3PZVA

C2 crystal form of the endo-1,4-beta-glucanase from bacillus subtilis 168
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
TPVAKNGQLSIKGTQLVNRDGKAVQLKGISSHGLQWYGEYVNKDSLKWLRDDWGITVFRAAMYTADGGYIDNPSVKNKVKEAVEAAKELGIYVIIDWHILNDGNPNQNKEKAKEFFKEMSSLYGNTPNVIYEIANEPNGDVNWKRDIKPYAEEVISVIRKNDPDNIIIVGTGTWSQDVNDAADDQLKDANVMYALHFYAGTHGQFLRDKANYALSKGAPIFVTEWGTSDASGNGGVFLDQSREWLKYLDSKTISWVNWNLSDKQESSSALKPGASKTGGWRLSDLSASGTFVRENILG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endoglucanase
publication title Dissecting structure-function-stability relationships of a thermostable GH5-CBM3 cellulase from Bacillus subtilis 168.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis subsp. subtilis
total genus 120
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2010-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3pzvA00
2WPGA 1J0KA 4N0RA 3WD2A 4HA3A 1GNXA 1JZ4A 1TCMA 1BYAA 3NDYA 4CN4A 3VGGA 5A8QA 4YHEA 3EYPA 2BVDA 4PMQA 2XTKA 3PZTA 1JYNA 3QOKA 4CCCA 1E72M 2VI0A 1ESWA 3N9KA 4UR9A 4HU0A 1AVAA 2YDRA 4NSBA 1M7XA 2F61A 2JEQA 3EMZA 8CGTA 1C8QA 1H41A 3WH5A 1DTUA 3NSXA 3ZT7A 3VGFA 5C71A 5FCZA 4TTGA 1KBBA 2YL8A 4WK9A 2GSJA 4D6GA 1HP4A 1R86A 5A6LA 3W81A 4WJXA 3IAPA 3W38A 4CD4A 2CEQA 4MDOA 3L2MA 5I0DA 1HIZA 3ZT5A 4U33A 3IAQA 1JDDA 1DWFM 3MUZ1 3WQ6A 4AZCA 1BSIA 4PCTA 3POCA 1NOFA 2W67A 3KZSA 1GCYA 2YLLA 1Q6CA 3A6OA 3WNNA 1HKKA 3BSGA 4UQDA 3GH7A 4PYSA 3UERA 3G6MA 4QCFA 5C70A 4H7VA 1E4LA 1WDQA 3OLDA 1C7TA 4GI6A 1WZLA 3BCFA 4H04A 3WDHA 2D0HA 5GNZA 1GPFA 2TAAA 2Y2WA 1W9BM 4KGLA 1QI2A 1RP8A 4ZE4A 4HZ6A 3WUEA 2NT1A 2WHJA 2Z1SA 2BVTA 1QVBA 1QPKA 2WVUA 3ZR5A 2B31A 4URIA 4MDPA 3UG3A 2C7FA 2W4XA 2J7CA 2VCAA 2XPKA 1B3XA 4GO8A 4ACZA 4F66A 2WCGA 1YQ2A 4UQ9A 2GFTA 1J0ZA 1NARA 1PPIA 1QHZA 3T2OA 2CITA 2BY3A 2J78A 1U33A 2PWFA 3O2LA 2YBTA 2CXGA 3ARXA 4M82A 1UWIA 1RH9A 4X0NA 2V3GA 4UOJA 