZZOA 1U5QA 1WBSA 4O84A 3VC4A 3F88A 4EL9A 1ZY5A 5CAOA 3MGYA 4FIJA 4KKEA 3IGGA 2YM7A 3NS9A 4D9UA 3TZ8A 1KE5A 4A4XA 3RBWA 4QP3A 2AC5A 3VUKA 5CQUA 3PWDA 1TQPA 2WQEA 1Q8YA 2ZDUA 4IC7A 4DF3A 4HCTA 1P14A 2JIUA 4CRLA 2OFUA 3BYMA 2OZAB 2YCFA 1JKSA 3R00A 3PA4A 2XJ0A 4GV1A 4GFMA 1PHKA 3ACKA 2V5QA 4ZOGA 1UWJA 4X2KA 4TXCA 5CAQA 3MBLA 4CGAA 3T9TA 3O0GA 4C4EA 5B2MA 3UQFA 3IW6A 3U6IA 1UKIA 3PSCA 2IG7A 4E7WA 2YWVA 4TWPA 5IEXA 5HG7A 4FTLA 4F9AA 2PYWA 3AMBA 4OTGA 1WMKA 5B7VA 4RIXA 4BKZA 4EJNA 3ZBFA 4I6HA 1Y57A 3UYTA 4PDOA 4AAAA 4PF4A 4G34A 3D5WA 3I6WA 3RMFA 3UPXA 3WE4A 4FNXA 4D4YA 2CMWA 3Q4UA 1FGKA 3LQ8A 1HOWA 1FVTA 3OW4A 3DKOA 3ENHA 2UZEA 3GP0A 1PMEA 5C26A 2W17A 3DJ7A 5CF5A 3WE8A 4ZY4A 3MPTA 3AT4A 5CVFA 3HGKA 3OCTA 4PMMA 4XG7A 2EB2A 2C6TA 2R3LA 5EQPA 2OF4A 4O7RA 4I22A 3HL7A 4L01A 4M14A 4S2ZA 4NTSA 3IW4A 3LE6A 4FTQA 5I3RA 4EQMA 3F7ZA 3R63A 2UVZA 4FV1A 3AC5A 4GYIA 3EJ1A 3MB6A 1CDKA 4QNAA 1YI6A 2ZJWA 4ACMA 4OT6A 4XRLA 2IZUA 2R0UA 3G0EA 3KRXA 4XEYA 2PE1A 4FV5A 4GL9A 4L9IA 3D2KA 3MSSA 4MXYA 2WU7A 2H8HA 4J7BA 2ZV2A 4XV9A 4Y46A 3NYVA 3NYOA 3W1FA 5L4QA 4O7YA 5EQEA 3QD3A 4J8MA 4AXAA 2WOUA 3RPSA 4BZDA 5GIOE 5HU3A 3GEQA 3QUDA 4N70A 5EHLA 3MY1A 4D4SA 5TT7A 1Q97A 2OFVA 5CEIA 4EH8A 4C2VA 2JD5A 5DA3A 3KULA 5GZAA 3OXZA 3AC1A 3TV6A 1E1XA 4C34A 1M2QA 2J2IB 3Q5ZA 5DR9A 4F9CA 1L8TA 1BLXA 3R8LA 3WBLA 3PVUA 1XH8A 4EH6A 2C4GA 3P4KA 1O6YA 2QOCA 3T3VA 3OWPA 4TPTA 4ID7A 5HESA 2ERKA 5M4CA 4BYJA 5AJQA 4MXXA 2W7XA 4U44A 4O91A 3C0IA 4X0MA 3DNEA 3ORTA 3F82A 2HZ4A 4F9WA 5I5ZA 4K2RA 3O50A 3UZRA 5CEMA 5I9VA 5J5SA 2XUUA 5FTGA 3KXGA 3W55A 4CKIA 3PG1A 4MQ1A 1V0OA 2GQSA 2F2UA 1ZYCA 3LXLA 5ICPA 4A06A 1PXOA 2WMRA 3ZM4A 3KN5A 4QMNA 4YJSA 5HKMA 1Q5KA 4GK4A 1OMWA 4JOAA 2B53A 2E2BA 3BYUA 3CPCA 4II5A 3F6XA 2OK1A 3GOKA 3LZBA 4IX5A 1VR2A 3TCPA 3V04A 4ZEGA 5CAUA 3DBCA 3F5PA 4FSQA 3THBA 3VS7A 3P7AA 4FZ6A 4CMOA 2C6IA 3QD2B 4O96A 3UC4A 3EL7A 5M57A 4GRBA 4P90A 3BV2A 1BMKA 4RIWB 3WOWA 2BR1A 4FICA 1AQ1A 3QRJA 4FZDB 4RA5A 5A4TA 5T6KA 3EKKA 3GCQA 1YRPA 3ACJA 4F7JA 3RWPA 2NRYA 4BCMA 2Y9QA 3L9NA 3MB7A 