3QBWA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to adenosine diphosphate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
347
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFSRAVLNIGGFSNVSLLRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 111
structure length 347
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA01
3H6EA 5AZIA 1BOTO 2HMPA 3HI0A 4BRKA 4EHTA 3IFRA 4PKIA 3VF4A 3O6WA 1TYQB 5LJVA 4BROA 5B8HA 1YXQA 3HM8A 3CJ7A 4FWLA 2I7NA 1MWKA 3VPZA 5EOYA 3LDQA 5AQOA 4BG9A 1XQSC 3H46O 3FZMA 4JD2A 4FL9A 1NGFA 4BRLA 3LM2A 2ASMA 4LC9B 4BRMA 5AZIB 4FWOA 1X9JA 1U2VA 3UKRA 4H5NA 1IJJA 4FWRA 3DJCA 1GLJO 3HZ6A 1NMDA 4CD1A 2QWLA 3AAPA 5ADXH 3JS6A 3LL3A 1C0FA 5EXWA 3SMSA 4BRCA 4GNIA 3IDHA 2ZF5O 4M7XA 1GLAG 3RSEA 2YI1A 4J8FA 4BR9A 3CHWA 3FZKA 3VEZA 4H0YB 3R6MA 1NGCA 3O5BA 4FWQA 3A5NC 1BA1A 2F9TA 3D7EO 4BQLA 3MN5A 4JD2B 3CERA 2D4WA 1NGAA 4O8KA 1T6DA 3R9PA 4BRHA 4A2BA 5BPNA 1J6ZA 1U2VB 3UKRB 1XUPO 3J8AA 2QWNA 4WYBA 1NWKA 4KBOA 3WQTA 4CZMA 1BA0A 1NGEA 3CQXA 4IZ9A 4YDUA 1DKGD 3A8YA 2CGJA 3RSEB 1BDGA 4QS7A 3CJAA 4H0VB 5AZJA 5ELZA 2BTFA 2VCPA 5LJWA 4HWIA 4K41A 5F1XA 1HPMA 2NRHA 4GY2B 4IXCA 1SZ2A 4NO7A 5BRDA 5EY4A 1U6ZA 4BREA 3O4WA 1GLCG 4AM7A 1HX1A 1BUPA 5BN8A 3DWLA 5AFUH 3FZHA 3JXUA 2V52B 3D2FA 4H0OA 4IJNA 4BVPA 4BR0A 2YHXA 3M1FA 2P9IA 5F0XA 5BN9A 4H0PA 4FWMA 3A0IX 1T44A 3CETA 3MN7A 2P9SA 4FOEA 2HOEA 1RGIA 5AQHA 2FXUA 1ATRA 2QM1A 5AZJB 2IVNA 3ATUA 1R59O 4BRAA 3QFUA 1OKJA 5I9EB 2CH6A 3FR0A 4I6MA 2F9WA 2P9LA 3LDPA 1E4GT 4MLHA 1YVNA 5BREA 3SLCA 2ZGZA 5ADXA 4BRFA 1NGGA 3WXIA 2D0OA 3D2FB 3H1VX 3IMXA 2A42A 4K43A 1GLLO 2P9PB 3QFPA 5E84A 2H3GX 3EKUA 2P9IB 3HTVA 1T6CA 5AQNA 5AQPA 3O08A 4CZKA 1K8KA 1ATSA 4XH1A 3CJ9A 3VEOA 2A3ZA 3BUZB 3MN9A 2P9SB 1MA9B 4CBUA 2A41A 2P9NA 3ENHA 4BC4A 5FPEA 3EN9A 3ZEUA 3KHYA 4JHDA 2IVPA 3WXKA 3GBTA 4B1ZA 1QHAA 3WUHA 2Q31A 4I6MB 4BR4A 4CBWA 3WXLA 2P9LB 4RCHA 4H0XB 3DXMA 1JCFA 4MO5A 1IG8A 2FSJA 3VF6A 2GWKA 2E1YA 1NGJA 3O80A 2E20A 5KQDA 