3A4WA 3ZIZA 3MV11 1C3FA 1UZ1A 3WKZA 4B3LA 3ZM8A 4OJYA 4W86A 1XSKA 3AZRA 1VRXA 2WMIA 3OLIA 4M24A 2X0HA 1WZMA 5DEZA 2BHZA 1MQPA 3TTQA 2WMJA 1CLXA 4HMEA 5JBDA 2DEPA 3GNPA 2CESA 4UNIA 4ZEPA 3UG4A 1GW1A 1Q4NX 2DSKA 3K4DA 4LYRA 3U7BA 3U7VA 4DWSC 5IXEA 1WKYA 2FHBA 4EAMA 1HL8A 1UZ4A 4LQ1A 1VBRA 1ISWA 1VEMA 1D2KA 3BCDA 1DHKA 1JAKA 3CIVA 2UY5A 3AIQA 3WNMA 2VT0A 2XIBA 3WBAA 2VX6A 4A3YA 1O6IA 2G3MA 4OZOA 1WDSA 3J7HA 2GJPA 1E6QM 2E40A 1EDQA 3VD7A 3ZJKA 1E40A 2WHLA 1W3KA 2WLZA 3PBGA 3ARRA 4GIAA 2J47A 4ATLA 3VIGA 3SCQA 4L4PA 2E9BA 3SCVA 3W0KA 3ZJ7A 5FL1A 3AS3A 4Z2IA 5CPSA 1H09A 3EMCA 4HA1A 2W5FA 2A3CA 1JDCA 4EKJA 3SUTA 4WSJA 2FGZA 1H4PA 1US3A 3WENA 3NJ3A 3PZQA 2J74A 1PIFA 2VZUA 4PBGA 4JZ5A 3RPMA 3VDCA 4CUCA 4WKHA 3ZMRA 2DSZA 3VIHA 1XSJA 2VZVA 1ZL1A 2NT0A 2WHMA 1MQQA 3EDEA 3VMNA 1OSEA 1MFVA 3WD3A 3GYCA 4DM2A 2X0YA 1E55A 2EJ1A 3AHVA 3KL3A 3ZSTA 3TP4A 1JL8A 1U30A 3F5KA 3MV01 5DFAA 4HOWA 2YL5A 2ZOXA 1OGGA 1TA3B 1MW3A 1V0MA 5FKYA 3TONA 3VNZA 1DWAM 1E71M 3VOCA 1I75A 1GJWA 2BFGA 1HVQA 1JG9A 3MS8A 4H41A 1W3LA 2ZICA 3EDFA 1EOKA 3L2LA 4QCEA 3RMEA 2JF7A 3WMCA 1FH7A 3GZAA 4QLJA 2VO5A 1HKMA 1V6YA 1ITXA 4MNKA 3WUBA 1I1WA 1JZ5A 3QOMA 1V3HA 3PN8A 3AHZA 2GDVA 1JYVA 1M03A 1ODUA 4Z2HA 1LJYA 5I5RA 3BMVA 1CIUA 3ARZA 2WANA 4J3WA 1L0PA 1E6NA 1KXQA 2G3IA 3IJ7A 1B90A 1J0HA 2DQXA 3QHMA 4NI3A 1UD6A 2DIEA 2CKSA 1EA9C 1OGSA 3CZKA 1US2A 1CGYA 2BY2A 3DECA 5A8MA 1QNOA 3W29A 2G4FA 1FHDA 5LA0A 1MW2A 2F2HA 4D6IA 3WEMA 3PZ9A 3T0AA 2D22A 3PZVA 2E4TA 1M04A 1K6AA 2DT1A 2J25A 1HJXA 1BG4A 1N82A 4M81A 3VTRA 1DP0A 4M29A 5BXTA 3OGRA 1CECA 4AZIA 1E5JA 2BHYA 2EBNA 1V3JA 1B1YA 1V02A 2PBGA 2WC4A 1J12A 2WKGA 3IK2A 4U31A 4Z2KA 1VEOA 2V3DA 1B31A 2XWDA 1UH2A 3ARSA 3L4UA 4W8AA 4B16A 5EFDA 1B3WA 1WDRA 1IT0A 2IXUA 1DWGM 4MTVA 4OOZA 1CBGA 3B9EA 2D24A 4D6JA 1HT6A 1M01A 5E70A 4GZEA 3AS1A 2DDXA 1GOQA 2XM1A 1HXJA 2PC8A 4PMZA 4HMCA 5A8NA 