3PWDA

Crystal structure of maize ck2 in complex with nbc (z1)
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
327
structure length
327
Chain Sequence
SKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLCGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAENS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
publication title Structural features underlying the selectivity of the kinase inhibitors NBC and dNBC: role of a nitro group that discriminates between CK2 and DYRK1A
pubmed doi rcsb
source organism Zea mays
total genus 104
structure length 327
sequence length 327
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3pwdA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pwdA02
4IM2A 4QYYA 4U0IA 1TVOA 5CASA 1S9JA 3RCDA 2OZOA 4OTFA 5AUVA 4IWDA 5J9LA 2VUWA 2YLEA 4IZAA 2QR7A 3ACKA 3NUXA 4CRSA 3L9MA 4IAZA 3UP2A 4OTHA 4C37A 4O2PA 4ZS0A 2OZAA 2J51A 4KWPA 4P2KA 3KRWA 2UZOA 3SXRA 3QTIA 3NIEA 3OS3A 4O0VA 3BU3A 5IA5A 5BNJA 3RTPA 3RPOA 4NM7A 1FINA 3RCJA 2CJMA 2VTJA 4YBKA 3W2CA 3ZSIA 4HW7A 1YXXA 2PVHA 4XG4A 5IH5A 4KIOA 5KHXA 4JXFA 1PY5A 3LXLA 4BZDA 3Q2JA 2XKEA 4FV2A 4FVRA 5T3QA 4QQ5A 3HGKA 1R1WA 4IVCA 4NCTA 3R8ZA 3T3UA 3VBXA 2QLQA 5BX0A 3ATTA 5C4LA 2GHGA 3LE6A 4BL1A 1OL5A 2V22A 1ZWSA 3P9JA 4FG7A 5KMIA 3R9HA 3BU5A 3DK6A 4DH3A 5LCKA 3FMNA 3E3BX 4NKAA 1OGUA 5BYZA 4ZJIA 1FVTA 4BWPA 4G16A 4A7CA 2GU8A 2PTKA 4FK3A 2CMWA 4GIIA 3MIYA 1U54B 3H0ZA 3OD6X 4X3FA 4BN1A 2GNGA 3LFAA 4LQMA 1JKKA 3W16A 2R4BA 4FZFB 2WQBA 4NZWB 5JRSA 2PMNX 4WOVA 5IH4A 2YDJA 1YI4A 3FI3A 3B8QA 4MXCA 4FSRA 4OTWA 3TIZA 1YOLA 2C6OA 3OG7A 4XCUA 3OOMA 4N57A 4O84A 4XV3A 4C0TA 4YTCA 4QMZA 2PE2A 5EM6A 3FY2A 4FICA 5CU6A 4H1JA 4EOLA 3SRVB 1TQPA 3NIZA 2IG7A 3POZA 1WBNA 3EOCA 1XH5A 4ZSLA 3UNJA 4DEAA 4DFYA 3NWWA 5CEMA 3MTFA 2W06A 4GIHA 4BCHA 3C51A 4C4EA 4IB3A 2PVYA 2R3JA 2I0HA 3CGFA 2V5QA 3WZEA 2WMXA 3A7IA 3HP2A 1I44A 4CFMA 2ITNA 1J7IA 4WKQA 4A9UA 3C4WA 4HYHA 3PJ2A 2Y9QA 2JDVA 4X6RA 3SOAA 5KMOA 2BALA 2W1HA 3DLSA 3FXZA 3V5JA 3UOKA 3IOPA 4JL9A 4IAFA 4U81A 