4NB4A 2NLXA 2V7ZA 4AM6A 2Q36A 4FWSA 4ISEA 4BR7A 1K8KB 2CGKA 2Q97A 4Z94A 3DXKA 3VENA 1S3XA 1BG3A 2I7PA 1ZBSA 1ZXOA 4FWPA 3M3ZA 3UB5A 4BR2A 3LDNA 3A5LC 2P9NB 4FPAA 3VGKA 5BPMA 4CZFA 4MLEA 2A6AA 3ZEUB 4YDUC 4JHDB 3BF1A 4BRIA 3I33A 3LDOA 5AFUA 2NZTA 1MWMA 1NGHA 2QWRA 3DXMB 4FPBA 4B1XB 2GELA 3U8XA 3CQYA 2FLOA 5AR0A 2FSNA 4IJAA 4XH5A 4A2AA 3QBXA 3WEEA 1D4XA 4BQZA 2Q1NA 5BRHA 3DXKB 1ATNA 2VWBA 5AQLA 4B9QA 2YHYA 1JCEA 2CH5A 1QZ6A 1C0GA 1YUWA 3D2EA 3TPQA 2DPNA 1ESVA 1QQMA 4PL7A 4CD3A 1RFQA 3HBTA 1H1VA 4QS8A 3OHRA 3VEXA 3QBWA 3WQUA 3DAWA 1GLFO 3G25A 5KPTA 2P9UA 5EX5A 3O1WA 4XH4A 3FZFA 4DQ8A 4WQ4A 3BEXA 3AAQA 5AQKA 5FPDA 4A62A 3FE1A 5AQWA 4FOIA 2J4RA 1X3NA 2WUSA 3L6QA 4EIAA 3O8MA 3WEEB 5AQMA 4CZIA 3VF2A 2ZWHA 4ISFA 5BPLA 3FGUA 4B1WB 2P9KB 2P9PA 3D2EB 3MN6A 2HF4A 2HF3A 2Q0RA 5AQGA 2E8AA 4CBXA 4A61A 3CIPA 4M7YA 1G99A 4K42A 1DGKN 4H03B 1HJOA 2KHOA 2P9UB 4CZLA 1NBWA 4BRPA 3VEVA 3R8EA 4PKHA 3CJBA 3H3NO 4BC5A 3FLCO 1HLUA 3ZX3A 2QWMA 1Y64A 4L3QA 3VGLA 4JN4A 4FWKA 5AQIA 5BRFA 4BC3A 2EWSA 4FWNA 3I8BA 3UE5A 3FZLA 4DHYA 5AQVA 3ULEA 1HKGA 2FF3B 3LM9A 1KAXA 2V7YA 2E1ZA 1WOQA 3WXJA 1TUUA 2AP1A 3ID8A 3ZX2A 5JLHA 4E1JA 2YHWA 4XEIA 2PBDA 3EL2A 4WQ5A 1X3MA 4BRQA 2QW9A 1KXPA 1QQOA 3WT0A 2A5XA 2QXLA 2ASOA 4K25A 5AQZA 1BO5O 3U9DA 3U9ZA 5JICA 3MMVA 1XC3A 2IIRA 1EQYA 3BP8A 2GTDA 4H5VA 4HTLA 5AQXA 2BUPA 4H5TA 4PL8A 1NM1A 3ULEB 3VGMA 3VOVA 4CZEA 3VERA 3H45C 5E26A 2E2NA 1RDWX 1GLEG 1Z05A 4H5WA 2ZGYA 2ITMA 3GE1A 3VEYA 2A40A 2E2PA 4CZHA 1V4TA 5JLFA 1NGDA 3EZWA 4M63C 2FSKA 3AARA 5AQFA 3ZX0A 3W0LA 4CZGA 1QQNA 3TU5A 5CE3A 2OANA 3F9MA 3EKSA 3QDKA 1TUYA 3QICA 3M6GA 5AQYA 4IO8A 4FO0A 3U4LA 4B1VA 4DB3A 4WQ4C 1Q18A 5JMVA 3H3OB 3SK3A 3C7NA 2QWPA 2VYPA 3LDLA 5KPRA 3CJCA 3A5OC 5AQSA 3VEWA 1GLDG 4B1YB 5FPNA 4ISGA 4JNEA 3B8AX 2P9KA 1NGIA 4QS9A 2D0PA 1BU6O 2GUPA 2V51B 4PKGA 1SAZA 3L0QA 1HKBA 3QMLA 1HKCA 4H5RA 2FF6A 4EAHD 4JAXA 5LY3A 5AQTA 5TKYA 1ZC6A 3C7NB 3ZETA 3UKUA 1Z6RA 4C23A 1DEJA 1JCGA 5EVZA 1LCUA 2ASPA 