2C5YA 4HCVA 4AT5A 3UNKA 3NCGA 3VS1A 2CNUA 1YDSE 2ITNA 3MS9A 3WYYA 4V04A 4BVUA 5KNJA 2YIRA 3QXPA 2QURA 4AW2A 3UOLA 3H9FA 4LG4A 3JVSA 4LI5A 3IOKA 2FSMX 2YZAA 4C33A 4FV4A 3Q9ZA 4S32A 4ENYA 2ITYA 3BU3A 3ZUTA 2OO8X 5IA1A 3ORIA 4IACA 5IQCA 1VYZA 3M11A 4IEBA 4YJOA 5A3XA 3V01A 3W16A 4ANOA 2WMAA 3RK5A 4BCIA 4NW6A 4BDIA 2XZSA 3D9VA 4OBQA 3KK8A 2F2CB 5JRSA 2QHMA 3UJGA 3WIKA 3P7CA 5E8ZA 1QPEA 3NIZA 4IVDA 4MQ2A 3TN8A 2VTTA 4FKSA 2BFYA 4I24A 4DE4A 3KMUA 3OROA 3E8DA 4GW8A 4J71A 4LV5A 5CT7A 3AG9A 2BCJA 2PZPA 2XNBA 4J99A 2HAKA 4DH3A 5FDXA 4GCJA 2XYUA 3MH3A 3R21A 4HPUE 4RIYB 5AAEA 4G3CA 3MH2A 3QTIA 3B8RA 2ITTA 5B2KA 2QHNA 2AYPA 4IHPA 4XOZA 4AT3A 1UWHA 3OWLA 4ANSA 3Q60A 3UOHA 4XG9A 1XO2B 4MXAA 1V1KA 1RQQA 1H00A 2QKWB 3P9JA 4HVHA 2GS2A 3AC8A 3PE1A 3QWKA 4O81A 4IAKA 2YIXA 4A4OA 4CFUA 2CCIA 4OTDA 4HVSA 2O64A 3W8LA 4WNMA 5HIBA 4O83A 4RWKA 3FLNC 4IWPA 1JKTA 4R3RA 5AM7A 4CYJA 3C4CA 3R2BA 5AADA 4LYNA 3OC1A 3UZTA 1H0VA 5CSWA 4AE6A 3TM0A 1CKIA 2GTMA 3R9NA 4J1RA 4ZIMA 4JBPA 4RFYA 5EYMA 3ZBXA 1APME 4JDIA 5CF8A 4C57A 3BLRA 2JIIA 4HGTA 4LQMA 4EYMA 3P86A 5HIEA 4RX7A 4R7BA 4IVCA 2HY81 3W8QA 1JSVA 2ETKA 1YWRA 4RGJA 4QYEA 5GINE 3PSBA 2R64A 2CGVA 4CT1A 3DKCA 3MTLA 4K1BA 3FMKA 5D7AA 5EI6A 3SHEA 3FZPA 4I5CA 3TUDA 1WAKA 3PPZA 2BDJA 3DBDA 4C35A 5G1XA 5K9IA 1G5SA 4QTAA 5EM6A 1M52A 5AP6A 4ZSAA 1W8CA 4ANQA 3QTXA 4QYFA 3H3CA 5L2IA 4ZY5A 2C68A 5IMXA 4NM3A 4U0IA 2WD1A 3OVVA 3UOKA 2R7BA 4ASDA 4E93A 3BLHA 2VUWA 4UB7A 3IS5A 3R8PA 2ERZE 3Q2MA 4GFGA 4DC2A 4FTNA 3ZEWA 2BMCA 4RQVA 2VZ6A 5DHJA 2W9ZB 3EQHA 3FWQA 4HPTE 3FY2A 4LL5A 4AGDA 3D0EA 4BY9E 3DFAA 5LVOA 1FVVA 5C8KA 4P2KA 1Z5MA 4H36A 2B9JA 3ID6C 3VUDA 2X2KA 4QP2A 2G2FA 4BTKA 5CSXA 3A7IA 2ITWA 1LPUA 4QMXA 4E5BA 2BRNA 4YR8A 1Q99A 1H24A 4MD8E 3OG7A 5JEBA 4F0FA 4NL0A 3E8NA 2XNPA 4Y95A 4YJQA 2UV2A 3F2NA 4WO5A 3TV7A 3BYSA 4RVTA 4O7WA 1YXUA 4ERWA 4J52A 4I6FA 3A7GA 5CEPA 3ZOSA 4RRVA 4GT5A 3LOKA 4AOJA 4G5JA 1MRUA 4I92A 2GNFA 4J8NA 4NW5A 5AV3A 2IJMA 4I1ZA 4WIHA 4AGWA 1PMVA 2EU9A 3FLQA 4LGHA 2QG7A 3PDTA 2VTRA 1PXIA 3FI2A 3PRFA 4E6DA 4E3CA 