1XHAA 5ICPA 1GY3A 3MVJA 3O2MA 3HV5A 4KIQA 5JSMA 2YIYA 3ZLYA 3D7TB 5E1EA 2Z2WA 5CLPA 4DEDA 3A60A 3PY3A 4BTKA 4EWQA 3QQFA 5HI2A 2RG6A 3AC8A 2VD5A 3MIAA 2UW7A 4CFVA 5L2IA 5K0XA 1OPLA 2OXYA 4EH2A 5HE3A 4RRVA 5ANEA 2HYYA 3OEFX 1BMKA 4N4SA 5FXSA 3UVQA 2QOBA 2UW5A 3V5LA 1OKZA 2VWWA 4I20A 4MVFA 4O38A 5AIRA 2CN5A 3TEIA 4F9BA 2CCHA 5FQDC 2UZUE 1OM1A 3DQXA 3VUDA 5A4QA 4FKTA 4AZSA 3RHXA 4CFWA 2HZ0A 2YERA 2QG5A 3MPMA 3AMAA 4D9UA 2Z7RA 2HOGA 1M17A 3U4WA 3PP0A 5AR8A 3KRJA 4OTQA 4MD9E 4EH8A 4HPTE 1JBPE 1ERKA 4M84A 4PF4A 3JR1A 4ZJVA 4LV8A 4C3RA 3BWJA 3TUCA 3RZFA 5JN2A 3Q9ZA 4U44A 1YW2A 4NFNA 4D2WA 4DITA 2R3MA 2EU9A 3U51A 2ZV7A 2QVSE 1AGWA 2E9VA 1SVHA 2WTKC 2WELA 3NYNA 3ORPA 4O27B 2JIUA 2FSMX 2VTSA 4J97A 5JFXA 2C3KA 3UNZA 4BRXA 3PG1A 1RQQA 2XIYA 4C7TA 3GT8A 4CT1A 2UZWE 3QBNA 4HCVA 4U43A 3ATSA 3LFCA 4RX5A 4ACGA 3NDMA 3P86A 2IW9A 4XG2A 3K5UA 3D2IA 2BRBA 4EZ5A 3RAWA 5B2LA 2GCDA 2P4IA 3QQJA 3ENHA 3KEXA 3V01A 1T45A 3O71A 3TKUA 4J7BA 3PG3A 2DYLA 2ITOA 3PP1A 4ANBA 4EK6A 3S3IA 2WTVA 2ONLA 3FMJA 4CLIA 1ZY5A 3ZTXA 3TM0A 2PUNA 2G01A 1URCA 5HOAA 3QQGA 5KZIA 3LXPA 4GFMA 3EN9A 2JBPA 4D2RA 4DH7A 2JGZA 4EK3A 2B9JA 5BQ0A 4NFMA 2XK7A 1YDTE 4FE2A 3ZZEA 3GNIB 4FSTA 2HWOA 4IWOA 3H30A 4GRBA 4L3JA 4LV5A 5D10A 4IVAA 4FTQA 5GIOE 4FSWA 3UGCA 4RMZA 4F6WA 3UMXA 4FEUA 2QONA 3BV2A 3QQUA 4ZMEA 2X7OA 2PVRA 3WF5A 1Y8YA 4BCKA 3V3VA 2JIIA 2QKRA 4FNWA 4GUBA 3OWJA 5C4KA 2P0CA 3AD6A 4MF0A 4U9AA 2BTSA 3JVSA 1FMKA 3KRLA 3KK9A 5JQ8A 2OJIA 3OW4A 4PMTA 5E8UA 4KKHA 3Q9WA 4L7FA 3C4FA 2A0CX 2ERKA 4YSMA 3VVHA 3HRCA 1OBGA 5CU0A 5KMJA 2WQMA 3NUYA 3QQHA 3UO6A 2EXCX 3BIZA 3N4VA 5EW9A 4ANMA 4C2WA 2VGOA 5CNOA 4X2NA 3QC4A 3Q04A 2Z7QA 4OUCA 3QCYA 3RK7A 5FDPA 4FSYA 1ZRZA 4K77A 3RWPA 1P2AA 3NS9A 5A4EA 3IW4A 5ANGA 3DKCA 1DI9A 2LAVA 4DLJA 4F09A 5JGDA 4BCIA 4IWPA 4TYIA 3DBEA 4YC8A 1BLXA 3VULA 1GIIA 4FG8A 5H9BA 3VJOA 4UY9A 3KL8A 5CENA 4CFNA 2PVLA 3G6GA 3QD0A 4APPA 3EL7A 5M4IA 2XEYA 3NGAA 3SKCA 2V7OA 3KXGA 3CIKA 3OCBA 4IDVA 3FL5A 4F9YA 1Q8ZA 3BELA 3O17A 5HBHA 5D7AA 1JNKA 5EW8A 2VTAA 4ZTNA 