3QAKA

Agonist bound structure of the human adenosine a2a receptor
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
453
structure length
444
Chain Sequence
IMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYRSTLQKEVHAAKSLAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKIIRSHVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein, hydrolase
molecule keywords Adenosine receptor A2a,lysozyme chimera
publication title Structure of an agonist-bound human A2A adenosine receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapien
total genus 167
structure length 444
sequence length 453
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3qakA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3qakA01
1CTWA 1KG9A 1M0KA 1L59A 1P5CA 111LA 4AMIA 1L9HA 1D3MA 4N6HA 3WQJA 1L21A 4W59A 171LA 1C3WA 3MBVA 149LA 251LA 4ARPA 1G0MA 4X1HA 3S3CB 3X3BA 3DN8A 3RZEA 108LA 4QRYA 131LA 5J7AA 1F50A 1CX6A 1KGBA 230LA 3CDRA 1L94A 255LA 253LA 5H2HA 4OV0A 3CODA 5BR5A 1D3JA 1QTZA 1G0JA 225LA 1L28A 4I7MA 3HT7A 4QIDA 3OE8A 2Y03A 1LLHA 3VGAA 177LA 7LZMA 1S8LA 138LA 186LA 3HWLA 1L33A 3HAPA 1L37A 4HWLA 4W58A 1CV4A 239LA 122LA 3CDQA 4BEYA 3V2YA 3HARA 3COCA 3QJTB 5F8UA 2F95A 1KW5A 2RBPA 1L76A 2RBQA 5B6WA 3GUPA 222LA 238LA 1BRXA 175LA 157LA 4LDEA 3PXOA 3HANA 4G71B 1L50A 2RBOA 1X0SA 4XT1A 220LA 165LA 262LA 1AT9A 3GUOA 2RAZX 107LA 163LA 2Y02A 1DYDA 164LA 1CUPA 2RB0X 1QTHA 2Q9DA 4ARMA 5AHYA 4I7TA 3DDLA 3C81A 1DYCA 2NTUA 1L96A 1L39A 1CU5A 5G2CA 1S51A 2R4SA 1SX7A 1C6MA 1DYGA 2O7AA 127LA 3VHZA 1L55A 1QUGA 1L29A 1L04A 1L89A 1DYFA 1L19A 3K2RA 3L2XA 1CU0A 1L54A 5LZMA 2F2QA 4ZPUA 2B6XA 1S8JA 234LA 4W51A 3S8GB 1L66A 1CU6A 3HH4A 1L99A 4MD2A 4ARLA 3AYNA 3QJQB 3DN2A 4MBSA 231LA 1C60A 2OE7X 4EPIA 1CWQA 2ZIYA 125LA 1C6TA 1LGXA 4EIYA 1XJTA 120LA 2ANVA 2NTWA 3HAOA 5H2NA 3VVKA 4LDLA 168LA 1BM1A 1L56A 5G28A 1MGYA 3ODUA 3V2WA 155LA 4MQTA 4BUOA 1L88A 1L97A 2ZFEA 2OE9X 1CV1A 3HUKA 4L35A 3C7WA 130LA 4XXJA 2BRDA 1L44A 3FA0A 5I14A 1FBKA 1L72A 3DQBA 4FBZA 156LA 1GZMA 2YDVA 4PXFA 5A45A 1ZURA 3HTDA 2I21A 1AP9A 3UZAA 1Q5IA 5H2KA 3UTWA 2KSAA 214LA 1SWYA 2NTGA 1CU3A 3HH5A 169LA 1L77A 4IARA 1O0AA 1L01A 190LA 1T8FA 4W53A 4PXKA 2QARC 1C65A 2Z6BA 4I7LA 1PXSA 3NS0A 1P37A 1G06A 1T8AA 3DMXA 1C6NA 5JJNA 4ARJA 1L86A 236LA 110LA 1L0KA 1L49A 3GUKA 5AZDA 