3GDQA 1V4SA 4RTFD 3QB0A 3MCPA 1KAYA 2D1KA 3A5MC 4H0TB 2W40A 2YCHA 3GG4A 4BRNA 3GOIA 1P8ZA 3H1QA 3FFKB 3KZBA 2GEMA 3HSCA 3W3DA 4BGBA 4BR5A 3SJHA 5KPZA 4WQ5C 2QWOA 5F2RA 2QWQA 5BR9A 2AA4A 2CGLA 4BRGA 5FPMA 1KAZA 3C0BA 3ZETB 2E2OA 3S41A 3UKUB 4FSVA 3AY9A 3CJ1A 4CZJA 5AQUA 2Q0UA 3O1BA 4Y0WA 3EO3A 2E88A 1S22A 2E2QA 1WUAA 2PAVA 3VESA 3CI5A 3MK6A 3IUCA 5AQJA 1HUXA 1NGBA 4IWVA 5AQQA 1TYQA 4F9OA 3GL1A 4DCHA 1NLVA 2W41A 2Q2RA 3KVGA 4B1UB 1GLBG 1LOTB 4MO4A 1MDUB 2YJFA 5AQRA 3MDQA 2GWJA 4CJ7A 4EFHA 3ATVA 3SMPA 3P4IA 1YAGA 4RWTA 5KQ8A 3L4IA 4O5FA 3ENOA 1E4FT 4BGAA 3BF3A 1QZ5A 4BRDA 4BVOA 1CZAN 1SQKA 2UYTA 4BG8A 2YJEA 4BC2A 1BWFO 3VETA 4CI6A 4EHUA 2IVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WSGA 2HMPA 2HSTA 2UXDK 4C1NK 3O9TA 3KLGA 3O6WA 3OBWA 4E1NA 5LJVA 4BROA 3QINA 1YXQA 4NCAA 2A1SA 3CJ7A 4DV7K 4DTNA 1WSHA 2NRTA 5AQOA 4BG9A 3PX6A 5J1EA 3H46O 4IOAL 4DV0K 3TI0A 3LM2A 3E66A 1X1PA 4DTUA 1FW6A 4KKOA 4LF6K 3OYLA 2X78A 4F4KA 1RBUA 2E6LA 2IS3A 4H5NA 4B08A 1C6VA 4FWRA 3OYDA 1OH7A 1NMDA 5ADXH 4CJQA 1W9HA 1C0FA 3K0SA 3QEXA 3OYKA 4GNIA 4CGFA 2ZF5O 2YI1A 4HVJA 1VHXA 1KQSM 3FZKA 1RDCA 3ZT2A 3ZSYA 3A5NC 2QTDA 1BA1A 1VSIA 3M8PA 4BDZA 4KH6A 1QHTA 2WFBA 4JD2B 4O8KA 5LMUK 3NGZA 3RMAA 3LP0A 1NKEA 4CEEA 4A2BA 3QEWA 3PV8A 1J6ZA 1GOAA 3TAQA 1U2VB 4DWIA 3NH0A 3VQ5A 1XUPO 2ZE2A 3NFAA 4JS4A 4O44A 1NWKA 3LAMA 1A5VA 3OTOK 1RT1A 4YDUA 1DKGD 3TTCA 4DFMA 3K9JA 3THYB 4F2RA 5KGWA 4K8ZA 3TAMA 3I55N 5CYMA 4CJTA 1GOBA 2WBNA 2DFEA 1VSKA 3K5NA 4DU4A 1JL2A 4K0KK 3CM5A 3O4WA 1SKWA 2VG5A 1KSPA 3DWLA 4OO1J 2G8VA 4DTXA 4WFBL 1UA0A 3D2FA 4BR0A 1LV5A 2YHXA 3KK7A 1HNWK 2P9IA 5F0XA 1EKEA 2E6MA 5H1SQ 1TGOA 3A0IX 1T44A 3J81O 5GAEP 4E7IA 3MN7A 5AQHA 1ATRA 5FRMA 4CGDA 1OKJA 1TK0A 5C24A 1YVUA 1XHZA 2F9WA 3ID6A 4IKFA 4LFAK 2P9LA 1S9GA 1E4GT 1RTIA 3LWLA 4JI5K 1VQ5N 1GLLO 3QFPA 4CEBA 3EKUA 3KD1E 3CCEN 3THVA 3NF8A 5AQPA 1ATSA 4YY3K 2D0BA 3D6RA 2A3ZA 3TWHA 2P9SB 1MA9B 1EO1A 4AILC 3OJUA 3TAPA 4JKBA 1D9FA 4OKKA 1UWBA 4FJJA 