2W5AA 3FEGA 2ZDUA 3OCGA 3EWHA 2QO7A 4BDCA 4C4JA 2VRXA 3FMKA 4KRDA 2PE1A 3Q60A 4WNPA 4B0GA 2YIXA 3VQUA 2BIKB 3QL8A 4EK8A 1H1PA 1V0PA 2X39A 4GG7A 4K11A 4K9YA 3QRIA 4DA5A 2GSFA 3HMMA 3FUPA 4WSYA 5DR2A 4PWNA 5A6OA 1Q62A 3QLFA 1LUFA 2WPAA 2XNMA 1R0EA 2F7EE 4OTGA 3BX5A 2C1BA 3G0FA 2YA9A 4JX7A 2O3PA 4JX3A 1KSWA 5IEXA 3FHIA 3IK3A 4C4GA 5EHLA 3VBYA 3GEQA 4ORKA 1B39A 1BL7A 1UV5A 2XIXA 4RGJA 3QTXA 5CANA 4M0YA 3F5PA 4BBFA 4AN9A 3NZ0A 3N51A 3R8LA 4ANLA 5BVWA 3VAPA 1H1SA 5LOHA 2WFYA 4PMMA 4PL3A 1OKWA 3NNWA 1G8SA 3KMUA 3DXQA 3GFEA 5LWNA 2JDOA 4HGTA 4KSPA 1FOTA 4FKWA 4EH4A 3LQ5A 1UKIA 1QMZA 4WG3A 5AV0A 4E6DA 4NL0A 1WCCA 5H3QA 4R78A 1YVJA 3UO4A 3AD4A 4I94A 5AP5A 4JR3A 3SW7A 3G9LX 5M06A 5FEDA 5LQFA 4O0UA 4YLKA 3HAMA 4WD5A 3FMDA 4O7WA 2CKOA 4A4XA 4RQKA 3SA0A 4TNDA 4RJ5A 2VNYA 4PPCA 1ZYSA 4G5JA 3V5TA 3A8XA 2E9PA 4I93A 3DKFA 3MH1A 2GTMA 3AT4A 3NNUA 2BZIB 5FEQA 5EOBA 5A3XA 4EWHA 2ZYBA 3DK3A 5C03A 4F0GA 2FO0A 2HENA 4HCTA 1DS5A 1YWRA 3FMLA 4ZZMA 3DV3A 4FTKA 4TYJA 2XK4A 4CG8A 4G34A 2CHLA 4OR5A 1NA7A 1IASA 1GIHA 4C62A 4R1YA 4K6ZA 2CGWA 4U45A 5IA3A 3LFBA 3PSDA 3BYSA 3GOKA 4KA3A 3WILA 3RK5A 3EJ1A 3G90X 3POOA 5H8BA 1XH8A 3V6RA 3JS2A 1JKSA 4ASEA 1KUTA 2I7QA 2YZLA 2GDOA 4JQ8A 3I79A 3KN6A 3EFLA 2C3IB 3QWJA 4DGOA 3OCSA 5IEVA 3OROA 4U97A 3L1SA 5CWZA 1QPJA 5GIPE 5HNIX 4UWYA 2X6EA 2QI8A 3R71A 4FTJA 4NSTA 4TTHB 3R04A 2XBJA 3HAVA 2PZRA 3R73A 5AX9A 3RPRA 3R9RA 4RIWA 4HYUA 4AX8A 4JR7A 2RIOA 1PHKA 1YWVA 3FE3A 4EKLA 3ULIA 3GCUA 3Q2MA 3WF6A 4IX4A 3O7LB 4L7SA 3KRRA 4DGMA 2PU8A 5HQ0A 4B6LA 3R01A 4E6AA 2ZAZA 5L6PA 1UU9A 3ZO3A 5DYJA 2BFYA 3UP7A 4XH6A 2XZSA 2QOKA 2R3RA 4ZS4A 4ZXTA 3F6XA 3HL7A 4TZRA 4K33A 2X2LA 4GFOA 4IZ5A 3C0HA 4QPSA 4L43A 3LFDA 5EHYA 4BDKA 4IH8A 3OT3A 4YC6A 4QMVA 2OK1A 4BKZA 2Z7LA 2PVMA 3ALOA 3GC9A 4MNEA 4IB1A 4YTIA 5JGAA 4NCTC 1OUKA 4RWLA 3C4CA 4DH5A 3BV3A 3PRIA 4C3FA 4QP2A 5E9EA 5EM7A 1KE8A 3WYXA 3P4KA 4AE6A 3PPJA 5AR5A 2W4OA 2EB2A 3OUKA 3WZKA 2UZDA 4X3FC 3VBWA 4F6SA 2AYPA 5FXRA 1TKIA 2H9VA 3A4OX 1Q97A 4ZEGA 3CTHA 3OWPA 4O0XA 5CEIA 4FTLA 4RVLA 