1P6WA 1HP5A 4LPCA 1UWRA 1E0VA 2ZXBA 4P7OA 1QI0A 2XUCA 5I78A 3GH5A 3BAYA 3W4RA 1G9HA 2XFYA 3AJ7A 3ZO9A 1UKPA 2JIEA 1W9VA 5M3WA 3LMYA 3MMUA 2A3EA 4KRTA 2WM0A 2QPUA 3I3DA 4WLCA 4OOUA 1OD8A 4JFTA 1GZJA 1EH9A 2V38A 4GXPA 3HMCA 2DH2A 2WAGA 1V6UA 4DUWA 3DYMA 1IZJA 4DM1A 1BVZA 1E6XM 2PB1A 3AIRA 5CXPA 2PI6A 4IISA 3CHCA 2EEXA 4AZCB 4W7VA 1V08A 1PX4A 2XGBA 1JI1A 3EMQA 1UD2A 2UY3A 1CENA 1KCKA 3FY1A 2FH6A 5A6KA 1AQHA 3L4XA 1XHGA 1V3KA 5D8WA 1J0IA 2XSBA 4CU6A 4MAZA 1J0YA 1J10A 5TD4A 3BC9A 5D9PA 2XHYA 4P7LA 5A2CA 4Z2LA 2CHNA 3QHOA 4PTVA 4LXFA 1VB9A 1VIWA 4DUXA 3AIUA 9CGTA 3WDRA 1E6ZA 1JI2A 1GVIA 3RDKA 3WF0A 1C93A 4PUDA 1Y7VA 4A3HA 1H3GA 3DYOA 2G8ZA 1CGUA 5A94A 2J62A 4NRRA 4PEEA 4D6EA 4ACZB 1WNOA 2GDUA 4JCLA 2OSWA 3RCNA 5FOOA 3AXHA 4XUYA 2ZXAA 1XYFA 2DT0A 5DT5A 4HZ8A 2ZXQA 2J79A 2BNJA 4XV0A 3F5JA 2E3ZA 3APGA 2A3AA 4AD2A 1NH6A 2DH3A 4AISA 5A8OA 3WNKA 2RGMA 4MB4A 3T2QA 3FHAA 1V3IA 5A6AA 2CBJA 1GQLA 4P7QA 5GPRA 3BMWA 1E6SM 1QW8A 5I3DA 5I6SA 1PBGA 4BQ3A 3LPFA 4ML4A 2CBVA 1G94A 1V6WA 1S46A 3CBWA 5A95A 1JZ3A 3GNRA 1TVPA 4TVCA 3CUHA 2YA0A 3A4XA 1ZBVA 2NSXA 1HL9A 3CPUA 4XB3A 1VJZA 3AMLA 2X8RA 3PZUA 1WDPA 1ZB5A 2EQDA 1R8LA 4J3XA 4MNJA 4XX6A 3GXIA 4JHZA 3AIEA 4Z2GA 2G3NA 4TOQA 1CGWA 3TA9A 4J3UA 4BQ5A 1DWHM 1JYXA 4UTFA 2WBKA 2J8FA 4AEFA 1FFRA 1G0CA 1QNRA 2YDQA 5IHSA 5C8BB 3CHEA 1W9XA 5A6SA 1RD6A 4W7WA 4PMYA 3OB8A 1JGIA 2EXOA 2XFFA 2YJQA 1KQYA 2RGLA 2QMKA 4M80A 1HN1A 3ZT6A 3MKKA 3T0DA 1MXDA 4H2CA 3WDPP 2XYLA 2WWDA 4AY1A 4UFJA 4UOQA 3WQ4A 1UR0A 3NDZA 1B3YA 1YHTA 4D71A 1JDAA 2VNCA 2J7EA 1BYDA 4OBSA 1EGZA 1KCLA 2V5CA 3HU7A 4CCDA 1HVXA 3GH4A 2D0FA 4AIUA 1QI5A 2WHKA 1OGBA 3WMBA 4AD1A 3W37A 1XCXA 2DGAA 2EPLX 2VJXA 5LA1A 4M1RA 3M46A 3WH9A 3BAKA 1ISXA 4AIEA 4FLQA 4W87A 2D0GA 3GTNA 5ABHA 1GONA 1GOKA 2VUYA 1BF2A 2AOSA 3VIIA 1HX0A 3AQUA 4D6DA 5ABGA 3T08A 4H8UA 5A6BD 1D7FA 4R27A 5BXSA 2OLHA 2AMGA 4AZ5A 