2Q31A 4DR1K 4WF9L 4RCHA 4MO5A 3ZSQA 1HR0K 2FSJA 3VF6A 3DLLL 5KQDA 1KD1O 1DTTA 4AM6A 4FJLA 4ISEA 3C6HA 2Q97A 3SPZA 3SUPA 1BG3A 5J2NA 4YOWA 4FWPA 3UB5A 3LPTA 2P9NB 4W5TA 1NJIO 2UU9K 3TR8A 4JHDB 1XC9A 4CF1A 3BF1A 3SUNA 1RBSA 3ZSWA 2QEXN 2YX6A 4JK8A 3O4NA 1Y97A 2NZTA 3DXMB 5HRSA 4FPBA 4XIUA 3U8XA 4CGGA 5DM6L 4A2AA 2X6NA 1D4XA 3DLKA 1N34K 3DXKB 3ULDA 4Z4GA 2CH5A 4JK7A 3TPQA 2DPNA 1ESVA 1QQMA 2O4GA 3AA4A 3HRGA 3OHRA 4A59A 3WQUA 5C0YA 2I5JA 3O1WA 5GAGP 3S3OA 3FZFA 1NK4A 3HJFA 3CMEN 3HPGA 4ZTFA 4HUEA 4X66K 5AQKA 3OYAA 5FPDA 3FE1A 4F3OA 3LZIA 1X3NA 2HVIA 1UA1A 4JI1K 2WUSA 3L6QA 1RBRA 5AQMA 1WBDA 3VF2A 2ZWHA 4ISFA 5BPLA 5K14A 1QS4A 1LWFA 1KC8O 4FZYA 2BDPA 4CHZA 3SQ0A 2DY4A 3J7YP 4DV5K 2PYJA 2Q0RA 3DLEA 4CJSA 1IKYA 1NK9A 4DR5K 3R3LA 2YNFA 4CBXA 2HBKA 3ITHA 4LF4K 4CZLA 2ZQBA 4R79A 4PKHA 5J2PA 1J5EK 5JVGL 3K9KA 3QEPA 2ZD1A 2KKZA 2QWMA 4L3QA 4DF4A 4JN4A 1XHXA 4FLTA 1WSEA 3I8BA 3ENBA 4CGJA 5DK5A 3O3HA 3SQ2A 2E1ZA 3KLIA 2HHWA 3WXJA 3KKSA 3C94A 1OH6A 1HNZK 3EL2A 1FK9A 4BDYA 4LSLA 1X3MA 4BRQA 1HQUA 2A5XA 4B9NA 5AQZA 2P1JA 1BO5O 3H08A 3U9DA 2OCEA 4OKEA 1D9DA 1T3VA 2QA4N 3AVGA 3PY8A 3VOVA 1VSEA 3VGMA 4CZEA 3AV9A 3OYCA 4DLGA 4JKFA 5JVHL 1J9AA 4CJEA 3VA0A 5E26A 1RDWX 5HBMA 4ELTA 2F8TA 3K59A 5M1OA 3GE1A 1V4TA 3EZWA 3AARA 2G8WA 3W0LA 3HO1A 1W2BM 5LL6Z 3QNNA 1RDBA 3EKSA 1X9WA 3KLFA 3M6GA 5AQYA 2PZSA 4JRPA 4CEAA 3BGRA 4B1VA 1LW2A 4MQ3A 4WQ4C 4IOXA 1SKSA 3F9KA 2F96A 4I2QA 2IOCA 3H3OB 4FJ9A 4DQSA 1N33K 5C42A 3A5OC 3VEWA 5GADP 1GLDG 2BH1A 1HQEA 4AHUA 4JNEA 3E9OA 2GUPA 2V51B 2HNZA 3VQPA 1KTQA 1A5XA 3L2UA 2HHTA 2OPPA 1HKCA 4F2SA 4JK9A 4JV5K 4EAHD 4JAXA 4CK2A 1RILA 3C7NB 3WXMB 4B8CA 3EYZA 4GV9A 4N47A 5EVZA 4AH9A 2ASPA 3K58A 1XNQK 3O9SA 3QIPA 4R5PA 2O8CA 2Y1IA 2PFUA 2XO7A 3H1QA 3FFKB 3KZBA 3HSCA 1YI2N 4BGBA 1EWQA 4Z4IA 4ILGB 5KGXA 3SBGA 4N41A 4MDAA 1ASVA 4FJIA 3AO4A 4BRGA 5IWAK 4X64K 5FPMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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