3OAXA 260LA 3C8SA 4X31A 1P8HA 4JKVA 1GUEA 187LA 1P8IA 4G70B 2YCXA 2OU9A 1G1WA 1LWKA 3HT8A 198LA 5ITEA 4I7JA 1QTCA 1D3FA 1L80A 5AHZA 3QDCA 4XTLA 159LA 4AQNA 1L91A 3AM6A 3HU9A 1L85A 1L93A 1G0GA 3FI5A 4K5YA 146LA 1L45A 1C6LA 4GP4B 5DYSA 3C83A 1C6AA 3RFMA 3DNAA 1C69A 241LA 1UAZA 3KJ6A 115LA 1CX7A 3HTGA 1LN6A 1L41A 3QAPA 5DHHA 4W55A 3EH5B 3DKEX 3DN6A 2Y00A 1C6PA 1TN5A 4GPOA 3VW7A 184LA 1L52A 4OO9A 1L23A 4ARQA 2OTYX 3L64A 1LI2A 1P2LA 5C1MA 1CVKA 3T45A 1UCQA 4W57A 1X0I1 3CAPA 144LA 3PWHA 114LA 1L53A 1QT4A 235LA 3HUAA 1QHJA 1QUHA 1L62A 1XIOA 1DYEA 247LA 128LA 2WJLA 4TL3A 219LA 216LA 1IW6A 4XTOA 5A8EA 2QPEB 1JV7A 188LA 1L64A 1L71A 1L13A 181LA 1QKPA 4KNFA 1D2WA 1C6KA 3C7YA 2X72A 1LGUA 1E0PA 158LA 1DYBA 1M0MA 1XJUA 1C6HA 256LA 2L6XA 1JV6A 1L11A 4J4QA 3PBLA 1KY1A 1PQJA 1L25A 4G7QB 142LA 4IAPA 2LNLA 4S0WA 1C68A 1GU8A 1QSQA 3F9LA 5B6ZA 1PQKA 1L08A 257LA 1CV3A 1L06A 1KY0A 1L47A 1D3NA 2B74A 3C80A 1S52A 4GP8B 1SX2A 4EJ4A 3SB9A 3C7ZA 1JGJA 212LA 1PQMA 2B6ZA 1LGWA 2HULA 3OE6A 4XT3A 3CDOA 1QT8A 258LA 2OTZX 180LA 1QS5A 4FPDA 1G0LA 1F88A 3C8RA 148LE 170LA 1L82A 1P46A 1L26A 2WJKA 1X0K1 1QS9A 1L07A 1C6IA 4I7OA 3EH3B 1G0PA 2I1XA 3ZPRA 1P7SA 5B0WA 173LA 1IW9A 1L20A 1P64A 3HDFA 191LA 1LYGA 2VT4A 126LA 1LI6A 4HYJA 2RB1X 4LDOA 1KNIA 1L95A 2L78A 2RH1A 1LYFA 206LA 2RBSA 1U19A 3S3DB 4BV0A 4I7RA 229LA 1F4ZA 4EKQA 2B7XA 3UG9A 4NC3A 1L60A 1T6HA 245LA 3EH4B 4MQSA 3UONA 4I7QA 4JR8A 2B72A 1DZEA 1L02A 3NY9A 3GUMA 5B34A 104LA 139LA 1L16A 1OWYA 4L6RA 4KLYA 2I35A 1C6GA 3D4SA 2R4RA 1OVKA 3HH3A 109LA 1L15A 1NHBA 4IB4A 5KKHA 5ITCA 2CUUA 3HH6A 1L34A 4EA3A 1L90A 3SB6A 2YDOA 2J4YA 119LA 1QT3A 4YXCA 102LA 1S54A 1L05A 2B73A 1KW7A 4WAVA 3G3WA 2B6WA 1CV6A 147LA 5B6YA 145LA 3CDVA 3DMZA 3CDTA 1T97A 1LW9A 5G2AA 224LA 1L75A 201LA 1LYDA 2F47A 3OE0A 3UTYA 3G3XA 1P36A 3HASA 1C64A 1L17A 1P56A 3QBKA 3DN3A 2LCBA 2LZMA 137LA 5B6VA 185LA 1LYIA 3DN0A 5G2DA 1JQUA 3P0GA 1L65A 1KMEA 172LA 4FAAB 6LZMA 1H2SA 176LA 174LA 1ZYTA 3SBBC 1L10A 1CU2A 3SB8A 249LA 2OU8A 1OVJA 5JJEA 3GUJA 2O79A 5AX0A 2JAFA 1L69A 1L36A 182LA 1L14A 4I7PA 4ARMB 167LA 2QPDB 1L73A 5LWEA 3ZPQA 1L0JA 103LA 2KS9A 3UZCA 118LA 2AT9A 1EPYA 2Y04A 3S3BB 244LA 1C67A 1P2RA 1TLAA 1HZXA 3SB7A 1L30A 1E12A 1L31A 2PEDA 3QBLA 3SB5A 1KG8A 1C6JA 4DAJA 151LA 1CUQA 1QM8A 215LA 3S8FB 3HU8A 1OV7A 1L61A 3PDSA 