4HPGA 4R5EA 5DMYA 3BAJA 2WSPA 5DT7A 3N1AA 2GJXA 2J7DA 2XVKA 4FMVA 3AS0A 3DHPA 2BHUA 1E6RA 3WF2A 3AMGA 3ARVA 1MQRA 3A3HA 1AQ0A 4PUEA 3ARWA 1JNEA 1KXHA 2NW0A 1OD0A 1BHGA 1QNQA 4P7NA 4U3AA 1A3HA 2F8QA 4X0VA 3BH4A 1OBAA 4WIWA 1VBUA 2W63A 3SURA 5M17A 2ZXDA 2VX7A 4D6HA 4HOXA 3VVGA 1UWUA 3OZOA 4UZUA 3VNYA 2DT2A 3WH8A 2ZUSA 3N04A 3EBVA 1KGUA 5DF0A 3OA5A 1TG7A 1E0XA 4GO9A 3OLGA 3WQ8A 1CGXA 1EIBA 1K9TA 3AHTA 4BZYA 1MWOA 2Y24A 3UR8A 1KWGA 2WCSA 2V3FA 2IUZA 3BGAA 4W93A 4WKAA 4YPJA 1ZJBA 1OT2A 3AIBA 1B0IA 3VX0A 3FW6A 1CPUA 2VQUA 4FLSA 3FXYA 2XSAA 7CGTA 2ZUUA 5JUVA 2MANA 4B3KA 3K46A 1JF5A 3SCRA 5A3HA 3VM7A 1UWSA 1V0KA 1XYZA 1OM0A 2VZOA 2D1ZA 4P7RA 1HJSA 4BF7A 4CGTA 1H2JA 1TE1A 3KE0A 1MFUA 1K9EA 4JIEA 2ZX7A 4PSRA 4DWSA 4PTWA 1NQ6A 1V6VA 4U2ZA 2OYMA 1V0LA 3EDJA 4WKFA 1PIGA 3WD1A 3VM5A 3NYDA 1W2PA 1R85A 1KB3A 2ZUTA 3SCUA 4IM4A 2G3JA 2QF8A 2XVLA 1FFQA 2WWCA 3T0BA 2PWEA 1KGXA 1FH8A 1C8XA 3HJEA 4GI8A 5BCAA 1K9FA 4CD8A 1C92A 3AMDA 1CTNA 1QOXA 3MUIA 3FNDA 1J0JA 4RE4A 2Y8VA 3WNLA 2E9MA 1PEZA 4TXEA 4UOZA 4UFMA 5E6YA 2XWEA 5LA2A 1QHPA 1XH0A 3U57A 4ZXOA 3QR3A 4J27A 3CZLA 3AISA 5ABFA 4AYSA 1MXGA 2J4GA 2WKLA 2WNWA 1PX3A 2ZX6A 3G6LA 1BG9A 5FL0A 3BAWA 3SUSA 1ECEA 3K8MA 1UR1A 4CU7A 4P8UA 1UG6A 4J3TA 3SCOA 2BY1A 1CYGA 3AIWA 3WY1A 5D4YA 3VD4A 3CUGA 1Q6DA 1BPLB 4Z2JA 1XH2A 5I24A 1LWJA 1EQPA 2ZUWA 1F4AA 4JKLA 4JAWA 1E4IA 1H11A 1TMQA 4F9DA 2ZWYA 4D1IA 1BYBA 4H8VA 4S3KA 4CD7A 1E4MM 3CH9A 2OSXA 1W1YA 2BV9A 7A3HA 2QHAA 3CLWA 1LG2A 4ATDA 1XRVA 1JD7A 2Y5EA 4U2YA 4JL2A 5D9MA 5EBAA 3W24A 1GQKA 4PCSA 1CXHA 4BA0A 2V3EA 1V3LA 3MUY1 2J7GA 1GQIA 2GJRA 3N13A 1KXVA 4X9YA 1W1VA 4GPNA 4KMQA 3SCNA 3WQ5A 3CMJA 1B2YA 2FH8A 5CPQA 5JIPA 4TUFA 4YN5A 3WF3A 3WMSA 2VQTA 1UOKA 1X6LA 5KZ6A 4EANA 5ABEA 1GORA 5AY7A 3M6DA 4W89A 2X2YA 2WMGA 3BLPX 4KRUA 2E0PA 3ARPA 5A2AA 3ZQ9A 2D3NA 2GK1A 1XD1A 3NSNA 1CGVA 4PMRA 1BYCA 4D72A 1J11A 