2H96A 4R6VA 2PULA 4FTNA 4B4LA 4CFFA 3RALA 3DFCB 2A1AB 3R7YA 5KMNA 3H9RA 3KF7A 1CKIA 4LRMA 2ZB0A 4ZSGA 4USFA 3QX2A 2YN8A 1H24A 3VWAA 2DWBA 4C58A 2CNUA 2HAKA 4FTTA 4LFIA 3F66A 4XOYA 4IM0A 3UQGA 2YISA 2YWPA 4O82A 1REKA 4W4WA 3H9FA 4J99A 3SC1A 5L8KA 4CXAA 1FPUA 3AT3A 3C5IA 4C35A 3NCZA 4A9YA 5I9UA 1U4DA 3CR0A 2CGXA 2WXVA 3F7ZA 3G0EA 4XRJA 3KREA 3PZHA 3HYHA 3V8SA 1UWJA 3CKWA 2DUVA 2PVKA 2RFNA 4O0RA 4XG3A 4M0ZA 3QTWA 4AN3A 5HTCA 3KVWA 3ZC5A 3FKOA 2X9FA 3PIXA 2YCQA 4IHPA 4Y95A 2BRGA 3O23A 4NIFB 3FLQA 4O6LA 2WTWA 5B2KA 3PWDA 2JBOA 2BR1A 4FMQA 5ANIA 1SVEA 3IDBA 1ZYJA 3ANQA 4DEHA 3UOJA 4BF2A 2JAVA 5FUTA 4ERWA 1OL1A 2PY3A 3M11A 3MA6A 4DFZE 1YRPA 4ZMFA 5TF9A 4WRGA 4FKOA 1STCE 4O7SA 3LFQA 1PW2A 4TKSA 4XHKB 2R3GA 5LARA 2VWZA 2YM4A 3CSVA 4XOZA 5GZ9A 3RM7A 4PNKA 4GK3A 4JS8A 1XQZA 4ONAA 3QHRA 3DB8A 4ALVA 3R9OA 2G1TA 3CBLA 3CP9A 2XBAA 3BYOA 4QTEA 2HXQA 3PYYA 5ACBC 3UC3A 4D2SA 2PE0A 4U80A 2UV2A 2PZIA 4GS6A 4KB8A 4CSVA 4D4RA 5HBJA 3ZSHA 1NY3A 4BR3A 3Q53A 3COMA 1XH6A 5J87A 4ASZA 2ZB1A 4TW9A 3RPYA 1BI8A 5DIAA 3EHAA 4CQGA 5AV1A 3ZMMA 3W2RA 1YWNA 1H1QA 2BVAA 3VS6A 2VAGA 3GCVA 5HGIA 1YHWA 5F9EA 4EYMA 2EWAA 3I7BA 4F63A 4EH6A 3QGYA 4QTCA 4EBWA 3TNWA 4FIJA 4BHZA 4IAAA 4EH3A 4ZAUA 1U54A 2OF2A 5J9ZA 3AG9A 3R7EA 4C34A 4ACCA 4UMRA 3HA6A 2GS7A 4GT4A 4L9IA 3QTQA 3PY0A 5KMMA 2G2HA 3VF9A 4FUXA 5M53A 4V04A 2P2IA 2PUUA 4LM5A 3OTUA 4DYMA 1ZZLA 3PLSA 1BI7A 3P0MA 4ASDA 4EONA 5J5TA 4F9WA 4BDEA 5AIKA 4CKIA 4O7RA 5DNRA 1LR4A 3I6WA 4K2RA 2C47A 3P78A 4FYNA 4QYHA 3QRKA 2UW0A 1KV2A 5EDRA 4FT7A 4QPAA 5ETAA 4U6RA 4UXQA 3KY2A 3UC4A 3SRVA 1VZOA 3AOXA 3D0EA 4GFGA 3COKA 2OGVA 4EL9A 3CQUA 4UMPA 3RPVA 5DR6A 5EOLA 4CYJA 4I1ZA 3ZONA 4EJNA 3OCTA 5IQEA 4MXXA 4I0RA 3II5A 4FV5A 3K3IA 4XX9A 4BKJA 1XR1A 2C69A 2FUMA 3MFRA 4GMYA 4O7NA 4JOAA 4Z9LA 2C5NA 3EQPA 3TZ7A 2XRUA 4K1BA 3MSSA 4L01A 3P7AA 2C4GA 3ROYA 2QNJA 4PTGA 2F49A 3FI8A 3OUNB 2PZYA 4FT5A 4JDJA 3BWFA 3TIYA 4CYIA 4HYSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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