1XEPA 3QBGA 4A4MA 3C82A 1QTBA 3LZMA 5B35A 1M0LA 3ABWA 1G0QA 5ETZA 1LYHA 1WTHA 3QJVB 4BEZA 1D9WA 5H2LA 4UHRA 1OYUA 2RBRA 248LA 4G72B 2Z55A 1PQOA 1L48A 192LA 2QB0B 3C8QA 2B6TA 1L84A 237LA 4MD1A 5G53A 1K28A 5H2IA 4AMJA 3GUIA 129LA 1P6YA 2LC9A 2B70A 2RAYX 1BRRA 3NYAA 2HUKA 2F93A 4QI1A 3NSBA 1L81A 1L0MA 1DYAA 1G1VA 4GRVA 1BRDA 1TN0A 1L24A 1L92A 1SSYA 205LA 2HPYA 209LA 3BVDB 2G87A 221LA 1QSBA 5B2NA 4EKPA 4GYCA 4E97A 1L00A 261LA 3HAQA 3HDEA 1C6CA 4GBRB 2KSBA 3C9MA 4UG2A 160LA 1R84A 1C61A 4WW3A 3X3CA 4HYXA 1ZWNA 3SBAA 3QJRB 1C6DA 4G7RB 1L27A 1CV0A 3HTFA 1CV5A 211LA 1C8RA 1L79A 2OE4X 2YCWA 1L43A 5DHGA 2I20A 1C66A 1L03A 1QUDA 3NY8A 1OV5A 199LA 5TGZA 1L67A 1I6SA 1P3NA 3OE9A 3FADA 4DJHA 4EKSA 3SN6R 4GP5B 141LA 1L12A 1L68A 4G7SB 4IAQA 5AWZA 197LA 4YXAC 2OEAX 3VI0A 213LA 5H2OA 1L63A 4W54A 1QKOA 112LA 3GULA 3QAKA 1R2NA 1VGOA 2ZZLA 4XTNA 227LA 2KSYA 226LA 1L35A 2B75A 2EI4A 1L18A 2Q9EA 1L46A 5JJJA 4PJZA 1LPYA 1LI3A 4I7KA 1QTVA 1FBBA 246LA 3F8VA 1G07A 2ANXA 3UTXA 3DN4A 1XJIA 5A44A 223LA 2Z73A 3PQRA 3GUNA 166LA 1IXFA 1L09A 1H68A 4ARQB 254LA 1P8UA 4FA7B 1B6IA 3HT6A 4DKLA 228LA 1PQDA 5FJGA 250LA 1L42A 1L51A 1C63A 4EPFA 1L70A 4YX7C 1L32A 1QTDA 1PXRA 1T8GA 1L40A 1L98A 1SSWA 1QUOA 161LA 1L83A 217LA 1L74A 5EN0A 5AX1A 178LA 3C9LA 123LA 150LA 2YCZA 4W52A 5G36A 3VG9A 4N4YB 3QJSB 3G3VA 5H2JA 2IGCA 1XMEB 3A7KA 252LA 195LA 3UTVA 1OVHA 243LA 1PY6A 4Y9HA 162LA 2M3GA 5H2PA 3DMVA 1D2YA 1QT5A 3QBIA 1KS3A 4LZMA 1LYEA 1LYJA 3HTBA 1L58A 3HT9A 1L57A 1JFPA 2HUMA 3ZEVA 1C8SA 113LA 4BVNA 1L38A 1C62A 3AYMA 1SWZA 242LA 1C6QA 233LA 2F32A 4I7SA 259LA 2Y01A 196LA 152LA 1JTMA 2O4WA 2RB2X 3EMLA 4W56A 4N4WA 1Q5JA 4GBRA 5BR2A 140LA 232LA 1C6BA 2RBNA 3JR6A 4JQ6A 1G0KA 1QT7A 1LWGA 1S53A 3DN1A 1OWZA 3QJUB 4X32A 5G54A 1PQIA 2NTHA 3REYA 4BWBA 210LA 200LA 1VJMA 4I7NA 1C6FA 3HUQA 1C6EA 1QT6A 183LA 2JAGA 189LA 1L22A 2YCYA 5B6XA 4PK0A 4EKRA 2B6YA 1L87A 143LA 240LA 2A4TA 1JTNA 218LA 1EHKB 4EXMA 3RUNA 5H2MA 2OU0X
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1CTWA 1P5CA 111LA 4AMIA 4WLXA 1AKIA 1LZTA 4H94A 1AM7A 1EL1A 1C3WA 4X1HA 3X3BA 1LZRA 1JSFA 4B4EA 1VDPA 1GFTA 1F50A 1OP9B 5AMYA 1L94A 1AT5A 1D3JA 1G0JA 2Y03A 1LLHA 1UUZC 7LZMA 4NFVA 1IVMA 138LA 3HWLA 1L33A 1OUHA 3HFMY 3WW6A 1NDMC 4ETAA 207LA 3COCA 2I25L 1BHZA 1DI5A 3GUPA 1CKDA 4G71B 3AW6A 3HBHA 