1WPCA 4OIFA 2QLYA 4CCEA 1NOUA 5HDRA 4PTXA 1FA2A 2WMFA 3AICA 3WF4A 3SUVA 3SCTA 1UKOA 3NUKA 1ZS2A 1BGAA 1E73M 4CN6A 3EDKA 3RM4A 1GOWA 3VGBA 5A69A 3DHUA 4PN2A 4FLRA 3CUJA 1QHOA 1GVYA 1CEOA 1CGTA 2E9LA 1KR0A 4U3CA 1UHVA 2YOCA 2YA2A 4U5IA 1SFSA 5EB8A 2FDMA 3PTKA 5CSYA 1VFUA 1UA7A 2CERA 3VINA 3VIPA 4PMOA 3IANA 1UR9A 3K4AA 1E1FA 1JD9A 4B9ZA 3ALFA 5E6ZA 1JAEA 2X05A 2QV4A 1J01A 4JL1A 6A3HA 5CGTA 4JFWA 3RIKA 4GINA 3VGDA 1CXEA 1KBKA 2VVNA 4NF7A 1BFNA 5BRPA 2VTFA 1Q6EA 3KEHA 2C8NA 1O7AA 4W85A 4CVUA 1V03A 1UWQA 3K8LA 1LF1A 3SCSA 1C8YA 3UCQA 5HPOA 4CD5A 4NZCA 3ZOAA 2J7HA 4GQQA 2CHOA 5IFTA 4GZJA 2HISA 1J18A 2VX4A 1WZKA 1HKJA 2FGLA 4Y7EA 1W9PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WPG A;  1J0K A;  4N0R A;  3WD2 A;  4HA3 A;  1GNX A;  1JZ4 A;  1TCM A;  1BYA A;  3NDY A;  4CN4 A;  3VGG A;  5A8Q A;  4YHE A;  3EYP A;  2BVD A;  4PMQ A;  2XTK A;  3PZT A;  1JYN A;  3QOK A;  4CCC A;  1E72 M;  2VI0 A;  1ESW A;  3N9K A;  4UR9 A;  4HU0 A;  1AVA A;  2YDR A;  4NSB A;  1M7X A;  2F61 A;  2JEQ A;  3EMZ A;  8CGT A;  1C8Q A;  1H41 A;  3WH5 A;  1DTU A;  3NSX A;  3ZT7 A;  3VGF A;  5C71 A;  5FCZ A;  4TTG A;  1KBB A;  2YL8 A;  4WK9 A;  2GSJ A;  4D6G A;  1HP4 A;  1R86 A;  5A6L A;  3W81 A;  4WJX A;  3IAP A;  3W38 A;  4CD4 A;  2CEQ A;  4MDO A;  3L2M A;  5I0D A;  1HIZ A;  3ZT5 A;  4U33 A;  3IAQ A;  1JDD A;  1DWF M;  3MUZ 1;  3WQ6 A;  4AZC A;  1BSI A;  4PCT A;  3POC A;  1NOF A;  2W67 A;  3KZS A;  1GCY A;  2YLL A;  1Q6C A;  3A6O A;  3WNN A;  1HKK A;  3BSG A;  4UQD A;  3GH7 A;  4PYS A;  3UER A;  3G6M A;  4QCF A;  5C70 A;  4H7V A;  1E4L A;  1WDQ A;  3OLD A;  1C7T A;  4GI6 A;  1WZL A;  3BCF A;  4H04 A;  3WDH A;  2D0H A;  5GNZ A;  1GPF A;  2TAA A;  2Y2W A;  1W9B M;  4KGL A;  1QI2 A;  1RP8 A;  4ZE4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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