3ATSA 4Z9LA 3DTCA 3L8PA 2PVMA 3W18A 4FVRA 2OU7A 1CTPE 2OW3A 3E63A 4WSYA 4F0IA 2XIRA 3P1AA 4UWYA 3EQFA 3QUPA 3U4UA 3W2SA 3DS6A 2G15A 4AOIA 5EI2A 2YDIA 4BFMA 5AEPA 3O7LD 2JIVA 4IIRA 3DQWA 2BIKB 4JDKA 4R7IA 2YN8A 3WILA 4YC6A 2WTIA 4EOMA 4MD7E 1Q3DA 2CGUA 3QC9A 2H6DA 5KO1A 4DT9A 5IMEA 3RI1A 4YO6A 5AR4A 5I9YA 2A19B 5HO6A 1H1WA 4PMPA 5CX9A 1JKLA 2WMSA 4MBJA 5M4UA 4CZUA 3EQRA 3LCKA 3QZHA 4QP9A 4H1JA 4U40A 3O8TA 3ZMMA 4DFYA 3G33A 3EQGA 3FPMA 1UNGA 5IQEA 5J9ZA 1TKIA 1XBCA 5CEOA 5LOHA 1G8SA 4G9RA 3GFEA 4I94A 4FKWA 5I4NA 3PVGA 4TYIA 5FG8A 3R83A 4I5MA 5LMKA 3EMGA 3SXFA 1V0BA 4MVFA 4WUNA 3RK7A 5HTBA 3HNGA 4NM0A 5JH6A 5I9ZA 3LVPA 3FSKA 4RMZA 4Y73A 2WMQA 3ORPA 3ZLSA 4LUEA 4TY1A 3VULA 4NU1A 4BCKA 5HBJA 1CM8A 5D9HA 4FIIA 2XNMA 4XJ0A 5IA4A 4FNYA 4XS2A 4F70A 2J90A 3PZEA 4D4VA 4RT7A 3FHIA 2OZAA 1MUOA 3LFBA 4GH2A 5JZJA 4HGLA 3R7OA 3UTOA 3K3JA 1FMOE 1OPLA 2JGZA 4UEUA 4XG6A 3ZRMA 2W5HA 1ZRZA 4O86A 3U54A 3A2CA 4DH1A 5KHXA 2UZWE 4KUJA 3BRBA 3QLGA 2IVUA 4ZTLA 3RPYA 3IDBA 5M55A 5LVNA 3JXWA 3QU0A 3S3IA 5JT2A 3ALOA 4FKTA 2PTKA 4QTDA 5M08A 3MFSA 4X6RA 3RAHA 2W06A 4BBEA 2R3OA 2R3JA 4YGAA 5DR6A 4BRXA 4YLLA 2IWIA 1YI4A 1GIHA 2Q0BA 2VX3A 2XK4A 1VEBA 3HP5A 5HG9A 4R1YA 2R3FA 4AW5A 1IG1A 3LMGA 2GS6A 5DR2A 5AMNA 1Q8ZA 5KX8A 2Q0NA 4TWCA 1U54B 1R3CA 3QXOA 3EB0A 4M84A 3D14A 4TYEA 2PK9A 2ZM3A 3HZTA 2P3GX 4RVKA 3BEGA 1YHSA 2BHHA 4JG8A 5HBHA 4D0WA 1OBDA 3FEGA 2GNJA 4UWBA 4RZWA 3COKA 4QQCA 1ZAOA 3NCZA 5JN2A 4IX6A 4YZCA 4ZJVA 4NEUA 3PFQA 3QRTA 2RFNA 4QP1A 4Y5HA 4NKAA 1GIJA 2B9IA 3UZPA 4TTHB 4ZTHA 4IWQA 1Q3WA 4JBOA 2PL0A 4QP6A 1LP4A 2BILB 4R8QA 1I44A 2V7OA 5AX3A 1OBGA 5AFVA 4DFXE 4CMUA 1KUTA 4GU6A 4FEXA 3D5UA 5L6WL 2CGWA 1KE7A 2R3PA 3JYAA 5ANJA 3Q2JA 4BBMA 4YJUA 2BALA 4PWNA 4N6YA 5IH6A 2OH0E 5CF4A 5LMKC 4P7EA 4RJ4A 4EKLA 4F6WA 1ZYSA 3KXNA 5DWRA 3I7BA 3G6GA 3HRBA 4QTBA 4PL4A 2OXYA 4BTMA 2WGJA 3K5VA 1W7HA 4CQEA 1OECA 3GC8A 2WQNA 5HIDA 2LAVA 2XH5A 2EVAA 2XBJA 4KKHA 5FTOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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