1OUIA 165LA 5B59A 163LA 164LA 1TAYA 1QTHA 2Q9DA 3DDLA 2NTUA 1L39A 1CNSA 2R4SA 1L55A 1CKGA 1QUGA 4YEOA 4W94A 3L2XA 234LA 4W51A 1OUBA 4MD2A 4MBSA 4NWHA 3ZVQA 3WW5A 125LA 1C6TA 4XJFA 4Z46A 4EIYA 5H2NA 132LA 2G4NA 1BVKC 1MGYA 5A3ZA 4H8ZA 2DBTA 4BUOA 2OE9X 4XENA 1XSFA 3HUKA 3CT1A 1YIKA 4L35A 3LYTA 130LA 1XFPL 1L72A 1ALCA 4H91A 1IOSA 4PXFA 2I21A 1AP9A 1SWYA 1B5ZA 4NGWA 3HH5A 1JUGA 1BB6A 4R6CA 4IARA 1T8FA 1YANA 4I7LA 1AT6A 1G06A 3D9AC 1GFGA 1L86A 236LA 3GUKA 2ZILA 4OWEA 4XJDA 4X31A 4JKVA 1GUEA 2F2NA 1P8IA 4L41A 1IX0A 1LZ5A 4DQJA 3WH1A 5LVIA 1BGIA 3HU9A 1L85A 4II8A 3LHMA 4K5YA 1LZDA 4WLDA 4GP4B 1IP7A 3DNAA 3TXFA 1UAZA 115LA 1CX7A 1L41A 3DKEX 1D6QA 2Y00A 4GPOA 4HPEA 184LA 1UIDA 1L23A 1LI2A 1XGTC 3TXJA 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 5A44 A;  223L A;  2Z73 A;  3PQR A;  3GUN A;  166L A;  1IXF A;  1L09 A;  1H68 A;  4ARQ B;  254L A;  1P8U A;  4FA7 B;  1B6I A;  3HT6 A;  4DKL A;  228L A;  1PQD A;  5FJG A;  250L A;  1L42 A;  1L51 A;  1C63 A;  4EPF A;  1L70 A;  4YX7 C;  1L32 A;  1QTD A;  1PXR A;  1T8G A;  1L40 A;  1L98 A;  1SSW A;  1QUO A;  161L A;  1L83 A;  217L A;  1L74 A;  5EN0 A;  5AX1 A;  178L A;  3C9L A;  123L A;  150L A;  2YCZ A;  4W52 A;  5G36 A;  3VG9 A;  4N4Y B;  3QJS B;  3G3V A;  5H2J A;  2IGC A;  1XME B;  3A7K A;  252L A;  195L A;  3UTV A;  1OVH A;  243L A;  1PY6 A;  4Y9H A;  162L A;  2M3G A;  5H2P A;  3DMV A;  1D2Y A;  1QT5 A;  3QBI A;  1KS3 A;  4LZM A;  1LYE A;  1LYJ A;  3HTB A;  1L58 A;  3HT9 A;  1L57 A;  1JFP A;  2HUM A;  3ZEV A;  1C8S A;  113L A;  4BVN A;  1L38 A;  1C62 A;  3AYM A;  1SWZ A;  242L A;  1C6Q A;  233L A;  2F32 A;  4I7S A;  259L A;  2Y01 A;  196L A;  152L A;  1JTM A;  2O4W A;  2RB2 X;  3EML A;  4W56 A;  4N4W A;  1Q5J A;  4GBR A;  5BR2 A;  140L A;  232L A;  1C6B A;  2RBN A;  3JR6 A;  4JQ6 A;  1G0K A;  1QT7 A;  1LWG A;  1S53 A;  3DN1 A;  1OWZ A;  3QJU B;  4X32 A;  5G54 A;  1PQI A;  2NTH A;  3REY A;  4BWB A;  210L A;  200L A;  1VJM A;  4I7N A;  1C6F A;  3HUQ A;  1C6E A;  1QT6 A;  183L A;  2JAG A;  189L A;  1L22 A;  2YCY A;  5B6X A;  4PK0 A;  4EKR A;  2B6Y A;  1L87 A;  143L A;  240L A;  2A4T A;  1JTN A;  218L A;  1EHK B;  4EXM A;  3RUN A;  5H2M A;  2OU0 X; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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